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当前共找到 703 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-09-21
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-12, Nature IF:50.5Q1
研究论文 该研究通过对28名免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41名未受影响个体的心脏、肿瘤和血液样本进行单细胞RNA测序结合T细胞受体测序、显微成像和蛋白质组学分析,揭示了免疫相关心肌炎的免疫应答特征 首次系统性地在心脏、血液和肿瘤三个维度上利用单细胞RNA测序联合TCR测序、多重显微成像和蛋白质组学手段,全面刻画免疫检查点抑制剂相关心肌炎的免疫图谱;发现心脏扩增的TCR克隆与肿瘤富集的TCR克隆基本不重叠;发现心脏扩增TCR存在于循环血液CD8 T细胞群中与致死性心肌炎相关 心脏扩增的TCR克隆未能识别已知的假定心脏自身抗原(α-肌球蛋白、肌钙蛋白I和肌钙蛋白T),心脏扩增TCR的抗原特异性仍不明确;样本量相对有限(28例患者和41例对照) 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的免疫发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系,并寻找潜在的生物标志物 28名免疫相关心肌炎患者和41名未受影响个体的心脏组织、血液和肿瘤样本 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, TCR测序, 多重显微成像, 蛋白质组学 NA 单细胞转录组数据, 图像, 蛋白质组数据 28例免疫相关心肌炎患者和41例未受影响个体;共分析84,576个心脏细胞和366,066个血液细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-09-21
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Dec, Advances in neural information processing systems
研究论文 该研究构建了STimage-1K4M数据集,将空间转录组学数据中的病理图像子图块与基因表达信息配对,为计算病理学多模态分析提供高粒度数据资源 首次将病理图像细分为子图块并与15,000-30,000维基因表达配对,提供4,293,195对子图块-基因表达数据,实现前所未有的细粒度多模态数据整合 摘要中未提及具体局限性 构建一个将病理图像子图块与空间基因表达配对的新型数据集,推动计算病理学多模态数据分析和创新应用 空间转录组学数据衍生的1,149张病理图像及其对应的基因表达信息 数字病理学 癌症 空间转录组学 NA 图像, 基因表达 1,149张图像,4,293,195对子图块-基因表达数据 NA 空间转录组学 NA NA
3 2026-09-20
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 该研究利用牙周炎小鼠模型,通过可生物降解聚合物载体局部缓释IL-4,评估其靶向巨噬细胞治疗慢性炎症的可行性 首次采用可控药物递送策略将IL-4包裹于可生物降解聚合物载体中,局部缓释至炎症牙周组织,并结合单细胞RNA测序技术揭示IL-4逆转促炎通路的机制 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中验证其安全性和有效性 评估利用可控药物递送策略靶向口腔内巨噬细胞治疗慢性炎症的可行性 牙周炎小鼠模型 数字病理学 牙周疾病 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-09-19
Unraveling the effects of prenatal anesthesia on neurodevelopment: A review of current evidence and future directions
2024-12, Neurotoxicology IF:3.4Q2
综述 本文综述了产前麻醉对胎儿神经发育影响的临床前和临床证据,并探讨了未来研究方向 提出将脑类器官与单细胞测序结合作为研究产前麻醉神经毒性机制的前沿工具 临床研究受伦理和技术限制,结果与临床前数据常存在冲突,许多发现仍无定论 综合产前麻醉对胎儿大脑发育影响的证据,并指出未来研究发展方向 产前麻醉、胎儿大脑发育、脑类器官、神经毒性 神经科学 神经系统疾病 单细胞测序 脑类器官 文本 NA NA NA NA NA
5 2026-09-18
Multinucleated giant cells are hallmarks of ovarian aging with unique immune and degradation-associated molecular signatures
2024-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过先进成像技术和激光捕获显微切割转录组分析,揭示了多核巨细胞(MNGCs)在卵巢衰老中的特征、分子签名及与免疫细胞的相互作用 首次通过激光捕获显微切割技术定义卵巢MNGCs的独特转录组,发现其形成随年龄增长的复杂互联网络,并揭示其与降解过程、免疫功能和代谢活性相关的分子特征 MNGCs的大尺寸限制了单细胞RNA测序等技术的应用,本研究使用激光捕获显微切割可能无法完全反映单个细胞的异质性 探究卵巢MNGCs的功能、分子特征及其在卵巢衰老过程中的作用 小鼠和非人灵长类动物的卵巢组织及MNGCs 数字病理学 NA 激光捕获显微切割、先进成像技术 NA 图像、转录组数据 NA NA NA NA NA
6 2026-09-16
Systemic immune profiling analysis identifying M2-TAM related genes predicted colon cancer prognosis and chemotherapy responses
2024-Dec-27, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 该研究通过整合批量转录组、单细胞RNA测序及临床数据,利用多种生物信息学方法构建了与M2型肿瘤相关巨噬细胞相关的基因特征模型,用于预测结肠癌的预后和化疗反应 首次系统性地识别并验证了由SNAI1、GRP、GABRD、CD1B、PABPC2、MFNG和DAPK1七个核心基因组成的M2-TAM相关预后风险模型,结合孟德尔随机化方法揭示了CTLA-4和CD274免疫检查点与结肠癌的因果关系 研究主要依赖公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床试验验证;样本量有限,且未进行体内外功能实验验证核心基因的生物学机制 开发新型M2型肿瘤相关巨噬细胞标志物,用于区分M2样巨噬细胞并预测结肠癌患者的预后和化疗反应 结肠癌(COAD)患者 数字病理学、机器学习 结直肠癌 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、孟德尔随机化 WGCNA、LASSO、Cox回归、CIBERSORT 转录组数据、单细胞数据、临床数据 TCGA-COAD队列及GEO数据库多个数据集(GSE17536、GSE166555等),具体样本量未在摘要中明确 NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-09-16
New insights into the role of mitophagy related gene affecting the metastasis of osteosarcoma through scRNA-seq and CRISPR-Cas9 genome editing
2024-12-18, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究整合单细胞测序和批量测序数据,结合CRISPR-Cas9基因编辑技术,揭示线粒体自噬相关基因在骨肉瘤转移中的作用,并构建预后模型 首次整合scRNA-seq、批量测序和CRISPR-Cas9全基因组筛选技术系统分析线粒体自噬在骨肉瘤转移中的作用,发现RPS27A为潜在新型生物标志物,并构建了线粒体自噬评分(MIP_score)预后模型及在线交互平台 摘要中未明确提及研究局限性 识别与骨肉瘤转移进展相关的线粒体自噬相关基因,分析其临床意义,构建预后模型并开发靶向治疗策略 骨肉瘤组织样本及骨肉瘤细胞系和动物模型 机器学习, 数字病理学 骨肉瘤 scRNA-seq, bulk RNA-seq, CRISPR-Cas9基因编辑 NA 图像, 文本 NA NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
8 2026-09-16
The CCL5/CCR5/SHP2 axis sustains Stat1 phosphorylation and activates NF-κB signaling promoting M1 macrophage polarization and exacerbating chronic prostatic inflammation
2024-12-05, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究通过细胞因子panel检测发现CCL5在慢性前列腺炎患者中显著升高,并通过体内外实验揭示CCL5/CCR5/SHP2轴通过维持Stat1磷酸化和激活NF-κB信号促进M1巨噬细胞极化,加剧慢性前列腺炎症 首次揭示CCL5/CCR5/SHP2轴在慢性前列腺炎中的关键驱动作用,阐明CCL5通过抑制SHP2与Stat1的相互作用维持Stat1磷酸化从而延长炎症信号的新机制,并验证了CCR5拮抗剂maraviroc的治疗潜力 摘要中未明确说明样本量大小的具体信息,缺乏临床试验数据验证,主要基于动物模型和体外实验,向临床转化的有效性仍需进一步验证 识别慢性前列腺炎中的关键细胞因子,探究其在驱动炎症反应中的作用机制,并评估治疗潜力 慢性前列腺炎样症状患者的血浆样本、实验性自身免疫性前列腺炎(EAP)小鼠模型、巨噬细胞 机器学习 前列腺癌 单细胞转录组学,细胞因子panel检测 NA 文本,图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-09-16
Cell state transitions are decoupled from cell division during early embryo development
2024-12, Nature cell biology IF:17.3Q1
研究论文 通过两种方法在斑马鱼胚胎中阻滞细胞周期,并在单细胞分辨率下分析,发现细胞分裂对分化并非必需,但会减缓某些细胞类型的分化并引发全局应激反应。 首次结合胚胎期扰动与单细胞RNA测序,系统揭示了细胞分裂与分化在早期胚胎发育中的解耦关系。 研究仅基于斑马鱼胚胎,结论是否适用于其他物种尚需验证。 确定细胞分裂在细胞分化中的作用 斑马鱼胚胎 发育生物学 不适用 单细胞RNA测序 不适用 转录组数据 未明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 不适用
10 2026-09-13
SuperSpot: coarse graining spatial transcriptomics data into metaspots
2024-12-26, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为 SuperSpot 的工作流程,通过将空间邻近且转录组相似的 spots 合并为 metaspots,以降低空间转录组数据的规模和稀疏性,便于大规模数据分析 基于 metacell 概念,将 spots 表示为图节点,边连接空间邻近的 spots,边权重表示转录组相似性,并利用层次聚类在用户定义的分辨率下将 spots 聚合为 metaspots 未明确提及 降低空间转录组数据的规模和稀疏性,促进利用最新技术生成的大型数据集的分析 空间转录组数据中的 spots(也称为 cells 或 bins,取决于技术) 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 VisiumHD NA
11 2026-09-13
Scope+: an open source generalizable architecture for single-cell RNA-seq atlases at sample and cell levels
2024-12-26, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一个名为Scope+的开源可扩展架构,用于单细胞RNA-seq图谱的快速访问、元分析和细胞级别选择,并应用于500万个COVID-19血液和免疫细胞数据构建了Covidscope门户 提出了细胞为单元的数据建模、新型数据库优化技术和创新软件架构设计三种策略,实现了图谱规模数据的高效访问,并支持细胞级别的元分析,且完全开源可适配 摘要中未明确提及 limitations 解决现有细胞图谱门户难以开源适配、不支持细胞级别元分析的问题,实现大规模单细胞图谱数据的快速访问和元分析 500万个COVID-19血液和免疫细胞数据 机器学习 COVID-19 单细胞RNA-seq NA 文本 500万个COVID-19血液和免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-09-13
Combined Autophagy Inhibition and Dendritic Cell Recruitment Induces Antitumor Immunity and Enhances Immune Checkpoint Blockade Sensitivity in Pancreatic Cancer
2024-12-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序探讨了胰腺导管腺癌中自噬抑制对树突状细胞活化和抗肿瘤免疫的影响,并提出了联合治疗策略 首次揭示自噬抑制可增加肿瘤抗原胞内积累从而激活树突状细胞,并发现联合氯喹、Flt3配体和抗LAG3抗体可显著抑制胰腺癌生长 研究主要基于小鼠模型,人体临床试验尚未开展,长期安全性和有效性有待验证 探索靶向自噬联合树突状细胞活化能否增强胰腺导管腺癌对免疫检查点抑制剂的敏感性 自噬缺陷型小鼠胰腺导管腺癌肿瘤、人胰腺导管腺癌肿瘤样本、原位同基因胰腺导管腺癌小鼠模型 肿瘤免疫学 胰腺癌 单细胞RNA测序、免疫治疗、自噬抑制 NA 基因表达数据、图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-09-10
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示IL-1β在致心律失常性心肌病进展中的作用,并验证抗IL-1β治疗的潜力。 首次结合snRNAseq和空间转录组学鉴定ACM疾病相关空间生态位,并证明IL-1β中和抗体在ACM小鼠模型中的治疗益处。 未提及明确的局限性。 阐明IL-1β在ACM疾病进展中的机制,并探索靶向IL-1β的治疗潜力。 ACM患者心肌样本和Dsg2突变小鼠。 数字病理学 致心律失常性心肌病 单核RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 ACM患者和对照供体的心肌样本,以及Dsg2突变小鼠 NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
14 2026-09-09
Sparse dimensionality reduction for analyzing single-cell-resolved interactions
2024-12-26, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出一个用于单细胞细胞-细胞相互作用数据的端到端降维工作流程,重点关注稀疏降维方法(Boosting Autoencoder)以识别与细胞对簇相关的特定配体-受体相互作用,并提供可视化及Jupyter notebook支持 首次将稀疏降维(Boosting Autoencoder)专门应用于单细胞细胞-细胞相互作用数据,能够精确识别与细胞对簇相关的特定配体-受体相互作用,提供了一个完整的端到端工作流程和可视化支持 论文中未明确说明局限性,但可能受限于依赖已知配体-受体相互作用先验信息,及工作流程需针对不同数据集进行调整 简化单细胞细胞-细胞相互作用数据的下游分析,通过稀疏降维方法精确识别特定配体-受体相互作用模式 单细胞转录组学数据中的细胞-细胞相互作用(细胞对) 机器学习 NA 单细胞转录组学(scRNA-seq) 稀疏降维模型(Boosting Autoencoder) 单细胞转录组数据(相互作用数据) NA NA NA NA NA
15 2026-09-06
Single-Cell Meta-Analysis Uncovers the Pancreatic Endothelial Cell Transcriptomic Signature and Reveals a Key Role for NKX2-3 in PLVAP Expression
2024-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 该研究通过单细胞元分析揭示了胰腺内皮细胞的转录组特征,并发现NKX2-3在PLVAP表达中的关键作用。 首次定义了跨物种和发育阶段保守的胰腺内皮细胞富集基因签名,并鉴定了一个特化的胰岛毛细血管亚群,同时发现NKX2-3转录因子作为上游调控因子促进PLVAP表达。 由于胰腺消化酶的干扰,难以分离和表征原代胰腺内皮细胞,可能影响验证的全面性;且未提供NKX2-3在体内的功能验证。 阐明胰腺内皮细胞的转录组特征和细胞异质性,并探索关键转录因子NKX2-3在调节内皮屏障基因表达中的作用。 人类和小鼠的胰腺内皮细胞(包括胰岛毛细血管亚群),以及HUVECs(人脐静脉内皮细胞)作为过表达模型。 数字病理学和单细胞转录组学 不适用 单核/单细胞RNA测序,批量RNA测序,空间转录组学,免疫荧光,RNAscope,RT-qPCR 细胞模型(HUVECs过表达)和生物信息学分析 基因表达数据和图像数据 多个公开单细胞数据集(具体样本数量未在题目和摘要中说明) 不适用 单细胞RNA测序,空间转录组学 不适用 不适用
16 2026-09-05
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Dec-11, Research square
研究论文 DBiTplus是一种在同一组织切片上整合基于成像和基于测序的空间组学方法,结合空间转录组学和蛋白质成像实现单细胞分辨率细胞分型和基因组规模通路研究 创新点在于DBiTplus将测序为基础的空间转录组学与成像为基础的蛋白质空间图谱相结合,并通过RNaseH保留组织完整性实现高复用蛋白成像,以及开发了用于两种模态数据注册的计算流程 未明确提及局限性 开发一种整合多模态空间组学方法,以同时获取转录组和蛋白质信息,实现单细胞分辨率的细胞分型和基因组规模的生物学通路探索 小鼠胚胎、正常人淋巴结和人淋巴瘤FFPE组织 空间组学 淋巴瘤 空间转录组学、成像蛋白质组学、微流控、CODEX NA 空间转录组数据、蛋白质成像数据、图像 三种组织类型(具体数量未知) NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 NA NA
17 2026-08-29
Protocol for isolating specific C. elegans neuron types for bulk and single-cell RNA sequencing
2024-12-20, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 描述了一种从秀丽隐杆线虫中分离特定神经元类型以进行批量或单细胞RNA测序的协议 提供了详细的步骤,用于从幼虫和成年动物中分离特定细胞类型,适用于批量或单细胞RNA测序 未明确提及 提供一种分离特定神经元类型进行基因表达谱分析的方法 秀丽隐杆线虫的特定神经元类型 分子生物学 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及 NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-08-28
The prognostic marker KRT81 is involved in suppressing CD8 + T cells and predicts immunotherapy response for triple-negative breast cancer
2024-12-31, Cancer biology & therapy IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了角蛋白81(KRT81)在三阴性乳腺癌中的预后价值及其对免疫治疗反应的预测作用,发现KRT81通过抑制CD8+ T细胞促进肿瘤进展 首次揭示KRT81在三阴性乳腺癌中作为独立预后因子,并通过单细胞RNA测序和共培养实验阐明其通过CD276抑制CD8+ T细胞的新机制,同时开发了基于KRT81的生存概率列线图 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内验证和临床前瞻性研究,且样本量可能有限,需进一步验证KRT81的临床应用价值 评估KRT81作为三阴性乳腺癌预后标志物和免疫治疗反应预测因子的潜力,并探索其免疫调节机制 三阴性乳腺癌肿瘤组织样本及细胞系,包括KRT81基因表达数据、单细胞RNA测序数据及免疫细胞共培养系统 数字病理学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序 Cox回归模型 基因表达数据、单细胞测序数据、图像数据 未明确给出具体样本数量,涉及TCGA等公共数据库及细胞系实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
19 2026-08-28
Peripheral Blood-Derived PD-1/CD28-CD19 CAR-Modified PD-1+ T-Cell Therapy in Patients with Solid Tumors
2024-12-03, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 该研究开发了基于外周血PD-1+ T细胞的PD-1/CD28-CD19 CAR-T细胞疗法,并在实体瘤患者中验证了其安全性和初步疗效 首次利用外周血PD-1+ T细胞,通过引入PD-1/CD28融合受体和CD19嵌合抗原受体增强其抗肿瘤活性,并成功应用于临床患者 仅纳入4例患者,样本量小,疗效评估有限,长期效果和安全性需进一步验证 评估修饰后外周血PD-1+ T细胞疗法在实体瘤中的安全性和有效性,并探索其作为治疗策略的潜力 实体瘤患者的外周血PD-1+ T细胞及纳入的4例癌症患者 细胞治疗、免疫肿瘤学 实体瘤(包括黑色素瘤) 单细胞RNA测序、嵌合抗原受体T细胞技术 CAR-T细胞模型 单细胞转录组数据、临床疗效数据 4例癌症患者及相应外周血样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
20 2026-08-22
Derivation of transplantable human thyroid follicular epithelial cells from induced pluripotent stem cells
2024-12-10, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本研究开发了一种新的人类诱导多能干细胞系,通过优化无血清培养基序列和单细胞RNA测序,成功分化出成熟的甲状腺滤泡上皮细胞,并在异种移植后显示出甲状腺滤泡组织结构和甲状腺球蛋白表达,但未能挽救体内甲状腺功能减退。 创新点在于开发了靶向NKX2-1和PAX8基因座的荧光报告基因人类iPSC系,实现了向甲状腺滤泡细胞命运细胞的鉴定和纯化,并通过单细胞RNA测序揭示了BMP4撤离促进细胞成熟的关键机制。 尽管iPSC衍生的甲状腺滤泡细胞表现出甲状腺特异性蛋白的持久表达,但在体内无法挽救甲状腺功能减退症状,表明细胞功能成熟度不足。 旨在从人类诱导多能干细胞中产生成熟且有功能的甲状腺滤泡上皮细胞,以探索治疗术后和先天性甲状腺功能减退的新方法。 人类诱导多能干细胞(iPSCs)及其衍生的甲状腺滤泡上皮细胞(TFCs),以及无胸腺免疫缺陷小鼠。 干细胞生物学 甲状腺功能减退 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个iPSC细胞系,以及异种移植后的免疫缺陷小鼠;具体样本数量未提供。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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