单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 703 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-12-15 |
Itaconate Ameliorates Experimental Autoimmune Uveitis by Modulating Teff/Treg Cell Imbalance Via the DNAJA1/CDC45 Axis
2024-Dec-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.23
PMID:39661355
|
研究论文 | 本研究探讨了衣康酸（ITA）对实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）的影响及其潜在机制，并确定了潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了衣康酸通过调节DNAJA1/CDC45轴来改善Teff/Treg细胞失衡，从而减轻EAU的炎症反应 | 本研究主要基于动物模型，尚未在人体中验证其疗效和安全性 | 阐明衣康酸对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响及其潜在机制，并确定潜在的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）及其相关细胞和分子机制 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型和葡萄膜炎患者样本 |
| 482 | 2024-12-15 |
Single-cell RNA sequencing reveals the CRTAC1+ population actively contributes to the pathogenesis of spinal ligament degeneration by SPP1+ macrophage
2024-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14320
PMID:39158018
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CRTAC1+细胞群通过SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的致病作用 | 首次揭示了CRTAC1+软骨细胞样细胞和SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的关键作用，并发现了ATF3作为调控CRTAC1软骨细胞样细胞致病性的关键转录因子 | 研究仅限于特定类型的韧带样本，未来需要进一步验证这些发现是否适用于其他类型的韧带或更广泛的退行性疾病 | 建立韧带组织的综合转录组图谱，识别韧带退行性变的治疗靶点 | 脊柱韧带退行性变中的细胞异质性和关键致病机制 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个退行性韧带和3个创伤性韧带样本，共32,014个细胞 |
| 483 | 2024-12-15 |
Single-cell transcriptomic atlas of taste papilla aging
2024-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14308
PMID:39169434
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了味蕾衰老的分子和细胞特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了味蕾衰老过程中差异表达的基因及其功能，并识别了与衰老相关的转录枢纽 | 研究仅限于味蕾细胞，未涉及其他感官细胞或整体衰老机制 | 揭示味蕾衰老的分子和细胞特征 | 味蕾细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年和年轻味蕾细胞 |
| 484 | 2024-12-15 |
Unraveling the effects of prenatal anesthesia on neurodevelopment: A review of current evidence and future directions
2024-Dec, Neurotoxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.neuro.2024.09.003
PMID:39276873
|
综述 | 本文综述了当前关于产前麻醉对神经发育影响的证据，并提出了未来研究方向 | 引入脑类器官作为研究工具，结合单细胞测序技术，探索产前麻醉引发的潜在神经毒性机制 | 临床研究受伦理和技术限制，难以直接获取人类产前脑组织，导致结果与临床前数据存在差异 | 探讨产前麻醉对胎儿脑发育的影响，并总结现有证据 | 产前麻醉对人类胎儿脑发育的影响 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 485 | 2024-12-15 |
Reliable estrogen-related prognostic signature for uterine corpus endometrial carcinoma
2024-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究探讨了子宫内膜癌中与雌激素相关的关键基因，并构建了预测患者预后的风险评分 | 首次基于8个与雌激素相关的基因构建了预测子宫内膜癌患者预后的风险评分，并验证了其可靠性和临床价值 | 研究仅基于公开数据集，未进行临床试验验证 | 探索子宫内膜癌中与雌激素相关的关键基因，并构建预测患者预后的风险评分 | 子宫内膜癌患者及其与雌激素相关的基因 | 数字病理学 | 妇科肿瘤 | scRNA-seq, bulk RNA, 单因素Cox回归分析, LASSO Cox回归分析, 多因素Cox回归分析, GO, KEGG, GSVA富集分析, CCK8检测 | Cox回归模型 | RNA数据 | 来自GEO, TCGA和Molecular Signature Database的子宫内膜癌scRNA-seq数据和bulk RNA数据 |
| 486 | 2024-12-15 |
Batch effects correction in scRNA-seq based on biological-noise decoupling autoencoder and central-cross loss
2024-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于生物噪声解耦自动编码器和中心交叉损失的单细胞RNA测序数据批次效应校正模型 | 该模型通过自动编码器重构数据，并使用层次聚类树逐步合并小簇，结合中心交叉损失在嵌入空间中形成更紧凑的聚类，从而在不丢失稀有细胞类型的情况下有效消除批次效应 | NA | 解决现有批次校正方法在降维过程中可能丢失稀有细胞类型的问题 | 单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 数据 | NA |
| 487 | 2024-12-15 |
CopyMix: Mixture model based single-cell clustering and copy number profiling using variational inference
2024-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于变分推断的混合模型CopyMix，用于单细胞聚类和拷贝数分析，旨在解决现有方法中存在的聚类伪影问题 | CopyMix通过联合推断细胞簇及其拷贝数分布，避免了传统方法中预处理和后处理步骤引入的聚类伪影问题 | NA | 研究肿瘤异质性，通过单细胞测序技术揭示肿瘤细胞亚群的基因组特征 | 单细胞DNA测序数据中的拷贝数变异和细胞聚类 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞DNA测序 | 混合模型 | 拷贝数数据 | 生物数据和模拟数据 |
| 488 | 2024-12-15 |
Choroid Plexus as a Mediator of CNS Inflammation in Multiple Sclerosis
2024-Dec, Multiple sclerosis (Houndmills, Basingstoke, England)
DOI:10.1177/13524585241292974
PMID:39503321
|
综述 | 本文综述了脉络丛在多发性硬化症（MS）中枢神经系统炎症中的作用 | 本文探讨了脉络丛作为免疫反应的调控者，并通过脑脊液传播与MS相关的神经炎症的新观点 | NA | 探讨脉络丛在多发性硬化症中枢神经系统炎症中的作用 | 脉络丛及其在脑脊液中的作用 | NA | 多发性硬化症 | 空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学 | NA | 脑脊液样本 | NA |
| 489 | 2024-12-15 |
Brca1 haploinsufficiency promotes early tumor onset and epigenetic alterations in a mouse model of hereditary breast cancer
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01958-6
PMID:39528827
|
研究论文 | 本文通过新的遗传工程小鼠模型研究了Brca1杂合性在乳腺癌发生中的作用 | 揭示了Brca1杂合性不足通过表观遗传改变加速肿瘤发生的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨Brca1杂合性不足在乳腺癌发生中的机制 | Brca1杂合性小鼠的乳腺上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序 | NA | RNA、染色质可及性数据 | Brca1杂合性小鼠的乳腺上皮细胞 |
| 490 | 2024-12-15 |
Consensus prediction of cell type labels in single-cell data with popV
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01993-3
PMID:39567746
|
研究论文 | 本文提出了一种名为popV的集成预测模型，用于单细胞数据中的细胞类型标签共识预测，并提供了不确定性评分 | popV通过基于本体的投票机制，实现了细胞类型标签的准确预测和不确定性评估，解决了现有方法在不确定性估计方面的不足 | NA | 提出一种新的方法来改进单细胞数据中细胞类型标签的预测和不确定性评估 | 单细胞数据的细胞类型标签 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 集成模型 | 单细胞数据 | NA |
| 491 | 2024-12-15 |
Multi-omic characteristics of longitudinal immune profiling after breakthrough infections caused by Omicron BA.5 sublineages
2024-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105428
PMID:39536392
|
研究论文 | 本研究通过临床评估、单细胞RNA测序、T细胞受体/B细胞受体测序和抗体质谱分析，监测了Omicron BA.5亚系突破性感染后第一个月内的免疫动态 | 首次揭示了Omicron BA.5亚系突破性感染后个体免疫动态特征，包括免疫激活、抗病毒反应、抗体成熟和类别转换 | 研究样本量较小，可能无法完全代表所有突破性感染患者的免疫动态 | 探讨Omicron BA.5亚系突破性感染后第一个月内的免疫动态变化 | Omicron BA.5亚系突破性感染患者的免疫动态 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、T细胞受体/B细胞受体测序、抗体质谱分析 | NA | RNA序列、TCR/BCR序列、抗体数据 | 纵向队列中的多个时间点样本 |
| 492 | 2024-12-15 |
Cell state transitions are decoupled from cell division during early embryo development
2024-Dec, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01546-0
PMID:39516639
|
研究论文 | 本文研究了细胞分裂在早期胚胎发育中对细胞分化的作用 | 通过在斑马鱼胚胎中使用两种独立的方法阻断细胞周期，并在单细胞分辨率下进行分析，发现细胞分裂对从早期原肠胚形成到分节结束的所有胚胎组织的分化是可有可无的 | 阻断细胞分裂会减缓某些细胞类型的分化，并引发全局应激反应 | 确定细胞分裂在细胞分化中的作用 | 斑马鱼胚胎的细胞分裂和分化 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼胚胎 |
| 493 | 2024-12-14 |
Hierarchical marker genes selection in scRNA-seq analysis
2024-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012643
PMID:39666603
|
研究论文 | 本文提出了一种分层标记基因选择策略，用于改进单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性和可解释性 | 提出了分层标记基因选择策略，通过分组相似的细胞群并分层选择标记基因，解决了传统one-vs-all策略在区分紧密相关细胞类型时标记基因重叠的问题 | 未提及 | 改进单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的异质细胞群 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未提及 |
| 494 | 2024-12-15 |
Deconvolution of cell-type-associated markers predictive of response to neoadjuvant radiotherapy
2024-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，对直肠癌术前新辅助放疗前的肿瘤转录组进行去卷积分析，揭示了与放疗反应相关的细胞类型特异性标记物 | 本研究首次通过去卷积分析揭示了直肠癌放疗抵抗和复发中不同细胞来源的分子标记物，并推断了与放疗反应相关的细胞类型特异性相互作用 | 本研究仅基于单细胞RNA测序数据进行分析，未考虑其他类型的数据或实验验证 | 揭示直肠癌放疗抵抗和复发中不同细胞来源的分子标记物及其与放疗反应的关系 | 直肠癌患者术前新辅助放疗前的肿瘤样本 | 数字病理学 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个独立数据集，包括GSE119409、GSE35452和GSE45404 |
| 495 | 2024-12-14 |
3D printed PGCL@PLA/10CSPL composite scaffolds loaded with fibronectin 1 for intervertebral disc degeneration treatment
2024-Dec-13, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad998f
PMID:39668784
|
研究论文 | 本文设计并制造了一种新型3D打印PGCL@PLA/10CSPL复合支架，用于椎间盘退行性疾病的治疗 | 本文创新性地设计了一种具有良好生物相容性和电活性的PGCL@1PAP/10CSPL支架，并加载了从单细胞转录组数据中识别出的纤维连接蛋白1（FN1），以加速异常髓核退变 | NA | 研究目的是开发一种新型植入系统，用于椎间盘退行性疾病的治疗 | 研究对象是椎间盘退行性疾病及其治疗 | 生物医学工程 | 椎间盘退行性疾病 | 3D打印技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 496 | 2024-12-14 |
Paired-Related Homeobox 1-Positive Cells Are Needed for Osseointegration
2024-Dec-11, The International journal of oral & maxillofacial implants
DOI:10.11607/jomi.10852
PMID:38498783
|
研究论文 | 研究Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中对种植体诱导骨整合过程的贡献及其潜在机制 | 首次揭示了Prrx1阳性细胞在骨整合过程中的作用，并发现Sema3C在Prrx1阳性细胞驱动的成骨过程中起关键作用 | 研究仅在啮齿动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨Prrx1阳性细胞在种植体诱导骨整合过程中的作用及其机制 | Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中的作用 | NA | NA | Cre重组酶诱导的谱系追踪、细胞消融、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用小鼠牙种植体模型进行实验 |
| 497 | 2024-12-14 |
EEE1F1 could serve as a prognostic biomarker for patients with endometrial cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Dec-11, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.065
PMID:39668036
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 498 | 2024-12-14 |
Unraveling pathogenesis and potential biomarkers for autism spectrum disorder associated with HIF1A pathway based on machine learning and experiment validation
2024-Dec-08, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106763
PMID:39657846
|
研究论文 | 本文通过机器学习和实验验证，揭示了HIF1A通路在自闭症谱系障碍（ASD）中的病理机制及其潜在的生物标志物 | 首次通过机器学习识别出与HIF1A通路相关的ASD诊断标志物，并验证了IL-6/JUN/HIF1A通路在ASD发病机制中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床应用仍需进一步验证 | 探讨HIF1A通路在ASD中的病理机制及其潜在的生物标志物 | 自闭症谱系障碍（ASD）及其相关基因和通路 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序、Western Blot、qPCR、免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | ASD小鼠模型及微胶质细胞BV-2细胞 |
| 499 | 2024-12-14 |
Conserved B cell signaling, activation, and differentiation in porcine jejunal and ileal Peyer's patches despite distinct immune landscapes
2024-Dec, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.08.005
PMID:39147277
|
研究论文 | 研究了猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，尽管存在不同的免疫环境，但发现了保守的B细胞动态 | 首次通过单细胞和空间转录组学研究猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并发现尽管存在不同的免疫环境，B细胞动态在肠道位置间是保守的 | 研究仅限于猪的空肠和回肠Peyer's patches，未涉及其他物种或其他肠道区域 | 探讨Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并研究其在不同肠道位置的保守性 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 |
| 500 | 2024-12-14 |
GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model
2024-Dec, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-01034-y
PMID:39375485
|
研究论文 | 本文构建了一个跨物种的基础模型GeneCompass，用于解析普遍的基因调控机制 | GeneCompass通过整合四种先验生物学知识，在自监督学习中增强了基因调控机制的理解，并在多个下游任务中超越了现有模型 | NA | 解析跨物种的普遍基因调控机制，推动基础生命过程研究和临床应用 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型 | 转录组数据 | 12000万个人类和小鼠的单细胞转录组数据 |