单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 620 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-12-10 |
Unraveling plant-microbe symbioses using single-cell and spatial transcriptomics
2024-Dec, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.06.008
PMID:38991926
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研究论文 | 本文讨论了单细胞和空间转录组学技术在研究植物-微生物共生关系中的优势 | 利用单细胞和空间转录组学技术，能够以前所未有的细节水平研究共生相互作用 | 主要限制在于同时捕获植物和微生物转录本的技术挑战 | 探讨新型空间和单细胞转录组学技术在研究植物-微生物内共生关系中的应用 | 植物-微生物共生关系 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 382 | 2024-12-10 |
Reduced TRIM expression correlates with anomalous CD4 T cell activation in systemic lupus Erythematosus and its clinical diagnostic potential
2024-Dec, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106913
PMID:39233252
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研究论文 | 研究探讨了TRIM在系统性红斑狼疮（SLE）患者循环CD4+T细胞亚群中的表达、功能及其临床相关性 | 发现TRIM+T细胞在SLE患者中减少，并与异常的CD4+T细胞激活相关，具有潜在的临床诊断价值 | NA | 阐明TRIM在SLE患者CD4+T细胞中的表达、功能及其临床意义 | TRIM在人类和小鼠外周血单核细胞（PBMCs）及脾脏CD4+T细胞亚群中的表达 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 包括SLE患者、健康对照（HCs）和类风湿性关节炎（RA）患者的外周血单核细胞（PBMCs）及小鼠脾脏CD4+T细胞亚群 |
| 383 | 2024-12-10 |
AOPPs induces EMT and fibrosis by activating oxidative stress through ERK/p38 MAPK signaling pathway in endometriosis
2024-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100950
PMID:39241657
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研究论文 | 研究探讨了高级氧化蛋白产物（AOPPs）通过激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导子宫内膜异位症（EMs）中的上皮-间质转化（EMT）和纤维化的机制 | 首次揭示了AOPPs在EMs中通过氧化应激激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导EMT和纤维化的机制 | 研究主要基于临床样本、单细胞测序和体内外模型，缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨AOPPs在子宫内膜异位症中诱导EMT和纤维化的分子机制 | 子宫内膜异位症（EMs）中的上皮-间质转化（EMT）和纤维化 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 使用正常大鼠进行慢性给药研究 |
| 384 | 2024-12-10 |
The relationship between Sjögren's syndrome and recurrent pregnancy loss: a bioinformatics analysis
2024-Dec, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2024.104363
PMID:39299134
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研究论文 | 研究Sjögren综合征与复发性流产之间的基因关联 | 首次揭示Sjögren综合征与复发性流产共享生物学途径，并鉴定出关键基因KCNN3 | NA | 探讨Sjögren综合征与复发性流产之间的基因关联 | Sjögren综合征和复发性流产的基因数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、limma分析、基因本体论和京都基因与基因组百科全书分析 | NA | 基因表达数据 | 从Gene Expression Omnibus数据库获取的基因数据 |
| 385 | 2024-12-10 |
ATN-161 alleviates caerulein-induced pancreatitis
2024-Dec, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.002
PMID:39396744
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研究论文 | 研究显示ATN-161通过阻断Integrin-α5信号减轻caerulein诱导的急性胰腺炎病理状况 | 首次揭示了ATN-161作为Integrin-α5拮抗剂在减轻急性胰腺炎症状中的治疗潜力 | NA | 探索减轻急性胰腺炎病理状况的药物干预方法 | ATN-161对caerulein诱导的急性胰腺炎的影响 | NA | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 386 | 2024-12-10 |
Targeting cancer-associated fibroblasts with pirfenidone: A novel approach for cancer therapy
2024-Dec, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2024.102624
PMID:39581071
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研究论文 | 本文探讨了使用吡非尼酮靶向癌症相关成纤维细胞（CAFs）作为癌症治疗的新方法 | 本文提出了一种新的癌症治疗方法，通过吡非尼酮靶向CAFs，并结合化疗药物和纳米载体递送系统，以提高疗效和减少副作用 | 尽管吡非尼酮显示出抗肿瘤潜力，但其安全性和有效性仍需通过临床试验进一步验证 | 研究吡非尼酮在癌症治疗中的应用，特别是通过靶向CAFs来抑制癌症进展 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在癌症进展中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-12-10 |
Endothelial KDM5B Regulated by Piezo1 Contributes to Disturbed Flow Induced Atherosclerotic Plaque Formation
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70237
PMID:39643939
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研究论文 | 研究了Piezo1调控的内皮细胞KDM5B在扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的作用 | 首次揭示了Piezo1通过上调KDM5B表达促进动脉粥样硬化斑块形成的机制 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在人体中验证 | 探讨扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的表观遗传调控机制 | 内皮细胞中的KDM5B表达及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用了HUVECs细胞和小鼠模型 |
| 388 | 2024-12-09 |
Statistical and computational methods for enabling the clinical and translational application of spatial transcriptomics
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70119
PMID:39644148
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-12-10 |
M2 macrophage derived HMOX1 defines chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Dec, Clinical and translational allergy
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/clt2.70014
PMID:39644500
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研究论文 | 本研究旨在开发与慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）相关的巨噬细胞诊断特征 | 提出了基于M2巨噬细胞来源的HMOX1作为CRSwNP的创新诊断标志物 | NA | 开发与CRSwNP相关的巨噬细胞诊断特征 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者和健康对照组的转录组数据 | NA | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 转录组分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | 诊断模型 | 转录组数据 | 54名CRSwNP患者和37名健康对照组，以及29个验证样本 |
| 390 | 2024-12-09 |
PTX3 exacerbates hepatocyte pyroptosis in hepatic ischemia-reperfusion injury by promoting macrophage M1 polarization
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113604
PMID:39549552
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研究论文 | 研究探讨了PTX3在肝缺血-再灌注损伤中通过促进巨噬细胞M1极化加剧肝细胞焦亡的作用 | 首次揭示了PTX3在肝缺血-再灌注损伤中通过调节巨噬细胞极化影响肝细胞焦亡的作用 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内实验验证 | 探讨PTX3在巨噬细胞介导的肝缺血-再灌注损伤中的潜在作用 | PTX3在肝缺血-再灌注损伤中的表达及其对巨噬细胞极化和肝细胞焦亡的影响 | NA | 肝病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和鼠肝缺血-再灌注损伤模型样本 |
| 391 | 2024-11-29 |
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity in ovarian cancer and constructs a prognostic signature for prognostic prediction and immunotherapy" [Int. Immunopharmacol. 140 (2024) 112855]
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113489
PMID:39603953
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-12-09 |
Dynamic transcriptome analysis of osteal macrophages identifies a distinct subset with senescence features in experimental osteoporosis
2024-Dec-06, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182418
PMID:39480497
|
研究论文 | 研究了实验性骨质疏松症中骨髓巨噬细胞的动态转录组分析，识别出具有衰老特征的特定亚群 | 首次揭示了骨质疏松症中骨髓巨噬细胞的异质性及其在衰老和炎症过程中的作用 | 实验仅在卵巢切除的小鼠模型中进行，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨骨髓巨噬细胞在实验性骨质疏松症中的具体功能及其在骨病理生理学中的潜在作用 | 骨髓巨噬细胞及其在骨质疏松症中的基因表达变化 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 卵巢切除的小鼠模型中的骨髓巨噬细胞样本 |
| 393 | 2024-12-09 |
NK cell subsets define sustained remission in rheumatoid arthritis
2024-Dec-06, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182390
PMID:39418106
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研究论文 | 研究旨在通过高维表型平台定义类风湿性关节炎持续缓解的免疫学特征 | 首次发现CD8+CD57+KIR2DL1+ NK细胞与类风湿性关节炎的持续缓解相关 | 研究仅限于外周血和滑液中的NK细胞分析，未涉及其他免疫细胞类型 | 探索类风湿性关节炎持续缓解的免疫学标志物 | 类风湿性关节炎患者的外周血和滑液中的NK细胞 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及外周血和滑液中的NK细胞样本 |
| 394 | 2024-12-09 |
Metabolism and spatial transcription resolved heterogeneity of glutamine metabolism in cervical carcinoma
2024-Dec-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-13275-6
PMID:39639273
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研究论文 | 研究通过AFADESI-MSI和空间转录组技术分析宫颈鳞状细胞癌（CSCC）的代谢和转录特征，揭示了谷氨酰胺代谢的异质性及其与ASCT2表达的关系 | 首次结合AFADESI-MSI和空间转录组技术，全面分析了CSCC的代谢和转录特征，揭示了谷氨酰胺代谢的异质性及其与ASCT2表达的关系 | 研究样本量有限，且仅限于CSCC，未来需扩大样本量并验证其他类型癌症中的适用性 | 探讨宫颈鳞状细胞癌中谷氨酰胺代谢的异质性及其潜在机制 | 宫颈鳞状细胞癌（CSCC）及其正常组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | AFADESI-MSI和空间转录组技术 | NA | 代谢和转录数据 | 122例宫颈癌和30例宫颈炎 |
| 395 | 2024-12-09 |
Computer-aided analysis reveals metallothionein-positive cancer-associated fibroblasts promote angiogenesis in gastric adenocarcinoma
2024-Dec-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01614-9
PMID:39636347
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研究论文 | 研究分析了胃腺癌中的肿瘤微环境，特别是癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞的异质性及其在肿瘤血管生成中的作用 | 首次发现了一种新型金属硫蛋白阳性癌症相关成纤维细胞（mtCAF），其高表达金属硫蛋白1X（MT1X）并分泌血管内皮生长因子A（VEGFA），可能在胃腺癌的血管生成中起重要作用 | 研究主要基于单细胞测序和空间转录组数据，缺乏体内实验验证 | 探讨胃腺癌肿瘤微环境的异质性及其在肿瘤血管生成中的作用 | 胃腺癌中的肿瘤细胞、癌症相关成纤维细胞（CAFs）和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、空间转录组 | NA | 单细胞测序数据、空间转录组数据 | 56个胃腺癌单细胞测序样本 |
| 396 | 2024-12-09 |
Parallel measurement of transcriptomes and proteomes from same single cells using nanodroplet splitting
2024-Dec-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54099-z
PMID:39638780
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研究论文 | 介绍了一种名为nanoSPLITS的平台，通过纳米液滴分裂技术同时测量单细胞的转录组和蛋白质组 | 首次实现了通过纳米液滴分裂技术同时测量单细胞的转录组和蛋白质组，提供了全面的基因调控网络、细胞多样性和时间动态的见解 | NA | 开发一种能够同时测量单细胞转录组和蛋白质组的新技术，以深入理解基因调控网络和细胞多样性 | 单细胞的转录组和蛋白质组 | 生物信息学 | NA | RNA测序和基于质谱的蛋白质组学 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 涉及从人胰腺胰岛分离的初级细胞 |
| 397 | 2024-12-09 |
Synaptic connectome of the Drosophila circadian clock
2024-Dec-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54694-0
PMID:39638801
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研究论文 | 本文通过Drosophila FlyWire脑连接组生成果蝇昼夜节律钟的全面连接图 | 发现了额外的背侧时钟神经元，揭示了新的间接光输入途径和时钟神经元与下游高级脑中心及神经分泌细胞的稀疏单突触连接 | NA | 研究果蝇昼夜节律网络的连接和功能 | 果蝇的昼夜节律神经网络 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学和受体映射 | NA | 连接组数据 | 约240个神经元 |
| 398 | 2024-12-09 |
NiCo identifies extrinsic drivers of cell state modulation by niche covariation analysis
2024-Dec-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54973-w
PMID:39639035
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研究论文 | 本文介绍了一种名为NiCo的计算框架，用于整合单细胞分辨率的空间转录组学数据与匹配的单细胞RNA测序参考数据，以推断空间微环境对细胞状态的影响 | NiCo能够预测新的微环境相互作用，这些相互作用调控细胞状态变化，从而影响组织发育和稳态 | NA | 理解细胞状态的调节机制，特别是在组织发育、稳态和疾病中的作用 | 细胞状态的内在和外在驱动因素，特别是微环境对细胞状态的影响 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠胚胎发育、成年小肠和肝脏的数据 |
| 399 | 2024-12-09 |
Engineering regional diversity: A morphogen screen for patterned brain organoids
2024-Dec-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.11.007
PMID:39642861
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研究论文 | 本文介绍了一种结合形态发生素调节剂筛选和单细胞测序的平台，用于增强脑类器官的区域化 | 本文首次系统性地利用形态发生素信号在干细胞分化中实现神经系统发育的细胞多样性 | NA | 探索形态发生素在神经系统发育中的作用，并开发一种系统性方法来利用这些信号 | 脑类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 400 | 2024-12-09 |
Oxygen-dependent alternative mRNA splicing and a cone-specific motor protein revealed by single-cell RNA sequencing in hypoxic retinas
2024-Dec-03, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110190
PMID:39638278
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了低氧条件下视网膜细胞的转录组变化，特别是光感受器细胞中的特定响应 | 首次在低氧视网膜中鉴定并确认了一种特异性诱导的驱动蛋白（Kif4），并发现了RNA结合蛋白在低氧条件下的异构体切换 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨这些变化在人类视网膜疾病中的潜在应用 | 探究低氧条件下特定视网膜细胞类型的响应机制 | 低氧条件下的小鼠视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠视网膜样本 |