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当前共找到 702 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-12-28 |
Driver mutation landscape of acute myeloid leukemia provides insights for neoantigen-based immunotherapy
2024-Dec-24, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217427
PMID:39725148
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研究论文 | 本研究通过DNA和RNA测序，全面分析了急性髓性白血病（AML）的驱动突变及其对患者预后和免疫微环境的影响，为基于新抗原的免疫治疗提供了新的见解 | 首次全面描绘了AML的新抗原景观，开发了两种表位免疫原性模型，并通过实验验证了30个新抗原的免疫原性 | 研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索AML驱动突变产生的新抗原及其对免疫治疗的影响 | 304名AML患者及其匹配的DNA和RNA测序数据，以及约2,500例AML病例的整合数据 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | DNA测序, RNA测序, 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术 | 表位免疫原性模型 | DNA, RNA, 单细胞RNA测序数据 | 304名AML患者及约2,500例AML病例 | NA | NA | NA | NA |
| 422 | 2024-12-28 |
Decoding Kidney Pathophysiology: Omics-Driven Approaches in Precision Medicine
2024-Dec-19, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm14121157
PMID:39728069
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研究论文 | 本文探讨了利用多组学技术在精准医学中解码肾脏病理生理学的方法 | 结合基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和表观基因组学等多组学技术，识别疾病亚型、分子生物标志物和治疗靶点，推动个性化治疗 | 数据整合问题、高成本和伦理困境等挑战仍然存在 | 通过精准医学改善肾脏疾病的诊断、风险评估和个性化治疗 | 慢性肾脏病（CKD） | 精准医学 | 慢性肾脏病 | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习和因果推理模型 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 423 | 2024-12-28 |
MitoSort: Robust Demultiplexing of Pooled Single-cell Genomic Data Using Endogenous Mitochondrial Variants
2024-Dec-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae073
PMID:39404807
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研究论文 | 本文提出了一种名为MitoSort的工具，利用线粒体种系变异对单细胞基因组数据进行样本去复用和交叉基因型双联体检测 | MitoSort使用线粒体种系变异作为内源性条形码，解决了现有工具在单细胞测序方法中覆盖核基因组区域不足的局限性 | MitoSort的应用依赖于线粒体变异的可靠检测，可能在某些情况下受到限制 | 开发一种高效且准确的方法，用于单细胞基因组数据中的样本去复用和双联体检测 | 单细胞基因组数据，特别是单细胞ATAC-seq数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞基因组数据 | 八个供体的B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 424 | 2024-12-28 |
Neonatal Brain Injury Triggers Niche-Specific Changes to Cellular Biogeography
2024-Dec, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0224-24.2024
PMID:39681473
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研究论文 | 本文通过高分辨率成像空间转录组学技术，构建了新生小鼠脑损伤后的全脑再生反应图谱，揭示了慢性缺氧对早期神经发育的影响 | 开发了一种新的方法来推断细胞类型空间邻近性的条件相关差异，从而识别细胞结构的特定区域变化 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨新生儿脑损伤后的分子机制，特别是慢性缺氧对神经发育的影响 | 新生小鼠的脑组织 | 数字病理学 | 新生儿脑损伤 | 高分辨率成像空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过800,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 425 | 2024-12-28 |
Comprehensive Analysis of Bulk RNA-Seq and Single-Cell RNA-Seq Data Unveils Sevoflurane-Induced Neurotoxicity Through SLC7A11-Associated Ferroptosis
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70307
PMID:39724413
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研究论文 | 本研究通过分析bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据，揭示了七氟醚通过SLC7A11相关的铁死亡诱导神经毒性的机制 | 首次发现七氟醚通过SLC7A11调控星形胶质细胞铁死亡，提供了七氟醚相关神经毒性通路的新见解 | 研究主要基于小鼠模型和U251星形胶质瘤细胞，尚未在人类样本中验证 | 探讨七氟醚对认知功能和神经发育的潜在影响，特别是对易感人群如婴儿和老年人的影响 | 七氟醚暴露的小鼠和U251星形胶质瘤细胞 | 神经科学 | 神经毒性 | bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq (scRNA-seq) | NA | RNA-Seq数据 | 七氟醚暴露的小鼠和U251星形胶质瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 426 | 2024-12-26 |
Single cell profiling of hematopoietic stem cell transplant recipients reveals TGF-β1 and IL-2 confer immunoregulatory functions to NK cells
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111416
PMID:39720529
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了在造血干细胞移植受者中，TGF-β1和IL-2如何赋予NK细胞免疫调节功能 | 首次定义了在造血干细胞移植后，CD56NK细胞群体与急性移植物抗宿主病（GVHD）保护之间的关联，并阐明了IL-2和TGF-β1联合作用在促进NK细胞调节表型中的角色 | 诱导的调节性NK细胞表型不稳定，暴露于不同细胞因子后会失去分泌TGF-β1的能力 | 研究造血干细胞移植后NK细胞的免疫调节功能 | 造血干细胞移植受者的NK细胞 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 造血干细胞移植受者的NK细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-12-26 |
Myeloperoxidase and Thyrotropin-Releasing Hormone Within Leukaemia Stem Cells Increased Chemosensitivity in Acute Myeloid Leukaemia
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70306
PMID:39720891
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研究论文 | 本研究探讨了白血病干细胞（LSCs）中的髓过氧化物酶（MPO）和促甲状腺激素释放激素（TRH）在急性髓性白血病（AML）化疗敏感性中的作用 | 首次在LSCs中识别出MPO和TRH作为AML化疗敏感性的潜在生物标志物，并发现其与患者无复发生存率和总生存率的显著相关性 | 样本量较小（20名患者），且仅涉及接受'7+3'诱导治疗的患者，可能限制结果的普遍性 | 识别LSCs中能预测AML化疗敏感性的生物标志物 | 急性髓性白血病（AML）患者 | 生物医学研究 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 20名新诊断的AML患者 | NA | NA | NA | NA |
| 428 | 2024-12-26 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Injuries in Aortic Dissection and Identifies PDGF Signalling Pathway as a Potential Therapeutic Target
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70293
PMID:39720896
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了主动脉夹层中的细胞异质性及相关损伤，并识别出PDGF信号通路作为潜在的治疗靶点 | 首次应用单细胞RNA测序技术全面解析主动脉夹层的细胞异质性，并发现PDGF信号通路在疾病中的关键作用 | 样本量较小，且未进行长期随访以验证治疗靶点的临床效果 | 揭示主动脉夹层的细胞异质性及分子机制，探索潜在治疗靶点 | 主动脉夹层患者及非主动脉夹层供体的主动脉细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 主动脉夹层患者及非主动脉夹层供体的主动脉细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 429 | 2024-12-25 |
Interplay between Netrin-1 and Norrin controls arteriovenous zonation of blood-retina barrier integrity
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2408674121
PMID:39693351
|
研究论文 | 研究探讨了Netrin-1和Norrin信号通路在控制视网膜屏障完整性中的相互作用 | 首次揭示了Netrin-1/Unc5b和Norrin/Lrp5信号通路在视网膜屏障中的区室化基因表达调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步验证在人类中的适用性 | 探讨Netrin-1和Norrin信号通路在视网膜屏障完整性中的作用 | 视网膜屏障的完整性和基因表达调控 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用出生后视网膜屏障功能性小鼠视网膜内皮细胞进行单细胞RNA测序，识别了超过100个视网膜屏障相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 430 | 2024-12-25 |
Pathway metrics accurately stratify T cells to their cells states
2024-Dec-24, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-024-00416-7
PMID:39716187
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PathSingle的Python工具，用于单细胞数据分析中的通路分析，能够准确分类T细胞的不同状态 | PathSingle采用独特的基于图的算法，能够分类不同的细胞状态，如T细胞亚型 | NA | 开发一种工具，用于从单细胞转录组数据中揭示生物学上有意义的见解 | T细胞及其亚型 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组分析 | 基于图的算法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 431 | 2024-12-25 |
Systematic pan-cancer analysis identifies ZBTB11 as a potential pan-cancer biomarker and immunotherapy target in multiple tumor types
2024-Dec-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01697-4
PMID:39715911
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研究论文 | 本文系统分析了ZBTB11在多种肿瘤类型中的表达、预后价值、基因突变和DNA启动子甲基化，并探讨了其在肿瘤发生和免疫治疗中的潜在作用 | 首次系统性地分析了ZBTB11在多种肿瘤类型中的表达和预后价值，并构建了ZBTB11的竞争性lncRNA-miRNA网络，揭示了其在肿瘤生物学行为中的调控作用 | 研究主要基于数据库和在线工具的分析，缺乏实验验证 | 探讨ZBTB11在多种肿瘤类型中的生物学意义及其作为潜在生物标志物和免疫治疗靶点的可能性 | ZBTB11在不同肿瘤类型中的表达、预后价值、基因突变、DNA甲基化和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 多种肿瘤类型 | DNA甲基化测序、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、突变数据、甲基化数据 | 多种肿瘤类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 432 | 2024-12-25 |
Uncovering the molecular networks of ferroptosis in the pathogenesis of type 2 diabetes and its complications: a multi-omics investigation
2024-Dec-23, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-01045-w
PMID:39716081
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示铁死亡在2型糖尿病及其并发症发病机制中的分子网络 | 首次通过多组学分析揭示铁死亡相关基因在2型糖尿病及其并发症中的作用，并验证了影像基因组学在非侵入性诊断中的潜力 | 研究依赖于现有数据集，可能存在样本偏倚和数据异质性 | 揭示铁死亡在2型糖尿病及其并发症中的作用，并探索非侵入性诊断的可能性 | 2型糖尿病及其并发症，包括糖尿病肾病、糖尿病心肌病和非酒精性脂肪肝病 | NA | 糖尿病 | 多组学分析、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质丰度数据、影像基因组数据 | 包括发现队列、验证队列和影像基因组队列的多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 433 | 2024-12-25 |
Single-cell transcriptome analysis reveals reciprocal epithelial and endothelial cell evolution in ovarian cancer
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111417
PMID:39717089
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了卵巢癌中上皮细胞和内皮细胞的相互进化关系 | 首次揭示了输卵管上皮细胞向卵巢癌上皮细胞的潜在发展趋势，并发现了与肿瘤血管生成相关的内皮细胞亚型 | 研究仅限于卵巢癌中的上皮细胞和内皮细胞，未涉及其他细胞类型 | 探讨卵巢癌发展过程中上皮细胞和内皮细胞的相互作用 | 卵巢癌中的上皮细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 87,847个上皮细胞和11,696个内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 434 | 2024-12-25 |
Current transcriptome database and biomarker discovery for immunotherapy by immune checkpoint blockade
2024-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.09.627506
PMID:39713380
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综述 | 本文综述了免疫检查点阻断（ICB）疗法的当前转录组数据库和生物标志物发现，重点讨论了肿瘤基因组、肿瘤微环境和肿瘤-宿主相互作用的生物标志物，并介绍了IOhub平台用于基准分析当前生物标志物 | 介绍了IOhub平台，该平台整合了36个bulk和10个单细胞转录组数据集，用于生物标志物的基准分析 | NA | 探讨免疫检查点阻断疗法的生物标志物发现和当前转录组数据库 | 肿瘤基因组、肿瘤微环境和肿瘤-宿主相互作用的生物标志物 | 数字病理学 | 癌症 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 36个bulk和10个单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 435 | 2024-12-25 |
Rates of evolution differ between cell types identified by single-cell RNAseq in threespine stickleback
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.06.627160
PMID:39713298
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研究论文 | 本文结合单细胞RNA测序（scRNAseq）和进化基因组学，研究了不同细胞类型在进化过程中的基因差异性 | 首次将单细胞RNA测序技术与进化基因组数据结合，揭示了免疫细胞类型的基因进化速度特别快 | 研究仅限于三刺鱼，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨不同细胞类型在进化过程中的基因差异性 | 三刺鱼的不同细胞类型及其特征基因的进化速度 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因数据 | 多个三刺鱼种群和物种的基因数据 | NA | NA | NA | NA |
| 436 | 2024-12-25 |
Inference and analysis of cell-cell communication of non-myeloid circulating cells in late sepsis based on single-cell RNA-seq
2024-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12109
PMID:39578684
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症中非髓系循环细胞间的细胞间通讯 | 揭示了脓毒症患者中细胞间相互作用的数量和强度增加，并发现了几条显著改变的信号通路，特别是传统树突状细胞和浆细胞样树突状细胞中的通路 | NA | 深入理解晚期脓毒症中免疫功能障碍的潜在机制 | 晚期脓毒症中淋巴系来源的白细胞间的细胞间通讯 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 437 | 2024-12-25 |
Identification of CCR7 and CBX6 as key biomarkers in abdominal aortic aneurysm: Insights from multi-omics data and machine learning analysis
2024-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12106
PMID:39602349
|
研究论文 | 本研究利用多组学数据和机器学习技术，识别了腹主动脉瘤中的关键生物标志物CCR7和CBX6，并揭示了其免疫机制 | 首次通过多组学数据和机器学习技术识别了腹主动脉瘤中的关键生物标志物CCR7和CBX6，并揭示了它们与免疫细胞浸润的相关性 | 研究主要基于数据分析，缺乏实验验证 | 识别腹主动脉瘤的关键生物标志物并揭示其免疫机制 | 腹主动脉瘤中的关键生物标志物和免疫机制 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 438 | 2024-12-25 |
Cell- and tissue-specific glycosylation pathways informed by single-cell transcriptomics
2024-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae169
PMID:39703423
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了人类组织和细胞类型的糖基化相关基因表达，揭示了细胞和组织特异性糖基化途径 | 首次在糖科学领域应用单细胞转录组学，揭示了糖基化基因和途径的表达层次结构，并展示了细胞和组织特异性糖基化模式 | 研究依赖于Tabula Sapiens数据集，可能无法涵盖所有人类细胞类型和组织 | 探讨单细胞水平上糖基化相关基因的表达模式及其在不同组织和细胞类型中的特异性 | 人类组织和细胞类型的糖基化相关基因表达 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | Tabula Sapiens数据集中的人类组织和细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 439 | 2024-12-25 |
Deep clustering representation of spatially resolved transcriptomics data using multi-view variational graph auto-encoders with consensus clustering
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.041
PMID:39717398
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研究论文 | 提出了一种名为STMVGAE的新工具，结合多视图变分图自编码器和共识聚类框架，用于空间转录组数据的深度聚类表示 | STMVGAE通过结合多视图变分图自编码器和共识聚类框架，有效整合了基因表达数据、组织学图像和空间坐标数据，显著提高了聚类精度和稳定性 | NA | 开发一种新的工具，用于准确识别空间转录组数据中的空间域，以支持下游分析 | 空间转录组数据中的空间域识别 | 数字病理学 | NA | 变分图自编码器（VGAE） | 卷积神经网络（CNN） | 图像和基因表达数据 | 五个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 440 | 2024-12-24 |
scEGOT: single-cell trajectory inference framework based on entropic Gaussian mixture optimal transport
2024-Dec-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05988-z
PMID:39710672
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scEGOT的单细胞轨迹推断框架，基于熵高斯混合最优传输理论，用于推断细胞分化轨迹 | scEGOT框架具有高解释性和低计算成本，能够应用于单细胞RNA-seq数据并扩展到其他单细胞数据类型如scATAC-seq | NA | 研究细胞分化机制并推断细胞分化轨迹 | 人类原始生殖细胞样细胞（PGCLC）诱导系统 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生成模型 | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |