单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 702 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2024-11-30 |
ROS-Induced Gingival Fibroblast Senescence: Implications in Exacerbating Inflammatory Responses in Periodontal Disease
2024-Dec, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02014-5
PMID:38630168
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研究论文 | 研究探讨了细胞衰老在牙周疾病发病机制中的作用及其机制 | 首次揭示了氧化应激诱导的细胞衰老在牙周疾病中加剧炎症反应的作用 | 研究仅限于体外实验，缺乏体内验证 | 探讨细胞衰老在牙周疾病中的作用及其机制 | 牙龈成纤维细胞和内皮细胞 | NA | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康和炎症牙龈组织中的牙龈成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 622 | 2024-11-30 |
Droplet-based single-cell sequencing: Strategies and applications
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108454
PMID:39271031
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综述 | 本文综述了基于液滴微流控技术的单细胞测序策略及其在基因组学、表观基因组学、转录组学和蛋白质组学分析中的应用 | 液滴微流控技术显著提高了单细胞研究的通量、成本效益和自动化水平 | 讨论了基于液滴的单细胞测序在基础研究和商业应用中的挑战和未来展望 | 全面阐述液滴微流控辅助的单细胞组学方法 | 液滴微流控技术在单细胞测序中的策略和应用 | NA | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 623 | 2024-11-30 |
Immune checkpoint expression on tumor-infiltrating lymphocytes (TIL) is dependent on HPV status in oropharyngeal carcinoma (OPSCC) - A single-cell RNA sequencing analysis
2024-Dec, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人乳头瘤病毒（HPV）状态对口咽鳞状细胞癌（OPSCC）中肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）免疫检查点分子表达的影响 | 本研究首次揭示了HPV状态与OPSCC中免疫检查点分子表达的复杂相互作用，并提出了基于HPV状态和免疫特征的个性化治疗策略 | 本研究的样本量较小，且仅限于OPSCC病例，未来需要更大规模的研究来验证结果 | 研究HPV状态对OPSCC中免疫检查点分子表达的影响，以确定可能补充抗PD1抗体的其他免疫检查点分子靶点 | 口咽鳞状细胞癌（OPSCC）中的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）和外周血单核细胞（PBMC） | 数字病理学 | 口咽癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat管道 | RNA测序数据 | 51例OPSCC病例和TCGA HNSCC数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 624 | 2024-11-29 |
Genes and Pathways Underpinning Klinefelter Syndrome at Bulk and Single-Cell Levels
2024-Dec, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-024-10689-6
PMID:38374521
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研究论文 | 研究探讨了Klinefelter综合征（KS）在批量和单细胞水平上的关键基因和通路 | 首次在单细胞水平上评估了KS患者不同细胞类型之间的细胞间通讯，并发现了关键基因和通路 | 研究依赖于现有的公开数据集，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 揭示Klinefelter综合征的发病机制中的关键基因和通路 | Klinefelter综合征患者的批量和单细胞转录组数据 | 基因组学 | 生殖系统疾病 | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了三个批量和一个单细胞转录组数据集，包括KS和对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 625 | 2024-11-29 |
Identifying an AML Prognostic Model Using 10 Marker Genes from Single-Cell Transcriptome and Bulk Transcriptome Analysis
2024-Dec, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-024-10678-9
PMID:38347290
|
研究论文 | 研究探讨了FANC核心复合物在骨髓衰竭中的作用，并通过单细胞和批量转录组分析确定了与核仁稳态相关的基因，开发了一种预测急性髓系白血病（AML）预后的模型 | 通过单细胞和批量转录组分析，揭示了FA患者与健康个体在细胞间通信上的显著差异，并开发了一种具有高预测精度的AML预后模型 | NA | 探讨FANC核心复合物在骨髓衰竭中的作用，并开发AML预后模型 | FA患者的造血干细胞和AML预后 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞转录组测序和批量转录组分析 | 预后模型 | 转录组数据 | FA患者和健康个体的造血干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 626 | 2024-11-29 |
m6A Modification of Profilin-1 in Vascular Smooth Muscle Cells Drives Phenotype Switching and Neointimal Hyperplasia via Activation of the p-ANXA2/STAT3 Pathway
2024-Dec, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321399
PMID:39508106
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研究论文 | 研究探讨了PFN1在血管平滑肌细胞中的m6A修饰如何通过激活p-ANXA2/STAT3通路驱动表型转换和新内膜增生 | 首次揭示了PFN1的m6A修饰在血管平滑肌细胞中的重要作用，并阐明了其通过激活p-ANXA2/STAT3通路促进表型转换和新内膜增生的机制 | NA | 探讨PFN1在血管平滑肌细胞中的作用及其在支架内再狭窄中的机制 | 血管平滑肌细胞、支架内再狭窄患者及多种实验模型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括狭窄的大鼠颈动脉、支架植入的猪冠状动脉、支架内再狭窄患者、PFN1SMC-IKO小鼠和PFN1过表达小鼠等多种样本 | NA | NA | NA | NA |
| 627 | 2024-11-27 |
FOS+ B cells: Key mediators of immunotherapy resistance in diverse cancer types
2024-Dec-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200895
PMID:39583007
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析免疫治疗患者，探讨了FOS B细胞在多种癌症类型中作为免疫治疗抵抗关键介质的作用 | 发现了FOS B细胞与免疫治疗抵抗的关联，并揭示了其潜在机制，为预测治疗反应提供了新的生物标志物 | NA | 探讨FOS B细胞在免疫治疗抵抗中的作用及其潜在机制 | FOS B细胞在多种癌症类型中的作用 | NA | 多种癌症类型 | 单细胞RNA测序、空间转录组分析、免疫荧光分析 | NA | RNA测序数据 | 25名免疫治疗患者和1,253例多癌症免疫治疗转录组分析 | NA | NA | NA | NA |
| 628 | 2024-11-27 |
Analysis of population heterogeneity in CHO cells by genome-wide DNA methylation analysis and by multi-modal single-cell sequencing
2024-Dec-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.10.012
PMID:39488254
|
研究论文 | 通过全基因组DNA甲基化分析和多模态单细胞测序分析CHO细胞的群体异质性 | 首次通过全基因组亚硫酸氢盐测序建立了CHO细胞的单碱基甲基化图谱，并揭示了DNA甲基化模式在CHO进化中的集群现象 | 研究仅限于CHO细胞系，未涉及其他细胞类型 | 探讨CHO细胞的非遗传机制，特别是DNA甲基化在细胞异质性中的作用 | CHO细胞的DNA甲基化和单细胞测序数据 | 数字病理学 | NA | 全基因组亚硫酸氢盐测序和多模态单细胞测序 | NA | DNA甲基化数据和单细胞测序数据 | 8个独立的CHO细胞系和3个独立培养的9833个细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 629 | 2024-11-26 |
Unraveling immune cell heterogeneity in autoimmune arthritis: insights from single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Immunological medicine
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/25785826.2024.2388343
PMID:39120105
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在自身免疫性关节炎（包括类风湿性关节炎和脊柱关节炎）发病机制和临床应用中的关键发现和进展 | 单细胞RNA测序揭示了炎症部位成纤维细胞和免疫细胞亚群的异质性，提供了对疾病机制和治疗反应差异的见解 | 成本和样本量限制是当前面临的挑战，但合作努力和利用公共数据库有望克服这些障碍 | 探讨单细胞RNA测序在自身免疫性关节炎中的应用，揭示细胞异质性并推动精准医学 | 类风湿性关节炎和脊柱关节炎中的成纤维细胞和免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 630 | 2024-11-26 |
Integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing reveals sphingolipid metabolism and immune landscape in clear cell renal cell carcinoma
2024-Dec, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24319
PMID:39230203
|
研究论文 | 本研究利用批量和单细胞RNA测序数据，全面分析了透明细胞肾细胞癌中的鞘脂代谢和免疫微环境 | 开发了一种风险评分模型，用于增强透明细胞肾细胞癌患者的预后预测 | 依赖于公共来源的观察数据，主要关注RNA测序数据，未涵盖蛋白质表达、翻译后修饰和全面代谢谱等关键方面 | 揭示透明细胞肾细胞癌中鞘脂代谢和肿瘤微环境的复杂性 | 透明细胞肾细胞癌样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序 | 风险评分模型 | RNA数据 | 来自公共数据库的透明细胞肾细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 631 | 2024-11-26 |
Ischemia-reperfusion responses in human lung transplants at the single-cell resolution
2024-Dec, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.08.019
PMID:39197591
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研究论文 | 研究了人类肺移植中缺血-再灌注反应在单细胞分辨率下的表现 | 首次在单细胞分辨率下分析了人类肺移植中的缺血-再灌注反应，揭示了不同细胞类型的炎症反应差异 | 样本量较小，仅包括6例肺移植病例 | 加速肺移植中肺损伤治疗的发展 | 人类肺移植中的缺血-再灌注反应 | 数字病理学 | 肺移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例肺移植病例的供体肺活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 632 | 2024-11-25 |
Integrative analysis of anoikis-related genes prognostic signature with immunotherapy and identification of CDKN3 as a key oncogene in lung adenocarcinoma
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113282
PMID:39383787
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研究论文 | 研究分析了与失巢凋亡相关的基因在肺腺癌中的表达模式和预后意义，并鉴定了CDKN3作为关键的致癌基因 | 构建了基于失巢凋亡相关基因的风险评分模型，并验证了其在免疫治疗和临床应用中的有效性 | NA | 研究失巢凋亡相关基因在肺腺癌中的预后价值及其与免疫治疗的关系 | 肺腺癌患者的失巢凋亡相关基因表达及其预后意义 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 基因表达数据 | 使用了TCGA-LUAD数据库和GEO数据集，以及临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 633 | 2024-11-25 |
OSCC-derived EVs educate fibroblasts and remodel collagen landscape
2024-Dec, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2024.10.004
PMID:39393503
|
研究论文 | 研究探讨了口腔鳞状细胞癌（OSCC）来源的细胞外囊泡（EVs）如何通过调节癌症相关肌成纤维细胞（mCAFs）和相关胶原蛋白来重塑肿瘤微环境 | 首次揭示了OSCC来源的EVs在调控纤维母细胞向mCAFs分化以及特定胶原蛋白类型富集中的重要作用 | NA | 探讨OSCC来源的EVs在肿瘤微环境重塑中的作用机制 | OSCC来源的EVs、纤维母细胞、mCAFs、胶原蛋白 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞测序、免疫荧光染色、蛋白质组分析 | NA | 单细胞测序数据、免疫荧光图像、蛋白质组数据 | OSCC组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 634 | 2024-11-23 |
CVGAE: A Self-Supervised Generative Method for Gene Regulatory Network Inference Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00633-y
PMID:38778003
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研究论文 | 提出了一种基于单细胞RNA测序数据的自我监督生成方法CVGAE用于基因调控网络推断 | 使用图神经网络进行归纳表示学习，将基因表达数据和观测拓扑结构合并到低维向量空间中，并采用多层GraphSAGE作为编码器和改进的解码器来克服网络稀疏性问题 | NA | 改进基因调控网络推断的准确性和模型泛化能力 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 多个包含四个相关真实网络的单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 635 | 2024-11-23 |
Luteinizing Hormone Receptor Mutation (LHRN316S) Causes Abnormal Follicular Development Revealed by Follicle Single-Cell Analysis and CRISPR/Cas9
2024-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00646-7
PMID:39150470
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和CRISPR/Cas9技术研究黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响，并利用CRISPR/Cas9技术构建了LHR小鼠模型 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响及其在女性不孕治疗中的潜在应用 | 卵泡中的卵母细胞、卵丘颗粒细胞和壁颗粒细胞 | NA | 女性不孕 | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9 | NA | RNA | 14只LHR雌性小鼠和ICR野生型雄性小鼠交配 | NA | NA | NA | NA |
| 636 | 2024-11-20 |
Landscape of multiple tissues' gene expression pattern associated with severe sepsis: Genetic insights from Mendelian randomization and trans-omics analysis
2024-Dec-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123181
PMID:39471899
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研究论文 | 研究了与严重脓毒症相关的多组织基因表达模式，并使用孟德尔随机化和跨组学分析方法揭示了ST7L作为泛组织风险因子的作用 | 首次揭示了ST7L作为泛组织风险因子在严重脓毒症中的作用，并通过跨组学分析验证了其在树突状细胞中的表达和功能 | 研究主要基于基因表达数据和跨组学分析，缺乏对临床治疗的直接指导 | 揭示与严重脓毒症相关的多组织基因表达模式，并识别潜在的治疗靶点 | 严重脓毒症患者的基因表达模式和跨组织风险因子 | 基因组学 | 脓毒症 | 孟德尔随机化、全基因组关联研究、表达数量性状位点分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26个队列中的12种组织类型 | NA | NA | NA | NA |
| 637 | 2024-11-20 |
Integrated analysis of multi-omics data for the discovery of biomarkers and therapeutic targets for juvenile idiopathic arthritis
2024-Dec, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2024.100256
PMID:39554251
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研究论文 | 本研究通过多组学数据的综合分析，发现了青少年特发性关节炎的生物标志物和治疗靶点 | 首次使用两样本孟德尔随机化分析方法，揭示了血浆蛋白与青少年特发性关节炎之间的因果关系 | 研究仅限于血浆蛋白的分析，未涉及其他可能的生物标志物 | 识别和开发青少年特发性关节炎的新药物靶点和生物标志物，以提高治疗效果 | 青少年特发性关节炎及其相关血浆蛋白 | 生物信息学 | 风湿性疾病 | 两样本孟德尔随机化分析、共定位分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组学、转录组学 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 638 | 2024-11-18 |
Discovering explainable biomarkers for breast cancer anti-PD1 response via network Shapley value analysis
2024-Dec, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2024.108481
PMID:39488042
|
研究论文 | 本文提出了一种基于合作博弈理论的新型特征选择方法，用于识别乳腺癌免疫治疗反应的解释性生物标志物 | 本文创新性地将Shapley值分析应用于基因调控网络，以量化特征重要性，并通过网络扩展原则和节点邻接性来增强特征选择的可解释性 | NA | 旨在识别预测乳腺癌免疫治疗反应的生物标志物 | 乳腺癌患者的免疫治疗反应 | 机器学习 | 乳腺癌 | Shapley值分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 639 | 2024-11-17 |
RB1 Mutations Induce Smoking-Related Bladder Cancer by Modulating the Cytochrome P450 Pathway
2024-Dec, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24409
PMID:39239764
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研究论文 | 研究探讨了RB1基因突变如何通过调节细胞色素P450途径促进吸烟相关的膀胱癌发生 | 首次揭示了RB1突变在吸烟相关膀胱癌中的作用机制，并阐明了其通过抑制细胞色素P450途径和调节肿瘤免疫微环境来驱动肿瘤发生 | 研究主要基于TCGA数据集和细胞实验，缺乏临床样本的验证 | 探讨吸烟引起的RB1突变与膀胱癌发生之间的关系及其分子机制 | RB1基因突变、细胞色素P450途径、膀胱癌细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RT-qPCR | NA | 转录组数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas (TCGA) 数据集和细胞实验样本 | NA | NA | NA | NA |
| 640 | 2024-11-17 |
STGAT: Graph attention networks for deconvolving spatial transcriptomics data
2024-Dec, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2024.108431
PMID:39461117
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研究论文 | 本文提出了一种名为STGAT的图注意力网络方法，用于解卷积空间转录组数据 | STGAT通过生成伪空间转录组数据和构建综合图，利用图注意力网络动态分配权重，显著提高了细胞类型组成的预测准确性 | NA | 提高空间转录组数据分析的分辨率和准确性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据的整合与解卷积 | 数字病理学 | NA | 图注意力网络 | 图注意力网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |