本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-02-04 |
Combined Autophagy Inhibition and Dendritic Cell Recruitment Induces Antitumor Immunity and Enhances Immune Checkpoint Blockade Sensitivity in Pancreatic Cancer
2024-Dec-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0830
PMID:39288081
|
研究论文 | 本研究探讨了自噬抑制与树突状细胞招募相结合在胰腺癌中的抗肿瘤免疫效应及其对免疫检查点阻断敏感性的增强作用 | 通过单细胞RNA测序揭示了自噬抑制在癌细胞中诱导树突状细胞激活的机制,并提出了三重疗法(氯喹、Flt3配体和抗LAG3抗体)显著抑制胰腺导管腺癌生长的创新治疗策略 | 自噬抑制在癌细胞中同时诱导了CD8+ T细胞耗竭,这可能限制了其长期疗效 | 研究自噬抑制与树突状细胞激活相结合在胰腺癌中的抗肿瘤免疫效应及其对免疫检查点阻断敏感性的增强作用 | 胰腺导管腺癌(PDAC)小鼠模型和人类PDAC肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-11-15 |
[Molecular pathology of skin fragility]
2024-Dec, Dermatologie (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1007/s00105-024-05425-5
PMID:39510987
|
综述 | 本文综述了皮肤脆弱性的分子病理学,重点关注皮肤屏障功能的维持及其相关遗传和自身免疫疾病 | 本文结合现代技术如单细胞和空间转录组学以及人工智能算法,推进了人类皮肤的分子图谱研究 | NA | 探讨皮肤脆弱性的分子机制及其相关疾病 | 皮肤屏障功能、遗传和自身免疫疾病、皮肤粘附结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 人工智能算法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2025-10-07 |
A novel biomarker of COVI-19: MMP8 emerged by integrated bulk RNAseq and single-cell sequencing
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82227-8
PMID:39730651
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞测序技术,发现MMP8是COVID-19的新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合bulk和单细胞测序数据揭示MMP8在COVID-19中的核心作用,并发现其通过RETN-TLR4和RETN-CAP1配体-受体模式介导细胞间相互作用 | 未明确说明样本量大小,需要进一步实验验证MMP8的具体功能机制 | 探索COVID-19的病理进展和分子改变,寻找诊断和治疗靶点 | 健康供体、非重症和重症COVID-19患者 | 生物信息学 | COVID-19 | bulk RNA-seq, 单细胞测序 | 差异表达基因分析, 分子相互作用网络分析 | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 244 | 2025-10-07 |
Reduced TRIM expression correlates with anomalous CD4 T cell activation in systemic lupus Erythematosus and its clinical diagnostic potential
2024-12, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106913
PMID:39233252
|
研究论文 | 本研究探讨了TRIM分子在系统性红斑狼疮患者CD4+T细胞中的表达特征及其临床诊断价值 | 首次揭示TRIM表达与CD4+T细胞异常活化的关联,并证明其在SLE临床鉴别诊断中的潜力 | 样本来源包括人和小鼠,但具体样本数量未明确说明 | 阐明TRIM在SLE患者CD4+T细胞中的表达、功能和临床相关性 | 系统性红斑狼疮患者、健康对照者和类风湿关节炎患者的PBMCs及小鼠外周血和脾脏CD4+T细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | SLE患者、健康对照和RA患者的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 245 | 2025-10-07 |
Intratumoural CD8+ CXCR5+ follicular cytotoxic T cells have prognostic value and are associated with CD19+ CD38+ B cells and tertiary lymphoid structures in colorectal cancer
2024-Dec-30, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03887-z
PMID:39739032
|
研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中CD8+ CXCR5+滤泡细胞毒性T细胞的预后价值及其与B细胞和三级淋巴结构的关系 | 首次系统比较TFC细胞在MSI-high和MSS结直肠癌中的生物学功能差异,并建立了预后预测模型 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 探索TFC细胞在结直肠癌中的特征及其在MSI-high和MSS亚型中的生物学功能差异 | 结直肠癌患者肿瘤组织和外周血样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 共培养实验 | 预测模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 临床队列和公共数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-10-07 |
TNFα has differential effects on the transcriptome profile of selected populations in murine cartilage
2024-Dec, Osteoarthritis and cartilage open
DOI:10.1016/j.ocarto.2024.100528
PMID:39494399
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析TNFα对小鼠软骨细胞转录组的差异影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示TNFα对骨骺软骨细胞不同亚群的差异调控作用 | 研究仅使用新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞,未验证其他年龄或物种 | 探究TNFα在软骨细胞炎症反应中的作用机制 | 新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 14,239个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2025-10-07 |
Transcriptional Profiling of Testis Development in Pre-Sexually-Mature Hezuo Pig
2024-Dec-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47010010
PMID:39852125
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析合作猪青春期前睾丸发育的转录组特征 | 首次在合作猪中应用单细胞RNA测序技术解析睾丸细胞异质性,揭示了Leydig细胞和肌样细胞共同祖细胞来源 | 仅分析了一个月龄的青春期前样本,缺乏发育时间序列数据 | 探究合作猪睾丸发育过程中不同细胞类型的转录变化 | 合作猪睾丸组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14,276个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 248 | 2025-10-07 |
SSL5-AnxA5 Fusion Protein Constructed Based on Human Atherosclerotic Plaque scRNA-Seq Data Preventing the Binding of Apoptotic Endothelial Cells, Platelets, and Inflammatory Cells
2024-Dec-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13010008
PMID:39857592
|
研究论文 | 基于人动脉粥样硬化斑块单细胞测序数据构建SSL5-AnxA5融合蛋白,用于阻止凋亡内皮细胞、血小板和炎症细胞的结合 | 首次基于人动脉粥样硬化斑块单细胞测序数据构建双功能融合蛋白SSL5-AnxA5,能够同时靶向PSGL1和凋亡细胞 | 研究主要基于体外实验,需要进一步的体内验证 | 开发预防斑块破裂后动脉阻塞的新型治疗蛋白 | 人动脉粥样硬化斑块、凋亡内皮细胞、血小板、炎症细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, PCR, Western blot, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | 从GEO数据库获取的SAP和ACS患者斑块单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-10-07 |
Disruption of immune responses by type 1 diabetes exacerbates SARS-CoV-2 mediated lung injury
2024-Dec-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00250.2024
PMID:39320093
|
研究论文 | 本研究探讨1型糖尿病如何通过破坏免疫反应加剧SARS-CoV-2感染引起的肺损伤 | 开发了用于高度固定组织流式细胞分析的新技术,并首次在糖尿病模型中揭示炎症性巨噬细胞特征与COVID-19严重程度的关联 | 研究使用小鼠模型,结果可能不能完全适用于人类;组织分析受生物安全限制 | 评估1型糖尿病对COVID-19肺炎严重程度的影响机制 | 野生型小鼠感染小鼠适应型SARS-CoV-2的糖尿病模型 | 免疫学 | COVID-19肺炎 | 转录组分析,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 糖尿病和正常血糖小鼠对照研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 250 | 2025-10-07 |
DDO1002, an NRF2-KEAP1 inhibitor, improves hematopoietic stem cell aging and stress response
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae043
PMID:39872153
|
研究论文 | 本研究探讨NRF2-KEAP1抑制剂DDO1002在改善造血干细胞衰老和应激反应中的作用 | 首次揭示DDO1002通过激活NRF2-ARE通路改善衰老造血干细胞功能并缓解辐射诱导的造血损伤 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果仍需验证 | 探究DDO1002对造血干细胞衰老和辐射损伤的保护作用 | 造血干细胞(HSCs),特别是衰老小鼠的造血干细胞 | 干细胞生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞测序,竞争性移植实验 | NA | 基因表达数据,细胞功能数据 | 衰老小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 251 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intercellular crosstalk and the regulatory landscape of stromal cells during the whole life of the mouse ovary
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae041
PMID:39872151
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠卵巢整个生命周期中基质细胞的细胞间通讯和调控景观 | 首次整合从胚胎期到老年期的单细胞RNA测序数据,系统描绘卵巢基质细胞的发育轨迹和细胞间通讯网络,并鉴定出CD24阳性间充质祖细胞作为基质细胞起源 | 研究主要基于小鼠模型,人类卵巢中的情况可能需要进一步验证 | 探索卵巢基质细胞的异质性、发育轨迹和细胞间通讯网络 | 小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 卵巢衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从胚胎11.5天到12月龄小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2025-10-07 |
Spatial multi-omics characterizes GPR35-relevant lipid metabolism signatures across liver zonation in MASLD
2024-Dec, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loae021
PMID:39873004
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了GPR35在MASLD中调控肝脏分区特异性脂质代谢的机制 | 首次结合空间转录组学、空间代谢组学和脂质代谢组学,在肝脏分区水平上系统解析GPR35调控MASLD进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;机制研究仍需进一步功能实验证实 | 阐明GPR35在代谢功能障碍相关脂肪肝病中调控肝脏分区特异性基因表达和代谢物分布的机制 | 小鼠肝脏组织,重点关注GPR35缺陷模型在MASLD进展中的变化 | 空间多组学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 空间转录组学,空间代谢组学,脂质代谢组学 | NA | 空间基因表达数据,空间代谢物分布数据 | GPR35缺陷小鼠模型 | NA | 空间转录组学,空间代谢组学 | NA | NA |
| 253 | 2025-10-07 |
Human-Mouse Chimeric Brain Models to Study Human Glial-Neuronal and Macroglial-Microglial Interactions
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.03.601990
PMID:39005270
|
研究论文 | 通过构建人鼠嵌合脑模型研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用机制 | 开发了同时移植人类诱导多能干细胞来源的神经祖细胞和原始巨噬细胞祖细胞的新型共移植模型,首次在体内观察到人类小胶质细胞修剪人类神经元突触并吞噬神经元的现象 | 使用小鼠作为宿主环境可能无法完全模拟人类大脑的复杂微环境 | 研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用及其在神经系统疾病中的作用 | 人鼠嵌合脑模型中的人类神经细胞(神经元、小胶质细胞、大胶质细胞) | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,超分辨率成像,3D重建技术,细胞间通讯分析 | 人鼠嵌合脑模型 | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing algorithms underestimate changes in transcriptional noise compared to single-molecule RNA imaging
2024-Dec-16, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100933
PMID:39662473
|
研究论文 | 比较单细胞RNA测序算法与单分子RNA成像在转录噪声量化方面的差异 | 首次系统比较多种scRNA-seq算法与smFISH在量化转录噪声变化方面的性能差异 | 所有scRNA-seq算法均系统性低估噪声变化,且仅测试了代表性基因面板 | 评估基因组范围内转录噪声的最佳量化方法 | 人类和小鼠数据集中的基因表达噪声 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子RNA荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, smFISH | NA | NA |
| 255 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes
2024-Dec, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003
PMID:39426602
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示生殖器疱疹患者免疫细胞多样性和系统性免疫反应特征 | 首次在单细胞水平系统分析生殖器疱疹患者外周血免疫细胞的转录组特征,发现特定免疫细胞亚群的激活状态和关键信号通路变化 | 样本量相对有限,主要关注外周血免疫细胞而未直接研究局部感染部位的免疫反应 | 探究HSV-2感染和复发过程中免疫系统的应答机制 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, ELISA | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 256 | 2025-10-07 |
Gene regulatory network inference based on novel ensemble method
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae036
PMID:39324652
|
研究论文 | 提出一种基于13种基础分类方法和灵活神经树的集成方法用于提高基因调控网络识别准确率 | 开发了基于基因编程变体和粒子群优化的混合进化算法来搜索最优灵活神经树模型 | NA | 提高基因调控网络识别准确率 | 基因调控网络 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 集成学习,灵活神经树,粒子群优化 | 基因表达数据 | 三个模拟数据集和三个真实单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 257 | 2025-10-07 |
Evolutionary diversity of CXCL16-CXCR6: Convergent substitutions and recurrent gene loss in sauropsids
2024-12, Immunogenetics
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s00251-024-01357-5
PMID:39400711
|
研究论文 | 本研究通过比较约400个脊椎动物CXCR6直系同源基因,揭示了CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性和基因丢失现象 | 首次在脊椎动物广泛尺度上揭示CXCR6的DRF基序非普遍性,发现鸟类中反复发生的CXCR6基因丢失现象 | 研究主要基于基因序列分析,功能验证实验相对有限 | 探究CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化历程和多样性 | 约400个脊椎动物的CXCR6直系同源基因 | 进化生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因序列比对 | NA | 基因序列数据,单细胞RNA测序数据 | 涵盖36个鸟类目和多种脊椎动物的约400个CXCR6直系同源基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2025-10-07 |
Initial regional cytoarchitectonic differences in dorsal and orbitobasal human developing frontal cortex revealed by spatial transcriptomics
2024-Dec-18, Brain structure & function
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00429-024-02865-6
PMID:39692769
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示人类胚胎发育期前额叶皮层背侧和眶基底区域早期细胞构筑差异 | 首次在转录组水平发现人类胚胎前额叶皮层背侧和眶基底区域瞬时细胞区室的基因表达差异,证实前额叶皮层区域特化在胎儿发育早期即已出现 | 研究仅聚焦于15孕周这一特定发育时期,样本量有限 | 探究人类胚胎前额叶皮层背侧和眶基底区域细胞构筑特征的转录组基础 | 人类胚胎发育期前额叶皮层组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 15孕周人类胚胎前额叶皮层样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler空间转录组分析平台 |
| 259 | 2025-10-07 |
Mesenchymal Traits as an Intrinsic Feature of Undifferentiated Cells
2024-Dec-24, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb13010001
PMID:39846630
|
研究论文 | 本研究通过分析公开单细胞转录组数据集,探讨间充质表型与未分化细胞状态的内在联系 | 挑战传统观点,提出间充质表型不仅是结构支持特征,更是未分化多能状态的形态学表达 | 基于公开数据集的分析,缺乏实验验证 | 探索间充质表型在胚胎发育和成体器官中与细胞未分化状态的关系 | 早期胚胎阶段和成体组织的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 公开单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2025-10-07 |
Construction of a neutrophil extracellular trap formation-related gene model for predicting the survival of lung adenocarcinoma patients and their response to immunotherapy
2024-Dec-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-463
PMID:39830760
|
研究论文 | 基于中性粒细胞胞外诱捕网形成相关基因构建肺腺癌患者生存预测和免疫治疗反应评估模型 | 首次利用中性粒细胞胞外诱捕网形成相关基因构建肺腺癌预后特征模型,并验证其在预测免疫治疗反应方面的价值 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 构建肺腺癌预后预测模型并评估免疫治疗反应 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,生物信息学分析 | LASSO Cox回归模型,风险评分模型 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |