单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
541	2024-11-15	SNRPB2 in the pan-cancer landscape: A bioinformatics exploration and validation in hepatocellular carcinoma 2024-Dec, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111445 PMID:39366532	研究论文	本文探讨了SNRPB2在泛癌中的作用，并通过实验验证了其在肝细胞癌中的影响	首次系统研究了SNRPB2在多种癌症中的表达及其与预后和免疫微环境的关系，并通过实验验证了其对肝癌细胞增殖和迁移的影响	需要进一步研究SNRPB2的潜在机制和临床治疗潜力	探讨SNRPB2在癌症中的作用及其作为预后标志物和免疫治疗候选者的潜力	SNRPB2在多种癌症中的表达及其对肝癌细胞增殖和迁移的影响	数字病理学	肝癌	基因表达分析、基因组和表观基因组分析、基因集富集分析、免疫细胞浸润评估	NA	基因表达数据、基因组数据、表观基因组数据	来自多个公共数据库的数据，包括TCGA、CPTAC和GEO
542	2024-11-15	Identification and Verification of Key Genes in Colorectal Cancer Liver Metastases Through Analysis of Single-Cell Sequencing Data and TCGA Data 2024-Dec, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1 DOI:10.1245/s10434-024-16194-9 PMID:39382748	研究论文	本研究通过单细胞测序数据和TCGA数据分析，识别和验证结直肠癌肝转移中的关键基因	本研究首次通过单细胞RNA测序数据和TCGA数据结合，识别出结直肠癌肝转移中的关键基因，并进行了实验验证	研究主要基于现有数据库和实验验证，未涉及大规模临床试验	识别结直肠癌肝转移中的关键基因，为治疗提供潜在靶点	结直肠癌肝转移样本和相关基因	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	17个结直肠癌肝转移样本
543	2024-11-15	Hidden liver-joint axis: HBV infection causes rheumatoid arthritis via TRAFD1 with imbalance of HBV X protein and trans-ferulic acid 2024-Dec, Virulence IF:5.5Q1 DOI:10.1080/21505594.2024.2422540 PMID:39484999	研究论文	研究HBV感染通过TRAFD1和HBV X蛋白与反式阿魏酸的不平衡导致类风湿性关节炎的机制	揭示了HBV感染与类风湿性关节炎之间的关联，并发现反式阿魏酸通过抑制TRAFD1表达缓解HBx诱导的类风湿性关节炎	研究主要基于小鼠模型和细胞实验，需要进一步的人体临床验证	探讨HBV感染与类风湿性关节炎之间的关系及其潜在机制	HBV感染、类风湿性关节炎、TRAFD1、HBV X蛋白、反式阿魏酸	生物医学	类风湿性关节炎	孟德尔随机化分析、单细胞转录组分析、代谢组学、WGCNA	NA	转录组数据、代谢数据	HBV-RA患者、HBV转基因、HBx转基因和TRADF1敲除小鼠
544	2024-11-15	Deciphering the cellular landscape and potential targets of nasopharyngeal and oral cancers using single-cell RNA sequencing 2024-Dec, Cell biology international IF:3.3Q3 DOI:10.1002/cbin.12236 PMID:39205595	研究论文	使用单细胞RNA测序技术研究鼻咽癌和口腔癌的细胞异质性及其潜在治疗靶点	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了鼻咽癌和口腔癌的肿瘤微环境中的细胞多样性及其相互作用，并发现MHC-II高表达的上皮细胞亚群与良好的预后和CD4 T细胞浸润相关	研究仅限于鼻咽癌和口腔癌，未涉及其他类型的癌症	揭示鼻咽癌和口腔癌的细胞异质性及其潜在治疗靶点	鼻咽癌和口腔癌的肿瘤微环境中的细胞类型及其相互作用	数字病理学	头颈部癌症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
545	2024-11-13	Spatial domains identification in spatial transcriptomics using modality-aware and subspace-enhanced graph contrastive learning 2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.csbj.2024.10.029 PMID:39507820	研究论文	本文提出了一种基于图对比学习和子空间分析的框架GRAS4T，用于空间转录组学中的空间域识别	结合对比学习和子空间分析模型，通过捕捉同一域内点的自表达性来准确区分不同的空间域	NA	开发一种新的方法来提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性	空间转录组学数据中的空间域	空间转录组学	NA	图对比学习	图对比学习框架	空间转录组数据	八个来自五个不同平台的空间转录组数据集
546	2024-11-06	TNFα has differential effects on the transcriptome profile of selected populations in murine cartilage 2024-Dec, Osteoarthritis and cartilage open DOI:10.1016/j.ocarto.2024.100528 PMID:39494399	研究论文	研究探讨了肿瘤坏死因子α（TNFα）对小鼠软骨细胞转录组的影响	首次在单细胞分辨率下分析了TNFα对软骨细胞转录组的影响，并揭示了其对不同细胞群的差异性作用	研究仅限于新生C57BL/6小鼠的软骨细胞，未涉及其他物种或年龄段的小鼠	深入理解肿瘤坏死因子α（TNFα）在软骨细胞炎症反应中的作用	新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞	数字病理学	NA	RNA测序（RNA-Seq）	NA	基因表达数据	14,239个细胞和24,320个基因
547	2024-11-02	Transcriptomic Evaluation of a Stress Vulnerability Network Using Single-Cell RNA Sequencing in Mouse Prefrontal Cortex 2024-Dec-01, Biological psychiatry IF:9.6Q1 DOI:10.1016/j.biopsych.2024.05.023 PMID:38866174	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序评估了小鼠前额叶皮层的应激脆弱性网络的转录组特征	首次识别出与大脑潜在应激脆弱状态相关的细胞类型和基因	样本量较小，仅包括12只C57BL/6小鼠	探讨应激脆弱性与情绪障碍（如抑郁症）之间的关系及其分子机制	小鼠前额叶皮层的单细胞RNA测序数据	数字病理学	抑郁症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	12只C57BL/6小鼠
548	2024-11-02	ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost 2024-Dec, Microbiological research IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.micres.2024.127912 PMID:39326350	研究论文	研究了β-葡聚糖训练对鱼类肠道Th17细胞在爱德华氏菌感染引起的肠道炎症中的作用	首次揭示了β-葡聚糖训练可以保留和恢复肠道Th17细胞的功能，从而缓解细菌感染引起的肠道炎症	NA	探讨鱼类肠道免疫细胞在细菌感染下的调节机制	鱼类肠道Th17细胞在爱德华氏菌感染下的功能变化	免疫学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	NA
549	2024-10-30	Integrating multiomics and Single-Cell communication analysis to uncover Ankylosing spondylitis mechanisms 2024-Dec-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113276 PMID:39357209	研究论文	本文通过整合多组学和单细胞通信分析，揭示了强直性脊柱炎的发病机制	本文首次通过单细胞测序和分子对接技术，识别了Cassia twigs在治疗强直性脊柱炎中的潜在药物靶点	样本量相对较小，且仅限于特定类型的样本	探讨强直性脊柱炎的发病机制及Cassia twigs的治疗作用	强直性脊柱炎患者和非患者的血液样本及临床数据	生物信息学	风湿性疾病	单细胞测序	逻辑回归	基因表达数据	28,458个个体样本，其中6,101个为强直性脊柱炎患者，22,357个为非患者
550	2024-10-30	Single-cell sequencing in diffuse large B-cell lymphoma: C1qC is a potential tumor-promoting factor 2024-Dec-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113319 PMID:39388888	研究论文	研究C1qC在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的潜在促瘤机制	首次揭示了C1qC在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的促瘤作用，并提出了C1qC作为潜在治疗靶点的可能性	研究主要集中在C1qC在M2巨噬细胞中的表达及其对淋巴瘤细胞的影响，未全面探讨C1qC在其他免疫细胞中的作用	探索C1qC在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的潜在机制及其临床意义	弥漫性大B细胞淋巴瘤患者及C1qC在免疫细胞中的表达	数字病理学	淋巴瘤	单细胞测序	NA	基因表达数据	涉及弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的临床数据及免疫细胞样本
551	2024-10-30	Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of immune landscape in drug users with HIV infection 2024-Dec-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113338 PMID:39405936	研究论文	本文通过单细胞RNA测序揭示了药物使用者中HIV感染的免疫景观异质性	首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了药物使用者与非药物使用者中HIV感染的免疫细胞异质性	研究仅限于外周血单核细胞，未涵盖其他组织或器官的免疫细胞	揭示药物使用对HIV感染免疫发病机制的影响	健康对照个体、药物使用HIV感染者和非药物使用HIV感染者的外周血单核细胞	数字病理学	HIV感染	单细胞RNA测序	NA	RNA	健康对照个体、药物使用HIV感染者和非药物使用HIV感染者的外周血单核细胞样本
552	2024-10-30	Mtb/HIV co-infection immune microenvironment subpopulations heterogeneity 2024-Dec-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113341 PMID:39405943	研究论文	研究了HIV-1和结核分枝杆菌（Mtb）共感染患者外周血单个核细胞的免疫微环境异质性	构建了Mtb/HIV共感染的单细胞全局转录图谱，揭示了不同细胞亚群的异质性，并发现了可能参与免疫反应的关键细胞亚群	研究仅基于Gene Expression Omnibus数据库和中国国家基因库核苷酸序列档案的单细胞RNA测序数据，样本量和数据来源有限	探讨HIV-1和结核分枝杆菌共感染对免疫反应和免疫细胞亚群的影响	HIV-1感染者和Mtb/HIV共感染者的外周血单个核细胞	NA	结核病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
553	2024-10-29	Comprehensive integration of single-cell RNA and transcriptome RNA sequencing to establish a pyroptosis-related signature for improving prognostic prediction of gastric cancer 2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.csbj.2024.02.002 PMID:38404710	研究论文	本研究整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据，建立了一个与细胞焦亡相关的特征，以提高胃癌患者的预后预测	首次整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据，建立了一个与细胞焦亡相关的特征，用于预测胃癌患者的生存时间和治疗反应	需要进一步验证该特征在不同人群和不同治疗方案中的适用性	探索细胞焦亡相关基因作为胃癌患者的预后生物标志物和治疗指标的价值	胃癌患者的细胞焦亡相关基因表达和分布	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	LASSO分析	RNA	GSE183904数据集和TCGA数据库中的胃癌转录组数据
554	2024-10-28	Recent advances in spatially variable gene detection in spatial transcriptomics 2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.csbj.2024.01.016 PMID:38370977	综述	本文综述了空间转录组学中空间变异基因检测的最新进展	本文介绍了近年来提出的多种新方法及其创新概念	NA	探讨空间转录组学数据分析中的空间变异基因检测方法	空间转录组学数据中的空间变异基因	空间转录组学	NA	空间转录组学技术	NA	转录组数据	NA
555	2024-10-26	SRSF2 is essential for maintaining pancreatic beta-cell identity and regulating glucose homeostasis in mice 2024-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119845 PMID:39265887	研究论文	研究探讨了剪接因子SRSF2在维持胰腺β细胞身份和调节小鼠血糖稳态中的关键作用	首次揭示了SRSF2在胰腺β细胞生存和血糖稳态中的重要作用，并通过单细胞RNA测序分析了其对β细胞身份和功能的调控机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证SRSF2的作用	探讨SRSF2在胰腺β细胞功能和血糖稳态中的作用	胰腺β细胞和小鼠模型	NA	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及10个月龄的小鼠和Min6细胞
556	2024-10-26	Interactions between polycyclic aromatic hydrocarbons and genetic variants in the cGAS-STING pathway affect the risk of colorectal cancer 2024-Dec, Archives of toxicology IF:4.8Q1 DOI:10.1007/s00204-024-03862-8 PMID:39287666	研究论文	研究多环芳烃与cGAS-STING通路基因变异在结直肠癌风险中的相互作用	首次探讨了cGAS-STING通路基因变异与多环芳烃暴露在结直肠癌风险中的相互作用	研究样本量较小，可能影响结果的普适性	探讨基因与环境因素在结直肠癌风险中的相互作用	cGAS-STING通路基因变异与多环芳烃暴露	NA	结直肠癌	RNA测序	NA	RNA	NA
557	2024-10-26	Evolutionary diversity of CXCL16-CXCR6: Convergent substitutions and recurrent gene loss in sauropsids 2024-Dec, Immunogenetics IF:2.9Q3 DOI:10.1007/s00251-024-01357-5 PMID:39400711	研究论文	研究CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响	首次在脊椎动物中比较了约400个CXCR6直系同源基因，发现DRF基序在不同物种中的替代和CXCR6基因在某些鸟类和爬行动物中的反复丢失	研究主要集中在脊椎动物，未涵盖所有物种，且对基因丢失的具体机制和免疫影响的深入研究有限	探讨CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响	CXCL16-CXCR6轴在不同脊椎动物中的基因变异和进化	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因序列	约400个CXCR6直系同源基因，涵盖多种脊椎动物
558	2024-10-24	Circulating RAC1 contributed to steroid-sensitive nephrotic syndrome: Mendelian randomization, single-cell RNA-sequencing, proteomic, and experimental evidence 2024-Dec, Renal failure IF:3.0Q1 DOI:10.1080/0886022X.2024.2416087 PMID:39422242	研究论文	研究探讨并验证了循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征（SSNS）之间的潜在因果关系	通过孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、蛋白质组学分析和实验研究，首次系统地验证了循环RAC1与SSNS之间的因果关系	研究主要集中在基因表达和蛋白质水平上，未深入探讨RAC1在细胞内的具体作用机制	探索并验证循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征之间的潜在因果关系	循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征（SSNS）	NA	肾病	单细胞RNA测序、蛋白质组学分析	NA	基因表达数据、蛋白质数据	包括SSNS患者和健康对照的外周血单个核细胞样本，以及最小变化肾病综合征患者的样本
559	2024-10-21	Predictive biomarkers for immune checkpoint inhibitors therapy in lung cancer 2024-Dec-31, Human vaccines & immunotherapeutics IF:4.1Q2 DOI:10.1080/21645515.2024.2406063 PMID:39415535	综述	本文综述了用于预测肺癌免疫检查点抑制剂疗效的生物标志物及其相关技术	本文结合单细胞测序和空间成像技术，以及深度学习和人工智能，探讨了新的预测生物标志物	PD-L1作为首个预测生物标志物，其预测价值仅限于特定人群	探讨用于预测肺癌免疫检查点抑制剂疗效的生物标志物及其相关技术	肺癌患者对免疫检查点抑制剂的反应	数字病理	肺癌	单细胞测序、空间成像技术、深度学习、人工智能	NA	NA	NA
560	2024-10-21	Excavating regulated cell death signatures to predict prognosis, tumor microenvironment and therapeutic response in HR+/HER2- breast cancer 2024-Dec, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102117 PMID:39241556	研究论文	研究探讨了调控性细胞死亡（RCD）在HR+/HER2-乳腺癌中的作用及其临床价值	构建了一个基于六个关键基因的RCD评分系统（CDScore），用于预测HR+/HER2-乳腺癌的预后、肿瘤微环境和治疗反应	NA	探索调控性细胞死亡在HR+/HER2-乳腺癌中的作用及其临床应用	HR+/HER2-乳腺癌患者	数字病理学	乳腺癌	单细胞测序	NA	基因表达数据	NA