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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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521 | 2024-12-12 |
Polyclonal-to-monoclonal transition in colorectal precancerous evolution
2024-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08133-1
PMID:39478225
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研究论文 | 本文使用基于碱基编辑的DNA条形码系统,在肠道肿瘤发生的小鼠模型中全面绘制了单细胞谱系图谱,揭示了结直肠癌前病变的克隆演化过程 | 首次通过高分辨率单细胞谱系分析,揭示了结直肠息肉的克隆起源和多克隆到单克隆的转变过程,并发现了早期多克隆病变中的细胞间相互作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的批量测序数据,可能无法完全反映人类结直肠癌前病变的复杂性 | 揭示结直肠癌前病变的起源和演化过程,为早期干预提供理论基础 | 小鼠肠道肿瘤模型和人类散发性结直肠息肉 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、全外显子测序、全基因组测序 | NA | 单细胞数据 | 260,922个单细胞,来自正常、炎症和肿瘤性肠道组织 |
522 | 2024-12-12 |
Tau Accumulation Induces Microglial State Alterations in Alzheimer's Disease Model Mice
2024-Dec, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0260-24.2024
PMID:39592224
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研究论文 | 本研究通过向人源化tau的敲入小鼠脑内注射来自人类大脑的tau蛋白,生成了一种新的阿尔茨海默病模型小鼠,并探讨了tau积累对小胶质细胞状态的影响 | 首次通过空间转录组学和单细胞RNA测序数据,展示了tau传播和积累在阿尔茨海默病模型小鼠脑中诱导疾病相关小胶质细胞表型的现象 | 需要进一步使用单细胞分辨率的空间转录组学来更准确地解释tau病理对小胶质细胞的影响 | 探讨tau病理与小胶质细胞状态之间的关系 | 阿尔茨海默病模型小鼠的小胶质细胞状态 | NA | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA | 人源化tau的敲入小鼠 |
523 | 2024-12-12 |
Research trends and hotspots of the applications of single-cell RNA sequencing in cardiovascular diseases: a bibliometric and visualized study
2024-Dec, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000002681
PMID:39649887
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研究论文 | 本研究通过文献计量学和可视化分析,探讨了单细胞RNA测序在心血管疾病中的应用趋势和热点 | 首次系统地对单细胞RNA测序在心血管疾病中的应用进行了文献计量学和可视化分析 | 研究仅基于Web of Science Core Collection数据库中的文献,可能存在一定的偏倚 | 探讨单细胞RNA测序在心血管疾病中的应用现状和发展趋势 | 单细胞RNA测序在心血管疾病中的应用文献 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 文本 | 1170篇文献 |
524 | 2024-12-12 |
Gene regulatory networks in abiotic stress responses via single-cell sequencing and spatial technologies: Advances and opportunities
2024-Dec, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2024.102662
PMID:39541907
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序和空间技术在解析非生物胁迫响应基因调控网络中的进展、挑战和机遇 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组技术,结合染色质可及性分析,揭示了植物细胞在非生物胁迫下的转录组景观和细胞间相互作用 | 需要进一步整合多组学数据以发现细胞类型特异性的基因调控网络 | 增强作物植物对气候变化的适应能力 | 非生物胁迫响应的基因调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
525 | 2024-12-11 |
Cordycepin enhances the Anticancer efficacy of PD-L1 blockade by modulating the tumor microenvironment of colon cancer
2024-Dec-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.177089
PMID:39489279
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研究论文 | 研究评估了抗PD-L1抗体与虫草素联合治疗结肠癌的效果及其机制 | 首次探讨了虫草素通过调节肿瘤微环境增强PD-L1阻断的抗肿瘤效果 | NA | 评估抗PD-L1抗体与虫草素联合治疗结肠癌的疗效 | 结肠癌及其肿瘤微环境 | NA | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
526 | 2024-12-11 |
Leukemia inhibitory factor receptor inhibition by EC359 reduces atherosclerotic stenosis grade in Ldlr-/- mice
2024-Dec-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.177121
PMID:39528103
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研究论文 | 本研究探讨了白血病抑制因子(LIF)受体在动脉粥样硬化发展中的作用,并通过实验验证了LIF受体抑制剂EC359在减少动脉粥样硬化狭窄程度方面的潜力 | 首次深入研究了LIF及其受体在动脉粥样硬化中的作用,并证明了LIF受体抑制剂EC359在减少动脉粥样硬化斑块大小和降低胆固醇水平方面的效果 | 研究仅在Ldlr-/-小鼠模型中进行,结果的普遍性和在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探讨LIF受体信号在动脉粥样硬化发展中的作用,并评估LIF受体抑制剂EC359的疗效 | LIF受体在动脉粥样硬化中的作用及EC359对动脉粥样硬化的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 实验涉及30只Ldlr-/-小鼠,分为两组,每组15只 |
527 | 2024-12-11 |
Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear-cell renal-cell carcinoma tumor microenvironment
2024-Dec-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03435-z
PMID:39639369
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研究论文 | 本文通过空间转录组学研究了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中整合素和胶原蛋白IV的空间耦合,以更好地理解免疫治疗耐药性 | 本文首次使用细胞分辨率的空间转录组学技术,分析了免疫治疗前后ccRCC肿瘤微环境中的分子变化,并发现免疫治疗后肿瘤中胶原蛋白IV和整合素αV的表达显著增加 | 本文仅分析了21个肿瘤样本,样本量较小,且未探讨潜在的治疗策略 | 研究透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中免疫治疗耐药性的分子机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤及其微环境 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学 | NA | 空间分子图像 | 21个ccRCC肿瘤样本 |
528 | 2024-12-11 |
Nonepithelial Gene Expression Correlates With Symptom Severity in Adults With Eosinophilic Esophagitis
2024-Dec, The journal of allergy and clinical immunology. In practice
DOI:10.1016/j.jaip.2024.05.015
PMID:38768900
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研究论文 | 本文研究了非上皮基因表达与嗜酸性食管炎(EoE)症状严重程度之间的相关性 | 首次揭示了非上皮细胞(如成纤维细胞)在EoE症状严重程度中的潜在作用 | 样本量有限,且仅限于成人患者 | 探讨EoE症状严重程度与食管基因表达之间的关系 | 嗜酸性食管炎患者的食管基因表达与症状严重程度 | NA | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 146名成人EoE患者 |
529 | 2024-12-11 |
Single-cell transcriptome analysis of the mouse lungs during the injury and recovery periods after lipopolysaccharide administration
2024-Dec, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01951-z
PMID:39377802
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了小鼠肺部在脂多糖处理后损伤和恢复期的细胞和分子变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脂多糖诱导的急性肺损伤(ALI)期间细胞间相互作用及Dpp4在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨急性肺损伤(ALI)期间细胞和分子变化,并寻找有效的治疗靶点 | 小鼠肺部在脂多糖处理后损伤和恢复期的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自损伤(第3天)和恢复(第6天)小鼠的肺泡组织样本 |
530 | 2024-12-11 |
Doxorubicin resistance involves modulation of interferon signaling, transcriptional bursting, and gene co-expression patterns of U-ISGF3-related genes
2024-12, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101071
PMID:39405604
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研究论文 | 研究了多柔比星(DOX)在人结肠癌细胞中诱导的转录组变化,揭示了与U-ISGF3相关基因的表达变化及其在化疗耐药中的潜在作用 | 首次揭示了U-ISGF3相关基因在多柔比星耐药中的作用,并发现HSH2D作为不良预后标志物在耐药细胞中的高表达 | 研究仅限于人结肠癌细胞,未探讨其他癌症类型中的适用性 | 探讨多柔比星诱导的化疗耐药机制及其潜在治疗靶点 | 人结肠癌细胞在亚毒性多柔比星处理后的转录组变化 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | 转录组数据 | 人结肠癌细胞 |
531 | 2024-12-11 |
Systematic analysis of human colorectal cancer scRNA-seq revealed limited pro-tumoral IL-17 production potential in gamma delta T cells
2024-12, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101072
PMID:39454432
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研究论文 | 本研究重新分析了九个已发表的人类结直肠癌全组织单细胞RNA测序数据集,揭示了γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的潜力有限 | 首次系统分析了人类结直肠癌中单细胞RNA测序数据,发现γδ T细胞在肿瘤微环境中主要表现为细胞毒性效应细胞,而非IL-17产生细胞 | 研究仅基于已发表的数据集,未进行新的实验验证 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的作用 | γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 165名结直肠癌患者的肿瘤和邻近正常组织中的951,785个细胞,其中18,483个为γδ T细胞 |
532 | 2024-12-11 |
Elucidating tobacco smoke-induced craniofacial deformities: Biomarker and MAPK signaling dysregulation unraveled by cross-species multi-omics analysis
2024-Dec, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.117343
PMID:39549573
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研究论文 | 本研究使用斑马鱼幼体模型,通过多组学分析揭示了烟草烟雾引起的颅面畸形与MAPK信号通路失调之间的关系 | 首次通过跨物种多组学分析揭示了烟草烟雾引起的颅面畸形相关的新型生物标志物和MAPK信号通路的失调 | 研究主要基于斑马鱼模型和人类胚胎腭间充质细胞,可能需要进一步的人体临床研究验证 | 揭示烟草烟雾引起的颅面畸形的发生机制,并寻找相关的生物标志物和信号通路 | 斑马鱼幼体和人类胚胎腭间充质细胞 | NA | NA | 多组学分析(mRNA-miRNA分析、单细胞转录组学、定量实时PCR) | NA | 基因、蛋白质、代谢物 | 斑马鱼幼体和人类胚胎腭间充质细胞 |
533 | 2024-12-10 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in ophthalmology]
2024-Dec-11, [Zhonghua yan ke za zhi] Chinese journal of ophthalmology
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在眼科领域的最新进展 | 单细胞RNA测序技术提供了研究细胞间基因表达和功能特征差异的强大工具 | 本文未提及具体的局限性 | 提供关于眼科疾病发病机制的新见解,并改进诊断和治疗策略 | 眼科疾病的发病机制和诊断治疗策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
534 | 2024-12-10 |
Unraveling plant-microbe symbioses using single-cell and spatial transcriptomics
2024-Dec, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.06.008
PMID:38991926
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研究论文 | 本文讨论了单细胞和空间转录组学技术在研究植物-微生物共生关系中的优势 | 利用单细胞和空间转录组学技术,能够以前所未有的细节水平研究共生相互作用 | 主要限制在于同时捕获植物和微生物转录本的技术挑战 | 探讨新型空间和单细胞转录组学技术在研究植物-微生物内共生关系中的应用 | 植物-微生物共生关系 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
535 | 2024-12-10 |
AOPPs induces EMT and fibrosis by activating oxidative stress through ERK/p38 MAPK signaling pathway in endometriosis
2024-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100950
PMID:39241657
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研究论文 | 研究探讨了高级氧化蛋白产物(AOPPs)通过激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导子宫内膜异位症(EMs)中的上皮-间质转化(EMT)和纤维化的机制 | 首次揭示了AOPPs在EMs中通过氧化应激激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导EMT和纤维化的机制 | 研究主要基于临床样本、单细胞测序和体内外模型,缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨AOPPs在子宫内膜异位症中诱导EMT和纤维化的分子机制 | 子宫内膜异位症(EMs)中的上皮-间质转化(EMT)和纤维化 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 使用正常大鼠进行慢性给药研究 |
536 | 2024-12-10 |
ATN-161 alleviates caerulein-induced pancreatitis
2024-Dec, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.002
PMID:39396744
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研究论文 | 研究显示ATN-161通过阻断Integrin-α5信号减轻caerulein诱导的急性胰腺炎病理状况 | 首次揭示了ATN-161作为Integrin-α5拮抗剂在减轻急性胰腺炎症状中的治疗潜力 | NA | 探索减轻急性胰腺炎病理状况的药物干预方法 | ATN-161对caerulein诱导的急性胰腺炎的影响 | NA | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
537 | 2024-12-10 |
Targeting cancer-associated fibroblasts with pirfenidone: A novel approach for cancer therapy
2024-Dec, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2024.102624
PMID:39581071
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研究论文 | 本文探讨了使用吡非尼酮靶向癌症相关成纤维细胞(CAFs)作为癌症治疗的新方法 | 本文提出了一种新的癌症治疗方法,通过吡非尼酮靶向CAFs,并结合化疗药物和纳米载体递送系统,以提高疗效和减少副作用 | 尽管吡非尼酮显示出抗肿瘤潜力,但其安全性和有效性仍需通过临床试验进一步验证 | 研究吡非尼酮在癌症治疗中的应用,特别是通过靶向CAFs来抑制癌症进展 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其在癌症进展中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA |
538 | 2024-12-10 |
Endothelial KDM5B Regulated by Piezo1 Contributes to Disturbed Flow Induced Atherosclerotic Plaque Formation
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70237
PMID:39643939
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研究论文 | 研究了Piezo1调控的内皮细胞KDM5B在扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的作用 | 首次揭示了Piezo1通过上调KDM5B表达促进动脉粥样硬化斑块形成的机制 | 研究主要集中在细胞和动物模型上,尚未在人体中验证 | 探讨扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的表观遗传调控机制 | 内皮细胞中的KDM5B表达及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用了HUVECs细胞和小鼠模型 |
539 | 2024-12-09 |
Statistical and computational methods for enabling the clinical and translational application of spatial transcriptomics
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70119
PMID:39644148
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
540 | 2024-12-10 |
M2 macrophage derived HMOX1 defines chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Dec, Clinical and translational allergy
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/clt2.70014
PMID:39644500
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研究论文 | 本研究旨在开发与慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)相关的巨噬细胞诊断特征 | 提出了基于M2巨噬细胞来源的HMOX1作为CRSwNP的创新诊断标志物 | NA | 开发与CRSwNP相关的巨噬细胞诊断特征 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)患者和健康对照组的转录组数据 | NA | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 转录组分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | 诊断模型 | 转录组数据 | 54名CRSwNP患者和37名健康对照组,以及29个验证样本 |