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当前共找到 699 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-07 |
Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.626682
PMID:39713308
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研究论文 | 本研究揭示了STAT3功能获得性突变综合征中嘌呤信号通路异常与CD8+ T细胞功能失调的分子机制 | 首次发现STAT3 GOF综合征中CD8+ T细胞存在嘌呤信号通路失调，具体表现为CD39表达上调而CD73和A2AR表达下调 | STAT3 GOF变异驱动病理的确切分子机制尚未完全阐明 | 探究STAT3功能获得性突变导致CD8+ T细胞失调的分子机制 | STAT3 GOF综合征患者和小鼠模型的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫调节疾病 | 单细胞RNA测序, 高维免疫分析, 功能评估 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | STAT3 GOF患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals a unique microenvironment in peri-implantitis
2024-12, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13982
PMID:38566468
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示种植体周围炎独特的免疫微环境特征 | 首次通过单细胞分析发现种植体周围炎中CXCL13+成纤维细胞亚群特异性增加，并揭示其通过CXCL8/CXCL6-CXCR2/CXCR1轴招募中性粒细胞的机制 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 揭示种植体周围炎的独特微环境特征 | 种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体的组织活检样本 | 数字病理学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 223 | 2025-10-07 |
Gpnmb and Spp1 mark a conserved macrophage injury response masking fibrosis-specific programming in the lung
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182700
PMID:39509324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肺损伤后巨噬细胞亚群，揭示了Gpnmb和Spp1标记的巨噬细胞是组织损伤的保守反应而非纤维化特异性程序 | 首次发现巨噬细胞亚群聚类主要由细胞起源和组织分区驱动而非损伤模型，并鉴定出Gpnmb表达巨噬细胞作为组织损伤的保守反应标志 | 研究仅基于小鼠模型和已有的人类数据集，需要进一步实验验证机制 | 探究肺损伤后不同巨噬细胞亚群在健康修复和纤维化修复中的不同作用机制 | 小鼠肺巨噬细胞和人类肺疾病数据集 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS或博来霉素处理的小鼠肺巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 224 | 2025-10-07 |
Predicting lung aging using scRNA-Seq data
2024-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012632
PMID:39700255
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研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序数据的年龄预测回归模型PolyEN | 提出了PolyEN模型，能够学习基因表达随时间的连续表示，并整合基因信息进行年龄预测 | NA | 基于单细胞RNA测序数据预测肺衰老 | 肺上皮细胞和肺内皮细胞 | 机器学习 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 225 | 2025-10-07 |
Intrinsic GATA4 expression sensitizes the aortic root to dilation in a Loeys-Dietz syndrome mouse model
2024-Dec, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00562-5
PMID:39567770
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析Loeys-Dietz综合征小鼠模型中血管平滑肌细胞的异质性，揭示GATA4表达如何增加主动脉根部对扩张的敏感性 | 首次发现表达GATA4的血管平滑肌细胞亚群在主动脉根部固有存在，并证明其具有低分化和促炎特征，且GATA4缺失可减轻主动脉根部扩张 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自现有单细胞RNA测序数据集验证 | 探究Loeys-Dietz综合征中主动脉根部特别易发生动脉瘤的分子机制 | Tgfbr1 LDS小鼠模型的主动脉血管平滑肌细胞 | 单细胞转录组学 | Loeys-Dietz综合征 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | LDS小鼠模型主动脉组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-07 |
ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost
2024-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127912
PMID:39326350
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了β-葡聚糖训练通过激活Th17细胞缓解鲆鱼肠道炎症的机制 | 首次在硬骨鱼中发现训练免疫通过调节肠道Th17细胞功能对抗细菌感染的机制 | 研究仅限于鲆鱼模型，尚未在其他物种验证 | 探究硬骨鱼肠道免疫细胞在细菌感染中维持肠道稳态的细胞机制 | 鲆鱼(Scophthalmus maximus)肠道免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肠道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2025-10-07 |
Characterization of CD8+ virtual memory T cells in IL-4 knockout mice using single-cell RNA sequencing
2024-12-17, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150950
PMID:39515094
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析IL-4敲除小鼠中CD8+虚拟记忆T细胞的特性 | 首次在IL-4缺陷条件下系统表征外周CD8+虚拟记忆T细胞的分子特征和亚群变化 | 研究仅使用C57BL/6小鼠品系，样本量有限 | 探究IL-4缺失对外周CD8+虚拟记忆T细胞发育和维持的影响机制 | 野生型和IL-4敲除C57BL/6小鼠的脾脏CD8+ T细胞 | 单细胞基因组学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 野生型和IL-4敲除C57BL/6小鼠脾脏CD8+ T细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 228 | 2025-10-07 |
HIV-SEQ REVEALS GLOBAL HOST GENE EXPRESSION DIFFERENCES BETWEEN HIV-TRANSCRIBING CELLS FROM VIREMIC AND SUPPRESSED PEOPLE WITH HIV
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.17.629023
PMID:39763963
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研究论文 | 开发了HIV-seq方法用于更有效地捕获HIV转录本，并比较HIV病毒血症期和抑制期患者中HIV转录细胞的基因表达差异 | 开发了HIV-seq技术，通过添加针对HIV基因组保守区域的定制捕获序列，将HIV RNA+细胞的检测效率提高了44% | HIV转录细胞频率低且HIV转录本水平低，非多聚腺苷酸化转录本难以捕获 | 研究HIV转录细胞在病毒血症期和抗逆转录病毒治疗抑制期的基因表达差异 | HIV感染者的血液样本细胞 | 单细胞测序分析 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | 单细胞RNA测序数据，表面表型数据 | 配对的HIV感染者血液样本（治疗前vs治疗后） | NA | 单细胞RNA-seq，表面表型分析 | NA | HIV-seq与CITE-seq联合使用 |
| 229 | 2025-10-07 |
Pseudo-Label Guided Structural Discriminative Subspace Learning for Unsupervised Feature Selection
2024-Dec, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2023.3319372
PMID:37796670
|
研究论文 | 提出一种名为伪标签引导结构判别子空间学习的无监督特征选择方法 | 将概率图构建引入特征选择学习过程作为统一框架，并提出伪标签引导学习机制结合基于图的方法和类间散布矩阵最大化思想 | 需要解决NP难问题，存在参数确定和计算复杂度挑战 | 开发更有效的无监督特征选择方法 | 九个真实世界数据集和三个单细胞RNA测序基因数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 子空间学习模型 | 基因表达数据 | 12个数据集（9个通用数据集+3个scRNA-seq数据集） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 230 | 2025-10-07 |
Optimizing CAR-T cell Culture: Differential effects of IL-2, IL-12, and IL-21 on CAR-T cells
2024-Dec, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2024.156758
PMID:39299100
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析比较了IL-2、IL-12和IL-21三种细胞因子对CAR-T细胞的影响 | 首次在单细胞水平系统比较不同细胞因子对CAR-T细胞表型的影响，发现IL-21能避免细胞衰竭和衰老 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 优化CAR-T细胞培养条件，寻找最佳细胞因子组合 | CAR-T细胞 | 单细胞测序分析 | 血液恶性肿瘤 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 231 | 2025-10-07 |
Ectopic expression of NKG7 enhances CAR-T function and improves the therapeutic efficacy in liquid and solid tumors
2024-Dec, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107506
PMID:39551173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现NKG7过表达可增强CAR-T细胞功能并提高对液体和实体瘤的治疗效果 | 首次利用临床样本单细胞测序数据发现NKG7可作为增强CAR-T细胞功能的靶点，并验证其在多种消化系统癌症模型中的治疗效果 | 研究样本量有限（19例单细胞测序数据），且缺乏治疗后活检样本验证 | 探索增强CAR-T细胞功能的策略并提高其抗肿瘤疗效 | 消化系统癌症患者肿瘤浸润T细胞及B7H3阳性消化系统癌细胞系 | 单细胞测序分析 | 消化系统癌症 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞模型 | 单细胞RNA测序数据 | 19例消化系统癌症临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 232 | 2025-10-07 |
Systemic immune profiling analysis identifying M2-TAM related genes predicted colon cancer prognosis and chemotherapy responses
2024-Dec-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000040979
PMID:39969348
|
研究论文 | 本研究通过系统免疫分析鉴定M2-TAM相关基因，用于预测结肠癌预后和化疗反应 | 开发了新的M2样巨噬细胞标记基因，建立了基于7个基因的M2-TAM风险模型，并通过孟德尔随机化验证了免疫检查点与结肠癌的因果关系 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索与M2样巨噬细胞相关的新生物标志物，用于结肠癌预后预测和治疗反应评估 | 结肠癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组分析，单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，LASSO回归，Cox回归，孟德尔随机化 | 风险预测模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结肠癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2025-10-07 |
NLSDeconv: an efficient cell-type deconvolution method for spatial transcriptomics data
2024-12-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae747
PMID:39705170
|
研究论文 | 提出了一种基于非负最小二乘的空间转录组学数据细胞类型反卷积方法NLSDeconv | 开发了计算效率优于现有18种反卷积方法的新算法 | NA | 解决空间转录组学数据缺乏单细胞分辨率的问题 | 空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 非负最小二乘法 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 234 | 2025-10-07 |
Accurate RNA velocity estimation based on multibatch network reveals complex lineage in batch scRNA-seq data
2024-Dec-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-02085-8
PMID:39696422
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研究论文 | 提出一种名为VeloVGI的新方法，用于在批次单细胞RNA测序数据中准确估计RNA速度并揭示复杂细胞谱系 | 通过结合最优传输和互最近邻方法构建批次数据中的邻居关系，并将图结构整合到编码器中改进速度估计 | 未明确说明方法在更广泛数据集上的适用性和计算效率 | 解决批次效应对RNA速度估计的影响，提高细胞发育轨迹推断的准确性 | 小鼠脊髓和嗅球组织细胞，以及多个公共单细胞RNA测序数据集 | 单细胞生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | VeloVGI（基于图神经网络的编码器模型） | 单细胞RNA测序数据（剪接和未剪接矩阵） | 多个公共数据集，包括小鼠脊髓和嗅球组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 235 | 2025-10-07 |
B-Cell Activation Gene Signature in Blood and Liver of Hepatitis B e Antigen-Positive Patients With Immune Active Chronic Hepatitis B
2024-Dec-16, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae280
PMID:38847286
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研究论文 | 本研究通过分析慢性乙型肝炎患者血液和肝脏中B细胞的基因表达谱，揭示了免疫活跃期患者的B细胞激活特征 | 首次在慢性乙型肝炎患者中同时分析血液和肝脏B细胞的基因表达特征，并通过单细胞RNA测序技术识别了naive和记忆B细胞亚群作为主要特征携带者 | 样本量有限，研究主要关注免疫活跃期患者，未涵盖所有慢性HBV感染阶段 | 探究慢性乙型肝炎患者B细胞的激活状态及其在HBV感染中的免疫反应特征 | 免疫活跃期慢性乙型肝炎患者和健康对照者的血液及肝脏B细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | RNA测序, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 慢性乙型肝炎患者和健康对照者样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 | NA | NA |
| 236 | 2025-10-07 |
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08105-5
PMID:39506125
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析免疫检查点抑制剂引发的心肌炎患者心脏、肿瘤和血液中的免疫反应特征 | 首次在irMyocarditis患者中同时分析心脏、肿瘤和血液的免疫反应，发现心脏扩增的TCR克隆不识别常见心脏自身抗原，且与肿瘤TCR克隆重叠度低 | 样本量相对有限（28例患者），部分机制仍需进一步验证 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系 | 28例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41例未受影响个体 | 免疫学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，显微镜检查，蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据，显微镜图像，蛋白质数据 | 28例irMyocarditis患者，41例对照个体，共分析84576个心脏细胞和366066个血液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2025-02-14 |
Reconstruction of gene regulatory networks from single cell transcriptomic data
2024-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/vjgb-24-104
PMID:39944798
|
综述 | 本文综述了从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据重建基因调控网络（GRNs）的方法和程序 | 本文特别关注了利用其他组学数据（主要是转录因子结合位点和开放染色质图谱）来提高单细胞转录组数据重建GRN的准确性 | 单细胞组学数据的技术和生物学特性需要特定的GRN推断方法 | 理解和研究细胞在发育过程中及响应各种内外刺激时使用的机制 | 基因调控网络（GRNs） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomes of dissecting the intra-tumoral heterogeneity of breast cancer microenvironment
2024-Dec-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06015-7
PMID:39724260
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示乳腺癌肿瘤微环境的瘤内异质性 | 首次构建包含54,055个细胞的乳腺癌单细胞转录组图谱，识别了恶性上皮细胞的六种共同表达程序和六种亚型特异性表达程序 | 样本量较小（仅4例恶性患者和4例非恶性患者），需要更大规模研究验证 | 研究乳腺癌异质性在单细胞转录组中的形成机制和作用 | 乳腺癌临床标本中的细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 54,055个高质量细胞，来自4例恶性和4例非恶性患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 239 | 2025-10-07 |
Case study of a neuroendocrine tumor of uncertain origin: single-cell transcriptomics unravels potential primary location
2024-Dec-31, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06071-z
PMID:39738894
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案例研究 | 通过单细胞转录组学技术确定一例来源不明的神经内分泌肿瘤的原发部位 | 首次将单细胞RNA测序和全外显子组测序结合用于神经内分泌肿瘤的原发部位鉴定 | 仅为一例个案研究，需要更大样本量验证 | 确定非器官局限性神经内分泌肿瘤的原发来源以指导精准诊疗 | 一例位于十二指肠和胰头之间的腹膜后非功能性神经内分泌肿瘤 | 单细胞转录组学 | 神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | 分子基因特征分类模型 | 单细胞转录组数据, 外显子组数据 | 1例神经内分泌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 240 | 2025-10-07 |
Identification of psoriasis-associated immune marker G3BP2 through single-cell RNA sequencing and meta analysis
2024-12, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13851
PMID:39267394
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和荟萃分析识别与银屑病相关的免疫标志物G3BP2 | 首次结合单细胞RNA测序和荟萃分析方法，在细胞水平阐明银屑病潜在机制并识别关键免疫调控标志基因 | 样本量相对有限（12例患者），机制研究主要基于生物信息学分析 | 探索银屑病发病机制并识别有效治疗靶点 | 银屑病患者皮肤组织样本 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 荟萃分析, WGCNA, LASSO回归, ROC分析 | PCA, tSNE, WGCNA, LASSO | 基因表达数据 | 12例银屑病患者皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |