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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Immune landscape of isocitrate dehydrogenase-stratified primary and recurrent human gliomas
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae139
PMID:39126294
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和光谱流式细胞术解析人类胶质瘤的免疫景观 | 发现表达颗粒溶素的新型炎症性小胶质细胞亚群,建立超越M1/M2范式的巨噬细胞极化基因组框架,提供胶质瘤特异性肿瘤免疫微环境参考特征 | 样本量相对有限,未完全阐明遗传差异和治疗效果对免疫的长期影响 | 解析IDH分层的人类原发性和复发性胶质瘤的免疫特征 | 48例人类胶质瘤样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 144,678个单细胞转录组, 超过200万个免疫细胞, 来自48例人类胶质瘤 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Unraveling plant-microbe symbioses using single-cell and spatial transcriptomics
2024-12, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.06.008
PMID:38991926
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综述 | 探讨单细胞和空间转录组学技术在研究植物-微生物共生关系中的应用与优势 | 首次系统评述单细胞和空间转录组学在植物-微生物共生研究中的创新应用,突破了传统RNA-seq技术的细胞分辨率限制 | 当前技术难以在同一细胞中同时捕获植物和微生物的转录本 | 研究植物与微生物之间的共生关系建立机制 | 植物-微生物共生体系 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Genome-scale modeling identifies dynamic metabolic vulnerabilities during the epithelial to mesenchymal transition
2024-Dec-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07408-7
PMID:39730911
|
研究论文 | 通过基因组尺度代谢建模识别上皮-间质转化过程中的动态代谢脆弱性 | 整合时间序列转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学数据,结合机制性计算模型揭示EMT过程中的时间动态代谢依赖关系 | 研究基于TGF-β刺激的细胞培养模型,可能无法完全反映体内EMT过程的复杂性 | 探索上皮-间质转化过程中的代谢网络重编程机制 | 上皮-间质转化过程中的细胞代谢变化 | 计算生物学 | 肺癌 | 基因组尺度代谢建模,时间序列转录组学,时间序列蛋白质组学,单细胞转录组学,CRISPR-Cas9筛选 | 机制性计算模型 | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞数据 | 多个细胞培养模型的EMT数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
Associations between cuprotosis-related genes and the spectrum of metabolic dysfunction-associated fatty liver disease: An exploratory study
2024-12, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.15946
PMID:39285685
|
研究论文 | 本研究探索铜死亡相关基因与代谢功能障碍相关脂肪肝疾病谱系之间的关联 | 首次系统研究铜死亡相关基因在MAFLD不同疾病阶段(包括肝癌)中的表达变化和功能作用 | 样本量相对有限,需要进一步功能验证实验 | 探索铜死亡相关基因在MAFLD疾病进展中的作用机制 | 代谢功能障碍相关脂肪肝疾病患者和MAFLD相关肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝疾病 | RNA测序,单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | 逻辑回归分析,差异相关性分析 | 基因表达数据,临床数据 | MAFLD患者331例,MAFLD相关HCC患者271例,验证队列656例 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Mapping the gene space at single-cell resolution with gene signal pattern analysis
2024-Dec, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00734-0
PMID:39706866
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研究论文 | 提出一种名为基因信号模式分析(GSPA)的图信号处理方法,用于从单细胞数据中学习基因表征 | 首次系统性地构建了基因嵌入问题,并开发了基于细胞-细胞图上扩散小波字典的基因表征学习方法 | NA | 开发能够从单细胞数据中学习基因表征的计算方法 | 单细胞测序数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序,图信号处理 | GSPA(基因信号模式分析) | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic and spatial analysis reveal the immunosuppressive microenvironment in relapsed/refractory angioimmunoblastic T-cell lymphoma
2024-12-18, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-024-01199-0
PMID:39695118
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研究论文 | 通过单细胞转录组和空间分析揭示复发/难治性血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤的免疫抑制微环境特征 | 首次结合单细胞RNA测序和成像质谱流式技术系统比较初诊与复发/难治性AITL的细胞组成和空间结构,发现YY1驱动的恶性Tfh细胞增殖、B细胞恶性转化中间状态及髓系细胞功能失调等新机制 | 样本量有限,主要基于观察性分析,缺乏功能性验证实验 | 解析复发/难治性AITL免疫抑制微环境的细胞和分子特征 | 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤患者样本 | 数字病理 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 | NA | 单细胞转录组数据, 空间蛋白表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
A low level of tumor necrosis factor α in tumor microenvironment maintains the self-renewal of glioma stem cells by Vasorin-mediated glycolysis
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae147
PMID:39093693
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研究论文 | 本研究探讨肿瘤微环境中低水平TNFα通过Vasorin介导的糖酵解维持胶质瘤干细胞自我更新的机制 | 首次揭示低水平TNFα通过VASN介导的糖酵解促进胶质瘤干细胞自我更新的新机制 | 未明确说明样本规模和研究局限性 | 探索肿瘤微环境中TNFα对胶质瘤干细胞自我更新的调控作用及其临床意义 | 胶质瘤干细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学,RNA测序,单细胞RNA测序,质谱分析 | 体外和体内模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Airway-derived emphysema-specific alveolar type II cells exhibit impaired regenerative potential in COPD
2024-Dec, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02071-2023
PMID:39147413
|
研究论文 | 本研究发现了COPD肺气肿特异性肺泡II型细胞亚群,并证明其再生能力受损 | 首次鉴定出位于扩张远端肺泡囊中的肺气肿特异性ATII细胞亚群(asATII细胞),该细胞共表达肺泡标志物和气道俱乐部细胞标志物 | 研究主要基于单细胞测序和类器官实验,需要进一步体内功能验证 | 探究COPD中肺组织再生障碍的潜在驱动因素 | 人类和小鼠的肺泡II型细胞和气道俱乐部细胞 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序,谱系标记,肺泡类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据,空间定位数据 | 人类和小鼠COPD模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Brca1 haploinsufficiency promotes early tumor onset and epigenetic alterations in a mouse model of hereditary breast cancer
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01958-6
PMID:39528827
|
研究论文 | 本研究通过新型基因工程小鼠模型揭示了Brca1单倍体不足通过表观遗传改变加速遗传性乳腺癌发生的机制 | 发现Brca1杂合状态本身存在固有的促肿瘤表观遗传改变,挑战了传统的'二次打击'假说 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究Brca1杂合性如何促进乳腺癌早期发生 | Brca1杂合基因工程小鼠的乳腺上皮细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Pax3/7 gene function in Oikopleura dioica supports a neuroepithelial-like origin for its house-making Fol territory
2024-12, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.08.012
PMID:39181419
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9突变株和单细胞RNA测序分析,探讨了Oikopleura dioica中pax37A和pax37B基因在房室制造滤器区域发育中的功能 | 首次揭示pax37B(而非pax37A)对房室滤器细胞分化的特异性调控作用,并提出滤器区域分泌上皮细胞可能保留或进化了神经上皮特征的新假说 | 研究仅针对特定海洋生物模型,其结论在其他生物中的普适性仍需验证 | 探究Pax3/7基因在尾索动物房室制造上皮发育中的功能机制 | Oikopleura dioica(尾索动物)的房室制造上皮及其滤器细胞 | 发育生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 野生型和突变型Oikopleura dioica个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Immune cell single-cell RNA sequencing analyses link an age-associated T cell subset to symptomatic benign prostatic hyperplasia
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.629739
PMID:39803459
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现与年龄相关的CD8 T细胞亚群与症状性良性前列腺增生相关 | 首次发现年龄相关的CD8 T细胞亚群(Taa)通过颗粒酶K介导的前列腺基质成纤维细胞SASP因子产生促进症状性BPH | 研究样本量有限,机制研究主要在体外进行 | 探究年龄相关免疫细胞变化在良性前列腺增生发病机制中的作用 | 人类前列腺组织和患者来源的前列腺成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序,体外细胞培养,细胞因子检测 | NA | 单细胞RNA测序数据,临床评分数据 | 未明确样本数量的人类前列腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
STING Activation in Macrophages and Microglia Drives Poststroke Inflammation: Implications for Neuroinflammatory Mechanisms and Therapeutic Interventions
2024-12, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70106
PMID:39698742
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研究论文 | 本研究揭示了STING激活通过I型干扰素信号驱动巨噬细胞和小胶质细胞向促炎表型转变的机制及其在脑卒中后神经炎症中的作用 | 首次阐明持续性吞噬作用通过激活STING信号通路促使巨噬细胞和小胶质细胞表型转变的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究脑卒中后巨噬细胞和小胶质细胞表型转变的分子机制 | 巨噬细胞、小胶质细胞及脑卒中模型小鼠 | 神经科学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序、免疫染色、细胞培养 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、行为学数据、影像数据 | C57BL/6雄性小鼠及原代细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Itaconate facilitates viral infection via alkylating GDI2 and retaining Rab GTPase on the membrane
2024-12-27, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02077-8
PMID:39730330
|
研究论文 | 本研究揭示了衣康酸通过烷基化GDI2并保留Rab GTPase在膜上促进病毒感染的机制 | 首次发现衣康酸通过直接烷基化GDI2蛋白的多个半胱氨酸位点,调节Rab GTPases的膜分布,从而促进病毒感染 | NA | 探究衣康酸在病毒感染中的作用机制 | 巨噬细胞、上皮细胞、中性粒细胞、VSV和IAV病毒 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
A phase 2 pilot study of umbilical cord blood infusion as an adjuvant consolidation therapy in elderly patients with acute myeloid leukemia
2024-12-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02065-y
PMID:39702351
|
研究论文 | 评估脐带血输注作为老年急性髓系白血病患者辅助巩固治疗的安全性和有效性 | 首次将脐带血作为抗衰老疗法应用于老年AML患者的辅助治疗,并通过单细胞RNA测序揭示其抗肿瘤和抗衰老机制 | 单臂二期临床试验,样本量有限(51例),缺乏对照组 | 探索脐带血输注在老年AML患者巩固治疗中的疗效和安全性 | 51例年龄60-75岁的老年急性髓系白血病患者 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、基因表达数据 | 51例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
SNRPB2 in the pan-cancer landscape: A bioinformatics exploration and validation in hepatocellular carcinoma
2024-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111445
PMID:39366532
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证探讨SNRPB2在泛癌景观中的作用及其在肝细胞癌中的功能 | 首次系统研究SNRPB2在多种癌症类型中的表达模式及其与预后的关联,并通过实验验证其在肝癌细胞增殖和迁移中的功能 | 需要进一步探索其潜在机制和临床治疗潜力 | 研究SNRPB2在癌症发生发展中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 多种癌症类型和肝细胞癌细胞 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析,基因表达分析,基因组和表观基因组分析,基因集富集分析,免疫细胞浸润评估,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,基因组数据,表观基因组数据,单细胞测序数据 | 来自TCGA、CPTAC和GEO等多个公共数据库的多种癌症样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
Elucidating ferroptosis mechanisms in heart failure through transcriptomics, single-cell sequencing, and experimental validation
2024-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111416
PMID:39293745
|
研究论文 | 通过转录组学、单细胞测序和实验验证阐明心力衰竭中铁死亡的机制 | 首次系统识别并验证了心力衰竭中铁死亡相关基因在不同细胞类型中的差异表达模式 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步功能验证 | 探索铁死亡在心力衰竭发病机制中的作用 | 心力衰竭患者数据、心力衰竭细胞模型和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞测序, LASSO回归, SVM-RFE机器学习 | LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | GEO数据库中心力衰竭数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
A cross-disease resource of living human microglia identifies disease-enriched subsets and tool compounds recapitulating microglial states
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01764-7
PMID:39406950
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类小胶质细胞异质性,识别疾病相关亚群并验证化合物对小胶质细胞状态的影响 | 构建了跨疾病的人类小胶质细胞资源库,识别了疾病富集亚群,并发现能重现在体状态的化合物 | 样本来源仅限于已获得的74名捐赠者,尚未涵盖所有神经系统疾病类型 | 解析人类小胶质细胞异质性及其在神经系统疾病中的作用 | 来自74名捐赠者的215,680个活体人类小胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, RNAscope-免疫荧光, MERFISH | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 215,680个小胶质细胞来自74名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
NOVEL ACTIVE PROTEINS FOR SEPSIS PROGNOSIS REVEALED THROUGH ScRNA-seq AND QUANTITATIVE PROTEOMICS
2024-12-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002408
PMID:38888471
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和定量蛋白质组学揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 首次在单细胞水平结合scRNA-seq和DIA蛋白质组学识别脓毒症预后相关活性蛋白,并利用Viper算法估计蛋白质活性 | 样本量相对有限(脓毒症患者53例,对照组16例),需要在更大队列中验证 | 通过多组学分析揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 脓毒症患者和健康对照者的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,定量蛋白质组学,DIA蛋白质组学 | Viper算法,基因集变异分析,细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 脓毒症患者53例(NS组26例,SV组27例),健康对照16例,共分析34,228个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Nanocoding: Lipid Nanoparticle Barcoding for Multiplexed Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.16.628827
PMID:39763829
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研究论文 | 本研究开发了一种基于脂质纳米颗粒的条形码技术Nanocoding,用于多重单细胞RNA测序 | 利用脂质纳米颗粒实现高密度条形码标记,将条形码载量提高10-100倍,且无需新型化学修饰 | NA | 开发更高效稳定的样本多重标记方法以解决scRNA-seq中的高成本和批次效应问题 | 培养细胞系、组织消化物中的异质性细胞、脾脏消化物、肥胖啮齿动物脂肪组织 | 单细胞测序技术 | 肥胖相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6重条形码样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Single cell and TCR analysis of immune cells from AAV gene therapy-dosed Duchenne muscular dystrophy patients
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101349
PMID:39524974
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析AAV基因治疗杜氏肌营养不良症患者的免疫细胞变化 | 首次在AAV基因治疗的DMD患者中结合单细胞RNA测序和TCR测序分析免疫反应,揭示了干扰素反应基因的诱导和T细胞克隆扩增模式 | 样本量较小(仅5名参与者),仅有一例发生血栓性微血管病 | 研究AAV基因治疗在DMD患者中引发的免疫反应机制 | 杜氏肌营养不良症患者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,TCR序列数据 | 5名DMD患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |