单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2024-12-01	Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes 2024-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54337-4 PMID:39604360	研究论文	本文通过单细胞转录组分析揭示了CD34作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物	首次报道了CD34作为窦房结起搏细胞的细胞表面标志物，并展示了其在干细胞分化培养中对窦房结细胞的富集作用	NA	揭示人类窦房结的细胞和分子组成，特别是寻找窦房结起搏细胞的细胞表面标志物	人类窦房结起搏心肌细胞及其标志物	数字病理学	心血管疾病	单细胞/单核RNA测序	NA	转录组数据	胎儿和人类多能干细胞衍生的窦房结细胞
142	2024-12-01	SLC2A3 promotes head and neck squamous cancer developing through negatively regulating CD8+ T cell in tumor microenvironment 2024-11-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-79417-9 PMID:39604419	研究论文	研究探讨了SLC2A3在头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的作用及其对肿瘤微环境中CD8+ T细胞的影响	首次揭示了SLC2A3在HNSC中的预后意义及其通过抑制CD8+ T细胞促进肿瘤发展的机制	研究主要基于TCGA数据库和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证	探讨SLC2A3在头颈部鳞状细胞癌中的预后意义及其对肿瘤微环境中免疫细胞的影响	SLC2A3基因、CD8+ T细胞、头颈部鳞状细胞癌患者	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序、磁激活细胞分选、流式细胞术、基因集富集分析、Western blot	NA	基因表达数据、单细胞数据	504名头颈部鳞状细胞癌患者
143	2024-12-01	Single-cell RNA sequencing reveals multiple immune cell subpopulations promote the formation of abnormal bone microenvironment in osteoporosis 2024-11-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-80993-z PMID:39604551	研究论文	本文通过单细胞RNA测序揭示了多种免疫细胞亚群在骨质疏松症中异常骨微环境形成中的作用	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨质疏松症中多种免疫细胞亚群及其在异常骨微环境形成中的作用	研究仅限于单细胞RNA测序数据分析，缺乏体内实验验证	识别促进骨质疏松症发展的免疫细胞亚群，为新疗法的开发提供基础	骨质疏松症中的免疫细胞亚群及其在异常骨微环境形成中的作用	数字病理学	骨质疏松症	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个样本
144	2024-12-01	Proximal tubule cell maturation rate and function are controlled by PPARα signaling in kidney organoids 2024-Nov-27, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-07069-6 PMID:39604738	研究论文	研究了PPARα信号在肾脏类器官中近端小管细胞成熟率和功能中的作用	揭示了PPARα信号在近端小管细胞成熟中的关键作用，并提出了一种促进近端小管细胞成熟的方法	NA	探索肾脏类器官中近端小管细胞的成熟机制，并开发促进其成熟的方法	人多能干细胞衍生的肾脏类器官中的近端小管细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	时间序列的肾脏类器官样本
145	2024-12-01	Zinc Ions Facilitate Metabolic Bioenergetic Recovery Post Spinal Cord Injury by Activating Microglial Mitophagy through the STAT3-FOXO3a-SOD2 Pathway 2024-Nov-27, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2024.11.045 PMID:39613048	研究论文	研究锌离子通过STAT3-FOXO3a-SOD2通路激活小胶质细胞自噬，促进脊髓损伤后的代谢和生物能量恢复	揭示了锌离子通过STAT3-FOXO3a-SOD2轴调控线粒体基因表达，改善小胶质细胞代谢功能，为脊髓损伤治疗提供了新的靶点	NA	探讨锌离子在脊髓损伤后通过激活小胶质细胞自噬促进代谢恢复的机制	脊髓损伤后的小胶质细胞代谢功能	NA	脊髓损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
146	2024-12-01	Defective ribosome assembly impairs leukemia progression in a murine model of acute myeloid leukemia 2024-Nov-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114864 PMID:39412990	研究论文	研究探讨了核糖体组装在急性髓系白血病（AML）中的作用及其对白血病进展的影响	揭示了核糖体组装缺陷可以延长AML小鼠模型的生存期，并展示了其在p53缺陷型AML中的抗白血病效果	NA	探讨核糖体组装在白血病细胞功能中的作用，并评估其作为AML治疗靶点的潜力	急性髓系白血病（AML）患者数据和鼠类模型	NA	急性髓系白血病	单细胞RNA测序和蛋白质组分析	NA	RNA和蛋白质数据	包含AML患者数据和鼠类模型
147	2024-12-01	Interleukin-1β modulates lymphoid differentiation of Flt3-positive multipotent progenitors after transplantation 2024-Nov-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114890 PMID:39425929	研究论文	研究探讨了IL-1β在移植后调节Flt3阳性多能祖细胞淋巴分化中的作用	首次揭示了IL-1β在促进B淋巴生成中的未被认识的功能，并强调了IL-1β在调节MPP细胞命运动态中的潜在作用	NA	研究IL-1β在移植后调节多能祖细胞淋巴分化中的机制	Flt3阳性多能祖细胞（MPPs）及其淋巴分化	NA	NA	单细胞RNA测序（RNA-seq）	NA	RNA	小鼠多能祖细胞（MPPs）
148	2024-12-01	Spatial, transcriptomic, and epigenomic analyses link dorsal horn neurons to chronic pain genetic predisposition 2024-Nov-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114876 PMID:39453813	研究论文	本文通过多物种方法研究了背角神经元在慢性疼痛遗传易感性中的作用	首次将背角神经元的转录组和表观基因组与慢性疼痛的遗传变异联系起来	NA	探讨慢性疼痛的遗传变异是否影响背角神经元的调控基因组	背角神经元及其在慢性疼痛中的作用	数字病理学	慢性疼痛	单核RNA测序 (snRNA-seq)、空间转录组学、单核开放染色质图谱	NA	转录组数据、表观基因组数据	包括猕猴、人类和小鼠的数据集
149	2024-12-01	scRNA-seq revealed transcriptional signatures of human umbilical cord primitive stem cells and their germ lineage origin regulated by imprinted genes 2024-11-26, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-79810-4 PMID:39587190	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示了人类脐带原始干细胞及其生殖系起源的转录特征，这些特征受印记基因调控	首次通过单细胞RNA测序技术展示了从脐带血中纯化的人类VSELs的分子特征，并发现其与小鼠骨髓来源的VSELs具有相似的转录特征	研究仅限于脐带血中的VSELs，未涉及其他组织来源的VSELs	探讨人类脐带原始干细胞及其生殖系起源的转录特征及其受印记基因调控的机制	人类脐带血中的VSELs及其转录特征	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	脐带血中的VSELs样本
150	2024-12-01	Spatial transcriptomics reveals substantial heterogeneity in triple-negative breast cancer with potential clinical implications 2024-Nov-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54145-w PMID:39592577	研究论文	研究使用空间转录组学技术分析了三阴性乳腺癌的肿瘤组织结构和细胞组成	首次结合组织形态学和空间转录组学对三阴性乳腺癌的肿瘤微环境进行深入分析，并识别出与疾病预后和免疫治疗反应相关的基因特征	NA	探讨三阴性乳腺癌的空间异质性及其临床意义	NA	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学	NA	基因表达数据	92名患者
151	2024-12-01	Single-Cell Transcriptomic Dataset of RPGR-associated Retinitis Pigmentosa Patient-Derived Retinal Organoids 2024-Nov-26, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-024-04124-z PMID:39592612	研究论文	研究利用单细胞转录组测序技术分析了RPGR相关视网膜色素变性患者的视网膜类器官	首次利用单细胞RNA测序技术分析了RPGR突变对视网膜类器官发育的影响	研究仅限于视网膜类器官，未涉及临床样本	探讨RPGR突变导致视网膜退化的机制并支持靶向治疗的发展	RPGR突变和正常的人诱导多能干细胞衍生的视网膜类器官	数字病理学	视网膜疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	71,096个细胞，包括33,839个对照组细胞和37,257个RPGR组细胞
152	2024-12-01	Spatially organized tumor-stroma boundary determines the efficacy of immunotherapy in colorectal cancer patients 2024-Nov-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54710-3 PMID:39592630	研究论文	研究通过整合空间增强分辨率组学测序、单细胞RNA测序和多重成像分析，探讨了结直肠癌患者中肿瘤-基质边界的空间组织与免疫治疗效果的关系	首次揭示了肿瘤-基质边界的空间组织和免疫状态与免疫检查点阻断疗法反应的关联，并提出了通过重编程肿瘤-基质边界来增强免疫治疗效果的可能性	NA	探讨结直肠癌患者中肿瘤微环境的空间组织与免疫治疗效果的关系	结直肠癌患者的肿瘤微环境	数字病理学	结直肠癌	空间增强分辨率组学测序、单细胞RNA测序、多重成像分析	NA	空间图谱	治疗前和接受免疫检查点阻断疗法的结直肠癌患者
153	2024-12-01	Highly neurogenic glia from human and mouse myenteric ganglia generate functional neurons following culture and transplantation into the gut 2024-Nov-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114919 PMID:39471175	研究论文	本文描述了一种从人和小鼠的肠肌间神经节中分离出高度神经发生性胶质细胞的方法，这些细胞在培养和移植到肠道后能够生成功能性神经元	本文提出了一种新的方法，通过分离肠肌间神经节的完整片段来富集肠胶质细胞，这种方法比传统的分离单个细胞的方法能产生更高纯度的神经元	NA	研究旨在开发一种新的方法来富集肠神经干细胞，以用于神经肠疾病的再生治疗	本文主要研究了从人和小鼠的肠肌间神经节中分离出的肠胶质细胞及其在培养和移植后的神经发生能力	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
154	2024-12-01	Polyclonal regeneration of mouse bone marrow endothelial cells after irradiative conditioning 2024-Nov-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114779 PMID:39489938	研究论文	研究了在小鼠骨髓内皮细胞（BM-ECs）经过辐射处理后，细胞和克隆机制如何促进其再生	开发了一种单细胞体外克隆形成实验，并使用机器学习模型展示了BM-ECs在辐射后的多克隆再生过程	NA	研究骨髓内皮细胞在辐射处理后的再生机制	小鼠骨髓内皮细胞（BM-ECs）	NA	NA	单细胞RNA测序、成像技术、流式细胞术	机器学习模型	单细胞数据	使用Rainbow小鼠进行研究
155	2024-12-01	The immune landscape of murine skeletal muscle regeneration and aging 2024-Nov-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114975 PMID:39541212	研究论文	本文研究了小鼠骨骼肌再生和衰老过程中的免疫景观	揭示了骨骼肌内免疫群体的意外复杂性和功能异质性，并发现衰老过程中髓系和淋巴系细胞的重塑	NA	探讨免疫衰老对骨骼肌再生能力下降的贡献	小鼠骨骼肌再生和衰老过程中的免疫环境	NA	NA	单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学分析和功能检测	NA	单细胞RNA数据	NA
156	2024-12-01	Leveraging CAR macrophages targeting c-Met for precision immunotherapy in pancreatic cancer: insights from single-cell multi-omics 2024-Nov-26, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-024-00996-4 PMID:39592929	研究论文	本研究利用单细胞多组学技术，探索了一种针对胰腺癌的新型免疫治疗策略，通过工程化CAR巨噬细胞靶向c-Met蛋白，以消除癌症干细胞并抑制肿瘤血管生成	本研究首次利用单细胞多组学技术，开发了靶向c-Met的CAR巨噬细胞，用于胰腺癌的精准免疫治疗	本研究主要在体外和小鼠模型中进行，尚未在临床试验中验证其疗效	探索针对胰腺癌的新型免疫治疗策略，特别是通过靶向癌症干细胞和肿瘤血管生成	胰腺癌组织中的癌症干细胞和肿瘤血管生成	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA数据	胰腺癌组织样本和小鼠模型
157	2024-12-01	Integrated analyses of multi-omic data derived from paired primary lung cancer and brain metastasis reveal the metabolic vulnerability as a novel therapeutic target 2024-Nov-26, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-024-01410-8 PMID:39593114	研究论文	本文通过综合分析来自154名患者的配对和未配对的原发性肺癌和脑转移瘤的多组学数据，揭示了线粒体特异性代谢在肺癌脑转移瘤中的激活和肿瘤免疫微环境的抑制，并提出了一种基于合理机制的联合治疗策略	本文首次揭示了肺癌脑转移瘤中线粒体特异性代谢的激活和肿瘤免疫微环境的抑制，并提出了一种新的治疗靶点——氧化磷酸化	本文的研究结果主要基于体外实验和动物模型，尚未在临床试验中验证	深入理解肺癌脑转移瘤的分子机制和肿瘤微环境，开发新的治疗策略	原发性肺癌和脑转移瘤的多组学数据	数字病理学	肺癌	基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和单细胞RNA测序	NA	多组学数据	154名患者的配对和未配对的原发性肺癌和脑转移瘤样本
158	2024-12-01	TET2 promotes tumor antigen presentation and T cell IFN-γ, which is enhanced by vitamin C 2024-Nov-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.175098 PMID:39388288	研究论文	本文研究了TET2基因在肿瘤抗原呈递和T细胞IFN-γ中的作用，并探讨了维生素C对其增强效果	首次揭示了TET2在肿瘤抗原呈递中的额外功能，并证明了维生素C对此功能的增强作用	NA	探讨TET2在肿瘤免疫中的作用及其与维生素C的关系	TET2基因、维生素C、肿瘤抗原呈递、T细胞IFN-γ	NA	NA	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	RNA	B16-OVA黑色素瘤肿瘤样本及患者肿瘤样本
159	2024-12-01	Loss of PADI2 and PADI4 ameliorates sepsis-induced acute lung injury by suppressing NLRP3+ macrophages 2024-Nov-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.181686 PMID:39405117	研究论文	研究探讨了PADI2和PADI4在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用	首次揭示了PADI2和PADI4通过抑制NLRP3+巨噬细胞来减轻脓毒症诱导的急性肺损伤	NA	探讨PADI2和PADI4在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用机制	PADI2和PADI4在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用	NA	急性肺损伤	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA	Pseudomonas aeruginosa肺炎诱导的脓毒症小鼠
160	2024-12-01	Identification of LRP1+CD13+ human periosteal stem cells that require LRP1 for bone repair 2024-Nov-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.173831 PMID:39405183	研究论文	研究揭示了人类骨膜中含有表达LRP1和CD13的骨修复关键干细胞群	首次发现并验证了LRP1+CD13+人类骨膜干细胞在骨修复中的关键作用及其分子标记	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探讨人类骨膜干细胞的分子特征及其在骨修复中的作用机制	人类和小鼠的骨膜干细胞及其在骨修复中的功能	干细胞生物学	NA	单细胞测序	NA	单细胞数据	涉及人类和小鼠的骨膜干细胞样本