单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 577 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2025-10-06
Dyna-vivo-seq unveils cellular RNA dynamics during acute kidney injury via in vivo metabolic RNA labeling-based scRNA-seq
2024-11-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究开发了一种名为Dyna-vivo-seq的新策略,通过体内代谢RNA标记的单细胞RNA测序技术揭示急性肾损伤过程中的细胞RNA动态变化 首次实现了在活体动物中进行基于代谢RNA标记的时间分辨动态转录分析,突破了该技术仅限于体外模型的限制 研究仅在雌性小鼠中进行,未涉及其他性别或物种 开发能够在活体生物单细胞水平表征动态转录组的方法 雌性小鼠急性肾损伤模型中的近端肾小管细胞 单细胞基因组学 急性肾损伤 代谢RNA标记,单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
142 2025-10-06
Spatial transcriptomics reveals substantial heterogeneity in triple-negative breast cancer with potential clinical implications
2024-11-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学技术揭示三阴性乳腺癌的肿瘤异质性及其临床意义 首次系统性地描绘TNBC的空间组织结构,识别出9种空间原型,并发现与免疫治疗反应相关的基因特征 样本量相对有限(92例患者),需要在更大队列中进一步验证 探索三阴性乳腺癌的肿瘤空间结构和微环境特征 92例三阴性乳腺癌患者样本 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 逐步聚类分析 空间转录组数据、组织形态学数据 92例TNBC患者 NA 空间转录组学 NA NA
143 2025-10-06
Bacterial single-cell RNA sequencing captures biofilm transcriptional heterogeneity and differential responses to immune pressure
2024-11-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究开发了一种优化的细菌单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq,用于分析金黄色葡萄球菌生物膜生长过程中的转录异质性及免疫细胞暴露后的转录适应 开发了首个针对细菌的单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq,能够在单细胞分辨率下探索生物膜动态和免疫压力响应 方法目前主要应用于金黄色葡萄球菌,在其他细菌物种中的适用性有待验证 研究细菌生物膜的转录异质性及其对免疫压力的差异响应 金黄色葡萄球菌生物膜 单细胞测序技术 细菌感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA BaSSSh-seq(细菌单细胞RNA测序方法)
144 2025-10-06
Single-cell transcriptomics unveils molecular signatures of neuronal vulnerability in a mouse model of prion disease that overlap with Alzheimer's disease
2024-11-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示了朊病毒病小鼠模型中神经元易损性的分子特征及其与阿尔茨海默病的重叠 首次通过单细胞转录组学系统识别朊病毒易损神经元亚群,并发现与阿尔茨海默病共享的易损性相关转录本 研究仅使用雌性小鼠模型,未涉及其他性别或更广泛的神经退行性疾病模型 探究特定神经元对错误折叠蛋白所致功能障碍和死亡更敏感的分子机制 朊病毒感染雌性小鼠的活体神经元 单细胞组学 神经退行性疾病 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 朊病毒感染雌性小鼠的神经元样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
145 2025-10-06
Immunotherapy that improves response to chemotherapy in high-grade serous ovarian cancer
2024-11-22, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析高级别浆液性卵巢癌中肿瘤浸润免疫细胞,发现可增强新辅助化疗反应的潜在靶点 首次在高级别浆液性卵巢癌中通过单细胞RNA测序鉴定出STAB1和FOXP3作为化疗增敏的免疫治疗靶点,并开发了相应的靶向治疗策略 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 探索提高高级别浆液性卵巢癌对新辅助化疗反应的免疫治疗策略 高级别浆液性卵巢癌患者和小鼠模型的肿瘤浸润免疫细胞 单细胞测序分析 卵巢癌 单细胞RNA测序, 体外抑制实验, 反义寡核苷酸技术 NA 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 患者样本64,097个细胞,小鼠模型69,781个细胞,使用三种不同的HGSOC同系小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
146 2025-10-06
Lenalidomide-induced pure red cell aplasia is associated with elevated expression of MHC-I molecules on erythrocytes
2024-11-22, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了来那度胺治疗多发性骨髓瘤时诱发纯红细胞再生障碍的机制 首次发现来那度胺通过上调红细胞MHC-I分子表达,激活CD8 T细胞导致红细胞生成障碍 研究基于单个病例,样本量有限,需要更大规模研究验证 探究来那度胺治疗诱发纯红细胞再生障碍的分子机制 多发性骨髓瘤患者骨髓样本 血液肿瘤学 多发性骨髓瘤 单细胞转录组分析,体外功能实验 NA 单细胞RNA测序数据,体外实验数据 1例多发性骨髓瘤患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
147 2025-10-06
A developmental biliary lineage program cooperates with Wnt activation to promote cell proliferation in hepatoblastoma
2024-11-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过组织学引导和空间转录组学分析肝母细胞瘤,揭示了胚胎胆道谱系程序与Wnt激活协同促进肿瘤细胞增殖的机制 发现胚胎胆道转录因子SOX4和生长因子FGF19在肝母细胞瘤增殖异质性中的关键作用,揭示了非遗传性表观遗传机制在肿瘤进化中的功能 研究主要基于患者来源的肿瘤类器官模型,需要进一步在体内验证这些发现 探究肝母细胞瘤中组织学和增殖异质性的分子机制 肝母细胞瘤患者肿瘤样本和患者来源的肿瘤类器官 空间转录组学 肝母细胞瘤 组织学引导的空间转录组学 NA 空间转录组数据、组织学图像 肝母细胞瘤患者样本和肿瘤类器官 NA 空间转录组学 NA NA
148 2025-10-06
Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes
2024-11-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析发现CD34可作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物 首次发现CD34可作为窦房结起搏细胞的表面标志物,并证明通过CD34分选可富集具有功能起搏表型的细胞 研究主要基于胎儿和干细胞来源的窦房结细胞,未涉及成人原代组织 鉴定人类窦房结起搏细胞的分子标志物 人类胎儿窦房结细胞和人多能干细胞分化的窦房结细胞 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞/单核RNA测序 NA 单细胞转录组数据 胎儿和干细胞来源的窦房结细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
149 2025-10-06
Spatially organized tumor-stroma boundary determines the efficacy of immunotherapy in colorectal cancer patients
2024-11-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过整合空间增强分辨率组学测序等技术,揭示了结直肠癌中肿瘤-基质边界的空间组织与免疫治疗疗效的关联 首次通过空间多组学技术系统解析肿瘤-基质边界的空间组织结构及其在免疫检查点阻断治疗响应中的作用机制 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 探究结直肠癌患者对免疫治疗不同响应的肿瘤微环境机制 未经治疗和接受ICB治疗的结直肠癌患者肿瘤样本 数字病理学 结直肠癌 空间增强分辨率组学测序,单细胞RNA测序,多重成像分析 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,成像数据 未明确具体样本数量 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
150 2025-10-06
Spatio-temporal transcriptomics of chromothriptic SHH-medulloblastoma identifies multiple genetic clones that resist treatment and drive relapse
2024-11-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学分析染色体碎裂型SHH髓母细胞瘤,揭示了其空间异质性特征和治疗抵抗机制 首次应用空间转录组学技术系统分析染色体碎裂型髓母细胞瘤的空间异质性,识别出多个遗传克隆在治疗抵抗和复发中的作用 样本量相对有限(13例肿瘤和11个PDX样本),需要更大规模研究验证发现 探索染色体碎裂型髓母细胞瘤的分子特征和侵袭性决定因素 染色体碎裂型和非染色体碎裂型髓母细胞瘤患者样本及患者来源异种移植模型 空间转录组学 髓母细胞瘤 空间转录组学 NA 空间转录组数据 13例髓母细胞瘤样本和11个患者来源异种移植样本 NA 空间转录组学 NA NA
151 2025-10-06
C/EBPβ-dependent autophagy inhibition hinders NK cell function in cancer
2024-11-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示自噬是NK细胞抗肿瘤功能的核心调节因子,并发现C/EBPβ依赖的自噬抑制会阻碍NK细胞在癌症中的功能 首次发现自噬作为NK细胞内的检查点,并通过CXCL12-CXCR4-C/EBPβ信号轴阐明其调控机制 研究主要基于前列腺癌模型,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 探索癌症如何导致NK细胞功能失调及克服免疫治疗抵抗的机制 肿瘤浸润NK细胞、人类前列腺癌患者样本、多种小鼠癌症模型 免疫学 前列腺癌 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据 晚期人类前列腺癌患者样本及多种小鼠癌症模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
152 2025-10-06
Transcription factors ASCL1 and OLIG2 drive glioblastoma initiation and co-regulate tumor cell types and migration
2024-11-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤发生发展中的协同调控作用 首次证明ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤形成中具有冗余功能,并共同调控肿瘤细胞类型和迁移能力 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 探究ASCL1和OLIG2转录因子在胶质母细胞瘤发生和异质性调控中的作用机制 小鼠脑室下区祖细胞和胶质母细胞瘤细胞 癌症生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 小鼠胶质母细胞瘤模型 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
153 2025-10-06
Granzyme K+CD8+ T cells interact with fibroblasts to promote neutrophilic inflammation in nasal polyps
2024-11-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析发现GZMK+CD8+ T细胞通过与成纤维细胞相互作用促进鼻息肉中的中性粒细胞炎症 首次发现GZMK+CD8+ T细胞通过表达CXCR4与分泌CXCL12的成纤维细胞相互作用,独特地通过GZMK而非其他颗粒酶诱导中性粒细胞趋化因子产生 NA 阐明慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞炎症的潜在机制 鼻息肉组织中的免疫细胞和基质细胞 单细胞生物学 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 单细胞分析,空间转录组学,T细胞受体测序 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,T细胞受体序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
154 2025-10-06
COVID-19 progression and convalescence in common variable immunodeficiency patients show dysregulated adaptive immune responses and persistent type I interferon and inflammasome activation
2024-11-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析普通变异型免疫缺陷病(CVID)患者在COVID-19感染前后的免疫反应特征 首次揭示CVID患者在COVID-19康复期仍持续存在I型干扰素特征和炎症小体激活,并发现适应性免疫反应失调的详细机制 样本量有限,未明确完整体液免疫在这些过程中的具体调控机制 研究CVID患者对SARS-CoV-2感染的免疫反应特征和长期影响 普通变异型免疫缺陷病(CVID)患者 免疫学 免疫缺陷病 单细胞RNA测序,光谱流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 CVID患者外周血样本(感染前、感染期间和康复期) NA 单细胞RNA-seq NA NA
155 2025-10-06
A single-cell transcriptomic census of mammalian olfactory epithelium aging
2024-11-18, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析年轻与年老小鼠嗅觉上皮,揭示衰老过程中的细胞和分子变化 首次在单细胞分辨率下系统绘制哺乳动物嗅觉上皮衰老的转录组图谱,识别了21种细胞类型中的衰老相关差异表达基因 研究仅限于小鼠模型,人类嗅觉上皮衰老可能存在物种特异性差异 探究哺乳动物嗅觉上皮衰老的细胞和分子机制 年轻和年老小鼠的嗅觉上皮组织 单细胞组学 衰老相关嗅觉功能障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 年轻和年老小鼠嗅觉上皮样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
156 2025-10-06
Long-Term Follow-up of Levonorgestrel Intrauterine Device for Atypical Hyperplasia and Early Endometrial Cancer Reveals Relapse Characterized by Immune Exhaustion
2024-Nov-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 评估左炔诺孕酮宫内节育器治疗子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌的长期随访结果及复发机制 首次使用空间转录组学分析LIUD治疗过程中免疫微环境变化,揭示复发与免疫耗竭相关 样本量较小(仅5例患者的纵向活检),需更大规模研究验证 探索LIUD治疗AH/G1EEC的长期疗效及复发机制 子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌患者 数字病理学 子宫内膜癌 空间转录组学, 数字空间分析, 细胞类型反卷积分析 MCP-counter分析 组织活检样本 43例初始响应患者(其中41例有随访数据),5例患者纵向活检 Nanostring 空间转录组学 GeoMX数字空间分析系统 Nanostring GeoMX数字空间分析
157 2025-10-06
Endoluminal Biopsy for Vein of Galen Malformation
2024-Nov-01, Neurosurgery IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过血管内组织采样技术对Galen静脉畸形病变进行原位分析,探索其遗传学和发病机制 首次在常规血管内治疗过程中通过线圈获取VOGM原位内皮细胞进行单细胞RNA测序分析 样本量较小(6名患者),需要更大规模研究验证发现 开发VOGM分子遗传学分类系统并探索个性化治疗策略 Galen静脉畸形患者的内皮细胞 单细胞基因组学 脑血管畸形 单细胞RNA测序,遗传分析 NA 单细胞转录组数据,DNA序列数据 6名患者(年龄12天至约6岁),10次ETS操作 NA 单细胞RNA测序 NA NA
158 2025-10-06
Augmenting antitumor efficacy of Th17-derived Th1 cells through IFN-γ-induced type I interferon response network via IRF7
2024-Nov-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了Th17来源的Th1细胞通过IFN-γ诱导的IRF7介导的I型干扰素反应网络增强抗肿瘤效能的机制 首次发现Th1细胞通过ECM1依赖性方式在肿瘤中更快迁移和积累,并阐明IFN-γ通过上调IRF7促进I型干扰素反应网络和ECM1表达的分子机制 Th1细胞表现出早期耗竭表型,其分化机制和抗肿瘤反应尚未完全阐明 探索Th17来源的Th1细胞的分化机制及其在癌症免疫治疗中的抗肿瘤效能 CD4 T细胞亚群,特别是共表达Th1和Th17标志物的T细胞 免疫学 实体恶性肿瘤 单细胞RNA测序,轨迹分析,转录组分析 NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
159 2025-10-06
Monocyte Invasion into the Retina Restricts the Regeneration of Neurons from Müller Glia
2024-Nov-13, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
研究论文 本研究揭示外周免疫系统中的单核细胞通过浸润受损视网膜并分泌骨桥蛋白抑制Müller胶质细胞的神经再生能力 首次发现外周免疫系统(单核细胞)是中枢神经系统再生的屏障,并鉴定出骨桥蛋白是抑制神经再生的关键细胞因子 研究主要基于小鼠模型,在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 探索限制哺乳动物视网膜神经元再生的机制 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞和浸润的单核细胞 神经再生 视网膜疾病 scRNA-seq(单细胞RNA测序) CCR2基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 不同性别的CCR2敲除小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
160 2025-10-07
Lamination-based organoid spatially resolved transcriptomics technique for primary lung and liver organoid characterization
2024-Nov-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究开发了一种基于层压的类器官空间转录组技术,用于表征原代肺和肝脏类器官 开发了新型层压式类器官空间转录组技术,解决了传统切片方法不适用于原代组织来源类器官的技术难题 技术尚未在其他类型类器官中验证,且依赖于自制层压设备 开发适用于原代组织来源类器官的空间转录组表征方法 原代小鼠肺和肝脏来源的类器官 空间转录组学 NA 空间转录组学,液滴工程方法,免疫组织化学 NA 空间转录组数据,图像数据 小鼠肺和肝脏类器官 NA 空间转录组学 自制层压设备 基于重量压缩的自制层压装置,液滴工程方法制备类器官
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