单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 620 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-12-14 |
3D printed PGCL@PLA/10CSPL composite scaffolds loaded with fibronectin 1 for intervertebral disc degeneration treatment
2024-Dec-13, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad998f
PMID:39668784
|
研究论文 | 本文设计并制造了一种新型3D打印PGCL@PLA/10CSPL复合支架，用于椎间盘退行性疾病的治疗 | 本文创新性地设计了一种具有良好生物相容性和电活性的PGCL@1PAP/10CSPL支架，并加载了从单细胞转录组数据中识别出的纤维连接蛋白1（FN1），以加速异常髓核退变 | NA | 研究目的是开发一种新型植入系统，用于椎间盘退行性疾病的治疗 | 研究对象是椎间盘退行性疾病及其治疗 | 生物医学工程 | 椎间盘退行性疾病 | 3D打印技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 282 | 2024-12-14 |
Activation of STAT6 in Intestinal Epithelial Cells Predisposes to Gut Inflammation
2024-Dec-13, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451394
PMID:39670708
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研究论文 | 研究探讨了STAT6在肠上皮细胞中的激活对肠道炎症的影响 | 首次揭示了STAT6在肠上皮细胞中的激活对肠道炎症的加剧作用 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 探讨STAT6在肠上皮细胞中的激活对溃疡性结肠炎的影响 | STAT6在肠上皮细胞中的激活及其对肠道炎症的影响 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用VillinCre_STAT6vt小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据集 |
| 283 | 2024-12-14 |
Fuzzy-Based Identification of Transition Cells to Infer Cell Trajectory for Single-Cell Transcriptomics
2024-Dec-13, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2023.0432
PMID:39670822
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研究论文 | 本文提出了一种基于模糊聚类的单细胞转录组学细胞轨迹推断方法，名为scFCTI，用于识别过渡细胞并推断细胞轨迹 | 本文的创新点在于引入了模糊聚类方法，量化细胞不确定性，从而能够识别不稳定的过渡细胞，并获得更精确的细胞分类和轨迹重建 | NA | 本文的研究目的是开发一种新的方法来推断单细胞转录组学中的细胞轨迹，特别是识别过渡细胞 | 本文的研究对象是单细胞RNA测序数据中的过渡细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 模糊聚类 | 转录组数据 | 五个真实数据集和四个不同结构的模拟数据集 |
| 284 | 2024-12-14 |
Genomic and the tumor microenvironment heterogeneity in multifocal hepatocellular carcinoma
2024-Dec-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001191
PMID:39666875
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序和单细胞RNA测序，分析了多灶性肝细胞癌中肝内转移和多中心发生的肿瘤微环境异质性 | 首次在单细胞分辨率下对多灶性肝细胞癌的肝内转移和多中心发生的肿瘤微环境进行了全面表征 | 研究样本量较小，仅包括七名患者，可能影响结果的普适性 | 深入解析多灶性肝细胞癌中肝内转移和多中心发生的肿瘤微环境异质性 | 多灶性肝细胞癌的肝内转移和多中心发生的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 23个样本，来自7名患者 |
| 285 | 2024-12-14 |
Evaluation of T Cell Receptor Construction Methods from scRNA-Seq Data
2024-Dec-12, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae086
PMID:39666949
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研究论文 | 本文评估了从单细胞RNA测序数据中构建T细胞受体（TCR）的不同方法的性能 | 引入了新的模拟器YASIM-scTCR，能够生成包含不同TCR衍生序列的scTCR-seq读取数据，并评估了不同方法在不同条件下的表现 | 研究中发现测序深度对从scRNA-seq数据中成功构建TCR有重要限制 | 评估不同方法从单细胞RNA测序数据中构建TCR的性能，并提供选择合适方法的基准 | T细胞受体（TCR）的构建方法及其在不同条件下的性能 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 使用了实验性的单细胞免疫图谱数据集 |
| 286 | 2024-12-14 |
Cholesterol restriction primes antiviral innate immunity via SREBP1-driven noncanonical type I IFNs
2024-Dec-12, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00346-9
PMID:39668245
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研究论文 | 研究探讨了胆固醇代谢与先天免疫反应之间的关系，特别是通过SREBP1介导的非经典型I型干扰素表达来增强RIG-I信号传导 | 揭示了胆固醇合成限制通过SREBP1依赖的方式诱导非经典型I型干扰素表达，从而增强RIG-I介导的抗病毒反应 | NA | 探讨胆固醇代谢与先天免疫反应之间的机制 | RIG-I活性、胆固醇合成抑制剂（如他汀类药物）对I型干扰素反应的影响 | NA | NA | 化学筛选、单细胞转录组分析 | NA | RNA | 小鼠模型、特定细胞类型 |
| 287 | 2024-12-14 |
Paired-Related Homeobox 1-Positive Cells Are Needed for Osseointegration
2024-Dec-11, The International journal of oral & maxillofacial implants
DOI:10.11607/jomi.10852
PMID:38498783
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研究论文 | 研究Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中对种植体诱导骨整合过程的贡献及其潜在机制 | 首次揭示了Prrx1阳性细胞在骨整合过程中的作用，并发现Sema3C在Prrx1阳性细胞驱动的成骨过程中起关键作用 | 研究仅在啮齿动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨Prrx1阳性细胞在种植体诱导骨整合过程中的作用及其机制 | Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中的作用 | NA | NA | Cre重组酶诱导的谱系追踪、细胞消融、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用小鼠牙种植体模型进行实验 |
| 288 | 2024-12-14 |
Impaired myofibroblast proliferation is a central feature of pathologic post-natal alveolar simplification
2024-Dec-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94425
PMID:39660606
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研究论文 | 本文研究了早产儿因支气管肺发育不良（BPD）导致的肺泡简化问题，并探讨了肌成纤维细胞增殖受损在其中的核心作用 | 通过多重小鼠模型和单细胞RNA测序，揭示了肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化的核心特征，并提出了抑制肌成纤维细胞增殖足以导致病理性肺泡简化 | 缺乏针对BPD的特异性治疗方法，且研究结果主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探讨支气管肺发育不良（BPD）中肺泡简化的机制及其潜在治疗方法 | 早产儿因BPD导致的肺泡简化及肌成纤维细胞的增殖 | NA | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多重小鼠模型 |
| 289 | 2024-12-14 |
EEE1F1 could serve as a prognostic biomarker for patients with endometrial cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Dec-11, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.065
PMID:39668036
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 290 | 2024-12-14 |
Spatial transcriptomics reveals molecular cues underlying the site specificity of the adult mouse oral mucosa and its stem cell niches
2024-Dec-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.007
PMID:39547226
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学研究成年小鼠口腔黏膜及其干细胞微环境的分子特征 | 首次通过空间转录组学技术揭示了成年小鼠口腔黏膜不同部位的分子标记和共享的细胞微环境及分化程序，并验证了FGF信号通路成分作为口腔上皮干细胞微环境因子的潜力 | NA | 揭示成年小鼠口腔黏膜不同部位的分子特征及其干细胞微环境的维持机制 | 成年小鼠的舌头、脸颊和腭部的口腔黏膜组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学（tomo-seq） | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠的舌头、脸颊和腭部组织样本 |
| 291 | 2024-12-14 |
Bone morphogenetic protein 4 induces hematopoietic stem cell development from murine hemogenic endothelial cells in culture
2024-Dec-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.005
PMID:39547225
|
研究论文 | 研究探讨了骨形态发生蛋白4（BMP4）在体外诱导小鼠早期造血内皮细胞（HECs）向造血干细胞（HSCs）分化的作用 | 首次揭示了BMP4在早期HECs向HSCs分化中的关键作用，为体外诱导HSCs提供了新的可能性 | 研究主要集中在体外实验，尚未验证BMP4在体内胚胎发育中的作用 | 阐明诱导早期HECs向HSCs分化的信号分子需求 | 小鼠早期造血内皮细胞（E9.5 HECs） | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | E9.5和E10.5的小鼠胚胎中的HECs |
| 292 | 2024-12-14 |
Synovial tissue myeloid dendritic cell subsets exhibit distinct tissue-niche localization and function in health and rheumatoid arthritis
2024-Dec-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.11.004
PMID:39609125
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研究论文 | 研究探讨了类风湿性关节炎（RA）中滑膜组织中的树突状细胞（DC）亚群在不同组织微环境中的定位和功能 | 通过单细胞和空间转录组学技术，首次揭示了健康和RA状态下滑膜组织中DC亚群的特定功能和微环境定位 | 研究主要基于滑膜组织样本，未涵盖全身免疫系统的其他部分 | 探索恢复RA患者免疫耐受的潜在途径 | 滑膜组织中的树突状细胞亚群及其在健康和RA状态下的功能 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 滑膜组织活检样本 |
| 293 | 2024-12-14 |
Parallel labeled-line organization of sympathetic outflow for selective organ regulation in mice
2024-Dec-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54928-1
PMID:39658565
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研究论文 | 本文通过结合单细胞转录组数据和病毒遗传工具包，在小鼠中识别出两种亚型的脊髓交感神经节前神经元（SPNs），并研究了它们在交感神经系统中的特定输出调控 | 首次在分子水平上定义了两种亚型的SPNs，并揭示了它们在交感神经系统中的非重叠投射模式和选择性调控功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在其他物种中验证 | 揭示交感神经系统中负责特定器官调控的神经回路组织 | 脊髓交感神经节前神经元（SPNs）及其在交感神经系统中的特定输出调控 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序，病毒遗传工具包 | NA | 基因表达数据 | 小鼠 |
| 294 | 2024-12-14 |
Unraveling pathogenesis and potential biomarkers for autism spectrum disorder associated with HIF1A pathway based on machine learning and experiment validation
2024-Dec-08, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106763
PMID:39657846
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研究论文 | 本文通过机器学习和实验验证，揭示了HIF1A通路在自闭症谱系障碍（ASD）中的病理机制及其潜在的生物标志物 | 首次通过机器学习识别出与HIF1A通路相关的ASD诊断标志物，并验证了IL-6/JUN/HIF1A通路在ASD发病机制中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床应用仍需进一步验证 | 探讨HIF1A通路在ASD中的病理机制及其潜在的生物标志物 | 自闭症谱系障碍（ASD）及其相关基因和通路 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序、Western Blot、qPCR、免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | ASD小鼠模型及微胶质细胞BV-2细胞 |
| 295 | 2024-12-14 |
Decoding the muscle transcriptome of patients with late-onset Pompe disease reveals markers of disease progression
2024-Dec-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae249
PMID:39045638
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研究论文 | 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了晚发型庞贝病患者的肌肉转录组变化及其与疾病进展的关系 | 首次应用单核RNA测序技术分析晚发型庞贝病患者的肌肉活检样本，结合空间转录组学技术比较健康个体与患者的基因表达差异，揭示了疾病进展的早期异常 | 样本量较小，仅包括8名患者和4名健康对照 | 揭示晚发型庞贝病患者的肌肉转录组变化及其与疾病进展的关系 | 晚发型庞贝病患者的肌肉组织 | 数字病理学 | 遗传性疾病 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 8名晚发型庞贝病患者和4名健康对照的肌肉样本 |
| 296 | 2024-12-14 |
Conserved B cell signaling, activation, and differentiation in porcine jejunal and ileal Peyer's patches despite distinct immune landscapes
2024-Dec, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.08.005
PMID:39147277
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研究论文 | 研究了猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，尽管存在不同的免疫环境，但发现了保守的B细胞动态 | 首次通过单细胞和空间转录组学研究猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并发现尽管存在不同的免疫环境，B细胞动态在肠道位置间是保守的 | 研究仅限于猪的空肠和回肠Peyer's patches，未涉及其他物种或其他肠道区域 | 探讨Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并研究其在不同肠道位置的保守性 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 |
| 297 | 2024-12-14 |
GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model
2024-Dec, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-01034-y
PMID:39375485
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研究论文 | 本文构建了一个跨物种的基础模型GeneCompass，用于解析普遍的基因调控机制 | GeneCompass通过整合四种先验生物学知识，在自监督学习中增强了基因调控机制的理解，并在多个下游任务中超越了现有模型 | NA | 解析跨物种的普遍基因调控机制，推动基础生命过程研究和临床应用 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型 | 转录组数据 | 12000万个人类和小鼠的单细胞转录组数据 |
| 298 | 2024-12-14 |
SRSF1 Is Crucial for Maintaining Satellite Cell Homeostasis During Skeletal Muscle Growth and Regeneration
2024-Dec, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13607
PMID:39381961
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研究论文 | 本文研究了剪接因子SRSF1在骨骼肌生长和再生过程中对卫星细胞稳态的维持作用 | 首次揭示了SRSF1在调节Fgfr1op2剪接中的关键作用，以及其对有丝分裂纺锤体组织和细胞衰老的影响 | 研究主要集中在新生小鼠的横膈膜和C2C12细胞系，可能无法完全代表所有骨骼肌的情况 | 探讨SRSF1缺失对卫星细胞功能和肌肉再生的影响机制 | 卫星细胞（SCs）及其在骨骼肌生长和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（RNA-seq）、免疫染色、EdU掺入实验 | NA | RNA | 新生小鼠横膈膜的单核细胞悬液（KO和对照组）、C2C12肌母细胞和原代肌母细胞 |
| 299 | 2024-12-14 |
Spatial Transcriptomics Unravel the Tissue Complexity of Oral Pathogenesis
2024-Dec, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241271934
PMID:39382116
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综述 | 本文综述了空间转录组学（ST）在口腔病理学中的应用，展示了其在不同颅面区域疾病发展中的研究进展 | 空间转录组学结合了全局基因表达和空间信息的分析，提供了传统转录组学方法所缺乏的空间分辨率，能够更好地研究疾病和健康组织状态中细胞区域的复杂相互关系 | 本文主要为综述性质，未提供具体的研究数据或实验结果 | 探讨空间转录组学在颅面区域疾病发展中的应用，并展示其在不同组织中的研究进展 | 颅面区域的组织，包括颅骨、腭、唾液腺、舌头、口腔底、口咽和牙周组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学（ST） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 300 | 2024-12-14 |
Electroacupuncture Slows Experimental Myopia Progression by Improving Retinal Mitochondrial Function: A Study Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400269
PMID:39404059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了晶状体诱导性近视和电针干预下的视网膜细胞图谱，并探讨了电针改善实验性近视进展的潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了电针通过改善视网膜线粒体功能来减缓实验性近视进展的机制 | 研究仅在豚鼠模型上进行，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨电针干预对实验性近视进展的影响及其潜在机制 | 晶状体诱导性近视和电针干预下的豚鼠视网膜细胞 | NA | 近视 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 晶状体诱导性近视和电针干预下的豚鼠视网膜细胞 |