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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Diverse NKT cells regulate early inflammation and neurological outcomes after cardiac arrest and resuscitation
2024-12-04, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adq5796
PMID:39630883
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研究论文 | 本研究通过分析心脏骤停患者的免疫细胞,发现多样NKT细胞与良好神经预后相关,并在小鼠模型中验证其神经保护作用 | 首次发现硫酸酯特异性dNKT细胞在心脏骤停后神经保护中的关键作用,并证明硫酸酯脂质治疗可改善神经功能 | 动物模型结果需要进一步临床验证,研究样本量有限 | 探索心脏骤停后神经损伤的免疫调节机制和潜在治疗策略 | 院外心脏骤停患者和小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大型OHCA患者队列和独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Impaired myofibroblast proliferation is a central feature of pathologic post-natal alveolar simplification
2024-Dec-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94425
PMID:39660606
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多种小鼠模型揭示了肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化病理过程的核心特征 | 首次通过单细胞RNA测序在多种BPD模型中系统证实肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化的核心机制,而非传统认为的TGFβ信号增强 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究支气管肺发育不良(BPD)中肺泡简化的发病机制 | 早产儿支气管肺发育不良和多种小鼠肺泡简化模型 | 单细胞生物学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 药理学方法, 遗传学方法 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54761-6
PMID:39737976
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析筛选胰腺癌分子成像靶点,并开发靶向claudin-4的PET成像探针 | 首次结合空间转录组学和蛋白质组学数据驱动筛选胰腺癌分子成像靶点,发现claudin-4作为高特异性成像靶标 | 研究基于人类手术样本,样本来源和数量可能存在限制 | 开发胰腺癌特异性分子成像靶点和成像探针 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者手术样本 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, PET成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 人类手术样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.19.629499
PMID:39763713
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研究论文 | 本研究揭示了肺成纤维细胞在烟曲霉感染期间通过免疫调节和组织重塑增强肺部防御的新机制 | 首次发现肺成纤维细胞在真菌感染中具有保护性功能,通过获得新的免疫调节特性和增强ECM分泌能力来限制感染严重程度 | 研究主要关注periostin阳性成纤维细胞亚群,其他成纤维细胞亚群的功能尚未完全阐明 | 探究肺成纤维细胞在烟曲霉感染过程中的功能响应和防御机制 | 肺成纤维细胞,烟曲霉菌,免疫正常和免疫抑制宿主 | 免疫学,传染病学 | 侵袭性曲霉病,真菌性肺炎 | 细胞谱系追踪,靶向细胞消融,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Chemotherapy induces myeloid-driven spatially confined T cell exhaustion in ovarian cancer
2024-Dec-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.11.005
PMID:39658541
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了化疗诱导的骨髓细胞驱动T细胞耗竭在卵巢癌中的空间限制机制 | 发现了化疗诱导的骨髓细胞网络(Myelonets)通过NECTIN2-TIGIT相互作用导致CD8 T细胞耗竭的空间限制机制 | 样本量相对有限(117例),且仅针对高级别浆液性卵巢癌 | 探究化疗对卵巢癌抗肿瘤免疫的适应性变化 | 117例高级别浆液性卵巢癌样本(化疗前后采集) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞数据,空间转录组数据 | 117例HGSC样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Postischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2024-Dec-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176207
PMID:39621585
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞氧感应PHD酶在缺血后肾脏修复中的关键作用,发现其失活通过诱导糖酵解促进肾脏不良修复 | 首次发现内皮细胞PHD1、PHD2和PHD3同时失活(而非仅PHD2)通过激活糖酵解/MCT4轴促进肾脏不良修复,并证明MCT4抑制剂可恢复适应性修复 | 机制研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接验证仍需进一步研究 | 探究缺血性急性肾损伤向慢性肾病转变的内皮细胞机制 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 病理生理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
VICTOR: Validation and inspection of cell type annotation through optimal regression
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.08.028
PMID:39296808
|
研究论文 | 介绍了一种名为VICTOR的新方法,用于评估单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的可靠性 | 通过弹性网络正则化回归结合最优阈值来评估细胞注释的置信度,在识别不准确注释方面表现优于现有方法 | NA | 开发评估单细胞数据细胞类型注释可靠性的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 弹性网络正则化回归 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
A temporal cortex cell atlas highlights gene expression dynamics during human brain maturation
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01990-6
PMID:39567748
|
研究论文 | 通过单核RNA测序构建人类颞叶皮层的儿科和成人联合细胞图谱,揭示大脑成熟过程中的基因表达动态 | 首次构建包含非洲裔样本的儿科和成人联合细胞图谱,发现与认知和突触可塑性相关的LTK和FREM兴奋性神经元亚型在儿科组织中表达升高 | 研究主要聚焦于颞叶皮层,可能无法完全代表其他脑区的发育特征 | 探索人类大脑成熟过程中的细胞类型特异性基因表达动态 | 人类颞叶组织样本,包含儿科和成人样本及非洲裔样本 | 单细胞基因组学 | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 未明确指定样本数量,但鉴定了75种细胞亚型 | NA | 单核RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Tumor Expression of CD83 Reduces Glioma Progression and Is Associated with Reduced Immunosuppression
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0281
PMID:39601621
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质瘤中CD83+肿瘤细胞可抑制肿瘤进展并改善免疫抑制微环境 | 首次发现肿瘤细胞自身表达的CD83能够调节免疫微环境并增强抗肿瘤T细胞反应 | 需要进一步研究CD83表达是否能够增强免疫治疗效果 | 探究CD83在胶质瘤免疫抑制微环境中的作用机制 | 人类和小鼠胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Physical inactivity exacerbates pathologic inflammatory signalling at the single cell level in patients with systemic lupus
2024-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105432
PMID:39531917
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现,系统性红斑狼疮患者的身体不活动会加剧免疫细胞的病理性炎症信号传导 | 首次在单细胞水平揭示身体不活动如何通过CD4+和CD8+T细胞加剧系统性红斑狼疮患者的病理性炎症信号传导 | 研究基于自我报告的身体活动数据,样本量相对有限(123例患者) | 探究身体活动对系统性红斑狼疮患者免疫细胞功能和炎症信号传导的影响机制 | 123名系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 123名系统性红斑狼疮患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Improved characterization of 3' single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae175
PMID:39703419
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研究论文 | 评估Element Aviti平台通过亲和碱基化学测序技术改进3'单细胞RNA-seq文库中polyA位点表征的能力 | 利用亲和碱基化学测序技术首次实现对胸腺嘧啶同聚物区域的准确测序,直接独立分配reads到polyA位点 | 与单端比对相比并未持续提高reads比对率,未排除其他新兴平台可能具有相似性能 | 改进3'单细胞RNA-seq文库的表征方法,特别是polyA位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库中的polyA位点 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA-seq, 亲和碱基化学测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti | Element Aviti平台采用亲和碱基化学测序技术 |
| 92 | 2025-10-06 |
Transiently increased coordination in gene regulation during cell phenotypic transitions
2024-Dec, PRX life
DOI:10.1103/prxlife.2.043009
PMID:40585428
|
研究论文 | 通过分析单细胞RNA测序数据,研究细胞表型转变过程中基因调控网络的协调机制 | 首次在五种不同细胞转变过程中观察到基因调控网络社区间相互作用的共同模式:调控数量和强度先增加后减少 | 仅基于五种细胞转变过程的分析,需要更多系统验证 | 探索细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制 | 五种不同细胞转变过程中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 过渡路径理论 | 单细胞RNA测序数据 | 五种不同细胞转变过程的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
KMT2D regulates tooth enamel development
2024-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.20.608898
PMID:39411159
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研究论文 | 本研究通过构建KMT2D条件性敲除小鼠模型,揭示了KMT2D在牙釉质发育中的关键作用机制 | 首次系统阐明了KMT2D通过直接调控关键基因参与成釉细胞分化的分子机制,为Kabuki综合征牙釉质发育异常提供了直接证据 | 研究仅使用小鼠模型,人类临床样本验证不足;单细胞RNA-seq数据为重新分析现有数据集 | 探究KMT2D基因在牙釉质发育过程中的具体功能和分子机制 | KMT2D条件性敲除小鼠模型及其牙胚组织 | 发育生物学 | 牙釉质发育不全 | 条件性基因敲除, micro-CT, 扫描电镜, RNA-seq, CUT&RUN-seq, 单细胞RNA-seq | 条件性敲除小鼠模型 | 基因组数据, 转录组数据, 影像数据, 组织学数据 | KMT2D条件性敲除小鼠及其对照 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CUT&RUN-seq | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
Side- and Disease-Dependent Changes in Human Aortic Valve Cell Population and Transcriptomic Heterogeneity Determined by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121623
PMID:39766890
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类主动脉瓣细胞群体和转录组异质性,揭示瓣膜疾病发展的侧向依赖性机制 | 首次使用新的内皮细胞富集方法独立分析主动脉瓣纤维面和心室面的单细胞转录组,发现侧向依赖性和疾病相关的细胞亚型 | 样本量较小(5名供者),无法完全代表疾病发展的所有阶段 | 探究钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)在瓣膜不同侧面的发展机制 | 人类主动脉瓣叶细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名供者的82,356个主动脉瓣细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Subcutaneous Fat Reveals Profibrotic Cells That Correlate With Visceral Adiposity in HIV
2024-Dec-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgae369
PMID:38820087
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示HIV感染者皮下脂肪中促纤维化细胞与内脏脂肪体积的关联 | 首次在HIV感染者中通过单细胞RNA测序鉴定皮下脂肪中间巨噬细胞和成纤维细胞亚群与内脏脂肪体积的关联 | 需要额外的纵向研究来确定因果关系和机制 | 研究HIV感染者皮下脂肪细胞类型组成和转录程序与内脏脂肪体积的关系 | 接受长期抗逆转录病毒治疗的HIV感染者 | 单细胞组学 | HIV感染和代谢疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 计算机断层扫描 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | 92名参与者进行bulk RNA测序, 43名进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
Transcriptional reprogramming primes CD8+ T cells toward exhaustion in Myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome
2024-Dec-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2415119121
PMID:39621903
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征中CD8+ T细胞趋向耗竭状态的转录重编程机制 | 首次整合单细胞RNA测序、RNA测序和ATAC测序对ME/CFS患者T细胞亚群进行多组学分析,发现CD8+ T细胞效应记忆亚群的耗竭特征 | 样本量有限,需要更大规模研究验证;未明确T细胞耗竭与疾病症状间的因果关系 | 阐明肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征中T细胞失调的基因调控机制 | 肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征患者的T细胞亚群,特别是CD8+ T细胞和先天T细胞 | 免疫学 | 肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征 | 单细胞RNA-seq, RNA-seq, ATAC-seq, 流式细胞术 | NA | 基因组学数据,表观基因组学数据,蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Multinucleated giant cells are hallmarks of ovarian aging with unique immune and degradation-associated molecular signatures
2024-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.626649
PMID:39677686
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研究论文 | 本研究通过先进成像技术和激光捕获显微切割定义了卵巢衰老中的多核巨细胞,揭示了其独特的分子特征和功能 | 首次系统定义了卵巢衰老中多核巨细胞的分子特征,发现其形成复杂互连网络并随年龄增加,具有独特的降解和免疫功能特征 | 多核巨细胞的大尺寸限制了通过单细胞RNA测序等技术进行分离和分析 | 研究卵巢衰老过程中多核巨细胞的功能和分子特征 | 小鼠和非人灵长类动物的卵巢组织 | 数字病理学 | 卵巢衰老 | 先进成像技术,激光捕获显微切割,转录组分析 | NA | 图像,转录组数据 | 小鼠和非人灵长类动物卵巢组织 | NA | 转录组分析 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
Dysregulated Treg repair responses lead to chronic rejection after heart transplantation
2024-Dec-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173593
PMID:39621314
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现心脏移植后慢性排斥反应中IL-33通过诱导Tregs产生amphiregulin促进纤维化进程 | 首次揭示IL-33- amphiregulin轴在调节性T细胞介导的修复反应失调导致慢性排斥中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证有限 | 探究心脏移植后慢性排斥反应的分子机制 | MHC II类不匹配的心脏移植模型和临床移植样本 | 免疫学 | 器官移植排斥 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠移植模型和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
Single-nucleus chromatin accessibility and transcriptomic map of breast tissues of women of diverse genetic ancestry
2024-Dec, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03011-9
PMID:39122969
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研究论文 | 本研究建立了涵盖不同遗传背景女性乳腺组织的单核染色质可及性与转录组图谱 | 首次整合多遗传背景女性样本的单核染色质可及性和基因表达数据,揭示了乳腺细胞类型的祖先依赖性变异 | 样本量相对有限(92名女性),未涵盖所有遗传背景群体 | 构建健康乳腺组织的综合细胞图谱并探索遗传背景对细胞组成的影响 | 92名不同遗传背景女性的乳腺组织样本 | 单细胞组学 | 乳腺疾病 | 单核染色质可及性测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因组学数据, 转录组数据 | 92名女性乳腺组织样本 | NA | 单核ATAC-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
sc-SPLASH provides ultra-efficient reference-free discovery in barcoded single-cell sequencing
2024-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630263
PMID:39763839
|
研究论文 | 开发了sc-SPLASH流程,用于无参考基因组的单细胞RNA测序数据分析 | 将SPLASH框架扩展到条形码单细胞RNA测序和空间转录组学,提供无需参考基因组的统计优先发现方法 | NA | 探索转录组多样性,包括剪接、V(D)J重组和参考基因组中缺失的序列 | 人类、海鞘和海绵的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台,10x Visium空间转录组平台 |