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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2024-12-08 |
The role of the tricellular junction protein ILDR2 in glomerulopathies: Expression patterns and functional insights
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111329
PMID:39640577
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研究论文 | 研究ILDR2蛋白在肾小球疾病中的表达模式和功能 | 首次探讨了ILDR2在足细胞中的作用及其在肾小球疾病中的保护作用 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本 | 探讨ILDR2在肾小球疾病中的作用及其对血滤的影响 | ILDR2蛋白及其在足细胞中的表达和功能 | NA | 肾小球疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)、超分辨率显微镜、液相色谱-串联质谱 (LC-MS/MS) | NA | 蛋白质 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 582 | 2024-12-08 |
Molecular and functional profiling of primary normal ovarian cells defines insights into cancer development and drug responses
2024-Dec-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200903
PMID:39634630
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研究论文 | 研究通过分子和功能分析正常卵巢细胞,揭示了癌症发展和药物反应的见解 | 首次对正常卵巢细胞进行单细胞转录组学、高内涵图像细胞绘制和高通量药物测试的综合分析 | 研究仅限于两种正常卵巢细胞系和代表性的卵巢癌细胞系,可能无法完全代表所有卵巢癌的异质性 | 探讨正常卵巢细胞与卵巢癌细胞的分子特征差异,以及这些差异如何影响癌症发展和药物反应 | 正常卵巢细胞(HOSE1C和HOSE2C)和代表性的高级别浆液性卵巢癌细胞(HGSOC) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学、高内涵图像细胞绘制、高通量药物测试 | NA | 转录组数据、图像数据 | 两种正常卵巢细胞系(HOSE1C和HOSE2C)和代表性的卵巢癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 583 | 2024-12-08 |
The CCL5/CCR5/SHP2 axis sustains Stat1 phosphorylation and activates NF-κB signaling promoting M1 macrophage polarization and exacerbating chronic prostatic inflammation
2024-Dec-05, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01943-w
PMID:39633456
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研究论文 | 本研究旨在识别慢性前列腺炎(CP)中关键的细胞因子,并探讨其在驱动炎症反应中的作用 | 首次揭示了CCL5/CCR5/SHP2轴在维持Stat1磷酸化和激活NF-κB信号通路中的作用,促进M1巨噬细胞极化和加剧慢性前列腺炎炎症 | NA | 识别慢性前列腺炎中的关键细胞因子并探讨其驱动炎症反应的机制 | 慢性前列腺炎患者和实验性自身免疫性前列腺炎(EAP)模型小鼠 | NA | 前列腺疾病 | 细胞因子检测、实验性自身免疫性前列腺炎模型、药理学抑制、单细胞转录组学 | NA | 细胞因子、基因表达 | 48种细胞因子的检测面板,实验性自身免疫性前列腺炎模型小鼠,药理学抑制剂的使用 | NA | NA | NA | NA |
| 584 | 2024-12-08 |
Single-cell immune profiling and validation of PBMCs in the onset of and recovery from herpes zoster
2024-Dec-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07289-w
PMID:39633072
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了带状疱疹发病和恢复期间外周血单核细胞的免疫细胞谱 | 首次详细描述了带状疱疹发病和恢复期间免疫细胞亚群的比例变化,并通过流式细胞术和血液常规数据进行了验证 | 研究样本主要来自男性患者,可能存在性别偏倚 | 深入了解带状疱疹的发病机制 | 带状疱疹发病和恢复期间的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 带状疱疹 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和ATAC测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 主要来自男性患者的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 585 | 2024-12-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals potential key prognostic markers in hepatocellular carcinoma
2024-Dec-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01646-1
PMID:39633216
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了肝细胞癌中的潜在关键预后标志物 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术,识别出与肝细胞癌预后相关的566个基因,并筛选出11个关键基因用于预测患者的生存率 | 本研究的样本量较小,且仅基于GEO数据库的数据进行分析,可能存在一定的局限性 | 通过单细胞RNA测序分析,识别肝细胞癌患者的潜在预后标志物 | 肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | RNA测序数据 | 2208个上调基因和1447个下调基因 | NA | NA | NA | NA |
| 586 | 2024-12-08 |
Investigating the role of KARS in lung adenocarcinoma via single-cell RNA sequencing
2024-Dec-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01633-6
PMID:39625565
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了KARS在肺腺癌中的表达和功能 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了KARS在肺腺癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系 | 研究主要基于已发表的数据集,缺乏体内实验验证 | 探讨KARS在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | KARS在肺腺癌中的表达及其与临床病理特征和患者预后的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA、GTEx和GEO的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 587 | 2024-12-08 |
The characteristics and functional significance of disulfidptosis-related genes in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Dec-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01629-2
PMID:39625660
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研究论文 | 研究了二硫化物凋亡相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的特征和功能意义 | 首次通过计算机辅助生物信息学分析,揭示了二硫化物凋亡相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的表达特征和功能意义 | 研究主要基于TCGA数据和单细胞测序数据,可能存在样本偏差和数据局限性 | 探讨二硫化物凋亡相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其临床意义 | 头颈部鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境中的细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | 非负矩阵分解 (NMF) | RNA测序数据 | TCGA数据库中的头颈部鳞状细胞癌患者数据和单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 588 | 2024-12-08 |
Cross-species single-cell RNA-seq analysis reveals disparate and conserved cardiac and extracardiac inflammatory responses upon heart injury
2024-Dec-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07315-x
PMID:39627536
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研究论文 | 研究通过跨物种单细胞RNA测序分析,揭示了心脏损伤后心脏和心脏外炎症反应的差异和保守性 | 首次在斑马鱼和小鼠中进行跨物种单细胞RNA测序,比较了心脏损伤后的炎症反应,并发现了不同物种间单核细胞/巨噬细胞的转录簇差异 | 研究仅限于斑马鱼和小鼠,未涉及人类样本,可能影响结果的普适性 | 研究心脏损伤后不同物种间的炎症反应差异,探讨其对再生和纤维化过程的影响 | 斑马鱼和小鼠的心脏损伤模型 | 心血管研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼和小鼠的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 589 | 2024-12-08 |
Single-cell view and a novel protective macrophage subset in perivascular adipose tissue in T2DM
2024-Dec-03, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-024-00668-5
PMID:39627688
|
研究论文 | 研究探讨了2型糖尿病(T2DM)中血管周围脂肪组织(PVAT)的单细胞景观及其在血管病变中的作用 | 首次揭示了T2DM中PVAT中单细胞水平的显著变化,并发现了一种新的具有保护作用的Pdpn+巨噬细胞亚群 | 研究主要基于大鼠模型,未来需要进一步在人类样本中验证 | 探讨T2DM中PVAT的细胞组成和功能变化及其在血管病变中的机制 | 血管周围脂肪组织(PVAT)中的细胞组成和功能 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 正常和T2DM大鼠的PVAT中的基质血管部分(SVF) | NA | NA | NA | NA |
| 590 | 2024-12-08 |
Ketogenic diet modulates immune cell transcriptional landscape and ameliorates experimental autoimmune uveitis in mice
2024-Dec-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03308-z
PMID:39627787
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研究论文 | 研究探讨了生酮饮食对小鼠免疫细胞转录组景观的影响及其在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的缓解作用 | 首次系统研究了生酮饮食对免疫微环境的影响,特别是在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的作用 | 研究仅限于小鼠模型,结果的临床转化尚需进一步验证 | 探讨生酮饮食对免疫细胞功能和葡萄膜炎的影响 | 小鼠的淋巴结和视网膜免疫细胞 | 免疫学 | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠的淋巴结和视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 591 | 2024-12-08 |
A dataset examining technical factors on fixed white blood cell single-cell RNA-seq
2024-Dec, Data in brief
IF:1.0Q3
DOI:10.1016/j.dib.2024.111096
PMID:39633974
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研究论文 | 本文评估了两种商业平台在去红细胞全血细胞上的固定单细胞RNA测序性能 | 引入了固定单细胞RNA测序方法来解决脆弱细胞在测序中的挑战 | 需要进一步校正存储时间和固定细胞数量引入的批次和技术效应 | 评估固定单细胞RNA测序技术在脆弱细胞中的应用效果 | 去红细胞全血细胞,特别是中性粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 592 | 2024-12-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of glioblastoma reveals pericytes contributing to the blood-brain-tumor barrier and tumor progression
2024-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70014
PMID:39640361
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了胶质母细胞瘤中的周细胞,揭示了周细胞在血脑肿瘤屏障中的作用及其与肿瘤进展的关系 | 本文首次鉴定了与血脑肿瘤屏障功能相关的周细胞标记物PTH1R,并揭示了其在胶质母细胞瘤中的表达与预后的关联 | 本文主要基于单细胞RNA测序数据和细胞系实验,缺乏体内实验的直接证据 | 旨在识别与血脑肿瘤屏障相关的周细胞,并研究其在胶质母细胞瘤中的作用 | 胶质母细胞瘤中的周细胞及其在血脑肿瘤屏障中的作用 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个胶质母细胞瘤样本和正常脑组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 593 | 2024-12-08 |
Comprehensive gene set enrichment and variation analyses identify SUV39H1 as a potential prognostic biomarker for glioblastoma immunorelevance
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.016
PMID:39640533
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研究论文 | 本研究通过基因集富集分析和变异分析,识别出SUV39H1作为胶质母细胞瘤免疫相关性的潜在预后生物标志物 | 首次揭示了SUV39H1在胶质母细胞瘤中的高表达与不良预后和免疫细胞浸润的相关性,并验证了其作为预后预测和免疫治疗靶点的潜力 | 研究主要基于TCGA数据库的数据,体外实验验证样本量有限 | 探讨SUV39H1在胶质母细胞瘤中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 胶质母细胞瘤患者样本及其免疫相关性 | 数字病理学 | 脑癌 | 基因集富集分析(GSEA)和基因集变异分析(GSVA) | NA | 转录组数据 | 使用TCGA数据库中的胶质母细胞瘤转录组和临床数据,体外实验涉及U87和U251胶质母细胞瘤细胞系以及CSC1589和TS576胶质母细胞瘤干细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 594 | 2024-12-07 |
Investigating TCR-pMHC interactions for TCRs without identified epitopes by constructing a computational pipeline
2024-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.136502
PMID:39423970
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研究论文 | 本文提出了一种计算流程,结合结构信息和单细胞测序数据,研究未识别表位的TCR的表位识别机制 | 通过抗原特异性聚类,将已知表位和未知表位的TCR进行表位序列映射,并使用分子动力学模拟揭示表位识别机制 | NA | 研究TCR与pMHC相互作用的分子机制,以激活T细胞免疫反应并合理设计基于TCR的治疗方法 | 未识别表位的TCR的表位识别机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 分子动力学模拟 | 序列数据 | 614个T细胞(TCR-614)和204个T细胞(TCR-204) | NA | NA | NA | NA |
| 595 | 2024-12-01 |
Cellular diversity of human inner ear organoids revealed by single-cell transcriptomics
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202524
PMID:39612289
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了人类内耳类器官的细胞多样性 | 本文讨论了通过单细胞转录组学分析提供的新见解,有助于定义理解内耳发育的新研究路径 | 目前尚不清楚这些类器官在多大程度上模拟了体内人类内耳的发育和细胞组成 | 研究人类内耳类器官的细胞多样性及其在发育、听力损失和眩晕相关突变以及新疗法中的应用 | 人类内耳类器官及其细胞类型 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 596 | 2024-12-06 |
Dietary caloric restriction protects experimental autoimmune uveitis by regulating Teff/Treg balance
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111279
PMID:39628557
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研究论文 | 研究探讨了饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响及其机制 | 首次详细研究了饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响,并揭示了其通过调节Teff/Treg平衡来减轻疾病的机制 | 研究仅在实验小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的治疗潜力 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞数据 | 小鼠颈部引流淋巴结样本 | NA | NA | NA | NA |
| 597 | 2024-12-06 |
A transcriptome-based risk model in sepsis enables prognostic prediction and drug repositioning
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111277
PMID:39628572
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研究论文 | 本研究开发了一种基于转录组特征的脓毒症风险模型,用于早期风险分层和药物再定位 | 该模型在脓毒症诊断和预后方面表现优异,揭示了高风险患者的免疫抑制状态和低风险患者对氢化可的松的反应不佳,并通过单细胞转录组分析进一步阐明了四个基因在免疫细胞类型中的表达模式和效应 | NA | 开发一种基于转录组特征的脓毒症风险模型,用于早期风险分层和药物再定位 | 脓毒症患者的风险分层和药物再定位 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组分析 | 风险评分模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 598 | 2024-12-06 |
Complete Genomic Landscape Reveals Hidden Evolutionary History and Selection Signature in Asian Water Buffaloes (Bubalus bubalis)
2024-Dec-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407615
PMID:39630943
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研究论文 | 研究揭示了亚洲水牛(Bubalus bubalis)的完整基因组图谱,揭示了其隐藏的进化历史和选择特征 | 首次对470个驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组进行了测序和整合,揭示了驯化和生产力的遗传决定因素 | NA | 识别亚洲水牛驯化和生产力的遗传决定因素 | 驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 470个驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 599 | 2024-12-06 |
Neutrophil-based single-cell sequencing combined with transcriptome sequencing to explore a prognostic model of sepsis
2024-12-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80791-7
PMID:39622858
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和转录组测序数据,构建了一个基于中性粒细胞的脓毒症预后模型 | 本研究首次结合单细胞测序和转录组测序数据,构建了一个基于中性粒细胞的脓毒症预后模型,并展示了其强大的预测准确性 | 本研究依赖于公开数据库的数据,可能存在数据质量和样本偏差的问题 | 探索脓毒症的分子机制,并构建一个有效的预后模型 | 脓毒症患者的中性粒细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序、转录组测序 | Lasso回归模型 | 单细胞数据、基因表达数据 | 脓毒症患者的单细胞和基因表达数据来自公开数据库,具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 600 | 2024-12-06 |
Multi-omics joint screening of biomarkers related to M2 macrophages in gastric cancer
2024-Dec-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01623-8
PMID:39623254
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研究论文 | 本研究通过多组学联合筛选胃癌中与M2巨噬细胞相关的生物标志物,并构建诊断模型 | 本研究首次通过多组学分析筛选出与M2巨噬细胞相关的三个生物标志物,并构建了基于这些标志物的诊断模型 | 本研究主要基于公共数据库的数据进行分析,缺乏体内实验验证 | 探索胃癌中M2巨噬细胞作为生物标志物的潜力,并构建诊断模型 | 胃癌中的M2巨噬细胞及相关生物标志物 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、差异表达基因筛选(DESeq2)、差异表达蛋白筛选(limma) | 诊断模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 4146个差异表达基因和1946个差异表达蛋白 | NA | NA | NA | NA |