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当前共找到 702 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Transcriptional reprogramming primes CD8+ T cells toward exhaustion in Myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome
2024-12-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2415119121
PMID:39621903
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征中CD8+ T细胞趋向耗竭状态的转录重编程机制 | 首次整合单细胞RNA测序、RNA测序和ATAC测序对ME/CFS患者T细胞亚群进行多组学分析，发现CD8+ T细胞效应记忆亚群的耗竭特征 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；未明确T细胞耗竭与疾病症状间的因果关系 | 阐明肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征中T细胞失调的基因调控机制 | 肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征患者的T细胞亚群，特别是CD8+ T细胞和先天T细胞 | 免疫学 | 肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征 | 单细胞RNA-seq, RNA-seq, ATAC-seq, 流式细胞术 | NA | 基因组学数据，表观基因组学数据，蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 2 | 2024-12-12 |
Rescue of cochlear vascular pathology prevents sensory hair cell loss in Norrie disease
2024-12-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322124121
PMID:39585982
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研究论文 | 研究通过条件激活β-catenin在血管内皮细胞中的稳定表达，探讨其在Norrie疾病小鼠模型中对耳蜗血管病理和感觉毛细胞损失的修复作用 | 首次证明在耳蜗微血管中，β-catenin是norrin结合内皮细胞表面受体后的主要下游细胞内效应因子，并验证了恢复该信号通路足以防止感觉毛细胞死亡和听力损失 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨Norrie疾病中耳蜗病理的修复机制 | Norrie疾病小鼠模型的耳蜗血管病理和感觉毛细胞损失 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类耳蜗样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2026-07-24 |
Advances in integrating single-cell sequencing data to unravel the mechanism of ferroptosis in cancer
2024-12-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae025
PMID:38874174
|
综述 | 综述了利用单细胞测序技术解析癌症中铁死亡机制的研究进展 | 整合单细胞测序技术揭示铁死亡在癌症中的机制调控通路、免疫检查点、生物标志物及细胞簇识别 | 未明确提及具体限制 | 总结单细胞测序在铁死亡相关癌症研究中的应用进展 | 铁死亡相关癌症研究中的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-24 |
A comprehensive survey of dimensionality reduction and clustering methods for single-cell and spatial transcriptomics data
2024-12-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae023
PMID:38860675
|
综述 | 系统总结了单细胞转录组和空间转录组数据降维与聚类分析中最广泛认可的算法 | 全面比较了单细胞和空间转录组数据降维与聚类的主流算法，为该领域新工具的开发提供见解 | NA | 总结单细胞转录组和空间转录组数据降维与聚类的最广泛认可算法 | 单细胞转录组和空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-07-10 |
Endoplasmic Reticulum Stress Induces ROS Production and Activates NLRP3 Inflammasome Via the PERK-CHOP Signaling Pathway in Dry Eye Disease
2024-12-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.34
PMID:39699913
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研究论文 | 本研究探讨内质网应激通过PERK-CHOP信号通路诱导ROS产生并激活NLRP3炎症小体在干眼症中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据结合体内外模型，揭示PERK-CHOP-TXNIP轴在干眼症中连接内质网应激与氧化应激及炎症的关键机制 | 未提及具体限制，如样本量较小或模型与人体差异等 | 研究内质网应激在干眼症发展中的潜在作用及其分子机制 | 干眼症小鼠模型、原代人角膜上皮细胞和永生化人角膜上皮细胞 | 数字病理学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序、siRNA转染、免疫荧光、Western blotting、实时PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取干眼小鼠角膜组织scRNA-seq数据，以及东莨菪碱诱导的干眼小鼠模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat R程序分析从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 |
| 6 | 2026-07-11 |
The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice
2024-12, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103976
PMID:39580061
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研究论文 | 本研究调查了甘氨酸受体亚基α1、α2、α4和β在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达谱 | 首次系统分析了甘氨酸受体四个亚基在不同性别小鼠中枢神经系统中的单细胞和整体表达模式 | RNAscope检测到Glra4的表达，但qRT-PCR未能检测到，表明低丰度转录本的检测方法存在局限性 | 明确甘氨酸受体亚基在成年小鼠中枢神经系统中的分布和性别差异 | 成年雌性和雄性小鼠的中枢神经系统组织及部分内脏器官 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, RNAscope | NA | 转录组表达数据 | 成年雌性和雄性小鼠多个脑区及脊髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-07-05 |
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627006
PMID:39713439
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研究论文 | 提出一种用于分析成分高通量测序数据的差异丰度检验方法cosmoDA | 将α-β幂相互作用模型扩展以包含协变量信息，并结合广义分数匹配估计框架，开发出可减少相关特征导致的假阳性发现的差异丰度检验方案 | 未明确提及 | 开发一种能够准确表征异质群体中协变量依赖性并降低相关特征假阳性率的差异丰度检验方法 | 成分高通量测序数据，包括单细胞RNA-Seq和扩增子测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 扩增子测序 | α-β幂相互作用模型 | 成分计数数据 | 模拟数据和真实数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 扩增子测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-07-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq revealed key genes for bone metastasis and chemoresistance in prostate cancer
2024-12, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01575-x
PMID:39395905
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示前列腺癌骨转移和化疗耐药的关键基因LDHA | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，系统识别出LDHA作为前列腺癌进展、骨转移和化疗耐药的关键基因，并通过细胞实验验证其功能 | 未提及具体的样本量和多中心验证，可能缺乏临床样本的进一步验证 | 探究前列腺癌进展、骨转移和化疗耐药的分子机制 | 前列腺癌相关基因和细胞系，包括PCa细胞和破骨细胞分化相关基质 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, TRAP染色 | Lasso回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-07-05 |
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08105-5
PMID:39506125
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、显微成像和蛋白质组学分析，研究免疫检查点抑制剂相关心肌炎在心脏、血液和肿瘤中的免疫反应 | 揭示了免疫检查点抑制剂相关心肌炎（irMyocarditis）中细胞毒性T细胞、传统树突状细胞和炎症性成纤维细胞在心脏组织中的共定位及频率增加，并发现心脏扩增的TCR克隆不识别假定的心脏自身抗原，且与肿瘤组织中的TCR库重叠性低 | 样本量有限（28例患者和41例健康对照），且未深入探讨心脏扩增TCRs与致命性心肌炎病例之间的具体机制 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系，并识别潜在生物标志物 | 28例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41例未受影响个体的心脏、肿瘤和血液样本 | 数字病理学 | 免疫相关心肌炎 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 多重显微成像, 蛋白质组学分析 | NA | 图像, 文本, 蛋白质组数据 | 28例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41例未受影响个体（包括心脏细胞84,576个，血细胞366,066个） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA和TCR测序；Illumina NovaSeq用于测序 |
| 10 | 2026-07-04 |
Dysregulated Treg repair responses lead to chronic rejection after heart transplantation
2024-12-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173593
PMID:39621314
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型，揭示心脏移植后IL-33+成纤维细胞与受体Treg之间的失调修复反应导致慢性排斥的机制 | 首次发现Treg分泌的双调蛋白（Areg）在慢性排斥反应中促进成纤维细胞增殖和纤维化，颠覆了传统认为Treg修复功能有益的观点 | 主要基于MHC-II不匹配小鼠模型，人类样本验证规模有限，且未涉及其他免疫抑制方案的影响 | 阐明心脏移植后慢性排斥反应中IL-33/Areg通路介导的失调修复机制 | MHC-II不匹配心脏移植小鼠模型、临床心脏移植患者样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MHC-II不匹配小鼠心脏移植模型（IL-33缺陷供体/Treg特异性Areg缺陷受体）及临床心脏移植患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 11 | 2026-07-04 |
Early concentrate starter introduction induces rumen epithelial parakeratosis by blocking keratinocyte differentiation with excessive ruminal butyrate accumulation
2024-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.12.016
PMID:38128723
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研究论文 | 研究了早期引入高浓度精料导致羔羊瘤胃上皮角化不全的机制，发现瘤胃丁酸过度积累通过阻断角质形成细胞分化引发该病 | 首次通过单细胞RNA测序揭示早期断奶羔羊瘤胃上皮从分化角质细胞到终末分化角质细胞的转变受阻，并利用瘤胃类器官模型验证高剂量丁酸直接导致角化不全 | 未提及具体限制，但模型仅针对新生羔羊且局限于短期观察 | 阐明瘤胃上皮角化过程及其影响因素，特别是早期营养干预策略对瘤胃健康的影响 | 新生羔羊瘤胃上皮组织及类器官 | 机器学习和单细胞组学 | 反刍动物消化系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 实时定量PCR, 代谢组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 组织切片图像 | 24只14日龄羔羊，分为三组（母乳、母乳+苜蓿干草、母乳+玉米大豆精料启动） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 12 | 2026-07-03 |
Side- and Disease-Dependent Changes in Human Aortic Valve Cell Population and Transcriptomic Heterogeneity Determined by Single-Cell RNA Sequencing
2024-12-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121623
PMID:39766890
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类主动脉瓣膜细胞群体和转录组异质性在侧别和疾病依赖性上的变化 | 首次通过单细胞RNA测序独立分析纤维层和心室层的内皮细胞，发现侧别依赖的细胞亚型和转录因子（如AP-1家族）在病变中的差异表达 | 样本量较小（仅5名供体），缺乏对非编码RNA或表观遗传调控的深入分析 | 探究钙化性主动脉瓣疾病在纤维层优先发展的细胞和分子机制 | 人类主动脉瓣膜的纤维层和心室层内皮细胞、间质细胞及免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名供体的主动脉瓣膜样本，包含82,356个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 13 | 2026-07-03 |
Optimizing CAR-T cell Culture: Differential effects of IL-2, IL-12, and IL-21 on CAR-T cells
2024-12, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2024.156758
PMID:39299100
|
research paper | 研究了IL-2、IL-12和IL-21对CAR-T细胞培养的影响，发现IL-21可防止细胞衰老和耗竭 | 首次通过scRNA-seq系统比较三种细胞因子对CAR-T细胞转录组、表观遗传、代谢及衰老状态的不同影响，揭示IL-21的独特保护作用 | 未提及具体样本量和体内验证实验 | 优化CAR-T细胞培养条件，确定最有效的细胞因子组合 | 经不同细胞因子(IL-2、IL-12、IL-21)和抗原处理的CAR-T细胞 | machine learning, 数字病理学 | 血液恶性肿瘤， 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 14 | 2026-07-01 |
SRSF1 Is Crucial for Maintaining Satellite Cell Homeostasis During Skeletal Muscle Growth and Regeneration
2024-12, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13607
PMID:39381961
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研究论文 | 本文揭示了剪接因子SRSF1在骨骼肌生长与再生过程中维持卫星细胞稳态的关键作用 | 首次阐明SRSF1通过调控Fgfr1op2剪接维持有丝分裂纺锤体组织，缺失导致卫星细胞有丝分裂异常、细胞周期阻滞及过早衰老 | 未明确说明研究局限性 | 探究SRSF1缺失影响卫星细胞功能的具体机制及其在肌肉再生中的角色 | 小鼠卫星细胞、C2C12成肌细胞、原代成肌细胞 | 分子生物学 | 肌肉萎缩与肌肉再生障碍 | 单细胞RNA测序、RNA测序、免疫染色、EdU掺入实验 | NA | 基因表达数据、测序数据 | 新生小鼠膈肌单核细胞悬液；每组至少4-10只小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-07-01 |
Modeling metabolic-associated steatohepatitis with human pluripotent stem cell-derived liver organoids
2024-12-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000585
PMID:39621053
|
研究论文 | 利用人多能干细胞衍生的肝脏类器官模拟代谢相关脂肪性肝炎 | 首次结合批量与单细胞RNA测序对肝脏类器官模型进行详细的分子表征，并验证了五味子提取物在该模型中的抗氧化、抗炎和抗纤维化作用 | 当前肝脏类器官模型缺乏详细的分子表征，需要进一步改进 | 建立改进的人类肝脏类器官疾病模型，以研究代谢相关脂肪性肝炎的发病机制并发现有效治疗方法 | 人多能干细胞衍生的肝脏类器官 | 数字病理学 | 代谢相关脂肪性肝炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-06-30 |
LSD1/KDM1A and GFI1B repress endothelial fate and induce hematopoietic fate in induced pluripotent stem cell-derived hemogenic endothelium
2024-12-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285214
PMID:38961746
|
研究论文 | 研究LSD1/KDM1A和GFI1B在诱导多能干细胞来源的血源性内皮细胞中抑制内皮命运并诱导造血命运的作用 | 发现LSD1/KDM1A和GFI1B在内皮-造血转化过程中不同细胞亚群的不同时间点发挥作用，且GFI1B在未定型血源性内皮细胞中不表达但异位表达可促进部分造血特化 | 未明确GFI1B在未定型血源性内皮细胞中不表达时的具体调控机制，且造血输出完全缺失的条件仅限于健康细胞系中LSD1/KDM1A抑制 | 阐明转录因子GFI1B及其辅因子LSD1/KDM1A在内皮-造血转化中的调控机制 | 诱导多能干细胞来源的血源性内皮细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 患者来源的iPSC系（GFI1B Q287*功能缺失）和健康iPSC系 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 17 | 2026-06-26 |
Genome-scale modeling identifies dynamic metabolic vulnerabilities during the epithelial to mesenchymal transition
2024-12-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07408-7
PMID:39730911
|
研究论文 | 通过基因组规模代谢建模鉴定上皮-间充质转化过程中的动态代谢脆弱性 | 利用基因组规模代谢建模整合时间序列转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学数据，揭示了EMT过程中糖酵解和谷氨酰胺代谢的时间依赖性，并实验验证了烯醇化酶3亚型在EMT期间细胞存活中的特异性作用 | NA | 利用计算模型整合异质性数据集，发现EMT过程中的时间依赖性和细胞状态特异性代谢脆弱性 | TGF-β刺激的细胞培养模型 | 机器学习 | 肺癌 | 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞转录组学, CRISPR-Cas9 | 基因组规模代谢模型 | 时间序列转录组数据, 时间序列蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-06-26 |
PKM2-mediated STAT3 phosphorylation promotes acute liver failure via regulating NLRP3-dependent pyroptosis
2024-12-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07227-w
PMID:39722076
|
研究论文 | 本研究揭示PKM2通过STAT3磷酸化调控NLRP3介导的细胞焦亡，从而促进急性肝衰竭的机制 | 首次发现PKM2在急性肝衰竭中作为NLRP3的非代谢调控因子，通过核转位与STAT3结合增强其磷酸化，进而促进NLRP3表达和巨噬细胞焦亡 | PKM2核转位抑制剂的药理学干预仅在动物模型中验证，尚未进行临床转化研究 | 阐明PKM2调控巨噬细胞炎症反应并促进急性肝衰竭的分子机制 | D-半乳糖胺/LPS诱导的急性肝衰竭小鼠模型及巨噬细胞 | 机器学习 | 急性肝衰竭 | NA | NA | 单细胞转录组数据 | D-半乳糖胺/LPS诱导的急性肝衰竭小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组分析 |
| 19 | 2026-06-26 |
Low expression of CCKBR in the acinar cells is associated with insufficient starch hydrolysis in ruminants
2024-12-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07406-9
PMID:39706905
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示成年山羊腺泡细胞中CCKBR低表达导致淀粉水解不足的机制 | 首次通过单细胞RNA测序与蛋白质组学联合分析，阐明反刍动物小肠淀粉消化率低的分子机制，发现CCKBR受体低表达和十二指肠CCK-I细胞分布少共同导致肠-胰反射缓慢 | 未提及 | 解析反刍动物小肠淀粉消化率低的生理机制 | 成年山羊和新生山羊的胰腺外分泌功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据 | 山羊样本（成年山羊和新生山羊） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-06-19 |
Evaluating predictive patterns of antigen-specific B cells by single-cell transcriptome and antibody repertoire sequencing
2024-12-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.11.005
PMID:39662471
|
research paper | 利用单细胞转录组和抗体库测序评估抗原特异性B细胞的预测模式 | 首次结合单细胞转录组和抗体库测序数据，使用机器学习预测抗原特异性B细胞，并评估了基于基因表达和抗体序列特征的模型性能 | 仅使用小鼠免疫B细胞数据，可能无法直接应用于人类或其他物种；机器学习模型的泛化能力需进一步验证 | 评估机器学习和基于基因表达与抗体库特征的模型在预测抗原特异性B细胞方面的性能 | 来自免疫小鼠的B细胞，标记为抗原特异性或非特异性 | machine learning | NA | 单细胞转录组测序, 抗体库测序 | CNN, LSTM, GAN, 线性模型, 非线性模型, 基于蛋白质语言模型的迁移学习 | 单细胞转录组数据, 抗体库序列数据 | 来自免疫小鼠的B细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 抗体库测序 | NA | NA |