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当前共找到 700 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-27 |
Single-cell RNA sequencing in stroke and traumatic brain injury: Current achievements, challenges, and future perspectives on transcriptomic profiling
2024-Dec-09, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X241305914
PMID:39648853
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综述 | 综述单细胞RNA测序在脑卒中和创伤性脑损伤中的应用现状、挑战及未来转录组分析的展望 | 系统总结了scRNA-seq在脑卒中和急性创伤性脑损伤领域的最新成果，并展望了结合空间转录组学的未来应用方向 | 组织解离过程可能诱导细胞应激反应，影响数据的准确性 | 概述单细胞RNA测序技术的工作流程、数据分析方法及优缺点，并探讨其在脑损伤研究中的应用与未来前景 | 脑卒中和创伤性脑损伤中的细胞类型及转录组特征 | 自然语言处理 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 基于液滴的scRNA-seq系统和空间转录组学平台 |
| 22 | 2026-04-27 |
Postischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2024-Dec-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176207
PMID:39621585
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研究论文 | 本文发现内皮细胞中HIF脯氨酰羟化酶（PHD1-3）在缺血后失活通过诱导糖酵解促进肾脏不良修复 | 首次揭示内皮细胞PHD1、PHD2和PHD3联合失活（而非单独PHD2失活）通过糖酵解/MCT4轴驱动AKI向CKD转变，并发现MCT4抑制剂syrosingopine可恢复适应性修复 | 未明确提及，但可能包括机制细节需进一步验证和临床转化距离 | 探究内皮细胞氧感应PHD酶在缺血后肾脏修复中的调控作用 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤、慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型、药物抑制 | NA | 单细胞转录组数据、组织病理数据 | 小鼠模型（PHDTiEC基因敲除小鼠）和人类肾组织样本（伴有严重AKI） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 23 | 2026-04-24 |
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts: diversity, topography, and perivascularity
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.15.628587
PMID:39763751
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研究论文 | 通过结合成像空间转录组学（MERFISH）和免疫组化共染技术优化工作流程，系统分析了小鼠视网膜平铺片上神经节细胞的空间分布、多样性和血管周围性 | 首次在分子水平上全面描绘了视网膜神经节细胞（RGC）类型在二维视网膜表面的空间拓扑结构，鉴定了血管周围RGC类型并验证了其进化保守性和神经保护作用 | 主要基于小鼠模型，人类数据仅来自有限的组织样本；且工作流程需要薄切片可能丢失完整细胞形态信息 | 揭示视网膜神经节细胞类型在视网膜表面的空间组织规律及其与血管微环境的关系 | 小鼠视网膜神经节细胞（RGCs）及人类视网膜同源细胞类型 | 数字病理学 | 视神经疾病 | MERFISH，免疫组织化学染色，视神经压迫模型 | 计算配准方法 | 图像 | 小鼠视网膜平铺片（数量未具体说明），人类视网膜组织样本 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 成像空间转录组学（MERFISH）结合免疫组化共染技术 |
| 24 | 2026-04-19 |
Choroid Plexus as a Mediator of CNS Inflammation in Multiple Sclerosis
2024-Dec, Multiple sclerosis (Houndmills, Basingstoke, England)
DOI:10.1177/13524585241292974
PMID:39503321
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综述 | 本文探讨了脉络丛在多发性硬化症（MS）中作为中枢神经系统炎症介质的作用 | 重新评估脉络丛在MS神经炎症中的关键角色，结合空间转录组学等无偏方法探索疾病新驱动因素 | 作为观点综述，主要基于现有文献分析，缺乏原始实验数据验证 | 阐明脉络丛如何通过脑脊液调节MS相关的神经炎症 | 多发性硬化症患者的脑组织和脑脊液标本 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学 | NA | 脑组织标本、脑脊液标本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 25 | 2026-04-18 |
Profiling low-mRNA content cells in complex human tissues using BD Rhapsody single-cell analysis
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103475
PMID:39661509
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研究论文 | 本文介绍了一种使用BD Rhapsody单细胞分析平台高效回收低mRNA含量免疫细胞的协议 | 优化了前列腺、肺和肝组织的组织解离方法，并结合Sample Tag抗体标记和微孔单细胞捕获技术，提高了低mRNA含量细胞的回收效率 | 协议主要针对前列腺、肺和肝组织，可能不适用于其他组织类型；且依赖于特定的BD Rhapsody平台 | 解决单细胞RNA测序中低mRNA含量免疫细胞回收的挑战 | 前列腺、肺和肝组织中的低mRNA含量免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统 |
| 26 | 2026-04-18 |
Decoding aging in the heart via single cell dual omics of non-cardiomyocytes
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111469
PMID:39735437
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研究论文 | 本研究通过单细胞双组学技术解析小鼠心脏非心肌细胞在衰老过程中的异质性和动态变化 | 首次在单细胞水平上结合scRNA-seq和scATAC-seq技术，系统揭示心脏非心肌细胞衰老的异质性响应和细胞间通讯变化 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证；样本量相对有限 | 解析心脏衰老在单细胞水平的分子机制，为衰老相关心脏疾病提供治疗指导 | 年轻、中年和老年小鼠的心脏非心肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据，单细胞表观基因组数据 | 多个年龄组（年轻、中年、老年）的小鼠心脏非心肌细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-04-15 |
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627006
PMID:39713439
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研究论文 | 本文提出了一种名为cosmoDA的新型差异丰度测试方案，用于处理具有相关特征的组成型高通量测序数据 | 扩展了a-b幂交互模型以纳入协变量信息，并结合广义得分匹配估计框架，显著降低了相关特征导致的假阳性检测 | 未明确说明模型对极端稀疏数据或大规模特征交互的适用性限制 | 开发能够准确估计群体异质性下特征交互并降低假发现率的差异丰度测试方法 | 稀疏组成型计数数据，特别是单细胞RNA测序和扩增子测序数据 | 生物信息学 | NA | 高通量测序，单细胞RNA-seq，扩增子测序 | a-b幂交互模型，广义得分匹配估计 | 组成型计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-04-13 |
Single-cell RNA sequencing combined with proteomics of infected macrophages reveals prothymosin-α as a target for treatment of apical periodontitis
2024-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.01.018
PMID:38237771
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合蛋白质组学，揭示了感染巨噬细胞中prothymosin-α（PTMA）的上调，并验证了其作为根尖周炎治疗靶点的潜力 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析根尖周炎中单核/巨噬细胞的异质性，并鉴定出PTMA作为新的治疗靶点 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，尚未进行人体临床试验 | 阐明单核/巨噬细胞在慢性根尖周炎进展中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 慢性根尖周炎患者的根尖周病变组织、健康对照牙周组织、THP-1来源的巨噬细胞、小鼠和大鼠的根尖周炎模型 | 单细胞组学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫荧光染色, 实时定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及患者组织样本、细胞系及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-04-13 |
Early concentrate starter introduction induces rumen epithelial parakeratosis by blocking keratinocyte differentiation with excessive ruminal butyrate accumulation
2024-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.12.016
PMID:38128723
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析，探讨了早期引入浓缩饲料如何通过过量丁酸积累阻断角质细胞分化，从而诱导瘤胃上皮角化不全 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示了瘤胃上皮细胞异质性和分化轨迹，并建立了瘤胃器官样模型来验证丁酸在角化不全中的作用 | 研究仅基于新生羔羊模型，结果可能无法直接推广到其他反刍动物或不同年龄阶段 | 阐明瘤胃上皮角化过程及导致角化不全的关键瘤胃代谢物 | 24只14日龄羔羊的瘤胃组织和瘤胃液样本 | 单细胞组学 | 瘤胃上皮角化不全 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 免疫荧光, 实时定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 基因表达数据 | 24只羔羊分为三组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-04-11 |
Side- and Disease-Dependent Changes in Human Aortic Valve Cell Population and Transcriptomic Heterogeneity Determined by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121623
PMID:39766890
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了人类主动脉瓣膜中细胞群体和转录组异质性在瓣膜不同侧面及疾病进展中的变化 | 首次采用新的取样方法，独立收集主动脉瓣膜纤维侧和心室侧的富集内皮细胞样本进行单细胞RNA测序，揭示了瓣膜内皮细胞在侧面和疾病依赖下的高度异质性，并识别出多个与疾病相关的独特细胞亚群和转录因子 | 样本量较小（仅5名捐赠者），且样本涵盖了从非病变到纤维钙化阶段的不同疾病状态，可能限制了统计效力或对特定疾病阶段的深入分析 | 探究钙化性主动脉瓣膜病（CAVD）在瓣膜纤维侧优先发展的细胞和分子机制 | 人类主动脉瓣膜细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名捐赠者的主动脉瓣膜小叶，共分析82,356个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-04-11 |
Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.626682
PMID:39713308
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3功能获得性突变综合征中CD8+ T细胞功能失调的分子机制，重点关注嘌呤能信号通路的改变 | 首次揭示STAT3 GOF变异通过改变CD39、CD73和A2AR表达，导致嘌呤能信号失调，从而驱动CD8+ T细胞病理 | 研究主要基于患者样本和小鼠模型，机制细节仍需进一步验证 | 阐明STAT3 GOF变异导致CD8+ T细胞功能失调的分子机制 | STAT3 GOF患者和小鼠模型中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫调节障碍 | 单细胞RNA测序、高维免疫分析、功能评估 | NA | 基因表达数据、功能数据 | STAT3 GOF患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-04-11 |
Isolation and Comprehensive Analysis of Cochlear Tissue-Derived Small Extracellular Vesicles
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408964
PMID:39497619
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研究论文 | 本研究评估了三种耳蜗组织消化及耳蜗组织来源的小细胞外囊泡（CDsEV）分离方法，首次提出使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为最优分离方法，并全面分析了CDsEV的内容物和细胞来源 | 首次提出并验证了使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为耳蜗组织来源小细胞外囊泡（CDsEV）的最优分离方法，并首次通过单CDsEV测序与单细胞RNA测序数据的联合分析来追踪CDsEV的细胞来源 | 研究主要基于方法学优化和初步分析，未深入探讨CDsEV在耳蜗疾病中的具体作用机制或进行大规模临床验证 | 评估耳蜗组织来源小细胞外囊泡（CDsEV）的分离方法，并分析其内容物和细胞来源，以增强对耳蜗内CDsEV功能的理解 | 耳蜗组织来源的小细胞外囊泡（CDsEV）及其内容物（miRNAs和蛋白质） | 生物医学研究 | 听力相关疾病 | 小RNA测序、蛋白质组学、单CDsEV测序、单细胞RNA测序 | NA | 测序数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-04-10 |
A Strategy Involving Microporous Microneedles Integrated with CAR-TREM2-Macrophages for Scar Management by Regulating Fibrotic Microenvironment
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202406153
PMID:39313983
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微孔微针与CAR-TREM2-巨噬细胞的策略，通过调节纤维化微环境来管理疤痕 | 工程化构建了能够靶向DPP4成纤维细胞并调节疤痕微环境中内皮细胞亚型的CAR-TREM2-巨噬细胞，并首次将其与微孔微针递送系统结合用于疤痕治疗 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序分析，缺乏大规模的体内长期疗效和安全性验证 | 开发一种通过多因子调节疤痕微环境来抑制疤痕形成的有效治疗策略 | 皮肤损伤后的疤痕组织，重点关注DPP4阳性成纤维细胞、异质性血管内皮细胞和TREM2巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤疤痕 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-04-09 |
Integrative Protocol for Generation of iPSC-Derived 3D Human Hepatic Organoids
2024-12-06, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67070
PMID:39714036
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研究论文 | 本文描述了一种利用人诱导多能干细胞生成三维人源肝类器官的优化方案 | 提出了一种从hiPSC到三维肝类器官的简化、标准化流程，并整合了适用于单细胞RNA测序的优化解离策略 | 方案耗时较长（46-50天），且未在多种疾病模型或大规模药物筛选中验证其普适性 | 建立稳定的人源肝细胞三维培养体系，用于肝脏发育研究、疾病建模、药物开发和移植潜力探索 | 人诱导多能干细胞衍生的三维肝类器官 | 干细胞与类器官技术 | 肝脏疾病 | 免疫荧光、定量RT-PCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-04-09 |
PRDM16 determines specification of ventricular cardiomyocytes by suppressing alternative cell fates
2024-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402719
PMID:39304345
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子PRDM16在心脏发育中通过抑制替代细胞命运来指定心室心肌细胞身份的关键作用 | 首次揭示PRDM16通过抑制心室传导系统和心房命运的主调控因子活性，促进心室工作心肌细胞身份，并利用单细胞RNA+ATAC测序技术验证其在二元细胞命运决定中的功能 | 研究主要基于小鼠模型，未在人类样本中直接验证；PRDM16表达在出生后下降，其长期影响需进一步探究 | 探究PRDM16在心脏发育中对心室心肌细胞身份决定的作用机制 | 小鼠心脏发育过程中的心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-04-09 |
Dysfunctional β-cell longevity in diabetes relies on energy conservation and positive epistasis
2024-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402743
PMID:39313296
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研究论文 | 本文探讨了PFKFB3表达β细胞在2型糖尿病中的功能失调与长寿机制，揭示了其通过能量节约和正上位性相互作用来维持生存的机制 | 首次将PFKFB3表达β细胞与“失败者”细胞特征联系起来，并揭示了PFKFB3通过正上位性相互作用促进功能失调β细胞在糖尿病中长寿的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，人类样本数量可能不足，且机制验证主要在动物模型中进行 | 研究PFKFB3如何掩盖功能失调β细胞的竞争特性，并探索其在2型糖尿病中的作用机制 | 人类和小鼠的PFKFB3阳性β细胞，特别是2型糖尿病中的“失败者”β细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间转录组数据 | 来自nPOD的2型糖尿病胰腺样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2026-04-07 |
Application of Spatial Transcriptomics in Digestive System Tumors
2024-12-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15010021
PMID:39858416
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用，包括其在探索肿瘤空间结构、异质性、肿瘤微环境及细胞间相互作用方面的作用，以及在诊断、预后和治疗中的潜力 | 强调了空间转录组学与单细胞RNA测序、人工智能和机器学习相结合在消化系统肿瘤研究中的重要性 | NA | 总结空间转录组学在消化系统肿瘤研究中的最新进展、应用前景和技术挑战 | 消化系统肿瘤 | 数字病理学 | 消化系统肿瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-04-07 |
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08105-5
PMID:39506125
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，分析了免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者的心脏、肿瘤和血液中的免疫反应 | 首次在irMyocarditis患者中同时分析心脏、肿瘤和血液的免疫反应，揭示了心脏扩增的T细胞克隆与肿瘤组织中的T细胞克隆重叠度低，并发现血液中循环CD8 T细胞存在心脏扩增TCR与致命病例相关 | 样本量相对有限（28例患者），且未明确心脏自身抗原的具体靶点 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系 | 免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者的心脏组织、肿瘤组织和血液样本 | 单细胞组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，显微镜技术，蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据，显微图像，蛋白质数据 | 28名irMyocarditis患者和41名未受影响个体的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-04-07 |
Polyclonal-to-monoclonal transition in colorectal precancerous evolution
2024-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08133-1
PMID:39478225
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研究论文 | 本研究利用碱基编辑器启用的DNA条形码系统，在小鼠肠道肿瘤发生模型中绘制单细胞谱系图，揭示了结直肠癌前病变的多克隆起源和向单克隆的转变过程 | 首次在体内模型中系统性地描绘了结直肠癌前病变的单细胞进化谱系，并提出了多克隆向单克隆转变的模型 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究结直肠癌前病变的起源和进化机制 | 小鼠肠道组织（正常、炎症和肿瘤）以及人类散发性结直肠息肉 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 碱基编辑器启用的DNA条形码系统、单细胞RNA测序、bulk全外显子组测序、单腺体全基因组测序 | NA | 单细胞谱系数据、基因组数据、转录组数据 | 260,922个单细胞来自小鼠正常、炎症和肿瘤肠道组织 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-04-06 |
Rhythmic IL-17 production by γδ T cells maintains adipose de novo lipogenesis
2024-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08131-3
PMID:39478228
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研究论文 | 本研究揭示了γδ T细胞通过昼夜节律性产生IL-17来维持脂肪组织从头脂肪生成，从而影响全身代谢稳态 | 首次发现IL-17产生的γδ T细胞依赖分子钟维持脂肪组织稳态，并揭示IL-17在全身代谢节律中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证 | 探究免疫系统昼夜节律在组织稳态中的作用，特别是IL-17产生细胞对脂肪代谢的影响 | 小鼠的γδ T细胞、iNKT细胞、MAIT细胞及脂肪组织 | 免疫学与代谢研究 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、分子钟报告基因、遗传操作、全身代谢分析 | NA | RNA测序数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |