单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 702 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-12-18 |
Sex-specific regulatory architecture of pancreatic islets from subjects with and without type 2 diabetes
2024-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00313-z
PMID:39567827
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研究论文 | 研究探讨了2型糖尿病患者与非糖尿病患者胰腺胰岛中性别特异性的调控结构差异 | 结合单细胞RNA测序和单核ATAC测序技术，首次揭示了2型糖尿病患者胰腺胰岛中性别特异性的染色质可及性和基因表达差异，并发现了与糖尿病相关的性别和细胞类型特异性变异 | 研究样本量较小，且仅限于人类胰腺胰岛，可能无法全面反映所有性别和细胞类型的差异 | 探讨2型糖尿病患者与非糖尿病患者胰腺胰岛中性别特异性的调控机制 | 2型糖尿病患者与非糖尿病患者的胰腺胰岛 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核ATAC测序（snATAC-seq） | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 52名捐赠者（包括2型糖尿病患者和非糖尿病患者） |
| 442 | 2024-11-22 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2024-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00308-w
PMID:39567832
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 443 | 2024-12-18 |
Exploring T Cell and NK Cell Involvement in Ankylosing Spondylitis Through Single-Cell Sequencing
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70206
PMID:39680481
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索强直性脊柱炎中T细胞和NK细胞的参与机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示了强直性脊柱炎中T细胞和NK细胞的关键作用，并发现了CD74基因在T细胞中的上调表达以及巨噬细胞迁移抑制因子信号通路在细胞间相互作用中的显著表达 | 研究样本量较小，仅包括三名强直性脊柱炎患者和三名非患者，可能影响结果的普适性 | 揭示强直性脊柱炎的复杂免疫机制，为识别新的治疗靶点和创新疗法奠定基础 | 强直性脊柱炎患者的骨髓细胞样本 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 三名强直性脊柱炎患者和三名非患者的骨髓细胞样本 |
| 444 | 2024-12-18 |
Cellular and Molecular Basis of Environment-Induced Color Change in a Tree Frog
2024-Dec-01, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14233472
PMID:39682437
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了树蛙皮肤颜色变化的细胞和分子机制 | 首次揭示了形态学颜色变化（MCC）在树蛙背景适应中的主导作用，并发现色素细胞的数量比单个细胞的转录活性对颜色变化的影响更大 | 研究对象仅限于一种树蛙，可能无法完全推广到其他物种 | 探讨环境诱导下树蛙皮肤颜色变化的细胞和分子机制 | 树蛙的皮肤色素细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 未明确说明具体样本数量 |
| 445 | 2024-12-18 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveals HSD3B7 as a Prognostic Biomarker and Potential Therapeutic Target in ccRCC
2024-Dec-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252312929
PMID:39684640
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了HSD3B7作为ccRCC的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出HSD3B7作为ccRCC的新型生物标志物，并验证了其在肿瘤进展中的作用 | 研究主要基于公开数据集，可能存在样本偏倚；功能研究仅限于体外和体内实验，缺乏临床验证 | 识别与ccRCC进展和预后相关的关键生物标志物，并探索其作为治疗靶点的潜力 | ccRCC的肿瘤进展和预后生物标志物 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 单细胞数据来自公开数据集，批量RNA-seq数据来自TCGA的ccRCC样本 |
| 446 | 2024-12-17 |
Inhibition of JNK Signaling Overcomes Cancer-Associated Fibroblast-Mediated Immunosuppression and Enhances the Efficacy of Immunotherapy in Bladder Cancer
2024-Dec-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0940
PMID:39292817
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研究论文 | 研究揭示了JNK信号通路在癌症相关成纤维细胞中介导的免疫抑制作用，并探讨了通过抑制JNK信号增强免疫治疗效果的策略 | 首次发现JNK信号通路在癌症相关成纤维细胞中通过上调胸腺基质淋巴细胞生成素（TSLP）表达来促进免疫抑制微环境，并提出抑制JNK信号与PD-1阻断联合治疗的新策略 | 研究主要集中在膀胱癌样本，结果的普适性需要进一步验证 | 探讨免疫抑制肿瘤微环境的机制，并寻找提高免疫治疗效果的新方法 | 膀胱癌中的癌症相关成纤维细胞（CAF）和CD8+ T细胞 | NA | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 膀胱癌样本 |
| 447 | 2024-12-17 |
Targeting SHCBP1 Inhibits Tumor Progression by Restoring Ciliogenesis in Ductal Carcinoma
2024-Dec-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1095
PMID:39312205
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研究论文 | 本文研究了SHCBP1在导管癌中的作用，发现SHCBP1的缺失通过恢复纤毛生成抑制肿瘤进展 | 首次揭示了SHCBP1与导管癌中纤毛生成之间的联系，并通过SHCBP1缺失恢复纤毛生成，抑制肿瘤进展 | 研究主要基于小鼠模型和患者来源的异种移植模型，需进一步验证在人类患者中的疗效 | 探讨SHCBP1在导管癌中的作用机制及其对纤毛生成的影响，寻找潜在的治疗策略 | 导管癌中的SHCBP1和纤毛生成 | NA | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 小鼠模型和大量导管癌患者样本 |
| 448 | 2024-12-17 |
A transcriptome-wide association study integrating multi-omics bioinformatics and Mendelian randomization reveals the prognostic value of ADAMDEC1 in colon cancer
2024-Dec-16, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-024-03910-3
PMID:39680087
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研究论文 | 本研究通过整合多组学生物信息学和孟德尔随机化方法，揭示了ADAMDEC1基因在结肠癌中的预后价值 | 本研究创新性地使用了scissor算法整合单细胞测序数据和bulk转录组数据，并结合孟德尔随机化方法，首次确定了ADAMDEC1基因作为结肠癌患者的预后保护因子 | 本研究依赖于现有的数据集和分析方法，可能存在数据偏倚和方法局限性 | 研究结肠癌的预后标志物，为临床试验和药物靶点研究提供线索 | 结肠癌患者的预后相关细胞和基因 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序 RNA-seq 孟德尔随机化 | NA | 转录组数据 基因组数据 | 使用了两个独立的外部验证数据集GSE17536和GSE39582，以及一个包含免疫组织化学实验的真实世界组织数据集 |
| 449 | 2024-12-17 |
Combined Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis to Reveal the Potential Influences of Intestinal Inflammatory Disease on Multiple Sclerosis
2024-Dec-16, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02195-z
PMID:39680254
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研究论文 | 本研究通过结合批量和单细胞转录组分析，揭示了肠道炎症疾病对多发性硬化症的潜在影响 | 首次通过结合批量和单细胞转录组数据，识别出IBD和MS之间的共同差异表达基因（DEGs），并验证了这些基因在两种疾病中的免疫特性 | 研究主要依赖于公共数据集，缺乏对患者的直接实验验证 | 探讨肠道炎症疾病与多发性硬化症之间的共同病理生理机制 | 多发性硬化症（MS）和炎症性肠病（IBD）的共同差异表达基因及其在免疫系统中的作用 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | RNA测序、单细胞转录组测序、质谱流式细胞术（CyTOF） | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个公共数据集，包括GSE126124、GSE9686、GSE36807、GSE21942、GSE17048、GSE75214、GSE16879和PRJCA003980 |
| 450 | 2024-12-17 |
SpatialCVGAE: Consensus Clustering Improves Spatial Domain Identification of Spatial Transcriptomics Using VGAE
2024-Dec-16, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00676-1
PMID:39680300
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpatialCVGAE的共识聚类框架，用于空间转录组数据分析，以提高空间域识别的稳定性和准确性 | SpatialCVGAE通过结合多个空间图和变分图自编码器（VGAE）学习多个潜在表示，并使用共识聚类方法整合这些结果，从而提高了模型的稳定性和鲁棒性 | NA | 解决空间转录组数据分析中由于数据稀疏和高噪声导致的聚类不稳定问题 | 空间转录组数据的空间域识别 | 数字病理学 | NA | 变分图自编码器（VGAE） | 变分图自编码器（VGAE） | 空间转录组数据 | NA |
| 451 | 2024-12-17 |
A human forebrain organoid model reveals the essential function of GTF2IRD1-TTR-ERK axis for the neurodevelopmental deficits of Williams syndrome
2024-Dec-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98081
PMID:39671308
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研究论文 | 本文研究了Williams综合征患者前脑类器官模型中GTF2IRD1-TTR-ERK轴对神经发育缺陷的关键作用 | 首次揭示了GTF2IRD1通过调节TTR-ERK通路在前脑类器官和小鼠模型中调控神经发育的关键功能 | 研究主要集中在体外类器官模型和小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨Williams综合征神经发育缺陷的分子机制 | Williams综合征患者的前脑类器官和小鼠模型 | 数字病理学 | Williams综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照和Williams综合征类器官的13个细胞集群 |
| 452 | 2024-12-17 |
Single-cell RNA sequencing reveals the important role of Dcaf17 in spermatogenesis of golden hamsters†
2024-Dec-12, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae132
PMID:39239833
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研究论文 | 本文研究了Dcaf17在金黄地鼠精子发生中的重要作用，通过单细胞RNA测序分析了Dcaf17缺失对不同精子发生阶段转录水平的影响 | 本文首次通过CRISPR-Cas9技术创建了Dcaf17缺陷的金黄地鼠模型，揭示了Dcaf17在精子发生中的关键调控作用，并提供了新的动物模型用于研究Dcaf17 | 本文仅在金黄地鼠模型中研究了Dcaf17的作用，未来需要进一步在其他物种中验证其普遍性 | 探讨Dcaf17在雄性生殖系统中的作用及其在精子发生中的分子机制 | Dcaf17缺陷的金黄地鼠及其精子发生过程 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Dcaf17缺陷的金黄地鼠 |
| 453 | 2024-12-17 |
Evaluating the Utilities of Foundation Models in Single-cell Data Analysis
2024-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.08.555192
PMID:38464157
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研究论文 | 本文评估了基础模型在单细胞数据分析中的性能 | 提出了一个评估框架，用于评估单细胞基础模型的超参数、初始设置和训练稳定性，并提供了预训练和微调的指南 | 单细胞基础模型在所有任务中并不总是优于任务特定方法，这挑战了开发单细胞分析基础模型的必要性 | 评估基础模型在单细胞数据分析中的性能，并提供改进方法开发的指南 | 单细胞测序数据分析中的基础模型 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型（如scGPT、Geneformer、CellPLM） | 单细胞数据 | NA |
| 454 | 2024-12-17 |
Bgee in 2024: focus on curated single-cell RNA-seq datasets, and query tools
2024-Dec-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1118
PMID:39656924
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研究论文 | 本文介绍了Bgee数据库的更新，重点是整合了经过精心筛选的单细胞RNA测序数据集，并提供了新的查询工具 | Bgee现在能够提供跨物种的基因表达模式比较，直至细胞分辨率，并且扩展了物种数量，增加了对鱼类、农业和兽医重要物种以及非人类灵长类动物的支持 | NA | 更新Bgee数据库，整合单细胞RNA测序数据，并提供新的查询工具 | 跨物种的基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及52个物种的单细胞RNA测序数据 |
| 455 | 2024-12-17 |
Identification of Key Genes in Fetal Gut Development at Single-Cell Level by Exploiting Machine Learning Techniques
2024-Dec, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400104
PMID:39324223
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研究论文 | 本研究利用机器学习技术在单细胞水平上识别胎儿肠道发育的关键基因 | 首次在单细胞水平上利用机器学习技术对胎儿肠道发育的细胞进行分类，并识别出关键基因 | 研究仅限于特定的单细胞测序数据集，可能无法全面代表所有胎儿肠道发育情况 | 通过机器学习技术增强对胎儿肠道发育的理解 | 胎儿肠道发育中的细胞分类和关键基因识别 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因特征数据 | 62,849个样本，每个样本具有33,694个不同的基因特征 |
| 456 | 2024-12-17 |
Exploring the Role of EBV Infection in EBV-T/NKLPD With EBV Capture Technology Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70094
PMID:39679761
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 457 | 2024-12-16 |
Homoharringtonine synergizes with venetoclax in early T cell progenitor acute lymphoblastic leukemia: Bench and bed
2024-Dec-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.07.018
PMID:39151422
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研究论文 | 研究评估了homoharringtonine（HHT）与venetoclax（VEN）联合治疗早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病（ETP-ALL）的协同效应及其机制 | 首次展示了HHT与VEN联合治疗ETP-ALL的强协同效应，并通过单细胞RNA测序和western blot验证了其机制 | 研究样本量较小，仅包括6名患者，需要进一步的大规模临床试验验证 | 探索HHT与VEN联合治疗ETP-ALL的疗效及其机制 | 早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病（ETP-ALL）患者 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序，western blot | NA | 细胞 | 6名ETP-ALL患者 |
| 458 | 2024-12-16 |
Single-cell transcriptomics of vomeronasal neuroepithelium reveals a differential endoplasmic reticulum environment amongst neuronal subtypes
2024-Dec-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98250
PMID:39670989
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析小鼠犁鼻器感觉上皮细胞，揭示了不同神经元亚型之间的内质网环境的差异 | 首次通过单细胞转录组学揭示了犁鼻器感觉上皮细胞中不同神经元亚型的内质网环境差异，并提供了可搜索的基因表达模式网络资源 | 研究仅限于小鼠犁鼻器感觉上皮细胞，未涉及其他物种或其他类型的细胞 | 探究犁鼻器感觉上皮细胞中的细胞类型、发育基因表达模式以及神经元之间的功能差异 | 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的神经元亚型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的多个单细胞样本 |
| 459 | 2024-12-16 |
CAR T cells secreting NGF-neutralizing scFv enhance efficacy in clear cell renal cell carcinoma by relieving immunosuppression through immunosympathectomy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009910
PMID:39653553
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研究论文 | 本研究探讨了通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv来缓解肾透明细胞癌免疫抑制微环境，从而增强CAR T细胞的抗肿瘤效果 | 首次提出通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv实现肿瘤免疫交感神经切除，从而减弱肿瘤微环境的免疫抑制 | 研究主要集中在肾透明细胞癌，其结果在其他类型肿瘤中的适用性尚不明确 | 探索通过免疫交感神经切除增强CAR T细胞在实体瘤中的疗效 | 肾透明细胞癌的免疫抑制微环境和CAR T细胞的抗肿瘤效果 | 免疫学 | 肾癌 | RNA测序 | CAR T细胞 | RNA | 多种癌症类型的基因集和肾透明细胞癌样本 |
| 460 | 2024-12-16 |
Multiomics reveals tumor microenvironment remodeling in locally advanced gastric and gastroesophageal junction cancer following neoadjuvant immunotherapy and chemotherapy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010041
PMID:39653554
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了局部晚期胃癌和胃食管交界癌在接受新辅助免疫治疗和化疗后肿瘤微环境的动态变化 | 首次通过多组学分析揭示了新辅助免疫化疗后肿瘤微环境的动态变化，并构建了一个预测主要病理反应的模型 | 样本量较小，仅基于一个临床试验的数据，可能限制了结果的普适性 | 探讨新辅助免疫化疗对局部晚期胃癌和胃食管交界癌肿瘤微环境的影响及其机制 | 局部晚期胃癌和胃食管交界癌患者在接受新辅助免疫化疗前后的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序、全转录组测序、多重免疫荧光和单细胞RNA测序 | 回归模型 | 基因组数据、转录组数据、免疫细胞数据 | 30名患者 |