单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
501	2024-12-14	SRSF1 Is Crucial for Maintaining Satellite Cell Homeostasis During Skeletal Muscle Growth and Regeneration 2024-Dec, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle DOI:10.1002/jcsm.13607 PMID:39381961	研究论文	本文研究了剪接因子SRSF1在骨骼肌生长和再生过程中对卫星细胞稳态的维持作用	首次揭示了SRSF1在调节Fgfr1op2剪接中的关键作用，以及其对有丝分裂纺锤体组织和细胞衰老的影响	研究主要集中在新生小鼠的横膈膜和C2C12细胞系，可能无法完全代表所有骨骼肌的情况	探讨SRSF1缺失对卫星细胞功能和肌肉再生的影响机制	卫星细胞（SCs）及其在骨骼肌生长和再生中的作用	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（RNA-seq）、免疫染色、EdU掺入实验	NA	RNA	新生小鼠横膈膜的单核细胞悬液（KO和对照组）、C2C12肌母细胞和原代肌母细胞
502	2024-12-14	Spatial Transcriptomics Unravel the Tissue Complexity of Oral Pathogenesis 2024-Dec, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241271934 PMID:39382116	综述	本文综述了空间转录组学（ST）在口腔病理学中的应用，展示了其在不同颅面区域疾病发展中的研究进展	空间转录组学结合了全局基因表达和空间信息的分析，提供了传统转录组学方法所缺乏的空间分辨率，能够更好地研究疾病和健康组织状态中细胞区域的复杂相互关系	本文主要为综述性质，未提供具体的研究数据或实验结果	探讨空间转录组学在颅面区域疾病发展中的应用，并展示其在不同组织中的研究进展	颅面区域的组织，包括颅骨、腭、唾液腺、舌头、口腔底、口咽和牙周组织	数字病理学	NA	空间转录组学（ST）	NA	基因表达数据	NA
503	2024-12-14	Electroacupuncture Slows Experimental Myopia Progression by Improving Retinal Mitochondrial Function: A Study Based on Single-Cell RNA Sequencing 2024-Dec, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400269 PMID:39404059	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序构建了晶状体诱导性近视和电针干预下的视网膜细胞图谱，并探讨了电针改善实验性近视进展的潜在机制	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了电针通过改善视网膜线粒体功能来减缓实验性近视进展的机制	研究仅在豚鼠模型上进行，结果的普适性有待进一步验证	探讨电针干预对实验性近视进展的影响及其潜在机制	晶状体诱导性近视和电针干预下的豚鼠视网膜细胞	NA	近视	单细胞RNA测序	NA	RNA	晶状体诱导性近视和电针干预下的豚鼠视网膜细胞
504	2024-12-14	Insufficient Mechanical Loading Downregulates Piezo1 in Chondrocytes and Impairs Fracture Healing Through ApoE-Induced Senescence 2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202400502 PMID:39418070	研究论文	研究探讨了机械负荷不足对软骨细胞中Piezo1表达的影响及其在骨折愈合中的作用	首次揭示了Piezo1在软骨细胞中的表达下调通过ApoE诱导的衰老影响骨折愈合的机制，并开发了一种可注射的热敏水凝胶来缓解这一问题	研究主要集中在体外实验和动物模型上，尚未在人体中验证其有效性	探讨机械负荷不足如何通过Piezo1和ApoE影响骨折愈合	软骨细胞、骨折愈合过程	NA	骨折	单细胞测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
505	2024-12-14	Quantum Dots-caused Retinal Degeneration in Zebrafish Regulated by Ferroptosis and Mitophagy in Retinal Pigment Epithelial Cells through Inhibiting Spliceosome 2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202406343 PMID:39420512	研究论文	本研究探讨了典型金属量子点（InP/ZnS QDs）对斑马鱼视网膜的影响及其机制	首次揭示了InP/ZnS QDs通过抑制剪接体导致视网膜色素上皮细胞中的铁死亡和线粒体自噬，从而引起视网膜退化	研究仅在斑马鱼模型中进行，可能无法完全反映人类视网膜的反应	阐明典型金属量子点对视网膜的影响及其机制	斑马鱼视网膜及视网膜色素上皮细胞	NA	NA	单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9系统	NA	RNA	斑马鱼样本
506	2024-12-14	Pericytes Modulate Third-Generation Tyrosine Kinase Inhibitor Sensitivity in EGFR-Mutated Lung Cancer Cells Through IL32-β5-Integrin Paracrine Signaling 2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405130 PMID:39435643	研究论文	研究探讨了周细胞通过IL32-β5-整合素旁分泌信号调节EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂敏感性的机制	首次揭示了周细胞通过IL32-β5-整合素旁分泌信号影响EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂的敏感性	研究主要基于细胞和动物实验，临床证据有限	探讨周细胞如何影响EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂的敏感性	EGFR突变肺癌细胞和周细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序，多重免疫染色	NA	RNA，蛋白质	来自EGFR突变患者的周细胞和肺癌细胞
507	2024-12-14	Hepatocyte-Targeted Lipid Nanoparticle Delivery of HERC2 Plasmid Controls Drug-Induced Hepatotoxicity by Limiting β-Catenin-Regulated CYP2E1 Expression 2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202401633 PMID:39440550	研究论文	研究探讨了HERC2在药物诱导的肝损伤中的保护作用，通过脂质纳米颗粒递送HERC2质粒，调控CYP2E1表达，减轻肝损伤	首次揭示了HERC2在药物代谢紊乱相关的急性肝损伤中的保护作用，并展示了脂质纳米颗粒递送HERC2质粒的治疗潜力	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨HERC2在药物诱导肝损伤中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力	HERC2在肝细胞中的表达及其对CYP2E1调控的影响	NA	肝损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA	APAP挑战的小鼠模型
508	2024-12-14	The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice 2024-Dec, Molecular and cellular neurosciences DOI:10.1016/j.mcn.2024.103976 PMID:39580061	研究论文	研究了成年雌性和雄性小鼠中甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta的mRNA表达谱	首次详细分析了甘氨酸受体亚基在不同脑区和脊髓中的表达模式，并比较了雌雄小鼠在特定脑区的表达差异	Glra4的表达水平过低，无法通过qRT-PCR检测到	探讨甘氨酸受体亚基在中枢神经系统中的表达模式及其在雌雄小鼠中的差异	甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达	NA	NA	单细胞RNA测序、定量实时PCR (qRT-PCR)、RNAscope	NA	mRNA表达数据	成年雌性和雄性小鼠
509	2024-12-14	Investigating intra-tumoural heterogeneity and microenvironment diversity in primary cardiac angiosarcoma through single-cell RNA sequencing 2024-Dec, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70113 PMID:39658531	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境多样性	首次通过单细胞RNA测序揭示了原发性心脏血管肉瘤的复杂细胞景观和免疫微环境，并识别了潜在的分子治疗靶点	样本量较小，仅基于四个患者的肿瘤样本进行分析	揭示原发性心脏血管肉瘤的细胞异质性和肿瘤微环境，为开发新型疗法提供分子靶点	原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境	数字病理学	心脏肿瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	四个患者的肿瘤样本和五个正常心脏组织样本
510	2024-12-14	Oxygen, angiogenesis, cancer and immune interplay in breast tumour microenvironment: a computational investigation 2024-Dec, Royal Society open science IF:2.9Q1 DOI:10.1098/rsos.240718 PMID:39665095	研究论文	本研究利用乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型（MMTV-PyMT）的数据，探讨了乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的相互作用	引入了一种基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据估算乳腺癌微环境中免疫细胞比例的方法，并通过混合遗传算法（HGA）进行参数估计	NA	研究乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的复杂动态相互作用	乳腺癌微环境中的内皮细胞、氧气、血管内皮生长因子（VEGF）以及免疫细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	混合遗传算法（HGA）	单细胞RNA测序数据	乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型（MMTV-PyMT）
511	2024-12-13	CAR-NK cells derived from cord blood originate mainly from CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK progenitor cells 2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development DOI:10.1016/j.omtm.2024.101374 PMID:39659759	研究论文	研究探讨了脐血来源的CAR-NK细胞主要来源于CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK祖细胞	首次确定CAR-NK细胞主要来源于CD56 NK祖细胞，并揭示了CD56CD7CD34HLA-DR Lin细胞是人类脐血来源CAR-NK细胞的主要来源	研究未详细探讨如何增强从这些NK祖细胞中产生NK细胞的质量和数量	探讨CAR-NK细胞在脐血中的起源	脐血来源的CAR-NK细胞及其祖细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	脐血单个核细胞
512	2024-12-13	Cancer-associated fibroblasts promote melanoma progression by inducing immune evasion: A risk prediction study based on single-cell RNA-seq and RNA-Seq data 2024-Dec-11, Asian journal of surgery IF:3.5Q1 DOI:10.1016/j.asjsur.2024.12.007 PMID:39665934	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
513	2024-12-13	Pericancerous cross-presentation to cytotoxic T lymphocytes impairs immunotherapeutic efficacy in hepatocellular carcinoma 2024-Dec-09, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2024.10.012 PMID:39547231	研究论文	研究揭示了在肝细胞癌中，癌周巨噬细胞通过内质网相关降解机制介导的细胞质途径交叉呈递抗原给CD103细胞毒性T淋巴细胞，导致CD103 CTLs滞留在癌周区域，激活NLRP3炎症小体，促进肝癌进展并抵抗免疫治疗	首次揭示了癌周巨噬细胞通过内质网相关降解机制交叉呈递抗原给CD103 CTLs，并阐明了这一过程如何促进肝癌进展和免疫治疗抵抗	研究主要集中在单细胞RNA测序和空间转录组学分析，可能需要进一步的实验验证	探讨癌周巨噬细胞与细胞毒性T淋巴细胞在肝细胞癌中的相互作用及其对免疫治疗效果的影响	肝细胞癌患者的癌周巨噬细胞和CD103细胞毒性T淋巴细胞	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学	NA	RNA	肝细胞癌患者
514	2024-12-13	Deletion of RFX6 impairs iPSC-derived islet organoid development and survival, with no impact on PDX1+/NKX6.1+ progenitors 2024-Dec, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-024-06232-2 PMID:39080045	研究论文	研究RFX6缺失对iPSC衍生的胰岛类器官发育和存活的影响，并探讨其在胰腺发育中的具体作用	首次揭示了RFX6在胰腺发育中的保护作用，并通过RNA-seq分析了RFX6缺失对胰腺内分泌分化、胰岛素分泌和离子转运相关基因的下调作用	研究主要集中在体外模型，未能在体内环境中验证RFX6缺失的影响	探讨RFX6在胰腺发育和糖尿病发病机制中的具体作用	RFX6在胰腺发育中的表达及其对iPSC衍生的胰岛类器官发育和存活的影响	干细胞生物学	糖尿病	CRISPR/Cas9, RNA-seq, 单细胞RNA测序	NA	RNA	多个iPSC系和hESC衍生的胰腺细胞
515	2024-12-13	Characterizing the impacts of dataset imbalance on single-cell data integration 2024-Dec, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-023-02097-9 PMID:38429430	研究论文	本研究探讨了数据集不平衡对单细胞数据整合的影响，并提出了评估和缓解不平衡影响的工具和指南	引入了新的属性（聚合细胞类型支持和最小细胞类型中心距离）来量化不平衡的影响，并提出了平衡聚类指标和不平衡整合指南	未提及具体的局限性	研究数据集不平衡对单细胞转录组数据整合的下游分析和生物学解释的影响	单细胞转录组数据整合方法在不同样本和条件下的表现	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	2600次整合实验
516	2024-12-13	Single-cell atlas of healthy vocal folds and cellular function in the endothelial-to-mesenchymal transition 2024-Dec, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13723 PMID:39245637	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和免疫染色技术，研究了成年Sprague-Dawley大鼠声带的细胞组成和功能	本文首次识别出与上皮-间充质转化相关的上皮细胞亚群，并揭示了其在病理状态下的功能重要性	研究仅限于成年Sprague-Dawley大鼠的声带，未涉及其他物种或病理条件	揭示声带黏膜的细胞和分子框架，并探讨发育通路在癌症病理状态中的功能重要性	成年Sprague-Dawley大鼠的声带细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	5836个细胞
517	2024-12-13	Omics in allergy and asthma 2024-Dec, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.09.023 PMID:39384073	综述	本文综述了组学技术在过敏和哮喘研究中的变革性影响，重点介绍了基因组学和转录组学相关的高通量技术的进展	单细胞RNA测序技术的快速普及显著提升了对过敏性疾病分子病理学的理解，高通量基因组测序加速了单基因疾病的发现	微生物组学、蛋白质组学、脂质组学和代谢组学等领域虽然迅速发展，但许多当前的研究结果仍缺乏确凿的证据	探讨组学技术在过敏和哮喘研究中的应用，以期通过整合组学数据深入理解疾病机制，推动精准医学的发展	过敏和哮喘的分子病理学及相关的单基因疾病	NA	过敏和哮喘	单细胞RNA测序、高通量基因组测序	NA	基因组数据、转录组数据	NA
518	2024-12-13	A Single-Cell RNA Sequencing Guided Multienzymatic Hydrogel Design for Self-Regenerative Repair in Diabetic Mandibular Defects 2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202410962 PMID:39436107	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病环境下阻碍巨噬细胞极化的关键因素，并设计了一种多酶水凝胶支架用于糖尿病下颌骨缺损的自修复	通过单细胞RNA测序技术指导设计多酶水凝胶支架，显著提升了糖尿病环境下骨组织工程的自修复能力	NA	探索糖尿病环境下骨组织再生的新方法	糖尿病下颌骨缺损中的巨噬细胞、间充质干细胞和内皮细胞	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
519	2024-12-12	Spatial transcriptomics identifies RBM39 as a gene associated with Gleason score progression in prostate cancer 2024-Dec-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111351 PMID:39650727	研究论文	本研究利用空间转录组学技术探讨了前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组模式，并鉴定了与Gleason评分进展相关的基因RBM39	首次通过空间转录组学技术揭示了前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组模式，并验证了RBM39与Gleason评分进展的相关性	研究主要基于Visium空间转录组学数据，可能无法完全捕捉到肿瘤的异质性	探讨前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组模式，并鉴定与Gleason评分进展相关的基因	前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组	数字病理学	前列腺癌	空间转录组学	PCA, Louvain聚类分析, inferCNV, DPT, PAGA	转录组数据	NA
520	2024-12-12	Corneal strain influences keratocyte proliferation and migration through upregulation of ALDH3A1 expression 2024-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202401392R PMID:39652089	研究论文	本研究探讨了角膜应变对角膜基质细胞增殖和迁移的影响，发现应变通过上调ALDH3A1表达抑制细胞增殖	首次揭示了角膜应变通过上调ALDH3A1表达抑制角膜基质细胞增殖和迁移的机制	研究主要集中在体外实验和动物模型，缺乏人体临床数据	探讨角膜应变对角膜基质细胞行为的影响及其分子机制	角膜基质细胞及其在角膜应变下的增殖和迁移行为	NA	NA	RT-qPCR, 免疫荧光染色, RNA干扰, 单细胞RNA测序	NA	基因表达数据, 细胞行为数据	人类角膜基质细胞, 小鼠角膜损伤模型, 圆锥角膜患者角膜基质细胞