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当前共找到 578 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-07 |
Integrating scRNA-seq and scATAC-seq with inter-type attention heterogeneous graph neural networks
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae711
PMID:39800872
|
研究论文 | 提出一种名为scMI的异构图嵌入方法，通过跨模态注意力机制整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据 | 设计了跨类型注意力机制来有效捕获基因与染色质可及性区域之间的长程跨模态相互作用，不依赖motif数据库 | 未明确说明方法在特定细胞类型或疾病背景下的适用性限制 | 开发单细胞多组学数据整合方法，改善跨模态关系学习 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 异构图神经网络, 注意力机制 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 162 | 2025-10-07 |
Deep learning in integrating spatial transcriptomics with other modalities
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae719
PMID:39800876
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综述 | 系统回顾深度学习在整合空间转录组学与其他模态数据中的应用 | 首次系统综述深度学习整合空间转录组学与多模态数据的方法，提出分类框架并总结整合策略 | 作为综述文章，不包含原始实验验证 | 促进开发更全面利用多模态信息的稳健计算方法 | 空间转录组学数据整合方法 | 机器学习 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序，组织学成像，染色质成像 | 深度学习 | 空间转录组数据，组织学图像，染色质图像，scRNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq，空间多组学 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-07 |
CellMsg: graph convolutional networks for ligand-receptor-mediated cell-cell communication analysis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae716
PMID:39800874
|
研究论文 | 提出了一种基于图卷积网络的细胞间通讯分析计算框架CellMsg | 结合配体-受体多模态特征和图卷积网络识别高可信度配体-受体相互作用，采用三点估计方法量化细胞间通讯强度 | NA | 开发计算工具解析细胞间通讯 | 细胞间通讯和配体-受体相互作用 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络(GCN) | 单细胞RNA测序数据 | 四个基准LRI数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics of IPMN Reveals Divergent Indolent and Malignant Lineages
2024-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.29.620810
PMID:39554015
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研究论文 | 通过空间转录组学分析胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤，揭示了惰性和恶性谱系的分化 | 首次使用数字空间RNA分析技术识别IPMN中与癌症风险相关的三种不同转录组状态 | 样本量较小(仅10个IPMN标本)，需要更大规模研究验证 | 开发改善IPMN风险分类准确性的分子诊断方法 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)标本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 数字空间RNA分析(DSP-RNA),全转录组测序 | NA | 空间转录组数据,基因表达数据 | 10个IPMN标本，涵盖从正常导管到癌症的各级异型增生 | Illumina | 空间转录组学,全转录组测序 | Illumina测序平台 | 数字空间RNA分析(DSP-RNA)技术 |
| 165 | 2025-10-07 |
Highly neurogenic glia from human and mouse myenteric ganglia generate functional neurons following culture and transplantation into the gut
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114919
PMID:39471175
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研究论文 | 本研究开发了从人和小鼠肠肌层神经节中分离高神经源性肠神经干细胞的方法，并验证了其移植后生成功能性神经元的能力 | 首次发现肠肌层神经节内的胶质细胞亚群是具有高神经源性潜能的肠神经干细胞库，并建立了选择性分离这些细胞的新方法 | 研究主要基于动物模型和异种移植实验，人类临床应用仍需进一步验证 | 开发更有效的肠神经干细胞分离方法，用于神经肠道疾病的再生治疗 | 人和小鼠肠肌层神经节中的肠胶质细胞 | 干细胞与再生医学 | 神经肠道疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 多组学分析, 光遗传学刺激 | NA | 基因表达数据, 生理功能数据 | 人和小鼠肠道组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 166 | 2025-10-07 |
Interleukin-1β modulates lymphoid differentiation of Flt3-positive multipotent progenitors after transplantation
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114890
PMID:39425929
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研究论文 | 本研究揭示了IL-1β在移植后通过调节Flt3阳性多能祖细胞命运促进B淋巴细胞生成的新机制 | 首次发现IL-1β能够诱导Flt3 MPPs从髓系偏向向淋巴系偏向的细胞命运转换，并促进B淋巴细胞生成 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类系统中验证 | 探究应激环境中调控造血干细胞和祖细胞行为的因子及其机制 | 表达Flt3的小鼠多能祖细胞(MPPs) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪,克隆分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2025-10-07 |
Spatial, transcriptomic, and epigenomic analyses link dorsal horn neurons to chronic pain genetic predisposition
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114876
PMID:39453813
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研究论文 | 本研究通过多物种方法整合猕猴、人类和小鼠数据，构建了背角神经元亚型的统一图谱，并揭示了慢性疼痛遗传易感性与神经元亚型特异性染色质区域的关联 | 首次构建了跨物种保守的背角神经元亚型图谱，结合空间转录组学精确定位神经元层状分布，并建立了慢性疼痛GWAS变异与神经元特异性调控元件的直接联系 | 研究主要依赖动物模型数据，人类样本验证相对有限，调控机制的功能验证需要进一步实验 | 确定慢性疼痛遗传变异是否影响背角神经元的调控基因组学 | 背角神经元 | 空间转录组学 | 慢性疼痛 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 开放染色质分析 | 跨物种整合分析 | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间定位数据 | 猕猴单核RNA测序图谱整合人类和小鼠数据集 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学, 单核开放染色质分析 | NA | NA |
| 168 | 2025-10-07 |
IL-2-inducible T cell kinase deficiency sustains chimeric antigen receptor T cell therapy against tumor cells
2024-Nov-26, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178558
PMID:39589809
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9技术敲除CAR-T细胞中的ITK基因，显著改善了CAR-T细胞的抗肿瘤效果和持久性 | 首次揭示ITK缺失可通过降低CAR-T细胞耗竭、增强记忆特征来提升抗肿瘤疗效 | 研究主要聚焦CD19-CAR-T细胞，尚未验证其他CAR靶点的普适性 | 探索改善CAR-T细胞治疗持久性和抗肿瘤效果的新策略 | CD19-CAR-T细胞 | 免疫治疗 | 白血病 | CRISPR-Cas9基因编辑，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-07 |
The peripheral Atf3 + neuronal population is responsible for nerve regeneration at the early stage of nerve injury revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Nov-13, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2024169
PMID:39539109
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示外周神经损伤早期Atf3+神经元群体在神经再生中的作用机制 | 发现CCI诱导的新型神经元群体(CIP)高表达Atf3和再生相关基因，并揭示其与卫星胶质细胞间的信号通讯网络 | 研究仅关注损伤后第3天的早期阶段，未涵盖完整再生过程的时间动态变化 | 探究外周神经损伤后背根神经节细胞的转录组变化与神经再生机制 | 小鼠背根神经节细胞 | 单细胞基因组学 | 外周神经损伤 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 小鼠慢性压迫损伤模型DRG细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-07 |
Defective ribosome assembly impairs leukemia progression in a murine model of acute myeloid leukemia
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114864
PMID:39412990
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型和单细胞分析揭示核糖体组装缺陷可延缓急性髓系白血病进展 | 首次证明核糖体组装缺陷可通过改变转录因子景观和增加核糖体生物合成来抑制白血病进展 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果尚需验证 | 探究核糖体组装在白血病细胞功能中的作用及其治疗潜力 | 急性髓系白血病（AML）细胞和小鼠模型 | 癌症生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | 小鼠白血病模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 患者数据集和多个小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 171 | 2025-10-07 |
Polyclonal regeneration of mouse bone marrow endothelial cells after irradiative conditioning
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114779
PMID:39489938
|
研究论文 | 本研究探讨了小鼠骨髓内皮细胞在辐照预处理后的多克隆再生机制 | 首次结合单细胞RNA测序、体外克隆形成实验和机器学习模型，系统揭示了骨髓内皮细胞再生的多克隆特性 | 研究仅限于小鼠模型，人类骨髓内皮细胞的再生机制可能有所不同 | 阐明辐照预处理后骨髓内皮细胞的再生机制 | 小鼠骨髓内皮细胞 | 单细胞生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 成像技术, 体外克隆形成实验 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2025-10-07 |
PIEZO-dependent mechanosensing is essential for intestinal stem cell fate decision and maintenance
2024-11-29, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adj7615
PMID:39607940
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研究论文 | 本研究揭示了PIEZO机械敏感通道通过感知细胞外机械刺激调控肠道干细胞命运决定和维持的机制 | 首次在体内证实PIEZO通道在肠道干细胞机械感知中的关键作用，并建立了从机械信号感知到干细胞功能调控的完整机制通路 | 研究主要基于小鼠模型，在人类肠道干细胞中的适用性需要进一步验证 | 探究肠道干细胞如何感知机械信号并维持稳态 | 小鼠肠道干细胞及其微环境 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，小鼠遗传学，生物工程基质，拉伸装置 | NA | 基因表达数据，机械性能测量数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2025-10-07 |
De novo detection of somatic variants in high-quality long-read single-cell RNA sequencing data
2024-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.06.583775
PMID:38496441
|
研究论文 | 开发了名为LongSom的计算工作流程，利用高质量长读长单细胞RNA测序数据检测体细胞变异 | 无需正常样本即可检测体细胞变异，能够同时检测SNV、mtSNV、CNA和基因融合，并基于细胞突变谱重新注释细胞类型 | NA | 开发检测体细胞变异的方法以重建肿瘤克隆异质性 | 人类卵巢癌样本 | 计算生物学 | 卵巢癌 | 长读长单细胞RNA测序 | 计算工作流程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2025-10-07 |
O-GlcNAcylation of circadian clock protein Bmal1 impairs cognitive function in diabetic mice
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00263-6
PMID:39375536
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研究论文 | 本研究揭示了高血糖通过O-GlcNAc糖基化修饰生物钟蛋白Bmal1导致糖尿病小鼠认知功能障碍的分子机制 | 首次发现Bmal1的O-GlcNAc糖基化修饰在糖尿病认知功能障碍中的关键作用，并开发了特异性阻断该修饰的短肽治疗方法 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明糖尿病相关认知功能障碍的分子机制 | 糖尿病小鼠的海马神经元 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2025-10-07 |
Understanding the heterogeneity of natural killer cells at the maternal-fetal interface: implications for pregnancy health and disease
2024-Nov-14, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae040
PMID:39570646
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综述 | 本文系统回顾了母胎界面自然杀伤细胞的异质性研究及其与妊娠健康的关系 | 整合了基于表面标志物、功能分子和单细胞RNA测序的NK细胞分类方法，并总结了dNK细胞分化途径 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证 | 探讨母胎界面NK细胞异质性及其在妊娠相关疾病中的作用 | 子宫NK细胞亚群和蜕膜NK细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-07 |
Expansion effect of romiplostim on hematopoietic stem and progenitor cells versus thrombopoietin and eltrombopag
2024-Nov, International journal of hematology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s12185-024-03853-6
PMID:39302624
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研究论文 | 比较罗米司亭与重组人血小板生成素和艾曲波帕对造血干细胞和祖细胞的体外扩增效果及分子机制 | 首次在单细胞水平揭示罗米司亭对最原始造血干细胞亚群中RHOA信号通路相关分子变化的特异性诱导作用 | 仅为体外研究，需要进一步体内实验验证 | 阐明罗米司亭与其他TPO受体激动剂的生物学效应差异 | 人CD34+造血干细胞和祖细胞 | 单细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 177 | 2025-10-07 |
Gene interactions analysis of brain spatial transcriptome for Alzheimer's disease
2024-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101337
PMID:39281834
|
研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病脑空间转录组数据，揭示了淀粉样蛋白-β积累过程中基因相互作用的动态变化 | 首次基于空间转录组学识别淀粉样蛋白-β积累过程中的多种基因关联，从时空依赖的基因相互作用角度为AD病因研究提供新视角 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 揭示阿尔茨海默病中基因相互作用的时空动态特征 | 小鼠和人类大脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组测序,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单核RNA-seq数据 | 敲除AD和野生型小鼠模型，不同AD小鼠模型，人类单核RNA-seq数据 | NA | 空间转录组学,单核RNA-seq | NA | NA |
| 178 | 2025-10-07 |
Automatically Detecting Anchor Cells and Clustering for scRNA-Seq Data Using scTSNN
2024-11, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3460761
PMID:39283774
|
研究论文 | 提出了一种名为scTSNN的张量共享最近邻锚点聚类方法，用于自动检测单细胞RNA测序数据中的锚点细胞并进行聚类 | 首次利用张量亲和力学习模块挖掘细胞间的局部-全局平衡拓扑结构，并设计基于密度的共享最近邻测量方法自动检测锚点细胞 | 在无监督场景下发现真实细胞类型仍然具有挑战性 | 开发自动检测锚点细胞和确定聚类数量的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 张量共享最近邻聚类模型 | 单细胞RNA测序数据 | 合成数据集和真实scRNA-seq数据集，包括哺乳动物细胞和宫颈癌肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 179 | 2025-10-07 |
PAGE-based transfer learning from single-cell to bulk sequencing enhances model generalization for sepsis diagnosis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae661
PMID:39710434
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研究论文 | 提出基于单细胞转录组的迁移学习方法scPAGE2，通过整合单细胞和批量转录组数据构建脓毒症诊断模型 | 开发了改进的差异表达基因对分析方法，实现了从单细胞到批量转录组数据的知识迁移 | 模型在更广泛疾病类型和临床场景中的适用性需要进一步验证 | 提高脓毒症诊断模型的泛化能力 | 脓毒症患者和急性髓系白血病患者的转录组数据 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序，荧光激活细胞分选 | 迁移学习 | 转录组数据 | 来自三个转录组平台和FACS的七个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2025-10-07 |
Metabolic Labeling and Digital Microfluidic Single-Cell Sequencing for Single Bacterial Genotypic-Phenotypic Analysis
2024-11, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202402177
PMID:39077951
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研究论文 | 开发了一种基于数字微流控的单细菌基因型-表型分析方法，用于抗生素耐药性分析 | 首次将代谢标记与数字微流控单细胞测序相结合，实现单细菌水平的基因型和表型同步分析 | NA | 开发能够同时分析细菌基因型和表型特征的方法，以全面了解抗生素耐药性 | 抗生素耐药性细菌 | 单细胞测序 | 细菌感染 | 全基因组测序，代谢标记，数字微流控 | NA | 基因组数据，荧光图像数据 | NA | NA | 单细胞全基因组测序 | 数字微流控平台 | 数字微流控自动化检测系统，用于单细菌分离和测序 |