单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 702 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2024-12-08 |
Cross-species single-cell RNA-seq analysis reveals disparate and conserved cardiac and extracardiac inflammatory responses upon heart injury
2024-Dec-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07315-x
PMID:39627536
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研究论文 | 研究通过跨物种单细胞RNA测序分析，揭示了心脏损伤后心脏和心脏外炎症反应的差异和保守性 | 首次在斑马鱼和小鼠中进行跨物种单细胞RNA测序，比较了心脏损伤后的炎症反应，并发现了不同物种间单核细胞/巨噬细胞的转录簇差异 | 研究仅限于斑马鱼和小鼠，未涉及人类样本，可能影响结果的普适性 | 研究心脏损伤后不同物种间的炎症反应差异，探讨其对再生和纤维化过程的影响 | 斑马鱼和小鼠的心脏损伤模型 | 心血管研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼和小鼠的多个样本 |
| 562 | 2024-12-08 |
Single-cell view and a novel protective macrophage subset in perivascular adipose tissue in T2DM
2024-Dec-03, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-024-00668-5
PMID:39627688
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研究论文 | 研究探讨了2型糖尿病（T2DM）中血管周围脂肪组织（PVAT）的单细胞景观及其在血管病变中的作用 | 首次揭示了T2DM中PVAT中单细胞水平的显著变化，并发现了一种新的具有保护作用的Pdpn+巨噬细胞亚群 | 研究主要基于大鼠模型，未来需要进一步在人类样本中验证 | 探讨T2DM中PVAT的细胞组成和功能变化及其在血管病变中的机制 | 血管周围脂肪组织（PVAT）中的细胞组成和功能 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 正常和T2DM大鼠的PVAT中的基质血管部分（SVF） |
| 563 | 2024-12-08 |
Ketogenic diet modulates immune cell transcriptional landscape and ameliorates experimental autoimmune uveitis in mice
2024-Dec-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03308-z
PMID:39627787
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研究论文 | 研究探讨了生酮饮食对小鼠免疫细胞转录组景观的影响及其在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的缓解作用 | 首次系统研究了生酮饮食对免疫微环境的影响，特别是在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床转化尚需进一步验证 | 探讨生酮饮食对免疫细胞功能和葡萄膜炎的影响 | 小鼠的淋巴结和视网膜免疫细胞 | 免疫学 | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠的淋巴结和视网膜样本 |
| 564 | 2024-12-08 |
Cell type mapping reveals tissue niches and interactions in subcortical multiple sclerosis lesions
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01796-z
PMID:39501036
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研究论文 | 研究使用单核和空间转录组学技术，分析了多发性硬化症（MS）亚皮质病灶中的细胞类型及其相互作用 | 首次详细描述了MS病灶中特定组织微环境的细胞类型组成及其在慢性活动性和非活动性阶段的相互作用 | NA | 揭示多发性硬化症病灶中细胞类型的组成及其相互作用 | 多发性硬化症亚皮质病灶及其对照组织 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单核和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 565 | 2024-12-08 |
A dataset examining technical factors on fixed white blood cell single-cell RNA-seq
2024-Dec, Data in brief
IF:1.0Q3
DOI:10.1016/j.dib.2024.111096
PMID:39633974
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研究论文 | 本文评估了两种商业平台在去红细胞全血细胞上的固定单细胞RNA测序性能 | 引入了固定单细胞RNA测序方法来解决脆弱细胞在测序中的挑战 | 需要进一步校正存储时间和固定细胞数量引入的批次和技术效应 | 评估固定单细胞RNA测序技术在脆弱细胞中的应用效果 | 去红细胞全血细胞，特别是中性粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 566 | 2024-12-08 |
Integrating Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing Identifies and Validates Lactylation-Related Signatures for Intervertebral Disc Degeneration
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70262
PMID:39636180
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研究论文 | 研究揭示了乳酸化水平升高与椎间盘退变（IVDD）发展之间的复杂关联，并通过多种bulk RNA测序数据分析了相关基因的表达水平，建立了与IVDD相关的基因特征 | 首次系统分析了乳酸化相关基因（LRGs）在椎间盘退变中的作用，并确定了CBX3作为关键基因，以及atosiban acetate作为潜在的治疗候选药物 | NA | 探讨乳酸化在椎间盘退变中的作用及其相关基因特征 | 乳酸化相关基因（LRGs）及其在椎间盘退变中的表达和功能 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | RNA测序 | NA | RNA | 多种bulk RNA测序数据 |
| 567 | 2024-12-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of glioblastoma reveals pericytes contributing to the blood-brain-tumor barrier and tumor progression
2024-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70014
PMID:39640361
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了胶质母细胞瘤中的周细胞，揭示了周细胞在血脑肿瘤屏障中的作用及其与肿瘤进展的关系 | 本文首次鉴定了与血脑肿瘤屏障功能相关的周细胞标记物PTH1R，并揭示了其在胶质母细胞瘤中的表达与预后的关联 | 本文主要基于单细胞RNA测序数据和细胞系实验，缺乏体内实验的直接证据 | 旨在识别与血脑肿瘤屏障相关的周细胞，并研究其在胶质母细胞瘤中的作用 | 胶质母细胞瘤中的周细胞及其在血脑肿瘤屏障中的作用 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个胶质母细胞瘤样本和正常脑组织样本 |
| 568 | 2024-12-08 |
Comprehensive gene set enrichment and variation analyses identify SUV39H1 as a potential prognostic biomarker for glioblastoma immunorelevance
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.016
PMID:39640533
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研究论文 | 本研究通过基因集富集分析和变异分析，识别出SUV39H1作为胶质母细胞瘤免疫相关性的潜在预后生物标志物 | 首次揭示了SUV39H1在胶质母细胞瘤中的高表达与不良预后和免疫细胞浸润的相关性，并验证了其作为预后预测和免疫治疗靶点的潜力 | 研究主要基于TCGA数据库的数据，体外实验验证样本量有限 | 探讨SUV39H1在胶质母细胞瘤中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 胶质母细胞瘤患者样本及其免疫相关性 | 数字病理学 | 脑癌 | 基因集富集分析（GSEA）和基因集变异分析（GSVA） | NA | 转录组数据 | 使用TCGA数据库中的胶质母细胞瘤转录组和临床数据，体外实验涉及U87和U251胶质母细胞瘤细胞系以及CSC1589和TS576胶质母细胞瘤干细胞系 |
| 569 | 2024-12-07 |
Elevated Shear Stress Modulates Heterogenous Cellular Subpopulations to Induce Vascular Remodeling
2024-Dec, Tissue engineering. Part A
DOI:10.1089/ten.TEA.2023.0362
PMID:38753711
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研究论文 | 研究探讨了高剪切应力对血管重塑过程中异质细胞亚群的调节作用 | 首次在单细胞分辨率下全面研究高剪切应力诱导血管重塑的分子机制 | 研究仅限于动物模型，尚未在人体中验证 | 探讨高剪切应力对血管重塑的影响及其分子机制 | 血管内皮细胞和巨噬细胞 | 心血管疾病 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用大鼠隐静脉构建动静脉环路模型 |
| 570 | 2024-12-07 |
A Strategy Involving Microporous Microneedles Integrated with CAR-TREM2-Macrophages for Scar Management by Regulating Fibrotic Microenvironment
2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202406153
PMID:39313983
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研究论文 | 本文介绍了一种利用微孔微针集成CAR-TREM2-巨噬细胞的策略，通过调节纤维化微环境来管理瘢痕 | 开发了CAR-TREM2-巨噬细胞，能够靶向DPP4成纤维细胞并调节瘢痕微环境中的内皮细胞亚型，有效预防瘢痕形成 | NA | 研究通过多因素调节瘢痕微环境来抑制瘢痕形成的有效策略 | DPP4阳性成纤维细胞、内皮细胞、TREM2巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤损伤 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 571 | 2024-12-07 |
Investigating TCR-pMHC interactions for TCRs without identified epitopes by constructing a computational pipeline
2024-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.136502
PMID:39423970
|
研究论文 | 本文提出了一种计算流程，结合结构信息和单细胞测序数据，研究未识别表位的TCR的表位识别机制 | 通过抗原特异性聚类，将已知表位和未知表位的TCR进行表位序列映射，并使用分子动力学模拟揭示表位识别机制 | NA | 研究TCR与pMHC相互作用的分子机制，以激活T细胞免疫反应并合理设计基于TCR的治疗方法 | 未识别表位的TCR的表位识别机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 分子动力学模拟 | 序列数据 | 614个T细胞（TCR-614）和204个T细胞（TCR-204） |
| 572 | 2024-12-01 |
Cellular diversity of human inner ear organoids revealed by single-cell transcriptomics
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202524
PMID:39612289
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了人类内耳类器官的细胞多样性 | 本文讨论了通过单细胞转录组学分析提供的新见解，有助于定义理解内耳发育的新研究路径 | 目前尚不清楚这些类器官在多大程度上模拟了体内人类内耳的发育和细胞组成 | 研究人类内耳类器官的细胞多样性及其在发育、听力损失和眩晕相关突变以及新疗法中的应用 | 人类内耳类器官及其细胞类型 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 573 | 2024-12-06 |
Dietary caloric restriction protects experimental autoimmune uveitis by regulating Teff/Treg balance
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111279
PMID:39628557
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研究论文 | 研究探讨了饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响及其机制 | 首次详细研究了饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响，并揭示了其通过调节Teff/Treg平衡来减轻疾病的机制 | 研究仅在实验小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的治疗潜力 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞数据 | 小鼠颈部引流淋巴结样本 |
| 574 | 2024-12-06 |
A transcriptome-based risk model in sepsis enables prognostic prediction and drug repositioning
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111277
PMID:39628572
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研究论文 | 本研究开发了一种基于转录组特征的脓毒症风险模型，用于早期风险分层和药物再定位 | 该模型在脓毒症诊断和预后方面表现优异，揭示了高风险患者的免疫抑制状态和低风险患者对氢化可的松的反应不佳，并通过单细胞转录组分析进一步阐明了四个基因在免疫细胞类型中的表达模式和效应 | NA | 开发一种基于转录组特征的脓毒症风险模型，用于早期风险分层和药物再定位 | 脓毒症患者的风险分层和药物再定位 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组分析 | 风险评分模型 | 转录组数据 | NA |
| 575 | 2024-12-06 |
Complete Genomic Landscape Reveals Hidden Evolutionary History and Selection Signature in Asian Water Buffaloes (Bubalus bubalis)
2024-Dec-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407615
PMID:39630943
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研究论文 | 研究揭示了亚洲水牛（Bubalus bubalis）的完整基因组图谱，揭示了其隐藏的进化历史和选择特征 | 首次对470个驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组进行了测序和整合，揭示了驯化和生产力的遗传决定因素 | NA | 识别亚洲水牛驯化和生产力的遗传决定因素 | 驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 470个驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组 |
| 576 | 2024-12-06 |
Neutrophil-based single-cell sequencing combined with transcriptome sequencing to explore a prognostic model of sepsis
2024-12-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80791-7
PMID:39622858
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和转录组测序数据，构建了一个基于中性粒细胞的脓毒症预后模型 | 本研究首次结合单细胞测序和转录组测序数据，构建了一个基于中性粒细胞的脓毒症预后模型，并展示了其强大的预测准确性 | 本研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据质量和样本偏差的问题 | 探索脓毒症的分子机制，并构建一个有效的预后模型 | 脓毒症患者的中性粒细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序、转录组测序 | Lasso回归模型 | 单细胞数据、基因表达数据 | 脓毒症患者的单细胞和基因表达数据来自公开数据库，具体样本数量未提及 |
| 577 | 2024-12-06 |
Multi-omics joint screening of biomarkers related to M2 macrophages in gastric cancer
2024-Dec-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01623-8
PMID:39623254
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研究论文 | 本研究通过多组学联合筛选胃癌中与M2巨噬细胞相关的生物标志物，并构建诊断模型 | 本研究首次通过多组学分析筛选出与M2巨噬细胞相关的三个生物标志物，并构建了基于这些标志物的诊断模型 | 本研究主要基于公共数据库的数据进行分析，缺乏体内实验验证 | 探索胃癌中M2巨噬细胞作为生物标志物的潜力，并构建诊断模型 | 胃癌中的M2巨噬细胞及相关生物标志物 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、差异表达基因筛选（DESeq2）、差异表达蛋白筛选（limma） | 诊断模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 4146个差异表达基因和1946个差异表达蛋白 |
| 578 | 2024-12-06 |
Cross-species single-cell analysis reveals divergence and conservation of peripheral blood mononuclear cells
2024-Dec-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-11030-6
PMID:39623297
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研究论文 | 本文通过跨物种单细胞转录组测序分析，揭示了外周血单核细胞在不同物种间的差异和保守性 | 首次在12个物种中进行外周血单核细胞的单细胞转录组比较分析，揭示了免疫细胞在进化过程中的保守性和特异性 | NA | 研究免疫细胞在不同物种间的进化保守性和差异 | 外周血单核细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 12个物种的外周血单核细胞 |
| 579 | 2024-12-06 |
SMART: spatial transcriptomics deconvolution using marker-gene-assisted topic model
2024-Dec-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03441-1
PMID:39623485
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SMART的空间转录组解卷积方法，通过标记基因辅助主题模型同时推断每个点的细胞类型特异性基因表达谱和细胞组成 | SMART方法在现实环境中优于现有方法，并提供两阶段方法以增强对细胞亚型的性能 | NA | 开发一种新的空间转录组解卷积方法，以提高细胞类型特异性基因表达和细胞组成的推断精度 | 空间转录组数据中的细胞类型特异性基因表达和细胞组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 主题模型 | 基因表达数据 | 多个数据集 |
| 580 | 2024-12-06 |
Prediction of Tumor-Associated Macrophages and Immunotherapy Benefits Using Weakly Supervised Contrastive Learning in Breast Cancer Pathology Images
2024-Dec, Journal of imaging informatics in medicine
DOI:10.1007/s10278-024-01166-y
PMID:38886290
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研究论文 | 本文提出了一种结合对比学习和弱监督学习的方法，用于从乳腺癌病理图像中预测肿瘤相关巨噬细胞和免疫治疗效果 | 本文首次将对比学习和弱监督学习应用于病理图像分析，以量化预测肿瘤浸润免疫细胞，特别是巨噬细胞的浸润水平 | 本文的实验主要基于乳腺癌数据，未来需要验证该方法在其他癌症类型中的适用性 | 研究旨在通过病理图像分析预测肿瘤免疫微环境中的免疫细胞浸润情况，以及评估免疫治疗效果 | 研究对象为乳腺癌病理图像中的肿瘤相关巨噬细胞和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 对比学习 | 对比学习模型 | 图像 | 两个独立的乳腺癌队列和空间转录组数据 |