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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-05 |
snRNA-seq of long-preserved FFPE samples from colorectal liver metastasis lesions with diverse prognoses
2024-12-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04323-8
PMID:39725704
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研究论文 | 本研究利用snRandom-seq技术对长期保存的FFPE结直肠癌肝转移样本进行单核RNA测序,以探索预后差异的潜在影响因素 | 首次在保存至少三年(多数超过五年)的FFPE样本中成功应用单核RNA测序技术,克服了长期保存导致的RNA降解挑战 | 样本量相对有限(18例),且仅针对结直肠癌肝转移,可能限制了结果的普适性 | 探究结直肠癌肝转移患者预后差异的细胞异质性基础 | 结直肠癌肝转移患者的长期保存FFPE组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例结直肠癌肝转移病例的多个病灶样本,共82,285个细胞 | NA | 单核RNA-seq | snRandom-seq | 专门针对FFPE样本的单核RNA测序技术 |
| 22 | 2026-03-05 |
Molecular Lineages and Spatial Distributions of Subplate Neurons in the Human Fetal Cerebral Cortex
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407137
PMID:39495628
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示了人类胎儿大脑皮层中底板神经元的分子起源、谱系特化和空间分布特征 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,系统描绘了人类胎儿大脑皮层底板神经元的分子轨迹和空间景观,并识别了人类特异性基因和细胞外基质基因在其中的稳定表达模式 | 研究仅覆盖妊娠10至25周的胎儿样本,未涉及更早期或更晚期的发育阶段,且样本量有限 | 探究人类胎儿大脑皮层中底板神经元的起源、发育谱系及其在皮层神经发生和早期结构折叠中的作用 | 人类胎儿大脑皮层中的底板神经元 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 妊娠10至25周的人类胎儿大脑皮层样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-03-05 |
Isolation and Comprehensive Analysis of Cochlear Tissue-Derived Small Extracellular Vesicles
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408964
PMID:39497619
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研究论文 | 本研究评估了三种耳蜗组织消化和耳蜗组织来源的小细胞外囊泡(CDsEV)分离方法,首次提出使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为最佳分离策略,并全面分析了CDsEV的内容物和细胞来源 | 首次提出并验证了使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为耳蜗组织来源小细胞外囊泡(CDsEV)的最佳分离方法,并首次通过单CDsEV测序与单细胞RNA测序数据的联合分析来追踪CDsEV的细胞来源 | NA | 评估耳蜗组织来源小细胞外囊泡(CDsEV)的分离方法,并全面分析其内容物(miRNA和蛋白质)及细胞来源,以增强对耳蜗内CDsEV功能的理解 | 耳蜗组织来源的小细胞外囊泡(CDsEV) | NA | NA | 小RNA测序, 蛋白质组学, 单CDsEV测序, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-03-05 |
Sirtuin1 Suppresses Calcium Oxalate Nephropathy via Inhibition of Renal Proximal Tubular Cell Ferroptosis Through PGC-1α-mediated Transcriptional Coactivation
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408945
PMID:39498889
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了Sirtuin1通过PGC-1α介导的转录共激活抑制肾近端小管细胞铁死亡,从而减轻草酸钙晶体诱导的肾损伤的机制 | 首次在草酸钙肾病模型中应用单细胞转录组测序技术,并揭示了Sirt1/PGC-1α/NRF2/GPX4信号轴在调控肾小管细胞铁死亡中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体样本或临床试验中得到验证 | 探究草酸钙晶体诱导肾损伤的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 草酸钙肾病小鼠模型的肾脏样本 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 草酸钙肾病小鼠的肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-03-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Pathological Processes and Crucial Targets for Vascular Endothelial Injury in Diabetic Hearts
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405543
PMID:39475009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病心脏中血管内皮损伤的病理过程和关键调控靶点 | 首次在糖尿病小鼠心脏组织中构建单细胞转录图谱,识别了内皮细胞异质性并发现关键转录因子Ets1的保护作用 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且病理阶段覆盖可能有限 | 探究糖尿病心脏血管内皮损伤的机制和细胞异质性 | 瘦素受体敲除(db/db)糖尿病小鼠的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个病理阶段的db/db糖尿病小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-03-05 |
AIP1 Regulates Ocular Angiogenesis Via NLRP12-ASC-Caspase-8 Inflammasome-Mediated Endothelial Pyroptosis
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405834
PMID:39527457
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,在氧诱导视网膜病变模型中,鉴定出血管内皮细胞特异性抗血管生成因子AIP1,并揭示其通过抑制NLRP12-ASC-caspase-8炎症小体介导的内皮细胞焦亡来调控病理性眼内血管生成 | 首次鉴定出AIP1作为血管内皮细胞特异性抗血管生成因子,并揭示了一个新的非经典炎症小体NLRP12-ASC-caspase-8在介导内皮细胞焦亡和促进视网膜新生血管形成中的作用机制 | NA | 探究炎症调控病理性眼内血管生成的分子机制 | 血管内皮细胞、氧诱导视网膜病变模型 | NA | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-03-05 |
Spatiotemporal Molecular Architecture of Lineage Allocation and Cellular Organization in Tooth Morphogenesis
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403627
PMID:39535354
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和单细胞RNA测序,描述了牙齿形态发生中谱系分配和细胞组织的高分辨率全基因组分子模式 | 发现牙齿形态发生中88%的谱系物种在初始牙蕾中已出现,而非传统认为的顺序出现;揭示了牙乳头的一种先前未被识别的萌芽样模式,以及釉质结在时空中的连续分化层次;建立了指导牙齿形态发生的调控网络,涉及机械转导信号 | NA | 研究牙齿形态发生中的时空分子架构,包括谱系分配和细胞组织 | 牙齿形态发生过程中的细胞和组织 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-03-04 |
Protocol for isolating specific C. elegans neuron types for bulk and single-cell RNA sequencing
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103439
PMID:39514392
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研究论文 | 本文介绍了一种从秀丽隐杆线虫中分离特定神经元类型以进行批量或单细胞RNA测序的详细实验方案 | 提供了一种针对秀丽隐杆线虫特定神经元类型的标准化分离流程,适用于幼虫和成年动物,结合了荧光激活细胞分选技术 | 该方案可能依赖于特定的荧光标记或遗传工具,且未在多种神经元类型或复杂条件下进行广泛验证 | 开发一种用于分离秀丽隐杆线虫特定神经元类型以进行基因表达分析的实验方案 | 秀丽隐杆线虫的特定神经元类型 | 单细胞测序 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-03-04 |
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08105-5
PMID:39506125
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了免疫检查点抑制剂相关心肌炎(irMyocarditis)患者心脏、血液和肿瘤组织中的免疫反应特征 | 首次在irMyocarditis患者中同时分析心脏、血液和肿瘤组织的单细胞转录组与T细胞受体谱,揭示了心脏扩增的T细胞克隆与肿瘤组织不重叠,并发现循环血液中特定CD8 T细胞群与致命性病例相关 | 样本量相对有限(28例患者),未明确心脏自身抗原,且机制性因果关系仍需进一步验证 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系 | 免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者的心脏组织、血液样本及配对肿瘤组织 | 单细胞组学与免疫学 | 心肌炎(免疫相关不良反应) | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,多重显微成像,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,T细胞受体序列数据,显微图像,蛋白质组数据 | 28例irMyocarditis患者,41例未受影响个体;共分析84,576个心脏细胞和366,066个血液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-03-02 |
Unsupervised multi-scale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2024-Dec-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5671748/v1
PMID:39764102
|
研究论文 | 本文开发了一种无监督多尺度聚类方法,用于从单细胞转录组数据中识别细胞类型和亚型的层次结构 | 提出了一种基于稀疏细胞-细胞相关性网络的多尺度聚类方法,能够在无监督方式下以更精细的分辨率解析细胞景观的复杂结构 | NA | 开发一种改进的单细胞RNA测序数据聚类方法,以揭示细胞亚型的层次结构 | 单细胞转录组数据 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 多尺度聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-03-02 |
Protocol for Xenium spatial transcriptomics studies using fixed frozen mouse brain sections
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103420
PMID:39535916
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研究论文 | 本文介绍了一种使用固定冷冻小鼠脑切片进行Xenium空间转录组学研究的实验方案 | 证明了除10× Genomics验证的FFPE和新鲜冷冻切片外,固定冷冻薄脑切片也兼容Xenium平台,并提供优异的成像和定量结果 | NA | 开发适用于Xenium空间转录组学平台的固定冷冻小鼠脑切片实验流程 | 固定冷冻的小鼠脑切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium分析仪 |
| 32 | 2026-03-02 |
Fibroblast growth factor 2 enhances BMSC stemness through ITGA2-dependent PI3K/AKT pathway activation
2024-12, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31423
PMID:39188080
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研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞生长因子2通过上调整合素α2表达并激活PI3K/AKT通路来增强骨髓间充质干细胞干性的分子机制 | 首次结合转录组学和单细胞测序技术,系统性地鉴定并验证了FGF2和ITGA2在调控BMSC干性中的关键作用,并阐明了其通过PI3K/AKT通路发挥功能的分子机制 | 研究主要在体外细胞模型中进行,缺乏体内动物实验验证;未深入探讨其他可能参与的信号通路 | 探索增强骨髓间充质干细胞干性维持的策略以提高其治疗潜力 | 骨髓间充质干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 转录组学分析,单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-03-01 |
Elevated Shear Stress Modulates Heterogenous Cellular Subpopulations to Induce Vascular Remodeling
2024-12, Tissue engineering. Part A
DOI:10.1089/ten.TEA.2023.0362
PMID:38753711
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研究论文 | 本研究通过动物模型、单细胞RNA测序和组织病理学方法,探究了高剪切应力如何通过调控异质性细胞亚群诱导血管重塑 | 首次在单细胞分辨率下全面研究了高剪切应力诱导血管重塑的分子机制,并精确操控血流以表征所有重要的细胞亚群 | 研究基于大鼠动物模型,结果向人类临床转化的有效性有待进一步验证 | 探究高剪切应力诱导血管重塑的分子机制,以寻找预防动静脉瘘失败的新疗法 | 大鼠隐静脉中的细胞亚群,特别是内皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,组织病理学 | NA | 单细胞转录组数据,组织病理学图像 | 大鼠隐静脉样本(高剪切应力组与无高剪切应力对照组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-02-28 |
Single-cell profiling of the amphioxus digestive tract reveals conservation of endocrine cells in chordates
2024-12-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq0702
PMID:39705360
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了文昌鱼消化道的细胞特征,包括其分段结构和细胞簇多样性,并强调了内分泌样细胞的保守性 | 首次在文昌鱼消化道中发现并描述了三种分泌胰岛素样、胰高血糖素样和生长抑素样肽的内分泌样细胞,揭示了脊椎动物消化系统进化的关键线索 | 研究基于模型生物文昌鱼,可能不完全代表所有脊椎动物的进化过程,且功能验证仅限于特定基因敲除线 | 探索脊椎动物消化系统的进化起源,通过分析原始脊索动物文昌鱼的消化道细胞特征 | 文昌鱼(amphioxus)的消化道组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,批量组织测序,基因敲除 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-02-27 |
Single cell and TCR analysis of immune cells from AAV gene therapy-dosed Duchenne muscular dystrophy patients
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101349
PMID:39524974
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和T细胞受体测序,分析了接受AAV基因治疗的杜氏肌营养不良症患者治疗前后的外周血单个核细胞,以探究免疫反应机制 | 首次在AAV基因治疗临床试验中结合单细胞转录组和TCR测序,揭示了治疗后T细胞干扰素反应基因的诱导以及特定TCR克隆的扩增,并发现部分扩增克隆与既往疱疹病毒感染相关 | 样本量较小(仅5名参与者),且仅有一例发生血栓性微血管病,限制了统计效力与普遍性结论的得出 | 探究高剂量AAV基因治疗在杜氏肌营养不良症患者中引发的免疫反应机制,特别是血栓性微血管病发生的潜在原因 | 接受AAV基因治疗的杜氏肌营养不良症患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 5名患者治疗前后的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-02-25 |
A novel biomarker of COVID-19: MMP8 emerged by integrated bulk RNAseq and single-cell sequencing
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82227-8
PMID:39730651
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞测序数据,发现MMP8是COVID-19的一个新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞测序和药理学数据库,鉴定出MMP8作为COVID-19的关键生物标志物,并揭示其在髓系细胞中的异质性表达及细胞间相互作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本量未明确说明;未涉及机制的功能性验证 | 阐明COVID-19的病理进展和分子改变,寻找诊断和治疗靶点 | 健康供体、非重症和重症COVID-19患者 | 生物信息学 | COVID-19 | bulk RNA-seq, 单细胞测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-02-25 |
A Strategy Involving Microporous Microneedles Integrated with CAR-TREM2-Macrophages for Scar Management by Regulating Fibrotic Microenvironment
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202406153
PMID:39313983
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微孔微针与CAR-TREM2-巨噬细胞的策略,通过调节纤维化微环境来管理疤痕 | 首次将靶向DPP4成纤维细胞并调节内皮细胞亚型的CAR-TREM2-巨噬细胞与微孔微针递送系统相结合,用于多因子调控疤痕微环境 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序分析,缺乏大规模动物模型或临床验证 | 开发一种通过调控疤痕微环境来有效预防和治疗皮肤创伤后疤痕形成的新策略 | 皮肤疤痕微环境中的DPP4阳性成纤维细胞、异质性血管内皮细胞和TREM2巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-02-25 |
A Single-Cell RNA Sequencing Guided Multienzymatic Hydrogel Design for Self-Regenerative Repair in Diabetic Mandibular Defects
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410962
PMID:39436107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术指导设计了一种多酶水凝胶支架,用于促进糖尿病下颌骨缺损的自再生修复 | 首次结合单细胞RNA测序分析揭示糖尿病环境下NO和ROS阻碍巨噬细胞重极化的关键机制,并据此设计具有双功能(NO清除和ROS清除)的多酶水凝胶支架 | 研究主要针对糖尿病下颌骨缺损模型,尚未验证在其他骨缺损类型或更广泛糖尿病并发症中的适用性 | 开发能够恢复糖尿病环境下生理性骨重塑功能的骨组织工程材料 | 糖尿病下颌骨缺损模型中的巨噬细胞、骨髓间充质干细胞和内皮细胞 | 组织工程与再生医学 | 糖尿病骨缺损 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-02-25 |
Nanomaterial-Mediated Reprogramming of Macrophages to Inhibit Refractory Muscle Fibrosis
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410368
PMID:39548911
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研究论文 | 本研究开发了一种功能化纳米材料,通过调控巨噬细胞极化来抑制难治性肌肉纤维化 | 利用聚乙烯亚胺功能化的纳米材料捕获细胞游离核酸,通过TLR7/9-NF-κB信号通路调控巨噬细胞表型,从而改变纤维-脂肪祖细胞亚群平衡 | 研究主要针对口面部肌肉纤维化,在其他类型肌肉或组织中的适用性需进一步验证 | 开发治疗难治性肌肉纤维化的新策略 | 巨噬细胞和纤维-脂肪祖细胞 | 生物医学工程 | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-02-20 |
A novel multi-omics approach for identifying key genes in intervertebral disc degeneration
2024-12, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100223
PMID:39528158
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研究论文 | 本研究采用多组学方法结合单细胞RNA测序、差异基因表达分析和孟德尔随机化,揭示了椎间盘退变的关键基因和遗传结构 | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,识别出与椎间盘退变相关的关键调控基因SLC40A1、PTGS2和GABARAPL1,并揭示了软骨细胞的动态基因表达模式 | 研究依赖于公开可用的单细胞数据集,样本来源和数量可能有限,且未进行实验验证 | 阐明椎间盘退变的遗传结构和关键基因,为治疗提供潜在靶点 | 椎间盘退变相关的细胞类型和基因 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |