单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 699 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-07 |
Differential Expression of CXCL12 in Human and Mouse Hair: Androgens Induce CXCL12 in Human Dermal Papilla and Dermal Sheath Cup
2024-Dec-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010095
PMID:39795953
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化分析，揭示了CXCL12在人类毛囊真皮乳头细胞和真皮鞘杯细胞中与雄激素受体共表达的现象 | 首次证明CXCL12在人类毛囊中与雄激素受体共表达，并发现CXCL12抗体可通过抑制雄激素受体活性促进毛发生长 | 研究主要基于体外实验，缺乏完整的体内验证 | 探究雄激素诱导的CXCL12对毛囊细胞的影响及其在雄激素性脱发中的作用机制 | 人类和小鼠皮肤组织、毛囊真皮乳头细胞、真皮鞘杯细胞 | 分子生物学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 毛发器官培养, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-07 |
MPCD Index for Hepatocellular Carcinoma Patients Based on Mitochondrial Function and Cell Death Patterns
2024-Dec-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010118
PMID:39795978
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研究论文 | 基于线粒体功能和细胞死亡模式构建肝细胞癌患者的MPCD指数 | 首次结合线粒体功能和程序性细胞死亡模式，通过机器学习构建MPCDI指数用于HCC患者分型 | NA | 研究肝细胞癌中线粒体功能与细胞死亡模式的关系并构建预后指数 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, RNA-seq | 机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | 来自TCGA、GEO和ICGC数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-07 |
Advances in DNA/RNA Sequencing and Their Applications in Acute Myeloid Leukemia (AML)
2024-Dec-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010071
PMID:39795930
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综述 | 本文探讨DNA/RNA测序技术在急性髓系白血病研究中的最新进展及其临床应用潜力 | 系统总结单细胞RNA测序在发现白血病干细胞稀有亚群方面的突破性进展 | 测序技术的临床广泛应用仍受成本、数据复杂性和伦理问题限制 | 评估DNA/RNA测序技术在急性髓系白血病诊疗中的应用前景 | 急性髓系白血病分子机制和白血病干细胞 | 基因组学 | 急性髓系白血病 | 全基因组测序, 全外显子组测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序, 全外显子组测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-10-07 |
MICROGLIA AGING IN THE HIPPOCAMPUS ADVANCES THROUGH INTERMEDIATE STATES THAT DRIVE ACTIVATION AND COGNITIVE DECLINE
2024-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.09.588665
PMID:38645176
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了海马区小胶质细胞在衰老过程中的中间状态及其对神经炎症和认知衰退的驱动作用 | 首次识别了小胶质细胞衰老过程中的中间状态，并证明这些中间状态通过异种共生实验和药理学方法驱动炎症激活和认知功能下降 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明小胶质细胞在衰老过程中从稳态到功能障碍的进展机制 | 小鼠海马区小胶质细胞 | 神经科学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序，假时间分析，条件性基因敲除 | 小鼠模型，异种共生模型 | 单细胞转录组数据 | 跨越成年寿命期的小鼠海马区小胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2025-10-07 |
Neutrophils with low production of reactive oxygen species are activated during immune priming and promote development of arthritis
2024-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103401
PMID:39471640
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术系统分析了胶原蛋白诱导关节炎模型中骨髓来源中性粒细胞的功能特征，揭示了活性氧在免疫启动阶段的保护作用机制 | 首次在免疫启动阶段发现高表达NCF1的中性粒细胞亚群，并揭示ROS通过代谢重编程调控中性粒细胞炎症表型的双向作用机制 | 研究基于小鼠关节炎模型，在人类RA疾病中的直接适用性需要进一步验证 | 探究中性粒细胞在类风湿关节炎发病机制中的作用，特别是ROS调控的分子机制 | 胶原蛋白诱导的关节炎模型小鼠骨髓来源中性粒细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞测序技术，功能分析，代谢组学 | NA | 单细胞测序数据，代谢组数据，功能实验数据 | 胶原蛋白诱导关节炎模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-07 |
[Molecular mechanism of Xinyang Tablets in improving myocardial fibrosis in uremic cardiomyopathy based on single-cell sequencing technology]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术探讨了心阳片对尿毒症心肌病心肌纤维化的改善作用及其分子机制 | 首次在单细胞水平揭示心阳片通过抑制内源性和外源性骨桥蛋白改善尿毒症心肌病心肌纤维化的作用机制 | 研究仅使用小鼠模型，样本量有限，需要进一步临床验证 | 研究心阳片对尿毒症心肌病心肌纤维化的治疗作用及分子机制 | 尿毒症心肌病小鼠模型的心脏组织细胞 | 单细胞测序分析 | 尿毒症心肌病 | 单细胞RNA测序 | t-SNE, K-means聚类, Seurat, Monocle3, CellChat | 单细胞基因表达数据 | 尿毒症心肌病小鼠模型分组研究 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 187 | 2025-10-07 |
Cytokines reprogram airway sensory neurons in asthma
2024-12-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115045
PMID:39661516
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研究论文 | 本研究揭示了哮喘中细胞因子通过JAK/STAT6通路重编程气道伤害感受神经元获得促炎表型的机制 | 首次发现IL-13通过JAK/STAT6通路触发伤害感受神经元中Npy1r过表达，并揭示NPY/NPY1R信号轴在限制神经元兴奋性中的代偿作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究过敏反应中伤害感受神经元获得促炎特性的分子机制 | 小鼠气道伤害感受神经元 | 神经免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序，逆行追踪，谱系报告，细胞因子筛选 | NA | 基因表达数据，细胞成像 | 卵清蛋白诱导的过敏性气道炎症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2025-10-07 |
SuperSpot: coarse graining spatial transcriptomics data into metaspots
2024-Dec-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae734
PMID:39657949
|
研究论文 | 提出一种名为SuperSpot的工作流程，将空间转录组学数据中的相邻且转录组相似的spots聚合成metaspots | 基于metacell概念，首次提出将空间邻近性和转录组相似性结合的空间spots聚合方法 | NA | 减少空间转录组数据的规模和稀疏性，促进大型数据集分析 | 空间转录组学数据中的spots（细胞或区域） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络，层次聚类 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | VisiumHD | NA |
| 189 | 2025-10-07 |
Scope+: an open source generalizable architecture for single-cell RNA-seq atlases at sample and cell levels
2024-Dec-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae727
PMID:39705183
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研究论文 | 提出了一种名为Scope+的开源通用架构，用于单细胞RNA测序图谱在样本和细胞级别的快速访问和元分析 | 开发了首个支持细胞级别元分析的开源单细胞图谱架构，采用细胞为单元的数据建模、创新的数据库优化技术和软件架构设计 | 目前主要应用于COVID-19血液和免疫细胞数据，在其他疾病和组织类型中的通用性需要进一步验证 | 解决大规模单细胞RNA测序图谱数据难以快速访问和进行元分析的问题 | 单细胞RNA测序图谱数据，特别是COVID-19相关的血液和免疫细胞 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 500万个COVID-19血液和免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2025-10-07 |
Metalloproteinase inhibitors regulate biliary progenitor cells through sDLK1 in organoid models of liver injury
2024-Dec-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164997
PMID:39699962
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研究论文 | 本研究通过器官样模型揭示金属蛋白酶抑制剂通过sDLK1调控胆道祖细胞在肝损伤中的作用机制 | 首次发现TIMP/ADAM/NOTCH/DLK1轴在肝祖细胞维持和胆管细胞分化中的调控作用 | 研究主要基于动物模型和器官样模型，尚未在人体内验证 | 探索肝损伤中胆道祖细胞的命运调控机制 | 肝祖细胞、胆管细胞、门静脉间充质细胞 | 细胞生物学 | 肝病 | 单细胞RNA测序、RNAscope、器官样培养 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 小鼠模型和患者来源的肝器官样 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-07 |
Identification of RNA-binding protein RBMS3 as a potential biomarker for immunotherapy in bladder cancer
2024-Dec, Cancer biomarkers : section A of Disease markers
IF:2.2Q3
DOI:10.3233/CBM-230489
PMID:39392600
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研究论文 | 本研究识别RNA结合蛋白RBMS3作为膀胱癌免疫治疗的潜在生物标志物 | 首次将RBMS3鉴定为膀胱癌中具有肿瘤微环境重塑功能的关键预后RNA结合蛋白 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证 | 开发基于RNA结合蛋白的预后特征并识别膀胱癌中的关键枢纽RBP | 膀胱癌组织和细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 风险模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 多个生物信息学数据库的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-10-07 |
Metabolic reprogramming by mutant GNAS creates an actionable dependency in intraductal papillary mucinous neoplasms of the pancreas
2024-Dec-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332412
PMID:39277181
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤中KRAS和GNAS突变共同表达导致代谢重编程的机制 | 首次证明GNAS R201C突变与KRAS G12D协同作用诱导胃幽门型化生基因特征和糖酵解依赖性 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，需要进一步在人类样本中验证 | 探究GNAS R201C突变对胰腺肿瘤表型、转录组特征和基因组依赖性的影响 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMNs)和肿瘤来源细胞系 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | CRISPR/Cas9筛选, 实时代谢分析, 磷酸化分析 | 小鼠遗传模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | p48Cre; KrasLSL-G12D; Rosa26LSL-rtTA; Tg (TetO-GnasR201C)小鼠模型和肿瘤来源细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-07 |
PPARγ-dependent remodeling of translational machinery in adipose progenitors is impaired in obesity
2024-Dec-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114945
PMID:39579770
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和核糖体分析揭示了PPARγ激动剂如何通过调控翻译机制促进肥胖状态下脂肪组织的可塑性 | 首次发现PPARγ直接调控核糖体因子表达并通过促进特定mRNA的翻译选择性来增强脂肪生成 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 探究PPARγ激动剂在肥胖状态下对脂肪组织前体细胞翻译机制的重塑作用 | 肥胖小鼠的基质血管组分细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序, 核糖体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 肥胖小鼠的腹股沟和附睾脂肪组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-07 |
Current insights into human pathogenic phenuiviruses and the host immune system
2024-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2024.2384563
PMID:39072499
|
综述 | 本综述全面概述了人类致病性白纤病毒与宿主免疫系统的相互作用机制 | 系统整合了白纤病毒毒力因子与宿主免疫互作的最新研究进展，特别关注RVFV和SFTSV的免疫逃避机制 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于现有文献分析 | 阐明人类致病性白纤病毒的宿主识别机制、免疫逃避策略和潜在治疗方法 | 人类致病性白纤病毒（特别是裂谷热病毒和发热伴血小板减少综合征病毒）及其与宿主免疫系统的相互作用 | NA | 病毒感染性疾病 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、基因编辑、单克隆抗体技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-07 |
Hidden liver-joint axis: HBV infection causes rheumatoid arthritis via TRAFD1 with imbalance of HBV X protein and trans-ferulic acid
2024-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2024.2422540
PMID:39484999
|
研究论文 | 本研究揭示了乙肝病毒通过TRAFD1介导的肝-关节轴机制导致类风湿关节炎的发病机制 | 首次发现HBV编码的HBx蛋白通过上调TRAFD1促进成纤维样滑膜细胞向肌成纤维细胞转化，并鉴定反式阿魏酸可抑制此过程 | 动物模型为CIA模型而非直接HBV感染模型，临床样本量未明确说明 | 探究乙肝病毒感染与类风湿关节炎之间的因果关系及分子机制 | 乙肝病毒感染者、类风湿关节炎患者、转基因小鼠模型、成纤维样滑膜细胞 | 分子生物学 | 类风湿关节炎 | 孟德尔随机化分析、单细胞转录组测序、代谢组学、WGCNA | CIA小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、代谢组学 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveal distinctive patterns of fibroblast activation in heart failure with preserved ejection fraction
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01074-w
PMID:39311911
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示射血分数保留型心衰中成纤维细胞激活的独特模式 | 首次在早期HFpEF模型中系统鉴定疾病特异性成纤维细胞表型，并发现血管生成素样4（ANGPTL4）的核心调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 解析HFpEF疾病进展中成纤维细胞的分子激活机制 | 小鼠心脏间质细胞（成纤维细胞和巨噬细胞）及人类心肌组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 小鼠HFpEF模型及两种HFrEF模型，人类心肌样本和血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome unveils unique transcriptomic signatures of human organ-specific endothelial cells
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01087-5
PMID:39508863
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研究论文 | 构建了包含超过21万个来自24个人类组织38个区域的内皮细胞图谱，揭示了不同组织内皮细胞的转录组异质性 | 首次系统性描绘了人类组织特异性内皮细胞的转录组特征，发现了毛细血管内皮细胞的高度异质性和组织特异性衰老模式 | 研究主要基于转录组数据，可能未完全捕捉蛋白质水平和功能层面的异质性 | 探索人类不同组织中内皮细胞的异质性和转录组特征 | 人类24个组织38个区域的210,000多个内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 多种疾病（与不同组织内皮细胞相关） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | >210,000个内皮细胞，来自24个人类组织的38个区域 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 198 | 2025-10-07 |
Synthetic control removes spurious discoveries from double dipping in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.21.550107
PMID:37546812
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研究论文 | 提出一种名为ClusterDE的统计方法，用于识别单细胞和空间转录组数据分析中可靠的细胞类型和空间域标记基因 | 通过生成合成零数据作为阴性对照，有效控制假发现率并消除因双重检验导致的虚假发现 | NA | 解决单细胞和空间转录组数据分析中的双重检验问题，识别可靠的差异表达基因 | 单细胞转录组数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 统计方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 199 | 2025-04-10 |
scRNA-Seq reveals age-dependent microglial evolution as a determinant of immune response following spinal cord injury
2024-12, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脊髓损伤后不同年龄组小胶质细胞的亚型及其功能差异 | 首次系统性地鉴定了脊髓损伤后年龄依赖性小胶质细胞亚型演化及其免疫功能差异 | 研究主要基于生物信息学分析，动物模型验证样本量有限 | 探究年龄因素如何通过小胶质细胞亚型影响脊髓损伤后的免疫反应 | 脊髓损伤后的小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, 免疫荧光染色 | 伪时间轨迹分析, CellChat细胞通讯分析 | 基因表达数据 | 整合GEO数据库中多个数据集的小鼠模型样本 | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2025-10-07 |
Transcriptomic Analysis of Air-Liquid Interface Culture in Human Lung Organoids Reveals Regulators of Epithelial Differentiation
2024-12-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13231991
PMID:39682739
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析气液界面培养对人肺类器官上皮分化的影响 | 首次使用单细胞RNA测序全面分析ALI培养对肺上皮细胞分化的调控机制 | NA | 识别影响上皮细胞分化的关键因素 | 人肺类器官上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |