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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-07 |
Gene regulatory network inference based on novel ensemble method
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae036
PMID:39324652
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研究论文 | 提出一种基于13种基础分类方法和灵活神经树的集成方法用于提高基因调控网络识别准确率 | 开发了基于基因编程变体和粒子群优化的混合进化算法来搜索最优灵活神经树模型 | NA | 提高基因调控网络识别准确率 | 基因调控网络 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 集成学习,灵活神经树,粒子群优化 | 基因表达数据 | 三个模拟数据集和三个真实单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 362 | 2025-10-07 |
Evolutionary diversity of CXCL16-CXCR6: Convergent substitutions and recurrent gene loss in sauropsids
2024-12, Immunogenetics
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s00251-024-01357-5
PMID:39400711
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研究论文 | 本研究通过比较约400个脊椎动物CXCR6直系同源基因,揭示了CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性和基因丢失现象 | 首次在脊椎动物广泛尺度上揭示CXCR6的DRF基序非普遍性,发现鸟类中反复发生的CXCR6基因丢失现象 | 研究主要基于基因序列分析,功能验证实验相对有限 | 探究CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化历程和多样性 | 约400个脊椎动物的CXCR6直系同源基因 | 进化生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因序列比对 | NA | 基因序列数据,单细胞RNA测序数据 | 涵盖36个鸟类目和多种脊椎动物的约400个CXCR6直系同源基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 363 | 2025-10-07 |
Initial regional cytoarchitectonic differences in dorsal and orbitobasal human developing frontal cortex revealed by spatial transcriptomics
2024-Dec-18, Brain structure & function
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00429-024-02865-6
PMID:39692769
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研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示人类胚胎发育期前额叶皮层背侧和眶基底区域早期细胞构筑差异 | 首次在转录组水平发现人类胚胎前额叶皮层背侧和眶基底区域瞬时细胞区室的基因表达差异,证实前额叶皮层区域特化在胎儿发育早期即已出现 | 研究仅聚焦于15孕周这一特定发育时期,样本量有限 | 探究人类胚胎前额叶皮层背侧和眶基底区域细胞构筑特征的转录组基础 | 人类胚胎发育期前额叶皮层组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 15孕周人类胚胎前额叶皮层样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler空间转录组分析平台 |
| 364 | 2025-10-07 |
Mesenchymal Traits as an Intrinsic Feature of Undifferentiated Cells
2024-Dec-24, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb13010001
PMID:39846630
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研究论文 | 本研究通过分析公开单细胞转录组数据集,探讨间充质表型与未分化细胞状态的内在联系 | 挑战传统观点,提出间充质表型不仅是结构支持特征,更是未分化多能状态的形态学表达 | 基于公开数据集的分析,缺乏实验验证 | 探索间充质表型在胚胎发育和成体器官中与细胞未分化状态的关系 | 早期胚胎阶段和成体组织的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 公开单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2025-10-07 |
Construction of a neutrophil extracellular trap formation-related gene model for predicting the survival of lung adenocarcinoma patients and their response to immunotherapy
2024-Dec-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-463
PMID:39830760
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研究论文 | 基于中性粒细胞胞外诱捕网形成相关基因构建肺腺癌患者生存预测和免疫治疗反应评估模型 | 首次利用中性粒细胞胞外诱捕网形成相关基因构建肺腺癌预后特征模型,并验证其在预测免疫治疗反应方面的价值 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 构建肺腺癌预后预测模型并评估免疫治疗反应 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,生物信息学分析 | LASSO Cox回归模型,风险评分模型 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2024-12-11 |
Improved tool for scRNA-seq analysis
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02040-x
PMID:39653731
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2025-10-07 |
Pancreatic Neuroendocrine Tumor: The Case Report of a Patient with Germline FANCD2 Mutation and Tumor Analysis Using Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-14, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13247621
PMID:39768544
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病例报告 | 报告一例携带胚系FANCD2突变的小胰腺神经内分泌肿瘤患者,并利用单细胞RNA测序进行肿瘤分析 | 首次将胚系FANCD2突变与胰腺神经内分泌肿瘤关联,并应用单细胞RNA测序技术分析肿瘤异质性 | NA | 探讨小胰腺神经内分泌肿瘤的分子特征和潜在预后标志物 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 368 | 2025-10-07 |
Harnessing Single-Cell and Spatial Transcriptomics for Crop Improvement
2024-Dec-11, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13243476
PMID:39771174
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组技术在作物改良中的应用进展 | 整合单细胞与空间转录组技术,揭示作物组织中细胞异质性和基因表达空间定位对作物改良的意义 | NA | 探讨单细胞和空间转录组技术在作物改良中的应用前景 | 作物生物学研究 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 369 | 2025-10-07 |
Circulating Adenoid Cystic Carcinoma associated MYB transcripts enable rapid and sensitive detection of metastatic disease in blood liquid biopsies
2024-Dec, The journal of liquid biopsy
DOI:10.1016/j.jlb.2024.100276
PMID:39801676
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研究论文 | 开发了一种基于MYB转录本的qPCR检测方法,用于通过血液液体活检检测腺样囊性癌转移 | 首次利用循环肿瘤细胞中MYB转录本表达作为生物标志物,开发了敏感且经济有效的转移性ACC检测方法 | 样本量较小(总样本49例),需要更大规模研究验证 | 开发通过血液液体活检检测腺样囊性癌转移的敏感诊断方法 | 腺样囊性癌患者血液样本 | 分子诊断 | 腺样囊性癌 | 定量聚合酶链反应(qPCR), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 49例患者(23例无ACC史,15例无疾病证据,6例局部ACC,5例转移性ACC) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 370 | 2025-10-07 |
Mechanistic insights into sevoflurane-induced hippocampal neuronal damage and cognitive dysfunction through the NEAT1/Nrf2 signaling axis in aged rats
2024-12-21, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09964-4
PMID:39707048
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了七氟醚通过NEAT1/Nrf2信号轴诱导老年大鼠海马神经元损伤和认知功能障碍的分子机制 | 首次发现lncRNA NEAT1通过抑制Nrf2/ARE/HO-1通路在七氟醚诱导的神经元损伤中发挥关键作用 | 研究仅针对老年大鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 阐明七氟醚麻醉导致老年患者神经损伤和认知功能障碍的分子机制 | 老年大鼠海马神经元 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,转录组分析,TUNEL染色,H&E染色,免疫组化,免疫荧光,流式细胞术 | 大鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 老年大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 371 | 2025-10-07 |
Durable complete response after combined treatment with tumor-infiltrating lymphocytes and oncolytic adenovirus (TILT-123) in a patient with metastatic mucosal melanoma
2024-Dec, Immuno-oncology technology
DOI:10.1016/j.iotech.2024.100726
PMID:39801682
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病例报告 | 报道一例转移性黏膜黑色素瘤患者通过肿瘤浸润淋巴细胞与溶瘤腺病毒联合治疗获得持久完全缓解的病例 | 首次展示TILT-123溶瘤病毒与肿瘤浸润淋巴细胞联合治疗在不使用预处理化疗或后处理白介素-2的情况下实现完全缓解 | 单病例报告,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探索联合免疫疗法在转移性黏膜黑色素瘤治疗中的效果 | 48岁女性转移性鼻窦黏膜黑色素瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞测序,免疫组织化学分析 | NA | 临床数据,单细胞测序数据,免疫组织化学数据 | 1例患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 372 | 2025-10-07 |
Lactylation-driven TNFR2 expression in regulatory T cells promotes the progression of malignant pleural effusion
2024-Dec-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010040
PMID:39721754
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控调节性T细胞中TNFR2表达的机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 首次发现乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控NF-κB p65转录因子,进而上调TNFR2表达的新表观遗传机制 | NA | 探索调节性T细胞中TNFR2表达的调控机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 人类和小鼠的恶性胸腔积液样本及调节性T细胞 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Sheds Light on Tumor Evolution: Perspectives from City of Hope's Clinical Trial Teams
2024-Dec-10, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13247507
PMID:39768430
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学在临床肿瘤研究中的应用及其对理解肿瘤演化的意义 | 提出了整合单细胞RNA测序到临床实验设计的实践经验,并强调了计算团队与临床团队协作的'团队医学'方法 | 实施单细胞方法面临高质量细胞获取、技术变异性和复杂计算分析等挑战 | 理解肿瘤异质性对肿瘤演化和治疗反应的影响,以开发更有效的治疗方法 | 乳腺癌、脑癌和卵巢癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 多种癌症(乳腺癌、脑癌、卵巢癌) | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2025-01-07 |
Prognostic model based on M2 macrophage-related signatures for predicting outcomes, enhancing risk stratification, and providing therapeutic insights in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Dec-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e41007
PMID:39759325
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研究论文 | 本研究提出了一种基于M2巨噬细胞相关基因的预测模型,用于对新诊断的弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者进行风险分层、预后预测和免疫特征评估 | 利用M2巨噬细胞相关基因构建预测模型,提供新的治疗选择和风险分层方法 | 研究依赖于公开数据库的数据,可能受到数据质量和样本量的限制 | 开发一种预测模型,用于DLBCL患者的风险分层和预后预测 | 新诊断的DLBCL患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的DLBCL患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2025-01-05 |
Spatial transcriptomics reveals unique metabolic profile and key oncogenic regulators of cervical squamous cell carcinoma
2024-Dec-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06011-y
PMID:39741285
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了宫颈鳞状细胞癌(CSCC)肿瘤微环境和代谢特征,揭示了不同肿瘤区域的代谢分布及其与肿瘤分化程度的关系 | 首次结合空间转录组学(ST)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,详细描绘了CSCC肿瘤边缘和核心区域的空间代谢分布,并发现了APP和TRPS1在肿瘤进展中的关键作用 | 研究样本量有限,且主要基于FFPE样本,可能影响结果的普适性 | 深入理解CSCC的肿瘤微环境和代谢特征,探索肿瘤进展的潜在机制 | 宫颈鳞状细胞癌(CSCC)患者的FFPE肿瘤样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 空间转录组学(ST)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | CSCC患者的FFPE肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2025-01-05 |
Targeting AURKA with multifunctional nanoparticles in CRPC therapy
2024-Dec-30, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-03070-7
PMID:39734237
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研究论文 | 本研究探讨了ART-T细胞膜包裹的AMS@AD纳米颗粒在光热-化疗-免疫联合治疗中对去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的疗效 | 首次将光热、化疗和免疫治疗结合,使用T细胞膜仿生纳米颗粒靶向AURKA,为CRPC提供了一种新的三重联合治疗方法 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未进行临床试验,实际疗效和安全性仍需进一步验证 | 评估CM-AMS@AD纳米颗粒在CRPC治疗中的疗效和潜在临床应用 | 去势抵抗性前列腺癌(CRPC) | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、动态光散射、透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | TCGA-PRAD数据集和GEO数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2025-01-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies the expression of hemoglobin in chondrocyte cell subpopulations in osteoarthritis
2024-Dec-30, BMC molecular and cell biology
IF:2.4Q4
DOI:10.1186/s12860-024-00519-3
PMID:39736555
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了骨关节炎中软骨细胞亚群中血红蛋白的表达特征及其相关通路 | 首次在软骨细胞中发现血红蛋白的表达,并揭示了其在骨关节炎进展中的潜在机制 | 研究依赖于公共数据库中的数据,未进行实验验证 | 探讨骨关节炎中软骨细胞亚群中血红蛋白的表达特征及其相关通路 | 正常人和骨关节炎患者的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库下载的正常人和骨关节炎患者的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2025-01-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal SPP1-CD44 signaling drives primary resistance to immune checkpoint inhibitors in RCC
2024-Dec-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06018-5
PMID:39736762
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了SPP1-CD44信号在肾细胞癌中对免疫检查点抑制剂原发性耐药的作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床样本分析,揭示了SPP1-CD44信号在肾细胞癌中对免疫检查点抑制剂原发性耐药的具体机制 | 研究主要基于实验室数据,尚未进行大规模临床试验验证 | 揭示肾细胞癌中对免疫检查点抑制剂原发性耐药的肿瘤-免疫相互作用和信号通路 | 肾细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因集富集分析(GSEA) | 细胞-细胞通信网络, 伪时间轨迹 | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2025-01-05 |
Microdissection and Single-Cell Suspension of Neocortical Layers From Ferret Brain for Single-Cell Assays
2024-Dec-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5133
PMID:39735300
|
研究论文 | 本文描述了一种从活体脑切片中微解剖发育中的大脑皮层各层,并通过酶解和机械解离生成单细胞悬液的方法,适用于高通量单细胞分析 | 该方法提高了大脑皮层遗传分析的分辨率,并促进了比小鼠更能模拟人类皮层发育的实验室动物模型(如雪貂)的研究 | NA | 研究大脑皮层发育过程中的遗传复杂性 | 雪貂大脑的发育中的大脑皮层 | 生物医学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, TrackerSeq | NA | 单细胞数据 | 胚胎期和早期出生后的雪貂大脑皮层 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2025-01-05 |
S100A8 promotes tumor progression by inducing phenotypic polarization of microglia through the TLR4/IL-10 signaling pathway in glioma
2024-Dec, Journal of the National Cancer Center
IF:7.6Q1
DOI:10.1016/j.jncc.2024.07.001
PMID:39735438
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研究论文 | 本研究探讨了S100A8在胶质瘤进展中的表达模式及其功能作用,揭示了其通过TLR4/IL-10信号通路诱导小胶质细胞表型极化促进肿瘤进展的机制 | 首次揭示了S100A8通过TLR4/IL-10信号通路诱导小胶质细胞M2极化,从而促进胶质瘤进展的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本量相对有限,需要进一步的大规模临床研究验证 | 全面评估S100A8在胶质瘤进展中的表达模式及功能作用 | 胶质瘤组织及细胞系 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 免疫组化(IHC)、Transwell实验、伤口愈合实验、CCK8实验、单细胞测序、共免疫沉淀(Co-IP) | NA | 组织样本、细胞系、公共数据库数据 | 98例胶质瘤患者组织样本 | NA | NA | NA | NA |