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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2024-09-30 |
Maximizing single cell dissociation protocol for individual zebrafish embryo
2024-Dec, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2024.102958
PMID:39329153
|
研究论文 | 本文介绍了一种优化的小鱼胚胎单细胞分离协议 | 提出了针对小鱼胚胎的高质量单细胞悬液分离方法 | NA | 优化单细胞分离技术,以研究细胞异质性和细胞状态 | 小鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 单个小鱼胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 662 | 2024-09-27 |
Dysfunctional β-cell longevity in diabetes relies on energy conservation and positive epistasis
2024-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402743
PMID:39313296
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研究论文 | 研究了PFKFB3表达的β细胞在糖尿病中的功能障碍及其与能量保存和正向上位性的关系 | 揭示了PFKFB3通过与抗凋亡基因的相互作用,促进糖尿病中功能障碍β细胞的长期存活,并提出了通过抑制PFKFB3来清除这些细胞以恢复葡萄糖耐量的方法 | NA | 探讨PFKFB3在糖尿病中如何掩盖功能障碍β细胞的竞争特性 | PFKFB3表达的β细胞及其在糖尿病中的功能障碍 | NA | 糖尿病 | scRNA-seq和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自nPOD T2D胰腺的PFKFB3阳性β细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 663 | 2024-09-25 |
AFSC: A self-supervised augmentation-free spatial clustering method based on contrastive learning for identifying spatial domains
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.09.005
PMID:39310278
|
研究论文 | 提出了一种基于对比学习的无数据增强自监督空间聚类方法AFSC,用于识别空间域 | 设计了无负样本或数据增强的对比学习模块,并结合空间信息和基因表达进行潜在表示学习 | 未提及 | 改进空间聚类方法以识别空间域 | 空间转录组数据中的空间域 | 生物信息学 | NA | 对比学习 | 自监督学习模型 | 基因表达数据 | 多个不同分辨率的空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 664 | 2024-09-25 |
UQCRB and LBH are correlated with Gleason score progression in prostate cancer: Spatial transcriptomics and experimental validation
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.08.026
PMID:39310280
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析前列腺癌组织中不同病理结构与Gleason评分进展的关系,并验证了UQCRB和LBH基因在前列腺癌进展中的作用 | 首次通过空间转录组学技术分析前列腺癌组织中Gleason评分进展相关的分子事件,并验证了UQCRB和LBH基因在前列腺癌进展中的关键作用 | 研究主要基于TCGA-PRAD数据集和实验验证,未来需在更多样本和临床数据中进一步验证 | 探讨前列腺癌中Gleason评分进展相关的分子机制 | 前列腺癌组织及其Gleason评分进展相关的基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 不同病理结构的前列腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 665 | 2024-09-25 |
Deciphering the cellular and molecular landscapes of Wnt/β-catenin signaling in mouse embryonic kidney development
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.08.025
PMID:39310276
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研究论文 | 研究探讨了Wnt/β-catenin信号通路在小鼠胚胎肾脏发育中的细胞和分子机制 | 首次详细分析了Wnt/β-catenin信号通路激活后在不同胚胎肾脏细胞类型中的基因表达变化,并鉴定了直接转录靶点 | 研究主要集中在体外实验,缺乏体内验证 | 揭示Wnt/β-catenin信号通路在胚胎肾脏发育中的具体作用 | 小鼠胚胎肾脏细胞和基因表达 | 数字病理学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序、ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了来自小鼠胚胎肾脏的多个数据集,包括GSE131240、GSE20325、GSE39583和GSE39837 | NA | NA | NA | NA |
| 666 | 2024-09-19 |
Shexiang Tongxin dropping pill ameliorates microvascular obstruction via downregulating ALOX12 after myocardial ischemia-reperfusion
2024-Dec-01, International journal of cardiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.ijcard.2024.132481
PMID:39179033
|
研究论文 | 研究了麝香通心滴丸通过下调ALOX12改善心肌缺血-再灌注后的微血管阻塞 | 首次揭示了麝香通心滴丸通过下调ALOX12改善心肌缺血-再灌注后的微血管阻塞的具体作用和机制 | 研究仅在动物模型中进行,尚未在临床患者中验证 | 阐明麝香通心滴丸在心肌缺血-再灌注诱导的微血管功能障碍中的作用及其潜在机制 | 小鼠心脏功能和微血管阻塞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 蛋白质组学和单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质和RNA | 小鼠心脏和心脏微血管内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 667 | 2024-09-07 |
Identifying the importance of PCK1 in maintaining ileal epithelial barrier integrity in Crohn's disease
2024-Dec-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148872
PMID:39159791
|
研究论文 | 研究探讨了PCK1基因在克罗恩病中维持回肠上皮屏障完整性的重要性 | 首次揭示了PCK1基因在克罗恩病中对回肠上皮屏障的维持作用 | 研究样本量较小,且仅限于回肠组织 | 探讨克罗恩病患者肠道屏障功能障碍的关键基因 | 克罗恩病患者的回肠组织和Caco-2细胞系 | NA | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序、基因芯片、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 11名克罗恩病患者和多个对照组的回肠组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 668 | 2024-09-07 |
A nomoscore of four genes for predicting the rupture risk in abdominal aortic aneurysm patients with osteoarthritis
2024-Dec-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148877
PMID:39173977
|
研究论文 | 本研究旨在通过基因表达数据和机器学习算法,识别与腹主动脉瘤破裂风险相关的潜在生物标志物,并开发预测模型 | 本研究首次结合基因表达数据和单细胞RNA测序数据,利用机器学习算法识别出四个关键基因,并开发了一个高预测性能的诺模图 | 本研究主要基于已有的基因表达和单细胞RNA测序数据,未来需要在更多样本和临床数据中验证其有效性 | 发现并验证能够预测腹主动脉瘤破裂风险的潜在生物标志物 | 腹主动脉瘤患者及其破裂风险 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | LASSO, 随机森林, SVM-RFE | 基因表达数据 | 两个基因表达数据集(GSE98278, GSE51588)和两个单细胞RNA测序数据集(GSE164678, GSE152583) | NA | NA | NA | NA |
| 669 | 2024-09-06 |
Time-resolved scRNA-seq reveals transcription dynamics of polarized macrophages with influenza A virus infection and antigen presentation to T cells
2024-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2024.2387450
PMID:39129565
|
研究论文 | 本研究利用时间分辨单细胞测序技术结合代谢RNA标记,揭示了流感A病毒感染后骨髓来源巨噬细胞在不同极化状态下的转录动态变化 | 本研究首次采用时间分辨单细胞测序技术,捕捉了传统scRNA-seq方法所缺乏的转录活动的时间维度,并揭示了M2极化巨噬细胞是支持流感A病毒成功复制的唯一状态 | NA | 研究流感A病毒感染后骨髓来源巨噬细胞在不同极化状态下的转录动态变化及其对T细胞抗原呈递能力的影响 | 骨髓来源巨噬细胞在流感A病毒感染后的转录动态变化及其对CD4和CD8 T细胞的抗原呈递能力 | 数字病理学 | 流感 | 时间分辨单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 670 | 2024-09-06 |
Comprehensive scRNA-seq analysis to identify new markers of M2 macrophages for predicting the prognosis of prostate cancer
2024-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2024.2398195
PMID:39221762
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析识别M2巨噬细胞的新标记物,用于预测前列腺癌的预后 | 首次通过单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析(WGCNA)整合M2巨噬细胞的标记基因和枢纽基因,筛选出前列腺癌的预后基因签名 | 研究主要基于公共数据库的数据,缺乏体内实验验证 | 探讨M2巨噬细胞在前列腺癌中的预后价值 | M2巨噬细胞及其相关基因在前列腺癌中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 基因表达数据 | 2431个M2巨噬细胞标记基因和650个枢纽基因 | NA | NA | NA | NA |
| 671 | 2024-08-30 |
Exploring the molecular mechanisms of asthma across multiple datasets
2024-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2023.2258926
PMID:38489401
|
研究论文 | 本研究通过分析212名个体的基因表达数据,包括哮喘患者和健康对照,识别出267个差异表达基因,并利用多种生物信息学工具探索这些基因在哮喘发病机制中的潜在作用。 | 本研究揭示了哮喘的新遗传方面,并强调了综合生物信息学在解码复杂疾病模式中的力量。 | 这些发现需要进一步验证,C1orf64和C7orf26在哮喘中的确切作用有待进一步研究以验证其治疗潜力。 | 探索哮喘的分子机制,发现新的分子靶点和全面理解其发病机制。 | 哮喘患者和健康对照的基因表达数据。 | NA | 哮喘 | 差异基因表达分析、通路富集、药物靶点预测和单细胞分析 | NA | 基因表达数据 | 212名个体 | NA | NA | NA | NA |
| 672 | 2024-08-25 |
A highly neutralizing human monoclonal antibody targeting a novel linear epitope on staphylococcal enterotoxin B
2024-Dec-31, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2024.2360338
PMID:38857905
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术从参与五价疫苗临床试验的志愿者中分离的PBMCs中鉴定出一种针对SEB的新型线性表位的人源单克隆抗体Hm0487,并通过X射线晶体学和功能研究验证了其高效中和SEB的能力 | 本研究首次鉴定出一种针对SEB的新型线性表位的人源单克隆抗体Hm0487,并揭示了其通过别构效应而非竞争受体结合位点来中和SEB的机制 | NA | 研究旨在发现和验证一种新型的人源单克隆抗体,用于中和SEB的毒性及其引起的感染 | SEB毒素及其引起的中毒性休克综合征 | NA | 中毒性休克综合征 | 单细胞测序,X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | 从参与五价疫苗临床试验的志愿者中分离的PBMCs | NA | NA | NA | NA |
| 673 | 2024-08-21 |
Integrative analysis of single-Cell RNA sequencing and experimental validation in the study of abdominal aortic aneurysm progression
2024-Dec-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148820
PMID:39103059
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序数据和实验验证,探讨腹主动脉瘤进展中的细胞相互作用和分子机制 | 通过单细胞RNA测序和细胞间相互作用分析,揭示了腹主动脉瘤中特定的配体-受体对在疾病发生中的关键作用 | NA | 理解腹主动脉瘤发展的细胞相互作用和分子机制,以识别潜在的治疗靶点 | 腹主动脉瘤及其对照样本的单细胞和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE197748、GSE164678和GSE183464数据集,包括腹主动脉瘤和对照样本的单细胞和批量RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 674 | 2024-08-14 |
Single-cell transcriptomic analysis uncovers heterogeneity in the labial gland microenvironment of primary Sjögren's syndrome
2024-Dec, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2024.100248
PMID:39131726
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了原发性干燥综合征患者唇腺微环境的细胞和分子机制 | 揭示了唇腺微环境中上皮细胞分化减少和干扰素信号通路增强等新的细胞功能变化 | 样本量较小,仅包括三名患者和三名健康对照 | 探究原发性干燥综合征唇腺微环境的细胞和分子机制 | 原发性干燥综合征患者的唇腺细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 32,337个细胞,来自三名原发性干燥综合征患者和三名健康个体 | NA | NA | NA | NA |
| 675 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in diabetic kidney disease: a literature review
2024-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2024.2387428
PMID:39099183
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在糖尿病肾病研究中的应用 | 探讨了scRNA-seq技术在揭示糖尿病肾病发病机制和分子机制方面的作用 | NA | 阐明糖尿病肾病的发病机制并识别新的治疗靶点 | 糖尿病肾病中的多种细胞类型和非肾脏因素 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 676 | 2024-08-07 |
Integrated-omics profiling unveils the disparities of host defense to ECM scaffolds during wound healing in aged individuals
2024-Dec, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序和空间转录组学,探讨了ECM支架在老年个体伤口愈合中的差异性表现及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了老年小鼠中ECM支架周围六种功能和空间上独特的巨噬细胞和淋巴细胞群 | NA | 探索年龄相关差异背后的机制,并为未来针对老年个体的精准生物材料开发提供依据 | ECM支架在老年个体伤口愈合中的表现及其机制 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 老年小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 677 | 2024-08-05 |
The prognostic marker KRT81 is involved in suppressing CD8 + T cells and predicts immunotherapy response for triple-negative breast cancer
2024-Dec-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2024.2355705
PMID:38778753
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研究论文 | 本研究探讨了角蛋白81(KRT81)在三阴性乳腺癌中的预后标志作用及其对免疫治疗反应的预测。 | KRT81被发现是三阴性乳腺癌的独立预测因子,并与免疫微环境相关,表明其在个性化治疗中的重要性。 | 目前研究主要集中在KRT81的表达相关性,尚未充分探讨其他潜在的影响因素。 | 研究KRT81在三阴性乳腺癌中的作用及其作为免疫治疗预后标志的潜力。 | 三阴性乳腺癌及其相关的免疫细胞浸润情况。 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种三阴性及非三阴性乳腺癌样本的差异表达分析 | NA | NA | NA | NA |
| 678 | 2024-08-04 |
A global view of altered ligand-receptor interactions in bone marrow aging based on single-cell sequencing
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.06.020
PMID:39050783
|
研究论文 | 基于单细胞转录组测序检测骨髓衰老的配体-受体相互作用 | 首次系统性探讨了衰老对骨髓配体-受体相互作用的影响 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类 | 了解衰老对骨髓的细胞间通讯的影响 | 对年轻和老年小鼠的骨髓细胞进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 研究涉及384,124条相互作用和16种骨髓细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 679 | 2024-08-05 |
LiverSCA: A comprehensive and user-friendly cell atlas in human hepatocellular carcinoma
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.06.031
PMID:39050786
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研究论文 | 我们开发了一个名为LiverSCA的细胞图谱,旨在支持肝癌相关的研究 | 提供了一个用户友好的网络界面和全面的功能,使研究人员能够轻松访问肝癌肿瘤微环境的细胞和分子景观 | NA | 帮助研究人员在肝癌研究中快速而便捷地探索细胞和分子特征 | 人类肝细胞癌的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 680 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity and differential expression of the maternal-fetal interface during ICP and normal pregnancy
2024-Dec, The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians
DOI:10.1080/14767058.2024.2361278
PMID:38835155
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研究论文 | 本研究揭示了在妊娠期肝内胆汁淤积(ICP)与正常妊娠中母-胎界面的细胞异质性和基因表达差异 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统性分析了ICP与正常妊娠中胎盘的细胞类型、基因特征和功能变化 | 样本数量较小,仅分析了两名个体,可能影响结果的通用性 | 研究ICP影响胎盘的遗传机制 | 对比ICP和正常妊娠胎盘中母-胎界面的细胞类型和基因表达 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | 2名个体,一名为ICP患者,一名为正常妊娠者 | NA | NA | NA | NA |