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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-07 |
PPARγ-dependent remodeling of translational machinery in adipose progenitors is impaired in obesity
2024-Dec-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114945
PMID:39579770
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和核糖体分析揭示了PPARγ激动剂如何通过调控翻译机制促进肥胖状态下脂肪组织的可塑性 | 首次发现PPARγ直接调控核糖体因子表达并通过促进特定mRNA的翻译选择性来增强脂肪生成 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证 | 探究PPARγ激动剂在肥胖状态下对脂肪组织前体细胞翻译机制的重塑作用 | 肥胖小鼠的基质血管组分细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序, 核糖体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 肥胖小鼠的腹股沟和附睾脂肪组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-07 |
Current insights into human pathogenic phenuiviruses and the host immune system
2024-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2024.2384563
PMID:39072499
|
综述 | 本综述全面概述了人类致病性白纤病毒与宿主免疫系统的相互作用机制 | 系统整合了白纤病毒毒力因子与宿主免疫互作的最新研究进展,特别关注RVFV和SFTSV的免疫逃避机制 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 阐明人类致病性白纤病毒的宿主识别机制、免疫逃避策略和潜在治疗方法 | 人类致病性白纤病毒(特别是裂谷热病毒和发热伴血小板减少综合征病毒)及其与宿主免疫系统的相互作用 | NA | 病毒感染性疾病 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、基因编辑、单克隆抗体技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-07 |
Hidden liver-joint axis: HBV infection causes rheumatoid arthritis via TRAFD1 with imbalance of HBV X protein and trans-ferulic acid
2024-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2024.2422540
PMID:39484999
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研究论文 | 本研究揭示了乙肝病毒通过TRAFD1介导的肝-关节轴机制导致类风湿关节炎的发病机制 | 首次发现HBV编码的HBx蛋白通过上调TRAFD1促进成纤维样滑膜细胞向肌成纤维细胞转化,并鉴定反式阿魏酸可抑制此过程 | 动物模型为CIA模型而非直接HBV感染模型,临床样本量未明确说明 | 探究乙肝病毒感染与类风湿关节炎之间的因果关系及分子机制 | 乙肝病毒感染者、类风湿关节炎患者、转基因小鼠模型、成纤维样滑膜细胞 | 分子生物学 | 类风湿关节炎 | 孟德尔随机化分析、单细胞转录组测序、代谢组学、WGCNA | CIA小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、代谢组学 | NA | NA |
| 184 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveal distinctive patterns of fibroblast activation in heart failure with preserved ejection fraction
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01074-w
PMID:39311911
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示射血分数保留型心衰中成纤维细胞激活的独特模式 | 首次在早期HFpEF模型中系统鉴定疾病特异性成纤维细胞表型,并发现血管生成素样4(ANGPTL4)的核心调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 解析HFpEF疾病进展中成纤维细胞的分子激活机制 | 小鼠心脏间质细胞(成纤维细胞和巨噬细胞)及人类心肌组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 小鼠HFpEF模型及两种HFrEF模型,人类心肌样本和血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome unveils unique transcriptomic signatures of human organ-specific endothelial cells
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01087-5
PMID:39508863
|
研究论文 | 构建了包含超过21万个来自24个人类组织38个区域的内皮细胞图谱,揭示了不同组织内皮细胞的转录组异质性 | 首次系统性描绘了人类组织特异性内皮细胞的转录组特征,发现了毛细血管内皮细胞的高度异质性和组织特异性衰老模式 | 研究主要基于转录组数据,可能未完全捕捉蛋白质水平和功能层面的异质性 | 探索人类不同组织中内皮细胞的异质性和转录组特征 | 人类24个组织38个区域的210,000多个内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 多种疾病(与不同组织内皮细胞相关) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | >210,000个内皮细胞,来自24个人类组织的38个区域 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2025-10-07 |
Synthetic control removes spurious discoveries from double dipping in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.21.550107
PMID:37546812
|
研究论文 | 提出一种名为ClusterDE的统计方法,用于识别单细胞和空间转录组数据分析中可靠的细胞类型和空间域标记基因 | 通过生成合成零数据作为阴性对照,有效控制假发现率并消除因双重检验导致的虚假发现 | NA | 解决单细胞和空间转录组数据分析中的双重检验问题,识别可靠的差异表达基因 | 单细胞转录组数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 统计方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 187 | 2025-04-10 |
scRNA-Seq reveals age-dependent microglial evolution as a determinant of immune response following spinal cord injury
2024-12, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脊髓损伤后不同年龄组小胶质细胞的亚型及其功能差异 | 首次系统性地鉴定了脊髓损伤后年龄依赖性小胶质细胞亚型演化及其免疫功能差异 | 研究主要基于生物信息学分析,动物模型验证样本量有限 | 探究年龄因素如何通过小胶质细胞亚型影响脊髓损伤后的免疫反应 | 脊髓损伤后的小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, 免疫荧光染色 | 伪时间轨迹分析, CellChat细胞通讯分析 | 基因表达数据 | 整合GEO数据库中多个数据集的小鼠模型样本 | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2025-10-07 |
Transcriptomic Analysis of Air-Liquid Interface Culture in Human Lung Organoids Reveals Regulators of Epithelial Differentiation
2024-12-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13231991
PMID:39682739
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析气液界面培养对人肺类器官上皮分化的影响 | 首次使用单细胞RNA测序全面分析ALI培养对肺上皮细胞分化的调控机制 | NA | 识别影响上皮细胞分化的关键因素 | 人肺类器官上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2025-10-07 |
Mucosal Single-Cell Profiling of Crohn's-Like Disease of the Pouch Reveals Unique Pathogenesis and Therapeutic Targets
2024-Dec, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.025
PMID:39084267
|
研究论文 | 通过单细胞分析技术研究克罗恩样储袋病(CDP)的黏膜细胞特征,揭示其独特发病机制和潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统描绘CDP的细胞图谱,发现内质网应激在免疫和非免疫细胞中普遍增强的独特特征 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究克罗恩样储袋病(CDP)的病理生理机制和潜在治疗靶点 | 接受回肠储袋肛管吻合术患者的黏膜组织样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 50例患者 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-07 |
Novel Perspective on Sevoflurane-Induced Cognitive Dysfunction: Implications of Neuronal SIRPα and Microglial Synaptic Remodeling
2024-12-18, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.4c00485
PMID:39644326
|
研究论文 | 本研究探讨神经元SIRPα和小胶质细胞突触重塑在七氟醚诱导新生小鼠认知功能障碍中的作用 | 首次揭示神经元SIRPα通过调控小胶质细胞功能改善七氟醚诱导的认知障碍,并发现IRF8与SIRPα表达的相关性 | 研究仅针对新生小鼠,未验证其他年龄阶段;转录组分析显示皮质小胶质细胞和神经元无显著变化 | 阐明七氟醚诱导认知功能障碍的分子机制 | 新生小鼠 | 神经科学 | 认知功能障碍 | 单细胞转录组测序, 慢病毒过表达, SCENIC分析 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | 新生小鼠皮质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2025-10-07 |
Unraveling the immunomodulatory impact of hydroxychloroquine on peripheral T cells using single-cell RNA sequencing
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103324
PMID:39405653
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示羟氯喹对外周T细胞的免疫调节作用机制 | 首次在单细胞水平系统阐明羟氯喹对T细胞亚群的差异化调控作用,特别是发现其对CD8+T细胞细胞毒性的增强作用 | 研究主要基于体外实验,需要更多体内实验验证;样本量有限 | 探究羟氯喹对T细胞的免疫调节机制 | 外周T细胞(CD4+T细胞和CD8+T细胞) | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 狼疮患者样本(含羟氯喹治疗组和未治疗组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2025-10-07 |
Cellular communication network factor 3 contributes to the pathological process of rheumatoid arthritis through promoting cell senescence and osteoclastogenesis in the joint
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103334
PMID:39549484
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研究论文 | 本研究探讨细胞通讯网络因子3在类风湿关节炎病理过程中的作用机制及治疗潜力 | 首次揭示CCN3通过促进细胞衰老和破骨细胞分化参与类风湿关节炎病理过程,并验证其抗体治疗的潜在价值 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究CCN3在类风湿关节炎中的分子功能及治疗靶点潜力 | 类风湿关节炎患者的关节组织、滑膜细胞、单核细胞及实验小鼠模型 | 病理学研究 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养、动物模型实验 | 实验性关节炎动物模型 | 基因表达数据、细胞表型数据、组织病理数据 | 公共单细胞RNA测序数据集及实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-07 |
EZH2 promotes B-cell autoimmunity in primary Sjogren's syndrome via METTL3-mediated m6A modification
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103341
PMID:39577129
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研究论文 | 本研究揭示了EZH2通过METTL3介导的m6A修饰促进原发性干燥综合征中B细胞自身免疫反应的机制 | 首次阐明METTL3通过m6A修饰调控EZH2表达,进而影响B细胞功能的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 探索EZH2在原发性干燥综合征B细胞自身免疫反应中的作用及治疗潜力 | 原发性干燥综合征患者外周血B细胞、唾液腺组织及三种干燥综合征小鼠模型 | 生物医学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,ChIP测序,ChIP-qPCR,流式细胞术,CFSE检测,RIP实验,放线菌素D实验,m6A-RIP-qPCR | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,临床数据 | 原发性干燥综合征患者样本和三种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序,染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-07 |
Long-term, cell type-specific effects of prenatal stress on dorsal striatum and relevant behaviors in mice
2024-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.627207
PMID:39763907
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨产前应激对成年后代背侧纹状体功能和行为的长期影响 | 首次在单细胞水平揭示产前应激对背侧纹状体多种细胞类型的长期分子影响,并发现与自闭症风险基因的关联 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究产前应激如何影响背侧纹状体细胞分子机制及相关行为 | 产前应激小鼠模型的成年后代 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据、行为数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2025-10-07 |
Spatially Informed Graph Structure Learning Extracts Insights from Spatial Transcriptomics
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403572
PMID:39382177
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研究论文 | 提出一种名为STAGUE的创新框架,通过空间信息图结构学习从空间转录组数据中提取生物学见解 | 首次将图结构学习与对比学习相结合,能够同时学习细胞图结构和低维嵌入,突破了传统仅依赖空间邻近度定义图结构的限制 | NA | 开发能够更好表征细胞间相互作用多样性的空间转录组数据分析方法 | 空间转录组数据集中的细胞图结构和细胞间相互作用 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,图结构学习,对比学习 | 图结构学习框架 | 空间转录组数据 | 86个真实和模拟的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-07 |
Cytokine expression and cytokine-mediated cell-cell communication during skeletal muscle regeneration revealed by integrative analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.12055
PMID:39691872
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研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序数据揭示骨骼肌再生过程中的细胞因子表达和细胞间通讯机制 | 首次整合15个公共单细胞RNA测序数据集,系统分析393种小鼠细胞因子在骨骼肌再生中的动态表达谱和细胞间通讯网络 | 仅分析早期再生时间点(0、2、5、7天),未涵盖完整再生过程;基于转录组数据推断细胞通讯,需实验验证 | 解析骨骼肌再生过程中细胞因子介导的细胞间通讯机制 | 小鼠骨骼肌再生过程中的各种细胞类型 | 单细胞生物学 | 肌肉损伤修复 | 单细胞RNA测序 | CellChat | 单细胞转录组数据 | 整合15个公共scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-10-07 |
Scaling deep identifiable models enables zero-shot characterization of single-cell biological states
2024-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.11.566161
PMID:38014345
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研究论文 | 开发了scShift深度学习框架,用于消除单细胞RNA测序数据中的批次效应并识别真实生物差异 | 通过扩展深度可识别模型实现了零样本表征能力,能够外推至未见过的生物状态如COVID-19后纤维化 | 需要大规模单细胞图谱数据进行训练,存在数据多样性过渡阈值 | 解决单细胞RNA测序数据分析中跨数据集批次效应的挑战 | 单细胞RNA测序数据,特别是肺纤维化状态 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 深度变分推断框架 | 单细胞RNA测序数据 | 超过200个训练模型,基于大规模单细胞图谱汇编 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 198 | 2025-10-07 |
Arctiin alleviates knee osteoarthritis by suppressing chondrocyte oxidative stress induced by accumulated iron via AKT/NRF2/HO-1 signaling pathway
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83383-7
PMID:39738432
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研究论文 | 本研究探讨牛蒡苷通过AKT/NRF2/HO-1信号通路减轻铁过载诱导的软骨细胞氧化应激,从而缓解膝骨关节炎 | 首次揭示牛蒡苷通过调节铁代谢和激活AKT/NRF2/HO-1通路同时抑制软骨细胞凋亡和铁死亡的双重保护机制 | 未明确牛蒡苷的具体分子靶点及其在人体中的安全有效性 | 探究牛蒡苷对铁过载所致膝骨关节炎的治疗作用及分子机制 | 膝骨关节炎患者的软骨细胞及疾病模型 | 分子生物学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序, CCK-8检测, 流式细胞术, 荧光检测, Q-RTPCR, Western Blotting, 显微CT, 组织染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白表达数据, 影像数据, 组织学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2025-10-07 |
Integrated analyses of Mendelian randomization, eQTL, and single-cell transcriptome identify CCN3 as a potential biomarker in aortic dissection
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83611-0
PMID:39738466
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、eQTL和单细胞转录组分析,鉴定CCN3作为主动脉夹层的潜在生物标志物 | 首次结合多种分析方法系统筛选主动脉夹层相关血浆分泌蛋白,发现CCN3在mRNA和血浆水平均下调并可能具有保护作用 | 当前AD与血浆蛋白水平相关性研究稀缺且缺乏特异性,样本量有限 | 探索血浆分泌蛋白作为主动脉夹层的潜在生物标志物 | 主动脉夹层患者与正常个体的基因表达和血浆蛋白水平 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究,eQTL分析,单细胞转录组测序,qPCR,酶联免疫吸附试验 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据,蛋白质数据 | 三个GEO数据集的患者样本和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2025-10-07 |
Claudin 7 suppresses invasion and metastasis through repression of a smooth muscle actin program
2024-Dec-02, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202311002
PMID:39320351
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研究论文 | 本研究揭示了紧密连接蛋白Claudin 7通过抑制平滑肌肌动蛋白相关基因表达来抑制乳腺癌侵袭和转移的机制 | 首次通过功能遗传学方法在鼠源乳腺癌类器官模型中证实Cldn7对侵袭转移的抑制作用,并发现其通过调控SMA相关基因和间充质表型实现这一功能 | 研究主要基于动物模型和细胞系,人类临床样本验证相对有限 | 探究Claudin 7在乳腺癌转移过程中的作用机制 | 鼠源乳腺癌类器官、人类乳腺癌细胞系、新鲜人类肿瘤组织 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 功能遗传学、转录组分析、RNA-seq | NA | 基因表达数据、RNA-seq数据 | 鼠源乳腺癌类器官模型、人类细胞系、人类肿瘤组织样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |