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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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241 | 2024-12-16 |
Novel insights into Cntnap4 in Alzheimer's disease: Intestinal flora interaction
2024-Dec-06, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138508
PMID:39647729
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、高通量转录组测序、16s rRNA测序和动物实验,探讨了Cntnap4基因在阿尔茨海默病中的作用及其与肠道菌群的相互作用 | 首次揭示了Cntnap4基因在阿尔茨海默病中的关键作用,并发现了肠道菌群与疾病进展之间的潜在联系 | 研究主要基于动物模型,需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨Cntnap4基因在阿尔茨海默病中的作用及其与肠道菌群的相互作用 | Cntnap4基因、肠道菌群、阿尔茨海默病小鼠模型 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、高通量转录组测序、16s rRNA测序 | NA | RNA序列 | 阿尔茨海默病小鼠和对照小鼠 |
242 | 2024-12-16 |
PPARα agonist ameliorates cholestatic liver injury by regulating hepatic macrophage homeostasis
2024-Dec-06, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138510
PMID:39647740
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研究论文 | 本研究探讨了PPARα激动剂通过调节肝巨噬细胞稳态减轻胆汁淤积性肝损伤的机制 | 首次揭示了PPARα激动剂通过抑制炎症反应、减少中性粒细胞浸润和促进M2样巨噬细胞极化来减轻胆汁淤积性肝损伤的免疫调节机制 | 研究仅在动物模型中进行,尚未在人体中验证 | 探讨PPARα激动剂减轻胆汁淤积性肝损伤的免疫调节机制 | 胆汁淤积性肝损伤的小鼠模型 | NA | 肝病 | CyTOF分析、scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 小鼠模型 |
243 | 2024-12-16 |
Single-nucleus chromatin accessibility and transcriptomic map of breast tissues of women of diverse genetic ancestry
2024-Dec, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03011-9
PMID:39122969
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研究论文 | 研究通过单核分析技术构建了不同遗传背景女性的乳腺组织染色质可及性和基因表达图谱 | 首次系统性地分析了不同遗传背景女性的乳腺组织中染色质可及性和基因表达的关系,并发现了新的细胞类型标记和基因调控网络 | 研究样本仅来自92名女性,可能无法全面代表所有遗传背景的多样性 | 探索不同遗传背景女性的乳腺组织中染色质可及性和基因表达的差异 | 不同遗传背景女性的乳腺组织 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 92名女性 |
244 | 2024-12-16 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Pivotal Role of DOCK2 in Sjögren Disease
2024-Dec, ACR open rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/acr2.11738
PMID:39382155
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了DOCK2在干燥综合征中的关键作用,并验证了DOCK2抑制剂在SjD小鼠模型中的治疗效果 | 首次揭示了DOCK2在CD8+ T细胞中的高表达与干燥综合征的关联,并验证了DOCK2抑制剂在缓解疾病症状中的有效性 | 研究仅在SjD小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证DOCK2抑制剂的疗效 | 解析干燥综合征唾液腺中的致病细胞群体及其免疫通路,并探索DOCK2作为潜在治疗靶点的可能性 | 干燥综合征小鼠模型的唾液腺免疫细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 干燥综合征小鼠模型的唾液腺免疫细胞 |
245 | 2024-12-15 |
Dynamic changes in serum adenosine and the adenosine metabolism-based signature for prognosis in HER2-positive metastatic breast cancer patients
2024-Dec-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39545
PMID:39669152
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研究论文 | 研究探讨了HER2阳性转移性乳腺癌患者中血清腺苷及其代谢相关标志物在预后中的作用 | 首次动态监测HER2阳性转移性乳腺癌患者的血清腺苷水平,并验证了其在曲妥珠单抗治疗中的预测价值 | 研究样本量较小,且仅限于HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 探索腺苷在HER2阳性转移性乳腺癌中的预后意义及其在曲妥珠单抗治疗中的预测作用 | HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | DESeq2 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 109名HER2阳性转移性乳腺癌患者 |
246 | 2024-12-15 |
Cancer specific up-regulated lactate genes associated with immunotherapy resistance in a pan-cancer analysis
2024-Dec-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39491
PMID:39669156
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研究论文 | 本文通过比较TCGA队列中的恶性组织和正常组织,定义了一个泛癌上调乳酸评分,并评估了其在非小细胞肺癌、转移性肾癌、膀胱癌和黑色素瘤中的免疫治疗效果 | 首次识别出癌症内在的乳酸特征,并揭示了其与免疫检查点抑制剂抵抗的相关性 | 研究主要基于TCGA和CPTAC数据集,可能存在数据偏倚;验证性研究仅限于NSCLC队列 | 识别与免疫治疗抵抗相关的癌症特异性上调乳酸基因,并探讨其潜在机制 | 非小细胞肺癌、转移性肾癌、膀胱癌和黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 转录组学和蛋白质组学数据 | 涉及TCGA、CPTAC以及内部NSCLC队列的多个样本 |
247 | 2024-12-15 |
O-GlcNAcylation stabilized WTAP promotes GBM malignant progression in an N6-methyladenosine-dependent manner
2024-Dec-13, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae268
PMID:39671515
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研究论文 | 本文研究了O-GlcNAcylation稳定WTAP通过N6-甲基腺苷依赖的方式促进胶质母细胞瘤恶性进展的机制 | 首次揭示了WTAP通过O-GlcNAcylation和去泛素化协同增强其蛋白稳定性,进而通过m6A修饰促进LOXL2 mRNA稳定性和蛋白分泌,从而调控胶质母细胞瘤干细胞和巨噬细胞的相互作用 | 实验主要在体外和体内模型中进行,缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨WTAP在胶质母细胞瘤恶性进展中的作用及其机制,并评估其作为免疫治疗靶点的潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞、巨噬细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、质谱、RNA免疫沉淀、共免疫沉淀 | NA | RNA | 涉及单细胞和bulk RNA测序数据,具体样本数量未明确 |
248 | 2024-12-15 |
Elevated Fcy receptor expression augments pro-inflammatory macrophage phagocytosis in systemic sclerosis and associated rheumatic diseases
2024-Dec-13, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae688
PMID:39672802
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研究论文 | 研究系统性硬化症(SSc)和其他风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型,揭示其激活、信号通路和治疗反应的机制 | 首次揭示了FcγR表达的巨噬细胞在SSc中的促吞噬和促炎作用,并提出了尼达尼布可能的治疗潜力 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据,缺乏体内实验验证 | 揭示驱动系统性硬化症和其他风湿性疾病中巨噬细胞增强吞噬作用的机制 | 系统性硬化症(SSc)、类风湿性关节炎(RA)、银屑病关节炎(PsA)和轴性脊柱炎(axSpA)患者的巨噬细胞 | NA | 风湿性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、RT-qPCR、Western blot | NA | RNA | 健康对照和SSc患者的皮肤和肺巨噬细胞,以及来自健康对照、SSc、RA、PsA和axSpA患者的单核细胞衍生的巨噬细胞 |
249 | 2024-12-15 |
Methionine-driven YTHDF1 expression facilitates bladder cancer progression by attenuating RIG-I-modulated immune responses and enhancing the eIF5B-PD-L1 axis
2024-Dec-13, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01434-y
PMID:39672819
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研究论文 | 本研究探讨了蛋氨酸对膀胱癌免疫治疗的影响,发现蛋氨酸通过上调YTHDF1表达,抑制RIG-I介导的I型干扰素通路,并增强eIF5B-PD-L1轴,从而促进膀胱癌进展 | 首次揭示了蛋氨酸通过YTHDF1调控RIG-I和eIF5B-PD-L1轴,抑制膀胱癌免疫治疗的机制,并提出了靶向蛋氨酸 depletion 的治疗策略 | 研究主要基于体外实验和动物模型,需进一步验证在人体中的有效性和安全性 | 探讨蛋氨酸对膀胱癌免疫治疗的影响及其分子机制 | 膀胱癌及其免疫治疗 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫沉淀、质谱分析 | NA | RNA | 包括MB49小鼠肿瘤模型和膀胱癌免疫治疗患者样本 |
250 | 2024-12-15 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional changes in circulating immune cells from patients with severe asthma induced by biologics
2024-Dec-13, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01368-y
PMID:39672815
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了严重嗜酸性粒细胞性哮喘患者在接受生物制剂治疗后外周血免疫细胞的转录变化 | 首次揭示了靶向T2的生物制剂在治疗严重嗜酸性粒细胞性哮喘时对循环免疫细胞中NF-κB信号通路相关基因表达的抑制作用 | 样本量较小,且仅关注了特定类型的生物制剂,未来需要进一步研究以确定与治疗反应和长期结果相关的潜在生物标志物 | 描述靶向T2的生物制剂对血液免疫细胞基因表达的影响 | 严重嗜酸性粒细胞性哮喘患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8名接受生物制剂治疗的严重嗜酸性粒细胞性哮喘患者的外周血单核细胞 |
251 | 2024-12-15 |
Author Correction: Dissection of artifactual and confounding glial signatures by single-cell sequencing of mouse and human brain
2024-Dec-13, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01855-5
PMID:39672966
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
252 | 2024-12-15 |
iFlpMosaics enable the multispectral barcoding and high-throughput comparative analysis of mutant and wild-type cells
2024-Dec-13, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02534-w
PMID:39672980
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研究论文 | 本文介绍了一种名为iFlpMosaics的工具包,用于多光谱条码标记和高通量比较分析突变细胞和野生型细胞 | iFlpMosaics工具包包含了一系列新的遗传工具和老鼠品系,能够实现重组酶依赖的比例诱导和单细胞克隆追踪,并在相同的组织微环境中进行多色荧光标记的野生型和Cre突变细胞的追踪 | NA | 研究基因功能,比较突变细胞和正常细胞的差异 | 突变细胞和野生型细胞 | NA | NA | 多光谱成像、荧光激活流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA | NA |
253 | 2024-12-15 |
A multiplexed, single-cell sequencing screen identifies compounds that increase neurogenic reprogramming of murine Muller glia
2024-Dec-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92091
PMID:39665620
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研究论文 | 本文通过单细胞测序筛选出能够促进小鼠Müller胶质细胞神经元再生的化合物 | 利用sci-Plex技术进行高通量单细胞分子 profiling,筛选并验证了两种促进体内神经发生的化合物 | 目前该过程的效率有限 | 提高哺乳动物中Müller胶质细胞的神经元再生能力 | 小鼠Müller胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 92种化合物 |
254 | 2024-12-15 |
Multiparameter imaging reveals clinically relevant cancer cell-stroma interaction dynamics in head and neck cancer
2024-Dec-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.046
PMID:39471809
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研究论文 | 本文报道了一种通过多参数成像量化头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中癌细胞与基质相互作用动态的方法 | 首次结合细胞状态标记与形态特征,以单细胞分辨率量化HNSCC的表型多样性,并揭示了部分上皮-间充质转化(pEMT)对疾病预后的影响 | NA | 研究癌细胞与基质相互作用对头颈部鳞状细胞癌表型多样性和临床特征的影响 | 头颈部鳞状细胞癌中的癌细胞与基质相互作用 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 多参数成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
255 | 2024-12-15 |
Cell type and dynamic state govern genetic regulation of gene expression in heterogeneous differentiating cultures
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100701
PMID:39626676
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研究论文 | 研究探讨了在异质性分化培养物中,细胞类型和动态状态如何调控基因表达的遗传机制 | 利用异质性分化培养物系统,研究了53个人类供体的单细胞RNA测序数据,揭示了与发育和疾病相关基因的新型调控变异 | 研究主要集中在体外系统,可能无法完全反映体内复杂的调控机制 | 探讨人类遗传变异在不同细胞环境中的分子效应,以理解与疾病相关位点的机制 | 异质性分化培养物中的细胞类型和发育阶段 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 53个人类供体的900,000多个细胞 |
256 | 2024-12-15 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Pseudo-temporal Dynamic Evolution Characteristics of ADSCs to Neuronal Differentiation
2024-Dec-11, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-024-01524-y
PMID:39661257
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了脂肪来源基质细胞向神经元分化的伪时间动态进化特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脂肪来源基质细胞向神经元分化的基因表达变化 | 研究仅限于体外实验,未涉及体内实验验证 | 揭示脂肪来源基质细胞向神经元分化的基因表达变化 | 脂肪来源基质细胞及其向神经元分化的过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 共收集了38,453个细胞,分为0-13个簇 |
257 | 2024-12-15 |
Identification of core immune-related genes CTSK, C3, and IFITM1 for diagnosing Helicobacter pylori infection-associated gastric cancer through transcriptomic analysis
2024-Dec-10, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138645
PMID:39667460
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研究论文 | 通过转录组分析识别与幽门螺杆菌感染相关胃癌的诊断基因CTSK、C3和IFITM1 | 首次通过转录组分析识别出CTSK、C3和IFITM1作为幽门螺杆菌感染相关胃癌的关键免疫相关诊断基因,并构建了随机森林模型评估其诊断性能 | 研究主要基于GEO数据库的基因表达数据,缺乏临床样本的验证 | 识别与幽门螺杆菌感染相关胃癌的诊断基因及其机制 | 幽门螺杆菌感染相关胃癌的诊断基因 | 基因表达分析 | 胃癌 | 差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、随机森林模型、单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 基因表达数据 | GEO数据库中的基因表达数据 |
258 | 2024-12-15 |
Itaconate Ameliorates Experimental Autoimmune Uveitis by Modulating Teff/Treg Cell Imbalance Via the DNAJA1/CDC45 Axis
2024-Dec-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.23
PMID:39661355
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研究论文 | 本研究探讨了衣康酸(ITA)对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)的影响及其潜在机制,并确定了潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了衣康酸通过调节DNAJA1/CDC45轴来改善Teff/Treg细胞失衡,从而减轻EAU的炎症反应 | 本研究主要基于动物模型,尚未在人体中验证其疗效和安全性 | 阐明衣康酸对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响及其潜在机制,并确定潜在的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)及其相关细胞和分子机制 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型和葡萄膜炎患者样本 |
259 | 2024-12-15 |
Proximity sequencing for the detection of mRNA, extracellular proteins and extracellular protein complexes in single cells
2024-Dec, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01030-x
PMID:39147984
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研究论文 | 本文介绍了一种名为邻近测序的步骤,用于在单细胞水平上同时测量蛋白质、mRNA和数百种细胞外膜上的蛋白质复合物 | 首次提出了一种能够在单细胞水平上同时测量蛋白质、mRNA和蛋白质复合物的邻近测序方法 | 该方法需要用户具备基本的分子生物学和单细胞测序经验,且实验过程需要大约16小时,分散在几天内完成 | 开发一种新的技术,能够在单细胞水平上同时测量蛋白质、mRNA和蛋白质复合物 | 单细胞中的mRNA、细胞外蛋白质和蛋白质复合物 | 分子生物学 | NA | 邻近测序 | NA | 蛋白质、mRNA | 单细胞 |
260 | 2024-12-15 |
Single-cell RNA sequencing reveals the CRTAC1+ population actively contributes to the pathogenesis of spinal ligament degeneration by SPP1+ macrophage
2024-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14320
PMID:39158018
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CRTAC1+细胞群通过SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的致病作用 | 首次揭示了CRTAC1+软骨细胞样细胞和SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的关键作用,并发现了ATF3作为调控CRTAC1软骨细胞样细胞致病性的关键转录因子 | 研究仅限于特定类型的韧带样本,未来需要进一步验证这些发现是否适用于其他类型的韧带或更广泛的退行性疾病 | 建立韧带组织的综合转录组图谱,识别韧带退行性变的治疗靶点 | 脊柱韧带退行性变中的细胞异质性和关键致病机制 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个退行性韧带和3个创伤性韧带样本,共32,014个细胞 |