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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-01-05 |
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.091631
PMID:39751616
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研究论文 | 本研究通过详细的组织学和生化分析,探讨了无症状阿尔茨海默病(AsymAD)与阿尔茨海默病(AD)在Aβ斑块微环境中的基因表达差异,揭示了AsymAD大脑中微胶质细胞的高效肌动蛋白基础细胞运动机制及其对Aβ毒性的保护作用 | 首次使用GeoMx全空间转录组图谱比较AsymAD与AD病例中Aβ斑块微环境的基因表达,揭示了AsymAD大脑中微胶质细胞的高效肌动蛋白基础细胞运动机制 | 研究样本量较小(AsymAD N=17, AD N=19, 对照组 N=13),且主要依赖于死后脑组织分析,可能无法完全反映活体情况 | 探讨AsymAD病例中对AD病理和认知衰退的抵抗机制 | 无症状阿尔茨海默病(AsymAD)和阿尔茨海默病(AD)患者的死后脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | GeoMx全空间转录组图谱,组织学和生化分析 | NA | 脑组织样本 | AsymAD N=17, AD N=19, 对照组 N=13 | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2025-01-05 |
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.090388
PMID:39751624
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研究论文 | 本文研究了雌激素通过微胶质细胞中的ERα信号通路抑制促炎信号通路的机制,并探讨了雌激素耗竭对微胶质细胞异质性的影响 | 首次通过单细胞转录组测序技术揭示了雌激素耗竭对海马微胶质细胞表型状态的影响,并提出了雌激素-ERα信号通路在微胶质细胞激活中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中进行验证 | 探讨雌激素耗竭对微胶质细胞异质性的影响及其在神经炎症中的作用 | 小鼠海马微胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2025-01-05 |
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.086555
PMID:39751771
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研究论文 | 本文通过空间转录组学方法,研究了阿尔茨海默病中抑制性中间神经元的转录组变化 | 首次在时间和空间上绘制了阿尔茨海默病早期和晚期中间神经元的转录组图谱,揭示了不同脑区和神经元亚型的独特转录变化 | 研究仅使用了雄性小鼠模型,未考虑性别差异的影响 | 探究阿尔茨海默病中抑制性中间神经元功能障碍的病理机制 | 5XFAD雄性小鼠的中间神经元(PV+和SST+) | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学(GeoMx DSP)、荧光原位杂交(FISH) | 线性混合效应模型 | 转录组数据 | 早期(12周)和晚期(30周)5XFAD雄性小鼠各2只,每时间点2张重复切片 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2025-01-05 |
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.086517
PMID:39751794
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研究论文 | 本研究使用数字空间分析技术(DSP)比较了阿尔茨海默病伴精神病(AD+P)和不伴精神病(AD-P)患者的淀粉样蛋白β和非淀粉样蛋白β区域的转录组数据 | 首次应用NanoString GeoMx™ DSP平台进行空间转录组学分析,揭示了AD+P患者中与淀粉样蛋白斑块相关的差异表达基因 | 样本量较小,且冷冻样本质量不佳,仅分析了FFPE切片,可能影响结果的普适性 | 探索阿尔茨海默病伴精神病的分子机制,寻找新的药物治疗靶点 | 阿尔茨海默病伴精神病(AD+P)和不伴精神病(AD-P)患者的脑组织样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 数字空间分析(DSP) | NA | RNA | 6个死后脑样本,来自前额叶皮层 | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2025-01-05 |
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.087498
PMID:39751802
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学(ST)和免疫组织化学技术,探索了阿尔茨海默病(AD)中神经斑块微环境中的分子机制 | 首次结合空间转录组学和免疫组织化学技术,揭示了AD中神经斑块微环境中胶质细胞的异质性,并识别了182个与斑块相关的基因 | 研究样本量较小,仅包括15例AD患者和2例对照,且空间转录组学技术的分辨率有限 | 探索阿尔茨海默病中神经斑块微环境的分子机制 | 阿尔茨海默病患者的前额叶皮层组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学(ST)、免疫组织化学、原位杂交 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 15例AD患者和2例对照的前额叶皮层组织,共32个切片 | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2025-01-05 |
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.085234
PMID:39751805
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究阿尔茨海默病(AD)中的细胞特异性脆弱性与病理学之间的关系,特别是在中颞回(MTG)区域 | 首次在中颞回(MTG)区域结合单细胞RNA测序和细胞质蛋白保留技术,揭示了pTau积累与细胞类型特异性脆弱性之间的分子变化关系 | 研究样本量较小(9名捐赠者),且仅针对特定病理阶段(Braak IV-VI期)的AD患者 | 研究阿尔茨海默病早期发病机制中细胞脆弱性与病理学之间的关系 | 阿尔茨海默病患者的中颞回(MTG)脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9名捐赠者的125,505个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2025-01-04 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in the immune microenvironment of spinal cord injury]
2024-Dec, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:39750053
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在脊髓损伤免疫微环境中的研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示脊髓损伤后局部免疫微环境中的细胞异质性和复杂的细胞间相互作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在脊髓损伤免疫微环境中的应用,以更全面地理解脊髓损伤的病理生理过程 | 脊髓损伤后的局部免疫微环境 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2025-01-03 |
Intervention of Tanshinone IIA on the PGK1-PDHK1 Pathway to Reprogram Macrophage Phenotype After Myocardial Infarction
2024-Dec, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07520-6
PMID:37991600
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研究论文 | 本研究探讨了丹参酮IIA通过调节巨噬细胞的能量代谢和表型变化来改善心肌梗死的机制 | 首次提出丹参酮IIA通过PGK1-PDHK1信号通路调节巨噬细胞能量代谢和表型变化的机制 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体中进行验证 | 探讨丹参酮IIA在心肌梗死治疗中的药理作用及其机制 | 心肌梗死模型中的巨噬细胞 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | RT-PCR, ELISA, 免疫荧光, JC-1, 钙离子浓度检测, 活性氧检测, 线粒体电子显微镜分析, 单细胞转录组数据挖掘, 细胞转录组测序, 分子对接技术 | 心肌梗死模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞表型数据 | 心肌梗死模型中的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2025-01-02 |
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627006
PMID:39713439
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的a-b幂交互模型,用于处理包含协变量信息的稀疏组合计数数据,并结合差异丰度测试方法cosmoDA,以减少相关特征导致的假阳性检测 | 扩展了a-b幂交互模型以包含协变量信息,并提出了新的差异丰度测试方法cosmoDA,显著降低了相关特征的假发现率 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种能够准确表征异质群体中协变量依赖关系的模型,并减少差异丰度测试中的假阳性检测 | 稀疏组合计数数据,特别是单细胞RNA测序和扩增子测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,扩增子测序 | a-b幂交互模型 | 计数数据 | 模拟数据和真实数据 | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2025-01-02 |
Neutrophils drive sexual dimorphism in experimental periodontitis
2024-Dec-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625678
PMID:39677749
|
研究论文 | 本研究旨在通过阐明性别特异性的牙周病进展机制,改善牙周病的治疗 | 揭示了中性粒细胞在牙周病性别二态性中的机制作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证有限 | 改善牙周病的治疗 | C57BL/6j小鼠和人类牙周病患者 | NA | 牙周病 | 流式细胞术、单细胞测序 | NA | 实验数据、临床数据 | ≥5只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2025-01-01 |
Interpretable machine learning-driven biomarker identification and validation for Alzheimer's disease
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80401-6
PMID:39730451
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研究论文 | 本研究结合生物信息学方法和可解释的机器学习,识别并验证了阿尔茨海默病的可靠生物标志物 | 引入了交互式SHAP面板用于精确决策,并通过可解释的机器学习诊断模型提供了新的生物标志物识别见解,特别是MYH9作为潜在的新生物标志物 | RHOQ在AD细胞模型和人脑组织样本中的mRNA表达模式相反,其作用仍需进一步探索 | 提高阿尔茨海默病的早期检测和诊断准确性,改善干预效果 | 阿尔茨海默病 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、单细胞转录组分析 | 机器学习算法、SHAP | 基因表达数据 | GEO数据库中的AD数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2025-01-01 |
Prognostic model based on tumor stemness genes for triple-negative breast cancer
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81503-x
PMID:39730613
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据,从肿瘤干细胞性的角度分析三阴性乳腺癌,并开发了一个基于7个肿瘤干细胞相关基因的预后模型 | 首次从肿瘤干细胞性的角度对三阴性乳腺癌进行分析,并开发了一个基于特定亚型标记基因的预后模型 | 研究结果需要进一步在更大规模的临床样本中进行验证 | 开发一个基于肿瘤干细胞相关基因的三阴性乳腺癌预后模型 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | 预后模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2025-01-01 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood links cell-type-specific regulation of splicing to autoimmune and inflammatory diseases
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02019-8
PMID:39627432
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了外周血中细胞类型特异性剪接调控与自身免疫和炎症疾病的关系 | 首次在亚洲免疫多样性图谱中,揭示了细胞类型特异性、性别偏向性和祖先偏向性的剪接差异,并发现了与自身免疫和炎症疾病遗传性相关的cis-sQTL效应 | 研究样本主要来自健康捐赠者,未涉及疾病患者,可能限制了结果的广泛适用性 | 探讨剪接调控在复杂疾病中的作用,特别是在不同遗传背景下的细胞类型特异性差异 | 474名健康捐赠者的约100万个外周血单核细胞 | 生物信息学 | 自身免疫和炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 474名健康捐赠者的约100万个外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-12-31 |
Tumor-derived CCL15 regulates RNA m6A methylation in cancer-associated fibroblasts to promote hepatocellular carcinoma growth
2024-Dec-27, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217420
PMID:39734010
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研究论文 | 本文揭示了CCL15在肝细胞癌(HCC)进展中的关键作用,通过调节癌症相关成纤维细胞(CAFs)中的RNA m6A甲基化促进HCC生长 | 首次发现CCL15通过STAT3通路诱导CAFs中FTO的表达,进而调控CEBPA mRNA的m6A甲基化,揭示了CCL15在HCC细胞与CAFs之间的新型调控轴 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在临床患者中进行验证 | 探讨CCL15在HCC生长中的具体作用和机制 | 肝细胞癌(HCC)细胞和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、共培养实验、类器官模型、异种移植模型、m6A测序、RNA测序 | NA | RNA测序数据、免疫荧光图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-12-31 |
Targeting UBE2T suppresses breast cancer stemness through CBX6-mediated transcriptional repression of SOX2 and NANOG
2024-Dec-21, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217409
PMID:39716485
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研究论文 | 本文揭示了UBE2T通过CBX6介导的转录抑制调控乳腺癌干细胞(BCSC)干性的机制,并提出了潜在的治疗策略 | 首次发现UBE2T通过TRIM25介导的CBX6泛素化降解调控SOX2和NANOG的转录,从而影响BCSC干性 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 研究UBE2T在乳腺癌干细胞干性调控中的作用及其潜在治疗策略 | 乳腺癌干细胞(BCSCs) | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),干性指数分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-12-31 |
Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution
2024-Dec, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339
PMID:39393164
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在非模式生物污染暴露研究中的应用 | 强调了单细胞RNA测序技术在揭示非模式生物对环境污染反应的分子机制中的潜力 | 主要基于已发表文献的分析,缺乏新的实验数据 | 探讨单细胞RNA测序技术在非模式生物污染暴露研究中的应用 | 非模式生物 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-12-30 |
scRNA + BCR-seq identifies proportions and characteristics of dual BCR B cells in the peritoneal cavity of mice and peripheral blood of healthy human donors across different ages
2024-Dec-28, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00493-6
PMID:39732722
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研究论文 | 本研究利用scRNA-seq和scBCR-seq技术,探讨了小鼠腹膜和健康志愿者外周血中双受体B细胞的存在及其与年龄的关系 | 首次揭示了老年小鼠和健康志愿者中双受体B细胞的比例和特性,并发现这些细胞在老年个体中显著增加 | 研究样本主要来自小鼠和健康志愿者,未涉及疾病状态下的双受体B细胞 | 探讨双受体B细胞在不同年龄个体中的存在及其特性 | 小鼠腹膜和健康志愿者外周血中的B细胞 | 免疫学 | NA | scRNA-seq, scBCR-seq | NA | 单细胞RNA测序数据, B细胞受体测序数据 | 小鼠和不同年龄的健康志愿者 | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-12-30 |
TIM3 on natural killer cells regulates antibody-dependent cellular cytotoxicity in HER2-positive gastric cancer
2024-Dec-24, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217412
PMID:39722406
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研究论文 | 本研究探讨了TIM3在自然杀伤细胞(NK细胞)上对HER2阳性胃癌(GC)中抗体依赖性细胞毒性(ADCC)的调节作用 | 首次揭示了TIM3在NK细胞中的表达与CD16的相关性,并提出了抗TIM3抗体与曲妥珠单抗联合治疗HER2阳性胃癌的新策略 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证其效果 | 研究HER2阳性胃癌中NK细胞的免疫检查点分子与曲妥珠单抗诱导的ADCC之间的关系 | HER2阳性胃癌患者和HER2转染的胃癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和免疫组织化学 | 小鼠HER2阳性胃癌模型 | 基因表达数据和免疫组化数据 | HER2阳性胃癌患者和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-12-30 |
Single-cell transcriptome profiling identifies the activation of type I interferon signaling in ossified posterior longitudinal ligament
2024-Dec, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1075-5
PMID:39441507
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了I型干扰素信号在OPLL患者骨化韧带中的激活,并探讨了其在骨化过程中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了I型干扰素信号在OPLL骨化过程中的激活,并验证了其在体外促进成骨分化的作用 | 研究主要基于体外实验,尚未在体内模型中验证I型干扰素信号阻断对OPLL的预防效果 | 探讨OPLL的分子机制及潜在预防干预措施 | OPLL患者的骨化韧带 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | OPLL患者的骨化韧带样本 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-12-30 |
Immunological face of megakaryocytes
2024-Dec, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1087-1
PMID:39542989
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综述 | 本文综述了巨核细胞(MKs)在免疫系统中的新兴角色及其在生理和病理环境中的功能 | 揭示了巨核细胞作为独特免疫细胞的多样化能力,并发现了具有免疫调节功能的‘免疫巨核细胞’亚群 | 需要进一步研究确定巨核细胞的免疫功能是由整个巨核细胞群体还是特定亚群执行 | 探讨巨核细胞在免疫系统中的功能及其在生理和病理环境中的作用 | 巨核细胞及其免疫功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |