单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
401	2024-12-09	Hypoxia regulates small extracellular vesicle biogenesis and cargo sorting through HIF-1α/HRS signaling pathway in head and neck squamous cell carcinoma 2024-Dec-02, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111546 PMID:39631619	研究论文	研究探讨了缺氧条件下头颈鳞状细胞癌中HIF-1α/HRS信号通路对小细胞外囊泡生成和货物分选的调控机制	首次揭示了缺氧通过HIF-1α/HRS信号通路调控小细胞外囊泡生成和货物分选的具体机制	研究主要集中在细胞和分子水平，缺乏体内实验验证	探讨缺氧如何影响头颈鳞状细胞癌中小细胞外囊泡的生成和货物分选	头颈鳞状细胞癌细胞和小细胞外囊泡	数字病理学	头颈癌	空间转录组学和免疫组化	NA	蛋白质	NA
402	2024-12-09	Single-cell RNA sequencing combined with proteomics of infected macrophages reveals prothymosin-α as a target for treatment of apical periodontitis 2024-Dec, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.01.018 PMID:38237771	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序结合蛋白质组学分析感染的巨噬细胞，揭示了prothymosin-α作为根尖周炎治疗靶点的潜力	本研究首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学结合的方法，揭示了prothymosin-α在根尖周炎中的上调表达及其对炎症反应和破骨细胞分化的调节作用	本研究主要集中在体外和动物模型中的验证，尚未进行临床试验验证其治疗效果	探索根尖周炎组织中单核细胞群体的异质性，寻找缓解根尖周炎的新靶点，并通过蛋白质组学和体内外评估进一步验证	根尖周炎组织中的单核细胞群体和健康对照组织中的单核细胞群体	数字病理学	口腔疾病	单细胞RNA测序、蛋白质组学	NA	基因表达数据、蛋白质数据	根尖周炎组织和健康对照组织的单核细胞群体，以及THP-1衍生的感染巨噬细胞
403	2024-12-09	Early concentrate starter introduction induces rumen epithelial parakeratosis by blocking keratinocyte differentiation with excessive ruminal butyrate accumulation 2024-Dec, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2023.12.016 PMID:38128723	研究论文	研究早期浓缩饲料引入对新生羔羊瘤胃上皮角化不全的影响及其机制	首次通过单细胞RNA测序和代谢组学分析揭示了早期浓缩饲料引入导致瘤胃上皮角化不全的机制，并建立了瘤胃上皮类器官模型	研究仅限于新生羔羊模型，未来需在其他年龄段和物种中验证	阐明早期浓缩饲料引入导致瘤胃上皮角化不全的机制	新生羔羊的瘤胃上皮细胞及其代谢物	NA	NA	单细胞RNA测序、免疫荧光、定量实时PCR、代谢组学分析	NA	RNA、代谢物	24只14天大的羔羊
404	2024-12-09	Skin microdialysis detects distinct immunologic patterns in chronic inflammatory skin diseases 2024-Dec, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.06.024 PMID:39142443	研究论文	本文通过皮肤微透析技术检测慢性炎症性皮肤病中的不同免疫模式	首次使用皮肤微透析技术分析慢性炎症性皮肤病的蛋白质组和细胞因子谱，并结合单细胞RNA测序揭示细胞来源	样本量较小，可能影响结果的普遍性	研究慢性炎症性皮肤病的病理生理机制，特别是蛋白质组水平	特应性皮炎、寻常型银屑病和结节性痒疹患者的皮损和非皮损皮肤	NA	皮肤病	皮肤微透析、蛋白质组分析、多重细胞因子分析、单细胞RNA测序	NA	蛋白质、细胞因子、RNA	特应性皮炎6例，寻常型银屑病7例，结节性痒疹6例，健康对照7例
405	2024-12-09	Single-cell sequencing analysis and bulk-seq identify IGFBP6 and TNFAIP6 as novel differential diagnosis markers for postburn pathological scarring 2024-Dec, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.burns.2024.08.021 PMID:39317554	研究论文	本研究通过单细胞测序和批量测序分析，鉴定了IGFBP6和TNFAIP6作为烧伤后病理性瘢痕的新型鉴别诊断标志物	本研究首次通过单细胞测序技术在细胞水平上揭示了病理性瘢痕的遗传特征，并鉴定了IGFBP6和TNFAIP6作为区分烧伤后瘢痕疙瘩和肥厚性瘢痕的关键基因	本研究仅限于烧伤后瘢痕疙瘩和肥厚性瘢痕的鉴别诊断，未涉及其他类型的病理性瘢痕	旨在通过分子水平上的鉴别诊断标志物，区分烧伤后瘢痕疙瘩和肥厚性瘢痕	烧伤后瘢痕疙瘩和肥厚性瘢痕的分子鉴别诊断标志物	NA	烧伤后病理性瘢痕	单细胞测序	NA	基因表达数据	烧伤后临床样本
406	2024-12-09	Different gene expression patterns between mouse and human brain pericytes revealed by single-cell/nucleus RNA sequencing 2024-Dec, Vascular pharmacology IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.vph.2024.107434 PMID:39423955	研究论文	研究比较了小鼠和人类大脑周细胞的基因表达模式	首次系统比较了小鼠和人类大脑周细胞的基因表达差异	仅限于成年小鼠和人类大脑周细胞的比较	探讨小鼠和人类大脑周细胞基因表达的相似性和差异性	小鼠和人类大脑周细胞	数字病理学	NA	单细胞/核RNA测序	NA	基因表达数据	四个小鼠和人类成年大脑周细胞单细胞/核RNA测序数据集
407	2024-12-09	Fhl1, a new spatially specific protein, regulates vein graft neointimal hyperplasia 2024-Dec, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70115 PMID:39639552	研究论文	研究探讨了Fhl1蛋白在静脉移植后新生内膜增生中的作用	首次使用空间转录组学技术分析新生内膜，并生成了特定的新生内膜转录组图谱	NA	研究Fhl1蛋白在静脉移植后新生内膜增生中的作用及其潜在的治疗价值	静脉移植后新生内膜增生	心血管疾病	心血管疾病	空间转录组学	NA	基因表达数据	使用Sprague-Dawley (SD) 大鼠和人类隐静脉样本进行研究
408	2024-12-09	NLRP3 inflammasome mediates pyroptosis of alveolar macrophages to induce radiation lung injury 2024-Dec-01, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136740 PMID:39642726	研究论文	研究探讨了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用	首次揭示了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用，并提出了潜在的治疗策略	NA	探讨辐射诱导的肺损伤中肺泡巨噬细胞焦亡和炎症小体激活的机制	肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞和上皮细胞	NA	辐射诱导的肺损伤	多色流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、共免疫沉淀和Duolink技术	NA	细胞和组织微环境数据	NA
409	2024-12-09	Single-cell transcriptomic analysis reveals regulative mechanisms of follicular selection and atresia in chicken granulosa cells 2024-Dec, Food research international (Ottawa, Ont.) DOI:10.1016/j.foodres.2024.115368 PMID:39643375	研究论文	研究通过单细胞RNA测序分析鸡卵泡颗粒细胞的转录组，揭示卵泡选择和闭锁的调节机制	首次发现未选择的卵泡中存在具有类固醇生成能力的颗粒细胞Ⅲ型，并首次注释了退化的颗粒细胞，发现其与脂质代谢紊乱显著相关	NA	探讨鸡卵泡选择和闭锁的调节机制	鸡卵泡颗粒细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	五个卵泡阶段的颗粒细胞层
410	2024-12-08	The role of the tricellular junction protein ILDR2 in glomerulopathies: Expression patterns and functional insights 2024-Dec-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111329 PMID:39640577	研究论文	研究ILDR2蛋白在肾小球疾病中的表达模式和功能	首次探讨了ILDR2在足细胞中的作用及其在肾小球疾病中的保护作用	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本	探讨ILDR2在肾小球疾病中的作用及其对血滤的影响	ILDR2蛋白及其在足细胞中的表达和功能	NA	肾小球疾病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)、超分辨率显微镜、液相色谱-串联质谱 (LC-MS/MS)	NA	蛋白质	小鼠模型
411	2024-12-08	Molecular and functional profiling of primary normal ovarian cells defines insights into cancer development and drug responses 2024-Dec-19, Molecular therapy. Oncology DOI:10.1016/j.omton.2024.200903 PMID:39634630	研究论文	研究通过分子和功能分析正常卵巢细胞，揭示了癌症发展和药物反应的见解	首次对正常卵巢细胞进行单细胞转录组学、高内涵图像细胞绘制和高通量药物测试的综合分析	研究仅限于两种正常卵巢细胞系和代表性的卵巢癌细胞系，可能无法完全代表所有卵巢癌的异质性	探讨正常卵巢细胞与卵巢癌细胞的分子特征差异，以及这些差异如何影响癌症发展和药物反应	正常卵巢细胞（HOSE1C和HOSE2C）和代表性的高级别浆液性卵巢癌细胞（HGSOC）	数字病理学	卵巢癌	单细胞转录组学、高内涵图像细胞绘制、高通量药物测试	NA	转录组数据、图像数据	两种正常卵巢细胞系（HOSE1C和HOSE2C）和代表性的卵巢癌细胞系
412	2024-12-08	MAIT cell plasticity enables functional adaptation that drives antibacterial immune protection 2024-Dec-06, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adp9841 PMID:39642244	研究论文	研究了黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）的适应性功能及其在抗菌免疫保护中的作用	定义了干扰素-γ（IFN-γ）产生型MAIT1细胞和白细胞介素-17A（IL-17A）产生型MAIT17细胞在体内的可塑性，并发现MAIT17细胞在特定条件下可以转化为MAIT1细胞，从而在黏膜组织中发挥抗菌作用	NA	探讨MAIT细胞在抗感染中的作用及其在疫苗开发中的潜在应用	MAIT1和MAIT17细胞亚群的功能和可塑性	免疫学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
413	2024-12-08	Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis 2024-Dec-06, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC PMID:39642371	研究论文	研究揭示了表观遗传调控因子CBX5在促进成纤维细胞代谢重编程和抑制肺纤维化中的关键作用	首次阐明CBX5在肺纤维化过程中通过调节成纤维细胞代谢重编程促进纤维化的机制	研究主要集中在体外和离体实验，缺乏体内实验验证	探讨表观遗传调控因子CBX5在肺纤维化中的作用及其机制	特发性肺纤维化中的成纤维细胞	数字病理学	肺纤维化	scRNA-seq, 免疫组化, RNA-seq	NA	基因表达数据	包括体外培养的IPF成纤维细胞和离体的IPF肺组织
414	2024-12-08	CDK9 recruits HUWE1 to degrade RARα and offers therapeutic opportunities for cutaneous T-cell lymphoma 2024-Dec-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54354-3 PMID:39632829	研究论文	本文研究了CDK9在皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）中的作用，发现CDK9通过招募E3连接酶HUWE1降解RARα，并提出了一种潜在的治疗策略	首次揭示了CDK9在CTCL中的驱动作用，并发现CDK9通过招募HUWE1降解RARα，为CTCL的治疗提供了新的靶点	NA	探讨CDK9在皮肤T细胞淋巴瘤中的作用及其治疗潜力	皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）细胞和CDK9蛋白	NA	皮肤T细胞淋巴瘤	单细胞RNA测序、PROTAC介导的降解	NA	RNA	体外和体内模型
415	2024-12-08	The CCL5/CCR5/SHP2 axis sustains Stat1 phosphorylation and activates NF-κB signaling promoting M1 macrophage polarization and exacerbating chronic prostatic inflammation 2024-Dec-05, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-024-01943-w PMID:39633456	研究论文	本研究旨在识别慢性前列腺炎（CP）中关键的细胞因子，并探讨其在驱动炎症反应中的作用	首次揭示了CCL5/CCR5/SHP2轴在维持Stat1磷酸化和激活NF-κB信号通路中的作用，促进M1巨噬细胞极化和加剧慢性前列腺炎炎症	NA	识别慢性前列腺炎中的关键细胞因子并探讨其驱动炎症反应的机制	慢性前列腺炎患者和实验性自身免疫性前列腺炎（EAP）模型小鼠	NA	前列腺疾病	细胞因子检测、实验性自身免疫性前列腺炎模型、药理学抑制、单细胞转录组学	NA	细胞因子、基因表达	48种细胞因子的检测面板，实验性自身免疫性前列腺炎模型小鼠，药理学抑制剂的使用
416	2024-12-08	Decoding the molecular, cellular, and functional heterogeneity of zebrafish intracardiac nervous system 2024-Dec-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54830-w PMID:39632839	研究论文	本文通过单细胞RNA测序、解剖学研究和电生理技术，对斑马鱼心脏内神经系统（IcNS）进行了全面的分类和功能分析	揭示了IcNS中多种神经元类型，包括类似于中枢神经系统中中央模式发生器网络的节律性神经元	NA	研究心脏内神经系统的组织和功能	斑马鱼心脏内神经系统中的神经元类型及其功能	NA	NA	单细胞RNA测序、解剖学研究、电生理技术	NA	RNA序列	NA
417	2024-12-08	Single-cell immune profiling and validation of PBMCs in the onset of and recovery from herpes zoster 2024-Dec-04, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-07289-w PMID:39633072	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了带状疱疹发病和恢复期间外周血单核细胞的免疫细胞谱	首次详细描述了带状疱疹发病和恢复期间免疫细胞亚群的比例变化，并通过流式细胞术和血液常规数据进行了验证	研究样本主要来自男性患者，可能存在性别偏倚	深入了解带状疱疹的发病机制	带状疱疹发病和恢复期间的外周血单核细胞	数字病理学	带状疱疹	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和ATAC测序	NA	转录组和表观基因组数据	主要来自男性患者的外周血单核细胞
418	2024-12-08	Single-cell RNA sequencing analysis reveals potential key prognostic markers in hepatocellular carcinoma 2024-Dec-04, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01646-1 PMID:39633216	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肝细胞癌中的潜在关键预后标志物	本研究首次通过单细胞RNA测序技术，识别出与肝细胞癌预后相关的566个基因，并筛选出11个关键基因用于预测患者的生存率	本研究的样本量较小，且仅基于GEO数据库的数据进行分析，可能存在一定的局限性	通过单细胞RNA测序分析，识别肝细胞癌患者的潜在预后标志物	肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	LASSO-Cox回归模型	RNA测序数据	2208个上调基因和1447个下调基因
419	2024-12-08	Investigating the role of KARS in lung adenocarcinoma via single-cell RNA sequencing 2024-Dec-03, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01633-6 PMID:39625565	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了KARS在肺腺癌中的表达和功能	首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了KARS在肺腺癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系	研究主要基于已发表的数据集，缺乏体内实验验证	探讨KARS在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力	KARS在肺腺癌中的表达及其与临床病理特征和患者预后的关系	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用了来自TCGA、GTEx和GEO的数据集
420	2024-12-08	The characteristics and functional significance of disulfidptosis-related genes in head and neck squamous cell carcinoma 2024-Dec-03, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01629-2 PMID:39625660	研究论文	研究了二硫化物凋亡相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的特征和功能意义	首次通过计算机辅助生物信息学分析，揭示了二硫化物凋亡相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的表达特征和功能意义	研究主要基于TCGA数据和单细胞测序数据，可能存在样本偏差和数据局限性	探讨二硫化物凋亡相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其临床意义	头颈部鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境中的细胞	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	RNA测序	非负矩阵分解 (NMF)	RNA测序数据	TCGA数据库中的头颈部鳞状细胞癌患者数据和单细胞测序数据