单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 702 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-12-16 |
Single-cell transcriptomics of vomeronasal neuroepithelium reveals a differential endoplasmic reticulum environment amongst neuronal subtypes
2024-Dec-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98250
PMID:39670989
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析小鼠犁鼻器感觉上皮细胞，揭示了不同神经元亚型之间的内质网环境的差异 | 首次通过单细胞转录组学揭示了犁鼻器感觉上皮细胞中不同神经元亚型的内质网环境差异，并提供了可搜索的基因表达模式网络资源 | 研究仅限于小鼠犁鼻器感觉上皮细胞，未涉及其他物种或其他类型的细胞 | 探究犁鼻器感觉上皮细胞中的细胞类型、发育基因表达模式以及神经元之间的功能差异 | 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的神经元亚型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的多个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 522 | 2024-12-16 |
CAR T cells secreting NGF-neutralizing scFv enhance efficacy in clear cell renal cell carcinoma by relieving immunosuppression through immunosympathectomy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009910
PMID:39653553
|
研究论文 | 本研究探讨了通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv来缓解肾透明细胞癌免疫抑制微环境，从而增强CAR T细胞的抗肿瘤效果 | 首次提出通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv实现肿瘤免疫交感神经切除，从而减弱肿瘤微环境的免疫抑制 | 研究主要集中在肾透明细胞癌，其结果在其他类型肿瘤中的适用性尚不明确 | 探索通过免疫交感神经切除增强CAR T细胞在实体瘤中的疗效 | 肾透明细胞癌的免疫抑制微环境和CAR T细胞的抗肿瘤效果 | 免疫学 | 肾癌 | RNA测序 | CAR T细胞 | RNA | 多种癌症类型的基因集和肾透明细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 523 | 2024-12-16 |
Multiomics reveals tumor microenvironment remodeling in locally advanced gastric and gastroesophageal junction cancer following neoadjuvant immunotherapy and chemotherapy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010041
PMID:39653554
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了局部晚期胃癌和胃食管交界癌在接受新辅助免疫治疗和化疗后肿瘤微环境的动态变化 | 首次通过多组学分析揭示了新辅助免疫化疗后肿瘤微环境的动态变化，并构建了一个预测主要病理反应的模型 | 样本量较小，仅基于一个临床试验的数据，可能限制了结果的普适性 | 探讨新辅助免疫化疗对局部晚期胃癌和胃食管交界癌肿瘤微环境的影响及其机制 | 局部晚期胃癌和胃食管交界癌患者在接受新辅助免疫化疗前后的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序、全转录组测序、多重免疫荧光和单细胞RNA测序 | 回归模型 | 基因组数据、转录组数据、免疫细胞数据 | 30名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 524 | 2024-12-15 |
Dynamic changes in serum adenosine and the adenosine metabolism-based signature for prognosis in HER2-positive metastatic breast cancer patients
2024-Dec-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39545
PMID:39669152
|
研究论文 | 研究探讨了HER2阳性转移性乳腺癌患者中血清腺苷及其代谢相关标志物在预后中的作用 | 首次动态监测HER2阳性转移性乳腺癌患者的血清腺苷水平，并验证了其在曲妥珠单抗治疗中的预测价值 | 研究样本量较小，且仅限于HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 探索腺苷在HER2阳性转移性乳腺癌中的预后意义及其在曲妥珠单抗治疗中的预测作用 | HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | DESeq2 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 109名HER2阳性转移性乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 525 | 2024-12-15 |
Cancer specific up-regulated lactate genes associated with immunotherapy resistance in a pan-cancer analysis
2024-Dec-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39491
PMID:39669156
|
研究论文 | 本文通过比较TCGA队列中的恶性组织和正常组织，定义了一个泛癌上调乳酸评分，并评估了其在非小细胞肺癌、转移性肾癌、膀胱癌和黑色素瘤中的免疫治疗效果 | 首次识别出癌症内在的乳酸特征，并揭示了其与免疫检查点抑制剂抵抗的相关性 | 研究主要基于TCGA和CPTAC数据集，可能存在数据偏倚；验证性研究仅限于NSCLC队列 | 识别与免疫治疗抵抗相关的癌症特异性上调乳酸基因，并探讨其潜在机制 | 非小细胞肺癌、转移性肾癌、膀胱癌和黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 转录组学和蛋白质组学数据 | 涉及TCGA、CPTAC以及内部NSCLC队列的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 526 | 2024-12-15 |
A multiplexed, single-cell sequencing screen identifies compounds that increase neurogenic reprogramming of murine Muller glia
2024-Dec-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92091
PMID:39665620
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序筛选出能够促进小鼠Müller胶质细胞神经元再生的化合物 | 利用sci-Plex技术进行高通量单细胞分子 profiling，筛选并验证了两种促进体内神经发生的化合物 | 目前该过程的效率有限 | 提高哺乳动物中Müller胶质细胞的神经元再生能力 | 小鼠Müller胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 92种化合物 | NA | NA | NA | NA |
| 527 | 2024-12-15 |
Multiparameter imaging reveals clinically relevant cancer cell-stroma interaction dynamics in head and neck cancer
2024-Dec-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.046
PMID:39471809
|
研究论文 | 本文报道了一种通过多参数成像量化头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中癌细胞与基质相互作用动态的方法 | 首次结合细胞状态标记与形态特征，以单细胞分辨率量化HNSCC的表型多样性，并揭示了部分上皮-间充质转化（pEMT）对疾病预后的影响 | NA | 研究癌细胞与基质相互作用对头颈部鳞状细胞癌表型多样性和临床特征的影响 | 头颈部鳞状细胞癌中的癌细胞与基质相互作用 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 多参数成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 528 | 2024-12-15 |
Itaconate Ameliorates Experimental Autoimmune Uveitis by Modulating Teff/Treg Cell Imbalance Via the DNAJA1/CDC45 Axis
2024-Dec-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.23
PMID:39661355
|
研究论文 | 本研究探讨了衣康酸（ITA）对实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）的影响及其潜在机制，并确定了潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了衣康酸通过调节DNAJA1/CDC45轴来改善Teff/Treg细胞失衡，从而减轻EAU的炎症反应 | 本研究主要基于动物模型，尚未在人体中验证其疗效和安全性 | 阐明衣康酸对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响及其潜在机制，并确定潜在的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）及其相关细胞和分子机制 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型和葡萄膜炎患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 529 | 2024-12-15 |
Single-cell RNA sequencing reveals the CRTAC1+ population actively contributes to the pathogenesis of spinal ligament degeneration by SPP1+ macrophage
2024-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14320
PMID:39158018
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CRTAC1+细胞群通过SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的致病作用 | 首次揭示了CRTAC1+软骨细胞样细胞和SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的关键作用，并发现了ATF3作为调控CRTAC1软骨细胞样细胞致病性的关键转录因子 | 研究仅限于特定类型的韧带样本，未来需要进一步验证这些发现是否适用于其他类型的韧带或更广泛的退行性疾病 | 建立韧带组织的综合转录组图谱，识别韧带退行性变的治疗靶点 | 脊柱韧带退行性变中的细胞异质性和关键致病机制 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个退行性韧带和3个创伤性韧带样本，共32,014个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 530 | 2024-12-15 |
Single-cell transcriptomic atlas of taste papilla aging
2024-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14308
PMID:39169434
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了味蕾衰老的分子和细胞特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了味蕾衰老过程中差异表达的基因及其功能，并识别了与衰老相关的转录枢纽 | 研究仅限于味蕾细胞，未涉及其他感官细胞或整体衰老机制 | 揭示味蕾衰老的分子和细胞特征 | 味蕾细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年和年轻味蕾细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 531 | 2024-12-15 |
Consensus prediction of cell type labels in single-cell data with popV
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01993-3
PMID:39567746
|
研究论文 | 本文提出了一种名为popV的集成预测模型，用于单细胞数据中的细胞类型标签共识预测，并提供了不确定性评分 | popV通过基于本体的投票机制，实现了细胞类型标签的准确预测和不确定性评估，解决了现有方法在不确定性估计方面的不足 | NA | 提出一种新的方法来改进单细胞数据中细胞类型标签的预测和不确定性评估 | 单细胞数据的细胞类型标签 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 集成模型 | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 532 | 2024-12-15 |
Multi-omic characteristics of longitudinal immune profiling after breakthrough infections caused by Omicron BA.5 sublineages
2024-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105428
PMID:39536392
|
研究论文 | 本研究通过临床评估、单细胞RNA测序、T细胞受体/B细胞受体测序和抗体质谱分析，监测了Omicron BA.5亚系突破性感染后第一个月内的免疫动态 | 首次揭示了Omicron BA.5亚系突破性感染后个体免疫动态特征，包括免疫激活、抗病毒反应、抗体成熟和类别转换 | 研究样本量较小，可能无法完全代表所有突破性感染患者的免疫动态 | 探讨Omicron BA.5亚系突破性感染后第一个月内的免疫动态变化 | Omicron BA.5亚系突破性感染患者的免疫动态 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、T细胞受体/B细胞受体测序、抗体质谱分析 | NA | RNA序列、TCR/BCR序列、抗体数据 | 纵向队列中的多个时间点样本 | NA | NA | NA | NA |
| 533 | 2024-12-14 |
Hierarchical marker genes selection in scRNA-seq analysis
2024-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012643
PMID:39666603
|
研究论文 | 本文提出了一种分层标记基因选择策略，用于改进单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性和可解释性 | 提出了分层标记基因选择策略，通过分组相似的细胞群并分层选择标记基因，解决了传统one-vs-all策略在区分紧密相关细胞类型时标记基因重叠的问题 | 未提及 | 改进单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的异质细胞群 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2024-12-14 |
Paired-Related Homeobox 1-Positive Cells Are Needed for Osseointegration
2024-Dec-11, The International journal of oral & maxillofacial implants
DOI:10.11607/jomi.10852
PMID:38498783
|
研究论文 | 研究Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中对种植体诱导骨整合过程的贡献及其潜在机制 | 首次揭示了Prrx1阳性细胞在骨整合过程中的作用，并发现Sema3C在Prrx1阳性细胞驱动的成骨过程中起关键作用 | 研究仅在啮齿动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨Prrx1阳性细胞在种植体诱导骨整合过程中的作用及其机制 | Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中的作用 | NA | NA | Cre重组酶诱导的谱系追踪、细胞消融、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用小鼠牙种植体模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 535 | 2024-12-14 |
EEE1F1 could serve as a prognostic biomarker for patients with endometrial cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Dec-11, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.065
PMID:39668036
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 536 | 2024-12-14 |
Conserved B cell signaling, activation, and differentiation in porcine jejunal and ileal Peyer's patches despite distinct immune landscapes
2024-Dec, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.08.005
PMID:39147277
|
研究论文 | 研究了猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，尽管存在不同的免疫环境，但发现了保守的B细胞动态 | 首次通过单细胞和空间转录组学研究猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并发现尽管存在不同的免疫环境，B细胞动态在肠道位置间是保守的 | 研究仅限于猪的空肠和回肠Peyer's patches，未涉及其他物种或其他肠道区域 | 探讨Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并研究其在不同肠道位置的保守性 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 537 | 2024-12-14 |
GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model
2024-Dec, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-01034-y
PMID:39375485
|
研究论文 | 本文构建了一个跨物种的基础模型GeneCompass，用于解析普遍的基因调控机制 | GeneCompass通过整合四种先验生物学知识，在自监督学习中增强了基因调控机制的理解，并在多个下游任务中超越了现有模型 | NA | 解析跨物种的普遍基因调控机制，推动基础生命过程研究和临床应用 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型 | 转录组数据 | 12000万个人类和小鼠的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 538 | 2024-12-14 |
Investigating intra-tumoural heterogeneity and microenvironment diversity in primary cardiac angiosarcoma through single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70113
PMID:39658531
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境多样性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了原发性心脏血管肉瘤的复杂细胞景观和免疫微环境，并识别了潜在的分子治疗靶点 | 样本量较小，仅基于四个患者的肿瘤样本进行分析 | 揭示原发性心脏血管肉瘤的细胞异质性和肿瘤微环境，为开发新型疗法提供分子靶点 | 原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四个患者的肿瘤样本和五个正常心脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 539 | 2024-12-14 |
Oxygen, angiogenesis, cancer and immune interplay in breast tumour microenvironment: a computational investigation
2024-Dec, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.240718
PMID:39665095
|
研究论文 | 本研究利用乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型（MMTV-PyMT）的数据，探讨了乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的相互作用 | 引入了一种基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据估算乳腺癌微环境中免疫细胞比例的方法，并通过混合遗传算法（HGA）进行参数估计 | NA | 研究乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的复杂动态相互作用 | 乳腺癌微环境中的内皮细胞、氧气、血管内皮生长因子（VEGF）以及免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 混合遗传算法（HGA） | 单细胞RNA测序数据 | 乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型（MMTV-PyMT） | NA | NA | NA | NA |
| 540 | 2024-12-13 |
CAR-NK cells derived from cord blood originate mainly from CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK progenitor cells
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101374
PMID:39659759
|
研究论文 | 研究探讨了脐血来源的CAR-NK细胞主要来源于CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK祖细胞 | 首次确定CAR-NK细胞主要来源于CD56 NK祖细胞，并揭示了CD56CD7CD34HLA-DR Lin细胞是人类脐血来源CAR-NK细胞的主要来源 | 研究未详细探讨如何增强从这些NK祖细胞中产生NK细胞的质量和数量 | 探讨CAR-NK细胞在脐血中的起源 | 脐血来源的CAR-NK细胞及其祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 脐血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |