单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 702 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2024-12-06 |
Dynamic single-cell sequencing unveils the tumor microenvironment evolution of gastric cancer abdominal wall metastases during radiotherapy
2024-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16308
PMID:39327670
|
研究论文 | 研究了放射治疗对胃癌腹壁转移瘤微环境的影响，通过单细胞RNA和T细胞受体测序分析了细胞组成和功能的变化 | 揭示了放射治疗期间胃癌腹壁转移瘤微环境中细胞组成和功能的动态变化，特别是免疫检查点基因的上调和T淋巴细胞的减少 | 仅基于一个患者的样本，结果的普适性有限 | 探讨放射治疗如何重塑胃癌腹壁转移瘤的微环境，以促进抗肿瘤免疫 | 胃癌腹壁转移瘤的微环境及其在放射治疗期间的动态变化 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA数据，T细胞受体数据 | 一个患者的四个肿瘤样本，分别在基线和放射治疗期间采集 |
| 582 | 2024-12-06 |
Single-cell sequencing insights into the transcriptional landscape of Parkinson's disease
2024-Dec, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102553
PMID:39454761
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综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术在帕金森病研究中的应用，探讨了这些技术在揭示疾病细胞异质性和分子特征方面的最新进展 | 本文介绍了单细胞T细胞受体测序和单细胞B细胞受体测序技术在帕金森病研究中的应用，提供了对免疫组库多样性的新见解 | 本文主要讨论了单细胞测序技术在帕金森病研究中的应用，但未深入探讨这些技术的局限性 | 探讨单细胞测序技术在帕金森病研究中的应用，揭示疾病的细胞异质性和分子机制 | 帕金森病中的退行性神经元、激活的神经胶质细胞和促炎性免疫细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq）、单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq） | NA | RNA | NA |
| 583 | 2024-12-06 |
Identifying T-cell clubs by embracing the local harmony between TCR and gene expressions
2024-Dec, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00070-5
PMID:39496799
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TCRclub的新方法，通过整合单细胞RNA测序数据和单细胞TCR测序数据，利用局部和谐性来识别功能相似的T细胞群 | TCRclub方法在整合TCR和基因表达数据方面具有创新性，能够识别功能相似的T细胞群 | NA | 开发一种有效的方法来整合TCR和基因表达数据，以识别功能相似的T细胞群，从而为癌症和传染病开发更有效的免疫治疗策略 | T细胞、TCR和基因表达数据 | 生物信息学 | 癌症、传染病 | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | 局部和谐性模型 | 基因表达数据、TCR数据 | 298,106个T细胞，涵盖七种不同疾病的数据集 |
| 584 | 2024-12-06 |
Cutaneous T cell lymphoma atlas reveals malignant TH2 cells supported by a B cell-rich tumor microenvironment
2024-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-02018-1
PMID:39558094
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学分析皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）患者的皮肤样本，揭示了恶性TH2细胞与B细胞丰富的肿瘤微环境之间的关系 | 首次揭示了恶性CTCL细胞通过T辅助2（T2）细胞免疫基因程序的共选择，并模拟肿瘤微环境以支持其生存，同时发现了与疾病进展相关的B细胞富集 | 研究仅限于皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL），未涵盖其他类型的淋巴瘤 | 揭示皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）中恶性TH2细胞与肿瘤微环境的关系，并寻找潜在的诊断标志物和治疗策略 | 皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）患者的皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞和空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 三个独立患者队列 |
| 585 | 2024-12-06 |
Molecular characterization and sub-retinal transplantation of hypoimmunogenic human retinal sheets in a minipig model of severe photoreceptor degeneration
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.203071
PMID:39633598
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研究论文 | 研究使用低免疫原性的人类视网膜片在小型猪模型中进行亚视网膜移植，以治疗严重的光感受器退化 | 利用低免疫原性的诱导多能干细胞生成自发极化的视网膜片，并通过单细胞RNA测序分析其发育过程 | 移植的视网膜片在功能上仍处于不成熟阶段，且研究样本量较小 | 开发治疗视网膜退行性疾病的新方法 | 视网膜片及其在光感受器退化模型中的移植效果 | 数字病理学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及一只移植的小型猪 |
| 586 | 2024-12-05 |
Artesunate remarkably alleviates interstitial cystitis/bladder pain syndrome in a murine model: Novel molecular signature deciphered by bulk tissue and single-cell transcriptomic analysis
2024-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401909R
PMID:39620925
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研究论文 | 研究了青蒿琥酯在减轻小鼠间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中的作用，并通过bulk组织和单细胞转录组分析揭示了新的分子特征 | 首次使用单细胞RNA测序探索间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征小鼠模型的免疫微环境，并研究青蒿琥酯治疗的可能分子机制 | 需要进一步研究以确认青蒿琥酯在间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征患者中的效果 | 探索更有效的间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征治疗方法 | 小鼠间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征模型 | NA | 泌尿系统疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 587 | 2024-12-05 |
Transcriptional reprogramming primes CD8+ T cells toward exhaustion in Myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome
2024-Dec-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2415119121
PMID:39621903
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研究论文 | 研究探讨了肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征（ME）中CD8+ T细胞的转录重编程和耗竭状态 | 首次通过多组学分析揭示了ME中CD8+ T细胞的耗竭状态，并验证了耗竭标志物的表达 | 研究仅限于特定T细胞亚群和症状诱发后的分析，未涵盖所有免疫细胞类型 | 研究ME中T细胞失调的基因调控状态，并探讨T细胞耗竭在疾病中的作用 | ME患者的CD8+ T细胞及其亚群 | 免疫学 | 肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征 | 单细胞RNA测序、RNA测序、ATAC测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 多个ME患者的T细胞样本 |
| 588 | 2024-12-05 |
Tumor-Associated Microglia Secrete Extracellular ATP to Support Glioblastoma Progression
2024-Dec-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0018
PMID:39618248
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研究论文 | 研究揭示了肿瘤相关小胶质细胞通过分泌胞外ATP促进胶质母细胞瘤进展的机制 | 首次发现肿瘤相关小胶质细胞在胶质母细胞瘤微环境中通过增加ATP合成酶表达和氧化磷酸化活性，分泌胞外ATP，激活P2X7受体，促进肿瘤细胞增殖和侵袭 | 研究主要基于体外和体内模型，缺乏临床试验验证 | 探讨肿瘤相关小胶质细胞在胶质母细胞瘤进展中的作用机制 | 胶质母细胞瘤患者样本、体外和体内模型 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 胶质母细胞瘤患者样本 |
| 589 | 2024-12-05 |
ATP2A3 in Primary Aldosteronism: Machine Learning-Based Discovery and Functional Validation
2024-Dec-02, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本文利用机器学习方法在原发性醛固酮增多症中发现了ATP2A3基因，并通过功能验证确认其在醛固酮生成中的关键作用 | 首次利用机器学习方法识别出ATP2A3作为原发性醛固酮增多症的关键特征基因，并通过多种实验验证了其在醛固酮生成中的调控作用 | NA | 利用机器学习方法发现原发性醛固酮增多症的新型生物标志物，揭示新的病理生理机制 | 原发性醛固酮增多症中的醛固酮生成腺瘤（APAs）及其相关基因ATP2A3 | 机器学习 | 内分泌疾病 | RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | APA组织样本、猪肾上腺、人肾上腺皮质细胞系 |
| 590 | 2024-12-05 |
Dysregulated Treg repair responses lead to chronic rejection after heart transplantation
2024-Dec-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173593
PMID:39621314
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研究论文 | 研究了心脏移植后慢性排斥反应中调节性T细胞（Tregs）和纤维母细胞之间的相互作用 | 首次揭示了IL-33在心脏移植慢性排斥反应中的作用，并发现Treg分泌的Areg促进了纤维母细胞的增殖，从而加剧了慢性排斥反应 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本的验证有限 | 探讨心脏移植后慢性排斥反应的机制 | 心脏移植后的慢性排斥反应、Tregs、纤维母细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型和临床样本 |
| 591 | 2024-12-05 |
Spatial transcriptomics deciphers the immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer with tumour thrombus
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70112
PMID:39617739
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 592 | 2024-12-05 |
Modeling metabolic-associated steatohepatitis with human pluripotent stem cell-derived liver organoids
2024-Dec-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000585
PMID:39621053
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研究论文 | 研究使用人类多能干细胞衍生的肝脏类器官模型来模拟代谢相关脂肪性肝炎（MASH） | 本研究改进了现有的肝脏类器官模型，通过详细分子特征分析和功能验证，提供了一个更精确的MASH疾病模型 | 研究中使用的类器官模型仍需进一步优化，以完全模拟人类MASH的复杂性 | 开发和验证一个改进的肝脏类器官模型，用于研究代谢相关脂肪性肝炎（MASH）的发病机制和治疗方法 | 人类多能干细胞衍生的肝脏类器官，以及MASH的分子和功能特征 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 593 | 2024-12-05 |
Gonadal sex reversal at single-cell resolution in Znrf3-deficient mice
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202707
PMID:39629665
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研究论文 | 研究了Znrf3缺陷小鼠在性决定期单细胞分辨率下的性逆转现象 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了Znrf3缺陷小鼠性逆转的转录组和细胞异质性 | NA | 进一步研究Znrf3缺陷小鼠的性逆转现象 | Znrf3缺陷小鼠的性腺 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组 | XY Znrf3缺陷小鼠的性腺细胞 |
| 594 | 2024-12-02 |
Low level exposure to BDE-47 facilitates the development of prostate cancer through TOP2A/LDHA/lactylation positive feedback circuit
2024-Dec-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2024.120094
PMID:39362459
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研究论文 | 研究低剂量BDE-47暴露通过TOP2A/LDHA/乳酸化正反馈回路促进前列腺癌发展的机制 | 首次探讨了BDE-47暴露与前列腺癌发展之间的关系，并揭示了TOP2A/LDHA/乳酸化正反馈回路在其中的作用 | NA | 探讨BDE-47暴露对前列腺癌进展的影响及其分子机制 | BDE-47暴露、前列腺癌细胞、TOP2A、LDHA、乳酸化 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接模拟 | NA | 基因表达数据 | 体外实验使用PC3和LNCaP细胞系，体内实验使用小鼠模型 |
| 595 | 2024-12-02 |
CD4+CD8αlow T Cell Clonal Expansion Dependent on Costimulation in Patients With Rheumatoid Arthritis
2024-Dec, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42960
PMID:39054665
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研究论文 | 研究了类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其对T细胞靶向治疗的反应 | 首次探讨了类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其与疾病活动的关系，并评估了靶向治疗的效果 | 样本量较小，研究对象仅包括类风湿性关节炎和银屑病关节炎患者，未涵盖其他自身免疫性疾病 | 探讨类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其对T细胞靶向治疗的反应 | 类风湿性关节炎患者和健康对照者的CD4+CD8αlow T细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA和T细胞受体序列 | 类风湿性关节炎患者3例，健康对照2例；类风湿性关节炎患者53例，银屑病关节炎患者52例，健康对照50例 |
| 596 | 2024-12-02 |
IL-1β mediated fibroblast-neutrophil crosstalk promotes inflammatory environment in skin lesions of SLE
2024-Dec, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110396
PMID:39522851
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研究论文 | 研究了系统性红斑狼疮（SLE）皮肤病变中纤维母细胞与中性粒细胞之间的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SLE病变中CXCL1纤维母细胞的独特亚群，并阐明了其与中性粒细胞的相互作用机制 | NA | 探讨SLE皮肤病变中纤维母细胞与中性粒细胞的相互作用及其在炎症环境中的作用 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者皮肤病变中的纤维母细胞和中性粒细胞 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 597 | 2024-12-02 |
Mutation-Driven Immune Microenvironments in Non-Small Cell Lung Cancer: Unrevealing Patterns through Cluster Analysis
2024-Dec, Yonsei medical journal
IF:2.6Q1
DOI:10.3349/ymj.2024.0062
PMID:39609084
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了非小细胞肺癌中不同突变类型的肿瘤微环境 | 揭示了非小细胞肺癌中不同突变类型与肿瘤微环境的密切关联，为个性化癌症诊断和治疗提供了新见解 | 研究样本仅来自21名患者，可能影响结果的普适性 | 全面分析非小细胞肺癌中主要突变类型的肿瘤微环境异质性 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | RNA-seq数据 | 64369个肿瘤组织细胞，来自21名非小细胞肺癌患者 |
| 598 | 2024-12-01 |
Cancer-cell derived S100A11 promotes macrophage recruitment in ER+ breast cancer
2024-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2429186
PMID:39587886
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研究论文 | 研究揭示了S100A11在ER+乳腺癌中促进巨噬细胞招募的作用 | 首次发现S100A11在巨噬细胞与癌细胞相互作用中的作用，并证明其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨ER+乳腺癌中巨噬细胞与癌细胞的相互作用 | ER+乳腺癌中的巨噬细胞和癌细胞 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 25个ER+乳腺癌样本 |
| 599 | 2024-12-01 |
Single-cell atlases reveal leaf cell-type-specific regulation of metal transporters in the hyperaccumulator Sedum alfredii under cadmium stress
2024-Dec-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136185
PMID:39418904
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研究论文 | 研究了镉胁迫下超积累植物Sedum alfredii叶片细胞类型的金属转运蛋白特异性调控 | 首次生成了Sedum alfredii的全长转录组，并构建了其叶片的首个单细胞图谱 | 对镉超积累的细胞类型特异性转录调控机制的理解仍有限 | 探讨镉胁迫下Sedum alfredii叶片细胞类型的特异性转录调控 | Sedum alfredii叶片在镉胁迫下的金属转运蛋白调控 | NA | NA | PacBio Iso-Seq技术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12,616个高质量单细胞样本 |
| 600 | 2024-12-01 |
Diethylhexyl phthalate induces immune dysregulation and is an environmental immune disruptor
2024-Dec-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136244
PMID:39442302
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研究论文 | 研究探讨了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯（DEHP）对免疫系统的干扰作用 | 首次全面评估了DEHP对小鼠免疫系统的单细胞RNA测序影响，并建立了小鼠盲肠结扎和穿刺模型来研究DEHP对败血症诱导的免疫抑制和器官损伤的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证DEHP的影响 | 探讨DEHP对免疫系统的干扰作用及其对急性感染和器官损伤的影响 | 小鼠的脾脏组织和免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠脾脏组织样本 |