单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 696 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2024-12-06 |
Complete Genomic Landscape Reveals Hidden Evolutionary History and Selection Signature in Asian Water Buffaloes (Bubalus bubalis)
2024-Dec-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407615
PMID:39630943
|
研究论文 | 研究揭示了亚洲水牛（Bubalus bubalis）的完整基因组图谱，揭示了其隐藏的进化历史和选择特征 | 首次对470个驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组进行了测序和整合，揭示了驯化和生产力的遗传决定因素 | NA | 识别亚洲水牛驯化和生产力的遗传决定因素 | 驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 470个驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 582 | 2024-12-06 |
Neutrophil-based single-cell sequencing combined with transcriptome sequencing to explore a prognostic model of sepsis
2024-12-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80791-7
PMID:39622858
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序和转录组测序数据，构建了一个基于中性粒细胞的脓毒症预后模型 | 本研究首次结合单细胞测序和转录组测序数据，构建了一个基于中性粒细胞的脓毒症预后模型，并展示了其强大的预测准确性 | 本研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据质量和样本偏差的问题 | 探索脓毒症的分子机制，并构建一个有效的预后模型 | 脓毒症患者的中性粒细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序、转录组测序 | Lasso回归模型 | 单细胞数据、基因表达数据 | 脓毒症患者的单细胞和基因表达数据来自公开数据库，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 583 | 2024-12-06 |
Multi-omics joint screening of biomarkers related to M2 macrophages in gastric cancer
2024-Dec-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01623-8
PMID:39623254
|
研究论文 | 本研究通过多组学联合筛选胃癌中与M2巨噬细胞相关的生物标志物，并构建诊断模型 | 本研究首次通过多组学分析筛选出与M2巨噬细胞相关的三个生物标志物，并构建了基于这些标志物的诊断模型 | 本研究主要基于公共数据库的数据进行分析，缺乏体内实验验证 | 探索胃癌中M2巨噬细胞作为生物标志物的潜力，并构建诊断模型 | 胃癌中的M2巨噬细胞及相关生物标志物 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、差异表达基因筛选（DESeq2）、差异表达蛋白筛选（limma） | 诊断模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 4146个差异表达基因和1946个差异表达蛋白 | NA | NA | NA | NA |
| 584 | 2024-12-06 |
Cross-species single-cell analysis reveals divergence and conservation of peripheral blood mononuclear cells
2024-Dec-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-11030-6
PMID:39623297
|
研究论文 | 本文通过跨物种单细胞转录组测序分析，揭示了外周血单核细胞在不同物种间的差异和保守性 | 首次在12个物种中进行外周血单核细胞的单细胞转录组比较分析，揭示了免疫细胞在进化过程中的保守性和特异性 | NA | 研究免疫细胞在不同物种间的进化保守性和差异 | 外周血单核细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 12个物种的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 585 | 2024-12-06 |
SMART: spatial transcriptomics deconvolution using marker-gene-assisted topic model
2024-Dec-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03441-1
PMID:39623485
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SMART的空间转录组解卷积方法，通过标记基因辅助主题模型同时推断每个点的细胞类型特异性基因表达谱和细胞组成 | SMART方法在现实环境中优于现有方法，并提供两阶段方法以增强对细胞亚型的性能 | NA | 开发一种新的空间转录组解卷积方法，以提高细胞类型特异性基因表达和细胞组成的推断精度 | 空间转录组数据中的细胞类型特异性基因表达和细胞组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 主题模型 | 基因表达数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 586 | 2024-12-06 |
Prediction of Tumor-Associated Macrophages and Immunotherapy Benefits Using Weakly Supervised Contrastive Learning in Breast Cancer Pathology Images
2024-Dec, Journal of imaging informatics in medicine
DOI:10.1007/s10278-024-01166-y
PMID:38886290
|
研究论文 | 本文提出了一种结合对比学习和弱监督学习的方法，用于从乳腺癌病理图像中预测肿瘤相关巨噬细胞和免疫治疗效果 | 本文首次将对比学习和弱监督学习应用于病理图像分析，以量化预测肿瘤浸润免疫细胞，特别是巨噬细胞的浸润水平 | 本文的实验主要基于乳腺癌数据，未来需要验证该方法在其他癌症类型中的适用性 | 研究旨在通过病理图像分析预测肿瘤免疫微环境中的免疫细胞浸润情况，以及评估免疫治疗效果 | 研究对象为乳腺癌病理图像中的肿瘤相关巨噬细胞和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 对比学习 | 对比学习模型 | 图像 | 两个独立的乳腺癌队列和空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 587 | 2024-12-06 |
Dynamic single-cell sequencing unveils the tumor microenvironment evolution of gastric cancer abdominal wall metastases during radiotherapy
2024-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16308
PMID:39327670
|
研究论文 | 研究了放射治疗对胃癌腹壁转移瘤微环境的影响，通过单细胞RNA和T细胞受体测序分析了细胞组成和功能的变化 | 揭示了放射治疗期间胃癌腹壁转移瘤微环境中细胞组成和功能的动态变化，特别是免疫检查点基因的上调和T淋巴细胞的减少 | 仅基于一个患者的样本，结果的普适性有限 | 探讨放射治疗如何重塑胃癌腹壁转移瘤的微环境，以促进抗肿瘤免疫 | 胃癌腹壁转移瘤的微环境及其在放射治疗期间的动态变化 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA数据，T细胞受体数据 | 一个患者的四个肿瘤样本，分别在基线和放射治疗期间采集 | NA | NA | NA | NA |
| 588 | 2024-12-06 |
Single-cell sequencing insights into the transcriptional landscape of Parkinson's disease
2024-Dec, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102553
PMID:39454761
|
综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术在帕金森病研究中的应用，探讨了这些技术在揭示疾病细胞异质性和分子特征方面的最新进展 | 本文介绍了单细胞T细胞受体测序和单细胞B细胞受体测序技术在帕金森病研究中的应用，提供了对免疫组库多样性的新见解 | 本文主要讨论了单细胞测序技术在帕金森病研究中的应用，但未深入探讨这些技术的局限性 | 探讨单细胞测序技术在帕金森病研究中的应用，揭示疾病的细胞异质性和分子机制 | 帕金森病中的退行性神经元、激活的神经胶质细胞和促炎性免疫细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq）、单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 589 | 2024-12-06 |
Identifying T-cell clubs by embracing the local harmony between TCR and gene expressions
2024-Dec, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00070-5
PMID:39496799
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TCRclub的新方法，通过整合单细胞RNA测序数据和单细胞TCR测序数据，利用局部和谐性来识别功能相似的T细胞群 | TCRclub方法在整合TCR和基因表达数据方面具有创新性，能够识别功能相似的T细胞群 | NA | 开发一种有效的方法来整合TCR和基因表达数据，以识别功能相似的T细胞群，从而为癌症和传染病开发更有效的免疫治疗策略 | T细胞、TCR和基因表达数据 | 生物信息学 | 癌症、传染病 | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | 局部和谐性模型 | 基因表达数据、TCR数据 | 298,106个T细胞，涵盖七种不同疾病的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 590 | 2024-12-06 |
Cutaneous T cell lymphoma atlas reveals malignant TH2 cells supported by a B cell-rich tumor microenvironment
2024-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-02018-1
PMID:39558094
|
研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学分析皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）患者的皮肤样本，揭示了恶性TH2细胞与B细胞丰富的肿瘤微环境之间的关系 | 首次揭示了恶性CTCL细胞通过T辅助2（T2）细胞免疫基因程序的共选择，并模拟肿瘤微环境以支持其生存，同时发现了与疾病进展相关的B细胞富集 | 研究仅限于皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL），未涵盖其他类型的淋巴瘤 | 揭示皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）中恶性TH2细胞与肿瘤微环境的关系，并寻找潜在的诊断标志物和治疗策略 | 皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）患者的皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞和空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 三个独立患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 591 | 2024-12-06 |
Molecular characterization and sub-retinal transplantation of hypoimmunogenic human retinal sheets in a minipig model of severe photoreceptor degeneration
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.203071
PMID:39633598
|
研究论文 | 研究使用低免疫原性的人类视网膜片在小型猪模型中进行亚视网膜移植，以治疗严重的光感受器退化 | 利用低免疫原性的诱导多能干细胞生成自发极化的视网膜片，并通过单细胞RNA测序分析其发育过程 | 移植的视网膜片在功能上仍处于不成熟阶段，且研究样本量较小 | 开发治疗视网膜退行性疾病的新方法 | 视网膜片及其在光感受器退化模型中的移植效果 | 数字病理学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及一只移植的小型猪 | NA | NA | NA | NA |
| 592 | 2024-12-05 |
Artesunate remarkably alleviates interstitial cystitis/bladder pain syndrome in a murine model: Novel molecular signature deciphered by bulk tissue and single-cell transcriptomic analysis
2024-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401909R
PMID:39620925
|
研究论文 | 研究了青蒿琥酯在减轻小鼠间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中的作用，并通过bulk组织和单细胞转录组分析揭示了新的分子特征 | 首次使用单细胞RNA测序探索间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征小鼠模型的免疫微环境，并研究青蒿琥酯治疗的可能分子机制 | 需要进一步研究以确认青蒿琥酯在间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征患者中的效果 | 探索更有效的间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征治疗方法 | 小鼠间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征模型 | NA | 泌尿系统疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 593 | 2024-12-05 |
Tumor-Associated Microglia Secrete Extracellular ATP to Support Glioblastoma Progression
2024-Dec-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0018
PMID:39618248
|
研究论文 | 研究揭示了肿瘤相关小胶质细胞通过分泌胞外ATP促进胶质母细胞瘤进展的机制 | 首次发现肿瘤相关小胶质细胞在胶质母细胞瘤微环境中通过增加ATP合成酶表达和氧化磷酸化活性，分泌胞外ATP，激活P2X7受体，促进肿瘤细胞增殖和侵袭 | 研究主要基于体外和体内模型，缺乏临床试验验证 | 探讨肿瘤相关小胶质细胞在胶质母细胞瘤进展中的作用机制 | 胶质母细胞瘤患者样本、体外和体内模型 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 胶质母细胞瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 594 | 2024-12-05 |
Spatial transcriptomics deciphers the immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer with tumour thrombus
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70112
PMID:39617739
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 595 | 2024-12-05 |
Modeling metabolic-associated steatohepatitis with human pluripotent stem cell-derived liver organoids
2024-Dec-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000585
PMID:39621053
|
研究论文 | 研究使用人类多能干细胞衍生的肝脏类器官模型来模拟代谢相关脂肪性肝炎（MASH） | 本研究改进了现有的肝脏类器官模型，通过详细分子特征分析和功能验证，提供了一个更精确的MASH疾病模型 | 研究中使用的类器官模型仍需进一步优化，以完全模拟人类MASH的复杂性 | 开发和验证一个改进的肝脏类器官模型，用于研究代谢相关脂肪性肝炎（MASH）的发病机制和治疗方法 | 人类多能干细胞衍生的肝脏类器官，以及MASH的分子和功能特征 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 596 | 2024-12-05 |
Gonadal sex reversal at single-cell resolution in Znrf3-deficient mice
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202707
PMID:39629665
|
研究论文 | 研究了Znrf3缺陷小鼠在性决定期单细胞分辨率下的性逆转现象 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了Znrf3缺陷小鼠性逆转的转录组和细胞异质性 | NA | 进一步研究Znrf3缺陷小鼠的性逆转现象 | Znrf3缺陷小鼠的性腺 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组 | XY Znrf3缺陷小鼠的性腺细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 597 | 2024-12-02 |
Low level exposure to BDE-47 facilitates the development of prostate cancer through TOP2A/LDHA/lactylation positive feedback circuit
2024-Dec-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2024.120094
PMID:39362459
|
研究论文 | 研究低剂量BDE-47暴露通过TOP2A/LDHA/乳酸化正反馈回路促进前列腺癌发展的机制 | 首次探讨了BDE-47暴露与前列腺癌发展之间的关系，并揭示了TOP2A/LDHA/乳酸化正反馈回路在其中的作用 | NA | 探讨BDE-47暴露对前列腺癌进展的影响及其分子机制 | BDE-47暴露、前列腺癌细胞、TOP2A、LDHA、乳酸化 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接模拟 | NA | 基因表达数据 | 体外实验使用PC3和LNCaP细胞系，体内实验使用小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 598 | 2024-12-02 |
CD4+CD8αlow T Cell Clonal Expansion Dependent on Costimulation in Patients With Rheumatoid Arthritis
2024-Dec, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42960
PMID:39054665
|
研究论文 | 研究了类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其对T细胞靶向治疗的反应 | 首次探讨了类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其与疾病活动的关系，并评估了靶向治疗的效果 | 样本量较小，研究对象仅包括类风湿性关节炎和银屑病关节炎患者，未涵盖其他自身免疫性疾病 | 探讨类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其对T细胞靶向治疗的反应 | 类风湿性关节炎患者和健康对照者的CD4+CD8αlow T细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA和T细胞受体序列 | 类风湿性关节炎患者3例，健康对照2例；类风湿性关节炎患者53例，银屑病关节炎患者52例，健康对照50例 | NA | NA | NA | NA |
| 599 | 2024-12-02 |
IL-1β mediated fibroblast-neutrophil crosstalk promotes inflammatory environment in skin lesions of SLE
2024-Dec, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110396
PMID:39522851
|
研究论文 | 研究了系统性红斑狼疮（SLE）皮肤病变中纤维母细胞与中性粒细胞之间的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SLE病变中CXCL1纤维母细胞的独特亚群，并阐明了其与中性粒细胞的相互作用机制 | NA | 探讨SLE皮肤病变中纤维母细胞与中性粒细胞的相互作用及其在炎症环境中的作用 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者皮肤病变中的纤维母细胞和中性粒细胞 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 600 | 2024-12-02 |
Mutation-Driven Immune Microenvironments in Non-Small Cell Lung Cancer: Unrevealing Patterns through Cluster Analysis
2024-Dec, Yonsei medical journal
IF:2.6Q1
DOI:10.3349/ymj.2024.0062
PMID:39609084
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了非小细胞肺癌中不同突变类型的肿瘤微环境 | 揭示了非小细胞肺癌中不同突变类型与肿瘤微环境的密切关联，为个性化癌症诊断和治疗提供了新见解 | 研究样本仅来自21名患者，可能影响结果的普适性 | 全面分析非小细胞肺癌中主要突变类型的肿瘤微环境异质性 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | RNA-seq数据 | 64369个肿瘤组织细胞，来自21名非小细胞肺癌患者 | NA | NA | NA | NA |