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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-07 |
Mucosal Single-Cell Profiling of Crohn's-Like Disease of the Pouch Reveals Unique Pathogenesis and Therapeutic Targets
2024-Dec, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.025
PMID:39084267
|
研究论文 | 通过单细胞分析技术研究克罗恩样储袋病(CDP)的黏膜细胞特征,揭示其独特发病机制和潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统描绘CDP的细胞图谱,发现内质网应激在免疫和非免疫细胞中普遍增强的独特特征 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究克罗恩样储袋病(CDP)的病理生理机制和潜在治疗靶点 | 接受回肠储袋肛管吻合术患者的黏膜组织样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 50例患者 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 202 | 2025-10-07 |
Novel Perspective on Sevoflurane-Induced Cognitive Dysfunction: Implications of Neuronal SIRPα and Microglial Synaptic Remodeling
2024-12-18, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.4c00485
PMID:39644326
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研究论文 | 本研究探讨神经元SIRPα和小胶质细胞突触重塑在七氟醚诱导新生小鼠认知功能障碍中的作用 | 首次揭示神经元SIRPα通过调控小胶质细胞功能改善七氟醚诱导的认知障碍,并发现IRF8与SIRPα表达的相关性 | 研究仅针对新生小鼠,未验证其他年龄阶段;转录组分析显示皮质小胶质细胞和神经元无显著变化 | 阐明七氟醚诱导认知功能障碍的分子机制 | 新生小鼠 | 神经科学 | 认知功能障碍 | 单细胞转录组测序, 慢病毒过表达, SCENIC分析 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | 新生小鼠皮质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 203 | 2025-10-07 |
Unraveling the immunomodulatory impact of hydroxychloroquine on peripheral T cells using single-cell RNA sequencing
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103324
PMID:39405653
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示羟氯喹对外周T细胞的免疫调节作用机制 | 首次在单细胞水平系统阐明羟氯喹对T细胞亚群的差异化调控作用,特别是发现其对CD8+T细胞细胞毒性的增强作用 | 研究主要基于体外实验,需要更多体内实验验证;样本量有限 | 探究羟氯喹对T细胞的免疫调节机制 | 外周T细胞(CD4+T细胞和CD8+T细胞) | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 狼疮患者样本(含羟氯喹治疗组和未治疗组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 204 | 2025-10-07 |
Cellular communication network factor 3 contributes to the pathological process of rheumatoid arthritis through promoting cell senescence and osteoclastogenesis in the joint
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103334
PMID:39549484
|
研究论文 | 本研究探讨细胞通讯网络因子3在类风湿关节炎病理过程中的作用机制及治疗潜力 | 首次揭示CCN3通过促进细胞衰老和破骨细胞分化参与类风湿关节炎病理过程,并验证其抗体治疗的潜在价值 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究CCN3在类风湿关节炎中的分子功能及治疗靶点潜力 | 类风湿关节炎患者的关节组织、滑膜细胞、单核细胞及实验小鼠模型 | 病理学研究 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养、动物模型实验 | 实验性关节炎动物模型 | 基因表达数据、细胞表型数据、组织病理数据 | 公共单细胞RNA测序数据集及实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 205 | 2025-10-07 |
EZH2 promotes B-cell autoimmunity in primary Sjogren's syndrome via METTL3-mediated m6A modification
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103341
PMID:39577129
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研究论文 | 本研究揭示了EZH2通过METTL3介导的m6A修饰促进原发性干燥综合征中B细胞自身免疫反应的机制 | 首次阐明METTL3通过m6A修饰调控EZH2表达,进而影响B细胞功能的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 探索EZH2在原发性干燥综合征B细胞自身免疫反应中的作用及治疗潜力 | 原发性干燥综合征患者外周血B细胞、唾液腺组织及三种干燥综合征小鼠模型 | 生物医学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,ChIP测序,ChIP-qPCR,流式细胞术,CFSE检测,RIP实验,放线菌素D实验,m6A-RIP-qPCR | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,临床数据 | 原发性干燥综合征患者样本和三种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序,染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 206 | 2025-10-07 |
Long-term, cell type-specific effects of prenatal stress on dorsal striatum and relevant behaviors in mice
2024-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.627207
PMID:39763907
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨产前应激对成年后代背侧纹状体功能和行为的长期影响 | 首次在单细胞水平揭示产前应激对背侧纹状体多种细胞类型的长期分子影响,并发现与自闭症风险基因的关联 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究产前应激如何影响背侧纹状体细胞分子机制及相关行为 | 产前应激小鼠模型的成年后代 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据、行为数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 207 | 2025-10-07 |
Spatially Informed Graph Structure Learning Extracts Insights from Spatial Transcriptomics
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403572
PMID:39382177
|
研究论文 | 提出一种名为STAGUE的创新框架,通过空间信息图结构学习从空间转录组数据中提取生物学见解 | 首次将图结构学习与对比学习相结合,能够同时学习细胞图结构和低维嵌入,突破了传统仅依赖空间邻近度定义图结构的限制 | NA | 开发能够更好表征细胞间相互作用多样性的空间转录组数据分析方法 | 空间转录组数据集中的细胞图结构和细胞间相互作用 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,图结构学习,对比学习 | 图结构学习框架 | 空间转录组数据 | 86个真实和模拟的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 208 | 2025-10-07 |
Cytokine expression and cytokine-mediated cell-cell communication during skeletal muscle regeneration revealed by integrative analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.12055
PMID:39691872
|
研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序数据揭示骨骼肌再生过程中的细胞因子表达和细胞间通讯机制 | 首次整合15个公共单细胞RNA测序数据集,系统分析393种小鼠细胞因子在骨骼肌再生中的动态表达谱和细胞间通讯网络 | 仅分析早期再生时间点(0、2、5、7天),未涵盖完整再生过程;基于转录组数据推断细胞通讯,需实验验证 | 解析骨骼肌再生过程中细胞因子介导的细胞间通讯机制 | 小鼠骨骼肌再生过程中的各种细胞类型 | 单细胞生物学 | 肌肉损伤修复 | 单细胞RNA测序 | CellChat | 单细胞转录组数据 | 整合15个公共scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 209 | 2025-10-07 |
Scaling deep identifiable models enables zero-shot characterization of single-cell biological states
2024-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.11.566161
PMID:38014345
|
研究论文 | 开发了scShift深度学习框架,用于消除单细胞RNA测序数据中的批次效应并识别真实生物差异 | 通过扩展深度可识别模型实现了零样本表征能力,能够外推至未见过的生物状态如COVID-19后纤维化 | 需要大规模单细胞图谱数据进行训练,存在数据多样性过渡阈值 | 解决单细胞RNA测序数据分析中跨数据集批次效应的挑战 | 单细胞RNA测序数据,特别是肺纤维化状态 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 深度变分推断框架 | 单细胞RNA测序数据 | 超过200个训练模型,基于大规模单细胞图谱汇编 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 210 | 2025-10-07 |
Arctiin alleviates knee osteoarthritis by suppressing chondrocyte oxidative stress induced by accumulated iron via AKT/NRF2/HO-1 signaling pathway
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83383-7
PMID:39738432
|
研究论文 | 本研究探讨牛蒡苷通过AKT/NRF2/HO-1信号通路减轻铁过载诱导的软骨细胞氧化应激,从而缓解膝骨关节炎 | 首次揭示牛蒡苷通过调节铁代谢和激活AKT/NRF2/HO-1通路同时抑制软骨细胞凋亡和铁死亡的双重保护机制 | 未明确牛蒡苷的具体分子靶点及其在人体中的安全有效性 | 探究牛蒡苷对铁过载所致膝骨关节炎的治疗作用及分子机制 | 膝骨关节炎患者的软骨细胞及疾病模型 | 分子生物学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序, CCK-8检测, 流式细胞术, 荧光检测, Q-RTPCR, Western Blotting, 显微CT, 组织染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白表达数据, 影像数据, 组织学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 211 | 2025-10-07 |
Integrated analyses of Mendelian randomization, eQTL, and single-cell transcriptome identify CCN3 as a potential biomarker in aortic dissection
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83611-0
PMID:39738466
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、eQTL和单细胞转录组分析,鉴定CCN3作为主动脉夹层的潜在生物标志物 | 首次结合多种分析方法系统筛选主动脉夹层相关血浆分泌蛋白,发现CCN3在mRNA和血浆水平均下调并可能具有保护作用 | 当前AD与血浆蛋白水平相关性研究稀缺且缺乏特异性,样本量有限 | 探索血浆分泌蛋白作为主动脉夹层的潜在生物标志物 | 主动脉夹层患者与正常个体的基因表达和血浆蛋白水平 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究,eQTL分析,单细胞转录组测序,qPCR,酶联免疫吸附试验 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据,蛋白质数据 | 三个GEO数据集的患者样本和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 212 | 2025-10-07 |
Claudin 7 suppresses invasion and metastasis through repression of a smooth muscle actin program
2024-Dec-02, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202311002
PMID:39320351
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研究论文 | 本研究揭示了紧密连接蛋白Claudin 7通过抑制平滑肌肌动蛋白相关基因表达来抑制乳腺癌侵袭和转移的机制 | 首次通过功能遗传学方法在鼠源乳腺癌类器官模型中证实Cldn7对侵袭转移的抑制作用,并发现其通过调控SMA相关基因和间充质表型实现这一功能 | 研究主要基于动物模型和细胞系,人类临床样本验证相对有限 | 探究Claudin 7在乳腺癌转移过程中的作用机制 | 鼠源乳腺癌类器官、人类乳腺癌细胞系、新鲜人类肿瘤组织 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 功能遗传学、转录组分析、RNA-seq | NA | 基因表达数据、RNA-seq数据 | 鼠源乳腺癌类器官模型、人类细胞系、人类肿瘤组织样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2025-10-07 |
Different gene expression patterns between mouse and human brain pericytes revealed by single-cell/nucleus RNA sequencing
2024-12, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2024.107434
PMID:39423955
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研究论文 | 通过单细胞/核RNA测序比较小鼠和人类大脑周细胞基因表达模式的异同 | 首次系统比较小鼠和人类大脑周细胞的转录组差异,识别物种特异性基因表达模式 | 仅分析成年大脑周细胞,未涵盖发育阶段或其他脑区 | 研究小鼠和人类大脑周细胞基因表达的相似性和差异性 | 小鼠和人类成年大脑周细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四个小鼠和人类大脑周细胞单细胞/核RNA测序数据集 | 10x Genomics,其他 | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium,Smart-seq | 10x单细胞RNA测序平台和Smart-seq单细胞RNA测序平台 |
| 214 | 2025-10-07 |
Development of a prognostic gene signature and exploration of P4HA1 in the modulation of cuproptosis in colorectal cancer
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82625-y
PMID:39738206
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于铜死亡相关基因的预后模型,并探索了P4HA1在结直肠癌铜死亡调控中的作用 | 首次构建了结直肠癌铜死亡相关基因的预后模型,并发现P4HA1作为关键基因调控铜死亡过程 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索铜死亡在结直肠癌中的作用并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组分析,WGCNA,LASSO回归,随机森林,单细胞测序,体外实验 | 预后预测模型 | 转录组数据,临床数据 | TCGA数据库结直肠癌患者数据及两个独立外部验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2025-10-07 |
Human Enteric Glia Diversity in Health and Disease: New Avenues for the Treatment of Hirschsprung Disease
2024-Dec-24, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.12.011
PMID:39725172
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了儿童肠道中两种主要肠胶质细胞亚类,并探索了5-HT激动剂对赫希施普龙病的治疗潜力 | 首次在人类肠道中鉴定出施万样肠胶质细胞和经典肠胶质细胞两种主要亚类,发现前者在出生后更为丰富且在赫希施普龙病无神经节段中持续存在 | 样本来源于儿科患者,结果可能不适用于成人群体;斑马鱼模型与人类疾病存在物种差异 | 探索健康与疾病状态下肠胶质细胞的多样性及其在赫希施普龙病治疗中的应用 | 儿科对照组和赫希施普龙病患者的肠道全层切除标本,以及野生型和ret突变斑马鱼 | 单细胞转录组学 | 赫希施普龙病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,荧光原位杂交,荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 儿科对照组和赫希施普龙病患者肠道样本,野生型和ret突变斑马鱼 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 216 | 2025-10-07 |
Identification and validation of up-regulated TNFAIP6 in osteoarthritis with type 2 diabetes mellitus
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82985-5
PMID:39733138
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定并验证了TNFAIP6作为2型糖尿病相关骨关节炎的关键上调基因 | 首次在转录水平系统研究T2DM与OA的关联,发现TNFAIP6作为前肥大软骨细胞标志物在T2DM相关OA中的新作用机制 | 研究样本来源为公共数据库,实验验证仅限于大鼠软骨细胞和人类关节软骨 | 探索2型糖尿病促进骨关节炎进展的分子机制 | 骨关节炎和2型糖尿病患者的基因表达数据、大鼠软骨细胞、人类关节软骨 | 生物信息学 | 骨关节炎, 2型糖尿病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析 | WGCNA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 217 | 2025-10-07 |
A prognostic molecular signature of hepatic steatosis is spatially heterogeneous and dynamic in human liver
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101871
PMID:39657669
|
研究论文 | 本研究通过整合临床表型、循环蛋白质组学和组织转录组学,识别出肝脏脂肪变性的动态功能生物标志物 | 发现肝脏脂肪变性的分子特征具有空间异质性和动态性,并建立了与脂肪肝疾病相关的循环多蛋白特征 | NA | 识别肝脏脂肪变性的动态功能生物标志物 | 人类肝脏组织 | 数字病理学 | 脂肪肝疾病 | 多模态成像,蛋白质组学分析,空间转录组学 | NA | 图像,蛋白质组数据,转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,蛋白质组分析 | NA | 人源化'芯片肝脏'模型 |
| 218 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of stem cells from human exfoliated deciduous teeth investigating functional heterogeneity in immunomodulation
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82734-8
PMID:39732760
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人脱落乳牙干细胞在免疫调节中的功能异质性 | 首次在单细胞水平揭示SHED不同分化状态下的免疫调节功能异质性,并与其他人源MSCs进行功能比较 | 仅进行体外实验验证,缺乏体内实验数据支持 | 探究人脱落乳牙干细胞的免疫调节功能异质性 | 人脱落乳牙干细胞(SHED) | 单细胞组学 | 炎症性疾病,自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 219 | 2025-10-07 |
Extrasinusoidal macrophages are a distinct subset of immunologically active dural macrophages
2024-12-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh1129
PMID:39705337
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术鉴定并表征了硬脑膜外窦巨噬细胞这一独特的免疫活性细胞亚群 | 首次发现硬脑膜外窦巨噬细胞在起源、扩增动力学和转录谱方面与软脑膜和中枢神经系统实质巨噬细胞存在显著差异,并揭示其在自身免疫性神经炎症中执行粒细胞凋亡清除功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类硬脑膜巨噬细胞的特性和功能仍需进一步验证 | 探究硬脑膜外窦巨噬细胞的细胞和功能异质性 | 小鼠硬脑膜巨噬细胞 | 免疫学 | 自身免疫性神经炎症 | 单细胞转录组学, 命运图谱, 共聚焦成像, 克隆分析, 转基因小鼠系 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 220 | 2025-10-07 |
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400332
PMID:39465979
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研究论文 | 本研究通过局部控制递送IL-4评估其在牙周病小鼠模型中减少炎症性骨丢失的效果 | 首次将IL-4封装于可生物降解聚合物载体中进行局部持续递送,并证明其能促进牙周组织修复和骨再生 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 评估靶向巨噬细胞的控释药物递送策略在慢性炎症治疗中的可行性 | 牙周病小鼠模型中的巨噬细胞和牙周组织 | 免疫治疗 | 牙周病 | 单细胞RNA测序,药物控释技术 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |