单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202412-202412] [清除筛选条件]
当前共找到 702 篇文献,本页显示第 641 - 660 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
641 2024-11-17
Integrating transcriptomic data and digital pathology for NRG-based prediction of prognosis and therapy response in gastric cancer
2024-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本文研究了非凋亡性细胞死亡相关基因(NRG)在胃癌(GC)中的预后和治疗反应预测作用,并开发了一种基于深度学习的模型 首次将转录组数据与数字病理学结合,构建NRG特征并开发深度学习模型,用于胃癌患者的预后和治疗反应预测 NA 研究非凋亡性细胞死亡相关基因在胃癌中的预后和治疗反应预测作用 胃癌患者的转录组数据和数字病理学图像 数字病理学 胃癌 RNA-seq ResNet50 图像 NA NA NA NA NA
642 2024-11-15
Integration of transcriptomics and spatial biology analyses reveals Galactomyces ferment filtrate promotes epidermal interconnectivity via induction of keratinocyte differentiation, proliferation and cellular bioenergetics
2024-Dec, International journal of cosmetic science IF:2.7Q2
研究论文 研究评估了Galactomyces Ferment Filtrate(GFF)对表皮分化和氧化应激反应的影响 首次通过转录组学和空间生物学分析揭示了GFF促进表皮细胞间连通性,并通过诱导角质形成细胞分化、增殖和细胞生物能量来实现 NA 评估GFF对表皮分化和氧化应激反应的影响 角质形成细胞和体外皮肤组织 NA NA 转录组学 NA 转录组数据 多个供体的角质形成细胞和体外皮肤组织 NA NA NA NA
643 2024-11-15
Single-cell integrated transcriptomics reveals the role of keratinocytes in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Dec, Journal of applied genetics IF:2.0Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,全面分析了头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的细胞水平特征,揭示了角质形成细胞在HNSCC发展中的潜在作用 通过hdWGCNA共表达网络分析,识别了与HNSCC进展相关的基因模块,并构建了一个基于特定基因的预测模型,展示了其在多个数据集中的稳健预测性能 需要进一步研究来验证和扩展这些发现,以最终改善HNSCC患者的治疗效果 理解HNSCC的分子机制,识别预后标志物和治疗靶点,以提高患者治疗效果 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)及其相关细胞类型 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 多个数据集 NA NA NA NA
644 2024-11-15
Prediction of clinical prognosis and drug sensitivity in hepatocellular carcinoma through the combination of multiple cell death pathways
2024-Dec, Cell biology international IF:3.3Q3
研究论文 研究通过结合多种细胞死亡途径预测肝细胞癌的临床预后和药物敏感性 开发了一种基于细胞死亡指数(CDI)的预测模型,结合了多种细胞死亡途径和临床信息,用于预测肝细胞癌的预后和药物敏感性 研究依赖于现有数据集,可能存在数据偏差;模型在不同数据集上的验证结果可能存在差异 开发一种预测肝细胞癌临床预后和药物敏感性的模型 肝细胞癌患者的临床预后和药物敏感性 机器学习 肝癌 机器学习算法 NA 转录组数据、单细胞转录组数据、基因组数据和临床信息 使用了来自TCGA-LIHC、GSE14520、GSE45436和GSE166635数据集的数据 NA NA NA NA
645 2024-11-15
Identification and Verification of Key Genes in Colorectal Cancer Liver Metastases Through Analysis of Single-Cell Sequencing Data and TCGA Data
2024-Dec, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序数据和TCGA数据分析,识别和验证结直肠癌肝转移中的关键基因 本研究首次通过单细胞RNA测序数据和TCGA数据结合,识别出结直肠癌肝转移中的关键基因,并进行了实验验证 研究主要基于现有数据库和实验验证,未涉及大规模临床试验 识别结直肠癌肝转移中的关键基因,为治疗提供潜在靶点 结直肠癌肝转移样本和相关基因 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 17个结直肠癌肝转移样本 NA NA NA NA
646 2024-11-15
Deciphering the cellular landscape and potential targets of nasopharyngeal and oral cancers using single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Cell biology international IF:3.3Q3
研究论文 使用单细胞RNA测序技术研究鼻咽癌和口腔癌的细胞异质性及其潜在治疗靶点 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了鼻咽癌和口腔癌的肿瘤微环境中的细胞多样性及其相互作用,并发现MHC-II高表达的上皮细胞亚群与良好的预后和CD4 T细胞浸润相关 研究仅限于鼻咽癌和口腔癌,未涉及其他类型的癌症 揭示鼻咽癌和口腔癌的细胞异质性及其潜在治疗靶点 鼻咽癌和口腔癌的肿瘤微环境中的细胞类型及其相互作用 数字病理学 头颈部癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
647 2024-11-13
Spatial domains identification in spatial transcriptomics using modality-aware and subspace-enhanced graph contrastive learning
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 本文提出了一种基于图对比学习和子空间分析的框架GRAS4T,用于空间转录组学中的空间域识别 结合对比学习和子空间分析模型,通过捕捉同一域内点的自表达性来准确区分不同的空间域 NA 开发一种新的方法来提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性 空间转录组学数据中的空间域 空间转录组学 NA 图对比学习 图对比学习框架 空间转录组数据 八个来自五个不同平台的空间转录组数据集 NA NA NA NA
648 2024-10-30
Integrating multiomics and Single-Cell communication analysis to uncover Ankylosing spondylitis mechanisms
2024-Dec-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本文通过整合多组学和单细胞通信分析,揭示了强直性脊柱炎的发病机制 本文首次通过单细胞测序和分子对接技术,识别了Cassia twigs在治疗强直性脊柱炎中的潜在药物靶点 样本量相对较小,且仅限于特定类型的样本 探讨强直性脊柱炎的发病机制及Cassia twigs的治疗作用 强直性脊柱炎患者和非患者的血液样本及临床数据 生物信息学 风湿性疾病 单细胞测序 逻辑回归 基因表达数据 28,458个个体样本,其中6,101个为强直性脊柱炎患者,22,357个为非患者 NA NA NA NA
649 2024-10-30
Single-cell sequencing in diffuse large B-cell lymphoma: C1qC is a potential tumor-promoting factor
2024-Dec-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究C1qC在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的潜在促瘤机制 首次揭示了C1qC在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的促瘤作用,并提出了C1qC作为潜在治疗靶点的可能性 研究主要集中在C1qC在M2巨噬细胞中的表达及其对淋巴瘤细胞的影响,未全面探讨C1qC在其他免疫细胞中的作用 探索C1qC在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的潜在机制及其临床意义 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者及C1qC在免疫细胞中的表达 数字病理学 淋巴瘤 单细胞测序 NA 基因表达数据 涉及弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的临床数据及免疫细胞样本 NA NA NA NA
650 2024-10-30
Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of immune landscape in drug users with HIV infection
2024-Dec-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序揭示了药物使用者中HIV感染的免疫景观异质性 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了药物使用者与非药物使用者中HIV感染的免疫细胞异质性 研究仅限于外周血单核细胞,未涵盖其他组织或器官的免疫细胞 揭示药物使用对HIV感染免疫发病机制的影响 健康对照个体、药物使用HIV感染者和非药物使用HIV感染者的外周血单核细胞 数字病理学 HIV感染 单细胞RNA测序 NA RNA 健康对照个体、药物使用HIV感染者和非药物使用HIV感染者的外周血单核细胞样本 NA NA NA NA
651 2024-10-30
Mtb/HIV co-infection immune microenvironment subpopulations heterogeneity
2024-Dec-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究了HIV-1和结核分枝杆菌(Mtb)共感染患者外周血单个核细胞的免疫微环境异质性 构建了Mtb/HIV共感染的单细胞全局转录图谱,揭示了不同细胞亚群的异质性,并发现了可能参与免疫反应的关键细胞亚群 研究仅基于Gene Expression Omnibus数据库和中国国家基因库核苷酸序列档案的单细胞RNA测序数据,样本量和数据来源有限 探讨HIV-1和结核分枝杆菌共感染对免疫反应和免疫细胞亚群的影响 HIV-1感染者和Mtb/HIV共感染者的外周血单个核细胞 NA 结核病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
652 2024-10-29
Comprehensive integration of single-cell RNA and transcriptome RNA sequencing to establish a pyroptosis-related signature for improving prognostic prediction of gastric cancer
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据,建立了一个与细胞焦亡相关的特征,以提高胃癌患者的预后预测 首次整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据,建立了一个与细胞焦亡相关的特征,用于预测胃癌患者的生存时间和治疗反应 需要进一步验证该特征在不同人群和不同治疗方案中的适用性 探索细胞焦亡相关基因作为胃癌患者的预后生物标志物和治疗指标的价值 胃癌患者的细胞焦亡相关基因表达和分布 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 LASSO分析 RNA GSE183904数据集和TCGA数据库中的胃癌转录组数据 NA NA NA NA
653 2024-10-28
Recent advances in spatially variable gene detection in spatial transcriptomics
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
综述 本文综述了空间转录组学中空间变异基因检测的最新进展 本文介绍了近年来提出的多种新方法及其创新概念 NA 探讨空间转录组学数据分析中的空间变异基因检测方法 空间转录组学数据中的空间变异基因 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
654 2024-10-24
Circulating RAC1 contributed to steroid-sensitive nephrotic syndrome: Mendelian randomization, single-cell RNA-sequencing, proteomic, and experimental evidence
2024-Dec, Renal failure IF:3.0Q1
研究论文 研究探讨并验证了循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征(SSNS)之间的潜在因果关系 通过孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、蛋白质组学分析和实验研究,首次系统地验证了循环RAC1与SSNS之间的因果关系 研究主要集中在基因表达和蛋白质水平上,未深入探讨RAC1在细胞内的具体作用机制 探索并验证循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征之间的潜在因果关系 循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征(SSNS) NA 肾病 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 NA 基因表达数据、蛋白质数据 包括SSNS患者和健康对照的外周血单个核细胞样本,以及最小变化肾病综合征患者的样本 NA NA NA NA
655 2024-10-21
Predictive biomarkers for immune checkpoint inhibitors therapy in lung cancer
2024-Dec-31, Human vaccines & immunotherapeutics IF:4.1Q2
综述 本文综述了用于预测肺癌免疫检查点抑制剂疗效的生物标志物及其相关技术 本文结合单细胞测序和空间成像技术,以及深度学习和人工智能,探讨了新的预测生物标志物 PD-L1作为首个预测生物标志物,其预测价值仅限于特定人群 探讨用于预测肺癌免疫检查点抑制剂疗效的生物标志物及其相关技术 肺癌患者对免疫检查点抑制剂的反应 数字病理 肺癌 单细胞测序、空间成像技术、深度学习、人工智能 NA NA NA NA NA NA NA
656 2024-10-21
Excavating regulated cell death signatures to predict prognosis, tumor microenvironment and therapeutic response in HR+/HER2- breast cancer
2024-Dec, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 研究探讨了调控性细胞死亡(RCD)在HR+/HER2-乳腺癌中的作用及其临床价值 构建了一个基于六个关键基因的RCD评分系统(CDScore),用于预测HR+/HER2-乳腺癌的预后、肿瘤微环境和治疗反应 NA 探索调控性细胞死亡在HR+/HER2-乳腺癌中的作用及其临床应用 HR+/HER2-乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
657 2024-10-20
Schisandrin C inhibits AKT1-regulated cell proliferation in A549 cells
2024-Dec-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究了五味子素C对A549细胞增殖的影响及其机制 首次探讨了五味子素C通过抑制AKT1信号通路来抑制A549细胞增殖的机制 仅在体外细胞实验和部分临床样本中验证了效果,缺乏大规模临床试验数据 探讨五味子素C对肺癌的影响及其作用机制 A549细胞和肺癌患者组织 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 A549细胞和肺癌患者组织样本 NA NA NA NA
658 2024-10-20
Potential crosstalk between Naïve CD4+ T cells and SPP1+ Macrophages is associated with clinical outcome and therapeutic response in hepatocellular carcinoma
2024-Dec-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究探讨了肝细胞癌中幼稚CD4+ T细胞与SPP1+巨噬细胞之间的潜在交叉对话及其对临床结果和治疗反应的影响 建立了基于幼稚CD4+ T细胞和SPP1+巨噬细胞交叉对话的机器学习模型TMPS,用于预测预后和治疗反应 NA 研究肝细胞癌中肿瘤微环境内细胞间交叉对话及其对临床结果和治疗反应的影响 幼稚CD4+ T细胞和SPP1+巨噬细胞的交叉对话 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST)和批量RNA测序(RNA-seq) 机器学习模型 RNA测序数据 4个独立队列 NA NA NA NA
659 2024-10-19
Revolutionizing prognostic predictions in colorectal cancer: Macrophage‑driven transcriptional insights from single‑cell RNA sequencing and gene co‑expression network analysis
2024-Dec, Oncology letters IF:2.5Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和基因共表达网络分析,揭示了结直肠癌中巨噬细胞驱动的转录组特征,并构建了一个新的预后模型 本研究首次通过单细胞RNA测序和基因共表达网络分析,识别了与巨噬细胞相关的预后生物标志物,并构建了一个新的预后模型 研究结果需要进一步的前瞻性研究验证 提高结直肠癌免疫治疗的预后预测准确性 结直肠癌中的巨噬细胞及其相关生物标志物 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 非负矩阵分解算法 基因表达数据 23个样本 NA NA NA NA
660 2024-10-16
A comprehensive overview of graph neural network-based approaches to clustering for spatial transcriptomics
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
综述 本文全面概述了基于图神经网络的空间转录组学聚类方法 本文提供了对最新GNN-based空间聚类方法的全面概述,并比较分析了这些方法在空间聚类中的性能 本文指出了现有方法的局限性,并提出了未来研究的方向 探讨和评估基于图神经网络的空间转录组学聚类方法 空间转录组学数据的空间聚类 机器学习 NA 图神经网络 图神经网络 空间转录组学数据 60个聚类场景 NA NA NA NA
回到顶部