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当前共找到 578 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
Matrisomics: Beyond the extracellular matrix for unveiling tumor microenvironment
2024-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2024.189178
PMID:39241895
|
综述 | 本文系统回顾了肿瘤微环境中基质组的研究进展，涵盖多组学方法和新技术应用 | 首次整合多组学水平（表观基因组学、基因组学、转录组学、蛋白质组学）和新兴测序技术研究肿瘤基质组 | 肿瘤基质组的具体机制和临床应用尚未完全阐明 | 探索肿瘤微环境中基质组的表达模式和功能作用 | 肿瘤组织中的基质组蛋白及其相关基因 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-06 |
Hematopoietic cells emerging from hemogenic endothelium exhibit lineage-specific oxidative stress responses
2024-11, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107815
PMID:39326495
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类胚胎造血过程中不同血细胞谱系对缺氧和氧化应激的特异性反应 | 首次在单细胞水平描述不同造血谱系对缺氧的转录反应，发现红细胞对氧化应激的特殊敏感性及代谢途径差异 | 研究主要基于体外模型，体内验证仍需进一步研究 | 探究缺氧对人类内皮-造血转变及后续造血过程的影响 | 人造血内皮细胞衍生的不同血细胞谱系 | 单细胞生物学 | 血液发育疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
Multi-sample non-negative spatial factorization
2024-Nov-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.01.599554
PMID:39005356
|
研究论文 | 提出多样本非负空间因子分解(mNSF)框架，用于分析多样本空间转录组数据 | 将单样本空间因子分解(NSF)扩展到多样本数据集，无需空间对齐，包含样本特异性空间相关性建模 | 未明确说明具体的数据规模限制和计算复杂度 | 开发多样本空间转录组数据分析方法 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非负空间因子分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
A modified model of PANoptosisto identify prognosis and immunotherapy response in bladder cancer
2024-11, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2024.106672
PMID:39368544
|
研究论文 | 本研究通过构建PANoptosis相关风险模型来识别膀胱癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次将PANoptosis概念应用于膀胱癌研究，并构建了包含五个关键基因的风险评分模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探究PANoptosis相关修饰模式在膀胱癌中的作用机制 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组测序, 单细胞测序 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据, 临床数据 | 膀胱癌患者队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-06 |
Single-Nucleus and Spatial Transcriptomics Revealing Host Response Differences Triggered by Mutated Virus in Severe Dengue
2024-11-15, Viruses
DOI:10.3390/v16111779
PMID:39599894
|
研究论文 | 通过单核和空间转录组技术揭示突变登革热病毒引发严重宿主反应差异的分子机制 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组技术分析突变登革热病毒在肝脏组织中的宿主反应差异，并鉴定出NRG/ErbB信号通路的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究突变登革热病毒引发严重宿主反应的分子机制 | 小鼠肝脏组织（未感染组、轻度感染NGC组、严重感染N10组） | 空间转录组学 | 登革热 | 单核RNA测序, 空间RNA测序, 计算机分子建模分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 小鼠肝脏组织样本（未感染、轻度感染、严重感染三组） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 106 | 2025-10-06 |
Validation of non-destructive morphology-based selection of cerebral cortical organoids by paired morphological and single-cell RNA-seq analyses
2024-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.09.005
PMID:39393360
|
研究论文 | 通过配对形态学和单细胞RNA测序分析验证基于非破坏性形态学的脑皮质类器官筛选方法 | 首次证明非破坏性形态分析可准确区分由脑皮质组织构成的类器官与其他脑组织类器官 | NA | 评估脑类器官分化培养中形成的类器官形态与其细胞组成的关系 | 脑类器官 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 形态学图像,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2025-10-06 |
Lineage-specific dynamics of loss of X upregulation during inactive-X reactivation
2024-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.001
PMID:39486405
|
研究论文 | 本研究探讨了失活X染色体重新激活过程中活性X染色体上调状态的变化规律 | 首次揭示了Xi重新激活与Xa上调状态丢失在不同细胞类型中的非同步性现象 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞数据相对有限 | 探究失活X染色体重新激活过程中活性X染色体上调状态的动态变化 | 小鼠胚胎外胚层、诱导多能干细胞、生殖细胞、胚胎外内胚层干细胞和人类B细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | 基因表达数据 | 多种细胞类型，具体样本数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional analysis of murine norovirus infection in a human intestinal cell line
2024-Nov-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01617-24
PMID:39475272
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探索了鼠诺如病毒在人肠道细胞系中的感染机制和宿主反应 | 建立了表达鼠诺如病毒受体的人肠道细胞系，首次在单细胞分辨率下分析了鼠诺如病毒感染的人细胞宿主反应 | 研究使用的是鼠诺如病毒而非人诺如病毒，且仅在工程化细胞系中进行 | 探索诺如病毒复制的宿主细胞需求及感染机制 | 表达鼠CD300lf受体的人肠道细胞系(mCD300lf-hCaco2)和鼠诺如病毒(MNV) | 单细胞生物学 | 急性胃肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-06 |
PTEN Loss Shapes Macrophage Dynamics in High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3890
PMID:39186679
|
研究论文 | 本研究揭示PTEN缺失通过IL33诱导HMOX1高表达巨噬细胞促进高级别浆液性卵巢癌进展的机制 | 首次发现PTEN缺失通过IL33诱导HMOX1hi巨噬细胞形成，并证明靶向该巨噬细胞可抑制肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩大 | 探索PTEN缺失对高级别浆液性卵巢癌免疫微环境的影响及治疗靶点 | 小鼠模型和人类高级别浆液性卵巢癌样本 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，RNA测序 | NA | 基因表达数据，流式细胞数据 | 小鼠模型和人类HGSC肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-06 |
SpottedPy quantifies relationships between spatial transcriptomic hotspots and uncovers environmental cues of epithelial-mesenchymal plasticity in breast cancer
2024-Nov-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03428-y
PMID:39529126
|
研究论文 | 开发了SpottedPy Python软件包用于识别肿瘤热点并分析癌症生态系统中的空间相互作用 | 开发了首个专门用于识别空间转录组热点和映射空间相互作用的Python工具包 | 未提及具体样本量和验证数据集 | 探索乳腺癌中上皮-间质可塑性的空间关系和环境线索 | 乳腺癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-06 |
Safety and reactogenicity of a controlled human infection model of sand fly-transmitted cutaneous leishmaniasis
2024-Nov, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03146-9
PMID:39095597
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研究论文 | 本研究建立了首个沙蝇传播皮肤利什曼病的受控人类感染模型，评估了其安全性和有效性 | 首次建立沙蝇传播皮肤利什曼病的受控人类感染模型，并提供了人类CL病变中免疫细胞分布和细胞因子/趋化因子表达的全面图谱 | 样本量较小（14名参与者），CL病变和活检程序导致的瘢痕形成明显 | 开发皮肤利什曼病疫苗并建立有效的临床前评估模型 | 健康人类参与者暴露于感染利什曼原虫的沙蝇 | 传染病学 | 皮肤利什曼病 | 空间转录组学，免疫组织化学 | 受控人类感染模型 | 临床数据，分子数据，影像数据 | 14名参与者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 112 | 2024-10-25 |
Spatial Transcriptomics: A New Frontier in Atherosclerosis Research?
2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321652
PMID:39441914
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics unveils skin cell specific antifungal immune responses and IL-1Ra- IL-1R immune evasion strategies of emerging fungal pathogen Candida auris
2024-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012699
PMID:39536069
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示新兴真菌病原体耳念珠菌在皮肤感染中的细胞特异性免疫反应及其IL-1Ra-IL-1R免疫逃逸策略 | 首次利用单细胞转录组学解析耳念珠菌皮肤感染的细胞特异性免疫反应，并发现其通过上调IL-1RN基因表达和独特细胞壁甘露聚糖外层逃逸宿主防御的新机制 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 阐明耳念珠菌在皮肤组织中持续定植的宿主免疫调节因素 | 耳念珠菌感染的小鼠皮肤组织 | 单细胞转录组学 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠皮肤感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2025-10-06 |
Single-cell integration reveals metaplasia in inflammatory gut diseases
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07571-1
PMID:39567783
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研究论文 | 通过整合25个单细胞RNA测序数据集构建了包含160万个细胞的胃肠道细胞图谱，揭示了炎症性肠道疾病中上皮细胞化生的新机制 | 开发了自动化质量控制方法scAutoQC，构建了首个跨越整个健康胃肠道的大规模单细胞参考图谱，发现了肠道炎症疾病中干细胞来源的上皮细胞化生现象 | 研究主要基于已有数据集整合，可能受原始数据质量和批次效应影响 | 系统解析胃肠道在健康和疾病状态下的细胞组成和状态变化 | 人类胃肠道组织和细胞 | 单细胞基因组学 | 炎症性肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 385个样本来自189名健康对照，总计约160万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-10-06 |
A spatial human thymus cell atlas mapped to a continuous tissue axis
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07944-6
PMID:39567784
|
研究论文 | 通过建立胸腺皮质-髓质轴形态学框架，绘制了人类胸腺空间细胞图谱并解析T细胞发育过程 | 建立了定量形态学框架（皮质-髓质轴）并应用于多模态单细胞数据，首次在胎儿发育早期系统描绘胸腺空间组织结构 | 研究主要聚焦于产前和早期产后阶段，未涵盖胸腺完全发育成熟后的完整过程 | 解析人类胸腺微解剖结构及其在T细胞发育过程中的作用机制 | 人类胎儿和早期产后胸腺组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 高分辨率多重成像, 单细胞多组学分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞多组学数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 116 | 2025-10-06 |
A multi-omic atlas of human embryonic skeletal development
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08189-z
PMID:39567793
|
研究论文 | 构建了人类胚胎骨骼发育的多组学图谱，揭示了骨骼形成过程中的细胞状态和调控机制 | 首次通过配对转录组和表观遗传分析结合空间转录组学，建立了人类胚胎骨骼发育的多组学图谱，并开发了ISS-Patcher和SNP2Cell两种新工具 | 研究时间窗口仅限于受孕后5-11周，样本数量有限 | 解析人类胚胎骨骼发育过程中的细胞命运决定机制 | 人类胚胎骨骼组织 | 发育生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞多组学测序, 空间转录组学 | 轨迹分析, 调控网络分析 | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 约336,000个细胞核 | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-06 |
Multi-site Ultrasound-guided Fine Needle Aspiration to Study Cells and Soluble Factors From Human Lymph Nodes
2024-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70063
PMID:39579041
|
研究论文 | 介绍应用超声引导细针穿刺技术从人类淋巴结采集样本的方法 | 采用多部位超声引导细针穿刺技术同时获取淋巴结免疫细胞和无细胞材料 | NA | 开发人类淋巴结采样技术以研究免疫反应和神经免疫疾病 | 人类头颈部宫颈淋巴结 | 数字病理学 | 神经免疫疾病 | 超声引导细针穿刺, 单细胞转录组测序, 流式细胞术, 蛋白质组学 | NA | 细胞样本, 无细胞上清液 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-06 |
A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06806-x
PMID:38057666
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学构建人类胚胎肢体发育的时空细胞图谱 | 首次在人类胚胎肢体发育中鉴定出多个新细胞群体，发现肌肉发育的两个不同阶段波次，并揭示关键转录抑制因子MSC | 研究主要基于转录组数据，功能验证实验相对有限 | 深入解析人类胚胎肢体发育的细胞多样性和时空动态变化 | 人类和小鼠胚胎肢体组织 | 空间转录组学 | 先天性肢体畸形 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 多个人类胚胎肢体样本和小鼠胚胎肢体样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | 使用VisiumStitcher整合多个解剖连续的空间转录组样本 |
| 119 | 2025-10-06 |
HiDDEN: a machine learning method for detection of disease-relevant populations in case-control single-cell transcriptomics data
2024-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53666-8
PMID:39487129
|
研究论文 | 提出一种名为HiDDEN的机器学习方法，用于在病例对照单细胞转录组数据中检测疾病相关细胞群体 | 开发了能够细化病例对照标签以准确反映每个细胞扰动状态的计算方法，解决了标准分析方法在受影响细胞比例小或扰动强度弱时的局限性 | 方法验证主要基于模拟数据集和有限的实际应用案例，需要更多真实世界数据的进一步验证 | 检测病例对照单细胞转录组数据中细微的转录变化和疾病相关细胞群体 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤，脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习方法 | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集、人类多发性骨髓瘤前体条件数据集、小鼠脱髓鞘模型数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2025-10-06 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces immunosuppression in human cancer by impairing bioenergetics and ribosome biogenesis in immune cells
2024-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53706-3
PMID:39487111
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前列腺素E2通过EP2/EP4受体信号通路损害肿瘤浸润免疫细胞的生物能量和核糖体生物合成，导致免疫抑制的机制 | 首次在人类癌症中系统阐明PGE2-EP2/EP4信号通路通过下调c-Myc和PGC-1，损害免疫细胞的氧化磷酸化、糖酵解和核糖体蛋白合成，从而抑制抗肿瘤免疫的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在更多人类癌症类型中验证；机制研究尚未完全揭示所有下游信号通路 | 探究前列腺素E2在肿瘤微环境中诱导免疫抑制的具体分子机制 | 人类癌症和雌性小鼠同系肿瘤中浸润的免疫细胞，包括CD8 T细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类癌症和雌性小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |