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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-07 |
Long-term, cell type-specific effects of prenatal stress on dorsal striatum and relevant behaviors in mice
2024-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.627207
PMID:39763907
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨产前应激对成年后代背侧纹状体功能和行为的长期影响 | 首次在单细胞水平揭示产前应激对背侧纹状体多种细胞类型的长期分子影响,并发现与自闭症风险基因的关联 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究产前应激如何影响背侧纹状体细胞分子机制及相关行为 | 产前应激小鼠模型的成年后代 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据、行为数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2025-10-07 |
Cytokine expression and cytokine-mediated cell-cell communication during skeletal muscle regeneration revealed by integrative analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.12055
PMID:39691872
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研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序数据揭示骨骼肌再生过程中的细胞因子表达和细胞间通讯机制 | 首次整合15个公共单细胞RNA测序数据集,系统分析393种小鼠细胞因子在骨骼肌再生中的动态表达谱和细胞间通讯网络 | 仅分析早期再生时间点(0、2、5、7天),未涵盖完整再生过程;基于转录组数据推断细胞通讯,需实验验证 | 解析骨骼肌再生过程中细胞因子介导的细胞间通讯机制 | 小鼠骨骼肌再生过程中的各种细胞类型 | 单细胞生物学 | 肌肉损伤修复 | 单细胞RNA测序 | CellChat | 单细胞转录组数据 | 整合15个公共scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2025-10-07 |
Scaling deep identifiable models enables zero-shot characterization of single-cell biological states
2024-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.11.566161
PMID:38014345
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研究论文 | 开发了scShift深度学习框架,用于消除单细胞RNA测序数据中的批次效应并识别真实生物差异 | 通过扩展深度可识别模型实现了零样本表征能力,能够外推至未见过的生物状态如COVID-19后纤维化 | 需要大规模单细胞图谱数据进行训练,存在数据多样性过渡阈值 | 解决单细胞RNA测序数据分析中跨数据集批次效应的挑战 | 单细胞RNA测序数据,特别是肺纤维化状态 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 深度变分推断框架 | 单细胞RNA测序数据 | 超过200个训练模型,基于大规模单细胞图谱汇编 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 264 | 2025-10-07 |
Arctiin alleviates knee osteoarthritis by suppressing chondrocyte oxidative stress induced by accumulated iron via AKT/NRF2/HO-1 signaling pathway
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83383-7
PMID:39738432
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研究论文 | 本研究探讨牛蒡苷通过AKT/NRF2/HO-1信号通路减轻铁过载诱导的软骨细胞氧化应激,从而缓解膝骨关节炎 | 首次揭示牛蒡苷通过调节铁代谢和激活AKT/NRF2/HO-1通路同时抑制软骨细胞凋亡和铁死亡的双重保护机制 | 未明确牛蒡苷的具体分子靶点及其在人体中的安全有效性 | 探究牛蒡苷对铁过载所致膝骨关节炎的治疗作用及分子机制 | 膝骨关节炎患者的软骨细胞及疾病模型 | 分子生物学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序, CCK-8检测, 流式细胞术, 荧光检测, Q-RTPCR, Western Blotting, 显微CT, 组织染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白表达数据, 影像数据, 组织学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2025-10-07 |
Integrated analyses of Mendelian randomization, eQTL, and single-cell transcriptome identify CCN3 as a potential biomarker in aortic dissection
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83611-0
PMID:39738466
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、eQTL和单细胞转录组分析,鉴定CCN3作为主动脉夹层的潜在生物标志物 | 首次结合多种分析方法系统筛选主动脉夹层相关血浆分泌蛋白,发现CCN3在mRNA和血浆水平均下调并可能具有保护作用 | 当前AD与血浆蛋白水平相关性研究稀缺且缺乏特异性,样本量有限 | 探索血浆分泌蛋白作为主动脉夹层的潜在生物标志物 | 主动脉夹层患者与正常个体的基因表达和血浆蛋白水平 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究,eQTL分析,单细胞转录组测序,qPCR,酶联免疫吸附试验 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据,蛋白质数据 | 三个GEO数据集的患者样本和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 266 | 2025-10-07 |
Claudin 7 suppresses invasion and metastasis through repression of a smooth muscle actin program
2024-Dec-02, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202311002
PMID:39320351
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研究论文 | 本研究揭示了紧密连接蛋白Claudin 7通过抑制平滑肌肌动蛋白相关基因表达来抑制乳腺癌侵袭和转移的机制 | 首次通过功能遗传学方法在鼠源乳腺癌类器官模型中证实Cldn7对侵袭转移的抑制作用,并发现其通过调控SMA相关基因和间充质表型实现这一功能 | 研究主要基于动物模型和细胞系,人类临床样本验证相对有限 | 探究Claudin 7在乳腺癌转移过程中的作用机制 | 鼠源乳腺癌类器官、人类乳腺癌细胞系、新鲜人类肿瘤组织 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 功能遗传学、转录组分析、RNA-seq | NA | 基因表达数据、RNA-seq数据 | 鼠源乳腺癌类器官模型、人类细胞系、人类肿瘤组织样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 267 | 2025-10-07 |
Different gene expression patterns between mouse and human brain pericytes revealed by single-cell/nucleus RNA sequencing
2024-12, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2024.107434
PMID:39423955
|
研究论文 | 通过单细胞/核RNA测序比较小鼠和人类大脑周细胞基因表达模式的异同 | 首次系统比较小鼠和人类大脑周细胞的转录组差异,识别物种特异性基因表达模式 | 仅分析成年大脑周细胞,未涵盖发育阶段或其他脑区 | 研究小鼠和人类大脑周细胞基因表达的相似性和差异性 | 小鼠和人类成年大脑周细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四个小鼠和人类大脑周细胞单细胞/核RNA测序数据集 | 10x Genomics,其他 | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium,Smart-seq | 10x单细胞RNA测序平台和Smart-seq单细胞RNA测序平台 |
| 268 | 2025-10-07 |
Development of a prognostic gene signature and exploration of P4HA1 in the modulation of cuproptosis in colorectal cancer
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82625-y
PMID:39738206
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于铜死亡相关基因的预后模型,并探索了P4HA1在结直肠癌铜死亡调控中的作用 | 首次构建了结直肠癌铜死亡相关基因的预后模型,并发现P4HA1作为关键基因调控铜死亡过程 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索铜死亡在结直肠癌中的作用并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组分析,WGCNA,LASSO回归,随机森林,单细胞测序,体外实验 | 预后预测模型 | 转录组数据,临床数据 | TCGA数据库结直肠癌患者数据及两个独立外部验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 269 | 2025-10-07 |
Human Enteric Glia Diversity in Health and Disease: New Avenues for the Treatment of Hirschsprung Disease
2024-Dec-24, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.12.011
PMID:39725172
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了儿童肠道中两种主要肠胶质细胞亚类,并探索了5-HT激动剂对赫希施普龙病的治疗潜力 | 首次在人类肠道中鉴定出施万样肠胶质细胞和经典肠胶质细胞两种主要亚类,发现前者在出生后更为丰富且在赫希施普龙病无神经节段中持续存在 | 样本来源于儿科患者,结果可能不适用于成人群体;斑马鱼模型与人类疾病存在物种差异 | 探索健康与疾病状态下肠胶质细胞的多样性及其在赫希施普龙病治疗中的应用 | 儿科对照组和赫希施普龙病患者的肠道全层切除标本,以及野生型和ret突变斑马鱼 | 单细胞转录组学 | 赫希施普龙病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,荧光原位杂交,荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 儿科对照组和赫希施普龙病患者肠道样本,野生型和ret突变斑马鱼 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 270 | 2025-10-07 |
Identification and validation of up-regulated TNFAIP6 in osteoarthritis with type 2 diabetes mellitus
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82985-5
PMID:39733138
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定并验证了TNFAIP6作为2型糖尿病相关骨关节炎的关键上调基因 | 首次在转录水平系统研究T2DM与OA的关联,发现TNFAIP6作为前肥大软骨细胞标志物在T2DM相关OA中的新作用机制 | 研究样本来源为公共数据库,实验验证仅限于大鼠软骨细胞和人类关节软骨 | 探索2型糖尿病促进骨关节炎进展的分子机制 | 骨关节炎和2型糖尿病患者的基因表达数据、大鼠软骨细胞、人类关节软骨 | 生物信息学 | 骨关节炎, 2型糖尿病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析 | WGCNA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 271 | 2025-10-07 |
A prognostic molecular signature of hepatic steatosis is spatially heterogeneous and dynamic in human liver
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101871
PMID:39657669
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研究论文 | 本研究通过整合临床表型、循环蛋白质组学和组织转录组学,识别出肝脏脂肪变性的动态功能生物标志物 | 发现肝脏脂肪变性的分子特征具有空间异质性和动态性,并建立了与脂肪肝疾病相关的循环多蛋白特征 | NA | 识别肝脏脂肪变性的动态功能生物标志物 | 人类肝脏组织 | 数字病理学 | 脂肪肝疾病 | 多模态成像,蛋白质组学分析,空间转录组学 | NA | 图像,蛋白质组数据,转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,蛋白质组分析 | NA | 人源化'芯片肝脏'模型 |
| 272 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of stem cells from human exfoliated deciduous teeth investigating functional heterogeneity in immunomodulation
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82734-8
PMID:39732760
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人脱落乳牙干细胞在免疫调节中的功能异质性 | 首次在单细胞水平揭示SHED不同分化状态下的免疫调节功能异质性,并与其他人源MSCs进行功能比较 | 仅进行体外实验验证,缺乏体内实验数据支持 | 探究人脱落乳牙干细胞的免疫调节功能异质性 | 人脱落乳牙干细胞(SHED) | 单细胞组学 | 炎症性疾病,自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 273 | 2025-10-07 |
Extrasinusoidal macrophages are a distinct subset of immunologically active dural macrophages
2024-12-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh1129
PMID:39705337
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术鉴定并表征了硬脑膜外窦巨噬细胞这一独特的免疫活性细胞亚群 | 首次发现硬脑膜外窦巨噬细胞在起源、扩增动力学和转录谱方面与软脑膜和中枢神经系统实质巨噬细胞存在显著差异,并揭示其在自身免疫性神经炎症中执行粒细胞凋亡清除功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类硬脑膜巨噬细胞的特性和功能仍需进一步验证 | 探究硬脑膜外窦巨噬细胞的细胞和功能异质性 | 小鼠硬脑膜巨噬细胞 | 免疫学 | 自身免疫性神经炎症 | 单细胞转录组学, 命运图谱, 共聚焦成像, 克隆分析, 转基因小鼠系 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 274 | 2025-10-07 |
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400332
PMID:39465979
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研究论文 | 本研究通过局部控制递送IL-4评估其在牙周病小鼠模型中减少炎症性骨丢失的效果 | 首次将IL-4封装于可生物降解聚合物载体中进行局部持续递送,并证明其能促进牙周组织修复和骨再生 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 评估靶向巨噬细胞的控释药物递送策略在慢性炎症治疗中的可行性 | 牙周病小鼠模型中的巨噬细胞和牙周组织 | 免疫治疗 | 牙周病 | 单细胞RNA测序,药物控释技术 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 275 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals a unique microenvironment in peri-implantitis
2024-12, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13982
PMID:38566468
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示种植体周围炎独特的免疫微环境特征 | 首次通过单细胞分析发现种植体周围炎中CXCL13+成纤维细胞亚群特异性增加,并揭示其通过CXCL8/CXCL6-CXCR2/CXCR1轴招募中性粒细胞的机制 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 揭示种植体周围炎的独特微环境特征 | 种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体的组织活检样本 | 数字病理学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2025-10-07 |
Gpnmb and Spp1 mark a conserved macrophage injury response masking fibrosis-specific programming in the lung
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182700
PMID:39509324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肺损伤后巨噬细胞亚群,揭示了Gpnmb和Spp1标记的巨噬细胞是组织损伤的保守反应而非纤维化特异性程序 | 首次发现巨噬细胞亚群聚类主要由细胞起源和组织分区驱动而非损伤模型,并鉴定出Gpnmb表达巨噬细胞作为组织损伤的保守反应标志 | 研究仅基于小鼠模型和已有的人类数据集,需要进一步实验验证机制 | 探究肺损伤后不同巨噬细胞亚群在健康修复和纤维化修复中的不同作用机制 | 小鼠肺巨噬细胞和人类肺疾病数据集 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS或博来霉素处理的小鼠肺巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 277 | 2025-10-07 |
Predicting lung aging using scRNA-Seq data
2024-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012632
PMID:39700255
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研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序数据的年龄预测回归模型PolyEN | 提出了PolyEN模型,能够学习基因表达随时间的连续表示,并整合基因信息进行年龄预测 | NA | 基于单细胞RNA测序数据预测肺衰老 | 肺上皮细胞和肺内皮细胞 | 机器学习 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-10-07 |
Intrinsic GATA4 expression sensitizes the aortic root to dilation in a Loeys-Dietz syndrome mouse model
2024-Dec, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00562-5
PMID:39567770
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析Loeys-Dietz综合征小鼠模型中血管平滑肌细胞的异质性,揭示GATA4表达如何增加主动脉根部对扩张的敏感性 | 首次发现表达GATA4的血管平滑肌细胞亚群在主动脉根部固有存在,并证明其具有低分化和促炎特征,且GATA4缺失可减轻主动脉根部扩张 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自现有单细胞RNA测序数据集验证 | 探究Loeys-Dietz综合征中主动脉根部特别易发生动脉瘤的分子机制 | Tgfbr1 LDS小鼠模型的主动脉血管平滑肌细胞 | 单细胞转录组学 | Loeys-Dietz综合征 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | LDS小鼠模型主动脉组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 279 | 2025-10-07 |
ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost
2024-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127912
PMID:39326350
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了β-葡聚糖训练通过激活Th17细胞缓解鲆鱼肠道炎症的机制 | 首次在硬骨鱼中发现训练免疫通过调节肠道Th17细胞功能对抗细菌感染的机制 | 研究仅限于鲆鱼模型,尚未在其他物种验证 | 探究硬骨鱼肠道免疫细胞在细菌感染中维持肠道稳态的细胞机制 | 鲆鱼(Scophthalmus maximus)肠道免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肠道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 280 | 2025-10-07 |
Characterization of CD8+ virtual memory T cells in IL-4 knockout mice using single-cell RNA sequencing
2024-12-17, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150950
PMID:39515094
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析IL-4敲除小鼠中CD8+虚拟记忆T细胞的特性 | 首次在IL-4缺陷条件下系统表征外周CD8+虚拟记忆T细胞的分子特征和亚群变化 | 研究仅使用C57BL/6小鼠品系,样本量有限 | 探究IL-4缺失对外周CD8+虚拟记忆T细胞发育和维持的影响机制 | 野生型和IL-4敲除C57BL/6小鼠的脾脏CD8+ T细胞 | 单细胞基因组学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 野生型和IL-4敲除C57BL/6小鼠脾脏CD8+ T细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |