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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-01-05 |
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.087498
PMID:39751802
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学(ST)和免疫组织化学技术,探索了阿尔茨海默病(AD)中神经斑块微环境中的分子机制 | 首次结合空间转录组学和免疫组织化学技术,揭示了AD中神经斑块微环境中胶质细胞的异质性,并识别了182个与斑块相关的基因 | 研究样本量较小,仅包括15例AD患者和2例对照,且空间转录组学技术的分辨率有限 | 探索阿尔茨海默病中神经斑块微环境的分子机制 | 阿尔茨海默病患者的前额叶皮层组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学(ST)、免疫组织化学、原位杂交 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 15例AD患者和2例对照的前额叶皮层组织,共32个切片 | NA | NA | NA | NA |
| 322 | 2025-01-05 |
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.085234
PMID:39751805
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究阿尔茨海默病(AD)中的细胞特异性脆弱性与病理学之间的关系,特别是在中颞回(MTG)区域 | 首次在中颞回(MTG)区域结合单细胞RNA测序和细胞质蛋白保留技术,揭示了pTau积累与细胞类型特异性脆弱性之间的分子变化关系 | 研究样本量较小(9名捐赠者),且仅针对特定病理阶段(Braak IV-VI期)的AD患者 | 研究阿尔茨海默病早期发病机制中细胞脆弱性与病理学之间的关系 | 阿尔茨海默病患者的中颞回(MTG)脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9名捐赠者的125,505个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2025-01-04 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in the immune microenvironment of spinal cord injury]
2024-Dec, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:39750053
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在脊髓损伤免疫微环境中的研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示脊髓损伤后局部免疫微环境中的细胞异质性和复杂的细胞间相互作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在脊髓损伤免疫微环境中的应用,以更全面地理解脊髓损伤的病理生理过程 | 脊髓损伤后的局部免疫微环境 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2025-01-03 |
Intervention of Tanshinone IIA on the PGK1-PDHK1 Pathway to Reprogram Macrophage Phenotype After Myocardial Infarction
2024-Dec, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07520-6
PMID:37991600
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研究论文 | 本研究探讨了丹参酮IIA通过调节巨噬细胞的能量代谢和表型变化来改善心肌梗死的机制 | 首次提出丹参酮IIA通过PGK1-PDHK1信号通路调节巨噬细胞能量代谢和表型变化的机制 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体中进行验证 | 探讨丹参酮IIA在心肌梗死治疗中的药理作用及其机制 | 心肌梗死模型中的巨噬细胞 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | RT-PCR, ELISA, 免疫荧光, JC-1, 钙离子浓度检测, 活性氧检测, 线粒体电子显微镜分析, 单细胞转录组数据挖掘, 细胞转录组测序, 分子对接技术 | 心肌梗死模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞表型数据 | 心肌梗死模型中的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 325 | 2025-01-02 |
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627006
PMID:39713439
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的a-b幂交互模型,用于处理包含协变量信息的稀疏组合计数数据,并结合差异丰度测试方法cosmoDA,以减少相关特征导致的假阳性检测 | 扩展了a-b幂交互模型以包含协变量信息,并提出了新的差异丰度测试方法cosmoDA,显著降低了相关特征的假发现率 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种能够准确表征异质群体中协变量依赖关系的模型,并减少差异丰度测试中的假阳性检测 | 稀疏组合计数数据,特别是单细胞RNA测序和扩增子测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,扩增子测序 | a-b幂交互模型 | 计数数据 | 模拟数据和真实数据 | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2025-01-02 |
Neutrophils drive sexual dimorphism in experimental periodontitis
2024-Dec-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625678
PMID:39677749
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研究论文 | 本研究旨在通过阐明性别特异性的牙周病进展机制,改善牙周病的治疗 | 揭示了中性粒细胞在牙周病性别二态性中的机制作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证有限 | 改善牙周病的治疗 | C57BL/6j小鼠和人类牙周病患者 | NA | 牙周病 | 流式细胞术、单细胞测序 | NA | 实验数据、临床数据 | ≥5只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2025-01-01 |
Interpretable machine learning-driven biomarker identification and validation for Alzheimer's disease
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80401-6
PMID:39730451
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研究论文 | 本研究结合生物信息学方法和可解释的机器学习,识别并验证了阿尔茨海默病的可靠生物标志物 | 引入了交互式SHAP面板用于精确决策,并通过可解释的机器学习诊断模型提供了新的生物标志物识别见解,特别是MYH9作为潜在的新生物标志物 | RHOQ在AD细胞模型和人脑组织样本中的mRNA表达模式相反,其作用仍需进一步探索 | 提高阿尔茨海默病的早期检测和诊断准确性,改善干预效果 | 阿尔茨海默病 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、单细胞转录组分析 | 机器学习算法、SHAP | 基因表达数据 | GEO数据库中的AD数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 328 | 2025-01-01 |
Prognostic model based on tumor stemness genes for triple-negative breast cancer
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81503-x
PMID:39730613
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据,从肿瘤干细胞性的角度分析三阴性乳腺癌,并开发了一个基于7个肿瘤干细胞相关基因的预后模型 | 首次从肿瘤干细胞性的角度对三阴性乳腺癌进行分析,并开发了一个基于特定亚型标记基因的预后模型 | 研究结果需要进一步在更大规模的临床样本中进行验证 | 开发一个基于肿瘤干细胞相关基因的三阴性乳腺癌预后模型 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | 预后模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 329 | 2025-01-01 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood links cell-type-specific regulation of splicing to autoimmune and inflammatory diseases
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02019-8
PMID:39627432
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了外周血中细胞类型特异性剪接调控与自身免疫和炎症疾病的关系 | 首次在亚洲免疫多样性图谱中,揭示了细胞类型特异性、性别偏向性和祖先偏向性的剪接差异,并发现了与自身免疫和炎症疾病遗传性相关的cis-sQTL效应 | 研究样本主要来自健康捐赠者,未涉及疾病患者,可能限制了结果的广泛适用性 | 探讨剪接调控在复杂疾病中的作用,特别是在不同遗传背景下的细胞类型特异性差异 | 474名健康捐赠者的约100万个外周血单核细胞 | 生物信息学 | 自身免疫和炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 474名健康捐赠者的约100万个外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 330 | 2024-12-31 |
Tumor-derived CCL15 regulates RNA m6A methylation in cancer-associated fibroblasts to promote hepatocellular carcinoma growth
2024-Dec-27, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217420
PMID:39734010
|
研究论文 | 本文揭示了CCL15在肝细胞癌(HCC)进展中的关键作用,通过调节癌症相关成纤维细胞(CAFs)中的RNA m6A甲基化促进HCC生长 | 首次发现CCL15通过STAT3通路诱导CAFs中FTO的表达,进而调控CEBPA mRNA的m6A甲基化,揭示了CCL15在HCC细胞与CAFs之间的新型调控轴 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在临床患者中进行验证 | 探讨CCL15在HCC生长中的具体作用和机制 | 肝细胞癌(HCC)细胞和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、共培养实验、类器官模型、异种移植模型、m6A测序、RNA测序 | NA | RNA测序数据、免疫荧光图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 331 | 2024-12-31 |
Targeting UBE2T suppresses breast cancer stemness through CBX6-mediated transcriptional repression of SOX2 and NANOG
2024-Dec-21, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217409
PMID:39716485
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研究论文 | 本文揭示了UBE2T通过CBX6介导的转录抑制调控乳腺癌干细胞(BCSC)干性的机制,并提出了潜在的治疗策略 | 首次发现UBE2T通过TRIM25介导的CBX6泛素化降解调控SOX2和NANOG的转录,从而影响BCSC干性 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 研究UBE2T在乳腺癌干细胞干性调控中的作用及其潜在治疗策略 | 乳腺癌干细胞(BCSCs) | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),干性指数分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-12-31 |
Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution
2024-Dec, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339
PMID:39393164
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在非模式生物污染暴露研究中的应用 | 强调了单细胞RNA测序技术在揭示非模式生物对环境污染反应的分子机制中的潜力 | 主要基于已发表文献的分析,缺乏新的实验数据 | 探讨单细胞RNA测序技术在非模式生物污染暴露研究中的应用 | 非模式生物 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 333 | 2024-12-30 |
scRNA + BCR-seq identifies proportions and characteristics of dual BCR B cells in the peritoneal cavity of mice and peripheral blood of healthy human donors across different ages
2024-Dec-28, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00493-6
PMID:39732722
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研究论文 | 本研究利用scRNA-seq和scBCR-seq技术,探讨了小鼠腹膜和健康志愿者外周血中双受体B细胞的存在及其与年龄的关系 | 首次揭示了老年小鼠和健康志愿者中双受体B细胞的比例和特性,并发现这些细胞在老年个体中显著增加 | 研究样本主要来自小鼠和健康志愿者,未涉及疾病状态下的双受体B细胞 | 探讨双受体B细胞在不同年龄个体中的存在及其特性 | 小鼠腹膜和健康志愿者外周血中的B细胞 | 免疫学 | NA | scRNA-seq, scBCR-seq | NA | 单细胞RNA测序数据, B细胞受体测序数据 | 小鼠和不同年龄的健康志愿者 | NA | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-12-30 |
TIM3 on natural killer cells regulates antibody-dependent cellular cytotoxicity in HER2-positive gastric cancer
2024-Dec-24, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217412
PMID:39722406
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研究论文 | 本研究探讨了TIM3在自然杀伤细胞(NK细胞)上对HER2阳性胃癌(GC)中抗体依赖性细胞毒性(ADCC)的调节作用 | 首次揭示了TIM3在NK细胞中的表达与CD16的相关性,并提出了抗TIM3抗体与曲妥珠单抗联合治疗HER2阳性胃癌的新策略 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证其效果 | 研究HER2阳性胃癌中NK细胞的免疫检查点分子与曲妥珠单抗诱导的ADCC之间的关系 | HER2阳性胃癌患者和HER2转染的胃癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和免疫组织化学 | 小鼠HER2阳性胃癌模型 | 基因表达数据和免疫组化数据 | HER2阳性胃癌患者和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-12-30 |
Single-cell transcriptome profiling identifies the activation of type I interferon signaling in ossified posterior longitudinal ligament
2024-Dec, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1075-5
PMID:39441507
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了I型干扰素信号在OPLL患者骨化韧带中的激活,并探讨了其在骨化过程中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了I型干扰素信号在OPLL骨化过程中的激活,并验证了其在体外促进成骨分化的作用 | 研究主要基于体外实验,尚未在体内模型中验证I型干扰素信号阻断对OPLL的预防效果 | 探讨OPLL的分子机制及潜在预防干预措施 | OPLL患者的骨化韧带 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | OPLL患者的骨化韧带样本 | NA | NA | NA | NA |
| 336 | 2024-12-30 |
Immunological face of megakaryocytes
2024-Dec, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1087-1
PMID:39542989
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综述 | 本文综述了巨核细胞(MKs)在免疫系统中的新兴角色及其在生理和病理环境中的功能 | 揭示了巨核细胞作为独特免疫细胞的多样化能力,并发现了具有免疫调节功能的‘免疫巨核细胞’亚群 | 需要进一步研究确定巨核细胞的免疫功能是由整个巨核细胞群体还是特定亚群执行 | 探讨巨核细胞在免疫系统中的功能及其在生理和病理环境中的作用 | 巨核细胞及其免疫功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-12-29 |
Unveiling chemotherapy-induced immune landscape remodeling and metabolic reprogramming in lung adenocarcinoma by scRNA-sequencing
2024-Dec-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95988
PMID:39729352
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了化疗对肺腺癌免疫景观和代谢重编程的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析化疗对肺腺癌免疫细胞和代谢的影响,并识别了两种巨噬细胞亚型 | 样本量较小,仅涉及9名患者,可能影响结果的普遍性 | 探讨化疗和免疫治疗对肺腺癌患者的影响,特别是免疫景观和代谢重编程 | 肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq, 流式细胞术, 免疫荧光, Seahorse检测, 肿瘤异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9名肺腺癌患者的83,622个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2024-12-29 |
Organoids as a model system for researching human neuroendocrine tumor of the breast
2024-Dec-27, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03621-w
PMID:39731167
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研究论文 | 本文首次建立了乳腺神经内分泌肿瘤(NETB)的类器官模型,并用于组织学染色、药物筛选和单细胞RNA测序 | 首次建立NETB的类器官模型,为临床研究提供了坚实的基础 | 样本量较小,仅基于一名中国女性患者的样本 | 研究乳腺神经内分泌肿瘤的发病机制和有效治疗方法 | 乳腺神经内分泌肿瘤(NETB) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 组织学染色、药物筛选、单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本、RNA测序数据 | 一名中国女性患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-12-29 |
Long-term in vitro expansion of a human fetal pancreas stem cell that generates all three pancreatic cell lineages
2024-Dec-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.10.044
PMID:39626658
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研究论文 | 本文报道了从8-17周胎儿胰腺样本中衍生出18种人类胎儿胰腺类器官(hfPO)系,并发现其中4种能够在优化培养条件下长期扩展并生成胰腺的三种细胞谱系 | 首次报道了能够长期体外扩展并生成胰腺三种细胞谱系的人类胎儿三能干细胞/祖细胞 | 研究仅限于胎儿胰腺样本,未涉及成体胰腺或其他器官 | 研究人类胎儿胰腺干细胞的长期体外扩展及其多向分化能力 | 人类胎儿胰腺样本 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 18种人类胎儿胰腺类器官(hfPO)系 | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-12-29 |
snRNA-seq of long-preserved FFPE samples from colorectal liver metastasis lesions with diverse prognoses
2024-Dec-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04323-8
PMID:39725704
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研究论文 | 本研究利用snRandom-seq技术对长期保存的FFPE样本进行单核RNA测序,以探索结直肠癌肝转移患者不同预后的潜在影响因素 | 首次在长期保存的FFPE样本中成功应用单核RNA测序技术,揭示了结直肠癌肝转移患者不同预后之间的异质性 | 样本数量有限(18例),且所有样本均为长期保存的FFPE样本,可能存在RNA降解问题 | 探索结直肠癌肝转移患者不同预后的潜在影响因素 | 18例具有不同预后的结直肠癌肝转移患者的多个病灶样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | snRNA-seq, snRandom-seq | NA | RNA测序数据 | 18例结直肠癌肝转移患者的82,285个细胞 | NA | NA | NA | NA |