单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
281 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文探讨了炎症小体与阿尔茨海默病(AD)之间的关联,并利用CRISPR技术研究了其在AD中的分子机制 利用CRISPR技术在人类诱导多能干细胞分化的微胶质细胞(iMG)模型中,揭示了炎症小体在AD中的关键作用,并发现了潜在的药物靶点 研究主要基于体外模型,尚未在体内或临床环境中验证其发现 探索炎症小体在阿尔茨海默病中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 人类诱导多能干细胞分化的微胶质细胞(iMG) 基因组学 阿尔茨海默病 CRISPR、单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、蛋白质组学 iMG模型 基因序列、蛋白质数据 NA
282 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,分析了阿尔茨海默病(AD)在性别特异性方面的分子因素,揭示了性别特异性对疾病的影响 首次在细胞分辨率上揭示了性别特异性对阿尔茨海默病的影响,并发现了85个性别特异性效应 未来需要进一步机制研究,将这些基因与其下游效应器在细胞类型特异性方式上连接起来 研究阿尔茨海默病在性别特异性方面的分子因素 424例来自宗教秩序研究和记忆与衰老项目(ROS/MAP)的背外侧前额叶皮层样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 负二项混合模型 RNA测序数据 424例样本(68%为女性,37%为AD病例)
283 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文研究了人类诱导多能干细胞衍生的神经干细胞外泌体(hiPSC-NSC-EVs)在阿尔茨海默病(AD)模型中的治疗效果 首次展示了hiPSC-NSC-EVs在AD模型中通过调节小胶质细胞活性和减少神经炎症信号级联反应来维持大脑功能的潜力 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证 探索hiPSC-NSC-EVs作为AD疾病修饰干预的潜力 5x家族性AD(5xFAD)小鼠模型 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNA-sequencing) NA 基因表达数据 5xFAD小鼠模型,每周注射hiPSC-NSC-EVs或对照剂,持续两周
284 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文介绍了MAD1小鼠模型,该模型通过替换小鼠的Aβ、Mapt和Apoe等位基因为人类对应基因,以更好地模拟晚发性阿尔茨海默病(LOAD)的病理过程 首次开发并表征了MAD1小鼠模型,该模型通过人类化基因替换,以生理水平表达相关基因,更准确地模拟LOAD的疾病进展 研究尚处于初步阶段,未观察到Aβ或tau蛋白的形成,且样本量较小 开发并验证一种更准确模拟晚发性阿尔茨海默病(LOAD)病理过程的小鼠模型 MAD1小鼠模型和野生型(WT)小鼠 数字病理学 阿尔茨海默病 NanoString CosMx单细胞空间转录组学、抗体空间蛋白质组学、snRNA-seq、免疫组织化学 小鼠模型 基因表达数据、蛋白质分布数据 4个月大的MAD1和WT小鼠(每组3只/性别),8个月大的MAD1小鼠(每组3只雄性,2只雌性)
285 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究探讨了慢性重度饮酒如何通过影响肝脏LRP-1表达来驱动阿尔茨海默病(AD)小鼠的脑部病理变化 首次研究了慢性重度饮酒通过肝脏LRP-1表达对AD小鼠脑部淀粉样变的影响 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本 研究慢性重度饮酒如何通过肝脏变化驱动AD病理 APP/PS1小鼠 病理学 阿尔茨海默病 免疫测定、Nanostring空间转录组学、AAV8介导的基因沉默 APP/PS1小鼠模型 生物样本数据 每组7-11只小鼠,总计约18-22只
286 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文利用空间蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,研究了阿尔茨海默病(AD)患者在接受Aβ免疫治疗后的神经免疫反应 首次揭示了Aβ免疫治疗后AD大脑中TREM2-APOE轴相关基因在小胶质细胞中的增加 研究样本量较小,仅涉及13名AD患者 探讨Aβ免疫治疗后AD大脑中的神经免疫反应机制 阿尔茨海默病(AD)患者的大脑组织 神经科学 阿尔茨海默病 空间蛋白质组学,单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据,RNA测序数据 13名AD患者的大脑组织
287 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文研究了TREM2激活抗体ATV:4D9对小胶质细胞染色质可及性的影响,揭示了其介导的转录因子变化 首次使用ATAC-Seq技术分析了ATV:4D9激活的小胶质细胞染色质可及性变化,并识别了潜在的调控转录因子 未明确ATV:4D9诱导的转录反应的具体分子机制 探讨TREM2激活抗体ATV:4D9对小胶质细胞染色质可及性的影响及其调控机制 小胶质细胞 生物信息学 阿尔茨海默病 ATAC-Seq, 荧光激活核分选(FANS) NA 染色质可及性数据 NA
288 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究探讨了SNX19在神经退行性疾病中的作用机制,特别是在阿尔茨海默病(AD)中的角色 首次在单细胞水平上研究SNX19在衰老后脑组织中的作用,并使用hiPSCs衍生的脑类器官模型进行机制研究 样本量较小,仅使用了48个后脑样本和2个hiPSCs 揭示SNX19在神经退行性疾病中的分子机制 人类后脑组织及hiPSCs衍生的脑类器官 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序、CRISPR基因编辑 脑类器官模型 RNA测序数据、基因表达数据 48个后脑样本、2个hiPSCs
289 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过详细的组织学和生化分析,探讨了无症状阿尔茨海默病(AsymAD)与阿尔茨海默病(AD)在Aβ斑块微环境中的基因表达差异,揭示了AsymAD大脑中微胶质细胞的高效肌动蛋白基础细胞运动机制及其对Aβ毒性的保护作用 首次使用GeoMx全空间转录组图谱比较AsymAD与AD病例中Aβ斑块微环境的基因表达,揭示了AsymAD大脑中微胶质细胞的高效肌动蛋白基础细胞运动机制 研究样本量较小(AsymAD N=17, AD N=19, 对照组 N=13),且主要依赖于死后脑组织分析,可能无法完全反映活体情况 探讨AsymAD病例中对AD病理和认知衰退的抵抗机制 无症状阿尔茨海默病(AsymAD)和阿尔茨海默病(AD)患者的死后脑组织 神经科学 阿尔茨海默病 GeoMx全空间转录组图谱,组织学和生化分析 NA 脑组织样本 AsymAD N=17, AD N=19, 对照组 N=13
290 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文研究了雌激素通过微胶质细胞中的ERα信号通路抑制促炎信号通路的机制,并探讨了雌激素耗竭对微胶质细胞异质性的影响 首次通过单细胞转录组测序技术揭示了雌激素耗竭对海马微胶质细胞表型状态的影响,并提出了雌激素-ERα信号通路在微胶质细胞激活中的关键作用 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中进行验证 探讨雌激素耗竭对微胶质细胞异质性的影响及其在神经炎症中的作用 小鼠海马微胶质细胞 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞转录组测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 小鼠模型
291 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过空间转录组学方法,研究了阿尔茨海默病中抑制性中间神经元的转录组变化 首次在时间和空间上绘制了阿尔茨海默病早期和晚期中间神经元的转录组图谱,揭示了不同脑区和神经元亚型的独特转录变化 研究仅使用了雄性小鼠模型,未考虑性别差异的影响 探究阿尔茨海默病中抑制性中间神经元功能障碍的病理机制 5XFAD雄性小鼠的中间神经元(PV+和SST+) 神经科学 阿尔茨海默病 空间转录组学(GeoMx DSP)、荧光原位杂交(FISH) 线性混合效应模型 转录组数据 早期(12周)和晚期(30周)5XFAD雄性小鼠各2只,每时间点2张重复切片
292 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究使用数字空间分析技术(DSP)比较了阿尔茨海默病伴精神病(AD+P)和不伴精神病(AD-P)患者的淀粉样蛋白β和非淀粉样蛋白β区域的转录组数据 首次应用NanoString GeoMx™ DSP平台进行空间转录组学分析,揭示了AD+P患者中与淀粉样蛋白斑块相关的差异表达基因 样本量较小,且冷冻样本质量不佳,仅分析了FFPE切片,可能影响结果的普适性 探索阿尔茨海默病伴精神病的分子机制,寻找新的药物治疗靶点 阿尔茨海默病伴精神病(AD+P)和不伴精神病(AD-P)患者的脑组织样本 数字病理学 阿尔茨海默病 数字空间分析(DSP) NA RNA 6个死后脑样本,来自前额叶皮层
293 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究结合空间转录组学(ST)和免疫组织化学技术,探索了阿尔茨海默病(AD)中神经斑块微环境中的分子机制 首次结合空间转录组学和免疫组织化学技术,揭示了AD中神经斑块微环境中胶质细胞的异质性,并识别了182个与斑块相关的基因 研究样本量较小,仅包括15例AD患者和2例对照,且空间转录组学技术的分辨率有限 探索阿尔茨海默病中神经斑块微环境的分子机制 阿尔茨海默病患者的前额叶皮层组织 数字病理学 阿尔茨海默病 空间转录组学(ST)、免疫组织化学、原位杂交 NA 基因表达数据、图像数据 15例AD患者和2例对照的前额叶皮层组织,共32个切片
294 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术研究阿尔茨海默病(AD)中的细胞特异性脆弱性与病理学之间的关系,特别是在中颞回(MTG)区域 首次在中颞回(MTG)区域结合单细胞RNA测序和细胞质蛋白保留技术,揭示了pTau积累与细胞类型特异性脆弱性之间的分子变化关系 研究样本量较小(9名捐赠者),且仅针对特定病理阶段(Braak IV-VI期)的AD患者 研究阿尔茨海默病早期发病机制中细胞脆弱性与病理学之间的关系 阿尔茨海默病患者的中颞回(MTG)脑组织 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 9名捐赠者的125,505个细胞
295 2025-01-04
[Research progress of single-cell RNA sequencing in the immune microenvironment of spinal cord injury]
2024-Dec, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:39750053
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在脊髓损伤免疫微环境中的研究进展 利用单细胞RNA测序技术揭示脊髓损伤后局部免疫微环境中的细胞异质性和复杂的细胞间相互作用 NA 探讨单细胞RNA测序技术在脊髓损伤免疫微环境中的应用,以更全面地理解脊髓损伤的病理生理过程 脊髓损伤后的局部免疫微环境 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA
296 2025-01-03
Intervention of Tanshinone IIA on the PGK1-PDHK1 Pathway to Reprogram Macrophage Phenotype After Myocardial Infarction
2024-Dec, Cardiovascular drugs and therapy IF:3.1Q2
研究论文 本研究探讨了丹参酮IIA通过调节巨噬细胞的能量代谢和表型变化来改善心肌梗死的机制 首次提出丹参酮IIA通过PGK1-PDHK1信号通路调节巨噬细胞能量代谢和表型变化的机制 研究主要基于动物模型,尚未在人体中进行验证 探讨丹参酮IIA在心肌梗死治疗中的药理作用及其机制 心肌梗死模型中的巨噬细胞 心血管疾病 心肌梗死 RT-PCR, ELISA, 免疫荧光, JC-1, 钙离子浓度检测, 活性氧检测, 线粒体电子显微镜分析, 单细胞转录组数据挖掘, 细胞转录组测序, 分子对接技术 心肌梗死模型 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞表型数据 心肌梗死模型中的巨噬细胞
297 2025-01-02
CHST4 associates with high-abundance immune infiltration in hormone receptor-positive breast cancer
2024-Dec-31, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本文研究了CHST4在激素受体阳性乳腺癌(HR+ BRCA)中与高丰度免疫浸润的关联 首次发现CHST4在HR+ BRCA中异常下调,并与淋巴结转移相关,揭示了CHST4在增强免疫细胞浸润中的潜在作用 研究主要基于预测和实验验证,尚未进行大规模的临床验证 探讨CHST4在HR+ BRCA中调控免疫浸润的机制 激素受体阳性乳腺癌(HR+ BRCA) 数字病理学 乳腺癌 免疫组织化学染色、单细胞测序 NA 单细胞测序数据、免疫组织化学数据 NA
298 2025-01-02
Comprehensive analysis of heterogeneity and cell-cell interactions in Crohn's disease reveals novel location-specific insights
2024-Dec-26, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了克罗恩病中结肠和回肠的异质性,并发现了一种新的上皮细胞亚群DUOX2-epi 发现了表达高水平DUOX2和DUOXA2的上皮细胞亚群DUOX2-epi,并揭示了其在结肠和回肠中通过不同机制触发炎症反应 研究仅限于未接受过治疗的克罗恩病患者,未涵盖其他治疗阶段的患者 理解克罗恩病中不同肠段的发病机制和治疗反应的多样性 克罗恩病患者的结肠和回肠 数字病理学 克罗恩病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 未明确说明样本数量,但研究对象为未接受过治疗的克罗恩病患者
299 2025-01-02
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种扩展的a-b幂交互模型,用于处理包含协变量信息的稀疏组合计数数据,并结合差异丰度测试方法cosmoDA,以减少相关特征导致的假阳性检测 扩展了a-b幂交互模型以包含协变量信息,并提出了新的差异丰度测试方法cosmoDA,显著降低了相关特征的假发现率 未明确提及具体局限性 开发一种能够准确表征异质群体中协变量依赖关系的模型,并减少差异丰度测试中的假阳性检测 稀疏组合计数数据,特别是单细胞RNA测序和扩增子测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序,扩增子测序 a-b幂交互模型 计数数据 模拟数据和真实数据
300 2025-01-02
Neutrophils drive sexual dimorphism in experimental periodontitis
2024-Dec-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究旨在通过阐明性别特异性的牙周病进展机制,改善牙周病的治疗 揭示了中性粒细胞在牙周病性别二态性中的机制作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证有限 改善牙周病的治疗 C57BL/6j小鼠和人类牙周病患者 NA 牙周病 流式细胞术、单细胞测序 NA 实验数据、临床数据 ≥5只小鼠
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