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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-28 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示了白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的关键驱动作用 | 首次结合单核RNA测序与空间转录组学技术,在ACM患者心肌样本中识别出炎症-纤维化空间生态位,并证实靶向IL-1β可改善疾病表型 | 研究主要基于患者样本和小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究致心律失常性心肌病的疾病进展机制并寻找潜在治疗靶点 | ACM患者心肌样本、对照捐赠者样本、纯合Desmoglein-2突变小鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | ACM患者和对照捐赠者的心肌样本,具体数量未明确说明 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-03-24 |
The transcription factor TCF21 is necessary for adoption of cell fates by Foxd1+ stromal progenitors during kidney development
2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.14.607910
PMID:39211232
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子TCF21在肾脏发育过程中对Foxd1+基质祖细胞命运决定的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示了TCF21缺失导致Foxd1+基质祖细胞亚群特异性耗竭,并发现突变肾脏中表达血管内皮标记物Endomucin的新型细胞簇 | 研究主要聚焦于胚胎期E14.5时间点,未涵盖肾脏发育全过程;单细胞测序样本量相对有限 | 阐明调控Foxd1+基质祖细胞分化的分子机制 | 小鼠胚胎肾脏中的Foxd1+基质祖细胞及其分化后代 | 发育生物学 | 先天性肾脏异常 | 单细胞RNA测序,免疫染色 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 32,461个GFP+细胞(来自E14.5胚胎肾脏) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-03-21 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Pivotal Role of DOCK2 in Sjögren Disease
2024-Dec, ACR open rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/acr2.11738
PMID:39382155
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了DOCK2在干燥综合征(SjD)发病机制中的关键作用,并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 首次在SjD小鼠模型中通过单细胞RNA测序鉴定出CD8+ T细胞亚群中DOCK2的异常高表达,并证明其抑制剂CPYPP能显著改善疾病症状 | 研究基于小鼠模型,其结论在人类患者中的适用性仍需进一步验证 | 解析干燥综合征唾液腺中致病性免疫细胞群及其免疫通路,并探索潜在治疗靶点 | 干燥综合征小鼠模型的唾液腺组织 | 单细胞转录组学 | 干燥综合征(自身免疫性疾病) | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-20 |
Single-Cell Analysis of Subcutaneous Fat Reveals Profibrotic Cells That Correlate With Visceral Adiposity in HIV
2024-Dec-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgae369
PMID:38820087
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了HIV感染者皮下脂肪中与内脏脂肪体积相关的促纤维化细胞变化 | 首次在HIV感染者中利用单细胞RNA测序技术,系统性地分析了皮下脂肪组织细胞组成和转录程序与内脏脂肪体积的关联 | 研究为横断面设计,无法确定因果关系,需要进一步的纵向研究来明确方向性和机制 | 探究HIV感染者皮下脂肪组织特异性细胞和分子程序与内脏脂肪体积的关系 | 接受长期抗逆转录病毒治疗的HIV感染者 | 数字病理学 | 心血管代谢疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,计算机断层扫描 | NA | RNA测序数据,影像数据 | 92名参与者进行bulk RNA测序,43名进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-03-20 |
Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.626682
PMID:39713308
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研究论文 | 本文探讨了STAT3功能获得性突变综合征中CD8+ T细胞功能失调与嘌呤信号通路异常的关系 | 揭示了STAT3 GOF变异通过改变嘌呤信号通路(CD39上调,CD73和A2AR下调)导致CD8+ T细胞功能失调的新机制 | 研究主要基于患者样本和小鼠模型,具体分子机制仍需进一步阐明 | 研究STAT3 GOF变异如何驱动CD8+ T细胞病理学机制 | STAT3 GOF综合征患者和小鼠模型中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫调节障碍 | 单细胞RNA测序,高维免疫分析,功能评估 | NA | 基因表达数据,功能数据 | STAT3 GOF患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-03-20 |
The astrocyte-enriched gene deathstar plays a crucial role in the development, locomotion, and lifespan of D. melanogaster
2024-12, Fly
IF:2.4Q3
DOI:10.1080/19336934.2024.2368336
PMID:38884422
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,在果蝇大脑中鉴定出一个星形胶质细胞富集表达的新基因deathstar,并揭示了其在个体发育、运动能力和寿命中的关键作用 | 首次在果蝇中鉴定出星形胶质细胞特异性表达的新基因deathstar,并系统阐明了其在发育、运动行为和寿命调控中的生理功能 | 研究主要基于果蝇模型,其发现向哺乳动物系统的直接推广性有待验证;RNA干扰技术可能存在脱靶效应 | 探究果蝇大脑星形胶质细胞特异性表达基因的功能及其在生理和行为调控中的作用 | 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的大脑组织,特别是星形胶质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,RNA干扰,免疫染色 | NA | 单细胞基因表达数据,图像数据 | 果蝇视叶和全脑的单细胞RNA测序数据,转基因成年果蝇脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-20 |
Optimization of hybridization chain reaction for imaging single RNA molecules in Drosophila larvae
2024-12, Fly
IF:2.4Q3
DOI:10.1080/19336934.2024.2409968
PMID:39351922
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研究论文 | 本文提出了一种优化的杂交链式反应(HCR)流程,用于在果蝇幼虫中实现单RNA分子的成像 | 开发了优化的HCR探针设计开源代码,仅需五对探针即可实现高特异性、高灵敏度且可多重检测的RNA可视化,显著降低了实验成本和时间 | 未明确说明该方法在其他生物体系或更复杂组织中的适用性,也未提供与其他现有成像方法的定量比较数据 | 优化单RNA分子成像技术,以支持基于单细胞RNA测序数据的筛选项目 | 果蝇幼虫中的特定RNA分子 | 分子成像 | NA | 杂交链式反应(HCR) | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2026-03-19 |
Integrating Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing Identifies and Validates Lactylation-Related Signatures for Intervertebral Disc Degeneration
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70262
PMID:39636180
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研究论文 | 本研究通过整合Bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示了乳酸化修饰与椎间盘退变(IVDD)的正相关性,建立了乳酸化相关基因(LRGs)特征,并验证了CBX3作为关键靶点及其抑制剂醋酸阿托西班的治疗潜力 | 首次系统性地整合Bulk和单细胞RNA-seq数据解析IVDD中的乳酸化修饰机制,鉴定出6个核心LRGs并发现CBX3的关键作用,首次提出醋酸阿托西班作为CBX3特异性抑制剂可通过调控乳酸化缓解IVDD进展 | 研究主要基于生物信息学分析和体外/体内实验验证,缺乏大规模临床队列验证;醋酸阿托西班的具体作用机制和长期疗效仍需进一步研究 | 探究乳酸化修饰在椎间盘退变(IVDD)中的作用机制,并寻找潜在的治疗靶点和生物标志物 | 椎间盘退变(IVDD)相关的基因表达数据和细胞/动物模型 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接, 体外实验, 体内实验 | NA | 基因表达数据 | 多个Bulk RNA-seq数据集(未明确样本数量),包含体内和体外实验样本 | NA | 单细胞RNA-seq, Bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-03-18 |
HIV-SEQ REVEALS GLOBAL HOST GENE EXPRESSION DIFFERENCES BETWEEN HIV-TRANSCRIBING CELLS FROM VIREMIC AND SUPPRESSED PEOPLE WITH HIV
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.17.629023
PMID:39763963
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研究论文 | 本研究开发了一种名为HIV-seq的新方法,用于更有效地捕获HIV转录本,并通过单细胞RNA-seq分析HIV感染者细胞,揭示了病毒转录细胞在病毒血症和抑制期间的基因表达差异 | 开发了HIV-seq方法,通过添加针对HIV基因组保守区域的自定义捕获序列,提高了HIV RNA+细胞的检测效率达44%,并结合CITE-seq进行表面表型分析,首次系统比较了病毒血症和ART抑制期间HIV转录细胞的转录特征 | 样本量相对较小,仅基于配对血液样本,可能无法完全代表所有组织中的HIV转录细胞,且方法依赖于自定义捕获序列的设计,可能对HIV变异株的覆盖不完全 | 研究HIV感染者中病毒转录细胞的基因表达差异,特别是在病毒血症和抗逆转录病毒治疗抑制期间的比较,以理解活跃病毒库细胞的持久性机制 | HIV感染者的血液样本,包括病毒血症和ART抑制期间的配对样本 | 单细胞测序 | HIV感染 | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表面表型数据 | 配对血液样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 表面表型分析 | NA | NA |
| 10 | 2026-03-14 |
A cross-disease resource of living human microglia identifies disease-enriched subsets and tool compounds recapitulating microglial states
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01764-7
PMID:39406950
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自74名不同神经系统疾病和中枢神经系统区域捐赠者的215,680个活体人类小胶质细胞,揭示了小胶质细胞的异质性,并识别了与疾病相关的亚群及能模拟其状态的化合物 | 构建了一个跨疾病的活体人类小胶质细胞资源库,识别了与疾病相关的亚群,并验证了能在体外模拟特定亚群状态的化合物,如喜树碱 | NA | 理解人类小胶质细胞的异质性,以促进针对其状态或功能的靶向治疗开发 | 活体人类小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 215,680个细胞来自74名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-14 |
Leveraging deep single-soma RNA sequencing to explore the neural basis of human somatosensation
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01794-1
PMID:39496796
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研究论文 | 本研究利用单细胞体深度RNA测序和空间转录组学技术,构建了人类背根神经节神经元图谱,揭示了人类体感生理学的新见解 | 首次通过单细胞体深度RNA测序技术,从个体人类背根神经节神经元中检测到平均超过9,000个独特基因,并识别出16种神经元类型,结合跨物种分析揭示了人类特异性神经元类型的存在 | 技术难度可能限制了样本获取和处理,且研究依赖于特定实验条件,可能影响结果的普适性 | 探索人类体感系统的神经基础,特别是背根神经节神经元的分子特征和功能 | 人类背根神经节神经元 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 空间转录组学, RNAscope原位杂交 | NA | RNA序列数据, 空间转录组数据 | 个体人类背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2024-11-07 |
Mapping out multiple sclerosis with spatial transcriptomics
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01798-x
PMID:39501034
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-03-14 |
Cell type mapping reveals tissue niches and interactions in subcortical multiple sclerosis lesions
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01796-z
PMID:39501036
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研究论文 | 本研究利用单核和空间转录组学技术,绘制了皮层下多发性硬化病变区域的细胞类型图谱,揭示了组织微环境中的细胞组成、相互作用及病变进展机制 | 首次结合单核与空间转录组学,系统性地绘制了皮层下多发性硬化病变中特定组织微环境(如血管周围空间、病变边缘)的细胞类型图谱,并揭示了慢性活动期病变边缘的细胞间通讯网络 | 研究主要聚焦于皮层下病变,可能未全面涵盖其他脑区或疾病阶段的微环境变化;样本量相对有限,需进一步扩大验证 | 解析多发性硬化病变中组织微环境的细胞组成、相互作用及病变进展的分子机制 | 皮层下多发性硬化病变组织及对照组织 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-03-13 |
Single-cell sequencing analysis and bulk-seq identify IGFBP6 and TNFAIP6 as novel differential diagnosis markers for postburn pathological scarring
2024-12, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2024.08.021
PMID:39317554
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和批量测序分析,鉴定出IGFBP6和TNFAIP6作为烧伤后病理性瘢痕(如瘢痕疙瘩和增生性瘢痕)的差异诊断标志物 | 首次在细胞水平利用单细胞测序技术结合批量测序,识别出IGFBP6和TNFAIP6作为区分烧伤后瘢痕疙瘩和增生性瘢痕的新型分子诊断标志物 | 研究样本来自单一中心,可能限制结果的普适性;未详细说明单细胞测序平台的具体技术细节 | 识别分子诊断生物标志物以区分烧伤后瘢痕疙瘩和增生性瘢痕 | 烧伤后病理性瘢痕(瘢痕疙瘩和增生性瘢痕)的临床样本 | 数字病理学 | 烧伤后病理性瘢痕 | 单细胞测序, 批量RNA测序, 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析, 基因集富集分析, 免疫组织化学染色, 定量逆转录PCR | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 批量测序数据 | 未明确指定样本数量,但包括来自研究中心的烧伤后临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-03-06 |
Spatially Informed Graph Structure Learning Extracts Insights from Spatial Transcriptomics
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403572
PMID:39382177
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研究论文 | 本文提出了一种名为STAGUE的创新框架,通过图结构学习从空间转录组数据中同时学习细胞图结构和低维嵌入,以提升空间聚类精度并发现新的细胞间相互作用 | STAGUE框架首次结合图结构学习和对比学习,参数化并优化细胞图邻接矩阵,克服了传统方法仅依赖空间邻近性定义图结构的局限性 | 未明确提及具体的数据集规模限制或计算复杂度问题,可能依赖于模拟和真实数据的泛化能力 | 旨在从空间转录组数据中提取更准确的细胞图结构和嵌入,以改善空间聚类和细胞间相互作用的发现 | 空间转录组数据集中的细胞,特别是人类乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图结构学习,对比学习 | 空间转录组数据 | 86个真实和模拟的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-03-06 |
Gastric Cancer Actively Remodels Mechanical Microenvironment to Promote Chemotherapy Resistance via MSCs-Mediated Mitochondrial Transfer
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404994
PMID:39392399
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研究论文 | 本研究揭示了胃癌通过间充质基质细胞介导的线粒体转移主动重塑机械微环境以促进化疗耐药性的机制 | 首次发现胃癌细胞通过分泌细胞外基质增加肿瘤组织硬度,从而促进间充质基质细胞通过微囊泡向胃癌细胞转移线粒体,导致奥沙利铂耐药 | 研究主要基于单细胞测序和体外实验,缺乏大规模临床验证,且具体机械信号通路细节需进一步探索 | 探究胃癌奥沙利铂耐药的机制,特别是细胞外机械信号在其中的作用 | 胃癌患者肿瘤组织、胃癌细胞、间充质基质细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、组织样本 | 奥沙利铂耐药的胃癌患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-03-06 |
Insufficient Mechanical Loading Downregulates Piezo1 in Chondrocytes and Impairs Fracture Healing Through ApoE-Induced Senescence
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400502
PMID:39418070
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研究论文 | 本研究探讨了机械负荷不足如何通过下调软骨细胞中的Piezo1表达,并经由ApoE诱导的衰老机制,影响骨折愈合过程 | 首次揭示了机械负荷不足通过Piezo1-ApoE轴调控软骨细胞衰老,从而影响骨折愈合的新机制,并开发了一种可注射热敏水凝胶用于局部治疗 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体中进行验证;水凝胶的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究机械负荷不足影响骨折愈合的分子机制,并开发新的治疗策略 | 骨折愈合过程中的软骨细胞,特别是肥厚性软骨细胞 | 骨生物学与再生医学 | 骨折愈合障碍 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-03-06 |
Quantum Dots-caused Retinal Degeneration in Zebrafish Regulated by Ferroptosis and Mitophagy in Retinal Pigment Epithelial Cells through Inhibiting Spliceosome
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406343
PMID:39420512
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研究论文 | 本研究揭示了InP/ZnS量子点通过诱导视网膜色素上皮细胞铁死亡和线粒体自噬,导致斑马鱼视网膜变性的机制 | 首次发现量子点通过抑制剪接因子prpf8,导致gpx4b mRNA未剪接,进而引发铁死亡和线粒体自噬,最终造成视网膜损伤 | 研究仅在斑马鱼模型中进行,尚未在哺乳动物或人体中验证 | 阐明典型金属量子点对视网膜的影响及其分子机制 | 斑马鱼视网膜 | 单细胞组学 | 视网膜变性 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | RNA测序数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-03-06 |
Pericytes Modulate Third-Generation Tyrosine Kinase Inhibitor Sensitivity in EGFR-Mutated Lung Cancer Cells Through IL32-β5-Integrin Paracrine Signaling
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405130
PMID:39435643
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研究论文 | 本研究揭示了周细胞通过IL32-β5-整合素旁分泌信号通路调节EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂敏感性的机制 | 首次发现周细胞通过分泌IL32激活β5-整合素-Src-Akt通路,从而影响EGFR突变肺癌细胞的TKI敏感性,并揭示了YY1信号在此过程中的调控作用 | 动物模型中周细胞对TKI疗效的影响独立于血管功能,但人体内血管功能的潜在影响仍需进一步研究 | 探究EGFR突变肺癌患者对第三代TKI反应受限的机制,特别是周细胞在其中的作用 | EGFR突变肺癌细胞、患者来源的周细胞、肿瘤组织样本、动物模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫染色、共培养实验、条件培养基实验、动物模型 | NA | RNA测序数据、免疫染色图像、细胞实验数据、动物实验数据 | EGFR突变患者来源的周细胞和肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-03-06 |
Hepatocyte-Targeted Lipid Nanoparticle Delivery of HERC2 Plasmid Controls Drug-Induced Hepatotoxicity by Limiting β-Catenin-Regulated CYP2E1 Expression
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401633
PMID:39440550
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研究论文 | 本研究揭示了HERC2通过调控β-catenin介导的CYP2E1表达,在药物性肝损伤中发挥保护作用,并开发了靶向肝细胞的脂质纳米颗粒递送HERC2质粒的治疗策略 | 首次阐明了HERC2在药物性肝损伤中的保护性作用机制,即通过促进β-catenin泛素化来负调控CYP2E1表达,并创新性地采用肝细胞靶向脂质纳米颗粒递送HERC2质粒进行干预 | 研究主要基于APAP诱导的肝损伤模型,在其他类型DILI中的普适性有待验证;脂质纳米颗粒递送系统的长期安全性和体内稳定性需进一步评估 | 探究HERC2在药物性肝损伤中的作用机制并开发靶向治疗策略 | 肝细胞、HERC2基因、β-catenin蛋白、CYP2E1酶 | 分子生物学与药理学 | 药物性肝损伤 | 单细胞RNA测序、脂质纳米颗粒递送、质粒转染 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 肝细胞特异性HERC2缺陷小鼠模型及对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |