单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 702 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-02-05 |
Development of a deep learning-based 1D convolutional neural network model for cross-species natural killer T cell identification using peripheral blood mononuclear cell single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, Veterinary world
IF:1.7Q2
DOI:10.14202/vetworld.2024.2846-2857
PMID:39897371
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于一维卷积神经网络（1DCNN）的模型，用于跨物种识别自然杀伤T细胞（NKT细胞），并利用外周血单核细胞（PBMC）的单细胞RNA测序数据进行验证 | 首次应用1DCNN模型进行跨物种NKT细胞识别，并成功识别了人类、犬类和猪类PBMC中的NKT细胞 | 需要进一步研究验证这些发现，并且模型在其他细胞类型识别中的应用尚未验证 | 开发一种用于跨物种NKT细胞识别的深度学习模型 | 人类、犬类和猪类的外周血单核细胞（PBMC） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 1DCNN | RNA测序数据 | 人类、犬类和猪类的PBMC数据集 |
| 182 | 2024-12-21 |
Metalloproteinase inhibitors regulate biliary progenitor cells through sDLK1 in organoid models of liver injury
2024-Dec-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164997
PMID:39699962
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研究论文 | 本文研究了金属蛋白酶抑制剂通过sDLK1调控胆管祖细胞在肝损伤器官模型中的作用 | 揭示了TIMP/ADAM/NOTCH/DLK1轴在肝祖细胞维持和胆管细胞分化中的作用，并提出了金属蛋白酶抑制剂调控胆管细胞分化和肝祖细胞保存的新机制 | NA | 研究肝细胞命运调控机制，以推进肝病的细胞治疗 | 肝祖细胞（LPC）和胆管祖细胞 | NA | 肝病 | RNA-seq | NA | RNA | NA |
| 183 | 2025-02-04 |
Combined Autophagy Inhibition and Dendritic Cell Recruitment Induces Antitumor Immunity and Enhances Immune Checkpoint Blockade Sensitivity in Pancreatic Cancer
2024-Dec-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0830
PMID:39288081
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研究论文 | 本研究探讨了自噬抑制与树突状细胞招募相结合在胰腺癌中的抗肿瘤免疫效应及其对免疫检查点阻断敏感性的增强作用 | 通过单细胞RNA测序揭示了自噬抑制在癌细胞中诱导树突状细胞激活的机制，并提出了三重疗法（氯喹、Flt3配体和抗LAG3抗体）显著抑制胰腺导管腺癌生长的创新治疗策略 | 自噬抑制在癌细胞中同时诱导了CD8+ T细胞耗竭，这可能限制了其长期疗效 | 研究自噬抑制与树突状细胞激活相结合在胰腺癌中的抗肿瘤免疫效应及其对免疫检查点阻断敏感性的增强作用 | 胰腺导管腺癌（PDAC）小鼠模型和人类PDAC肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 184 | 2024-11-15 |
[Molecular pathology of skin fragility]
2024-Dec, Dermatologie (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1007/s00105-024-05425-5
PMID:39510987
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综述 | 本文综述了皮肤脆弱性的分子病理学，重点关注皮肤屏障功能的维持及其相关遗传和自身免疫疾病 | 本文结合现代技术如单细胞和空间转录组学以及人工智能算法，推进了人类皮肤的分子图谱研究 | NA | 探讨皮肤脆弱性的分子机制及其相关疾病 | 皮肤屏障功能、遗传和自身免疫疾病、皮肤粘附结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 人工智能算法 | 转录组数据 | NA |
| 185 | 2025-02-02 |
Reduced TRIM expression correlates with anomalous CD4 T cell activation in systemic lupus Erythematosus and its clinical diagnostic potential
2024-12, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106913
PMID:39233252
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研究论文 | 本研究探讨了系统性红斑狼疮（SLE）患者循环CD4+T细胞亚群中T细胞受体相互作用分子（TRIM）的表达、功能及其临床相关性 | 首次在SLE患者中系统性地研究了TRIM在CD4+T细胞亚群中的表达及其与疾病活动的相关性，并探讨了其在临床诊断中的潜在应用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和流式细胞术分析，未涉及TRIM在SLE中的具体分子机制 | 阐明TRIM在SLE患者CD4+T细胞亚群中的表达、功能及其临床意义 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者、健康对照者（HCs）和类风湿性关节炎（RA）患者的外周血单核细胞（PBMCs）及小鼠的CD4+T细胞亚群 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、流式细胞术数据 | SLE患者、健康对照者（HCs）和类风湿性关节炎（RA）患者的外周血单核细胞（PBMCs）及小鼠的CD4+T细胞亚群 |
| 186 | 2025-02-01 |
TNFα has differential effects on the transcriptome profile of selected populations in murine cartilage
2024-Dec, Osteoarthritis and cartilage open
DOI:10.1016/j.ocarto.2024.100528
PMID:39494399
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研究论文 | 本文研究了肿瘤坏死因子α（TNFα）对小鼠软骨细胞转录组的影响，特别是在总RNA和单细胞分辨率下的差异 | 通过单细胞RNA测序技术，揭示了TNFα对不同细胞群体的转录组影响，特别是对炎症反应和基质生物合成的抑制作用 | 研究仅限于新生C57BL/6小鼠的软骨细胞，可能不适用于其他物种或年龄段的细胞 | 探讨TNFα在软骨细胞炎症反应中的作用 | 新生C57BL/6小鼠的软骨细胞 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA测序数据 | 14,239个细胞和24,320个基因 |
| 187 | 2025-01-31 |
Transcriptional Profiling of Testis Development in Pre-Sexually-Mature Hezuo Pig
2024-Dec-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47010010
PMID:39852125
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术对合作猪（HZP）青春期前一个月龄的睾丸进行了转录组分析，揭示了不同细胞类型在精子发生过程中的转录变化 | 首次在合作猪中应用单细胞RNA测序技术，揭示了睾丸发育过程中不同细胞类型的转录变化，为理解精子发生和睾丸细胞生物学提供了新的见解 | 研究仅针对一个月龄的合作猪睾丸，未涵盖更广泛的发育阶段或不同品种的猪 | 探索合作猪青春期前睾丸发育过程中的细胞类型和转录变化 | 合作猪（HZP）一个月龄的睾丸 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 14,276个细胞 |
| 188 | 2025-01-31 |
Application of Spatial Transcriptomics in Digestive System Tumors
2024-Dec-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15010021
PMID:39858416
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用，包括其在揭示肿瘤空间结构、异质性、肿瘤微环境及细胞间相互作用方面的作用，以及在诊断、预后和治疗中的应用 | 结合空间转录组学与单细胞RNA测序（scRNA-seq）、人工智能和机器学习在消化系统癌症研究中的重要性 | 技术挑战和应用前景仍需进一步探讨 | 探讨空间转录组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用及其前景 | 消化系统肿瘤 | 数字病理学 | 消化系统肿瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 189 | 2025-01-31 |
SSL5-AnxA5 Fusion Protein Constructed Based on Human Atherosclerotic Plaque scRNA-Seq Data Preventing the Binding of Apoptotic Endothelial Cells, Platelets, and Inflammatory Cells
2024-Dec-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13010008
PMID:39857592
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研究论文 | 本文基于人类动脉粥样硬化斑块的单细胞RNA测序数据，构建了SSL5-AnxA5融合蛋白，用于防止凋亡内皮细胞、血小板和炎症细胞的结合 | 通过单细胞测序分析，识别了SAP和ACS患者斑块中annexin V和P-selectin糖蛋白配体1通路的显著变化，并构建了SSL5-AnxA5融合蛋白，展示了其在防止细胞间相互作用中的潜力 | NA | 研究SSL5-AnxA5融合蛋白在防止动脉粥样硬化斑块破裂后局部炎症中的作用 | 凋亡内皮细胞、血小板和炎症细胞 | 生物医学工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、PCR、Western blot、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据 | SAP和ACS患者的斑块样本 |
| 190 | 2025-01-31 |
Disruption of immune responses by type 1 diabetes exacerbates SARS-CoV-2 mediated lung injury
2024-Dec-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00250.2024
PMID:39320093
|
研究论文 | 本文研究了1型糖尿病（T1DM）对COVID-19肺炎严重程度的影响，通过小鼠模型发现高血糖小鼠表现出更严重的肺损伤和免疫反应受损 | 引入了一种新技术，用于将高度固定的组织消化成单细胞悬液，适用于流式细胞术分析，并揭示了T1DM小鼠肺部T细胞募集减少和炎症性巨噬细胞的特征 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类数据，且样本量未明确说明 | 评估1型糖尿病是否加剧COVID-19肺炎的严重程度，并探索其潜在机制 | 野生型小鼠感染小鼠适应的SARS-CoV-2病毒 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、流式细胞术 | 小鼠模型 | 转录组数据、流式细胞数据 | NA |
| 191 | 2025-01-30 |
DDO1002, an NRF2-KEAP1 inhibitor, improves hematopoietic stem cell aging and stress response
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae043
PMID:39872153
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研究论文 | 本文研究了DDO1002作为NRF2-KEAP1抑制剂在改善造血干细胞衰老和应激反应中的作用 | 首次阐明了DDO1002通过激活NRF2-ARE信号通路来减少细胞内活性氧水平，从而延缓细胞衰老和改善造血功能 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探讨DDO1002在缓解全身照射后或衰老过程中造血功能下降的作用 | 造血干细胞（HSCs） | 生物医学 | 老年疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | 老年小鼠 |
| 192 | 2025-01-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intercellular crosstalk and the regulatory landscape of stromal cells during the whole life of the mouse ovary
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae041
PMID:39872151
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠卵巢整个生命周期中基质细胞的细胞间通讯和调控景观 | 首次整合了从胚胎期到成年期的单细胞RNA测序数据，揭示了卵巢基质细胞的动态变化和细胞间通讯网络，并识别了基质细胞的起源——间充质祖细胞（CD24） | 研究主要基于小鼠模型，人类卵巢中的相关机制仍需进一步验证 | 研究卵巢基质细胞的异质性、发育轨迹及细胞间通讯网络 | 小鼠卵巢中的基质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从E11.5（胚胎第11.5天）到M12（12月龄）的小鼠卵巢样本 |
| 193 | 2025-01-30 |
Spatial multi-omics characterizes GPR35-relevant lipid metabolism signatures across liver zonation in MASLD
2024-Dec, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loae021
PMID:39873004
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研究论文 | 本研究通过结合脂质代谢组学、空间转录组学（ST）和空间代谢组学（SM），旨在识别由GPR35调控的MASLD中不同肝脏分区的特定基因和代谢物的空间分布 | 首次在肝脏分区水平上揭示了GPR35在MASLD中的调控机制，特别是其对脂质代谢和炎症反应的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨GPR35在MASLD中的调控机制及其对肝脏分区的影响 | 小鼠肝脏 | 代谢组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 脂质代谢组学、空间转录组学（ST）、空间代谢组学（SM） | NA | 代谢物和基因表达数据 | NA |
| 194 | 2024-12-11 |
Distinct immune microenvironment of venous tumor thrombus in hepatocellular carcinoma at single-cell resolution
2024-Dec-10, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001182
PMID:39656099
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓（PVTT）的免疫微环境特征 | 首次在单细胞分辨率下揭示了PVTT中免疫细胞的组成和功能，特别是C5aR+ TAMs在免疫抑制环境中的作用 | 研究主要集中在PVTT的免疫微环境，未涉及其他类型的肿瘤血栓 | 探索肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓的免疫微环境特征 | 肝细胞癌中的门静脉肿瘤血栓（PVTT） | 数字病理学 | 肝癌 | 时间飞行质谱（CyTOF），单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞数据 | 使用了PVTT细胞系CSQT2和单核细胞系THP-1进行实验 |
| 195 | 2024-12-12 |
Gene regulatory network inference based on novel ensemble method
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae036
PMID:39324652
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研究论文 | 本研究提出了一种基于13种基本分类方法和灵活神经树（FNT）的集成方法，以提高基因调控网络（GRN）的识别准确性 | 开发了一种基于基因编程变体和粒子群优化的混合进化算法来搜索最优的FNT模型，并证明了所提出的集成方法在多个数据集上优于多种现有算法 | NA | 提高基因调控网络的识别准确性 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 灵活神经树（FNT） | 基因数据 | 三个模拟数据集和三个真实单细胞RNA-seq数据集 |
| 196 | 2024-10-26 |
Evolutionary diversity of CXCL16-CXCR6: Convergent substitutions and recurrent gene loss in sauropsids
2024-12, Immunogenetics
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s00251-024-01357-5
PMID:39400711
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研究论文 | 研究CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响 | 首次在脊椎动物中比较了约400个CXCR6直系同源基因，发现DRF基序在不同物种中的替代和CXCR6基因在某些鸟类和爬行动物中的反复丢失 | 研究主要集中在脊椎动物，未涵盖所有物种，且对基因丢失的具体机制和免疫影响的深入研究有限 | 探讨CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响 | CXCL16-CXCR6轴在不同脊椎动物中的基因变异和进化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列 | 约400个CXCR6直系同源基因，涵盖多种脊椎动物 |
| 197 | 2025-01-28 |
Initial regional cytoarchitectonic differences in dorsal and orbitobasal human developing frontal cortex revealed by spatial transcriptomics
2024-Dec-18, Brain structure & function
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00429-024-02865-6
PMID:39692769
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研究论文 | 本文通过空间转录组学技术揭示了人类胎儿大脑皮层早期发育中背侧和眶基底区域在细胞结构上的差异 | 首次在转录组水平上深入研究了人类胎儿额叶发育过程中背侧和眶基底区域的细胞结构特征，并保留了空间信息 | 研究仅关注了15个孕周后的胎儿大脑发育，未涵盖其他关键发育阶段 | 探讨人类胎儿额叶发育过程中背侧和眶基底区域在细胞结构上的差异及其分子机制 | 人类胎儿额叶的背侧和眶基底区域 | 空间转录组学 | NA | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) | NA | 基因表达数据 | 15个孕周后的胎儿大脑样本 |
| 198 | 2025-01-26 |
Mesenchymal Traits as an Intrinsic Feature of Undifferentiated Cells
2024-Dec-24, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb13010001
PMID:39846630
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研究论文 | 本文通过分析早期胚胎阶段和成人组织的单细胞转录组数据集，探讨了间充质表型在未分化细胞中的内在特征 | 挑战了传统观点，提出间充质表型和混合间充质/上皮状态可能标志着具有干细胞特性的癌细胞，并将这一概念扩展到病理背景之外 | 研究主要依赖于公开的单细胞转录组数据集，可能缺乏实验验证 | 探讨间充质表型在未分化细胞中的内在特征及其在胚胎发育和成人器官中的表达 | 早期胚胎阶段和成人组织的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开的单细胞转录组数据集 |
| 199 | 2025-01-26 |
Dynamic cell fate plasticity and tissue integration drive functional synovial joint regeneration
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.628180
PMID:39713398
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研究论文 | 本文通过开发成年斑马鱼的单侧全关节切除模型，研究了如何刺激原生滑膜关节组织的再生 | 揭示了成年骨骼中潜在的分子和细胞程序，这些程序被用于再生具有润滑关节软骨的复杂关节 | 研究仅限于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物中进行验证 | 研究成年哺乳动物滑膜关节的再生能力及其机制 | 成年斑马鱼的滑膜关节 | 生物医学工程 | 关节疾病 | microCT、组织学、活体成像、单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 图像、RNA测序数据 | 成年斑马鱼的全关节切除模型 |
| 200 | 2024-12-11 |
Improved tool for scRNA-seq analysis
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02040-x
PMID:39653731
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |