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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-06 |
Lenalidomide-induced pure red cell aplasia is associated with elevated expression of MHC-I molecules on erythrocytes
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54571-w
PMID:39578482
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研究论文 | 本研究揭示了来那度胺治疗多发性骨髓瘤时诱发纯红细胞再生障碍的机制 | 首次发现来那度胺通过上调红细胞MHC-I分子表达,激活CD8 T细胞导致红细胞生成障碍 | 研究基于单个病例,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探究来那度胺治疗诱发纯红细胞再生障碍的分子机制 | 多发性骨髓瘤患者骨髓样本 | 血液肿瘤学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组分析,体外功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,体外实验数据 | 1例多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-10-06 |
A developmental biliary lineage program cooperates with Wnt activation to promote cell proliferation in hepatoblastoma
2024-11-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53802-4
PMID:39567523
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研究论文 | 本研究通过组织学引导和空间转录组学分析肝母细胞瘤,揭示了胚胎胆道谱系程序与Wnt激活协同促进肿瘤细胞增殖的机制 | 发现胚胎胆道转录因子SOX4和生长因子FGF19在肝母细胞瘤增殖异质性中的关键作用,揭示了非遗传性表观遗传机制在肿瘤进化中的功能 | 研究主要基于患者来源的肿瘤类器官模型,需要进一步在体内验证这些发现 | 探究肝母细胞瘤中组织学和增殖异质性的分子机制 | 肝母细胞瘤患者肿瘤样本和患者来源的肿瘤类器官 | 空间转录组学 | 肝母细胞瘤 | 组织学引导的空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、组织学图像 | 肝母细胞瘤患者样本和肿瘤类器官 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes
2024-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54337-4
PMID:39604360
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现CD34可作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物 | 首次发现CD34可作为窦房结起搏细胞的表面标志物,并证明通过CD34分选可富集具有功能起搏表型的细胞 | 研究主要基于胎儿和干细胞来源的窦房结细胞,未涉及成人原代组织 | 鉴定人类窦房结起搏细胞的分子标志物 | 人类胎儿窦房结细胞和人多能干细胞分化的窦房结细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞/单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胎儿和干细胞来源的窦房结细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2025-10-06 |
Spatially organized tumor-stroma boundary determines the efficacy of immunotherapy in colorectal cancer patients
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54710-3
PMID:39592630
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研究论文 | 本研究通过整合空间增强分辨率组学测序等技术,揭示了结直肠癌中肿瘤-基质边界的空间组织与免疫治疗疗效的关联 | 首次通过空间多组学技术系统解析肿瘤-基质边界的空间组织结构及其在免疫检查点阻断治疗响应中的作用机制 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究结直肠癌患者对免疫治疗不同响应的肿瘤微环境机制 | 未经治疗和接受ICB治疗的结直肠癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间增强分辨率组学测序,单细胞RNA测序,多重成像分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,成像数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 165 | 2025-10-06 |
Spatio-temporal transcriptomics of chromothriptic SHH-medulloblastoma identifies multiple genetic clones that resist treatment and drive relapse
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54709-w
PMID:39609432
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析染色体碎裂型SHH髓母细胞瘤,揭示了其空间异质性特征和治疗抵抗机制 | 首次应用空间转录组学技术系统分析染色体碎裂型髓母细胞瘤的空间异质性,识别出多个遗传克隆在治疗抵抗和复发中的作用 | 样本量相对有限(13例肿瘤和11个PDX样本),需要更大规模研究验证发现 | 探索染色体碎裂型髓母细胞瘤的分子特征和侵袭性决定因素 | 染色体碎裂型和非染色体碎裂型髓母细胞瘤患者样本及患者来源异种移植模型 | 空间转录组学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 13例髓母细胞瘤样本和11个患者来源异种移植样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 166 | 2025-10-06 |
C/EBPβ-dependent autophagy inhibition hinders NK cell function in cancer
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54355-2
PMID:39609420
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研究论文 | 本研究揭示自噬是NK细胞抗肿瘤功能的核心调节因子,并发现C/EBPβ依赖的自噬抑制会阻碍NK细胞在癌症中的功能 | 首次发现自噬作为NK细胞内的检查点,并通过CXCL12-CXCR4-C/EBPβ信号轴阐明其调控机制 | 研究主要基于前列腺癌模型,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索癌症如何导致NK细胞功能失调及克服免疫治疗抵抗的机制 | 肿瘤浸润NK细胞、人类前列腺癌患者样本、多种小鼠癌症模型 | 免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据 | 晚期人类前列腺癌患者样本及多种小鼠癌症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-06 |
Transcription factors ASCL1 and OLIG2 drive glioblastoma initiation and co-regulate tumor cell types and migration
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54750-9
PMID:39609428
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤发生发展中的协同调控作用 | 首次证明ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤形成中具有冗余功能,并共同调控肿瘤细胞类型和迁移能力 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究ASCL1和OLIG2转录因子在胶质母细胞瘤发生和异质性调控中的作用机制 | 小鼠脑室下区祖细胞和胶质母细胞瘤细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 168 | 2025-10-06 |
Granzyme K+CD8+ T cells interact with fibroblasts to promote neutrophilic inflammation in nasal polyps
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54685-1
PMID:39614076
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现GZMK+CD8+ T细胞通过与成纤维细胞相互作用促进鼻息肉中的中性粒细胞炎症 | 首次发现GZMK+CD8+ T细胞通过表达CXCR4与分泌CXCL12的成纤维细胞相互作用,独特地通过GZMK而非其他颗粒酶诱导中性粒细胞趋化因子产生 | NA | 阐明慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞炎症的潜在机制 | 鼻息肉组织中的免疫细胞和基质细胞 | 单细胞生物学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞分析,空间转录组学,T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-06 |
COVID-19 progression and convalescence in common variable immunodeficiency patients show dysregulated adaptive immune responses and persistent type I interferon and inflammasome activation
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54732-x
PMID:39609471
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析普通变异型免疫缺陷病(CVID)患者在COVID-19感染前后的免疫反应特征 | 首次揭示CVID患者在COVID-19康复期仍持续存在I型干扰素特征和炎症小体激活,并发现适应性免疫反应失调的详细机制 | 样本量有限,未明确完整体液免疫在这些过程中的具体调控机制 | 研究CVID患者对SARS-CoV-2感染的免疫反应特征和长期影响 | 普通变异型免疫缺陷病(CVID)患者 | 免疫学 | 免疫缺陷病 | 单细胞RNA测序,光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | CVID患者外周血样本(感染前、感染期间和康复期) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic census of mammalian olfactory epithelium aging
2024-11-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.020
PMID:39173624
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析年轻与年老小鼠嗅觉上皮,揭示衰老过程中的细胞和分子变化 | 首次在单细胞分辨率下系统绘制哺乳动物嗅觉上皮衰老的转录组图谱,识别了21种细胞类型中的衰老相关差异表达基因 | 研究仅限于小鼠模型,人类嗅觉上皮衰老可能存在物种特异性差异 | 探究哺乳动物嗅觉上皮衰老的细胞和分子机制 | 年轻和年老小鼠的嗅觉上皮组织 | 单细胞组学 | 衰老相关嗅觉功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老小鼠嗅觉上皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 171 | 2025-10-06 |
Long-Term Follow-up of Levonorgestrel Intrauterine Device for Atypical Hyperplasia and Early Endometrial Cancer Reveals Relapse Characterized by Immune Exhaustion
2024-Nov-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0362
PMID:38922360
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研究论文 | 评估左炔诺孕酮宫内节育器治疗子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌的长期随访结果及复发机制 | 首次使用空间转录组学分析LIUD治疗过程中免疫微环境变化,揭示复发与免疫耗竭相关 | 样本量较小(仅5例患者的纵向活检),需更大规模研究验证 | 探索LIUD治疗AH/G1EEC的长期疗效及复发机制 | 子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学, 数字空间分析, 细胞类型反卷积分析 | MCP-counter分析 | 组织活检样本 | 43例初始响应患者(其中41例有随访数据),5例患者纵向活检 | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMX数字空间分析系统 | Nanostring GeoMX数字空间分析 |
| 172 | 2025-10-06 |
Endoluminal Biopsy for Vein of Galen Malformation
2024-Nov-01, Neurosurgery
IF:3.9Q1
DOI:10.1227/neu.0000000000002986
PMID:38747605
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研究论文 | 本研究通过血管内组织采样技术对Galen静脉畸形病变进行原位分析,探索其遗传学和发病机制 | 首次在常规血管内治疗过程中通过线圈获取VOGM原位内皮细胞进行单细胞RNA测序分析 | 样本量较小(6名患者),需要更大规模研究验证发现 | 开发VOGM分子遗传学分类系统并探索个性化治疗策略 | Galen静脉畸形患者的内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 脑血管畸形 | 单细胞RNA测序,遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据,DNA序列数据 | 6名患者(年龄12天至约6岁),10次ETS操作 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2025-10-06 |
Augmenting antitumor efficacy of Th17-derived Th1 cells through IFN-γ-induced type I interferon response network via IRF7
2024-Nov-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412120121
PMID:39541355
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研究论文 | 本研究揭示了Th17来源的Th1细胞通过IFN-γ诱导的IRF7介导的I型干扰素反应网络增强抗肿瘤效能的机制 | 首次发现Th1细胞通过ECM1依赖性方式在肿瘤中更快迁移和积累,并阐明IFN-γ通过上调IRF7促进I型干扰素反应网络和ECM1表达的分子机制 | Th1细胞表现出早期耗竭表型,其分化机制和抗肿瘤反应尚未完全阐明 | 探索Th17来源的Th1细胞的分化机制及其在癌症免疫治疗中的抗肿瘤效能 | CD4 T细胞亚群,特别是共表达Th1和Th17标志物的T细胞 | 免疫学 | 实体恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序,轨迹分析,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2025-10-06 |
Monocyte Invasion into the Retina Restricts the Regeneration of Neurons from Müller Glia
2024-Nov-13, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0938-24.2024
PMID:39353729
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研究论文 | 本研究揭示外周免疫系统中的单核细胞通过浸润受损视网膜并分泌骨桥蛋白抑制Müller胶质细胞的神经再生能力 | 首次发现外周免疫系统(单核细胞)是中枢神经系统再生的屏障,并鉴定出骨桥蛋白是抑制神经再生的关键细胞因子 | 研究主要基于小鼠模型,在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 | 探索限制哺乳动物视网膜神经元再生的机制 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞和浸润的单核细胞 | 神经再生 | 视网膜疾病 | scRNA-seq(单细胞RNA测序) | CCR2基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 不同性别的CCR2敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-10-07 |
Lamination-based organoid spatially resolved transcriptomics technique for primary lung and liver organoid characterization
2024-Nov-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2408939121
PMID:39514315
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研究论文 | 本研究开发了一种基于层压的类器官空间转录组技术,用于表征原代肺和肝脏类器官 | 开发了新型层压式类器官空间转录组技术,解决了传统切片方法不适用于原代组织来源类器官的技术难题 | 技术尚未在其他类型类器官中验证,且依赖于自制层压设备 | 开发适用于原代组织来源类器官的空间转录组表征方法 | 原代小鼠肺和肝脏来源的类器官 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,液滴工程方法,免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据,图像数据 | 小鼠肺和肝脏类器官 | NA | 空间转录组学 | 自制层压设备 | 基于重量压缩的自制层压装置,液滴工程方法制备类器官 |
| 176 | 2025-05-07 |
Cell-type deconvolution for bulk RNA-seq data using single-cell reference: a comparative analysis and recommendation guideline
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf031
PMID:39899596
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研究论文 | 本文通过系统评估九种基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法,提出了在不同场景下选择合适方法的推荐指南 | 首次系统比较了多种基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法,并提出了实用推荐指南 | 研究仅评估了九种方法,可能未涵盖所有现有方法 | 评估和比较基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法在组织细胞类型比例估计中的准确性和鲁棒性 | 九种反卷积方法和五组单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | 五组单细胞RNA测序数据集和真实批量数据 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2025-10-07 |
Deciphering cell states and the cellular ecosystem to improve risk stratification in acute myeloid leukemia
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf028
PMID:39865982
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研究论文 | 通过构建急性髓系白血病单细胞转录组图谱和开发sciNMF工作流程,系统解析细胞异质性并建立ACE特征以改善预后预测 | 提出了sciNMF工作流程识别26种白血病和免疫细胞状态,首次定义了AML细胞生态系统(ACE)概念并开发了12基因特征(ACEsig) | 研究基于单细胞转录组数据,需要进一步验证其在更广泛临床场景中的应用效果 | 改善急性髓系白血病的风险分层策略 | 急性髓系白血病患者的白血病细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,但包含公共RNA-seq队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 178 | 2025-10-07 |
Salmonella dry surface biofilm: morphology, single-cell landscape, and sanitization
2024-Nov-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01623-24
PMID:39494899
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研究论文 | 本研究比较了鼠伤寒沙门氏菌干表面生物膜和湿表面生物膜的形成特征,并通过单细胞转录组学分析其功能异质性,最后评估了黄酮类化合物与异丙醇联合使用的消毒效果 | 首次全面研究干表面生物膜的特性并探索其潜在生存机制,提出溶解于70%异丙醇的桑色素作为高效干式消毒剂 | 研究仅针对鼠伤寒沙门氏菌,未涉及其他食源性病原体 | 探究干表面生物膜的形成特征、功能异质性及消毒方法 | 鼠伤寒沙门氏菌干表面生物膜和湿表面生物膜 | 微生物学 | 食源性疾病 | 共聚焦激光扫描显微镜,电子显微镜,单细胞转录组学 | NA | 显微镜图像,转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-07 |
Inhibition of SUMOylation Induces Adaptive Antitumor Immunity against Pancreatic Cancer through Multiple Effects on the Tumor Microenvironment
2024-Nov-04, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-23-0572
PMID:39150446
|
研究论文 | 本研究通过抑制SUMOylation探索了胰腺癌治疗的新机制,发现该过程通过调节肿瘤微环境诱导适应性抗肿瘤免疫 | 首次揭示SUMOylation抑制在体内通过T细胞依赖性机制诱导适应性抗肿瘤免疫,而非直接抑制肿瘤细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探究SUMOylation抑制对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响及其治疗机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)小鼠模型及肿瘤微环境中的各类细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序,流式细胞术,免疫荧光,免疫组化,Western blot,qPCR | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,基因表达数据 | 临床相关原位PDAC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2025-10-07 |
CRISPR Screening of Transcribed Super-Enhancers Identifies Drivers of Triple-Negative Breast Cancer Progression
2024-Nov-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3995
PMID:39186674
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研究论文 | 通过CRISPR筛选技术鉴定三阴性乳腺癌进展的关键调控元件 | 首次系统分析三阴性乳腺癌特异性超级增强子及其eRNA转录本,结合CRISPR干扰和染色质互作图谱揭示调控机制 | 研究聚焦于前30个eRNA产生的超级增强子,可能未覆盖所有相关调控元件 | 揭示三阴性乳腺癌中超级增强子驱动的基因调控网络 | 三阴性乳腺癌细胞系和动物模型 | 功能基因组学 | 三阴性乳腺癌 | CRISPR干扰筛选,RNA测序,Hi-C染色质构象捕获,单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | 基因组学数据,转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,染色质可及性测序 | NA | NA |