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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
Restoring Mitochondrial Quantity and Quality to Reverse Warburg Effect and Drive Tumor Differentiation
2024-Dec-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5494402/v1
PMID:39711563
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研究论文 | 本研究通过联合使用视黄酸和线粒体解偶联剂恢复肿瘤线粒体功能,诱导神经母细胞瘤分化并抑制增殖 | 首次提出通过协同增强线粒体生物合成和呼吸作用来恢复肿瘤线粒体数量和质量,从而逆转Warburg效应并驱动肿瘤分化 | 研究主要聚焦于神经母细胞瘤模型,在其他肿瘤类型中的适用性需要进一步验证 | 探索通过恢复线粒体功能诱导肿瘤分化的治疗策略 | 神经母细胞瘤细胞和原位异种移植模型 | 癌症生物学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,U-C-葡萄糖/谷氨酰胺同位素示踪,线粒体功能分析 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-05 |
Cellular cartography reveals mouse prostate organization and determinants of castration resistance
2024-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.630532
PMID:39763898
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研究论文 | 通过整合单细胞测序和空间转录组技术构建小鼠前列腺细胞图谱,揭示去势抵抗的细胞机制 | 首次系统整合单细胞RNA测序、单细胞多组学和空间转录组技术,揭示小鼠前列腺叶特异性细胞类型及其在去势抵抗中的作用 | 主要基于小鼠模型,人类前列腺数据的验证仍需进一步研究 | 解析前列腺细胞身份和去势反应的转录、表观遗传及空间基础 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,单细胞多组学,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据,空间转录组数据 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌荟萃分析数据 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-05 |
Diethylhexyl phthalate induces immune dysregulation and is an environmental immune disruptor
2024-12-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136244
PMID:39442302
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)对小鼠免疫系统的破坏作用 | 首次在单细胞水平系统揭示DEHP通过抑制炎症信号和热休克蛋白表达导致免疫失调的机制 | 研究仅使用小鼠模型,未直接验证对人体免疫系统的影响 | 探究DEHP对环境免疫系统的破坏作用及其机制 | 小鼠脾脏组织和外周血免疫细胞 | 免疫毒理学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-05 |
Pulmonary surfactant biogenesis blockage mediated polyhexamethylene guanidine disinfectant induced pulmonary fibrosis
2024-12-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136307
PMID:39488979
|
研究论文 | 本研究揭示了聚六亚甲基胍消毒剂通过阻断肺表面活性物质生物合成诱发肺纤维化的机制 | 首次发现PHMG通过破坏自噬流导致AT2细胞内肺表面活性物质生物合成受阻的机制 | NA | 探究PHMG消毒剂吸入暴露诱发肺纤维化的时间效应和分子机制 | 肺泡II型上皮细胞(AT2细胞) | 毒理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Preclinical Models for Functional Precision Lung Cancer Research
2024-Dec-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17010022
PMID:39796653
|
综述 | 本文综述了肺癌精准医学研究中临床前模型的应用与发展 | 系统比较了各类肺癌临床前模型的优劣,并强调了患者来源类器官与多组学技术结合在功能性精准肿瘤学中的新兴价值 | 体内模型成本高、耗时长且劳动密集,限制了其广泛应用 | 推动肺癌精准医疗发展,优化个体化治疗策略 | 肺癌临床前研究模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Single-cell atlases reveal leaf cell-type-specific regulation of metal transporters in the hyperaccumulator Sedum alfredii under cadmium stress
2024-12-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136185
PMID:39418904
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了镉超富集植物东南景天叶片在镉胁迫下金属转运蛋白的细胞类型特异性调控机制 | 首次构建东南景天的全长转录组和叶片单细胞图谱,首次在单细胞水平揭示金属转运蛋白的细胞类型特异性表达模式 | 研究仅针对叶片组织,未涉及其他器官;样本数量相对有限 | 探究镉超富集植物东南景天在镉胁迫下的细胞类型特异性转录调控机制 | 东南景天(Sedum alfredii)叶片细胞 | 植物生物学 | NA | PacBio Iso-Seq全长转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组测序数据,单细胞基因表达数据 | 12,616个高质量单细胞(来自对照和镉处理样本) | PacBio | 全长转录组测序,单细胞RNA测序 | PacBio Iso-Seq | PacBio Iso-Seq技术用于生成全长转录组 |
| 87 | 2025-10-06 |
Decoding the mosaic of inflammatory bowel disease: Illuminating insights with single-cell RNA technology
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.07.011
PMID:39421242
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在炎症性肠病研究中的最新进展与应用 | 系统整合单细胞转录组、蛋白质组、T细胞受体谱和表观遗传分析,提供IBD发病机制的全面视角 | 缺乏纵向研究数据,需要整合多种单细胞和空间转录组技术 | 探索单细胞测序技术在炎症性肠病研究中的应用价值 | 炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎和克罗恩病)患者细胞 | 数字病理 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组分析, T细胞受体谱分析, 表观遗传分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Spatial proteomics and transcriptomics of the maternal-fetal interface in placenta accreta spectrum
2024-12, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.09.004
PMID:39349165
|
研究论文 | 本研究通过空间蛋白质组学和转录组学分析植入性胎盘谱系中母胎界面的分子特征 | 首次在植入性胎盘病例中整合空间转录组学和蛋白质组学分析,揭示滋养细胞深层侵袭的分子机制 | 样本量有限,研究结果需要更大规模验证 | 探究植入性胎盘谱系中母胎界面的分子改变机制 | 植入性胎盘患者的母胎界面组织 | 空间组学 | 胎盘疾病 | 免疫组织化学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 组织图像 | 植入性胎盘病例组织样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Cell state transitions are decoupled from cell division during early embryo development
2024-Dec, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01546-0
PMID:39516639
|
研究论文 | 本研究通过细胞周期阻滞实验证明斑马鱼胚胎发育中细胞分化与细胞分裂可解耦发生 | 首次在胚胎发育过程中系统证明细胞分裂对所有胚胎组织分化并非必需 | 研究仅针对斑马鱼早期胚胎发育阶段,未涉及其他物种或后期发育过程 | 探究细胞分裂在胚胎细胞分化过程中的作用机制 | 斑马鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals the loss of FABP4-positive proliferating valvular endothelial cells relates to functional mitral regurgitation
2024-12-20, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03791-4
PMID:39707349
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析功能性二尖瓣反流患者二尖瓣叶的细胞组成和分子变化 | 首次在功能性二尖瓣反流中发现FABP4阳性增殖性瓣膜内皮细胞亚群的异常减少及其在疾病中的作用 | 样本量较小(仅6例患者),需要更大规模研究验证 | 研究功能性二尖瓣反流的发病机制和分子变化 | 二尖瓣反流患者的二尖瓣叶组织和原代瓣膜内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,免疫组织化学,体外细胞实验 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 6例心脏移植患者(3例二尖瓣反流,3例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Epithelial tubule interconnection driven by HGF-Met signaling in the kidney
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416887121
PMID:39705305
|
研究论文 | 本研究揭示了HGF-Met信号通路通过MAPK和MMPs促进肾脏上皮小管吻合的机制 | 首次发现HGF能够独立于细胞增殖促进上皮小管吻合,并建立了可视化定量分析小管连接的实验方法 | 研究仅限于胚胎小鼠肾脏模型,尚未在人类或其他成年动物模型中验证 | 探究肾脏上皮小管吻合的分子机制 | 胚胎小鼠肾脏上皮小管 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,荧光图像 | 胚胎小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Decoding aging in the heart via single cell dual omics of non-cardiomyocytes
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111469
PMID:39735437
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研究论文 | 通过单细胞双组学技术解析心脏非心肌细胞在衰老过程中的分子变化 | 首次在单细胞水平同时应用转录组和表观基因组分析心脏非心肌细胞的衰老过程,揭示了细胞类型内衰老异质性和细胞间通讯的变化 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;仅关注非心肌细胞,未包含心肌细胞分析 | 解析心脏衰老的细胞和分子机制 | 年轻、中年和老年小鼠的心脏非心肌细胞 | 单细胞组学 | 心脏衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 年轻、中年和老年三个年龄组的小鼠心脏非心肌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Genomic and the tumor microenvironment heterogeneity in multifocal hepatocellular carcinoma
2024-Dec-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001191
PMID:39666875
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研究论文 | 本研究通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序,深入解析了多灶性肝细胞癌中瘤内转移和多中心发生的肿瘤微环境异质性 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了多灶性肝细胞癌中瘤内转移和多中心发生的基因组和肿瘤微环境差异 | 样本量相对有限(7名患者的23个样本),需要在更大队列中验证 | 阐明多灶性肝细胞癌中瘤内转移和多中心发生的肿瘤微环境异质性 | 多灶性肝细胞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 全外显子组测序,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因组数据,转录组数据,图像数据 | 7名患者的23个样本,另有验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子组测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
Distinct immune microenvironment of venous tumor thrombus in hepatocellular carcinoma at single-cell resolution
2024-Dec-10, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001182
PMID:39656099
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研究论文 | 通过单细胞分辨率技术揭示肝细胞癌中静脉肿瘤血栓的独特免疫微环境特征 | 首次在单细胞水平系统揭示PVTT中C5aR+TAMs的免疫抑制功能及其临床意义 | 样本量有限,机制研究主要基于细胞系实验 | 探索肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓的免疫微环境特征 | 肝细胞癌患者的门静脉肿瘤血栓、原发肿瘤和血液样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 飞行时间质谱流式技术, 单细胞RNA测序, 多重荧光免疫组化染色 | NA | 单细胞数据, 蛋白质表达数据, 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Proximity sequencing for the detection of mRNA, extracellular proteins and extracellular protein complexes in single cells
2024-12, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01030-x
PMID:39147984
|
研究论文 | 介绍一种能够同时检测单细胞中mRNA、细胞外蛋白和细胞外蛋白复合物的邻近测序方法 | 首次实现单细胞水平上同时测量蛋白质、mRNA和数百种位于细胞外膜的蛋白复合物 | 需要基本的分子生物学和单细胞测序专业知识,实验过程需要数天时间完成 | 开发能够同时检测单细胞中多种生物分子的测序方法 | 单细胞中的mRNA、细胞外蛋白和细胞外蛋白复合物 | 单细胞测序 | NA | 邻近测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
CHST4 associates with high-abundance immune infiltration in hormone receptor-positive breast cancer
2024-12-31, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae190
PMID:39213175
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研究论文 | 本研究揭示了CHST4在激素受体阳性乳腺癌中通过调节免疫细胞浸润影响肿瘤进展的新机制 | 首次发现CHST4在HR+ BRCA中异常下调并与淋巴结转移相关,揭示了其通过调节硫酸化外周淋巴结地址素增强免疫细胞浸润的新功能 | 研究主要基于生物信息学分析和免疫组化验证,缺乏体内功能实验直接证明CHST4的因果作用 | 探究CHST4在激素受体阳性乳腺癌免疫浸润调控中的作用机制 | 激素受体阳性乳腺癌组织和相关免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 免疫组化染色、富集分析、单细胞测序分析 | NA | 组织样本、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Immune landscape of isocitrate dehydrogenase-stratified primary and recurrent human gliomas
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae139
PMID:39126294
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和光谱流式细胞术解析人类胶质瘤的免疫景观 | 发现表达颗粒溶素的新型炎症性小胶质细胞亚群,建立超越M1/M2范式的巨噬细胞极化基因组框架,提供胶质瘤特异性肿瘤免疫微环境参考特征 | 样本量相对有限,未完全阐明遗传差异和治疗效果对免疫的长期影响 | 解析IDH分层的人类原发性和复发性胶质瘤的免疫特征 | 48例人类胶质瘤样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 144,678个单细胞转录组, 超过200万个免疫细胞, 来自48例人类胶质瘤 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
Unraveling plant-microbe symbioses using single-cell and spatial transcriptomics
2024-12, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.06.008
PMID:38991926
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综述 | 探讨单细胞和空间转录组学技术在研究植物-微生物共生关系中的应用与优势 | 首次系统评述单细胞和空间转录组学在植物-微生物共生研究中的创新应用,突破了传统RNA-seq技术的细胞分辨率限制 | 当前技术难以在同一细胞中同时捕获植物和微生物的转录本 | 研究植物与微生物之间的共生关系建立机制 | 植物-微生物共生体系 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
Genome-scale modeling identifies dynamic metabolic vulnerabilities during the epithelial to mesenchymal transition
2024-Dec-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07408-7
PMID:39730911
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研究论文 | 通过基因组尺度代谢建模识别上皮-间质转化过程中的动态代谢脆弱性 | 整合时间序列转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学数据,结合机制性计算模型揭示EMT过程中的时间动态代谢依赖关系 | 研究基于TGF-β刺激的细胞培养模型,可能无法完全反映体内EMT过程的复杂性 | 探索上皮-间质转化过程中的代谢网络重编程机制 | 上皮-间质转化过程中的细胞代谢变化 | 计算生物学 | 肺癌 | 基因组尺度代谢建模,时间序列转录组学,时间序列蛋白质组学,单细胞转录组学,CRISPR-Cas9筛选 | 机制性计算模型 | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞数据 | 多个细胞培养模型的EMT数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
Associations between cuprotosis-related genes and the spectrum of metabolic dysfunction-associated fatty liver disease: An exploratory study
2024-12, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.15946
PMID:39285685
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研究论文 | 本研究探索铜死亡相关基因与代谢功能障碍相关脂肪肝疾病谱系之间的关联 | 首次系统研究铜死亡相关基因在MAFLD不同疾病阶段(包括肝癌)中的表达变化和功能作用 | 样本量相对有限,需要进一步功能验证实验 | 探索铜死亡相关基因在MAFLD疾病进展中的作用机制 | 代谢功能障碍相关脂肪肝疾病患者和MAFLD相关肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝疾病 | RNA测序,单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | 逻辑回归分析,差异相关性分析 | 基因表达数据,临床数据 | MAFLD患者331例,MAFLD相关HCC患者271例,验证队列656例 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |