单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 703 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-01-31 |
Application of Spatial Transcriptomics in Digestive System Tumors
2024-Dec-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15010021
PMID:39858416
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用，包括其在揭示肿瘤空间结构、异质性、肿瘤微环境及细胞间相互作用方面的作用，以及在诊断、预后和治疗中的应用 | 结合空间转录组学与单细胞RNA测序（scRNA-seq）、人工智能和机器学习在消化系统癌症研究中的重要性 | 技术挑战和应用前景仍需进一步探讨 | 探讨空间转录组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用及其前景 | 消化系统肿瘤 | 数字病理学 | 消化系统肿瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 222 | 2025-01-31 |
SSL5-AnxA5 Fusion Protein Constructed Based on Human Atherosclerotic Plaque scRNA-Seq Data Preventing the Binding of Apoptotic Endothelial Cells, Platelets, and Inflammatory Cells
2024-Dec-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13010008
PMID:39857592
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研究论文 | 本文基于人类动脉粥样硬化斑块的单细胞RNA测序数据，构建了SSL5-AnxA5融合蛋白，用于防止凋亡内皮细胞、血小板和炎症细胞的结合 | 通过单细胞测序分析，识别了SAP和ACS患者斑块中annexin V和P-selectin糖蛋白配体1通路的显著变化，并构建了SSL5-AnxA5融合蛋白，展示了其在防止细胞间相互作用中的潜力 | NA | 研究SSL5-AnxA5融合蛋白在防止动脉粥样硬化斑块破裂后局部炎症中的作用 | 凋亡内皮细胞、血小板和炎症细胞 | 生物医学工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、PCR、Western blot、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据 | SAP和ACS患者的斑块样本 |
| 223 | 2025-01-31 |
Disruption of immune responses by type 1 diabetes exacerbates SARS-CoV-2 mediated lung injury
2024-Dec-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00250.2024
PMID:39320093
|
研究论文 | 本文研究了1型糖尿病（T1DM）对COVID-19肺炎严重程度的影响，通过小鼠模型发现高血糖小鼠表现出更严重的肺损伤和免疫反应受损 | 引入了一种新技术，用于将高度固定的组织消化成单细胞悬液，适用于流式细胞术分析，并揭示了T1DM小鼠肺部T细胞募集减少和炎症性巨噬细胞的特征 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类数据，且样本量未明确说明 | 评估1型糖尿病是否加剧COVID-19肺炎的严重程度，并探索其潜在机制 | 野生型小鼠感染小鼠适应的SARS-CoV-2病毒 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、流式细胞术 | 小鼠模型 | 转录组数据、流式细胞数据 | NA |
| 224 | 2025-01-30 |
DDO1002, an NRF2-KEAP1 inhibitor, improves hematopoietic stem cell aging and stress response
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae043
PMID:39872153
|
研究论文 | 本文研究了DDO1002作为NRF2-KEAP1抑制剂在改善造血干细胞衰老和应激反应中的作用 | 首次阐明了DDO1002通过激活NRF2-ARE信号通路来减少细胞内活性氧水平，从而延缓细胞衰老和改善造血功能 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探讨DDO1002在缓解全身照射后或衰老过程中造血功能下降的作用 | 造血干细胞（HSCs） | 生物医学 | 老年疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | 老年小鼠 |
| 225 | 2025-01-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intercellular crosstalk and the regulatory landscape of stromal cells during the whole life of the mouse ovary
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae041
PMID:39872151
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠卵巢整个生命周期中基质细胞的细胞间通讯和调控景观 | 首次整合了从胚胎期到成年期的单细胞RNA测序数据，揭示了卵巢基质细胞的动态变化和细胞间通讯网络，并识别了基质细胞的起源——间充质祖细胞（CD24） | 研究主要基于小鼠模型，人类卵巢中的相关机制仍需进一步验证 | 研究卵巢基质细胞的异质性、发育轨迹及细胞间通讯网络 | 小鼠卵巢中的基质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从E11.5（胚胎第11.5天）到M12（12月龄）的小鼠卵巢样本 |
| 226 | 2025-01-30 |
Spatial multi-omics characterizes GPR35-relevant lipid metabolism signatures across liver zonation in MASLD
2024-Dec, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loae021
PMID:39873004
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研究论文 | 本研究通过结合脂质代谢组学、空间转录组学（ST）和空间代谢组学（SM），旨在识别由GPR35调控的MASLD中不同肝脏分区的特定基因和代谢物的空间分布 | 首次在肝脏分区水平上揭示了GPR35在MASLD中的调控机制，特别是其对脂质代谢和炎症反应的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨GPR35在MASLD中的调控机制及其对肝脏分区的影响 | 小鼠肝脏 | 代谢组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 脂质代谢组学、空间转录组学（ST）、空间代谢组学（SM） | NA | 代谢物和基因表达数据 | NA |
| 227 | 2024-12-11 |
Distinct immune microenvironment of venous tumor thrombus in hepatocellular carcinoma at single-cell resolution
2024-Dec-10, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001182
PMID:39656099
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓（PVTT）的免疫微环境特征 | 首次在单细胞分辨率下揭示了PVTT中免疫细胞的组成和功能，特别是C5aR+ TAMs在免疫抑制环境中的作用 | 研究主要集中在PVTT的免疫微环境，未涉及其他类型的肿瘤血栓 | 探索肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓的免疫微环境特征 | 肝细胞癌中的门静脉肿瘤血栓（PVTT） | 数字病理学 | 肝癌 | 时间飞行质谱（CyTOF），单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞数据 | 使用了PVTT细胞系CSQT2和单核细胞系THP-1进行实验 |
| 228 | 2024-12-12 |
Gene regulatory network inference based on novel ensemble method
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae036
PMID:39324652
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研究论文 | 本研究提出了一种基于13种基本分类方法和灵活神经树（FNT）的集成方法，以提高基因调控网络（GRN）的识别准确性 | 开发了一种基于基因编程变体和粒子群优化的混合进化算法来搜索最优的FNT模型，并证明了所提出的集成方法在多个数据集上优于多种现有算法 | NA | 提高基因调控网络的识别准确性 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 灵活神经树（FNT） | 基因数据 | 三个模拟数据集和三个真实单细胞RNA-seq数据集 |
| 229 | 2024-10-26 |
Evolutionary diversity of CXCL16-CXCR6: Convergent substitutions and recurrent gene loss in sauropsids
2024-12, Immunogenetics
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s00251-024-01357-5
PMID:39400711
|
研究论文 | 研究CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响 | 首次在脊椎动物中比较了约400个CXCR6直系同源基因，发现DRF基序在不同物种中的替代和CXCR6基因在某些鸟类和爬行动物中的反复丢失 | 研究主要集中在脊椎动物，未涵盖所有物种，且对基因丢失的具体机制和免疫影响的深入研究有限 | 探讨CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响 | CXCL16-CXCR6轴在不同脊椎动物中的基因变异和进化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列 | 约400个CXCR6直系同源基因，涵盖多种脊椎动物 |
| 230 | 2025-01-28 |
Initial regional cytoarchitectonic differences in dorsal and orbitobasal human developing frontal cortex revealed by spatial transcriptomics
2024-Dec-18, Brain structure & function
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00429-024-02865-6
PMID:39692769
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学技术揭示了人类胎儿大脑皮层早期发育中背侧和眶基底区域在细胞结构上的差异 | 首次在转录组水平上深入研究了人类胎儿额叶发育过程中背侧和眶基底区域的细胞结构特征，并保留了空间信息 | 研究仅关注了15个孕周后的胎儿大脑发育，未涵盖其他关键发育阶段 | 探讨人类胎儿额叶发育过程中背侧和眶基底区域在细胞结构上的差异及其分子机制 | 人类胎儿额叶的背侧和眶基底区域 | 空间转录组学 | NA | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) | NA | 基因表达数据 | 15个孕周后的胎儿大脑样本 |
| 231 | 2025-01-26 |
Mesenchymal Traits as an Intrinsic Feature of Undifferentiated Cells
2024-Dec-24, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb13010001
PMID:39846630
|
研究论文 | 本文通过分析早期胚胎阶段和成人组织的单细胞转录组数据集，探讨了间充质表型在未分化细胞中的内在特征 | 挑战了传统观点，提出间充质表型和混合间充质/上皮状态可能标志着具有干细胞特性的癌细胞，并将这一概念扩展到病理背景之外 | 研究主要依赖于公开的单细胞转录组数据集，可能缺乏实验验证 | 探讨间充质表型在未分化细胞中的内在特征及其在胚胎发育和成人器官中的表达 | 早期胚胎阶段和成人组织的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开的单细胞转录组数据集 |
| 232 | 2025-01-26 |
Dynamic cell fate plasticity and tissue integration drive functional synovial joint regeneration
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.628180
PMID:39713398
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研究论文 | 本文通过开发成年斑马鱼的单侧全关节切除模型，研究了如何刺激原生滑膜关节组织的再生 | 揭示了成年骨骼中潜在的分子和细胞程序，这些程序被用于再生具有润滑关节软骨的复杂关节 | 研究仅限于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物中进行验证 | 研究成年哺乳动物滑膜关节的再生能力及其机制 | 成年斑马鱼的滑膜关节 | 生物医学工程 | 关节疾病 | microCT、组织学、活体成像、单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 图像、RNA测序数据 | 成年斑马鱼的全关节切除模型 |
| 233 | 2024-12-11 |
Improved tool for scRNA-seq analysis
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02040-x
PMID:39653731
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2025-01-23 |
Construction of a neutrophil extracellular trap formation-related gene model for predicting the survival of lung adenocarcinoma patients and their response to immunotherapy
2024-Dec-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-463
PMID:39830760
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于中性粒细胞胞外陷阱形成相关基因（NFRGs）的预后模型，用于预测肺腺癌（LUAD）患者的生存和免疫治疗反应 | 首次使用NFRGs构建预测LUAD患者生存和免疫治疗反应的预后模型，并验证了其有效性 | 研究依赖于TCGA和GEO数据集，需要进一步的外部验证和临床实验来确认模型的普适性 | 构建一个基于NFRGs的预后签名，用于分层LUAD患者并指导个体化管理策略 | 肺腺癌（LUAD）患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据集中的LUAD患者样本 |
| 235 | 2025-01-22 |
The transcription factor TCF21 is necessary for adoption of cell fates by Foxd1+ stromal progenitors during kidney development
2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.14.607910
PMID:39211232
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子TCF21在Foxd1+基质祖细胞命运决定中的作用，揭示了其在肾脏发育中的关键角色 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了Tcf21缺失对Foxd1+基质祖细胞分化的影响，并发现了一个新的表达Endomucin的细胞群 | 研究仅针对胚胎期14.5天的肾脏样本，未涉及其他发育阶段或成年肾脏 | 探究Tcf21在Foxd1+基质祖细胞命运决定中的作用及其对肾脏发育的影响 | Foxd1+基质祖细胞及其分化产生的多种细胞类型 | 发育生物学 | 先天性肾脏异常 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 32,461个GFP+细胞来自胚胎期14.5天的肾脏样本 |
| 236 | 2025-01-21 |
Human-Mouse Chimeric Brain Models to Study Human Glial-Neuronal and Macroglial-Microglial Interactions
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.03.601990
PMID:39005270
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研究论文 | 本文介绍了一种通过移植人类诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的神经细胞生成的人鼠嵌合脑模型，用于研究人类神经细胞的发育和功能 | 创新性地使用共移植方法生成包含人类小胶质细胞、大胶质细胞和神经元的人鼠嵌合脑模型，并通过超分辨率成像和单细胞RNA测序技术揭示了神经元与胶质细胞之间的动态相互作用 | 模型依赖于小鼠宿主环境，可能不完全模拟人类大脑的复杂性 | 研究人类神经细胞在体内的发育和功能，特别是胶质细胞与神经元之间的相互作用 | 人类诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的神经细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 超分辨率成像、3D重建技术、单细胞RNA测序 | 人鼠嵌合脑模型 | 图像、基因表达数据 | NA |
| 237 | 2025-01-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes
2024-Dec, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003
PMID:39426602
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了生殖器疱疹（GH）患者免疫景观的多样性及其对HSV-2感染的反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细描绘了GH患者的免疫细胞多样性及其在HSV-2感染和复发中的反应 | 研究主要依赖于外周血样本，可能无法完全代表局部感染部位的免疫反应 | 探讨HSV-2感染和复发的机制，特别是免疫细胞在其中的作用 | 健康个体和复发性GH患者的免疫细胞 | 生物信息学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR），ELISA | NA | RNA序列数据 | 健康个体和复发性GH患者的外周血样本 |
| 238 | 2025-01-16 |
Pancreatic Neuroendocrine Tumor: The Case Report of a Patient with Germline FANCD2 Mutation and Tumor Analysis Using Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-14, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13247621
PMID:39768544
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研究论文 | 本文报告了一例携带FANCD2基因种系突变的胰腺神经内分泌肿瘤患者，并利用单细胞RNA测序技术对肿瘤进行了分析 | 首次在胰腺神经内分泌肿瘤患者中报告了FANCD2基因种系突变，并应用单细胞RNA测序技术进行肿瘤分析 | 样本量较小，仅为单一病例报告 | 探讨胰腺神经内分泌肿瘤的分子特征和预后标志物 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1例患者 |
| 239 | 2025-01-16 |
Harnessing Single-Cell and Spatial Transcriptomics for Crop Improvement
2024-Dec-11, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13243476
PMID:39771174
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组技术在作物改良中的应用及其最新进展 | 结合单细胞和空间转录组技术，揭示了作物组织中细胞群体的异质性及其对环境刺激的响应，为作物遗传改良和育种策略提供了新的视角 | 未提及具体的技术局限或挑战 | 探讨单细胞和空间转录组技术在作物改良中的应用及其潜力 | 作物生物学中的细胞群体及其基因表达 | 作物科学 | NA | 单细胞转录组技术、空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 240 | 2025-01-16 |
Splicing the Difference: Harnessing the Complexity of the Transcriptome in Hematopoiesis
2024-Dec, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104655
PMID:39393608
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综述 | 本文综述了转录组复杂性在造血过程中的作用，特别是选择性剪接在造血干细胞维持、分化及血液系统疾病中的重要性 | 强调了选择性剪接事件及其调节因子在造血过程中的关键作用，并探讨了剪接因子突变如何导致血液系统恶性肿瘤 | NA | 更新关于选择性剪接在造血及其相关疾病中的最新技术和研究进展 | 造血干细胞、造血祖细胞、功能性血细胞及血液系统恶性肿瘤 | 分子生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 多色流式细胞分选、批量测序、单细胞测序 | NA | NA | NA |