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当前共找到 702 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-19 |
Tracking the gene expression programs and clonal relationships that underlie mast, myeloid, and T lineage specification from stem cells
2024-12-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.11.001
PMID:39615483
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研究论文 | 利用多能干细胞分化系统，结合时间分辨单细胞RNA测序和转录谱系条形码技术，追踪从干细胞到肥大细胞、髓系和T细胞谱系规范过程中的基因表达程序和克隆关系 | 首次使用时间分辨单细胞RNA测序和转录谱系条形码技术，实时捕捉人类T细胞规范的转录动态和细胞命运限制事件，鉴定出YBX1在T细胞谱系规范中的作用，并揭示肥大细胞和髓系潜能早期在造血过程中相互分叉 | 可能受限于体外分化系统的模型特性，未涉及体内微环境的影响 | 理解人类T细胞规范的转录动态和细胞命运限制事件 | 人类多能干细胞分化而来的造血祖细胞及其衍生的肥大细胞、髓系和T细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序、转录谱系条形码 | 基因调控网络推断 | 单细胞转录组数据 | 时间分辨的单细胞RNA测序数据，涉及体外分化系统的多个时间点样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-06-17 |
Ionizing radiation inhibits zebrafish embryo hatching through induction of tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMPs) expression
2024-12, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17318
PMID:39547957
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示电离辐射通过诱导组织金属蛋白酶抑制剂表达抑制斑马鱼胚胎孵化的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序在脊椎动物发育过程中揭示电离辐射对脑/中枢神经系统和孵化腺细胞簇比例的影响，并发现组织金属蛋白酶抑制剂在孵化腺中上调是导致孵化延迟的关键调控机制 | 虽然观察到了孵化延迟，但未观察到包括大脑在内的某些器官的形态学变化 | 揭示电离辐射对水生生物和人类生物学效应的分子机制，特别是在脊椎动物发育过程中的影响 | 斑马鱼胚胎 | 生物信息学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序、全胚胎原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎，暴露于5戈瑞电离辐射 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-06-15 |
Single-Cell Analysis of Subcutaneous Fat Reveals Profibrotic Cells That Correlate With Visceral Adiposity in HIV
2024-12-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgae369
PMID:38820087
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析HIV感染者皮下脂肪中的促纤维化细胞，发现其与内脏脂肪组织体积相关 | 首次在HIV感染者中揭示了皮下脂肪组织特异性的细胞组成和转录程序与内脏脂肪组织体积的关联，特别是中间巨噬细胞、肌成纤维细胞和MYOC+成纤维细胞的比例升高 | 需要进一步的纵向研究来确定方向性和机制 | 表征HIV感染者皮下脂肪组织细胞类型特异性组成和转录程序，探索与内脏脂肪组织体积增大的关联 | 长期接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者 | 机器学习 | 心血管疾病, 代谢性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 92名参与者进行批量RNA测序，43名进行单细胞RNA测序 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台 |
| 24 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution
2024-12, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339
PMID:39393164
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综述 | 本短篇综述强调了单细胞RNA测序在揭示基因型-表型关系中的关键作用，特别是在非模式生物对环境污染反应中的应用潜力 | 将单细胞RNA测序的应用范围从典型疾病研究扩展到非模式生物对环境污染物的反应，提供了对细胞异质性的全面理解 | 未详细讨论单细胞RNA测序在非模式生物中应用的技术挑战或数据分析难点 | 通过分析已发表文章，说明单细胞RNA测序在生物学领域的最新进展，并探讨其在非模式生物对环境污染反应研究中的潜力 | 单细胞RNA测序应用相关的已发表文章 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-06-02 |
Batch effects correction in scRNA-seq based on biological-noise decoupling autoencoder and central-cross loss
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 提出基于生物噪声解耦自编码器和中心交叉损失的BDACL模型，用于消除单细胞RNA测序数据的批次效应 | 通过自编码器重构数据和层次聚类树逐步合并小簇，引入中心交叉损失以无监督方式消除批次效应，同时保留稀有细胞类型 | 未提及具体局限性 | 解决单细胞RNA测序数据中批次效应导致稀有细胞类型信息丢失的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 26 | 2026-06-02 |
CopyMix: Mixture model based single-cell clustering and copy number profiling using variational inference
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出CopyMix模型，通过变分推断同时进行单细胞聚类和拷贝数变异分析，以研究肿瘤异质性 | 首次通过变分推断联合推断细胞聚类及其拷贝数谱，避免了传统分步处理中引入的人为聚类伪影 | 未明确说明局限性 | 开发一种能同时进行单细胞聚类和拷贝数谱推断的方法，以更好地研究肿瘤异质性 | 肿瘤细胞亚群 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞DNA测序 | 混合隐马尔可夫模型 | 拷贝数数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-06-02 |
Deconvolution of cell-type-associated markers predictive of response to neoadjuvant radiotherapy
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据，对直肠癌新辅助放疗前样本进行细胞类型解卷积，识别预测放疗反应的细胞类型相关标记 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据，系统解析了直肠癌新辅助放疗响应的细胞类型特异性标记及其相互作用网络 | 未明确说明具体局限性 | 揭示直肠癌放疗后耐药和复发的细胞来源分子标记及治疗靶点 | 直肠癌患者新辅助放疗前的肿瘤样本 | 数字病理学, 机器学习 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 三个独立数据集（GSE119409、GSE35452、GSE45404） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-06-01 |
Airway-derived emphysema-specific alveolar type II cells exhibit impaired regenerative potential in COPD
2024-Dec, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02071-2023
PMID:39147413
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研究论文 | 发现了一种位于肺泡远端囊泡中的特异性ATII细胞亚群（asATII细胞），该细胞在COPD中表现出再生潜力受损，并可能成为新的治疗靶点 | 首次发现并描述了一种同时表达肺泡标记物表面活性蛋白C和club细胞标记物SCGB3A2的肺气肿特异性ATII细胞亚群（asATII细胞），并在小鼠模型中证实其来源于club细胞 | 未提及具体研究局限，但基于摘要可推断可能包括：研究主要在体外类器官模型中进行，缺乏体内功能验证；样本量及临床相关性有待进一步确认 | 探究COPD肺气肿中组织再生受损的驱动因素，特别是肺上皮祖细胞异常 | COPD患者和健康对照的肺泡II型（ATII）细胞及气道club细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、谱系标记 | NA | 基因表达数据 | 人及小鼠样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-05-31 |
Atlas of Metastatic Gastric Cancer Links Ferroptosis to Disease Progression and Immunotherapy Response
2024-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.038
PMID:39097198
|
研究论文 | 对转移性胃癌进行单细胞转录组和免疫图谱分析，揭示铁死亡在疾病进展和免疫治疗反应中的作用 | 首次构建大规模转移性胃癌的单细胞图谱，揭示铁死亡逃逸机制及其与免疫治疗联合的潜在治疗策略 | 主要基于治疗初治患者，可能无法完全反映治疗后的动态变化 | 通过单细胞和免疫图谱揭示转移性胃癌的肿瘤和免疫生物学特征，探索铁死亡在疾病进展中的作用及联合治疗策略 | 68对配对的治疗初治原发性转移性胃癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序, 免疫分析 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫数据 | 68对配对的治疗初治原发性转移性胃癌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-05-31 |
Mucosal Single-Cell Profiling of Crohn's-Like Disease of the Pouch Reveals Unique Pathogenesis and Therapeutic Targets
2024-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.025
PMID:39084267
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示贮袋克罗恩样病的独特发病机制和治疗靶点 | 首次利用单细胞RNA测序和质谱流式技术对贮袋克罗恩样病患者黏膜细胞进行全面分析，发现其内质网应激升高可能是新型诊断标志物和治疗靶点 | 研究样本量有限（50例），且主要基于横断面分析，缺乏纵向动态观察 | 探究溃疡性结肠炎患者术后贮袋克罗恩样病的病理生理机制 | 贮袋克罗恩样病患者、正常贮袋患者、贮袋炎患者及家族性腺瘤性息肉病患者的黏膜细胞 | 单细胞分析 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、质谱流式技术、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式数据 | 50例患者（包括正常和CDP组）：其中部分样本进行单细胞RNA测序，部分进行质谱流式分析 | 10x Genomics, Fluidigm | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | 10x Chromium, CyTOF | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒用于单细胞RNA测序；质谱流式技术使用CyTOF平台 |
| 31 | 2026-05-31 |
Identification of Key Genes in Fetal Gut Development at Single-Cell Level by Exploiting Machine Learning Techniques
2024-12, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400104
PMID:39324223
|
研究论文 | 利用机器学习技术对单细胞测序数据进行分析，识别胎儿肠道发育过程中的关键基因 | 采用了增量特征选择方法结合四种特征排序算法，从大规模单细胞数据中提取关键基因和分类规则，构建高效分类器 | 未提及明确的局限性 | 通过机器学习技术增强对胎儿肠道发育的理解 | 胎儿肠道发育过程中的细胞，包括结肠、十二指肠和回肠的上皮、免疫、间充质和血管细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 62,849个样本，每个样本有33,694个基因特征 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-05-30 |
Reliable estrogen-related prognostic signature for uterine corpus endometrial carcinoma
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究探索子宫体子宫内膜癌(UCEC)中关键的雌激素相关基因(ERGs)，并构建可靠的预后风险评分 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA数据识别出8个雌激素相关基因构建预后风险评分，并发现其与免疫微环境及药物敏感性相关 | 未提及外部验证队列，且样本来源可能存在偏倚 | 探索子宫体子宫内膜癌中关键的雌激素相关基因并建立预后预测模型 | 子宫体子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序 | LASSO Cox回归、多元Cox回归 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本量，数据来源包括GEO和TCGA数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-05-30 |
Highlighting roles of autophagy in human diseases: a perspective from single-cell RNA sequencing analyses
2024-12, Drug discovery today
IF:6.5Q1
DOI:10.1016/j.drudis.2024.104224
PMID:39521332
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综述 | 该综述探讨了自噬在人类疾病中的作用，并从单细胞RNA测序分析的角度进行了阐述 | 利用单细胞RNA测序技术揭示自噬通路在多种生理和病理背景下的转录景观，提供了分子层面的新视角 | 未明确说明具体局限性 | 总结单细胞RNA测序在自噬研究中的最新进展，并强调其在多种疾病分子特征研究中的潜力 | 自噬相关的人类疾病 | 单细胞转录组学 | 癌症及其他疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-05-29 |
Neuronal cell populations in circumoral nerve ring of sea cucumber Apostichopus japonicus: Ultrastructure and transcriptional profile
2024-12, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101263
PMID:38850626
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究了仿刺参围口神经环中神经元的超微结构和转录谱，鉴定出六种神经元细胞类型 | 首次对海参神经元细胞进行单细胞转录组分析，鉴定了六种神经元类型及神经肽前体基因和G蛋白偶联受体的表达模式 | 仅聚焦于围口神经环区域，未涵盖海参其他神经组织；尚未对鉴定出的神经元类型进行功能验证 | 阐明海参神经元细胞的类型、分子特征和进化意义 | 仿刺参（Apostichopus japonicus）围口神经环中的神经元细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2024-12-15 |
Cell type and dynamic state govern genetic regulation of gene expression in heterogeneous differentiating cultures
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100701
PMID:39626676
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研究论文 | 研究探讨了在异质性分化培养物中，细胞类型和动态状态如何调控基因表达的遗传机制 | 利用异质性分化培养物系统，研究了53个人类供体的单细胞RNA测序数据，揭示了与发育和疾病相关基因的新型调控变异 | 研究主要集中在体外系统，可能无法完全反映体内复杂的调控机制 | 探讨人类遗传变异在不同细胞环境中的分子效应，以理解与疾病相关位点的机制 | 异质性分化培养物中的细胞类型和发育阶段 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 53个人类供体的900,000多个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2026-05-28 |
scTrends: A living review of commercial single-cell and spatial 'omic technologies
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100723
PMID:39667347
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综述 | 对商业化单细胞和空间组学技术进行动态综述，涵盖从微流控到成像等多种方法，并讨论其在药物研发中的应用趋势 | 首次以“活综述”形式动态追踪单细胞和空间组学技术的商业化进展，系统整合微流控、组合索引、NGS和成像等多种平台方法，并特别强调新兴技术对药物机制发现的潜在扩展作用 | 文章未对具体平台性能进行量化比较，且作为动态综述可能难以完全覆盖所有最新技术细节 | 系统梳理单细胞和空间组学商业化技术的现状与趋势，为药物研发和学术研究提供资源参考 | 商业化单细胞技术（微流控、板基法、组合索引）和空间组学技术（测序和成像基方法） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、微流控、组合索引、成像技术 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics, Illumina, BGI, 布鲁克 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ | 微流控单细胞平台、基于组合索引的plate-based方法、NGS空间转录组学（如10x Visium）、成像基空间转录组学（如MERFISH） |
| 37 | 2026-05-27 |
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.19.629499
PMID:39763713
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研究论文 | 本研究通过细胞谱系追踪、靶向细胞消融和单细胞RNA测序，揭示了肺成纤维细胞在烟曲霉感染中的激活及其通过免疫调节和组织重塑增强宿主防御的作用 | 首次发现肺成纤维细胞在烟曲霉感染中的保护性角色，证明成纤维细胞通过免疫调节和细胞外基质分泌参与宿主防御，而非仅仅作为组织损伤的被动响应者 | 未明确说明研究局限性 | 探索肺成纤维细胞在烟曲霉感染引起的肺损伤中的功能响应及其对宿主防御的重要性 | 肺成纤维细胞及烟曲霉感染的小鼠模型 | 数字病理学 | 侵袭性曲霉病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 免疫正常和免疫抑制小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3′测序 |
| 38 | 2026-05-25 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析，揭示IL-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的驱动作用 | 首次在人类ACM样本中采用单核RNA测序和空间转录组学联合分析，鉴定出疾病相关的炎症-纤维化空间微环境，并证明抗IL-1β中和抗体在ACM小鼠模型中可减轻纤维化、保护心脏功能 | 主要基于小鼠模型验证治疗策略，人类样本数量有限且未进行干预性临床试验验证 | 阐明IL-1β在ACM发病机制中的作用并评估其作为治疗靶点的潜力 | 人类ACM心肌样本和Dsg2突变小鼠模型 | 数字病理学 | 致心律失常性心肌病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 人类ACM患者与对照供体的心肌样本，以及Dsg2基因纯合突变小鼠 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Genomics单核RNA测序和Visium空间转录组学平台 |
| 39 | 2026-05-25 |
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400332
PMID:39465979
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研究论文 | 通过局部控制释放IL-4减少牙周炎小鼠模型中的炎症性骨丢失 | 首次证明使用可控药物递送策略局部释放IL-4可逆转炎症性骨丢失并促进骨再生，并利用单细胞RNA测序揭示其通过将巨噬细胞转向修复表型的作用机制 | 未提及具体局限性，但可能包括小鼠模型与人类的差异、递送系统的长期效果及安全性需进一步验证 | 评估使用可控药物递送策略靶向口腔巨噬细胞治疗慢性炎症的可行性 | 牙周炎小鼠模型中的巨噬细胞和牙周组织 | 数字化病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牙周炎小鼠模型，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 40 | 2026-05-23 |
Single-cell profiling of the peripheral blood immune landscape during mid- and late-stage pregnancy
2024-12-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 通过单细胞测序分析中晚期妊娠外周血免疫细胞图谱 | 首次揭示了HOPX+ CD4+ T细胞、ZNF683+CD8+ T细胞和KLRB1+CD8+ T细胞在妊娠中晚期显著差异，并发现了罕见XIST+ T细胞亚型在妊娠中可能参与免疫相关基因转录翻译调控和胰岛素信号通路 | 样本量较小，仅纳入3例中期和3例晚期妊娠女性，且未涉及早期妊娠对比或妊娠相关疾病研究 | 建立中晚期妊娠女性外周血单个核细胞免疫谱，为研究妊娠相关疾病提供基础 | 中晚期妊娠女性的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例妊娠女性（中期3例，晚期3例） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |