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当前共找到 699 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-07 |
B-Cell Activation Gene Signature in Blood and Liver of Hepatitis B e Antigen-Positive Patients With Immune Active Chronic Hepatitis B
2024-Dec-16, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae280
PMID:38847286
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研究论文 | 本研究通过分析慢性乙型肝炎患者血液和肝脏中B细胞的基因表达谱，揭示了免疫活跃期患者的B细胞激活特征 | 首次在慢性乙型肝炎患者中同时分析血液和肝脏B细胞的基因表达特征，并通过单细胞RNA测序技术识别了naive和记忆B细胞亚群作为主要特征携带者 | 样本量有限，研究主要关注免疫活跃期患者，未涵盖所有慢性HBV感染阶段 | 探究慢性乙型肝炎患者B细胞的激活状态及其在HBV感染中的免疫反应特征 | 免疫活跃期慢性乙型肝炎患者和健康对照者的血液及肝脏B细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | RNA测序, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 慢性乙型肝炎患者和健康对照者样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 | NA | NA |
| 262 | 2025-02-14 |
Reconstruction of gene regulatory networks from single cell transcriptomic data
2024-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/vjgb-24-104
PMID:39944798
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综述 | 本文综述了从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据重建基因调控网络（GRNs）的方法和程序 | 本文特别关注了利用其他组学数据（主要是转录因子结合位点和开放染色质图谱）来提高单细胞转录组数据重建GRN的准确性 | 单细胞组学数据的技术和生物学特性需要特定的GRN推断方法 | 理解和研究细胞在发育过程中及响应各种内外刺激时使用的机制 | 基因调控网络（GRNs） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomes of dissecting the intra-tumoral heterogeneity of breast cancer microenvironment
2024-Dec-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06015-7
PMID:39724260
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示乳腺癌肿瘤微环境的瘤内异质性 | 首次构建包含54,055个细胞的乳腺癌单细胞转录组图谱，识别了恶性上皮细胞的六种共同表达程序和六种亚型特异性表达程序 | 样本量较小（仅4例恶性患者和4例非恶性患者），需要更大规模研究验证 | 研究乳腺癌异质性在单细胞转录组中的形成机制和作用 | 乳腺癌临床标本中的细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 54,055个高质量细胞，来自4例恶性和4例非恶性患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 264 | 2025-10-07 |
Case study of a neuroendocrine tumor of uncertain origin: single-cell transcriptomics unravels potential primary location
2024-Dec-31, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06071-z
PMID:39738894
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案例研究 | 通过单细胞转录组学技术确定一例来源不明的神经内分泌肿瘤的原发部位 | 首次将单细胞RNA测序和全外显子组测序结合用于神经内分泌肿瘤的原发部位鉴定 | 仅为一例个案研究，需要更大样本量验证 | 确定非器官局限性神经内分泌肿瘤的原发来源以指导精准诊疗 | 一例位于十二指肠和胰头之间的腹膜后非功能性神经内分泌肿瘤 | 单细胞转录组学 | 神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | 分子基因特征分类模型 | 单细胞转录组数据, 外显子组数据 | 1例神经内分泌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 265 | 2025-10-07 |
Identification of psoriasis-associated immune marker G3BP2 through single-cell RNA sequencing and meta analysis
2024-12, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13851
PMID:39267394
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和荟萃分析识别与银屑病相关的免疫标志物G3BP2 | 首次结合单细胞RNA测序和荟萃分析方法，在细胞水平阐明银屑病潜在机制并识别关键免疫调控标志基因 | 样本量相对有限（12例患者），机制研究主要基于生物信息学分析 | 探索银屑病发病机制并识别有效治疗靶点 | 银屑病患者皮肤组织样本 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 荟萃分析, WGCNA, LASSO回归, ROC分析 | PCA, tSNE, WGCNA, LASSO | 基因表达数据 | 12例银屑病患者皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 266 | 2025-10-07 |
InTraSeq: A Multimodal Assay that Uncovers New Single-Cell Biology and Regulatory Mechanisms
2024-Dec-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5284652/v1
PMID:39711533
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型多模态单细胞测序技术InTraSeq，能够同时测量单个细胞中的mRNA、表面标志物、细胞质蛋白和核蛋白 | 开发了能够同时测量细胞内mRNA和多种蛋白质（包括翻译后修饰和转录因子）的多模态单细胞测序技术 | NA | 开发和应用多模态单细胞测序技术以更全面地研究细胞功能和调控机制 | Th17细胞分化过程中的细胞状态和调控机制 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，多模态单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 超过85,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，多模态单细胞分析 | InTraSeq | 基于寡核苷酸条形码抗体的多模态单细胞测序技术 |
| 267 | 2025-10-07 |
Biophysical model for joint analysis of chromatin and RNA sequencing data
2024-Dec, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.110.064405
PMID:39916216
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研究论文 | 提出一种用于联合分析染色质和RNA测序数据的生物物理模型 | 开发了能够参数化多组学数据的染色质动力学和转录生物物理模型，并评估多组学数据相对于非配准单细胞测序的优势 | 模型主要应用于单细胞ATAC-seq数据，对其他模态数据的整合验证有限 | 开发联合分析染色质可及性和基因表达数据的计算方法 | 单细胞多组学测序数据和非配准单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学测序 | 生物物理模型 | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 268 | 2025-02-07 |
Application of deep learning models on single-cell RNA sequencing analysis uncovers novel markers of double negative T cells
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82406-7
PMID:39732739
|
研究论文 | 本研究应用深度学习模型分析单细胞RNA测序数据，揭示了C57BL/6小鼠脾脏双阴性T细胞的新标记物 | 使用深度学习模型scVI捕捉非线性基因表达模式，发现了新的双阴性T细胞亚群标记物，并通过流式细胞术验证 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证较少 | 揭示双阴性T细胞的新标记物及其在自身免疫中的潜在作用 | C57BL/6小鼠和MRL/lpr小鼠的双阴性T细胞 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Single Cell Variational Inference (scVI) | 基因表达数据 | C57BL/6小鼠和MRL/lpr小鼠的双阴性T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2025-02-06 |
Dendritic cells type 1 control the formation, maintenance, and function of tertiary lymphoid structures in cancer
2024-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.628014
PMID:39763802
|
研究论文 | 本文研究了在癌症中1型树突状细胞（cDC1）对三级淋巴结构（TLS）形成、维持和功能的关键作用 | 揭示了cDC1在肿瘤早期和进展阶段对TLS形成和维持的不同机制，并提出了cDC1靶向治疗作为增强TLS功能和抗肿瘤免疫的潜在策略 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类癌症患者中验证 | 探讨1型树突状细胞在癌症中三级淋巴结构形成和维持中的作用 | 非小细胞肺癌（NSCLC）小鼠模型 | 免疫学 | 肺癌 | 空间转录组学、多重成像 | 小鼠模型 | 图像、转录组数据 | 多种人类肿瘤样本及小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2025-10-07 |
Integration of bulk and single-cell RNA-seq reveals prognostic gene signatures in patients with bladder cancer treated with immune checkpoint inhibitors
2024-Dec-21, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03839-7
PMID:39708127
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA-seq数据，开发了膀胱癌免疫检查点抑制剂治疗的预后基因标志物 | 首次结合bulk和单细胞RNA-seq数据识别与膀胱癌免疫治疗预后相关的基因特征，并联合肿瘤突变负荷进行综合预后评估 | 研究依赖于公共数据集，需要进一步的前瞻性验证 | 开发可靠的生物标志物以改善膀胱癌免疫检查点抑制剂治疗的预后分层 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CIBERSORT分析 | 基因特征评分模型 | 基因表达数据 | 多个公共数据集（GSE176307, GSE135337）和两个独立验证数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 271 | 2025-10-07 |
Decoding the muscle transcriptome of patients with late-onset Pompe disease reveals markers of disease progression
2024-Dec-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae249
PMID:39045638
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了晚发型庞贝病肌肉转录组特征及疾病进展标志物 | 首次应用单核RNA测序技术研究LOPD患者骨骼肌细胞的转录异质性，并结合空间转录组学技术定位病理改变 | 样本量较小（8例患者和4例对照），需要更大规模研究验证发现 | 揭示晚发型庞贝病肌肉损伤的分子病理生理机制 | 晚发型庞贝病患者的肌肉活检样本和健康对照肌肉样本 | 数字病理学 | 庞贝病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 组织学图像 | 8例LOPD患者肌肉活检样本和4例健康对照肌肉样本 | NanoString | 单核RNA测序, 空间转录组学 | GeoMx | 单核RNA测序结合GeoMx空间转录组学平台 |
| 272 | 2025-10-07 |
AnnoGCD: a generalized category discovery framework for automatic cell type annotation
2024-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae166
PMID:39660254
|
研究论文 | 提出了一种名为AnnoGCD的计算框架，用于单细胞RNA测序数据的自动细胞类型注释 | 结合广义类别发现和异常检测，能够在半监督设置下同时分类已知细胞类型和发现新细胞类型 | 仅在五个人类单细胞RNA测序数据集和一个小鼠模型图谱上进行了评估 | 开发自动细胞类型注释的计算框架 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 半监督学习，广义类别发现，异常检测 | 单细胞RNA测序数据 | 五个人类数据集和一个小鼠图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-07 |
Exploring transcription modalities from bimodal, single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae179
PMID:39703422
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研究论文 | 本研究提出了一种椭圆参数化方法来分析双模态单细胞RNA测序数据，揭示了四种不同的转录模式 | 首次利用双模态单细胞RNA测序数据的二维形状信息，发现了四种可解释的转录模式 | 仅在细胞周期和结直肠癌两个数据集中进行了验证，需要更多数据集验证普适性 | 探索双模态单细胞RNA测序数据中的转录模式及其生物学意义 | 细胞周期数据集和结直肠癌数据集中的基因表达模式 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 椭圆参数化方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-02-05 |
Development of a deep learning-based 1D convolutional neural network model for cross-species natural killer T cell identification using peripheral blood mononuclear cell single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, Veterinary world
IF:1.7Q2
DOI:10.14202/vetworld.2024.2846-2857
PMID:39897371
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研究论文 | 本研究开发了一种基于一维卷积神经网络（1DCNN）的模型，用于跨物种识别自然杀伤T细胞（NKT细胞），并利用外周血单核细胞（PBMC）的单细胞RNA测序数据进行验证 | 首次应用1DCNN模型进行跨物种NKT细胞识别，并成功识别了人类、犬类和猪类PBMC中的NKT细胞 | 需要进一步研究验证这些发现，并且模型在其他细胞类型识别中的应用尚未验证 | 开发一种用于跨物种NKT细胞识别的深度学习模型 | 人类、犬类和猪类的外周血单核细胞（PBMC） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 1DCNN | RNA测序数据 | 人类、犬类和猪类的PBMC数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2025-02-04 |
Combined Autophagy Inhibition and Dendritic Cell Recruitment Induces Antitumor Immunity and Enhances Immune Checkpoint Blockade Sensitivity in Pancreatic Cancer
2024-Dec-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0830
PMID:39288081
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研究论文 | 本研究探讨了自噬抑制与树突状细胞招募相结合在胰腺癌中的抗肿瘤免疫效应及其对免疫检查点阻断敏感性的增强作用 | 通过单细胞RNA测序揭示了自噬抑制在癌细胞中诱导树突状细胞激活的机制，并提出了三重疗法（氯喹、Flt3配体和抗LAG3抗体）显著抑制胰腺导管腺癌生长的创新治疗策略 | 自噬抑制在癌细胞中同时诱导了CD8+ T细胞耗竭，这可能限制了其长期疗效 | 研究自噬抑制与树突状细胞激活相结合在胰腺癌中的抗肿瘤免疫效应及其对免疫检查点阻断敏感性的增强作用 | 胰腺导管腺癌（PDAC）小鼠模型和人类PDAC肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-11-15 |
[Molecular pathology of skin fragility]
2024-Dec, Dermatologie (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1007/s00105-024-05425-5
PMID:39510987
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综述 | 本文综述了皮肤脆弱性的分子病理学，重点关注皮肤屏障功能的维持及其相关遗传和自身免疫疾病 | 本文结合现代技术如单细胞和空间转录组学以及人工智能算法，推进了人类皮肤的分子图谱研究 | NA | 探讨皮肤脆弱性的分子机制及其相关疾病 | 皮肤屏障功能、遗传和自身免疫疾病、皮肤粘附结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 人工智能算法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2025-10-07 |
Reduced TRIM expression correlates with anomalous CD4 T cell activation in systemic lupus Erythematosus and its clinical diagnostic potential
2024-12, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106913
PMID:39233252
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研究论文 | 本研究探讨了TRIM分子在系统性红斑狼疮患者CD4+T细胞中的表达特征及其临床诊断价值 | 首次揭示TRIM表达与CD4+T细胞异常活化的关联，并证明其在SLE临床鉴别诊断中的潜力 | 样本来源包括人和小鼠，但具体样本数量未明确说明 | 阐明TRIM在SLE患者CD4+T细胞中的表达、功能和临床相关性 | 系统性红斑狼疮患者、健康对照者和类风湿关节炎患者的PBMCs及小鼠外周血和脾脏CD4+T细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | SLE患者、健康对照和RA患者的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 278 | 2025-10-07 |
Intratumoural CD8+ CXCR5+ follicular cytotoxic T cells have prognostic value and are associated with CD19+ CD38+ B cells and tertiary lymphoid structures in colorectal cancer
2024-Dec-30, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03887-z
PMID:39739032
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中CD8+ CXCR5+滤泡细胞毒性T细胞的预后价值及其与B细胞和三级淋巴结构的关系 | 首次系统比较TFC细胞在MSI-high和MSS结直肠癌中的生物学功能差异，并建立了预后预测模型 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步验证 | 探索TFC细胞在结直肠癌中的特征及其在MSI-high和MSS亚型中的生物学功能差异 | 结直肠癌患者肿瘤组织和外周血样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 共培养实验 | 预测模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 临床队列和公共数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 279 | 2025-10-07 |
TNFα has differential effects on the transcriptome profile of selected populations in murine cartilage
2024-Dec, Osteoarthritis and cartilage open
DOI:10.1016/j.ocarto.2024.100528
PMID:39494399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析TNFα对小鼠软骨细胞转录组的差异影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示TNFα对骨骺软骨细胞不同亚群的差异调控作用 | 研究仅使用新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞，未验证其他年龄或物种 | 探究TNFα在软骨细胞炎症反应中的作用机制 | 新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 14,239个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 280 | 2025-10-07 |
Transcriptional Profiling of Testis Development in Pre-Sexually-Mature Hezuo Pig
2024-Dec-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47010010
PMID:39852125
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析合作猪青春期前睾丸发育的转录组特征 | 首次在合作猪中应用单细胞RNA测序技术解析睾丸细胞异质性，揭示了Leydig细胞和肌样细胞共同祖细胞来源 | 仅分析了一个月龄的青春期前样本，缺乏发育时间序列数据 | 探究合作猪睾丸发育过程中不同细胞类型的转录变化 | 合作猪睾丸组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14,276个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |