单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
601	2024-12-02	Low level exposure to BDE-47 facilitates the development of prostate cancer through TOP2A/LDHA/lactylation positive feedback circuit 2024-Dec-15, Environmental research IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.envres.2024.120094 PMID:39362459	研究论文	研究低剂量BDE-47暴露通过TOP2A/LDHA/乳酸化正反馈回路促进前列腺癌发展的机制	首次探讨了BDE-47暴露与前列腺癌发展之间的关系，并揭示了TOP2A/LDHA/乳酸化正反馈回路在其中的作用	NA	探讨BDE-47暴露对前列腺癌进展的影响及其分子机制	BDE-47暴露、前列腺癌细胞、TOP2A、LDHA、乳酸化	数字病理学	前列腺癌	RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接模拟	NA	基因表达数据	体外实验使用PC3和LNCaP细胞系，体内实验使用小鼠模型
602	2024-12-02	CD4+CD8αlow T Cell Clonal Expansion Dependent on Costimulation in Patients With Rheumatoid Arthritis 2024-Dec, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/art.42960 PMID:39054665	研究论文	研究了类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其对T细胞靶向治疗的反应	首次探讨了类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其与疾病活动的关系，并评估了靶向治疗的效果	样本量较小，研究对象仅包括类风湿性关节炎和银屑病关节炎患者，未涵盖其他自身免疫性疾病	探讨类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其对T细胞靶向治疗的反应	类风湿性关节炎患者和健康对照者的CD4+CD8αlow T细胞	NA	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序	NA	单细胞RNA和T细胞受体序列	类风湿性关节炎患者3例，健康对照2例；类风湿性关节炎患者53例，银屑病关节炎患者52例，健康对照50例
603	2024-12-02	IL-1β mediated fibroblast-neutrophil crosstalk promotes inflammatory environment in skin lesions of SLE 2024-Dec, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110396 PMID:39522851	研究论文	研究了系统性红斑狼疮（SLE）皮肤病变中纤维母细胞与中性粒细胞之间的相互作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了SLE病变中CXCL1纤维母细胞的独特亚群，并阐明了其与中性粒细胞的相互作用机制	NA	探讨SLE皮肤病变中纤维母细胞与中性粒细胞的相互作用及其在炎症环境中的作用	系统性红斑狼疮（SLE）患者皮肤病变中的纤维母细胞和中性粒细胞	NA	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
604	2024-12-02	Mutation-Driven Immune Microenvironments in Non-Small Cell Lung Cancer: Unrevealing Patterns through Cluster Analysis 2024-Dec, Yonsei medical journal IF:2.6Q1 DOI:10.3349/ymj.2024.0062 PMID:39609084	研究论文	本文通过单细胞RNA测序数据分析了非小细胞肺癌中不同突变类型的肿瘤微环境	揭示了非小细胞肺癌中不同突变类型与肿瘤微环境的密切关联，为个性化癌症诊断和治疗提供了新见解	研究样本仅来自21名患者，可能影响结果的普适性	全面分析非小细胞肺癌中主要突变类型的肿瘤微环境异质性	非小细胞肺癌患者的肿瘤组织细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	聚类分析	RNA-seq数据	64369个肿瘤组织细胞，来自21名非小细胞肺癌患者
605	2024-12-01	Cancer-cell derived S100A11 promotes macrophage recruitment in ER+ breast cancer 2024-Dec-31, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2024.2429186 PMID:39587886	研究论文	研究揭示了S100A11在ER+乳腺癌中促进巨噬细胞招募的作用	首次发现S100A11在巨噬细胞与癌细胞相互作用中的作用，并证明其作为治疗靶点的潜力	研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证	探讨ER+乳腺癌中巨噬细胞与癌细胞的相互作用	ER+乳腺癌中的巨噬细胞和癌细胞	NA	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	25个ER+乳腺癌样本
606	2024-12-01	Single-cell atlases reveal leaf cell-type-specific regulation of metal transporters in the hyperaccumulator Sedum alfredii under cadmium stress 2024-Dec-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136185 PMID:39418904	研究论文	研究了镉胁迫下超积累植物Sedum alfredii叶片细胞类型的金属转运蛋白特异性调控	首次生成了Sedum alfredii的全长转录组，并构建了其叶片的首个单细胞图谱	对镉超积累的细胞类型特异性转录调控机制的理解仍有限	探讨镉胁迫下Sedum alfredii叶片细胞类型的特异性转录调控	Sedum alfredii叶片在镉胁迫下的金属转运蛋白调控	NA	NA	PacBio Iso-Seq技术，单细胞RNA测序	NA	RNA	12,616个高质量单细胞样本
607	2024-12-01	Huaier-induced suppression of cancer-associated fibroblasts confers immunotherapeutic sensitivity in triple-negative breast cancer 2024-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.156051 PMID:39299097	研究论文	研究探讨了中药华蟾素在三阴性乳腺癌中的治疗作用及其对肿瘤免疫微环境的影响	首次使用单细胞RNA测序系统分析华蟾素对三阴性乳腺癌微环境的影响，并揭示了华蟾素通过抑制癌症相关成纤维细胞向肌成纤维细胞的转变来增强免疫治疗效果	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证华蟾素的效果	探讨华蟾素在三阴性乳腺癌患者肿瘤免疫微环境中的治疗作用	三阴性乳腺癌及其肿瘤免疫微环境	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠模型
608	2024-12-01	Single-cell RNA transcriptomics reveals Du-Zhong-Wan promotes osteoporotic fracture healing via YAP/β-catenin/VEGF axis in BMSCs 2024-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.155572 PMID:39366157	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了杜仲丸通过YAP/β-catenin/VEGF轴促进骨髓间充质干细胞（BMSCs）的成骨分化和血管生成，从而促进骨质疏松性骨折愈合	本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了杜仲丸在分子水平上促进骨质疏松性骨折愈合的具体机制，特别是YAP/β-catenin/VEGF轴的作用	本研究主要集中在小鼠模型上，未来需要在人体样本中验证这些发现	阐明杜仲丸在单细胞水平上促进骨质疏松性骨折愈合的机制	骨髓间充质干细胞（BMSCs）和内皮细胞（ECs）	数字病理学	骨质疏松症	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠股骨骨折模型样本
609	2024-12-01	Wogonin mitigates microglia-mediated synaptic over-pruning and cognitive impairment following epilepsy 2024-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.156222 PMID:39547095	研究论文	研究黄酮类化合物Wogonin对癫痫后微胶质细胞介导的突触过度修剪和认知障碍的影响	首次探讨了Wogonin通过AKT/FoxO1通路抑制微胶质细胞的炎症反应和突触吞噬作用，从而减轻癫痫后的突触过度修剪和认知障碍	研究仅在动物模型上进行，尚未在人类中验证其效果	探讨Wogonin对癫痫后微胶质细胞介导的突触修剪和认知功能的影响	癫痫小鼠模型及其认知功能	神经科学	癫痫	单细胞测序	NA	图像	使用Pilocarpine诱导的癫痫小鼠模型，样本量为未知
610	2024-12-01	Single-cell dissection reveals immunosuppressive F13A1+ macrophage as a hallmark for multiple primary lung cancers 2024-Dec, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70091 PMID:39601163	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了多发性原发性肺癌（MPLC）和单发性原发性肺癌（SPLC）的肿瘤及邻近组织，揭示了MPLC中特异性富集的免疫抑制性F13A1+巨噬细胞亚型	发现了MPLC中特异性富集的免疫抑制性F13A1+巨噬细胞亚型，并揭示了其在塑造免疫抑制性肿瘤微环境和促进肿瘤生长中的作用	NA	探讨多发性原发性肺癌（MPLC）与单发性原发性肺癌（SPLC）之间的分子机制差异	多发性原发性肺癌（MPLC）和单发性原发性肺癌（SPLC）的肿瘤及邻近组织	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	MPLC和SPLC患者的肿瘤及邻近组织样本
611	2024-11-30	ROS-Induced Gingival Fibroblast Senescence: Implications in Exacerbating Inflammatory Responses in Periodontal Disease 2024-Dec, Inflammation IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s10753-024-02014-5 PMID:38630168	研究论文	研究探讨了细胞衰老在牙周疾病发病机制中的作用及其机制	首次揭示了氧化应激诱导的细胞衰老在牙周疾病中加剧炎症反应的作用	研究仅限于体外实验，缺乏体内验证	探讨细胞衰老在牙周疾病中的作用及其机制	牙龈成纤维细胞和内皮细胞	NA	牙周疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	健康和炎症牙龈组织中的牙龈成纤维细胞
612	2024-11-30	Spatial Transcriptomics Reveals the Transcriptomic Signatures in a Mouse Model of Pediatric Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis 2024-Dec, The American journal of pathology DOI:10.1016/j.ajpath.2024.08.008 PMID:39222909	研究论文	本研究开发了一种小鼠模型来模拟儿童代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH），并使用空间转录组技术分析了其肝脏转录组特征	首次开发了模拟儿童MASH的小鼠模型，并利用空间转录组技术揭示了与疾病相关的转录组特征	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证结果	研究儿童代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）的发病机制	小鼠模型的肝脏转录组特征	NA	代谢功能障碍相关脂肪性肝炎	空间转录组技术	NA	转录组数据	C57BL/6J小鼠，共8周龄
613	2024-11-30	Droplet-based single-cell sequencing: Strategies and applications 2024-Dec, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108454 PMID:39271031	综述	本文综述了基于液滴微流控技术的单细胞测序策略及其在基因组学、表观基因组学、转录组学和蛋白质组学分析中的应用	液滴微流控技术显著提高了单细胞研究的通量、成本效益和自动化水平	讨论了基于液滴的单细胞测序在基础研究和商业应用中的挑战和未来展望	全面阐述液滴微流控辅助的单细胞组学方法	液滴微流控技术在单细胞测序中的策略和应用	NA	NA	液滴微流控技术	NA	NA	NA
614	2024-11-30	Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq revealed key genes for bone metastasis and chemoresistance in prostate cancer 2024-Dec, Genes & genomics IF:1.6Q3 DOI:10.1007/s13258-024-01575-x PMID:39395905	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了前列腺癌骨转移和化疗耐药性的关键基因	首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出与前列腺癌进展、骨转移和化疗耐药性相关的关键基因LDHA	研究主要基于TCGA数据库和细胞实验，缺乏临床样本验证	探讨前列腺癌进展、骨转移和化疗耐药性的分子机制	前列腺癌的进展、骨转移和化疗耐药性	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序、RT-qPCR	lasso回归模型	基因表达数据	7928个与肿瘤进展和转移相关的基因，7个与前列腺癌预后相关的基因
615	2024-11-30	Immune checkpoint expression on tumor-infiltrating lymphocytes (TIL) is dependent on HPV status in oropharyngeal carcinoma (OPSCC) - A single-cell RNA sequencing analysis 2024-Dec, Oral oncology IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.oraloncology.2024.107107 PMID:39549431	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了人乳头瘤病毒（HPV）状态对口咽鳞状细胞癌（OPSCC）中肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）免疫检查点分子表达的影响	本研究首次揭示了HPV状态与OPSCC中免疫检查点分子表达的复杂相互作用，并提出了基于HPV状态和免疫特征的个性化治疗策略	本研究的样本量较小，且仅限于OPSCC病例，未来需要更大规模的研究来验证结果	研究HPV状态对OPSCC中免疫检查点分子表达的影响，以确定可能补充抗PD1抗体的其他免疫检查点分子靶点	口咽鳞状细胞癌（OPSCC）中的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）和外周血单核细胞（PBMC）	数字病理学	口咽癌	单细胞RNA测序	Seurat管道	RNA测序数据	51例OPSCC病例和TCGA HNSCC数据集
616	2024-11-29	Genes and Pathways Underpinning Klinefelter Syndrome at Bulk and Single-Cell Levels 2024-Dec, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-024-10689-6 PMID:38374521	研究论文	研究探讨了Klinefelter综合征（KS）在批量和单细胞水平上的关键基因和通路	首次在单细胞水平上评估了KS患者不同细胞类型之间的细胞间通讯，并发现了关键基因和通路	研究依赖于现有的公开数据集，可能存在数据质量和样本多样性的限制	揭示Klinefelter综合征的发病机制中的关键基因和通路	Klinefelter综合征患者的批量和单细胞转录组数据	基因组学	生殖系统疾病	转录组分析	NA	基因表达数据	使用了三个批量和一个单细胞转录组数据集，包括KS和对照样本
617	2024-11-29	Identifying an AML Prognostic Model Using 10 Marker Genes from Single-Cell Transcriptome and Bulk Transcriptome Analysis 2024-Dec, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-024-10678-9 PMID:38347290	研究论文	研究探讨了FANC核心复合物在骨髓衰竭中的作用，并通过单细胞和批量转录组分析确定了与核仁稳态相关的基因，开发了一种预测急性髓系白血病（AML）预后的模型	通过单细胞和批量转录组分析，揭示了FA患者与健康个体在细胞间通信上的显著差异，并开发了一种具有高预测精度的AML预后模型	NA	探讨FANC核心复合物在骨髓衰竭中的作用，并开发AML预后模型	FA患者的造血干细胞和AML预后	数字病理学	血液疾病	单细胞转录组测序和批量转录组分析	预后模型	转录组数据	FA患者和健康个体的造血干细胞
618	2024-11-29	m6A Modification of Profilin-1 in Vascular Smooth Muscle Cells Drives Phenotype Switching and Neointimal Hyperplasia via Activation of the p-ANXA2/STAT3 Pathway 2024-Dec, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321399 PMID:39508106	研究论文	研究探讨了PFN1在血管平滑肌细胞中的m6A修饰如何通过激活p-ANXA2/STAT3通路驱动表型转换和新内膜增生	首次揭示了PFN1的m6A修饰在血管平滑肌细胞中的重要作用，并阐明了其通过激活p-ANXA2/STAT3通路促进表型转换和新内膜增生的机制	NA	探讨PFN1在血管平滑肌细胞中的作用及其在支架内再狭窄中的机制	血管平滑肌细胞、支架内再狭窄患者及多种实验模型	NA	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	包括狭窄的大鼠颈动脉、支架植入的猪冠状动脉、支架内再狭窄患者、PFN1SMC-IKO小鼠和PFN1过表达小鼠等多种样本
619	2024-11-27	FOS+ B cells: Key mediators of immunotherapy resistance in diverse cancer types 2024-Dec-19, Molecular therapy. Oncology DOI:10.1016/j.omton.2024.200895 PMID:39583007	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序数据分析免疫治疗患者，探讨了FOS B细胞在多种癌症类型中作为免疫治疗抵抗关键介质的作用	发现了FOS B细胞与免疫治疗抵抗的关联，并揭示了其潜在机制，为预测治疗反应提供了新的生物标志物	NA	探讨FOS B细胞在免疫治疗抵抗中的作用及其潜在机制	FOS B细胞在多种癌症类型中的作用	NA	多种癌症类型	单细胞RNA测序、空间转录组分析、免疫荧光分析	NA	RNA测序数据	25名免疫治疗患者和1,253例多癌症免疫治疗转录组分析
620	2024-11-27	Analysis of population heterogeneity in CHO cells by genome-wide DNA methylation analysis and by multi-modal single-cell sequencing 2024-Dec-10, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.10.012 PMID:39488254	研究论文	通过全基因组DNA甲基化分析和多模态单细胞测序分析CHO细胞的群体异质性	首次通过全基因组亚硫酸氢盐测序建立了CHO细胞的单碱基甲基化图谱，并揭示了DNA甲基化模式在CHO进化中的集群现象	研究仅限于CHO细胞系，未涉及其他细胞类型	探讨CHO细胞的非遗传机制，特别是DNA甲基化在细胞异质性中的作用	CHO细胞的DNA甲基化和单细胞测序数据	数字病理学	NA	全基因组亚硫酸氢盐测序和多模态单细胞测序	NA	DNA甲基化数据和单细胞测序数据	8个独立的CHO细胞系和3个独立培养的9833个细胞核