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当前共找到 699 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-12-03 |
Nonepithelial Gene Expression Correlates With Symptom Severity in Adults With Eosinophilic Esophagitis
2024-Dec, The journal of allergy and clinical immunology. In practice
DOI:10.1016/j.jaip.2024.05.015
PMID:38768900
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研究论文 | 本研究探讨了嗜酸性粒细胞性食管炎（EoE）患者症状严重程度与非上皮细胞基因表达之间的相关性 | 首次将患者报告的症状指标（EEsAI）与食管非上皮细胞基因表达关联，揭示了成纤维细胞等非上皮细胞在EoE症状严重性中的潜在作用 | 样本量相对有限（146名成人），且仅基于回顾性数据分析，未进行实验验证 | 揭示EoE症状变异的分子机制，探索症状严重程度与食管基因表达的关系 | 146名成人EoE患者，根据食管扩张史分组 | 生物信息学 | 嗜酸性粒细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 146名成人EoE患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-12-03 |
Spatial Transcriptomics Unravel the Tissue Complexity of Oral Pathogenesis
2024-Dec, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241271934
PMID:39382116
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综述 | 本文综述了空间转录组学在口腔疾病组织复杂性研究中的应用，包括其工作流程、数据分析方法以及在颅面发育和疾病中的具体案例 | 空间转录组学作为一种前沿方法，首次在口腔疾病领域系统性地整合了基因表达与空间信息，揭示了传统方法无法观察到的细胞区域间复杂相互作用 | 本文为综述性文章，未涉及原始实验数据，且空间转录组学技术本身可能存在分辨率限制和数据分析复杂性等挑战 | 探讨空间转录组学在理解口腔疾病组织复杂性和发病机制中的应用潜力 | 颅面区域组织（如颅骨、腭部、唾液腺、舌头、口腔底部、口咽部和牙周组织）以及相关疾病状态（如Sjögren病、口腔鳞状细胞癌、HPV感染、牙周病） | 数字病理学 | 口腔疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 23 | 2025-12-03 |
Targeting GSDME-mediated macrophage polarization for enhanced antitumor immunity in hepatocellular carcinoma
2024-Dec, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01231-0
PMID:39496854
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研究论文 | 本研究通过分析肝癌患者样本，发现GSDME通过调控巨噬细胞极化影响抗PD1治疗耐药性，并探索了Eliprodil与抗PD1联合治疗的潜力 | 首次揭示GSDME在肿瘤相关巨噬细胞中通过PDPK1/PI3K-AKT通路促进M2样极化，并发现小分子Eliprodil可阻断该通路，为联合免疫治疗提供新靶点 | 样本量较小（仅9例患者），临床前模型结果需在更大规模临床试验中验证 | 探索肝细胞癌抗PD1治疗耐药机制并开发联合免疫治疗新策略 | 肝细胞癌患者肿瘤组织、肿瘤相关巨噬细胞、CD8+T细胞及小鼠肝癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | RNA测序、单细胞测序、流式细胞术 | NA | 转录组数据、单细胞数据 | 9例接受抗PD1单药治疗的肝细胞癌患者肿瘤组织 | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-12-03 |
Splicing the Difference: Harnessing the Complexity of the Transcriptome in Hematopoiesis
2024-Dec, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104655
PMID:39393608
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综述 | 本文综述了转录组复杂性在造血过程中的作用，重点关注可变剪接、相关调控因子及其在血液系统恶性肿瘤中的意义 | 整合了多色流式细胞分选与批量及单细胞测序等前沿技术，系统阐述了可变剪接在造血及血液疾病中的调控机制 | 作为一篇综述文章，未提供原始实验数据，主要基于现有文献进行总结和展望 | 更新关于可变剪接在造血过程中作用的研究进展，阐明剪接因子突变如何导致血液恶性肿瘤 | 造血系统，包括造血干细胞、祖细胞、成熟血细胞及相关血液疾病（如骨髓增生异常综合征） | 自然语言处理 | 血液系统恶性肿瘤 | 多色流式细胞分选，批量测序，单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-12-03 |
Nanomaterial-Mediated Reprogramming of Macrophages to Inhibit Refractory Muscle Fibrosis
2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410368
PMID:39548911
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研究论文 | 本研究开发了一种功能化纳米材料，通过调控巨噬细胞极化来抑制难治性肌肉纤维化 | 利用聚乙烯亚胺功能化的纳米材料捕获细胞游离核酸，通过TLR7/9-NF-κB信号通路调控巨噬细胞表型，从而改变纤维-脂肪生成祖细胞的亚群平衡 | 研究主要关注口面部肌肉纤维化，在其他肌肉类型或组织中的适用性需进一步验证 | 开发治疗难治性肌肉纤维化的新策略 | 巨噬细胞和纤维-脂肪生成祖细胞 | NA | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-12-03 |
Age-Related ECM Stiffness Mediates TRAIL Activation in Muscle Stem Cell Differentiation
2024-Dec, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400334
PMID:39601528
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研究论文 | 本研究探讨了年龄相关的细胞外基质（ECM）硬化如何通过TRAIL通路影响肌肉干细胞（MuSC）的分化，揭示了其在肌肉再生障碍中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和体外基质工程，系统分析了年龄和ECM硬度对MuSC分化的协同影响，并识别出TRAIL通路在年龄相关纤维化群体中的关键作用 | 研究主要基于体外模型和动物实验，人类样本的验证不足；BAPN的长期治疗效果和副作用未充分评估 | 探究年龄相关ECM硬化如何通过分子机制影响肌肉干细胞的分化和功能，以阐明肌肉再生障碍的成因 | 年轻和年老小鼠的肌肉干细胞（MuSCs） | 单细胞组学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 年轻和年老MuSCs在软硬不同基质条件下的四组实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-11-27 |
Single-Cell Multiomics Identifies Glycan Epitope LacNAc as a Potential Cell-Surface Effector Marker of Peripheral T Cells in Bladder Cancer Patients
2024-12-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00635
PMID:39582226
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术首次系统整合了膀胱癌患者外周血中单细胞转录组、T细胞受体谱和糖基化表位LacNAc分析 | 首次系统整合单细胞转录组、TCR谱和糖基化表位LacNAc分析，开发了不改变免疫细胞转录状态的单细胞糖组学多组学平台 | NA | 探索膀胱癌患者外周T细胞的糖基化表位标志物及其免疫功能 | 膀胱癌患者的外周血免疫细胞 | 单细胞多组学 | 膀胱癌 | 单细胞多组学，化学酶标记，DNA条形码 | NA | 单细胞转录组，T细胞受体谱，糖基化数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | 利用化学酶标记与DNA条形码的单细胞糖组学多组学平台 |
| 28 | 2025-11-15 |
Inflammatory Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2024-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630257
PMID:39763863
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研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断后病毒反弹前后的血浆蛋白质组和单细胞转录组，发现可检测病毒血症前炎症单核细胞增加 | 首次在可检测HIV-1病毒反弹前观察到CD16单核细胞增加和独特转录特征 | 研究样本量有限，仅关注外周血单个核细胞 | 识别治疗停止后病毒反弹的早期信号，为延长HIV-1缓解期提供策略 | HIV-1感染者的外周血单个核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-11-15 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2024-Dec-19, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型，重点总结了单细胞转录组学、多组学和空间转录组学研究的新发现 | 整合单细胞转录组学、多组学和空间转录组学技术为神经退行性疾病小鼠模型提供新见解 | 承认没有任何小鼠模型是完美的，存在模型局限性 | 研究神经退行性疾病的病因学和潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型，特别是阿尔茨海默病和额颞叶痴呆模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 30 | 2025-11-12 |
BDNF augmentation reverses cranial radiation therapy-induced cognitive decline and neurodegenerative consequences
2024-12-18, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01906-9
PMID:39696694
|
研究论文 | 本研究探讨了利鲁唑通过增加BDNF水平逆转颅脑放疗诱导的认知衰退和神经退行性后果 | 首次证明FDA批准的ALS药物利鲁唑可通过增加BDNF水平逆转放疗诱导的认知功能障碍，并利用空间转录组学揭示其神经保护机制 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人体验证；未评估神经发生的影响 | 评估利鲁唑对放疗诱导认知功能障碍的治疗效果 | 成年小鼠模型（颅脑照射9 Gy） | 神经科学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学，双重免疫荧光染色，生化评估 | 动物模型 | 基因表达数据，免疫荧光图像，行为学数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 31 | 2025-11-11 |
CORTADO: Hill Climbing Optimization for Cell-Type Specific Marker Gene Discovery
2024-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.23.630040
PMID:39763976
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于爬山优化算法的计算框架CORTADO，用于高效发现细胞类型特异性标记基因 | CORTADO通过优化差异表达、基因表达谱独特性和稀疏性三个关键特性，克服了传统方法仅依赖p值排序的局限性 | NA | 开发高效发现细胞类型特异性标记基因的计算方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群和标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 爬山优化算法 | 基因表达数据 | 多个数据集（包括DLPFC 151507、Zeisel小鼠脑数据集和外周血单核细胞数据集） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-10-18 |
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts: diversity, topography, and perivascularity
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.15.628587
PMID:39763751
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和免疫组化分析视网膜神经节细胞的多样性和空间分布特征 | 首次结合MERFISH空间转录组学和免疫组化共染色技术，系统分析视网膜神经节细胞在二维空间中的分布模式及其与血管的邻近关系 | 研究主要基于小鼠模型，人类视网膜数据验证有限 | 探究视网膜神经节细胞的空间分布规律及其与局部微环境的关系 | 小鼠和人类视网膜神经节细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | MERFISH空间转录组学, 免疫组化共染色 | 计算配准方法 | 空间转录组数据, 图像数据 | 45种小鼠视网膜神经节细胞类型 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 成像基础的空间转录组学技术 |
| 33 | 2025-10-15 |
Unsupervised multi-scale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2024-Dec-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5671748/v1
PMID:39764102
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研究论文 | 开发了一种无监督多尺度聚类方法，用于识别单细胞转录组数据中的细胞类型和亚型层次结构 | 构建稀疏细胞-细胞相关性网络，以无监督方式在多尺度分辨率下识别细胞类型和亚型 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中的细胞聚类方法，以揭示更精细的细胞景观结构 | 单细胞转录组数据中的细胞类型和亚型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多尺度聚类 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-08 |
Dynamic cell fate plasticity and tissue integration drive functional synovial joint regeneration
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.628180
PMID:39713398
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研究论文 | 本研究通过建立成年斑马鱼单侧全关节切除模型，揭示了关节组织再生的细胞来源和分子机制 | 首次在成年脊椎动物中实现功能性滑膜关节的完全再生，并鉴定出神经嵴来源的多能细胞群体作为再生细胞来源 | 研究仅限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性尚需验证 | 探索刺激天然滑膜关节组织再生的机制 | 成年斑马鱼的滑膜关节 | 发育生物学 | 关节疾病 | 单细胞RNA测序, 克隆谱系追踪, 显微CT, 组织学分析, 活体成像 | NA | 基因表达数据, 影像数据, 组织学数据 | 成年斑马鱼关节切除模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Cellular communication network factor 2 regulates smooth muscle cell transdifferentiation and lipid accumulation in atherosclerosis
2024-12-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae215
PMID:39365752
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研究论文 | 本研究揭示了细胞通讯网络因子2在调控平滑肌细胞转分化和动脉粥样硬化脂质积累中的保护作用 | 首次发现SMC特异性CCN2缺失通过调控内质网应激、内吞作用和脂质积累机制促进动脉粥样硬化发展 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明CCN2在动脉粥样硬化中调控平滑肌细胞可塑性的功能和机制 | 人类和小鼠的血管平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | 可诱导小鼠SMC CCN2缺失模型 | 基因表达数据 | 人类和小鼠动脉粥样硬化样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-05 |
Data-driven discovery of cell-type-directed network-correcting combination therapy for Alzheimer's disease
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.09.627436
PMID:39713353
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研究论文 | 本研究开发了一种基于细胞类型特异性网络的阿尔茨海默病联合疗法发现方法 | 首次将单细胞转录组学、药物扰动数据库和临床记录整合，开发细胞类型特异性多靶点药物发现策略 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类患者中验证 | 开发针对阿尔茨海默病的细胞类型导向联合疗法 | 阿尔茨海默病小鼠模型、神经元和胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、临床记录 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-10-05 |
Comparison of imaging-based single-cell resolution spatial transcriptomics profiling platforms using formalin-fixed, paraffin-embedded tumor samples
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.13.628390
PMID:39763763
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研究论文 | 使用福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本系统比较三种成像型单细胞空间转录组学平台的性能 | 首次使用严格对照实验系统评估商业空间转录组平台在单细胞分辨率下的表现差异 | 研究仅针对特定肿瘤类型（肺腺癌和胸膜间皮瘤），样本量有限 | 比较不同空间转录组学平台在肿瘤研究中的性能差异 | 福尔马林固定石蜡包埋的肺腺癌和胸膜间皮瘤手术切除样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 免疫荧光, RNA测序 | NA | 图像, 转录组数据 | 组织微阵列中的连续5微米切片样本 | CosMx, MERFISH, Xenium | 单细胞空间转录组学, 多重免疫荧光, 数字空间分析 | CosMx, MERFISH, Xenium, GeoMx Digital Spatial Profiler | 单细胞分辨率空间转录组学平台（包括单模态和多模态） |
| 38 | 2025-10-05 |
A specific gene expression program underlies antigen archiving by lymphatic endothelial cells in mammalian lymph nodes
2024-Dec-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5493746/v1
PMID:39711554
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研究论文 | 本研究揭示了淋巴结中淋巴内皮细胞通过特定基因表达程序实现抗原归档的机制 | 首次定义了淋巴内皮细胞抗原归档的独特转录程序，并证明该程序能预测不同疾病状态和物种中的抗原归档能力 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 探究淋巴内皮细胞如何实现持久抗原归档及其独特转录特征 | 淋巴结淋巴内皮细胞和树突状细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染（基孔肯雅病毒） | 单细胞测序, 空间转录组学, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 多个时间点的免疫后淋巴结组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-05 |
Linking transcriptome and morphology in bone cells at cellular resolution with generative AI
2024-Dec-31, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjae151
PMID:39303095
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观点文章 | 探讨生成式AI在骨细胞转录组与形态学关联分析中的应用前景与挑战 | 首次系统提出将生成式AI应用于骨细胞多模态数据整合分析，实现细胞分辨率下的转录组与形态学关联研究 | 骨单细胞数据集存在技术偏差、重要骨细胞类型缺乏分析、空间信息不足等问题 | 推动生成式AI在骨细胞生物学研究中的应用，揭示细胞水平的复杂生物过程 | 骨细胞 | 计算机视觉,自然语言处理,机器学习 | 骨科疾病 | 单细胞测序,空间转录组学 | 生成式AI | 组织学图像,单细胞分子数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-05 |
An integrated single-nucleus and spatial transcriptomics atlas reveals the molecular landscape of the human hippocampus
2024-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.590643
PMID:38712198
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研究论文 | 通过整合单核和空间转录组学数据构建人类海马体分子图谱 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术揭示人类海马体细胞类型的分子特征和空间分布 | 研究样本仅来自10名神经典型成年捐赠者，样本量相对有限 | 解析人类海马体细胞类型的分子特征和空间组织 | 人类前海马体组织 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 非负矩阵分解(NMF) | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 10名成年神经典型捐赠者的相邻组织切片 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |