单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
361	2024-12-11	Cordycepin enhances the Anticancer efficacy of PD-L1 blockade by modulating the tumor microenvironment of colon cancer 2024-Dec-15, European journal of pharmacology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.ejphar.2024.177089 PMID:39489279	研究论文	研究评估了抗PD-L1抗体与虫草素联合治疗结肠癌的效果及其机制	首次探讨了虫草素通过调节肿瘤微环境增强PD-L1阻断的抗肿瘤效果	NA	评估抗PD-L1抗体与虫草素联合治疗结肠癌的疗效	结肠癌及其肿瘤微环境	NA	结肠癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
362	2024-12-11	Leukemia inhibitory factor receptor inhibition by EC359 reduces atherosclerotic stenosis grade in Ldlr-/- mice 2024-Dec-15, European journal of pharmacology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.ejphar.2024.177121 PMID:39528103	研究论文	本研究探讨了白血病抑制因子（LIF）受体在动脉粥样硬化发展中的作用，并通过实验验证了LIF受体抑制剂EC359在减少动脉粥样硬化狭窄程度方面的潜力	首次深入研究了LIF及其受体在动脉粥样硬化中的作用，并证明了LIF受体抑制剂EC359在减少动脉粥样硬化斑块大小和降低胆固醇水平方面的效果	研究仅在Ldlr-/-小鼠模型中进行，结果的普遍性和在人类中的适用性尚需进一步验证	探讨LIF受体信号在动脉粥样硬化发展中的作用，并评估LIF受体抑制剂EC359的疗效	LIF受体在动脉粥样硬化中的作用及EC359对动脉粥样硬化的影响	心血管疾病	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	实验涉及30只Ldlr-/-小鼠，分为两组，每组15只
363	2024-12-11	Distinct immune microenvironment of venous tumor thrombus in hepatocellular carcinoma at single-cell resolution 2024-Dec-10, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001182 PMID:39656099	研究论文	本研究探讨了肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓（PVTT）的免疫微环境特征	首次在单细胞分辨率下揭示了PVTT中免疫细胞的组成和功能，特别是C5aR+ TAMs在免疫抑制环境中的作用	研究主要集中在PVTT的免疫微环境，未涉及其他类型的肿瘤血栓	探索肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓的免疫微环境特征	肝细胞癌中的门静脉肿瘤血栓（PVTT）	数字病理学	肝癌	时间飞行质谱（CyTOF），单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光染色	NA	单细胞数据	使用了PVTT细胞系CSQT2和单核细胞系THP-1进行实验
364	2024-12-11	Identify critical genes of breast cancer and corresponding leading natural product compounds of potential therapeutic targets 2024-Dec-10, Molecular diversity IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11030-024-11035-z PMID:39656376	研究论文	本文通过多组学研究，识别乳腺癌的关键基因、治疗靶点和潜在的天然产物疗法	本文首次结合多组学数据，包括基因共表达网络分析、染色质免疫沉淀测序、单细胞RNA测序和空间转录组学，识别乳腺癌的关键基因和潜在治疗靶点，并筛选出针对squalene epoxidase的天然产物化合物	本文的局限性在于研究主要基于数据分析，尚未进行临床试验验证其发现的有效性	识别乳腺癌的关键基因和潜在治疗靶点，探索天然产物疗法	乳腺癌的关键基因、治疗靶点和天然产物化合物	数字病理学	乳腺癌	基因共表达网络分析（WGCNA）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST）	NA	基因表达数据	乳腺癌细胞系和患者样本
365	2024-12-11	Multi-Omics Biomarkers for Predicting Efficacy of Biologic and Small-Molecule Therapies in Adults With Inflammatory Bowel Disease: A Systematic Review 2024-Dec-10, United European gastroenterology journal IF:5.8Q1 DOI:10.1002/ueg2.12720 PMID:39656426	综述	本文系统回顾了用于预测炎症性肠病患者对生物制剂和小分子药物治疗反应的多组学生物标志物	本文整合了多种组学数据，强调了多组学模型在预测治疗反应中的影响，并评估了可能对多种治疗干预产生不同效果的特定生物标志物	NA	探讨用于预测炎症性肠病患者对生物制剂和小分子药物治疗反应的生物标志物	炎症性肠病患者的生物标志物	NA	炎症性肠病	多组学方法（包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、微生物组学和代谢组学）	多组学整合模型	多组学数据	NA
366	2024-12-11	Fusobacterium nucleatum promotes colorectal cancer through neogenesis of tumor stem cells 2024-Dec-10, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI181595 PMID:39656543	研究论文	本研究揭示了Fusobacterium nucleatum通过重新编程隐窝细胞并激活LY6A+复苏干细胞（RSCs），促进其转化为肿瘤干细胞，从而加速结直肠癌（CRC）的发生	首次揭示了Fusobacterium nucleatum通过LY6A-RPS14信号轴促进肿瘤干细胞的形成，并加速结直肠癌的进展	NA	探讨Fusobacterium nucleatum在结直肠癌中的作用机制	Fusobacterium nucleatum感染对肠道干细胞和肿瘤干细胞的影响	NA	结直肠癌	单细胞测序分析	NA	单细胞数据	人类CRC患者和鼠模型的肠道隐窝细胞
367	2024-12-11	Single-cell analysis reveals fibroblast heterogeneity and myofibroblast conversion in ligamentum flavum hypertrophy 2024-Dec-07, The spine journal : official journal of the North American Spine Society DOI:10.1016/j.spinee.2024.12.001 PMID:39653186	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了黄韧带肥大中的细胞组成和信号通路	首次揭示了黄韧带肥大中成纤维细胞的异质性及其向肌成纤维细胞的转化过程，并发现了新的信号通路如GAS和GRN	样本量较小，仅来自三名患者	研究黄韧带肥大中的细胞组成和信号通路	黄韧带组织	数字病理学	脊柱疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	三名接受腰椎减压手术的患者
368	2024-12-11	Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear-cell renal-cell carcinoma tumor microenvironment 2024-Dec-05, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-024-03435-z PMID:39639369	研究论文	本文通过空间转录组学研究了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤微环境中整合素和胶原蛋白IV的空间耦合，以更好地理解免疫治疗耐药性	本文首次使用细胞分辨率的空间转录组学技术，分析了免疫治疗前后ccRCC肿瘤微环境中的分子变化，并发现免疫治疗后肿瘤中胶原蛋白IV和整合素αV的表达显著增加	本文仅分析了21个肿瘤样本，样本量较小，且未探讨潜在的治疗策略	研究透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中免疫治疗耐药性的分子机制	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤及其微环境	数字病理学	肾癌	空间转录组学	NA	空间分子图像	21个ccRCC肿瘤样本
369	2024-12-11	Nonepithelial Gene Expression Correlates With Symptom Severity in Adults With Eosinophilic Esophagitis 2024-Dec, The journal of allergy and clinical immunology. In practice DOI:10.1016/j.jaip.2024.05.015 PMID:38768900	研究论文	本文研究了非上皮基因表达与嗜酸性食管炎（EoE）症状严重程度之间的相关性	首次揭示了非上皮细胞（如成纤维细胞）在EoE症状严重程度中的潜在作用	样本量有限，且仅限于成人患者	探讨EoE症状严重程度与食管基因表达之间的关系	嗜酸性食管炎患者的食管基因表达与症状严重程度	NA	消化系统疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	146名成人EoE患者
370	2024-12-11	Single-cell transcriptome analysis of the mouse lungs during the injury and recovery periods after lipopolysaccharide administration 2024-Dec, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2 DOI:10.1007/s00011-024-01951-z PMID:39377802	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析了小鼠肺部在脂多糖处理后损伤和恢复期的细胞和分子变化	首次通过单细胞RNA测序揭示了脂多糖诱导的急性肺损伤（ALI）期间细胞间相互作用及Dpp4在其中的关键作用	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	探讨急性肺损伤（ALI）期间细胞和分子变化，并寻找有效的治疗靶点	小鼠肺部在脂多糖处理后损伤和恢复期的细胞和分子变化	数字病理学	肺部疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	来自损伤（第3天）和恢复（第6天）小鼠的肺泡组织样本
371	2024-12-11	Doxorubicin resistance involves modulation of interferon signaling, transcriptional bursting, and gene co-expression patterns of U-ISGF3-related genes 2024-12, Neoplasia (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.neo.2024.101071 PMID:39405604	研究论文	研究了多柔比星（DOX）在人结肠癌细胞中诱导的转录组变化，揭示了与U-ISGF3相关基因的表达变化及其在化疗耐药中的潜在作用	首次揭示了U-ISGF3相关基因在多柔比星耐药中的作用，并发现HSH2D作为不良预后标志物在耐药细胞中的高表达	研究仅限于人结肠癌细胞，未探讨其他癌症类型中的适用性	探讨多柔比星诱导的化疗耐药机制及其潜在治疗靶点	人结肠癌细胞在亚毒性多柔比星处理后的转录组变化	数字病理学	结肠癌	单细胞RNA测序	数学模型	转录组数据	人结肠癌细胞
372	2024-12-11	Systematic analysis of human colorectal cancer scRNA-seq revealed limited pro-tumoral IL-17 production potential in gamma delta T cells 2024-12, Neoplasia (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.neo.2024.101072 PMID:39454432	研究论文	本研究重新分析了九个已发表的人类结直肠癌全组织单细胞RNA测序数据集，揭示了γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的潜力有限	首次系统分析了人类结直肠癌中单细胞RNA测序数据，发现γδ T细胞在肿瘤微环境中主要表现为细胞毒性效应细胞，而非IL-17产生细胞	研究仅基于已发表的数据集，未进行新的实验验证	探讨γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的作用	γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的功能	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	165名结直肠癌患者的肿瘤和邻近正常组织中的951,785个细胞，其中18,483个为γδ T细胞
373	2024-12-11	Neutrophils with low production of reactive oxygen species are activated during immune priming and promote development of arthritis 2024-Dec, Redox biology IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.redox.2024.103401 PMID:39471640	研究论文	本研究通过单细胞测序技术分析了骨髓来源的中性粒细胞在II型胶原诱导的关节炎模型中的表型特征，揭示了ROS在免疫启动中的保护作用及其对关节炎发展的影响	首次系统性地揭示了ROS调控下中性粒细胞的功能和炎症表型特征，并发现了Ncf1缺陷中性粒细胞的代谢重编程与关节炎发展的关联	研究主要基于小鼠模型，结果的外推性和临床应用尚需进一步验证	探讨中性粒细胞在类风湿性关节炎发展中的作用及其分子机制	骨髓来源的中性粒细胞在II型胶原诱导的关节炎模型中的表型特征	免疫学	类风湿性关节炎	单细胞测序技术	NA	基因表达数据	包括免疫启动和加强的小鼠模型中的中性粒细胞样本
374	2024-12-11	Single-cell transcriptome unveils unique transcriptomic signatures of human organ-specific endothelial cells 2024-Dec, Basic research in cardiology IF:7.5Q1 DOI:10.1007/s00395-024-01087-5 PMID:39508863	研究论文	本文构建了一个包含超过210,000个来自24种人类组织38个区域的血管内皮细胞的单细胞转录组图谱，揭示了不同组织中血管内皮细胞的转录组、表型、代谢和转录调控的显著差异	首次系统性地揭示了人类器官特异性血管内皮细胞的独特转录组特征，并展示了这些细胞在不同组织和血管床中的疾病关联性	研究主要集中在转录组层面，未涉及功能性实验验证	揭示人类不同组织中血管内皮细胞的异质性及其与特定疾病的关联	来自24种人类组织38个区域的血管内皮细胞	数字病理学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	超过210,000个血管内皮细胞样本
375	2024-12-11	Elucidating tobacco smoke-induced craniofacial deformities: Biomarker and MAPK signaling dysregulation unraveled by cross-species multi-omics analysis 2024-Dec, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.117343 PMID:39549573	研究论文	本研究使用斑马鱼幼体模型，通过多组学分析揭示了烟草烟雾引起的颅面畸形与MAPK信号通路失调之间的关系	首次通过跨物种多组学分析揭示了烟草烟雾引起的颅面畸形相关的新型生物标志物和MAPK信号通路的失调	研究主要基于斑马鱼模型和人类胚胎腭间充质细胞，可能需要进一步的人体临床研究验证	揭示烟草烟雾引起的颅面畸形的发生机制，并寻找相关的生物标志物和信号通路	斑马鱼幼体和人类胚胎腭间充质细胞	NA	NA	多组学分析（mRNA-miRNA分析、单细胞转录组学、定量实时PCR）	NA	基因、蛋白质、代谢物	斑马鱼幼体和人类胚胎腭间充质细胞
376	2024-12-10	[Research progress of single-cell RNA sequencing in ophthalmology] 2024-Dec-11, [Zhonghua yan ke za zhi] Chinese journal of ophthalmology DOI:10.3760/cma.j.cn112142-20240112-00024 PMID:39648033	综述	本文综述了单细胞RNA测序技术在眼科领域的最新进展	单细胞RNA测序技术提供了研究细胞间基因表达和功能特征差异的强大工具	本文未提及具体的局限性	提供关于眼科疾病发病机制的新见解，并改进诊断和治疗策略	眼科疾病的发病机制和诊断治疗策略	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
377	2024-12-10	DRIM modulates Src activation and regulates angiogenic functions in vascular endothelial cells 2024-Dec-08, Cell biology international IF:3.3Q3 DOI:10.1002/cbin.12265 PMID:39648301	研究论文	研究探讨了DRIM蛋白在血管内皮细胞中的表达及其对Src激活和血管生成功能的影响	首次揭示了DRIM在血管内皮细胞中的双重定位及其对Src激活的关键作用	研究主要集中在体外细胞实验，缺乏体内实验验证	探讨DRIM在血管内皮细胞中的功能及其对Src激活的影响	DRIM蛋白在血管内皮细胞中的表达及其对Src激活和血管生成功能的影响	NA	NA	蛋白质组学分析	NA	蛋白质	人类血管内皮细胞
378	2024-12-10	CRISPR-Cas9 screening identifies the role of FER as a tumor suppressor 2024-Dec-08, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6374 PMID:39648412	研究论文	本研究使用CRISPR-Cas9筛选技术，识别出FER作为肿瘤抑制基因在肿瘤发生和发展中的重要作用	首次通过体内全基因组CRISPR-Cas9筛选技术识别出FER作为肿瘤抑制基因，并揭示了其在肿瘤发生和发展中的关键作用	研究主要集中在体内实验，缺乏体外实验验证；样本量较小，可能影响结果的普适性	系统识别肿瘤抑制基因，以增进对肿瘤发生机制的理解，并开发早期诊断和疾病进展缓解策略	FER基因在肿瘤发生和发展中的作用	NA	NA	CRISPR-Cas9筛选技术，单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
379	2024-12-10	Prenatal exposure on nanoplastics: A study of spatial transcriptomics in hippocampal offspring 2024-Dec-05, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) DOI:10.1016/j.envpol.2024.125480 PMID:39644950	研究论文	研究了母体暴露于纳米塑料对后代海马体区域空间转录组的影响	首次使用空间转录组学技术研究母体暴露于纳米塑料对后代海马体区域的影响，揭示了纳米塑料干预后细胞类型和基因表达的变化	研究仅限于大鼠模型，结果的普适性有待进一步验证	探讨母体暴露于纳米塑料对后代大脑发育的影响及其机制	大鼠后代的海马体区域	数字病理学	NA	空间转录组学	NA	转录组数据	大鼠后代海马体区域样本
380	2024-12-10	Harnessing machine learning and multi-omics to explore tumor evolutionary characteristics and the role of AMOTL1 in prostate cancer 2024-Dec-04, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138402 PMID:39643184	研究论文	本研究利用单细胞测序和批量RNA测序，结合机器学习和多组学分析，开发并验证了肿瘤进化特征预测指标（TECPI），以探索前列腺癌中的肿瘤进化特性和AMOTL1的作用	本研究开发了TECPI，该指标在预测前列腺癌进展和指导治疗方面优于传统临床预测指标和其他已发表模型，并展示了其在泛癌中的通用性和适用性	NA	探索前列腺癌中的肿瘤进化特性和AMOTL1的作用，并开发新的预测指标以指导个性化精准治疗	前列腺癌的肿瘤细胞进化特征和AMOTL1在药物动力学中的作用	机器学习	前列腺癌	单细胞测序、批量RNA测序	机器学习模型	基因组数据	NA