单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 620 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-12-07 |
Single-cell transcriptomics of human organoid-derived enteroendocrine cell populations from the small intestine
2024-Dec-05, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287463
PMID:39639676
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对人类小肠类器官来源的肠内分泌细胞群体进行了图谱绘制 | 首次通过CRISPR-Cas9技术对人类小肠类器官进行基因修饰，并利用单细胞RNA测序技术详细分析了肠内分泌细胞的基因表达特征 | 研究主要集中在小肠类器官，未涉及大肠和其他器官的肠内分泌细胞 | 通过单细胞RNA测序技术绘制人类肠内分泌细胞的图谱，以促进针对肠内分泌轴的药物开发 | 人类小肠类器官来源的肠内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自人类十二指肠和回肠的类器官样本 |
| 442 | 2024-12-07 |
Cancer-associated fibroblast-derived MMP11 promotes tumor progression in pancreatic cancer
2024-Dec-05, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16418
PMID:39639765
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研究论文 | 研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）分泌的MMP11在胰腺癌进展中的作用 | 首次揭示了MMP11在胰腺导管腺癌（PDAC）中的表达模式及其通过TGF-β1介导的CAF激活促进肿瘤进展的机制 | 研究主要集中在体外和动物模型中，尚未在临床样本中验证MMP11抑制对患者生存的影响 | 探讨MMP11在胰腺癌中的表达及其对肿瘤进展的影响 | 胰腺导管腺癌（PDAC）组织、癌症相关成纤维细胞（CAFs）、胰腺癌细胞 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、共免疫荧光染色 | NA | RNA | 涉及AsPC-1和BxPC-3细胞以及裸鼠模型 |
| 443 | 2024-12-07 |
Elevated Shear Stress Modulates Heterogenous Cellular Subpopulations to Induce Vascular Remodeling
2024-Dec, Tissue engineering. Part A
DOI:10.1089/ten.TEA.2023.0362
PMID:38753711
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研究论文 | 研究探讨了高剪切应力对血管重塑过程中异质细胞亚群的调节作用 | 首次在单细胞分辨率下全面研究高剪切应力诱导血管重塑的分子机制 | 研究仅限于动物模型，尚未在人体中验证 | 探讨高剪切应力对血管重塑的影响及其分子机制 | 血管内皮细胞和巨噬细胞 | 心血管疾病 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用大鼠隐静脉构建动静脉环路模型 |
| 444 | 2024-12-07 |
A Strategy Involving Microporous Microneedles Integrated with CAR-TREM2-Macrophages for Scar Management by Regulating Fibrotic Microenvironment
2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202406153
PMID:39313983
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研究论文 | 本文介绍了一种利用微孔微针集成CAR-TREM2-巨噬细胞的策略，通过调节纤维化微环境来管理瘢痕 | 开发了CAR-TREM2-巨噬细胞，能够靶向DPP4成纤维细胞并调节瘢痕微环境中的内皮细胞亚型，有效预防瘢痕形成 | NA | 研究通过多因素调节瘢痕微环境来抑制瘢痕形成的有效策略 | DPP4阳性成纤维细胞、内皮细胞、TREM2巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤损伤 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 445 | 2024-12-07 |
Investigating TCR-pMHC interactions for TCRs without identified epitopes by constructing a computational pipeline
2024-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.136502
PMID:39423970
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研究论文 | 本文提出了一种计算流程，结合结构信息和单细胞测序数据，研究未识别表位的TCR的表位识别机制 | 通过抗原特异性聚类，将已知表位和未知表位的TCR进行表位序列映射，并使用分子动力学模拟揭示表位识别机制 | NA | 研究TCR与pMHC相互作用的分子机制，以激活T细胞免疫反应并合理设计基于TCR的治疗方法 | 未识别表位的TCR的表位识别机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 分子动力学模拟 | 序列数据 | 614个T细胞（TCR-614）和204个T细胞（TCR-204） |
| 446 | 2024-12-07 |
Splicing the Difference: Harnessing the Complexity of the Transcriptome in Hematopoiesis
2024-Dec, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104655
PMID:39393608
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综述 | 本文综述了剪接变异在造血过程中的复杂性和重要性，并介绍了相关的新技术和研究进展 | 本文介绍了多色流式细胞分选与批量和单细胞测序相结合的新技术，以及剪接因子突变在血液系统恶性肿瘤中的作用 | NA | 更新听众对造血过程中剪接变异的新技术和研究进展的了解 | 造血过程中的剪接变异及其在血液系统疾病中的作用 | NA | 血液系统疾病 | 多色流式细胞分选、批量测序、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 447 | 2024-12-01 |
Cellular diversity of human inner ear organoids revealed by single-cell transcriptomics
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202524
PMID:39612289
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了人类内耳类器官的细胞多样性 | 本文讨论了通过单细胞转录组学分析提供的新见解，有助于定义理解内耳发育的新研究路径 | 目前尚不清楚这些类器官在多大程度上模拟了体内人类内耳的发育和细胞组成 | 研究人类内耳类器官的细胞多样性及其在发育、听力损失和眩晕相关突变以及新疗法中的应用 | 人类内耳类器官及其细胞类型 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 448 | 2024-12-06 |
Dietary caloric restriction protects experimental autoimmune uveitis by regulating Teff/Treg balance
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111279
PMID:39628557
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研究论文 | 研究探讨了饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响及其机制 | 首次详细研究了饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响，并揭示了其通过调节Teff/Treg平衡来减轻疾病的机制 | 研究仅在实验小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的治疗潜力 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞数据 | 小鼠颈部引流淋巴结样本 |
| 449 | 2024-12-06 |
A transcriptome-based risk model in sepsis enables prognostic prediction and drug repositioning
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111277
PMID:39628572
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研究论文 | 本研究开发了一种基于转录组特征的脓毒症风险模型，用于早期风险分层和药物再定位 | 该模型在脓毒症诊断和预后方面表现优异，揭示了高风险患者的免疫抑制状态和低风险患者对氢化可的松的反应不佳，并通过单细胞转录组分析进一步阐明了四个基因在免疫细胞类型中的表达模式和效应 | NA | 开发一种基于转录组特征的脓毒症风险模型，用于早期风险分层和药物再定位 | 脓毒症患者的风险分层和药物再定位 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组分析 | 风险评分模型 | 转录组数据 | NA |
| 450 | 2024-12-06 |
Diverse NKT cells regulate early inflammation and neurological outcomes after cardiac arrest and resuscitation
2024-Dec-04, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adq5796
PMID:39630883
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研究论文 | 研究分析了心脏骤停和复苏后循环免疫细胞的变化，发现多样性NKT细胞在改善神经系统结果中起关键作用 | 首次发现多样性NKT细胞在心脏骤停后对神经系统保护的作用，并提出通过增强这些细胞的数量或功能来治疗心脏骤停的策略 | 研究主要基于小鼠模型和临床患者数据，需要进一步的临床试验验证 | 探讨心脏骤停后神经系统损伤的机制及潜在治疗策略 | 心脏骤停患者和小鼠模型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞 | 大量心脏骤停患者和小鼠样本 |
| 451 | 2024-12-06 |
Complete Genomic Landscape Reveals Hidden Evolutionary History and Selection Signature in Asian Water Buffaloes (Bubalus bubalis)
2024-Dec-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407615
PMID:39630943
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研究论文 | 研究揭示了亚洲水牛（Bubalus bubalis）的完整基因组图谱，揭示了其隐藏的进化历史和选择特征 | 首次对470个驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组进行了测序和整合，揭示了驯化和生产力的遗传决定因素 | NA | 识别亚洲水牛驯化和生产力的遗传决定因素 | 驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 470个驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组 |
| 452 | 2024-12-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the dynamic changes in the tumor microenvironment during NMIBC recurrence
2024-Dec-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02044-2
PMID:39633115
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）复发过程中肿瘤微环境（TME）的动态变化 | 发现了与NMIBC复发相关的肿瘤相关成纤维细胞亚型和高表达IL-6的巨噬细胞亚型，并揭示了雌激素在复发性尿路上皮癌细胞中的上调 | 样本量较小，仅收集了10个样本，可能影响结果的普适性 | 帮助泌尿科医生和临床研究人员深入了解膀胱癌复发过程中肿瘤微环境的变化 | 非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）的复发过程 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10个非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）的初发和复发样本 |
| 453 | 2024-12-06 |
Dual function of PHF16 in reinstating homeostasis of murine intestinal epithelium after crypt regeneration
2024-Dec-02, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.08.009
PMID:39232563
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研究论文 | 研究报告了PHF16在肠道上皮再生后恢复稳态中的双重功能 | 首次揭示了PHF16通过调节HBO1介导的组蛋白H3K14乙酰化和CDC73的泛素化来恢复肠道上皮稳态 | NA | 研究PHF16在肠道上皮再生后的稳态恢复中的作用 | PHF16在小鼠肠道上皮再生中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), RNA测序 (RNA-seq), ATAC测序 | NA | RNA, ATAC | Phf16小鼠的肠道器官样本 |
| 454 | 2024-12-06 |
Neutrophil-based single-cell sequencing combined with transcriptome sequencing to explore a prognostic model of sepsis
2024-12-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80791-7
PMID:39622858
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和转录组测序数据，构建了一个基于中性粒细胞的脓毒症预后模型 | 本研究首次结合单细胞测序和转录组测序数据，构建了一个基于中性粒细胞的脓毒症预后模型，并展示了其强大的预测准确性 | 本研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据质量和样本偏差的问题 | 探索脓毒症的分子机制，并构建一个有效的预后模型 | 脓毒症患者的中性粒细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序、转录组测序 | Lasso回归模型 | 单细胞数据、基因表达数据 | 脓毒症患者的单细胞和基因表达数据来自公开数据库，具体样本数量未提及 |
| 455 | 2024-12-06 |
Left atrial single-cell transcriptomics reveals amphiregulin as a surrogate marker for atrial fibrillation
2024-Dec-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07308-w
PMID:39622943
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析左心房组织，揭示了心房颤动患者中巨噬细胞和单核细胞的异质性及其与非免疫细胞的相互作用，并识别出功能性生物标志物 | 首次通过单细胞和核RNA测序技术分析左心房组织，揭示了心房颤动患者中巨噬细胞和单核细胞的异质性及其与非免疫细胞的相互作用，并发现Amphiregulin作为心房颤动的替代标志物 | 研究样本量较小，且仅限于左心房组织，未来需要更大规模的研究来验证结果 | 识别心房颤动患者中巨噬细胞和单核细胞的异质性及其与非免疫细胞的相互作用，并寻找功能性生物标志物 | 心房颤动患者左心房组织中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞和核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 心房颤动患者和健康对照组的左心房组织样本 |
| 456 | 2024-12-06 |
Multi-omics joint screening of biomarkers related to M2 macrophages in gastric cancer
2024-Dec-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01623-8
PMID:39623254
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研究论文 | 本研究通过多组学联合筛选胃癌中与M2巨噬细胞相关的生物标志物，并构建诊断模型 | 本研究首次通过多组学分析筛选出与M2巨噬细胞相关的三个生物标志物，并构建了基于这些标志物的诊断模型 | 本研究主要基于公共数据库的数据进行分析，缺乏体内实验验证 | 探索胃癌中M2巨噬细胞作为生物标志物的潜力，并构建诊断模型 | 胃癌中的M2巨噬细胞及相关生物标志物 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、差异表达基因筛选（DESeq2）、差异表达蛋白筛选（limma） | 诊断模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 4146个差异表达基因和1946个差异表达蛋白 |
| 457 | 2024-12-06 |
Cross-species single-cell analysis reveals divergence and conservation of peripheral blood mononuclear cells
2024-Dec-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-11030-6
PMID:39623297
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研究论文 | 本文通过跨物种单细胞转录组测序分析，揭示了外周血单核细胞在不同物种间的差异和保守性 | 首次在12个物种中进行外周血单核细胞的单细胞转录组比较分析，揭示了免疫细胞在进化过程中的保守性和特异性 | NA | 研究免疫细胞在不同物种间的进化保守性和差异 | 外周血单核细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 12个物种的外周血单核细胞 |
| 458 | 2024-12-06 |
SMART: spatial transcriptomics deconvolution using marker-gene-assisted topic model
2024-Dec-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03441-1
PMID:39623485
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SMART的空间转录组解卷积方法，通过标记基因辅助主题模型同时推断每个点的细胞类型特异性基因表达谱和细胞组成 | SMART方法在现实环境中优于现有方法，并提供两阶段方法以增强对细胞亚型的性能 | NA | 开发一种新的空间转录组解卷积方法，以提高细胞类型特异性基因表达和细胞组成的推断精度 | 空间转录组数据中的细胞类型特异性基因表达和细胞组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 主题模型 | 基因表达数据 | 多个数据集 |
| 459 | 2024-12-06 |
Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-related platelet bias: implications for bone marrow transplantation and blood disorders
2024-Dec-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04084-6
PMID:39623507
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研究论文 | 研究了造血干细胞的异质性和与年龄相关的血小板偏向性，及其对骨髓移植和血液疾病的临床意义 | 揭示了造血干细胞中血小板偏向性的进化保守性，并探讨了其在骨髓移植和衰老相关血液疾病中的临床意义 | 讨论了当前方法学的局限性，并提出了未来研究方向以优化基于造血干细胞的治疗 | 探讨造血干细胞的异质性和与年龄相关的血小板偏向性对骨髓移植和血液疾病的影响 | 造血干细胞及其在骨髓移植和血液疾病中的作用 | NA | 血液疾病 | 单细胞RNA测序和分子条码技术 | NA | NA | NA |
| 460 | 2024-12-06 |
Prediction of Tumor-Associated Macrophages and Immunotherapy Benefits Using Weakly Supervised Contrastive Learning in Breast Cancer Pathology Images
2024-Dec, Journal of imaging informatics in medicine
DOI:10.1007/s10278-024-01166-y
PMID:38886290
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研究论文 | 本文提出了一种结合对比学习和弱监督学习的方法，用于从乳腺癌病理图像中预测肿瘤相关巨噬细胞和免疫治疗效果 | 本文首次将对比学习和弱监督学习应用于病理图像分析，以量化预测肿瘤浸润免疫细胞，特别是巨噬细胞的浸润水平 | 本文的实验主要基于乳腺癌数据，未来需要验证该方法在其他癌症类型中的适用性 | 研究旨在通过病理图像分析预测肿瘤免疫微环境中的免疫细胞浸润情况，以及评估免疫治疗效果 | 研究对象为乳腺癌病理图像中的肿瘤相关巨噬细胞和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 对比学习 | 对比学习模型 | 图像 | 两个独立的乳腺癌队列和空间转录组数据 |