单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 700 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-06 |
Decoding the molecular, cellular, and functional heterogeneity of zebrafish intracardiac nervous system
2024-12-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54830-w
PMID:39632839
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、解剖学研究和电生理技术对斑马鱼心内神经系统进行全面分类和功能表征 | 首次系统揭示心内神经系统的细胞类型多样性，发现具有起搏器/节律生成特征的神经元亚群 | 研究仅限于斑马鱼模型，人类心内神经系统的直接相关性需要进一步验证 | 解析心内神经系统的分子、细胞和功能异质性 | 斑马鱼心内神经系统 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 解剖学研究, 电生理技术 | NA | 单细胞转录组数据, 解剖学数据, 电生理记录 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-06 |
Dual function of PHF16 in reinstating homeostasis of murine intestinal epithelium after crypt regeneration
2024-12-02, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.08.009
PMID:39232563
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子PHF16通过双重机制恢复肠道上皮稳态 | 首次发现PHF16通过HBO1介导的H3K14乙酰化激活RAR/RXR靶基因，同时通过CDC73泛素化抑制YAP/TAZ活性的双重机制 | 研究主要基于小鼠模型和肠道类器官，人类临床相关性尚需验证 | 探究PHF16在肠道上皮稳态恢复中的分子机制 | 小鼠肠道干细胞、再生干细胞和肠道类器官 | 表观遗传学 | 肠道损伤修复 | 单细胞RNA测序, RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | Phf16基因敲除小鼠模型和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序, ATAC测序 | NA | NA |
| 223 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of the holothurian regenerating intestine reveals the pluripotency of the coelomic epithelium
2024-Dec-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.01.601561
PMID:39005414
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究海参肠道再生过程中体腔上皮细胞的多能性 | 首次在棘皮动物再生研究中应用单细胞RNA测序技术，识别出再生原基中的13个不同细胞群，并发现至少4种新的前体细胞群 | 研究局限于海参这一特定物种，分子机制仍需进一步验证 | 探究海参肠道再生过程中再生原基细胞的分子特征和分化潜能 | 海参再生肠道组织中的细胞群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, HCR-FISH分析 | NA | 单细胞转录组数据, 荧光原位杂交图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 224 | 2025-10-06 |
Cancer-specific innate and adaptive immune rewiring drives resistance to PD-1 blockade in classic Hodgkin lymphoma
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54512-7
PMID:39737927
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间分析揭示了经典霍奇金淋巴瘤对PD-1阻断治疗的免疫应答机制 | 首次发现循环和肿瘤浸润的IL1β单核细胞/巨噬细胞群在cHL患者中的特异性存在及其与PD-1阻断耐药性的关联 | 样本来源和数量未明确说明，需要进一步验证外周血检测的临床实用性 | 阐明经典霍奇金淋巴瘤对PD-1阻断治疗的免疫应答机制和耐药性原因 | 经典霍奇金淋巴瘤患者和健康供体的免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，空间分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 225 | 2025-10-06 |
Immune checkpoint inhibitor-induced severe epidermal necrolysis mediated by macrophage-derived CXCL10 and abated by TNF blockade
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54180-7
PMID:39737932
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了免疫检查点抑制剂诱导的严重表皮坏死松解症的发病机制 | 首次发现巨噬细胞来源的CXCL10在ICI-SJS/TEN发病机制中的关键作用，并证实TNF阻断可有效治疗该病症 | 样本量较小（仅25例患者），需要更大规模研究验证 | 探究免疫检查点抑制剂诱导严重皮肤不良反应的分子机制和治疗方法 | 免疫检查点抑制剂诱导的Stevens-Johnson综合征/中毒性表皮坏死松解症患者 | 单细胞测序分析 | 皮肤不良反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个队列共25例ICI诱导SJS/TEN患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-06 |
The relationship between Sjögren's syndrome and recurrent pregnancy loss: a bioinformatics analysis
2024-12, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2024.104363
PMID:39299134
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研究论文 | 通过生物信息学分析揭示干燥综合征与复发性流产之间的基因关联 | 首次发现干燥综合征与复发性流产共享KCNN3枢纽基因及相关生物学通路 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探索干燥综合征与复发性流产之间的基因相关性 | 干燥综合征和复发性流产的基因表达数据 | 生物信息学 | 自身免疫疾病与生殖疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), limma分析, 单细胞RNA测序 | ceRNA网络 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的干燥综合征和复发性流产样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 227 | 2025-05-10 |
Multivariate stochastic modeling for transcriptional dynamics with cell-specific latent time using SDEvelo
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55146-5
PMID:39738101
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研究论文 | 本文提出了一种名为SDEvelo的生成方法，通过多元随机微分方程（SDE）建模未剪接和剪接RNA的动态，以推断RNA速度 | SDEvelo首次通过多元随机微分方程建模RNA速度，显式地模拟转录动态中的固有不确定性，并估计跨基因的细胞特异性潜在时间 | 未提及具体局限性 | 改进单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究中的动态建模方法，以更准确地重建和预测细胞分化和状态转换的定向轨迹 | 未剪接和剪接RNA的动态 | 生物信息学 | 癌症 | scRNA-seq, 空间转录组学 | SDE | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 模拟数据和四个scRNA-seq及空间转录组学数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2025-10-07 |
Interpretable single-cell factor decomposition using sciRED
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.01.605536
PMID:39149356
|
研究论文 | 开发了一种名为sciRED的可解释单细胞因子分解方法，用于改进单细胞RNA测序数据的分析 | 通过去除已知混杂效应、使用旋转提高因子可解释性、将因子映射到已知协变量、识别可能捕获隐藏生物现象的未解释因子 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的因子分析解释性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分解模型 | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2025-05-08 |
Induced B-Cell Receptor Diversity Predicts PD-1 Blockade Immunotherapy Response
2024-Dec-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.626669
PMID:39677742
|
research paper | 研究通过单细胞RNA测序和高清空间转录组学分析，揭示了B细胞受体多样性在预测PD-1阻断免疫治疗反应中的作用 | 发现PD-1抑制成功反应的特征是治疗后B细胞受体克隆多样性的诱导，并验证了其作为跨多种癌症治疗反应预测因子的普遍性 | 研究样本主要集中在特定类型的癌症患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 探索PD-1阻断免疫治疗反应的机制，并寻找预测治疗反应的生物标志物 | 局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者 | digital pathology | basal cell carcinoma, glioblastoma, melanoma, head and neck squamous cell carcinoma | single-cell RNA sequencing, high-definition spatial transcriptomics, spatial immunoreceptor profiling | machine learning | RNA sequencing data | 一组局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及更大的胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2025-10-07 |
S100A11 is a potential prognostic biomarker and correlated with tumor immunosuppressive microenvironment in glioma
2024-Dec-20, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000040701
PMID:39705426
|
研究论文 | 本研究探讨S100A11作为胶质瘤相关巨噬细胞潜在生物标志物的作用及其与胶质母细胞瘤免疫抑制微环境的关系 | 首次发现S100A11在胶质瘤相关巨噬细胞中高表达，并证实其与巨噬细胞浸润存在强相关性 | NA | 更好理解胶质瘤免疫微环境，探索S100A11作为生物标志物的潜力 | 胶质瘤相关巨噬细胞(GAMs)和胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | Western blot, 免疫组织化学, 免疫荧光分析, 单细胞测序, 免疫浸润分析 | NA | 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 231 | 2025-10-07 |
TCR transgenic clone selection guided by immune receptor analysis and single-cell RNA expression of polyclonal responders
2024-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98344
PMID:39854619
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞测序和TCR谱分析快速筛选抗原特异性TCR序列并生成TCR转基因小鼠的新方法 | 利用单细胞测序和TCR谱分析技术替代传统的杂交瘤筛选方法，快速选择最佳TCR克隆 | NA | 开发快速生成抗原特异性TCR转基因小鼠的方法 | SARS-CoV-2刺突蛋白特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, TCR谱分析, PCR克隆 | NA | 单细胞RNA表达数据, TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 232 | 2025-10-07 |
NK cell exhaustion in Wilson's disease revealed by single-cell RNA sequencing predicts the prognosis of cholecystitis
2024-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98867
PMID:39854622
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示威尔逊病中NK细胞耗竭及其与胆囊炎预后的关联 | 首次在威尔逊病模型中揭示代谢异常导致NK细胞耗竭，并证实其与胆囊炎预后的直接关联 | 回顾性临床研究，样本来源单一，机制验证不够充分 | 探究肝脏疾病代谢异常影响胆囊炎风险的免疫机制 | 威尔逊病患者及胆囊炎患者 | 单细胞组学 | 肝胆疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据，临床数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals S100A8/A9hi neutrophils-induced endothelial cell death and lymphocyte infiltration after ischemic stroke
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151023
PMID:39579533
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示缺血性中风后S100A8/A9高中性粒细胞诱导的内皮细胞死亡和淋巴细胞浸润机制 | 首次发现S100A8/A9hi中性粒细胞亚群在缺血性中风中的关键作用，并证实S100A8/A9抑制剂paquinimod的神经保护作用 | 未明确说明样本来源和具体数量，机制研究仍需进一步验证 | 探究缺血性中风后免疫细胞与血脑屏障相互作用的分子机制 | 中性粒细胞、内皮细胞和T细胞 | 单细胞基因组学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 234 | 2025-10-07 |
Revealing the roles of IL-7R in abdominal aortic aneurysm through integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151042
PMID:39586133
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研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示IL-7R在腹主动脉瘤发病机制中的关键作用 | 首次通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据系统分析IL-7R在AAA中的作用机制，发现IL-7R通过JAK/STAT通路促进IFN-γ分泌并诱导平滑肌细胞表型转换 | 数据来源于公共数据库GEO，缺乏独立验证队列；样本数量未明确说明 | 探索腹主动脉瘤的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 腹主动脉瘤组织样本和CD4记忆T细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of lung fibroblasts in a bleomycin-induced systemic sclerosis mouse model
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151017
PMID:39608052
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究博来霉素诱导的系统性硬化症小鼠模型中肺成纤维细胞的转录组特征 | 首次在系统性硬化症小鼠模型中鉴定出两个不同的成纤维细胞亚群：NPNT阳性和PI16阳性细胞，并比较了皮下和气管内博来霉素诱导模型的差异 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探索成纤维细胞在肺纤维化中的分子机制 | 系统性硬化症小鼠模型中的肺成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 博来霉素诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2025-10-07 |
Surface Molecular Markers for the Isolation of Viable Fibroblast Subpopulations in the Female Reproductive Tract: A Comprehensive Review
2024-Dec-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010233
PMID:39796089
|
综述 | 本文系统综述了女性生殖道中成纤维细胞亚群的表面分子标记及其在选择性细胞分离中的应用潜力 | 基于两千多篇研究文章，首次全面整合女性生殖系统中成纤维细胞亚群的表面标记和分子特征 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要依赖现有文献分析 | 识别和表征女性生殖道中成纤维细胞亚群及其特异性表面标记 | 女性生殖系统中的成纤维细胞亚群 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 转录组数据, 蛋白质谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2025-10-07 |
Differential Expression of CXCL12 in Human and Mouse Hair: Androgens Induce CXCL12 in Human Dermal Papilla and Dermal Sheath Cup
2024-Dec-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010095
PMID:39795953
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化分析，揭示了CXCL12在人类毛囊真皮乳头细胞和真皮鞘杯细胞中与雄激素受体共表达的现象 | 首次证明CXCL12在人类毛囊中与雄激素受体共表达，并发现CXCL12抗体可通过抑制雄激素受体活性促进毛发生长 | 研究主要基于体外实验，缺乏完整的体内验证 | 探究雄激素诱导的CXCL12对毛囊细胞的影响及其在雄激素性脱发中的作用机制 | 人类和小鼠皮肤组织、毛囊真皮乳头细胞、真皮鞘杯细胞 | 分子生物学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 毛发器官培养, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 238 | 2025-10-07 |
MPCD Index for Hepatocellular Carcinoma Patients Based on Mitochondrial Function and Cell Death Patterns
2024-Dec-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010118
PMID:39795978
|
研究论文 | 基于线粒体功能和细胞死亡模式构建肝细胞癌患者的MPCD指数 | 首次结合线粒体功能和程序性细胞死亡模式，通过机器学习构建MPCDI指数用于HCC患者分型 | NA | 研究肝细胞癌中线粒体功能与细胞死亡模式的关系并构建预后指数 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, RNA-seq | 机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | 来自TCGA、GEO和ICGC数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | NA |
| 239 | 2025-10-07 |
Advances in DNA/RNA Sequencing and Their Applications in Acute Myeloid Leukemia (AML)
2024-Dec-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010071
PMID:39795930
|
综述 | 本文探讨DNA/RNA测序技术在急性髓系白血病研究中的最新进展及其临床应用潜力 | 系统总结单细胞RNA测序在发现白血病干细胞稀有亚群方面的突破性进展 | 测序技术的临床广泛应用仍受成本、数据复杂性和伦理问题限制 | 评估DNA/RNA测序技术在急性髓系白血病诊疗中的应用前景 | 急性髓系白血病分子机制和白血病干细胞 | 基因组学 | 急性髓系白血病 | 全基因组测序, 全外显子组测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序, 全外显子组测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 240 | 2025-10-07 |
MICROGLIA AGING IN THE HIPPOCAMPUS ADVANCES THROUGH INTERMEDIATE STATES THAT DRIVE ACTIVATION AND COGNITIVE DECLINE
2024-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.09.588665
PMID:38645176
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了海马区小胶质细胞在衰老过程中的中间状态及其对神经炎症和认知衰退的驱动作用 | 首次识别了小胶质细胞衰老过程中的中间状态，并证明这些中间状态通过异种共生实验和药理学方法驱动炎症激活和认知功能下降 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明小胶质细胞在衰老过程中从稳态到功能障碍的进展机制 | 小鼠海马区小胶质细胞 | 神经科学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序，假时间分析，条件性基因敲除 | 小鼠模型，异种共生模型 | 单细胞转录组数据 | 跨越成年寿命期的小鼠海马区小胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |