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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Itaconate facilitates viral infection via alkylating GDI2 and retaining Rab GTPase on the membrane
2024-12-27, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02077-8
PMID:39730330
|
研究论文 | 本研究揭示了衣康酸通过烷基化GDI2并保留Rab GTPase在膜上促进病毒感染的机制 | 首次发现衣康酸通过直接烷基化GDI2蛋白的多个半胱氨酸位点,调节Rab GTPases的膜分布,从而促进病毒感染 | NA | 探究衣康酸在病毒感染中的作用机制 | 巨噬细胞、上皮细胞、中性粒细胞、VSV和IAV病毒 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
A phase 2 pilot study of umbilical cord blood infusion as an adjuvant consolidation therapy in elderly patients with acute myeloid leukemia
2024-12-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02065-y
PMID:39702351
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研究论文 | 评估脐带血输注作为老年急性髓系白血病患者辅助巩固治疗的安全性和有效性 | 首次将脐带血作为抗衰老疗法应用于老年AML患者的辅助治疗,并通过单细胞RNA测序揭示其抗肿瘤和抗衰老机制 | 单臂二期临床试验,样本量有限(51例),缺乏对照组 | 探索脐带血输注在老年AML患者巩固治疗中的疗效和安全性 | 51例年龄60-75岁的老年急性髓系白血病患者 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、基因表达数据 | 51例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
SNRPB2 in the pan-cancer landscape: A bioinformatics exploration and validation in hepatocellular carcinoma
2024-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111445
PMID:39366532
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证探讨SNRPB2在泛癌景观中的作用及其在肝细胞癌中的功能 | 首次系统研究SNRPB2在多种癌症类型中的表达模式及其与预后的关联,并通过实验验证其在肝癌细胞增殖和迁移中的功能 | 需要进一步探索其潜在机制和临床治疗潜力 | 研究SNRPB2在癌症发生发展中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 多种癌症类型和肝细胞癌细胞 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析,基因表达分析,基因组和表观基因组分析,基因集富集分析,免疫细胞浸润评估,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,基因组数据,表观基因组数据,单细胞测序数据 | 来自TCGA、CPTAC和GEO等多个公共数据库的多种癌症样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
Elucidating ferroptosis mechanisms in heart failure through transcriptomics, single-cell sequencing, and experimental validation
2024-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111416
PMID:39293745
|
研究论文 | 通过转录组学、单细胞测序和实验验证阐明心力衰竭中铁死亡的机制 | 首次系统识别并验证了心力衰竭中铁死亡相关基因在不同细胞类型中的差异表达模式 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步功能验证 | 探索铁死亡在心力衰竭发病机制中的作用 | 心力衰竭患者数据、心力衰竭细胞模型和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞测序, LASSO回归, SVM-RFE机器学习 | LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | GEO数据库中心力衰竭数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
A cross-disease resource of living human microglia identifies disease-enriched subsets and tool compounds recapitulating microglial states
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01764-7
PMID:39406950
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类小胶质细胞异质性,识别疾病相关亚群并验证化合物对小胶质细胞状态的影响 | 构建了跨疾病的人类小胶质细胞资源库,识别了疾病富集亚群,并发现能重现在体状态的化合物 | 样本来源仅限于已获得的74名捐赠者,尚未涵盖所有神经系统疾病类型 | 解析人类小胶质细胞异质性及其在神经系统疾病中的作用 | 来自74名捐赠者的215,680个活体人类小胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, RNAscope-免疫荧光, MERFISH | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 215,680个小胶质细胞来自74名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
NOVEL ACTIVE PROTEINS FOR SEPSIS PROGNOSIS REVEALED THROUGH ScRNA-seq AND QUANTITATIVE PROTEOMICS
2024-12-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002408
PMID:38888471
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和定量蛋白质组学揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 首次在单细胞水平结合scRNA-seq和DIA蛋白质组学识别脓毒症预后相关活性蛋白,并利用Viper算法估计蛋白质活性 | 样本量相对有限(脓毒症患者53例,对照组16例),需要在更大队列中验证 | 通过多组学分析揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 脓毒症患者和健康对照者的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,定量蛋白质组学,DIA蛋白质组学 | Viper算法,基因集变异分析,细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 脓毒症患者53例(NS组26例,SV组27例),健康对照16例,共分析34,228个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
Nanocoding: Lipid Nanoparticle Barcoding for Multiplexed Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.16.628827
PMID:39763829
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于脂质纳米颗粒的条形码技术Nanocoding,用于多重单细胞RNA测序 | 利用脂质纳米颗粒实现高密度条形码标记,将条形码载量提高10-100倍,且无需新型化学修饰 | NA | 开发更高效稳定的样本多重标记方法以解决scRNA-seq中的高成本和批次效应问题 | 培养细胞系、组织消化物中的异质性细胞、脾脏消化物、肥胖啮齿动物脂肪组织 | 单细胞测序技术 | 肥胖相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6重条形码样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Single cell and TCR analysis of immune cells from AAV gene therapy-dosed Duchenne muscular dystrophy patients
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101349
PMID:39524974
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析AAV基因治疗杜氏肌营养不良症患者的免疫细胞变化 | 首次在AAV基因治疗的DMD患者中结合单细胞RNA测序和TCR测序分析免疫反应,揭示了干扰素反应基因的诱导和T细胞克隆扩增模式 | 样本量较小(仅5名参与者),仅有一例发生血栓性微血管病 | 研究AAV基因治疗在DMD患者中引发的免疫反应机制 | 杜氏肌营养不良症患者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,TCR序列数据 | 5名DMD患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Diverse NKT cells regulate early inflammation and neurological outcomes after cardiac arrest and resuscitation
2024-12-04, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adq5796
PMID:39630883
|
研究论文 | 本研究通过分析心脏骤停患者的免疫细胞,发现多样NKT细胞与良好神经预后相关,并在小鼠模型中验证其神经保护作用 | 首次发现硫酸酯特异性dNKT细胞在心脏骤停后神经保护中的关键作用,并证明硫酸酯脂质治疗可改善神经功能 | 动物模型结果需要进一步临床验证,研究样本量有限 | 探索心脏骤停后神经损伤的免疫调节机制和潜在治疗策略 | 院外心脏骤停患者和小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大型OHCA患者队列和独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Impaired myofibroblast proliferation is a central feature of pathologic post-natal alveolar simplification
2024-Dec-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94425
PMID:39660606
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多种小鼠模型揭示了肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化病理过程的核心特征 | 首次通过单细胞RNA测序在多种BPD模型中系统证实肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化的核心机制,而非传统认为的TGFβ信号增强 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究支气管肺发育不良(BPD)中肺泡简化的发病机制 | 早产儿支气管肺发育不良和多种小鼠肺泡简化模型 | 单细胞生物学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 药理学方法, 遗传学方法 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54761-6
PMID:39737976
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析筛选胰腺癌分子成像靶点,并开发靶向claudin-4的PET成像探针 | 首次结合空间转录组学和蛋白质组学数据驱动筛选胰腺癌分子成像靶点,发现claudin-4作为高特异性成像靶标 | 研究基于人类手术样本,样本来源和数量可能存在限制 | 开发胰腺癌特异性分子成像靶点和成像探针 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者手术样本 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, PET成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 人类手术样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.19.629499
PMID:39763713
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研究论文 | 本研究揭示了肺成纤维细胞在烟曲霉感染期间通过免疫调节和组织重塑增强肺部防御的新机制 | 首次发现肺成纤维细胞在真菌感染中具有保护性功能,通过获得新的免疫调节特性和增强ECM分泌能力来限制感染严重程度 | 研究主要关注periostin阳性成纤维细胞亚群,其他成纤维细胞亚群的功能尚未完全阐明 | 探究肺成纤维细胞在烟曲霉感染过程中的功能响应和防御机制 | 肺成纤维细胞,烟曲霉菌,免疫正常和免疫抑制宿主 | 免疫学,传染病学 | 侵袭性曲霉病,真菌性肺炎 | 细胞谱系追踪,靶向细胞消融,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Chemotherapy induces myeloid-driven spatially confined T cell exhaustion in ovarian cancer
2024-Dec-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.11.005
PMID:39658541
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了化疗诱导的骨髓细胞驱动T细胞耗竭在卵巢癌中的空间限制机制 | 发现了化疗诱导的骨髓细胞网络(Myelonets)通过NECTIN2-TIGIT相互作用导致CD8 T细胞耗竭的空间限制机制 | 样本量相对有限(117例),且仅针对高级别浆液性卵巢癌 | 探究化疗对卵巢癌抗肿瘤免疫的适应性变化 | 117例高级别浆液性卵巢癌样本(化疗前后采集) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞数据,空间转录组数据 | 117例HGSC样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Postischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2024-Dec-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176207
PMID:39621585
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞氧感应PHD酶在缺血后肾脏修复中的关键作用,发现其失活通过诱导糖酵解促进肾脏不良修复 | 首次发现内皮细胞PHD1、PHD2和PHD3同时失活(而非仅PHD2)通过激活糖酵解/MCT4轴促进肾脏不良修复,并证明MCT4抑制剂可恢复适应性修复 | 机制研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接验证仍需进一步研究 | 探究缺血性急性肾损伤向慢性肾病转变的内皮细胞机制 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 病理生理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
VICTOR: Validation and inspection of cell type annotation through optimal regression
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.08.028
PMID:39296808
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研究论文 | 介绍了一种名为VICTOR的新方法,用于评估单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的可靠性 | 通过弹性网络正则化回归结合最优阈值来评估细胞注释的置信度,在识别不准确注释方面表现优于现有方法 | NA | 开发评估单细胞数据细胞类型注释可靠性的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 弹性网络正则化回归 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
A temporal cortex cell atlas highlights gene expression dynamics during human brain maturation
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01990-6
PMID:39567748
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研究论文 | 通过单核RNA测序构建人类颞叶皮层的儿科和成人联合细胞图谱,揭示大脑成熟过程中的基因表达动态 | 首次构建包含非洲裔样本的儿科和成人联合细胞图谱,发现与认知和突触可塑性相关的LTK和FREM兴奋性神经元亚型在儿科组织中表达升高 | 研究主要聚焦于颞叶皮层,可能无法完全代表其他脑区的发育特征 | 探索人类大脑成熟过程中的细胞类型特异性基因表达动态 | 人类颞叶组织样本,包含儿科和成人样本及非洲裔样本 | 单细胞基因组学 | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 未明确指定样本数量,但鉴定了75种细胞亚型 | NA | 单核RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
Tumor Expression of CD83 Reduces Glioma Progression and Is Associated with Reduced Immunosuppression
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0281
PMID:39601621
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质瘤中CD83+肿瘤细胞可抑制肿瘤进展并改善免疫抑制微环境 | 首次发现肿瘤细胞自身表达的CD83能够调节免疫微环境并增强抗肿瘤T细胞反应 | 需要进一步研究CD83表达是否能够增强免疫治疗效果 | 探究CD83在胶质瘤免疫抑制微环境中的作用机制 | 人类和小鼠胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Physical inactivity exacerbates pathologic inflammatory signalling at the single cell level in patients with systemic lupus
2024-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105432
PMID:39531917
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现,系统性红斑狼疮患者的身体不活动会加剧免疫细胞的病理性炎症信号传导 | 首次在单细胞水平揭示身体不活动如何通过CD4+和CD8+T细胞加剧系统性红斑狼疮患者的病理性炎症信号传导 | 研究基于自我报告的身体活动数据,样本量相对有限(123例患者) | 探究身体活动对系统性红斑狼疮患者免疫细胞功能和炎症信号传导的影响机制 | 123名系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 123名系统性红斑狼疮患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Improved characterization of 3' single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae175
PMID:39703419
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研究论文 | 评估Element Aviti平台通过亲和碱基化学测序技术改进3'单细胞RNA-seq文库中polyA位点表征的能力 | 利用亲和碱基化学测序技术首次实现对胸腺嘧啶同聚物区域的准确测序,直接独立分配reads到polyA位点 | 与单端比对相比并未持续提高reads比对率,未排除其他新兴平台可能具有相似性能 | 改进3'单细胞RNA-seq文库的表征方法,特别是polyA位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库中的polyA位点 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA-seq, 亲和碱基化学测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti | Element Aviti平台采用亲和碱基化学测序技术 |
| 80 | 2025-10-06 |
Transiently increased coordination in gene regulation during cell phenotypic transitions
2024-Dec, PRX life
DOI:10.1103/prxlife.2.043009
PMID:40585428
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研究论文 | 通过分析单细胞RNA测序数据,研究细胞表型转变过程中基因调控网络的协调机制 | 首次在五种不同细胞转变过程中观察到基因调控网络社区间相互作用的共同模式:调控数量和强度先增加后减少 | 仅基于五种细胞转变过程的分析,需要更多系统验证 | 探索细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制 | 五种不同细胞转变过程中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 过渡路径理论 | 单细胞RNA测序数据 | 五种不同细胞转变过程的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |