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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-07 |
Spatial multi-omics characterizes GPR35-relevant lipid metabolism signatures across liver zonation in MASLD
2024-Dec, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loae021
PMID:39873004
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了GPR35在MASLD中调控肝脏分区特异性脂质代谢的机制 | 首次结合空间转录组学、空间代谢组学和脂质代谢组学,在肝脏分区水平上系统解析GPR35调控MASLD进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;机制研究仍需进一步功能实验证实 | 阐明GPR35在代谢功能障碍相关脂肪肝病中调控肝脏分区特异性基因表达和代谢物分布的机制 | 小鼠肝脏组织,重点关注GPR35缺陷模型在MASLD进展中的变化 | 空间多组学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 空间转录组学,空间代谢组学,脂质代谢组学 | NA | 空间基因表达数据,空间代谢物分布数据 | GPR35缺陷小鼠模型 | NA | 空间转录组学,空间代谢组学 | NA | NA |
| 262 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing algorithms underestimate changes in transcriptional noise compared to single-molecule RNA imaging
2024-Dec-16, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100933
PMID:39662473
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研究论文 | 比较单细胞RNA测序算法与单分子RNA成像在转录噪声量化方面的差异 | 首次系统比较多种scRNA-seq算法与smFISH在量化转录噪声变化方面的性能差异 | 所有scRNA-seq算法均系统性低估噪声变化,且仅测试了代表性基因面板 | 评估基因组范围内转录噪声的最佳量化方法 | 人类和小鼠数据集中的基因表达噪声 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子RNA荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, smFISH | NA | NA |
| 263 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes
2024-Dec, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003
PMID:39426602
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示生殖器疱疹患者免疫细胞多样性和系统性免疫反应特征 | 首次在单细胞水平系统分析生殖器疱疹患者外周血免疫细胞的转录组特征,发现特定免疫细胞亚群的激活状态和关键信号通路变化 | 样本量相对有限,主要关注外周血免疫细胞而未直接研究局部感染部位的免疫反应 | 探究HSV-2感染和复发过程中免疫系统的应答机制 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, ELISA | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 264 | 2025-10-07 |
Gene regulatory network inference based on novel ensemble method
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae036
PMID:39324652
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研究论文 | 提出一种基于13种基础分类方法和灵活神经树的集成方法用于提高基因调控网络识别准确率 | 开发了基于基因编程变体和粒子群优化的混合进化算法来搜索最优灵活神经树模型 | NA | 提高基因调控网络识别准确率 | 基因调控网络 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 集成学习,灵活神经树,粒子群优化 | 基因表达数据 | 三个模拟数据集和三个真实单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 265 | 2025-10-07 |
Evolutionary diversity of CXCL16-CXCR6: Convergent substitutions and recurrent gene loss in sauropsids
2024-12, Immunogenetics
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s00251-024-01357-5
PMID:39400711
|
研究论文 | 本研究通过比较约400个脊椎动物CXCR6直系同源基因,揭示了CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性和基因丢失现象 | 首次在脊椎动物广泛尺度上揭示CXCR6的DRF基序非普遍性,发现鸟类中反复发生的CXCR6基因丢失现象 | 研究主要基于基因序列分析,功能验证实验相对有限 | 探究CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化历程和多样性 | 约400个脊椎动物的CXCR6直系同源基因 | 进化生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因序列比对 | NA | 基因序列数据,单细胞RNA测序数据 | 涵盖36个鸟类目和多种脊椎动物的约400个CXCR6直系同源基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 266 | 2025-10-07 |
Initial regional cytoarchitectonic differences in dorsal and orbitobasal human developing frontal cortex revealed by spatial transcriptomics
2024-Dec-18, Brain structure & function
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00429-024-02865-6
PMID:39692769
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示人类胚胎发育期前额叶皮层背侧和眶基底区域早期细胞构筑差异 | 首次在转录组水平发现人类胚胎前额叶皮层背侧和眶基底区域瞬时细胞区室的基因表达差异,证实前额叶皮层区域特化在胎儿发育早期即已出现 | 研究仅聚焦于15孕周这一特定发育时期,样本量有限 | 探究人类胚胎前额叶皮层背侧和眶基底区域细胞构筑特征的转录组基础 | 人类胚胎发育期前额叶皮层组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 15孕周人类胚胎前额叶皮层样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler空间转录组分析平台 |
| 267 | 2025-10-07 |
Mesenchymal Traits as an Intrinsic Feature of Undifferentiated Cells
2024-Dec-24, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb13010001
PMID:39846630
|
研究论文 | 本研究通过分析公开单细胞转录组数据集,探讨间充质表型与未分化细胞状态的内在联系 | 挑战传统观点,提出间充质表型不仅是结构支持特征,更是未分化多能状态的形态学表达 | 基于公开数据集的分析,缺乏实验验证 | 探索间充质表型在胚胎发育和成体器官中与细胞未分化状态的关系 | 早期胚胎阶段和成体组织的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 公开单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 268 | 2025-10-07 |
Construction of a neutrophil extracellular trap formation-related gene model for predicting the survival of lung adenocarcinoma patients and their response to immunotherapy
2024-Dec-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-463
PMID:39830760
|
研究论文 | 基于中性粒细胞胞外诱捕网形成相关基因构建肺腺癌患者生存预测和免疫治疗反应评估模型 | 首次利用中性粒细胞胞外诱捕网形成相关基因构建肺腺癌预后特征模型,并验证其在预测免疫治疗反应方面的价值 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 构建肺腺癌预后预测模型并评估免疫治疗反应 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,生物信息学分析 | LASSO Cox回归模型,风险评分模型 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 269 | 2024-12-11 |
Improved tool for scRNA-seq analysis
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02040-x
PMID:39653731
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2025-10-07 |
Unraveling the effects of prenatal anesthesia on neurodevelopment: A review of current evidence and future directions
2024-Dec, Neurotoxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.neuro.2024.09.003
PMID:39276873
|
综述 | 综述产前麻醉对神经发育影响的研究证据并展望未来研究方向 | 整合脑类器官与单细胞测序技术探索产前麻醉的神经毒性机制 | 临床研究受限于伦理和技术障碍,现有发现尚无定论 | 探讨产前麻醉对胎儿大脑发育的影响 | 胎儿神经发育过程 | NA | NA | 单细胞测序 | 脑类器官 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2025-10-07 |
Pancreatic Neuroendocrine Tumor: The Case Report of a Patient with Germline FANCD2 Mutation and Tumor Analysis Using Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-14, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13247621
PMID:39768544
|
病例报告 | 报告一例携带胚系FANCD2突变的小胰腺神经内分泌肿瘤患者,并利用单细胞RNA测序进行肿瘤分析 | 首次将胚系FANCD2突变与胰腺神经内分泌肿瘤关联,并应用单细胞RNA测序技术分析肿瘤异质性 | NA | 探讨小胰腺神经内分泌肿瘤的分子特征和潜在预后标志物 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 272 | 2025-10-07 |
Harnessing Single-Cell and Spatial Transcriptomics for Crop Improvement
2024-Dec-11, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13243476
PMID:39771174
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组技术在作物改良中的应用进展 | 整合单细胞与空间转录组技术,揭示作物组织中细胞异质性和基因表达空间定位对作物改良的意义 | NA | 探讨单细胞和空间转录组技术在作物改良中的应用前景 | 作物生物学研究 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-07 |
Highlighting roles of autophagy in human diseases: a perspective from single-cell RNA sequencing analyses
2024-Dec, Drug discovery today
IF:6.5Q1
DOI:10.1016/j.drudis.2024.104224
PMID:39521332
|
综述 | 本文从单细胞RNA测序分析的角度探讨自噬在人类疾病中的作用 | 首次系统整合单细胞RNA测序技术与自噬研究,为疾病分子特征提供新视角 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨自噬在人类疾病中的分子机制及单细胞测序技术的应用前景 | 自噬相关基因表达谱及疾病细胞群体 | 单细胞组学 | 癌症及其他人类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 274 | 2025-10-07 |
Circulating Adenoid Cystic Carcinoma associated MYB transcripts enable rapid and sensitive detection of metastatic disease in blood liquid biopsies
2024-Dec, The journal of liquid biopsy
DOI:10.1016/j.jlb.2024.100276
PMID:39801676
|
研究论文 | 开发了一种基于MYB转录本的qPCR检测方法,用于通过血液液体活检检测腺样囊性癌转移 | 首次利用循环肿瘤细胞中MYB转录本表达作为生物标志物,开发了敏感且经济有效的转移性ACC检测方法 | 样本量较小(总样本49例),需要更大规模研究验证 | 开发通过血液液体活检检测腺样囊性癌转移的敏感诊断方法 | 腺样囊性癌患者血液样本 | 分子诊断 | 腺样囊性癌 | 定量聚合酶链反应(qPCR), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 49例患者(23例无ACC史,15例无疾病证据,6例局部ACC,5例转移性ACC) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 275 | 2025-10-07 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.20.629650
PMID:39764057
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研究论文 | 开发了一种名为IN-DEPTH的空间多组学整合方法,用于分析肿瘤微环境中的空间重组 | 提出IN-DEPTH方法实现同一切片的空间蛋白质组学和转录组学整合分析,并开发SGCC算法进行多模态空间数据分析 | 未明确说明样本数量的具体限制和方法的适用范围 | 开发空间多组学整合方法以深入理解肿瘤微环境的空间组织 | 淋巴组织和弥漫性大B细胞淋巴瘤(EBV阳性和阴性) | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞分析 | k-bandlimited Spectral Graph Cross-Correlation (SGCC) | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 276 | 2025-10-07 |
Mechanistic insights into sevoflurane-induced hippocampal neuronal damage and cognitive dysfunction through the NEAT1/Nrf2 signaling axis in aged rats
2024-12-21, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09964-4
PMID:39707048
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了七氟醚通过NEAT1/Nrf2信号轴诱导老年大鼠海马神经元损伤和认知功能障碍的分子机制 | 首次发现lncRNA NEAT1通过抑制Nrf2/ARE/HO-1通路在七氟醚诱导的神经元损伤中发挥关键作用 | 研究仅针对老年大鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 阐明七氟醚麻醉导致老年患者神经损伤和认知功能障碍的分子机制 | 老年大鼠海马神经元 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,转录组分析,TUNEL染色,H&E染色,免疫组化,免疫荧光,流式细胞术 | 大鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 老年大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 277 | 2025-10-07 |
Durable complete response after combined treatment with tumor-infiltrating lymphocytes and oncolytic adenovirus (TILT-123) in a patient with metastatic mucosal melanoma
2024-Dec, Immuno-oncology technology
DOI:10.1016/j.iotech.2024.100726
PMID:39801682
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病例报告 | 报道一例转移性黏膜黑色素瘤患者通过肿瘤浸润淋巴细胞与溶瘤腺病毒联合治疗获得持久完全缓解的病例 | 首次展示TILT-123溶瘤病毒与肿瘤浸润淋巴细胞联合治疗在不使用预处理化疗或后处理白介素-2的情况下实现完全缓解 | 单病例报告,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探索联合免疫疗法在转移性黏膜黑色素瘤治疗中的效果 | 48岁女性转移性鼻窦黏膜黑色素瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞测序,免疫组织化学分析 | NA | 临床数据,单细胞测序数据,免疫组织化学数据 | 1例患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-10-07 |
Miltefosine reinvigorates exhausted T cells by targeting their bioenergetic state
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101869
PMID:39657666
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研究论文 | 本研究通过筛选FDA批准的小分子库,发现米替福新能够通过改善T细胞的生物能量状态来逆转T细胞耗竭 | 首次发现米替福新能够以不依赖PD-1/PD-L1的方式逆转T细胞耗竭,即使在PD-1抗体治疗无效的终末耗竭状态下仍能增强CAR-T细胞活性 | 研究主要基于体外模型和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发针对T细胞耗竭的新型免疫治疗策略 | 耗竭的CAR-T细胞和T细胞 | 免疫治疗 | 肿瘤 | 单细胞测序,小分子筛选 | CAR-T细胞模型,同种异体和同基因肿瘤模型 | 基因表达数据,细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 279 | 2025-10-07 |
Lactylation-driven TNFR2 expression in regulatory T cells promotes the progression of malignant pleural effusion
2024-Dec-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010040
PMID:39721754
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控调节性T细胞中TNFR2表达的机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 首次发现乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控NF-κB p65转录因子,进而上调TNFR2表达的新表观遗传机制 | NA | 探索调节性T细胞中TNFR2表达的调控机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 人类和小鼠的恶性胸腔积液样本及调节性T细胞 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2025-10-07 |
Global identification of mammalian host and nested gene pairs reveal tissue-specific transcriptional interplay
2024-Dec-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279430.124
PMID:39578100
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研究论文 | 本研究通过构建小鼠和人类宿主/嵌套基因对的全面目录,揭示了组织特异性转录互作模式 | 提供了最新的宿主/嵌套基因对目录,发现转录共现具有组织特异性,特别是在睾丸组织中尤为普遍 | NA | 系统识别哺乳动物宿主和嵌套基因对,揭示其组织特异性转录互作机制 | 小鼠和人类基因组中的宿主/嵌套基因对 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |