单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 700 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 481 | 2024-12-18 |
Single-Cell RNA Sequencing of PBMCs Identified Junction Plakoglobin (JUP) as Stratification Biomarker for Endometriosis
2024-Dec-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313071
PMID:39684780
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了子宫内膜异位症患者外周血单核细胞的单细胞图谱，并发现Junction Plakoglobin (JUP)作为诊断和分层标志物的潜力 | 首次构建了子宫内膜异位症患者外周血单核细胞的单细胞图谱，并发现JUP在子宫内膜异位症和卵巢癌患者血清中的显著升高，增强了诊断的特异性 | 敏感性较低，仅为19% | 识别子宫内膜异位症患者外周血单核细胞的独特特征，并开发非侵入性早期诊断工具 | 子宫内膜异位症患者的外周血单核细胞和JUP作为诊断标志物 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 107,964个细胞和199名患者（包括20名卵巢癌患者） | NA | NA | NA | NA |
| 482 | 2024-12-18 |
Characterization of an Activated Metabolic Transcriptional Program in Hepatoblastoma Tumor Cells Using scRNA-seq
2024-Dec-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313044
PMID:39684755
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肝母细胞瘤肿瘤细胞中的代谢转录程序，并使用机器学习方法建立了肿瘤表达代谢评分 | 首次在单细胞水平上验证了肝母细胞瘤肿瘤细胞中激活的代谢转录程序，并识别出一系列具有预测价值的代谢酶 | 研究仅限于肝母细胞瘤，未探讨其他类型的儿童肝癌 | 探讨肝母细胞瘤中代谢重编程的分子机制 | 肝母细胞瘤肿瘤细胞中的代谢酶表达 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Elasticnet | RNA | 使用了GSE104766和GSE131329数据集的bulk RNA测序数据，以及GSE180665数据集的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 483 | 2024-12-18 |
Tackling the Complexity of Spatial Transcriptomics Data Interpretation with Large Language Models
2024-Dec-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.28.625773
PMID:39677817
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研究论文 | 本研究探讨了大型语言模型（LLMs）在空间转录组数据分析和解释中的潜力，特别是在小鼠黑色素瘤肿瘤模型中的应用 | 本研究展示了LLMs在空间转录组数据分析中的潜力，能够结合高级模式识别与广泛的知识整合，增强数据解释能力 | 目前的工作流程尚需进一步开发以实现可扩展性 | 探索LLMs在空间转录组数据解释中的应用，以加速将空间转录组数据转化为生物学见解 | 小鼠黑色素瘤肿瘤模型的空间转录组数据 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组 | LLM（大型语言模型） | 基因表达数据 | 小鼠黑色素瘤肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 484 | 2024-12-18 |
Identification of a Highly Functional Effector CD8 + T Cell Program after Transplantation in Mice and Humans
2024-Dec-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.26.625263
PMID:39677722
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研究论文 | 研究在移植后的小鼠和人类中，CD8+ T细胞在急性排斥反应中的功能和命运 | 首次发现CD43 1B11信号在移植排斥反应中的作用，并证明CD43 1B11单克隆抗体治疗可以克服大多数小鼠的共刺激阻断诱导的耐受性 | 研究主要集中在小鼠模型和少数人类样本上，可能无法完全反映人类移植排斥反应的复杂性 | 探讨CD8+ T细胞在移植排斥反应中的作用及其在急性排斥反应中的命运 | 小鼠和人类移植后的CD8+ T细胞 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 485 | 2024-12-18 |
The Immunoregulatory Architecture of the Adult Oral Cavity
2024-Dec-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.01.626279
PMID:39677739
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研究论文 | 本文首次展示了人类成年口腔和颅面组织的综合图谱，通过单细胞RNA测序和空间图谱技术揭示了口腔免疫调节的细胞和分子结构 | 首次整合了人类成年口腔和颅面组织的综合图谱，并开发了AstroSuite软件包用于分析细胞邻域和多细胞相互作用模块 | 研究主要集中在健康状态下的口腔组织，对疾病状态下的变化研究较少 | 深入理解口腔组织的免疫调节结构，为精准医学提供基础 | 人类成年口腔和颅面组织的细胞、分子和空间结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 约250,000个细胞，来自70个样本，涵盖13个微环境 | NA | NA | NA | NA |
| 486 | 2024-12-18 |
Innovative Insights into Single-Cell Technologies and Multi-Omics Integration in Livestock and Poultry
2024-Dec-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252312940
PMID:39684651
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）与多组学整合技术在畜禽研究中的应用 | 强调了scRNA-seq与表观组学、蛋白质组学和空间转录组学数据的结合，提供了多维度的分析方法 | NA | 探讨单细胞技术和多组学整合在畜禽研究中的应用 | 畜禽中的关键物种，包括家禽、猪和反刍动物 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 487 | 2024-12-18 |
The Immunomodulatory Effects of Vitamin D on COVID-19 Induced Glioblastoma Recurrence via the PI3K-AKT Signaling Pathway
2024-Dec-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252312952
PMID:39684661
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研究论文 | 本研究探讨了维生素D通过PI3K-AKT信号通路对COVID-19诱导的胶质母细胞瘤复发的免疫调节作用 | 本研究通过整合生物信息学方法，揭示了维生素D与COVID-19在胶质母细胞瘤中的分子相互作用，并确定了关键的预后基因 | 本研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探讨COVID-19与胶质母细胞瘤之间的分子相互作用，并研究维生素D的免疫调节作用 | COVID-19感染的胶质母细胞瘤患者 | NA | 脑癌 | 生物信息学方法，包括富集分析、生存分析和分子对接 | NA | 基因表达数据 | 203个共同差异表达基因，6个预后关键基因 | NA | NA | NA | NA |
| 488 | 2024-12-18 |
Specialized metabolism in St John's wort
2024-Dec, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2024.102625
PMID:39236592
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研究论文 | 本文研究了圣约翰草（Hypericum perforatum L.）的特殊代谢，特别是其标志性生物活性化合物hyperforin和hypericin的生物合成 | 本文揭示了圣约翰草中多种代谢物的生物合成途径，并发现了新的酶如hyperforin合酶，为药物开发提供了可扩展的生物活性化合物生产方法 | NA | 研究圣约翰草的特殊代谢及其生物活性化合物的生物合成途径 | 圣约翰草（Hypericum perforatum L.）及其生物活性化合物hyperforin和hypericin | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 489 | 2024-12-18 |
Single-cell transcriptomics and tissue metabolomics uncover mechanisms underlying wooden breast disease in broilers
2024-Dec, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104433
PMID:39489032
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学和组织代谢组学揭示了肉鸡木胸病的发病机制 | 首次综合分析了鸡木胸肌肉的转录组和代谢组，发现了木胸肌肉中独特的巨噬细胞簇（第11簇），并揭示了木胸病发生时细胞间相互作用网络的减弱以及关键差异代谢物的变化 | 研究主要集中在转录组和代谢组分析，未深入探讨木胸病的具体分子机制 | 揭示肉鸡木胸病的病理生理机制 | 肉鸡木胸肌肉的基因表达、细胞间相互作用及代谢物变化 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞转录组学、代谢组学 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 490 | 2024-12-18 |
SDC4 protein action and related key genes in nonhealing diabetic foot ulcers based on bioinformatics analysis and machine learning
2024-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.137789
PMID:39557273
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、转录组分析和机器学习方法，识别了非愈合性糖尿病足溃疡中的关键基因SDC4及其相关基因 | 首次通过单细胞RNA测序和机器学习方法识别了非愈合性糖尿病足溃疡中的关键基因SDC4，并构建了高精度和稳定性的预测模型 | 研究仅基于GEO数据库中的数据，未进行体内或体外实验验证 | 识别非愈合性糖尿病足溃疡中的关键基因，并探讨其分子机制和信号通路变化 | 非愈合性糖尿病足溃疡中的关键基因及其相关细胞类型 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、LASSO回归算法 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用了GSE165816、GSE134431和GSE143735三个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 491 | 2024-12-18 |
Exploring T Cell and NK Cell Involvement in Ankylosing Spondylitis Through Single-Cell Sequencing
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70206
PMID:39680481
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索强直性脊柱炎中T细胞和NK细胞的参与机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示了强直性脊柱炎中T细胞和NK细胞的关键作用，并发现了CD74基因在T细胞中的上调表达以及巨噬细胞迁移抑制因子信号通路在细胞间相互作用中的显著表达 | 研究样本量较小，仅包括三名强直性脊柱炎患者和三名非患者，可能影响结果的普适性 | 揭示强直性脊柱炎的复杂免疫机制，为识别新的治疗靶点和创新疗法奠定基础 | 强直性脊柱炎患者的骨髓细胞样本 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 三名强直性脊柱炎患者和三名非患者的骨髓细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 492 | 2024-12-18 |
Cellular and Molecular Basis of Environment-Induced Color Change in a Tree Frog
2024-Dec-01, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14233472
PMID:39682437
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了树蛙皮肤颜色变化的细胞和分子机制 | 首次揭示了形态学颜色变化（MCC）在树蛙背景适应中的主导作用，并发现色素细胞的数量比单个细胞的转录活性对颜色变化的影响更大 | 研究对象仅限于一种树蛙，可能无法完全推广到其他物种 | 探讨环境诱导下树蛙皮肤颜色变化的细胞和分子机制 | 树蛙的皮肤色素细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 未明确说明具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 493 | 2024-12-18 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveals HSD3B7 as a Prognostic Biomarker and Potential Therapeutic Target in ccRCC
2024-Dec-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252312929
PMID:39684640
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了HSD3B7作为ccRCC的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出HSD3B7作为ccRCC的新型生物标志物，并验证了其在肿瘤进展中的作用 | 研究主要基于公开数据集，可能存在样本偏倚；功能研究仅限于体外和体内实验，缺乏临床验证 | 识别与ccRCC进展和预后相关的关键生物标志物，并探索其作为治疗靶点的潜力 | ccRCC的肿瘤进展和预后生物标志物 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 单细胞数据来自公开数据集，批量RNA-seq数据来自TCGA的ccRCC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 494 | 2024-12-17 |
Inhibition of JNK Signaling Overcomes Cancer-Associated Fibroblast-Mediated Immunosuppression and Enhances the Efficacy of Immunotherapy in Bladder Cancer
2024-Dec-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0940
PMID:39292817
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研究论文 | 研究揭示了JNK信号通路在癌症相关成纤维细胞中介导的免疫抑制作用，并探讨了通过抑制JNK信号增强免疫治疗效果的策略 | 首次发现JNK信号通路在癌症相关成纤维细胞中通过上调胸腺基质淋巴细胞生成素（TSLP）表达来促进免疫抑制微环境，并提出抑制JNK信号与PD-1阻断联合治疗的新策略 | 研究主要集中在膀胱癌样本，结果的普适性需要进一步验证 | 探讨免疫抑制肿瘤微环境的机制，并寻找提高免疫治疗效果的新方法 | 膀胱癌中的癌症相关成纤维细胞（CAF）和CD8+ T细胞 | NA | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 膀胱癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 495 | 2024-12-17 |
A human forebrain organoid model reveals the essential function of GTF2IRD1-TTR-ERK axis for the neurodevelopmental deficits of Williams syndrome
2024-Dec-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98081
PMID:39671308
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研究论文 | 本文研究了Williams综合征患者前脑类器官模型中GTF2IRD1-TTR-ERK轴对神经发育缺陷的关键作用 | 首次揭示了GTF2IRD1通过调节TTR-ERK通路在前脑类器官和小鼠模型中调控神经发育的关键功能 | 研究主要集中在体外类器官模型和小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨Williams综合征神经发育缺陷的分子机制 | Williams综合征患者的前脑类器官和小鼠模型 | 数字病理学 | Williams综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照和Williams综合征类器官的13个细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 496 | 2024-12-17 |
Single-cell RNA sequencing reveals the important role of Dcaf17 in spermatogenesis of golden hamsters†
2024-Dec-12, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae132
PMID:39239833
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研究论文 | 本文研究了Dcaf17在金黄地鼠精子发生中的重要作用，通过单细胞RNA测序分析了Dcaf17缺失对不同精子发生阶段转录水平的影响 | 本文首次通过CRISPR-Cas9技术创建了Dcaf17缺陷的金黄地鼠模型，揭示了Dcaf17在精子发生中的关键调控作用，并提供了新的动物模型用于研究Dcaf17 | 本文仅在金黄地鼠模型中研究了Dcaf17的作用，未来需要进一步在其他物种中验证其普遍性 | 探讨Dcaf17在雄性生殖系统中的作用及其在精子发生中的分子机制 | Dcaf17缺陷的金黄地鼠及其精子发生过程 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Dcaf17缺陷的金黄地鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 497 | 2024-12-17 |
Bgee in 2024: focus on curated single-cell RNA-seq datasets, and query tools
2024-Dec-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1118
PMID:39656924
|
研究论文 | 本文介绍了Bgee数据库的更新，重点是整合了经过精心筛选的单细胞RNA测序数据集，并提供了新的查询工具 | Bgee现在能够提供跨物种的基因表达模式比较，直至细胞分辨率，并且扩展了物种数量，增加了对鱼类、农业和兽医重要物种以及非人类灵长类动物的支持 | NA | 更新Bgee数据库，整合单细胞RNA测序数据，并提供新的查询工具 | 跨物种的基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及52个物种的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 498 | 2024-12-17 |
Identification of Key Genes in Fetal Gut Development at Single-Cell Level by Exploiting Machine Learning Techniques
2024-Dec, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400104
PMID:39324223
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研究论文 | 本研究利用机器学习技术在单细胞水平上识别胎儿肠道发育的关键基因 | 首次在单细胞水平上利用机器学习技术对胎儿肠道发育的细胞进行分类，并识别出关键基因 | 研究仅限于特定的单细胞测序数据集，可能无法全面代表所有胎儿肠道发育情况 | 通过机器学习技术增强对胎儿肠道发育的理解 | 胎儿肠道发育中的细胞分类和关键基因识别 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因特征数据 | 62,849个样本，每个样本具有33,694个不同的基因特征 | NA | NA | NA | NA |
| 499 | 2024-12-17 |
Exploring the Role of EBV Infection in EBV-T/NKLPD With EBV Capture Technology Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70094
PMID:39679761
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2024-12-16 |
Homoharringtonine synergizes with venetoclax in early T cell progenitor acute lymphoblastic leukemia: Bench and bed
2024-Dec-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.07.018
PMID:39151422
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研究论文 | 研究评估了homoharringtonine（HHT）与venetoclax（VEN）联合治疗早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病（ETP-ALL）的协同效应及其机制 | 首次展示了HHT与VEN联合治疗ETP-ALL的强协同效应，并通过单细胞RNA测序和western blot验证了其机制 | 研究样本量较小，仅包括6名患者，需要进一步的大规模临床试验验证 | 探索HHT与VEN联合治疗ETP-ALL的疗效及其机制 | 早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病（ETP-ALL）患者 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序，western blot | NA | 细胞 | 6名ETP-ALL患者 | NA | NA | NA | NA |