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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-12-18 |
Combined single cell and spatial transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity of hedgehog pathway in gastric cancer
2024-Dec, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00297-0
PMID:39251886
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序数据和空间转录组学,深入探讨了hedgehog通路在胃癌中的作用 | 首次通过结合单细胞测序和空间转录组学,揭示了hedgehog通路在胃癌中的细胞异质性,并发现了CCND1在肿瘤相关成纤维细胞形成中的重要作用 | 研究主要基于单细胞和空间转录组数据,缺乏体内实验验证 | 探讨hedgehog通路在胃癌中的作用,并寻找潜在的治疗靶点 | 胃癌中的hedgehog通路及相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2024-12-18 |
Single-cell transcriptomics and tissue metabolomics uncover mechanisms underlying wooden breast disease in broilers
2024-Dec, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104433
PMID:39489032
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学和组织代谢组学揭示了肉鸡木胸病的发病机制 | 首次综合分析了鸡木胸肌肉的转录组和代谢组,发现了木胸肌肉中独特的巨噬细胞簇(第11簇),并揭示了木胸病发生时细胞间相互作用网络的减弱以及关键差异代谢物的变化 | 研究主要集中在转录组和代谢组分析,未深入探讨木胸病的具体分子机制 | 揭示肉鸡木胸病的病理生理机制 | 肉鸡木胸肌肉的基因表达、细胞间相互作用及代谢物变化 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞转录组学、代谢组学 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 463 | 2024-12-18 |
SDC4 protein action and related key genes in nonhealing diabetic foot ulcers based on bioinformatics analysis and machine learning
2024-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.137789
PMID:39557273
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、转录组分析和机器学习方法,识别了非愈合性糖尿病足溃疡中的关键基因SDC4及其相关基因 | 首次通过单细胞RNA测序和机器学习方法识别了非愈合性糖尿病足溃疡中的关键基因SDC4,并构建了高精度和稳定性的预测模型 | 研究仅基于GEO数据库中的数据,未进行体内或体外实验验证 | 识别非愈合性糖尿病足溃疡中的关键基因,并探讨其分子机制和信号通路变化 | 非愈合性糖尿病足溃疡中的关键基因及其相关细胞类型 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、LASSO回归算法 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用了GSE165816、GSE134431和GSE143735三个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2024-12-18 |
Exploring T Cell and NK Cell Involvement in Ankylosing Spondylitis Through Single-Cell Sequencing
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70206
PMID:39680481
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索强直性脊柱炎中T细胞和NK细胞的参与机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示了强直性脊柱炎中T细胞和NK细胞的关键作用,并发现了CD74基因在T细胞中的上调表达以及巨噬细胞迁移抑制因子信号通路在细胞间相互作用中的显著表达 | 研究样本量较小,仅包括三名强直性脊柱炎患者和三名非患者,可能影响结果的普适性 | 揭示强直性脊柱炎的复杂免疫机制,为识别新的治疗靶点和创新疗法奠定基础 | 强直性脊柱炎患者的骨髓细胞样本 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 三名强直性脊柱炎患者和三名非患者的骨髓细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-12-18 |
Cellular and Molecular Basis of Environment-Induced Color Change in a Tree Frog
2024-Dec-01, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14233472
PMID:39682437
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了树蛙皮肤颜色变化的细胞和分子机制 | 首次揭示了形态学颜色变化(MCC)在树蛙背景适应中的主导作用,并发现色素细胞的数量比单个细胞的转录活性对颜色变化的影响更大 | 研究对象仅限于一种树蛙,可能无法完全推广到其他物种 | 探讨环境诱导下树蛙皮肤颜色变化的细胞和分子机制 | 树蛙的皮肤色素细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 未明确说明具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-12-18 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveals HSD3B7 as a Prognostic Biomarker and Potential Therapeutic Target in ccRCC
2024-Dec-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252312929
PMID:39684640
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了HSD3B7作为ccRCC的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,识别出HSD3B7作为ccRCC的新型生物标志物,并验证了其在肿瘤进展中的作用 | 研究主要基于公开数据集,可能存在样本偏倚;功能研究仅限于体外和体内实验,缺乏临床验证 | 识别与ccRCC进展和预后相关的关键生物标志物,并探索其作为治疗靶点的潜力 | ccRCC的肿瘤进展和预后生物标志物 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 单细胞数据来自公开数据集,批量RNA-seq数据来自TCGA的ccRCC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2024-12-17 |
Inhibition of JNK Signaling Overcomes Cancer-Associated Fibroblast-Mediated Immunosuppression and Enhances the Efficacy of Immunotherapy in Bladder Cancer
2024-Dec-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0940
PMID:39292817
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研究论文 | 研究揭示了JNK信号通路在癌症相关成纤维细胞中介导的免疫抑制作用,并探讨了通过抑制JNK信号增强免疫治疗效果的策略 | 首次发现JNK信号通路在癌症相关成纤维细胞中通过上调胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)表达来促进免疫抑制微环境,并提出抑制JNK信号与PD-1阻断联合治疗的新策略 | 研究主要集中在膀胱癌样本,结果的普适性需要进一步验证 | 探讨免疫抑制肿瘤微环境的机制,并寻找提高免疫治疗效果的新方法 | 膀胱癌中的癌症相关成纤维细胞(CAF)和CD8+ T细胞 | NA | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 膀胱癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-12-17 |
A human forebrain organoid model reveals the essential function of GTF2IRD1-TTR-ERK axis for the neurodevelopmental deficits of Williams syndrome
2024-Dec-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98081
PMID:39671308
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研究论文 | 本文研究了Williams综合征患者前脑类器官模型中GTF2IRD1-TTR-ERK轴对神经发育缺陷的关键作用 | 首次揭示了GTF2IRD1通过调节TTR-ERK通路在前脑类器官和小鼠模型中调控神经发育的关键功能 | 研究主要集中在体外类器官模型和小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证 | 探讨Williams综合征神经发育缺陷的分子机制 | Williams综合征患者的前脑类器官和小鼠模型 | 数字病理学 | Williams综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照和Williams综合征类器官的13个细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-12-17 |
Single-cell RNA sequencing reveals the important role of Dcaf17 in spermatogenesis of golden hamsters†
2024-Dec-12, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae132
PMID:39239833
|
研究论文 | 本文研究了Dcaf17在金黄地鼠精子发生中的重要作用,通过单细胞RNA测序分析了Dcaf17缺失对不同精子发生阶段转录水平的影响 | 本文首次通过CRISPR-Cas9技术创建了Dcaf17缺陷的金黄地鼠模型,揭示了Dcaf17在精子发生中的关键调控作用,并提供了新的动物模型用于研究Dcaf17 | 本文仅在金黄地鼠模型中研究了Dcaf17的作用,未来需要进一步在其他物种中验证其普遍性 | 探讨Dcaf17在雄性生殖系统中的作用及其在精子发生中的分子机制 | Dcaf17缺陷的金黄地鼠及其精子发生过程 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Dcaf17缺陷的金黄地鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2024-12-17 |
Evaluating the Utilities of Foundation Models in Single-cell Data Analysis
2024-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.08.555192
PMID:38464157
|
研究论文 | 本文评估了基础模型在单细胞数据分析中的性能 | 提出了一个评估框架,用于评估单细胞基础模型的超参数、初始设置和训练稳定性,并提供了预训练和微调的指南 | 单细胞基础模型在所有任务中并不总是优于任务特定方法,这挑战了开发单细胞分析基础模型的必要性 | 评估基础模型在单细胞数据分析中的性能,并提供改进方法开发的指南 | 单细胞测序数据分析中的基础模型 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型(如scGPT、Geneformer、CellPLM) | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-12-17 |
Bgee in 2024: focus on curated single-cell RNA-seq datasets, and query tools
2024-Dec-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1118
PMID:39656924
|
研究论文 | 本文介绍了Bgee数据库的更新,重点是整合了经过精心筛选的单细胞RNA测序数据集,并提供了新的查询工具 | Bgee现在能够提供跨物种的基因表达模式比较,直至细胞分辨率,并且扩展了物种数量,增加了对鱼类、农业和兽医重要物种以及非人类灵长类动物的支持 | NA | 更新Bgee数据库,整合单细胞RNA测序数据,并提供新的查询工具 | 跨物种的基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及52个物种的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2024-12-17 |
Identification of Key Genes in Fetal Gut Development at Single-Cell Level by Exploiting Machine Learning Techniques
2024-Dec, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400104
PMID:39324223
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研究论文 | 本研究利用机器学习技术在单细胞水平上识别胎儿肠道发育的关键基因 | 首次在单细胞水平上利用机器学习技术对胎儿肠道发育的细胞进行分类,并识别出关键基因 | 研究仅限于特定的单细胞测序数据集,可能无法全面代表所有胎儿肠道发育情况 | 通过机器学习技术增强对胎儿肠道发育的理解 | 胎儿肠道发育中的细胞分类和关键基因识别 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因特征数据 | 62,849个样本,每个样本具有33,694个不同的基因特征 | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2024-12-17 |
Exploring the Role of EBV Infection in EBV-T/NKLPD With EBV Capture Technology Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70094
PMID:39679761
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2024-12-16 |
Homoharringtonine synergizes with venetoclax in early T cell progenitor acute lymphoblastic leukemia: Bench and bed
2024-Dec-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.07.018
PMID:39151422
|
研究论文 | 研究评估了homoharringtonine(HHT)与venetoclax(VEN)联合治疗早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP-ALL)的协同效应及其机制 | 首次展示了HHT与VEN联合治疗ETP-ALL的强协同效应,并通过单细胞RNA测序和western blot验证了其机制 | 研究样本量较小,仅包括6名患者,需要进一步的大规模临床试验验证 | 探索HHT与VEN联合治疗ETP-ALL的疗效及其机制 | 早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP-ALL)患者 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序,western blot | NA | 细胞 | 6名ETP-ALL患者 | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2024-12-16 |
Single-cell transcriptomics of vomeronasal neuroepithelium reveals a differential endoplasmic reticulum environment amongst neuronal subtypes
2024-Dec-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98250
PMID:39670989
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析小鼠犁鼻器感觉上皮细胞,揭示了不同神经元亚型之间的内质网环境的差异 | 首次通过单细胞转录组学揭示了犁鼻器感觉上皮细胞中不同神经元亚型的内质网环境差异,并提供了可搜索的基因表达模式网络资源 | 研究仅限于小鼠犁鼻器感觉上皮细胞,未涉及其他物种或其他类型的细胞 | 探究犁鼻器感觉上皮细胞中的细胞类型、发育基因表达模式以及神经元之间的功能差异 | 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的神经元亚型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的多个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-12-16 |
CAR T cells secreting NGF-neutralizing scFv enhance efficacy in clear cell renal cell carcinoma by relieving immunosuppression through immunosympathectomy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009910
PMID:39653553
|
研究论文 | 本研究探讨了通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv来缓解肾透明细胞癌免疫抑制微环境,从而增强CAR T细胞的抗肿瘤效果 | 首次提出通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv实现肿瘤免疫交感神经切除,从而减弱肿瘤微环境的免疫抑制 | 研究主要集中在肾透明细胞癌,其结果在其他类型肿瘤中的适用性尚不明确 | 探索通过免疫交感神经切除增强CAR T细胞在实体瘤中的疗效 | 肾透明细胞癌的免疫抑制微环境和CAR T细胞的抗肿瘤效果 | 免疫学 | 肾癌 | RNA测序 | CAR T细胞 | RNA | 多种癌症类型的基因集和肾透明细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2024-12-16 |
Multiomics reveals tumor microenvironment remodeling in locally advanced gastric and gastroesophageal junction cancer following neoadjuvant immunotherapy and chemotherapy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010041
PMID:39653554
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了局部晚期胃癌和胃食管交界癌在接受新辅助免疫治疗和化疗后肿瘤微环境的动态变化 | 首次通过多组学分析揭示了新辅助免疫化疗后肿瘤微环境的动态变化,并构建了一个预测主要病理反应的模型 | 样本量较小,仅基于一个临床试验的数据,可能限制了结果的普适性 | 探讨新辅助免疫化疗对局部晚期胃癌和胃食管交界癌肿瘤微环境的影响及其机制 | 局部晚期胃癌和胃食管交界癌患者在接受新辅助免疫化疗前后的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序、全转录组测序、多重免疫荧光和单细胞RNA测序 | 回归模型 | 基因组数据、转录组数据、免疫细胞数据 | 30名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2024-12-16 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Pivotal Role of DOCK2 in Sjögren Disease
2024-Dec, ACR open rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/acr2.11738
PMID:39382155
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了DOCK2在干燥综合征中的关键作用,并验证了DOCK2抑制剂在SjD小鼠模型中的治疗效果 | 首次揭示了DOCK2在CD8+ T细胞中的高表达与干燥综合征的关联,并验证了DOCK2抑制剂在缓解疾病症状中的有效性 | 研究仅在SjD小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证DOCK2抑制剂的疗效 | 解析干燥综合征唾液腺中的致病细胞群体及其免疫通路,并探索DOCK2作为潜在治疗靶点的可能性 | 干燥综合征小鼠模型的唾液腺免疫细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 干燥综合征小鼠模型的唾液腺免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2024-12-15 |
Dynamic changes in serum adenosine and the adenosine metabolism-based signature for prognosis in HER2-positive metastatic breast cancer patients
2024-Dec-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39545
PMID:39669152
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研究论文 | 研究探讨了HER2阳性转移性乳腺癌患者中血清腺苷及其代谢相关标志物在预后中的作用 | 首次动态监测HER2阳性转移性乳腺癌患者的血清腺苷水平,并验证了其在曲妥珠单抗治疗中的预测价值 | 研究样本量较小,且仅限于HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 探索腺苷在HER2阳性转移性乳腺癌中的预后意义及其在曲妥珠单抗治疗中的预测作用 | HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | DESeq2 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 109名HER2阳性转移性乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-12-15 |
Cancer specific up-regulated lactate genes associated with immunotherapy resistance in a pan-cancer analysis
2024-Dec-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39491
PMID:39669156
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研究论文 | 本文通过比较TCGA队列中的恶性组织和正常组织,定义了一个泛癌上调乳酸评分,并评估了其在非小细胞肺癌、转移性肾癌、膀胱癌和黑色素瘤中的免疫治疗效果 | 首次识别出癌症内在的乳酸特征,并揭示了其与免疫检查点抑制剂抵抗的相关性 | 研究主要基于TCGA和CPTAC数据集,可能存在数据偏倚;验证性研究仅限于NSCLC队列 | 识别与免疫治疗抵抗相关的癌症特异性上调乳酸基因,并探讨其潜在机制 | 非小细胞肺癌、转移性肾癌、膀胱癌和黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 转录组学和蛋白质组学数据 | 涉及TCGA、CPTAC以及内部NSCLC队列的多个样本 | NA | NA | NA | NA |