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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
521 2024-12-14
EEE1F1 could serve as a prognostic biomarker for patients with endometrial cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Dec-11, Asian journal of surgery IF:3.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
522 2024-12-14
Conserved B cell signaling, activation, and differentiation in porcine jejunal and ileal Peyer's patches despite distinct immune landscapes
2024-Dec, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 研究了猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化,尽管存在不同的免疫环境,但发现了保守的B细胞动态 首次通过单细胞和空间转录组学研究猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化,并发现尽管存在不同的免疫环境,B细胞动态在肠道位置间是保守的 研究仅限于猪的空肠和回肠Peyer's patches,未涉及其他物种或其他肠道区域 探讨Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化,并研究其在不同肠道位置的保守性 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 免疫学 NA 单细胞和空间转录组学 NA 转录组数据 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 NA NA NA NA
523 2024-12-14
GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model
2024-Dec, Cell research IF:28.1Q1
研究论文 本文构建了一个跨物种的基础模型GeneCompass,用于解析普遍的基因调控机制 GeneCompass通过整合四种先验生物学知识,在自监督学习中增强了基因调控机制的理解,并在多个下游任务中超越了现有模型 NA 解析跨物种的普遍基因调控机制,推动基础生命过程研究和临床应用 人类和小鼠的单细胞转录组数据 机器学习 NA 单细胞测序 基础模型 转录组数据 12000万个人类和小鼠的单细胞转录组数据 NA NA NA NA
524 2024-12-14
SRSF1 Is Crucial for Maintaining Satellite Cell Homeostasis During Skeletal Muscle Growth and Regeneration
2024-Dec, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
研究论文 本文研究了剪接因子SRSF1在骨骼肌生长和再生过程中对卫星细胞稳态的维持作用 首次揭示了SRSF1在调节Fgfr1op2剪接中的关键作用,以及其对有丝分裂纺锤体组织和细胞衰老的影响 研究主要集中在新生小鼠的横膈膜和C2C12细胞系,可能无法完全代表所有骨骼肌的情况 探讨SRSF1缺失对卫星细胞功能和肌肉再生的影响机制 卫星细胞(SCs)及其在骨骼肌生长和再生中的作用 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA测序(RNA-seq)、免疫染色、EdU掺入实验 NA RNA 新生小鼠横膈膜的单核细胞悬液(KO和对照组)、C2C12肌母细胞和原代肌母细胞 NA NA NA NA
525 2024-12-14
The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice
2024-Dec, Molecular and cellular neurosciences
研究论文 研究了成年雌性和雄性小鼠中甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta的mRNA表达谱 首次详细分析了甘氨酸受体亚基在不同脑区和脊髓中的表达模式,并比较了雌雄小鼠在特定脑区的表达差异 Glra4的表达水平过低,无法通过qRT-PCR检测到 探讨甘氨酸受体亚基在中枢神经系统中的表达模式及其在雌雄小鼠中的差异 甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达 NA NA 单细胞RNA测序、定量实时PCR (qRT-PCR)、RNAscope NA mRNA表达数据 成年雌性和雄性小鼠 NA NA NA NA
526 2024-12-14
Investigating intra-tumoural heterogeneity and microenvironment diversity in primary cardiac angiosarcoma through single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境多样性 首次通过单细胞RNA测序揭示了原发性心脏血管肉瘤的复杂细胞景观和免疫微环境,并识别了潜在的分子治疗靶点 样本量较小,仅基于四个患者的肿瘤样本进行分析 揭示原发性心脏血管肉瘤的细胞异质性和肿瘤微环境,为开发新型疗法提供分子靶点 原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 数字病理学 心脏肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 四个患者的肿瘤样本和五个正常心脏组织样本 NA NA NA NA
527 2024-12-14
Oxygen, angiogenesis, cancer and immune interplay in breast tumour microenvironment: a computational investigation
2024-Dec, Royal Society open science IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型(MMTV-PyMT)的数据,探讨了乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的相互作用 引入了一种基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据估算乳腺癌微环境中免疫细胞比例的方法,并通过混合遗传算法(HGA)进行参数估计 NA 研究乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的复杂动态相互作用 乳腺癌微环境中的内皮细胞、氧气、血管内皮生长因子(VEGF)以及免疫细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 混合遗传算法(HGA) 单细胞RNA测序数据 乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型(MMTV-PyMT) NA NA NA NA
528 2024-12-13
CAR-NK cells derived from cord blood originate mainly from CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK progenitor cells
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
研究论文 研究探讨了脐血来源的CAR-NK细胞主要来源于CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK祖细胞 首次确定CAR-NK细胞主要来源于CD56 NK祖细胞,并揭示了CD56CD7CD34HLA-DR Lin细胞是人类脐血来源CAR-NK细胞的主要来源 研究未详细探讨如何增强从这些NK祖细胞中产生NK细胞的质量和数量 探讨CAR-NK细胞在脐血中的起源 脐血来源的CAR-NK细胞及其祖细胞 细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 脐血单个核细胞 NA NA NA NA
529 2024-12-13
Cancer-associated fibroblasts promote melanoma progression by inducing immune evasion: A risk prediction study based on single-cell RNA-seq and RNA-Seq data
2024-Dec-11, Asian journal of surgery IF:3.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
530 2024-12-13
Pericancerous cross-presentation to cytotoxic T lymphocytes impairs immunotherapeutic efficacy in hepatocellular carcinoma
2024-Dec-09, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 研究揭示了在肝细胞癌中,癌周巨噬细胞通过内质网相关降解机制介导的细胞质途径交叉呈递抗原给CD103细胞毒性T淋巴细胞,导致CD103 CTLs滞留在癌周区域,激活NLRP3炎症小体,促进肝癌进展并抵抗免疫治疗 首次揭示了癌周巨噬细胞通过内质网相关降解机制交叉呈递抗原给CD103 CTLs,并阐明了这一过程如何促进肝癌进展和免疫治疗抵抗 研究主要集中在单细胞RNA测序和空间转录组学分析,可能需要进一步的实验验证 探讨癌周巨噬细胞与细胞毒性T淋巴细胞在肝细胞癌中的相互作用及其对免疫治疗效果的影响 肝细胞癌患者的癌周巨噬细胞和CD103细胞毒性T淋巴细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 NA RNA 肝细胞癌患者 NA NA NA NA
531 2024-12-13
Deletion of RFX6 impairs iPSC-derived islet organoid development and survival, with no impact on PDX1+/NKX6.1+ progenitors
2024-Dec, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 研究RFX6缺失对iPSC衍生的胰岛类器官发育和存活的影响,并探讨其在胰腺发育中的具体作用 首次揭示了RFX6在胰腺发育中的保护作用,并通过RNA-seq分析了RFX6缺失对胰腺内分泌分化、胰岛素分泌和离子转运相关基因的下调作用 研究主要集中在体外模型,未能在体内环境中验证RFX6缺失的影响 探讨RFX6在胰腺发育和糖尿病发病机制中的具体作用 RFX6在胰腺发育中的表达及其对iPSC衍生的胰岛类器官发育和存活的影响 干细胞生物学 糖尿病 CRISPR/Cas9, RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA RNA 多个iPSC系和hESC衍生的胰腺细胞 NA NA NA NA
532 2024-12-13
Characterizing the impacts of dataset imbalance on single-cell data integration
2024-Dec, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本研究探讨了数据集不平衡对单细胞数据整合的影响,并提出了评估和缓解不平衡影响的工具和指南 引入了新的属性(聚合细胞类型支持和最小细胞类型中心距离)来量化不平衡的影响,并提出了平衡聚类指标和不平衡整合指南 未提及具体的局限性 研究数据集不平衡对单细胞转录组数据整合的下游分析和生物学解释的影响 单细胞转录组数据整合方法在不同样本和条件下的表现 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 2600次整合实验 NA NA NA NA
533 2024-12-13
Single-cell atlas of healthy vocal folds and cellular function in the endothelial-to-mesenchymal transition
2024-Dec, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和免疫染色技术,研究了成年Sprague-Dawley大鼠声带的细胞组成和功能 本文首次识别出与上皮-间充质转化相关的上皮细胞亚群,并揭示了其在病理状态下的功能重要性 研究仅限于成年Sprague-Dawley大鼠的声带,未涉及其他物种或病理条件 揭示声带黏膜的细胞和分子框架,并探讨发育通路在癌症病理状态中的功能重要性 成年Sprague-Dawley大鼠的声带细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 5836个细胞 NA NA NA NA
534 2024-12-13
Omics in allergy and asthma
2024-Dec, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
综述 本文综述了组学技术在过敏和哮喘研究中的变革性影响,重点介绍了基因组学和转录组学相关的高通量技术的进展 单细胞RNA测序技术的快速普及显著提升了对过敏性疾病分子病理学的理解,高通量基因组测序加速了单基因疾病的发现 微生物组学、蛋白质组学、脂质组学和代谢组学等领域虽然迅速发展,但许多当前的研究结果仍缺乏确凿的证据 探讨组学技术在过敏和哮喘研究中的应用,以期通过整合组学数据深入理解疾病机制,推动精准医学的发展 过敏和哮喘的分子病理学及相关的单基因疾病 NA 过敏和哮喘 单细胞RNA测序、高通量基因组测序 NA 基因组数据、转录组数据 NA NA NA NA NA
535 2024-12-12
Spatial transcriptomics identifies RBM39 as a gene associated with Gleason score progression in prostate cancer
2024-Dec-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术探讨了前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组模式,并鉴定了与Gleason评分进展相关的基因RBM39 首次通过空间转录组学技术揭示了前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组模式,并验证了RBM39与Gleason评分进展的相关性 研究主要基于Visium空间转录组学数据,可能无法完全捕捉到肿瘤的异质性 探讨前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组模式,并鉴定与Gleason评分进展相关的基因 前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组 数字病理学 前列腺癌 空间转录组学 PCA, Louvain聚类分析, inferCNV, DPT, PAGA 转录组数据 NA NA NA NA NA
536 2024-12-12
Corneal strain influences keratocyte proliferation and migration through upregulation of ALDH3A1 expression
2024-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了角膜应变对角膜基质细胞增殖和迁移的影响,发现应变通过上调ALDH3A1表达抑制细胞增殖 首次揭示了角膜应变通过上调ALDH3A1表达抑制角膜基质细胞增殖和迁移的机制 研究主要集中在体外实验和动物模型,缺乏人体临床数据 探讨角膜应变对角膜基质细胞行为的影响及其分子机制 角膜基质细胞及其在角膜应变下的增殖和迁移行为 NA NA RT-qPCR, 免疫荧光染色, RNA干扰, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 细胞行为数据 人类角膜基质细胞, 小鼠角膜损伤模型, 圆锥角膜患者角膜基质细胞 NA NA NA NA
537 2024-12-12
Nuclear translocation of plasma membrane protein ADCY7 potentiates T cell-mediated antitumour immunity in HCC
2024-Dec-10, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本文研究了ADCY7蛋白在肝细胞癌(HCC)中通过核转位增强T细胞介导的抗肿瘤免疫的作用 首次揭示了ADCY7通过核转位作为转录共激活因子促进CCL5表达,从而增强CD8+ T细胞浸润,抑制HCC进展 NA 探讨HCC中导致免疫逃逸的关键基因,并提出重塑HCC微环境的新治疗策略 肝细胞癌(HCC)中的免疫逃逸机制及ADCY7蛋白的功能 数字病理学 肝细胞癌 CRISPR筛选、单细胞RNA测序、流式细胞术、染色质免疫沉淀、共免疫沉淀 NA 基因组数据、单细胞RNA测序数据 使用HCC小鼠模型进行实验 NA NA NA NA
538 2024-12-12
RNA isoform diversity in human neurodegenerative diseases
2024-Dec-10, eNeuro IF:2.7Q3
研究论文 本文结合10X Genomics短读长单核RNA测序和PacBio长读长单核RNA测序,研究了与神经退行性疾病相关的基因在单细胞水平上的RNA异构体多样性 本文首次在单细胞水平上结合短读长和长读长测序技术,揭示了人类前额叶皮层中与神经退行性疾病相关的基因的RNA异构体多样性,并开发了一种用于检测异构体结构差异的信息学方法 本文仅比较了阿尔茨海默病、路易体痴呆和帕金森病三种神经退行性疾病,且样本量有限 研究人类神经退行性疾病中RNA异构体的多样性及其潜在的疾病特征和治疗靶点 人类前额叶皮层样本中的单核RNA异构体 数字病理学 神经退行性疾病 单核RNA测序(snRNA-seq) NA RNA 25名阿尔茨海默病、路易体痴呆或帕金森病患者及年龄匹配的对照组样本,共分析了超过165,000个细胞 NA NA NA NA
539 2024-12-12
Advances in integrating single-cell sequencing data to unravel the mechanism of ferroptosis in cancer
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
综述 本文综述了单细胞测序技术在铁死亡相关癌症研究中的进展 单细胞测序技术提供了比传统批量测序更精细的细胞和分子特征信息,有助于揭示铁死亡相关的机制和途径 NA 探讨单细胞测序技术在铁死亡相关癌症研究中的应用 铁死亡相关的途径、免疫检查点、生物标志物以及与铁死亡相关的肿瘤细胞簇 数字病理学 癌症 单细胞测序 NA 单细胞数据 NA NA NA NA NA
540 2024-12-12
A comprehensive survey of dimensionality reduction and clustering methods for single-cell and spatial transcriptomics data
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
综述 本文系统总结了用于单细胞和空间转录组数据降维和聚类分析的最广泛认可的算法 提供了对该领域现有工具的全面总结,为开发新工具提供了有价值的见解和思路 NA 总结单细胞和空间转录组数据降维和聚类分析的算法 单细胞转录组和空间转录组数据 生物信息学 NA 单细胞转录组学,空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
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