单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 620 篇文献,本页显示第 221 - 240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
221 2024-12-17
GraphVelo allows inference of multi-modal single cell velocities and molecular mechanisms
2024-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为GraphVelo的图基机器学习方法,用于推断多模态单细胞速度和分子机制 GraphVelo能够将RNA速度扩展到多模态数据,并揭示基因之间、基因调控层之间以及病毒与宿主细胞之间的定量非线性调控关系 现有的RNA速度推断方法在处理复杂转录动力学、低表达或缺乏剪接动力学的基因时存在局限性 开发一种新的方法来推断多模态单细胞数据的速度,并揭示分子机制 单细胞RNA测序数据和多组学数据 机器学习 NA RNA速度推断 图基机器学习 多模态数据 多个合成和实验的单细胞RNA测序数据集以及多组学数据集
222 2024-12-17
Bgee in 2024: focus on curated single-cell RNA-seq datasets, and query tools
2024-Dec-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了Bgee数据库的更新,重点是整合了经过精心筛选的单细胞RNA测序数据集,并提供了新的查询工具 Bgee现在能够提供跨物种的基因表达模式比较,直至细胞分辨率,并且扩展了物种数量,增加了对鱼类、农业和兽医重要物种以及非人类灵长类动物的支持 NA 更新Bgee数据库,整合单细胞RNA测序数据,并提供新的查询工具 跨物种的基因表达模式 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及52个物种的单细胞RNA测序数据
223 2024-12-17
Identification of Key Genes in Fetal Gut Development at Single-Cell Level by Exploiting Machine Learning Techniques
2024-Dec, Proteomics IF:3.4Q2
研究论文 本研究利用机器学习技术在单细胞水平上识别胎儿肠道发育的关键基因 首次在单细胞水平上利用机器学习技术对胎儿肠道发育的细胞进行分类,并识别出关键基因 研究仅限于特定的单细胞测序数据集,可能无法全面代表所有胎儿肠道发育情况 通过机器学习技术增强对胎儿肠道发育的理解 胎儿肠道发育中的细胞分类和关键基因识别 机器学习 NA 单细胞测序 NA 基因特征数据 62,849个样本,每个样本具有33,694个不同的基因特征
224 2024-12-17
Highlighting roles of autophagy in human diseases: a perspective from single-cell RNA sequencing analyses
2024-Dec, Drug discovery today IF:6.5Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在自噬研究中的最新进展及其在多种疾病分子特征中的潜在应用 利用单细胞RNA测序技术在单细胞分辨率下研究自噬途径,显著提升了对自噬在不同生理和病理背景下作用的理解 自噬在癌症和其他疾病中的作用仍然复杂且未完全理解 探讨自噬在人类疾病中的作用,并利用单细胞RNA测序技术推动新疗法和药物的开发 自噬在不同疾病中的分子机制 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
225 2024-12-17
An organotypic atlas of human vascular cells
2024-Dec, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究整合了来自19个人体器官和组织的单细胞转录组数据,定义了42种血管细胞状态,并揭示了血管细胞在不同组织中的分子特征和相互作用 首次通过单细胞转录组学技术构建了人体血管细胞的器官型图谱,揭示了不同血管床中的细胞状态和分子特征 研究主要基于单细胞转录组数据,缺乏功能验证和体内实验 揭示人体血管系统中不同组织间的分子决定因素和细胞状态 人体血管系统中的内皮细胞和壁细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 约67,000个细胞,来自62名供体
226 2024-12-17
Spatially resolved single-cell atlas unveils a distinct cellular signature of fatal lung COVID-19 in a Malawian population
2024-Dec, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究通过组织学和高维成像技术,分析了马拉维成年人的致命性肺病,并生成了来自肺、血液和鼻细胞的单细胞转录组数据,揭示了COVID-19在不同人群中的细胞特征 首次在非洲人群中进行单细胞研究,揭示了COVID-19在马拉维人群中的独特免疫和炎症机制 样本量较小,且仅限于马拉维成年人 探讨COVID-19在不同人群中的病理和免疫机制 马拉维成年人的致命性肺病,包括COVID-19和非COVID-19病例 数字病理学 COVID-19 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 9例COVID-19病例和7例非COVID-19病例
227 2024-12-17
Exploring the Role of EBV Infection in EBV-T/NKLPD With EBV Capture Technology Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec, Journal of medical virology IF:6.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
228 2024-12-17
Creatine promotes endometriosis progression by inducing M2 polarization of peritoneal macrophages
2024-Dec-01, Reproduction (Cambridge, England)
研究论文 本文研究了肌酸通过诱导腹膜巨噬细胞M2极化促进子宫内膜异位症进展的机制 首次揭示了肌酸在子宫内膜异位症中的免疫调节作用,并阐明了其通过诱导M2极化促进病变的机制 实验主要在体外进行,缺乏体内实验验证 探讨肌酸在子宫内膜异位症中的作用及其机制 腹膜巨噬细胞和子宫内膜异位症患者 NA 子宫内膜异位症 单细胞测序 RNA测序 NA RNA 子宫内膜异位症患者和非患者
229 2024-12-17
TEAD3 and TEAD4 play overlapping role in bovine preimplantation development
2024-Dec-01, Reproduction (Cambridge, England)
研究论文 研究探讨了TEAD3和TEAD4在牛胚胎植入前发育中的重叠作用 首次揭示了TEAD3在牛胚胎植入前发育中的特异性表达,并发现TEAD3和TEAD4在牛胚胎发育中具有冗余功能 研究仅限于牛胚胎,未探讨其他物种中的情况 确定TEAD3在牛胚胎植入前发育中的功能作用 牛胚胎植入前发育中的TEAD3和TEAD4 NA NA 单细胞RNA测序、RNA干扰、碱基编辑 NA RNA 牛胚胎的单细胞RNA测序分析
230 2024-12-16
Fibroblast-specific TGF-β signaling mediates cardiac dysfunction, fibrosis, and hypertrophy in obese diabetic mice
2024-Dec-14, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 研究探讨了TGF-β信号在糖尿病心肌病中的作用,特别是通过纤维母细胞特异性TbR2和Smad3的缺失来减轻心脏功能障碍、纤维化和肥大 首次揭示了纤维母细胞特异性TGF-β/Smad3信号在2型糖尿病中导致心室纤维化、肥大和功能障碍的作用 体外实验未发现基质细胞或细胞内TSP-4对心脏纤维母细胞的显著激活作用,可能需要进一步研究 研究TGF-β诱导的纤维母细胞激活在糖尿病心肌病发病机制中的作用 肥胖糖尿病db/db小鼠的心脏功能、纤维化和肥大 NA 糖尿病 转录组学研究、单细胞RNA测序、Ingenuity路径分析 NA 基因表达数据 肥胖糖尿病db/db小鼠及纤维母细胞特异性TbR2和Smad3缺失的小鼠
231 2024-12-16
Cardiac Reprogramming and Gata4 Overexpression Reduce Fibrosis and Improve Diastolic Dysfunction in Heart Failure With Preserved Ejection Fraction
2024-Dec-14, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本文研究了心脏重编程和Gata4过表达在HFpEF模型中减少纤维化和改善舒张功能障碍的效果 首次证明了Gata4过表达在心脏纤维化中的抑制作用,并改善了HFpEF中的舒张功能障碍 研究仅在动物模型和人类心脏成纤维细胞中进行,尚未在临床试验中验证 探讨心脏重编程和Gata4过表达在HFpEF中的治疗潜力 HFpEF模型小鼠和人类心脏成纤维细胞 心血管疾病 心力衰竭 RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学 NA RNA Tcf21iCre/Tomato/MGTH2A转基因小鼠和人类心脏成纤维细胞
232 2024-12-16
Prevention of Intrauterine Adhesion with Platelet-Rich Plasma Double-Network Hydrogel
2024-Dec-14, Advanced biology IF:3.2Q3
研究论文 研究探讨了使用富血小板血浆双网络水凝胶(DN gel)预防宫腔粘连的效果 首次提出使用富血小板血浆双网络水凝胶(DN gel)进行宫腔粘连的预防,并通过单细胞测序分析其作用机制 研究结果主要基于实验数据,临床应用效果仍需进一步验证 探讨富血小板血浆双网络水凝胶在预防宫腔粘连中的应用效果 宫腔粘连患者 NA 妇科疾病 单细胞测序 NA 单细胞数据 具体样本数量未在摘要中提及
233 2024-12-16
SLAM-seq reveals independent contributions of RNA processing and stability to gene expression in African trypanosomes
2024-Dec-14, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 研究探讨了非洲锥虫中RNA加工和稳定性对基因表达的独立贡献 开发了SLAM-seq技术,结合TT-seq和scRNA-seq数据,量化了RNA加工速率和半衰期,揭示了RNA加工和稳定性对mRNA水平的独立影响 NA 研究非洲锥虫中RNA加工和降解过程对基因表达的控制机制 非洲锥虫(Trypanosoma brucei)中的RNA加工和稳定性 基因表达调控 寄生虫病 SLAM-seq, TT-seq, scRNA-seq NA RNA NA
234 2024-12-16
Homoharringtonine synergizes with venetoclax in early T cell progenitor acute lymphoblastic leukemia: Bench and bed
2024-Dec-13, Med (New York, N.Y.)
研究论文 研究评估了homoharringtonine(HHT)与venetoclax(VEN)联合治疗早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP-ALL)的协同效应及其机制 首次展示了HHT与VEN联合治疗ETP-ALL的强协同效应,并通过单细胞RNA测序和western blot验证了其机制 研究样本量较小,仅包括6名患者,需要进一步的大规模临床试验验证 探索HHT与VEN联合治疗ETP-ALL的疗效及其机制 早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP-ALL)患者 NA 白血病 单细胞RNA测序,western blot NA 细胞 6名ETP-ALL患者
235 2024-12-16
Single-cell transcriptomics of vomeronasal neuroepithelium reveals a differential endoplasmic reticulum environment amongst neuronal subtypes
2024-Dec-13, eLife IF:6.4Q1
研究论文 研究通过单细胞转录组学分析小鼠犁鼻器感觉上皮细胞,揭示了不同神经元亚型之间的内质网环境的差异 首次通过单细胞转录组学揭示了犁鼻器感觉上皮细胞中不同神经元亚型的内质网环境差异,并提供了可搜索的基因表达模式网络资源 研究仅限于小鼠犁鼻器感觉上皮细胞,未涉及其他物种或其他类型的细胞 探究犁鼻器感觉上皮细胞中的细胞类型、发育基因表达模式以及神经元之间的功能差异 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的神经元亚型 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的多个单细胞样本
236 2024-12-16
Insulin-like growth factor binding protein 7 identified in aged dental pulp by single-cell RNA sequencing
2024-Dec-12, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序探索年轻和老年牙髓组织的异质性,并鉴定老年牙髓组织中的新标记物IGFBP7 首次通过单细胞RNA测序技术鉴定老年牙髓组织中的IGFBP7,并验证其对细胞衰老的影响 需要进一步研究以明确IGFBP7影响牙髓老化的具体机制 探索年轻和老年牙髓组织的异质性,并寻找老年牙髓组织的新标记物及其机制 年轻和老年牙髓组织 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫组织化学染色,RNA测序 NA RNA 8个牙髓样本,共测序32,012个细胞
237 2024-12-16
CAR T cells secreting NGF-neutralizing scFv enhance efficacy in clear cell renal cell carcinoma by relieving immunosuppression through immunosympathectomy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv来缓解肾透明细胞癌免疫抑制微环境,从而增强CAR T细胞的抗肿瘤效果 首次提出通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv实现肿瘤免疫交感神经切除,从而减弱肿瘤微环境的免疫抑制 研究主要集中在肾透明细胞癌,其结果在其他类型肿瘤中的适用性尚不明确 探索通过免疫交感神经切除增强CAR T细胞在实体瘤中的疗效 肾透明细胞癌的免疫抑制微环境和CAR T细胞的抗肿瘤效果 免疫学 肾癌 RNA测序 CAR T细胞 RNA 多种癌症类型的基因集和肾透明细胞癌样本
238 2024-12-16
Multiomics reveals tumor microenvironment remodeling in locally advanced gastric and gastroesophageal junction cancer following neoadjuvant immunotherapy and chemotherapy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了局部晚期胃癌和胃食管交界癌在接受新辅助免疫治疗和化疗后肿瘤微环境的动态变化 首次通过多组学分析揭示了新辅助免疫化疗后肿瘤微环境的动态变化,并构建了一个预测主要病理反应的模型 样本量较小,仅基于一个临床试验的数据,可能限制了结果的普适性 探讨新辅助免疫化疗对局部晚期胃癌和胃食管交界癌肿瘤微环境的影响及其机制 局部晚期胃癌和胃食管交界癌患者在接受新辅助免疫化疗前后的肿瘤微环境 数字病理学 胃癌 全外显子测序、全转录组测序、多重免疫荧光和单细胞RNA测序 回归模型 基因组数据、转录组数据、免疫细胞数据 30名患者
239 2024-12-16
DEHP-mediated oxidative stress leads to impaired testosterone synthesis in Leydig cells through the cAMP/PKA/SF-1/StAR pathway
2024-Dec-08, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
研究论文 本研究探讨了DEHP通过cAMP/PKA/SF-1/StAR途径介导的氧化应激导致Leydig细胞中睾酮合成受损的机制 首次揭示了DEHP通过诱导氧化应激抑制cAMP/PKA/SF-1/StAR途径,从而导致Leydig细胞中睾酮合成受损的机制 研究主要集中在体外和体内实验,缺乏更大规模的临床验证 探讨DEHP对Leydig细胞损伤的作用及其机制 Leydig细胞及其在DEHP暴露下的结构和功能变化 NA NA scRNA-seq NA 基因表达数据 涉及体外和体内实验,具体样本数量未明确提及
240 2024-12-16
Exploring immune gene expression and potential regulatory mechanisms in anaplastic thyroid carcinoma using a combination of single-cell and bulk RNA sequencing data
2024-Dec-07, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本文通过结合单细胞和批量RNA测序数据,探索了间变性甲状腺癌中的免疫基因表达及其潜在的调控机制 本文创新性地整合了单细胞和批量RNA测序数据,识别了间变性甲状腺癌中的差异表达免疫基因,并构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络,为治疗间变性甲状腺癌提供了潜在靶点 本文的局限性在于依赖于已有的公开数据集,未进行实验验证,且样本量较小 本文旨在通过分析单细胞和批量RNA测序数据,识别间变性甲状腺癌中的免疫基因表达及其调控机制,为诊断和治疗提供新靶点 本文的研究对象是间变性甲状腺癌中的免疫基因表达及其调控机制 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) NA RNA测序数据 来自Gene Expression Omnibus(GEO)数据库的单细胞和批量RNA测序数据
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