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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-12-21 |
Roles of boron in preventing cadmium uptake by Capsicum annuum root tips: Novel insights from ultrastructural investigation and single-cell RNA sequencing
2024-Dec-20, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.177858
PMID:39631329
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研究论文 | 本文通过超微结构分析和单细胞RNA测序研究了硼对辣椒根尖镉吸收的影响及其分子机制 | 首次通过超微结构分析和单细胞RNA测序揭示了硼通过诱导根尖内皮层木质化来减少镉积累的机制 | 研究仅限于辣椒根尖,未探讨其他植物或组织中的情况 | 探讨硼在减少作物镉积累中的作用及其分子机制 | 辣椒(Capsicum annuum L.)根尖 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-12-21 |
SNRNP70 regulates the splicing of CD55 to promote osteosarcoma progression
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185269
PMID:39704173
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研究论文 | 研究探讨了SNRNP70在调节CD55剪接以促进骨肉瘤进展中的作用 | 首次揭示了SNRNP70通过调节CD55的剪接促进骨肉瘤进展的机制,并发现SNRNP70表达的成骨细胞与巨噬细胞通过ADGRE5/CD55信号通路进行交流 | 研究主要集中在体外和体内实验,缺乏更大规模的临床验证 | 探讨SNRNP70在骨肉瘤进展中的作用及其机制 | SNRNP70、CD55、骨肉瘤细胞及免疫细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括原发性和转移性骨肉瘤样本,具体数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-12-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals the contribution of smooth muscle cells and endothelial cells to fibrosis in human atrial tissue with atrial fibrillation
2024-Dec-19, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00999-1
PMID:39701940
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了心房颤动患者心房组织中平滑肌细胞和内皮细胞在纤维化中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了心房颤动患者心房组织中的细胞异质性和基因表达变化,揭示了不同细胞类型在疾病过程中的相互作用和信号通路 | 研究仅限于心房颤动患者的心房组织,未涉及其他组织或疾病状态 | 探讨心房颤动患者心房组织中细胞异质性和基因表达变化,寻找新的细胞干预靶点 | 心房颤动患者的心房组织中的平滑肌细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-12-21 |
FOLR2+ macrophage depletion from intestinal metaplasia to early gastric cancer: single-cell sequencing insight into gastric cancer progression
2024-Dec-19, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03245-y
PMID:39702278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫组化染色,探讨了从肠上皮化生到早期胃癌过程中FOLR2+巨噬细胞的免疫景观及其在胃癌进展中的潜在机制 | 首次揭示了FOLR2+巨噬细胞在肠上皮化生到早期胃癌进展中的抗肿瘤免疫潜力及其逐渐减少的现象,并阐明了其通过抗原交叉呈递激活CD8+ T细胞的机制 | 样本量较小,仅包括5例完全肠上皮化生、6例不完全肠上皮化生和4例早期胃癌患者 | 研究肠上皮化生和早期胃癌的免疫景观及其在胃癌进展中的潜在机制 | 完全肠上皮化生、不完全肠上皮化生和早期胃癌患者的胃活检样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组化染色、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5例完全肠上皮化生、6例不完全肠上皮化生和4例早期胃癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-12-21 |
SNAI1 promotes epithelial-mesenchymal transition and maintains cancer stem cell-like properties in thymic epithelial tumors through the PIK3R2/p-EphA2 Axis
2024-Dec-19, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03243-0
PMID:39702326
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研究论文 | 本研究探讨了SNAI1在胸腺上皮肿瘤中的致癌作用及其通过PIK3R2/p-EphA2轴维持癌症干细胞样特性的机制 | 首次揭示了SNAI1通过PIK3R2/p-EphA2轴促进上皮-间质转化并维持癌症干细胞样特性的机制 | 研究主要基于体外和体内实验,需要进一步的临床验证 | 探讨胸腺上皮肿瘤中的致癌基因及其潜在治疗靶点 | 胸腺上皮肿瘤及其癌症干细胞样特性 | 数字病理学 | 胸腺癌 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag、RNA测序、染色质免疫沉淀、CUT&RUN、荧光素酶报告基因分析、共免疫沉淀、质谱分析、磷酸化蛋白质组学 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA数据库的数据以及体外和体内实验样本 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-12-21 |
Single cell transcriptomics reveals the cellular heterogeneity of keloids and the mechanism of their aggressiveness
2024-Dec-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07311-1
PMID:39702490
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了瘢痕疙瘩的细胞异质性及其侵袭性机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术比较了同一患者中瘢痕疙瘩与非侵袭性病理瘢痕的细胞异质性,发现了机械响应性成纤维细胞亚群在瘢痕疙瘩侵袭性中的关键作用 | 研究样本仅来自同一患者,可能限制了结果的普适性 | 探讨瘢痕疙瘩的侵袭性机制 | 瘢痕疙瘩和非侵袭性病理瘢痕的细胞异质性 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 同一患者的瘢痕疙瘩和非侵袭性病理瘢痕样本 | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-12-21 |
Adipocyte-derived CXCL10 in obesity promotes the migration and invasion of ovarian cancer cells
2024-Dec-19, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01568-0
PMID:39702497
|
研究论文 | 本文研究了肥胖诱导的脂肪细胞来源的CXCL10在卵巢癌细胞迁移和侵袭中的作用 | 首次揭示了肥胖通过脂肪细胞来源的CXCL10促进卵巢癌细胞迁移和侵袭的机制 | 研究仅基于体外实验和单细胞RNA测序数据,缺乏体内实验验证 | 探讨肥胖与卵巢癌迁移和侵袭之间的关系 | 卵巢癌细胞和肥胖相关的脂肪组织 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 24个常见上调基因 | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-12-21 |
Analysis of immune cell activation in patients with diabetes foot ulcer from the perspective of single cell
2024-Dec-19, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-02179-7
PMID:39702546
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了糖尿病足溃疡患者的免疫细胞激活情况 | 首次构建了糖尿病和糖尿病足溃疡组织的单细胞生态图谱,并探索了潜在的中药药物靶点基因相互作用网络 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据,未涉及临床试验验证 | 揭示糖尿病足溃疡的细胞学机制并探索潜在的治疗靶点 | 糖尿病足溃疡患者的免疫细胞和相关基因 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-12-21 |
Single-cell dissection of multifocal bladder cancer reveals malignant and immune cells variation between primary and recurrent tumor lesions
2024-Dec-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07343-7
PMID:39702554
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了多灶性膀胱癌患者的原发性和复发性肿瘤病变,揭示了恶性细胞和免疫细胞在不同病变间的变异 | 首次揭示了复发性多灶性膀胱癌中恶性细胞的区域转录相似性和细胞间通讯的一致性,并发现了IL4I1酶在复发性肿瘤中的表达偏好及其对肿瘤进展的影响 | 研究样本量较小,仅包括五名患者,可能影响结果的普适性 | 探讨多灶性膀胱癌中原发性和复发性肿瘤病变的异质性 | 多灶性膀胱癌患者的原发性和复发性肿瘤病变 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五名多灶性膀胱癌患者,包括三例原发性肿瘤和两例复发性肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-12-21 |
C3G improves lipid droplet accumulation in the proximal tubules of high-fat diet-induced ORG mice
2024-Dec-13, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107550
PMID:39675540
|
研究论文 | 本文研究了Cyanidin-3-glucoside(C3G)在高脂饮食诱导的ORG小鼠模型中改善近端小管脂滴积累的作用及其机制 | 首次揭示了C3G通过调节肠道微生物群和抑制PPARγ/CD36通路来减少ORG小鼠近端小管脂滴积累的作用 | 研究仅在动物模型中进行,尚未在人体中验证C3G的疗效 | 探讨C3G在ORG中的治疗效果及其潜在机制 | 高脂饮食诱导的ORG小鼠模型 | NA | 肾脏疾病 | 16S rRNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 粪便、血清、肾脏的代谢数据 | 三组小鼠:正常对照组、ORG组和C3G治疗组 | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-12-21 |
Increased inflammatory signature in myeloid cells of non-small cell lung cancer patients with high clonal hematopoiesis burden
2024-Dec-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96951
PMID:39641768
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研究论文 | 研究探讨了非小细胞肺癌患者中克隆性造血负担与免疫治疗反应及炎症标志物的关系 | 首次揭示了非小细胞肺癌患者中克隆性造血负担与免疫治疗反应之间的潜在联系,并发现严重克隆性造血组中髓系细胞的炎症途径显著富集 | 研究样本量有限,且未发现克隆性造血状态对免疫治疗反应的显著影响 | 探讨非小细胞肺癌患者中克隆性造血负担与免疫治疗反应及炎症标志物的关系 | 非小细胞肺癌患者的血液样本及免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、全外显子测序 | NA | RNA | 100名转移性非小细胞肺癌患者及63份血液样本,以及180名患者的独立复制队列 | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-12-21 |
Spatial and temporal expression analysis of BMP signal modifiers, Smoc1 and Smoc2, from postnatal to adult developmental stages in the mouse testis
2024-Dec, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2024.119383
PMID:39510490
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研究论文 | 研究分析了Smoc1和Smoc2在小鼠睾丸从出生到成年发育阶段中的时空表达模式 | 首次分析了Smoc1和Smoc2在小鼠出生后睾丸中的时空表达模式,揭示了它们在生殖细胞和体细胞中的不同表达模式 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类或其他物种 | 探讨Smoc1和Smoc2在小鼠睾丸发育过程中的表达模式及其在生殖中的潜在作用 | Smoc1和Smoc2在小鼠睾丸中的mRNA和蛋白质表达 | NA | NA | RNA原位杂交、免疫荧光和单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 新生儿、幼年和成年小鼠睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-12-21 |
A preclinical and phase I clinical study of ex vivo-expanded amyloid beta-specific human regulatory T cells in Alzheimer's disease
2024-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2024.117721
PMID:39626378
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研究论文 | 本文研究了体外扩增的针对β淀粉样蛋白的调节性T细胞在阿尔茨海默病中的安全性和有效性 | 首次在临床试验中评估了体外扩增的针对β淀粉样蛋白的人类调节性T细胞在阿尔茨海默病中的应用 | 临床试验中探索性评估的效果未达到统计学显著性,需要进一步研究以确认其临床疗效 | 探讨体外扩增的针对β淀粉样蛋白的人类调节性T细胞在阿尔茨海默病中的治疗潜力 | 体外扩增的针对β淀粉样蛋白的人类调节性T细胞及其在阿尔茨海默病模型和临床试验中的应用 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 6名阿尔茨海默病患者和3xTg小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-12-21 |
Expression of ABC transporters in the Drosophila testis stem cell niche: Comparison of two approaches
2024-Dec, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2024.119386
PMID:39638273
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研究论文 | 研究了果蝇睾丸干细胞微环境中ABC转运蛋白的表达,并比较了两种方法的结果 | 首次在果蝇睾丸干细胞微环境中研究ABC转运蛋白的表达,并比较了增强子和基因陷阱筛选与Fly Cell Atlas单细胞测序数据的表达模式 | 两种基因表达方法的结果相关性较弱,表明单一技术可能存在局限性 | 探讨ABC转运蛋白在果蝇睾丸干细胞微环境中的表达情况 | 果蝇睾丸中的ABC转运蛋白基因 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 六个ABC转运蛋白基因(ABCB7, MRP, rdog, CG3164, CG31121, 和 CG9663) | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-12-21 |
Approximate nearest neighbor graph provides fast and efficient embedding with applications for large-scale biological data
2024-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae172
PMID:39703432
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研究论文 | 本文提出了一种新的降维算法annembed,通过结合t-SNE和UMAP的优点,并使用HNSW图替换K-最近邻图,提高了大规模生物数据处理的效率和速度 | 创新点包括结合t-SNE和UMAP创建新的降维算法,使用HNSW图替换K-最近邻图,以及通过结合HNSW和局部敏感哈希算法扩展到DNA/RNA序列数据 | NA | 提高大规模生物数据降维和嵌入的效率和速度 | 大规模微生物基因组数据库、单细胞RNA测序数据和宏基因组contig(或群体)分箱 | 生物信息学 | NA | HNSW, 局部敏感哈希算法 | NA | DNA/RNA序列数据 | 数百万到数十亿个数据点 | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-12-21 |
Spatial transcriptomics in breast cancer reveals tumour microenvironment-driven drug responses and clonal therapeutic heterogeneity
2024-Dec, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcae046
PMID:39703753
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研究论文 | 本研究利用乳腺癌患者的空间转录组数据,预测药物敏感性,揭示了肿瘤微环境在治疗反应中的作用 | 本研究首次通过空间转录组数据揭示了肿瘤微环境对药物反应的影响,并发现了肿瘤内不同位置的亚克隆具有不同的药物反应 | 本研究仅基于乳腺癌患者的数据,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨肿瘤微环境在乳腺癌治疗反应中的作用,优化治疗策略 | 乳腺癌患者的肿瘤微环境和药物敏感性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组 | NA | 转录组数据 | 乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-12-20 |
CCL4L2 participates in tendinopathy progression by promoting macrophage inflammatory responses: a single-cell analysis
2024-Dec-19, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-024-05268-9
PMID:39696421
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析CCL4L2在肌腱病进展中的作用,发现CCL4L2通过促进巨噬细胞的炎症反应参与肌腱病的进展 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了CCL4L2在肌腱病中的作用,并验证了其通过激活M1相关炎症信号通路促进巨噬细胞极化和抑制肌腱干细胞分化的机制 | 研究仅在体外实验中验证了CCL4L2的作用,尚未在体内模型中进行验证 | 探讨CCL4L2在肌腱病进展中的作用及其机制 | 肌腱病中的巨噬细胞和肌腱干细胞 | 数字病理学 | 肌腱病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 疾病组和健康组的多个细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-12-20 |
Single-cell RNA sequencing uncovers heterogenous immune cell responses upon exposure to food additive (E171) titanium dioxide
2024-Dec-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-03036-9
PMID:39696498
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,揭示了在暴露于食品添加剂二氧化钛(E171 TiO)后,免疫细胞的异质性反应 | 首次通过单细胞RNA测序技术,详细分析了不同免疫细胞亚群在暴露于E171 TiO后的转录组和免疫反应的异质性 | 研究仅使用了Sprague-Dawley大鼠作为模型,可能无法完全代表所有物种的免疫反应 | 探讨食品添加剂E171 TiO对免疫系统的细胞毒性和转录组影响 | 免疫细胞在暴露于E171 TiO后的异质性反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了32只Sprague-Dawley大鼠(16只处理组,16只对照组) | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-12-20 |
Zi Shen Wan Fang repaired blood-brain barrier integrity in diabetic cognitive impairment mice via preventing cerebrovascular cells senescence
2024-Dec-19, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-024-01041-6
PMID:39696612
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研究论文 | 本研究探讨了Zi Shen Wan Fang(ZSWF)通过预防脑血管细胞衰老修复糖尿病认知障碍小鼠血脑屏障完整性的机制 | 首次揭示了ZSWF通过抑制Cdkn1a和衰老相关分泌表型(SASP)基因的表达,预防脑血管细胞衰老,从而修复血脑屏障完整性并改善认知功能 | 实验仅在动物模型上进行,尚未在人体中验证其有效性和安全性 | 揭示糖尿病认知障碍小鼠血脑屏障完整性破坏的机制,并阐明ZSWF修复血脑屏障完整性及改善认知功能的机制 | 糖尿病认知障碍小鼠及其血脑屏障完整性 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光分析,分子对接 | NA | 基因表达数据 | 糖尿病小鼠模型,ZSWF剂量为9.36和18.72 g/kg,持续8周 | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-12-20 |
Statistical analysis supports pervasive RNA subcellular localization and alternative 3' UTR regulation
2024-Dec-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87517
PMID:39699003
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研究论文 | 本文开发了一种名为SPRAWL的统计框架,用于检测小鼠大脑和肝脏中细胞类型特异性的RNA亚细胞定位调控,并研究了3' UTR长度与亚细胞定位之间的相关性 | 提出了新的统计框架SPRAWL,用于整合多组学单细胞分辨率的基因异构体测量,以优先筛选功能性3' UTR候选者 | 研究仅限于小鼠大脑和肝脏的数据,尚未在其他物种或组织中验证 | 研究RNA亚细胞定位及其与3' UTR调控的关系,并开发新的统计方法来分析这些关系 | 小鼠大脑和肝脏中的RNA亚细胞定位及3' UTR调控 | 基因组学 | NA | 空间转录组学技术 | 统计框架 | 基因表达数据 | 小鼠大脑和肝脏的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |