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当前共找到 699 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-02-15 |
Single-cell gene regulatory network analysis for mixed cell populations
2024-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.64
PMID:41674874
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研究论文 | 本文提出了一种名为VMPLN的算法，用于从混合细胞群体的单细胞RNA测序数据中联合推断不同细胞类型的基因调控网络 | 开发了VMPLN算法，通过变分推理方法联合估计混合细胞群体中不同细胞类型的基因调控网络，避免了传统两步法（先聚类再推断）中聚类不确定性导致的网络估计不准确问题 | 未明确说明算法在计算效率或大规模数据集上的可扩展性限制 | 从单细胞RNA测序数据中准确推断混合细胞群体的基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据中的混合细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合泊松对数正态模型（MPLN），变分推理 | 单细胞RNA测序计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-02-15 |
Novel insights into immunopathogenesis and crucial biomarkers between primary open-angle glaucoma and systemic lupus erythematosus
2024-Dec, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.27
PMID:41676113
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研究论文 | 本研究通过整合分析基因表达数据，揭示了系统性红斑狼疮与原发性开角型青光眼之间的免疫病理机制关联，并识别了关键生物标志物和潜在治疗药物 | 首次通过多组学方法（包括差异表达分析、加权基因共表达网络分析、机器学习、免疫浸润分析和单细胞转录组分析）系统性探索SLE与POAG的共同生物标志物和免疫病理机制，并利用分子对接预测潜在治疗药物 | 研究主要基于公共数据库的基因表达数据，实验验证仅在人小梁网干细胞中进行RT-qPCR，缺乏临床样本或动物模型的进一步验证 | 识别系统性红斑狼疮和原发性开角型青光眼的共同生物标志物及潜在治疗药物，阐明两者关联的免疫病理机制 | 基因表达数据（来自GEO数据库的GSE27276、GSE50772和GSE148371数据集）和人小梁网干细胞 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮和原发性开角型青光眼 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析、基因富集分析、机器学习、miRNA和转录因子分析、免疫浸润分析、单细胞转录组分析、分子对接、RT-qPCR | 机器学习（具体模型未指定） | 基因表达数据 | 基于三个GEO数据集（GSE27276、GSE50772、GSE148371），具体样本数量未明确 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 43 | 2026-02-14 |
Identifying cell-type-specific spatially variable genes with ctSVG
2024-Dec-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5655066/v1
PMID:39764138
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研究论文 | 本文提出了一种名为ctSVG的计算方法，专门用于在单细胞分辨率下识别细胞类型特异性空间可变基因 | 开发了ctSVG方法，能够准确分配Visium方块至细胞，并识别出与样本范围SVGs或细胞类型标记基因不重叠的新基因，从而更充分利用空间位置信息 | NA | 旨在解决先前方法在识别空间可变基因时未能充分利用空间位置信息的问题 | Visium HD空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间转录组学平台 |
| 44 | 2026-02-13 |
Transcriptomic Analysis of Air-Liquid Interface Culture in Human Lung Organoids Reveals Regulators of Epithelial Differentiation
2024-12-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13231991
PMID:39682739
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序全面分析了气液界面培养对人类肺类器官上皮细胞分化的影响 | 利用单细胞RNA测序技术首次系统揭示了气液界面培养如何通过调控特定信号通路促进纤毛细胞分化 | 研究仅基于体外类器官模型，未在体内验证；样本量相对有限 | 识别影响上皮细胞分化的关键因素，以开发体外呼吸模型 | 人类肺类器官中的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-02-13 |
Electroacupuncture Slows Experimental Myopia Progression by Improving Retinal Mitochondrial Function: A Study Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400269
PMID:39404059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，建立了透镜诱导型近视（LIM）及电针（EA）干预下豚鼠视网膜细胞的完整图谱，并揭示了EA通过改善视网膜线粒体功能来减缓实验性近视进展的潜在机制 | 首次在单细胞水平上建立了LIM和EA干预下豚鼠视网膜的综合图谱，并发现了EA通过上调视锥细胞和Müller胶质细胞中线粒体呼吸链相关基因（如COX3、ND4、ND2）的表达来改善视网膜线粒体功能，从而减缓近视进展 | 研究仅在豚鼠模型中进行，结果是否适用于人类近视尚需进一步验证；研究主要基于基因表达分析，功能验证实验相对有限 | 探索电针（EA）减缓实验性近视进展的潜在分子机制 | 透镜诱导型近视（LIM）的豚鼠模型 | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及LIM和EA处理的豚鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2026-02-13 |
Age-Related ECM Stiffness Mediates TRAIL Activation in Muscle Stem Cell Differentiation
2024-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400334
PMID:39601528
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研究论文 | 本研究探讨了年龄相关的细胞外基质硬化如何通过TRAIL通路影响肌肉干细胞分化，揭示了其在肌肉再生障碍中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和体外基质工程，系统解析了年龄和基质硬度对肌肉干细胞分化的协同影响，并发现TRAIL通路在年龄相关纤维化群体中的特异性激活 | 研究主要基于体外模型和动物实验，人类肌肉组织的直接证据尚不充分；BAPN治疗的长期效果和副作用未深入评估 | 阐明年龄相关ECM硬化导致肌肉干细胞功能障碍的分子机制 | 年轻和年老小鼠的肌肉干细胞 | 单细胞组学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老肌肉干细胞在软/硬基质上的四组对比实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-02-09 |
Single-cell RNA sequencing of appendiceal adenocarcinoma reveals a low proportion of epithelial cells and a fibroblast enriched tumor microenvironment
2024-Dec, ESMO gastrointestinal oncology
DOI:10.1016/j.esmogo.2024.100094
PMID:41646948
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，首次对阑尾腺癌的肿瘤微环境进行了深入分析，揭示了其与结直肠癌的差异 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于阑尾腺癌研究，揭示了其肿瘤微环境中成纤维细胞的富集特征和独特的细胞组成 | 样本量较小（仅3例阑尾腺癌和1例结直肠癌患者），可能限制结果的普遍性 | 探索阑尾腺癌的单细胞水平特征，以支持其作为独立疾病实体的分类 | 阑尾腺癌和结直肠癌患者的腹膜转移样本 | 数字病理学 | 阑尾腺癌 | 单细胞RNA测序 | k-means聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 3例阑尾腺癌和1例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5' 单细胞RNA测序 |
| 48 | 2026-02-07 |
Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-related platelet bias: implications for bone marrow transplantation and blood disorders
2024-12-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04084-6
PMID:39623507
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综述 | 本文综述了造血干细胞（HSCs）的异质性，特别是与年龄相关的血小板偏向性（P-HSCs），并探讨了其对骨髓移植和血液疾病的临床意义 | 聚焦于Claus Nerlov团队的研究，揭示了血小板偏向性HSCs在物种间的进化保守性及其在衰老过程中的扩增 | 讨论了当前研究方法（如单细胞RNA测序和分子条形码技术）的局限性，并提出了未来研究方向 | 优化基于HSC的疗法，改善血液疾病的临床结果 | 造血干细胞（HSCs），特别是血小板偏向性HSCs（P-HSCs） | NA | 血液疾病 | 单细胞RNA测序，分子条形码 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2026-02-05 |
Imaging spatial transcriptomics reveals molecular patterns of vulnerability to pathology in a transgenic α-synucleinopathy model
2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.31.606032
PMID:39372781
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研究论文 | 本研究利用成像空间转录组学技术，结合免疫荧光分析，在转基因α-突触核蛋白病小鼠模型中揭示了特定神经元亚型对病理的易感性及其分子机制 | 首次将成像空间转录组学与下游免疫荧光技术结合，在同一组织切片中识别出易受α-突触核蛋白磷酸化病理影响的神经元亚型，并揭示了相关转录调控机制 | 研究基于转基因小鼠模型，可能无法完全模拟人类疾病的所有特征，且样本量未明确说明 | 探究帕金森病和路易体痴呆中α-突触核蛋白病理选择性易感性的分子基础 | 转基因过表达人类α-突触核蛋白的小鼠模型中的皮层和海马神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 成像空间转录组学，免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 50 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Dec, Advances in neural information processing systems
DOI:10.52202/079017-1129
PMID:41551654
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研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过提供子图块图像的基因组特征，弥补了现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M数据集首次将空间转录组学数据与组织病理学图像结合，为子图块区域提供高维基因表达信息，实现了前所未有的数据粒度 | 数据集仅包含1,149张图像，可能无法覆盖所有病理类型或变异，且基因表达维度较高可能增加计算复杂度 | 旨在推动多模态数据分析在计算病理学等领域的先进研究 | 空间转录组学数据衍生的组织病理学图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 51 | 2026-01-23 |
Inflammation and mechanical force-induced bone remodeling
2024-Dec-30, Periodontology 2000
IF:17.5Q1
DOI:10.1111/prd.12619
PMID:39740162
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综述 | 本文综述了炎症和机械力诱导的骨重塑过程，重点关注牙周炎和正畸牙齿移动中的细胞作用 | 利用单细胞RNA测序技术的新进展，深入探讨了不同细胞类型在炎症和机械力驱动的骨重塑中的作用和相互作用，并分析了这两种条件（慢性炎症与急性瞬时炎症）的联合效应 | NA | 探讨炎症和机械力在骨重塑中的作用机制，特别是在牙周炎和正畸牙齿移动中的细胞和分子基础 | 宿主免疫细胞（角质形成细胞、白细胞、基质细胞、骨细胞、成骨细胞、破骨细胞）及其在骨重塑中的功能 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-01-22 |
Matrine induces V-ATPase-dependent cytoplasmic vacuolation and inhibits the function of the lysosome in leukemia cells
2024-Dec, Pharmaceutical science advances
DOI:10.1016/j.pscia.2023.100013
PMID:41550167
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研究论文 | 本文研究了苦参碱通过诱导V-ATPase依赖性细胞质空泡化并抑制溶酶体功能来抑制白血病细胞增殖的新分子机制 | 揭示了苦参碱通过质子化激活V-ATPase导致溶酶体功能抑制和空泡形成的新机制 | NA | 探究苦参碱抑制白血病细胞增殖的分子机制 | 白血病细胞 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序, 透射电子显微镜, 荧光显微镜, 蛋白质印迹, 流式细胞术 | NA | RNA-seq数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-01-21 |
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Dec-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5398491/v1
PMID:39711562
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DBiTplus的整合多模态空间组学方法，结合了基于测序的空间转录组学和基于成像的空间蛋白质分析，用于在同一组织切片上进行单细胞分辨率细胞分型和基因组尺度生物通路研究 | 开发了DBiTplus方法，首次在同一组织切片上整合了测序和成像两种空间组学技术，实现了单细胞分辨率的转录组和蛋白质组空间图谱构建 | 在应用示例中，小鼠胚胎研究使用了有限的蛋白质标记物，可能限制了蛋白质分析的全面性 | 开发一种整合多模态空间组学方法，以在同一组织切片上同时分析转录组和蛋白质组空间信息 | 小鼠胚胎、正常人类淋巴结、人类淋巴瘤FFPE组织 | 空间组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质分析、微流体技术 | NA | 空间转录组数据、蛋白质成像数据 | 多个组织样本，包括小鼠胚胎、人类淋巴结和淋巴瘤FFPE组织 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质分析 | DBiTplus、CODEX | DBiTplus整合了测序和成像技术，CODEX用于高多重蛋白质成像 |
| 54 | 2026-01-14 |
Human-Mouse Chimeric Brain Models to Study Human Glial-Neuronal and Macroglial-Microglial Interactions
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.03.601990
PMID:39005270
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研究论文 | 本文介绍了一种通过共移植人类诱导多能干细胞衍生的神经细胞构建人鼠嵌合脑模型的方法，用于在体内研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用 | 创新性地开发了人鼠嵌合脑模型，通过共移植人类诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞和原始巨噬细胞祖细胞，首次在体内同时模拟人类小胶质细胞、大胶质细胞和神经元的相互作用 | 模型基于小鼠脑环境，可能无法完全复制人类脑的复杂生理条件，且移植细胞的长期行为和功能稳定性需进一步验证 | 研究人类神经胶质细胞与神经元在体内的相互作用机制，以揭示脑功能复杂性并为神经系统疾病治疗提供新见解 | 人类诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞、原始巨噬细胞祖细胞及其在鼠脑中的共移植模型 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、超分辨率成像、3D重建技术 | 人鼠嵌合脑模型 | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-12-28 |
Failure of metabolic checkpoint control during late-stage granulopoiesis drives neutropenia in reticular dysgenesis
2024-Dec-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024123
PMID:39378586
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研究论文 | 本文研究了线粒体腺苷酸激酶2功能缺失导致网状发育不全的严重免疫缺陷综合征，揭示了代谢检查点在造血分化中的调控作用 | 通过结合患者单细胞转录组学和CRISPR模型，首次揭示了AK2缺陷在不同造血阶段对代谢检查点的影响差异，特别是在晚期粒细胞生成中导致代谢失衡的新机制 | 研究主要基于体外模型和患者样本，可能无法完全模拟体内复杂的造血微环境，且机制细节仍需进一步验证 | 探究代谢检查点在造血分化过程中维持代谢稳态的调控网络 | 网状发育不全患者样本和原代人造血干细胞CRISPR模型 | NA | 免疫缺陷综合征 | 单细胞转录组学, CRISPR基因编辑 | CRISPR模型 | 转录组数据 | 患者样本和原代细胞模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2025-12-24 |
Turncoat antibodies unmasked in a model of autoimmune demyelination: from biology to therapy
2024-Dec-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.623846
PMID:39677612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自身免疫性脑脊髓炎模型中产生致病性抗体的浆母细胞特性，并开发了一种新型抗体疗法来中和这些致病抗体 | 首次在EAE模型中发现分泌致病性抗体的滤泡外浆母细胞，并利用合成抗体8-18C5及其变体成功阻断致病抗体结合，为自身免疫性疾病提供了新的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类MOGAD患者的验证数据有限，且抗体疗法的长期安全性和有效性需进一步评估 | 开发选择性中和致病性自身抗体的疗法，并深入理解自身免疫性脑脊髓炎模型中抗体反应的生物学特性 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型和MOG抗体疾病（MOGAD）患者样本 | NA | 自身免疫性脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-12-22 |
Reprogramming of cells during embryonic transfating: overcoming a reprogramming block
2024-Dec-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.203152
PMID:39628450
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了海胆胚胎中细胞在缺失微球细胞后的重编程过程，并发现信号时序对色素细胞恢复的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术实时追踪胚胎细胞在转命运过程中的基因调控状态转变，并揭示Delta信号在Nodal信号之前表达可克服重编程障碍 | 研究仅针对海胆胚胎模型，未验证其他动物胚胎中的普适性 | 探究胚胎调节性发育中细胞替代能力的分子机制 | 海胆胚胎细胞（特别是微球细胞缺失后的早期内胚层细胞） | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及多个时间点的海胆胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2025-12-14 |
Supervised Screening of EGFR Inhibitors Validated through Computational Structural Biology Approaches
2024-Dec-12, ACS medicinal chemistry letters
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acsmedchemlett.4c00385
PMID:39691517
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法，筛选并验证了针对乳腺癌中EGFR过表达的有效抑制剂 | 结合多组学数据（CCLE、GDSC、scRNA-seq）与机器学习相似性搜索，并通过计算结构生物学方法验证候选化合物的分子相互作用和构象动力学 | 研究主要基于计算和体外数据，缺乏体内实验验证和临床前模型评估 | 识别和验证针对乳腺癌EGFR过表达的有效治疗化合物 | 乳腺癌细胞系数据、ChEMBL数据库中的化合物 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、机器学习建模 | 支持向量机（SVM）、人工神经网络（ANN）、随机森林（RF） | 多组学数据（基因表达、药物敏感性）、化学化合物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2025-12-13 |
Targeting SHCBP1 Inhibits Tumor Progression by Restoring Ciliogenesis in Ductal Carcinoma
2024-Dec-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1095
PMID:39312205
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研究论文 | 本研究揭示了SHCBP1通过调控Rab8 GTPase活性影响中体残余物与中心体的接近，从而抑制导管癌中纤毛发生，并证明靶向SHCBP1可恢复纤毛发生并抑制肿瘤进展 | 首次发现SHCBP1通过调控Rab8 GTPase活性介导中体残余物与中心体接近，从而控制导管癌纤毛发生的新机制 | 研究主要基于动物模型和患者来源异种移植模型，尚未在人体临床试验中验证 | 阐明导管癌中纤毛缺失的机制及其临床意义，开发新的治疗策略 | 导管癌 | 肿瘤生物学 | 导管癌 | 单细胞转录组分析、基因敲除、患者来源异种移植模型 | 转基因小鼠模型、PDX模型 | 转录组数据、临床预后数据 | 大型患者队列及转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2025-12-13 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Pseudo-temporal Dynamic Evolution Characteristics of ADSCs to Neuronal Differentiation
2024-Dec-11, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-024-01524-y
PMID:39661257
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了脂肪来源基质细胞向神经元分化的伪时间动态演化特征 | 首次在单细胞分辨率下描绘了ADSCs向神经元分化的连续动态基因表达图谱，并识别出两个不同的细胞状态机制 | 研究仅基于体外诱导模型，未验证体内分化潜力；样本时间点覆盖有限，可能遗漏关键过渡状态 | 解析ADSCs向神经元分化的遗传特征与动态演化过程 | 脂肪来源基质细胞及其在不同诱导时间点（0、1、3、5、6、8小时）的衍生细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病（帕金森病相关） | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析（Monocle2） | 单细胞转录组数据 | 38,453个细胞，涵盖8个时间点组别 | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析平台 |