单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 578 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
121	2025-10-06	Controlling human stem cell-derived islet composition using magnetic sorting 2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.11.19.624394 PMID:39605713	研究论文	本研究开发了一种通过磁性分选控制干细胞来源胰岛细胞组成的方法	首次使用基于CD49a标记的磁性激活细胞分选技术来富集功能性β细胞	未提及研究的局限性	改善干细胞来源胰岛的细胞组成和功能，用于1型糖尿病治疗	人类多能干细胞来源的胰岛细胞	细胞生物学	1型糖尿病	磁性激活细胞分选, 单细胞RNA测序, 免疫染色	NA	基因表达数据, 图像数据	未明确说明样本数量	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
122	2025-10-06	The IL-1β inhibitor canakinumab in previously treated lower-risk myelodysplastic syndromes: a phase 2 clinical trial 2024-11-13, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54290-2 PMID:39537648	研究论文	评估IL-1β抑制剂canakinumab在既往治疗过的低危骨髓增生异常综合征患者中的安全性和疗效	首次在人体临床试验中证明IL-1β抑制剂canakinumab可通过抑制TNF介导的炎症信号通路影响造血分化	仅针对遗传复杂性较低的患者有效，样本量较小（25例患者）	评估靶向IL-1β信号通路是否能挽救MDS患者的无效红细胞生成	25例既往治疗过的低危MDS患者（中位年龄74岁，60%男性）	临床医学	骨髓增生异常综合征	单细胞RNA测序	NA	临床数据，基因表达数据	25例MDS患者	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
123	2025-10-06	Reconstructing the regulatory programs underlying the phenotypic plasticity of neural cancers 2024-11-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53954-3 PMID:39516198	研究论文	开发了一种名为scregclust的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据重建细胞调控程序	提出单细胞调控驱动聚类方法，能高效划分基因模块并预测关键转录因子和激酶	对细胞状态调控机制的理解仍有限	研究神经系统癌症的表型可塑性调控程序	成人和儿童脑癌肿瘤样本及发育组织	生物信息学	神经系统癌症	单细胞RNA测序	scregclust算法	单细胞RNA测序数据	15种肿瘤类型的数据	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
124	2025-10-06	Uncovering functional lncRNAs by scRNA-seq with ELATUS 2024-11-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54005-7 PMID:39521797	研究论文	开发名为ELATUS的计算框架，通过单细胞RNA测序数据增强功能性长链非编码RNA的检测能力	结合伪比对工具Kallisto和选择性功能过滤，创建专门针对lncRNAs的单细胞RNA测序分析流程，在参考注释不准确的情况下表现更优	未提及具体样本数量和研究规模，主要关注方法学比较	开发优化单细胞RNA测序数据分析方法，提高功能性长链非编码RNA的检测准确性	长链非编码RNA（lncRNAs）在单细胞水平的表达分析	生物信息学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞多组学测序（single-cell multiome），ATAC-seq	计算框架ELATUS，基于Kallisto伪比对工具	单细胞转录组数据，表观基因组数据	NA	NA	单细胞RNA测序，单细胞多组学测序	NA	NA
125	2025-10-06	Divergent WNT signaling and drug sensitivity profiles within hepatoblastoma tumors and organoids 2024-11-20, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52757-w PMID:39567475	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了肝母细胞瘤的分子异质性和药物敏感性特征	首次在肝母细胞瘤中识别出两种具有不同WNT信号模式的肿瘤上皮亚型，并发现它们对特定靶向药物的敏感性差异	研究样本量有限，需要更大规模的验证研究	表征肝母细胞瘤的分子异质性并识别新的靶向治疗策略	肝母细胞瘤组织和肿瘤来源的类器官	数字病理学	肝母细胞瘤	单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 高通量药物筛选	NA	单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据, 药物反应数据	肝母细胞瘤组织和肿瘤类器官样本	NA	单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学	NA	NA
126	2025-10-06	Molecular profiles, sources and lineage restrictions of stem cells in an annelid regeneration model 2024-11-18, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54041-3 PMID:39557833	研究论文	通过单细胞RNA测序和嵌合转基因技术研究海洋环节动物后部再生过程中的细胞谱系和分子机制	首次结合单细胞RNA测序和新型嵌合转基因技术揭示环节动物再生过程中多种细胞群重新出现干细胞特征	研究仅限于海洋环节动物模型，结论在其他动物门类的普适性仍需验证	探索动物再生能力的分子和细胞机制	海洋环节动物Platynereis dumerilii的后部再生过程	发育生物学	NA	单细胞RNA测序, 嵌合转基因技术	NA	单细胞转录组数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
127	2025-10-06	Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer 2024-11-16, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54364-1 PMID:39550375	研究论文	本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了前列腺癌中club-like细胞与免疫抑制性髓系细胞的相互作用机制	首次在前列腺癌中发现club-like细胞作为上皮细胞亚型在肿瘤微环境中的关键作用，并揭示其与髓源性抑制细胞的关联	研究样本量相对有限，机制研究仍需进一步功能验证	探索前列腺癌治疗抵抗的肿瘤微环境机制	前列腺癌患者肿瘤微环境中的细胞亚群	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序,空间转录组学	NA	转录组数据,空间定位数据	120名患者	NA	单细胞RNA-seq,空间转录组学	NA	NA
128	2025-10-06	GPRC5A promotes lung colonization of esophageal squamous cell carcinoma 2024-11-16, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54251-9 PMID:39550386	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序发现GPRC5A通过调控YAP1信号通路促进食管鳞癌肺转移	首次揭示早期播散癌细胞具有滋养层样'肿瘤植入'表型，并发现GPRC5A/WWP1/LATS1/YAP1这一新的转移调控通路	机制研究仍需进一步验证，临床样本量有限	探索食管鳞癌肺转移的分子机制	食管鳞癌细胞和148例ESCC患者	癌症生物学	食管鳞癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	148例ESCC患者	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
129	2025-10-06	Defective germinal center selection results in persistence of self-reactive B cells from the primary to the secondary repertoire in Primary Antiphospholipid Syndrome 2024-11-15, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54228-8 PMID:39548093	研究论文	通过单细胞多组学技术解析原发性抗磷脂综合征中自身反应性B细胞的起源和存活机制	首次在人类PAPS中系统追踪自身反应性B细胞从初始到记忆和长寿命浆细胞阶段的全过程，揭示其通过缺陷的生发中心选择而持续存在	样本来源仅限于外周血和骨髓，未涉及其他淋巴器官；研究人群为三重阳性PAPS患者，结果可能不适用于所有PAPS亚型	阐明原发性抗磷脂综合征中自身反应性B细胞的起源和存活机制	原发性抗磷脂综合征患者的B细胞	免疫学	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序, B细胞受体谱分析, CITEseq, 单细胞永生化	NA	单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, BCR序列数据	三重阳性PAPS患者的外周血和骨髓样本	NA	单细胞RNA测序, 单细胞多组学	NA	NA
130	2025-10-06	Multi-omics with dynamic network biomarker algorithm prefigures organ-specific metastasis of lung adenocarcinoma 2024-11-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53849-3 PMID:39543109	研究论文	本研究通过动态网络生物标志物算法和多组学数据预测肺腺癌器官特异性转移	首次结合动态网络生物标志物算法、单细胞RNA测序和血清蛋白质组学数据定位肺腺癌转移前状态	研究仅基于两个临床队列，需要更大样本验证	早期检测肺腺癌器官特异性转移	肺腺癌患者原发性病灶和血清样本	生物信息学	肺癌	单细胞RNA测序, 液相色谱-质谱联用	神经网络	单细胞RNA测序数据, 质谱数据	两个临床队列，包含四种主要肺腺癌远处转移类型	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
131	2025-10-06	Dyna-vivo-seq unveils cellular RNA dynamics during acute kidney injury via in vivo metabolic RNA labeling-based scRNA-seq 2024-11-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54202-4 PMID:39543112	研究论文	本研究开发了一种名为Dyna-vivo-seq的新策略，通过体内代谢RNA标记的单细胞RNA测序技术揭示急性肾损伤过程中的细胞RNA动态变化	首次实现了在活体动物中进行基于代谢RNA标记的时间分辨动态转录分析，突破了该技术仅限于体外模型的限制	研究仅在雌性小鼠中进行，未涉及其他性别或物种	开发能够在活体生物单细胞水平表征动态转录组的方法	雌性小鼠急性肾损伤模型中的近端肾小管细胞	单细胞基因组学	急性肾损伤	代谢RNA标记，单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
132	2025-10-06	Spatial transcriptomics reveals substantial heterogeneity in triple-negative breast cancer with potential clinical implications 2024-11-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54145-w PMID:39592577	研究论文	本研究通过空间转录组学技术揭示三阴性乳腺癌的肿瘤异质性及其临床意义	首次系统性地描绘TNBC的空间组织结构，识别出9种空间原型，并发现与免疫治疗反应相关的基因特征	样本量相对有限（92例患者），需要在更大队列中进一步验证	探索三阴性乳腺癌的肿瘤空间结构和微环境特征	92例三阴性乳腺癌患者样本	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学	逐步聚类分析	空间转录组数据、组织形态学数据	92例TNBC患者	NA	空间转录组学	NA	NA
133	2025-10-06	Bacterial single-cell RNA sequencing captures biofilm transcriptional heterogeneity and differential responses to immune pressure 2024-11-24, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54581-8 PMID:39580490	研究论文	本研究开发了一种优化的细菌单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，用于分析金黄色葡萄球菌生物膜生长过程中的转录异质性及免疫细胞暴露后的转录适应	开发了首个针对细菌的单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，能够在单细胞分辨率下探索生物膜动态和免疫压力响应	方法目前主要应用于金黄色葡萄球菌，在其他细菌物种中的适用性有待验证	研究细菌生物膜的转录异质性及其对免疫压力的差异响应	金黄色葡萄球菌生物膜	单细胞测序技术	细菌感染	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	BaSSSh-seq（细菌单细胞RNA测序方法）
134	2025-10-06	Single-cell transcriptomics unveils molecular signatures of neuronal vulnerability in a mouse model of prion disease that overlap with Alzheimer's disease 2024-11-23, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54579-2 PMID:39580485	研究论文	本研究利用单细胞转录组学揭示了朊病毒病小鼠模型中神经元易损性的分子特征及其与阿尔茨海默病的重叠	首次通过单细胞转录组学系统识别朊病毒易损神经元亚群，并发现与阿尔茨海默病共享的易损性相关转录本	研究仅使用雌性小鼠模型，未涉及其他性别或更广泛的神经退行性疾病模型	探究特定神经元对错误折叠蛋白所致功能障碍和死亡更敏感的分子机制	朊病毒感染雌性小鼠的活体神经元	单细胞组学	神经退行性疾病	单细胞转录组测序	NA	单细胞RNA测序数据	朊病毒感染雌性小鼠的神经元样本	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
135	2025-10-06	Immunotherapy that improves response to chemotherapy in high-grade serous ovarian cancer 2024-11-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54295-x PMID:39578450	研究论文	通过单细胞RNA测序分析高级别浆液性卵巢癌中肿瘤浸润免疫细胞，发现可增强新辅助化疗反应的潜在靶点	首次在高级别浆液性卵巢癌中通过单细胞RNA测序鉴定出STAB1和FOXP3作为化疗增敏的免疫治疗靶点，并开发了相应的靶向治疗策略	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探索提高高级别浆液性卵巢癌对新辅助化疗反应的免疫治疗策略	高级别浆液性卵巢癌患者和小鼠模型的肿瘤浸润免疫细胞	单细胞测序分析	卵巢癌	单细胞RNA测序, 体外抑制实验, 反义寡核苷酸技术	NA	单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据	患者样本64,097个细胞，小鼠模型69,781个细胞，使用三种不同的HGSOC同系小鼠模型	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
136	2025-10-06	Lenalidomide-induced pure red cell aplasia is associated with elevated expression of MHC-I molecules on erythrocytes 2024-11-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54571-w PMID:39578482	研究论文	本研究揭示了来那度胺治疗多发性骨髓瘤时诱发纯红细胞再生障碍的机制	首次发现来那度胺通过上调红细胞MHC-I分子表达，激活CD8 T细胞导致红细胞生成障碍	研究基于单个病例，样本量有限，需要更大规模研究验证	探究来那度胺治疗诱发纯红细胞再生障碍的分子机制	多发性骨髓瘤患者骨髓样本	血液肿瘤学	多发性骨髓瘤	单细胞转录组分析，体外功能实验	NA	单细胞RNA测序数据，体外实验数据	1例多发性骨髓瘤患者	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
137	2025-10-06	A developmental biliary lineage program cooperates with Wnt activation to promote cell proliferation in hepatoblastoma 2024-11-20, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53802-4 PMID:39567523	研究论文	本研究通过组织学引导和空间转录组学分析肝母细胞瘤，揭示了胚胎胆道谱系程序与Wnt激活协同促进肿瘤细胞增殖的机制	发现胚胎胆道转录因子SOX4和生长因子FGF19在肝母细胞瘤增殖异质性中的关键作用，揭示了非遗传性表观遗传机制在肿瘤进化中的功能	研究主要基于患者来源的肿瘤类器官模型，需要进一步在体内验证这些发现	探究肝母细胞瘤中组织学和增殖异质性的分子机制	肝母细胞瘤患者肿瘤样本和患者来源的肿瘤类器官	空间转录组学	肝母细胞瘤	组织学引导的空间转录组学	NA	空间转录组数据、组织学图像	肝母细胞瘤患者样本和肿瘤类器官	NA	空间转录组学	NA	NA
138	2025-10-06	Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes 2024-11-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54337-4 PMID:39604360	研究论文	通过单细胞转录组分析发现CD34可作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物	首次发现CD34可作为窦房结起搏细胞的表面标志物，并证明通过CD34分选可富集具有功能起搏表型的细胞	研究主要基于胎儿和干细胞来源的窦房结细胞，未涉及成人原代组织	鉴定人类窦房结起搏细胞的分子标志物	人类胎儿窦房结细胞和人多能干细胞分化的窦房结细胞	单细胞生物学	心血管疾病	单细胞/单核RNA测序	NA	单细胞转录组数据	胎儿和干细胞来源的窦房结细胞	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
139	2025-10-06	Spatially organized tumor-stroma boundary determines the efficacy of immunotherapy in colorectal cancer patients 2024-11-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54710-3 PMID:39592630	研究论文	本研究通过整合空间增强分辨率组学测序等技术，揭示了结直肠癌中肿瘤-基质边界的空间组织与免疫治疗疗效的关联	首次通过空间多组学技术系统解析肿瘤-基质边界的空间组织结构及其在免疫检查点阻断治疗响应中的作用机制	样本量有限，需要更大规模研究验证发现	探究结直肠癌患者对免疫治疗不同响应的肿瘤微环境机制	未经治疗和接受ICB治疗的结直肠癌患者肿瘤样本	数字病理学	结直肠癌	空间增强分辨率组学测序,单细胞RNA测序,多重成像分析	NA	空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,成像数据	未明确具体样本数量	NA	空间转录组学,单细胞RNA-seq	NA	NA
140	2025-10-06	Spatio-temporal transcriptomics of chromothriptic SHH-medulloblastoma identifies multiple genetic clones that resist treatment and drive relapse 2024-11-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54709-w PMID:39609432	研究论文	本研究通过空间转录组学分析染色体碎裂型SHH髓母细胞瘤，揭示了其空间异质性特征和治疗抵抗机制	首次应用空间转录组学技术系统分析染色体碎裂型髓母细胞瘤的空间异质性，识别出多个遗传克隆在治疗抵抗和复发中的作用	样本量相对有限（13例肿瘤和11个PDX样本），需要更大规模研究验证发现	探索染色体碎裂型髓母细胞瘤的分子特征和侵袭性决定因素	染色体碎裂型和非染色体碎裂型髓母细胞瘤患者样本及患者来源异种移植模型	空间转录组学	髓母细胞瘤	空间转录组学	NA	空间转录组数据	13例髓母细胞瘤样本和11个患者来源异种移植样本	NA	空间转录组学	NA	NA