单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 658 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-12-08 |
Matrix glycosaminoglycans and proteoglycans in human cornea organoids and similarities with fetal corneal stages
2024-Nov-28, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.11.007
PMID:39615587
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析，比较了人角膜类器官与胎儿角膜发育阶段的相似性 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析，评估了人角膜类器官的成熟度，并发现其与胎儿角膜发育阶段的相似性 | 研究仅限于两个iPSC系，且未探讨类器官成熟度的优化方法 | 评估人角膜类器官的成熟度及其与胎儿角膜发育阶段的相似性 | 人角膜类器官及其与胎儿角膜的比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | RNA | 两个iPSC系（IMR90.4和NCRM-1）生成的人角膜类器官及不同发育阶段的胎儿角膜样本 |
| 82 | 2024-12-08 |
Controlling human stem cell-derived islet composition using magnetic sorting
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.19.624394
PMID:39605713
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研究论文 | 研究通过磁性细胞分选技术控制人干细胞衍生的胰岛细胞组成 | 开发了一种磁性激活细胞分选（MACS）协议，用于富集与功能性胰岛素产生β细胞相关的CD49a标记的干细胞衍生的胰岛细胞 | NA | 提高干细胞衍生的胰岛细胞中β细胞的比例和功能，以改善1型糖尿病的治疗效果 | 人多能干细胞衍生的胰岛细胞 | NA | 1型糖尿病 | 磁性激活细胞分选（MACS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从人多能干细胞衍生的胰岛细胞，包括CD49a富集、CD49a耗竭和未分选的胰岛细胞 |
| 83 | 2024-12-07 |
Single-cell analysis of human peripheral blood reveals high immune response activity in successful ageing individuals
2024-Nov-30, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2024.112011
PMID:39622417
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析人类外周血中的免疫细胞，揭示了长寿个体（百岁老人和超级百岁老人）中免疫系统的重塑机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了百岁老人和超级百岁老人中免疫系统的动态调节机制，并发现了与健康衰老相关的免疫重塑标志物 | 研究样本量较小，且仅限于外周血单核细胞，可能无法全面反映整个免疫系统的变化 | 探讨长寿个体中免疫系统的动态调节机制及其分子基础 | 百岁老人、超级百岁老人和老年对照组的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 87,215个外周血单核细胞，来自7名超级百岁老人、3名百岁老人和4名老年对照组 |
| 84 | 2024-12-07 |
Mechanistic study of the regulation of mitochondrial function by the GPNMB/Nrf2/NF-κB signaling pathway mediated by Quzhi Tang to alleviate chondrocyte senescence
2024-Nov-29, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2024.119165
PMID:39617085
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研究论文 | 研究了曲志汤通过GPNMB/Nrf2/NF-κB信号通路调节线粒体功能以减轻软骨细胞衰老的机制 | 首次揭示了曲志汤通过调节GPNMB/Nrf2/NF-κB信号通路来修复线粒体损伤并减轻软骨细胞衰老 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性需进一步验证 | 探讨曲志汤治疗膝骨关节炎的潜在药物机制 | 软骨细胞衰老及相关信号通路 | NA | 骨关节炎 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠软骨组织样本 |
| 85 | 2024-12-07 |
Qingfei Yin alleviates Streptococcus pneumoniae pneumonia by promoting complete autophagy to suppress necroptosis
2024-Nov-29, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156280
PMID:39637472
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研究论文 | 研究清肺饮通过促进完全自噬抑制坏死性凋亡来缓解肺炎链球菌肺炎的机制 | 首次揭示了清肺饮通过下调p62表达促进完全自噬，从而减轻肺炎链球菌诱导的肺上皮细胞坏死性凋亡 | 仅在动物模型和细胞实验中验证了清肺饮的作用机制，尚未进行临床试验 | 探讨清肺饮治疗肺炎链球菌肺炎的机制 | 肺炎链球菌诱导的肺炎及肺上皮细胞 | NA | 肺炎 | 单细胞转录组学、HE染色、免疫荧光、AO染色、PI染色、Western blot | NA | 细胞、组织 | 113,353个细胞、小鼠模型、TC-1细胞模型 |
| 86 | 2024-12-07 |
Alpha-2-macroglobulin mitigates glucocorticoid-induced osteonecrosis via Keap1/Nrf2 pathway activation
2024-Nov-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究探讨了α-2-巨球蛋白通过激活Keap1/Nrf2信号通路减轻糖皮质激素诱导的股骨头坏死的作用 | 首次揭示了α-2-巨球蛋白在糖皮质激素诱导的股骨头坏死中的作用及其通过Keap1/Nrf2通路减轻症状的机制 | 研究主要基于动物模型和患者样本的转录组和蛋白质组分析，缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨α-2-巨球蛋白在糖皮质激素诱导的股骨头坏死中的作用及其机制 | 糖皮质激素诱导的股骨头坏死及其相关生物标志物 | NA | 股骨头坏死 | 转录组分析、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 患者样本和糖皮质激素诱导的股骨头坏死大鼠模型 |
| 87 | 2024-12-07 |
Taurine ameliorates radiation-induced oxidative stress in bone marrow mesenchymal stromal cells and promotes osteogenesis
2024-Nov-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究探讨了牛磺酸对辐射诱导的骨髓间充质干细胞氧化应激的影响及其促进成骨的作用 | 首次揭示了牛磺酸代谢在辐射后下颌骨间充质细胞中的激活，并通过补充牛磺酸显著改善了辐射小鼠的生存率和下颌骨成骨 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨牛磺酸在辐射诱导的下颌骨坏死中的作用及其潜在的治疗价值 | 骨髓间充质干细胞和辐射小鼠 | NA | NA | scRNA-Seq 和代谢组学 | NA | NA | 辐射和未辐射的骨髓间充质干细胞，以及辐射和未辐射的小鼠 |
| 88 | 2024-12-07 |
[Revealing research progress for immunological characteristics of chronic hepatitis B applying single-cell RNA sequencing technology]
2024-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在慢性乙型肝炎免疫特征研究中的进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示慢性乙型肝炎中免疫细胞转录组微小变化，为探索免疫发病机制和潜在治疗靶点提供技术支持 | NA | 探讨慢性乙型肝炎的免疫机制和潜在治疗靶点 | 慢性乙型肝炎患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 89 | 2024-12-07 |
Safety and reactogenicity of a controlled human infection model of sand fly-transmitted cutaneous leishmaniasis
2024-Nov, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03146-9
PMID:39095597
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研究论文 | 研究建立了一种通过沙蝇传播的利什曼原虫皮肤病的受控人类感染模型，以促进疫苗开发 | 首次提供了人类利什曼原虫皮肤病变的免疫细胞分布和细胞因子/趋化因子表达的综合图谱 | 研究样本量较小，且存在疤痕形成的风险 | 建立受控人类感染模型以促进利什曼原虫皮肤病疫苗的开发 | 利什曼原虫皮肤病变的免疫反应和病理机制 | NA | 利什曼病 | 免疫组织化学和空间转录组学 | NA | 免疫细胞分布和细胞因子/趋化因子表达 | 14名参与者 |
| 90 | 2024-12-07 |
Proinflammatory immune cells disrupt angiogenesis and promote germinal matrix hemorrhage in prenatal human brain
2024-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01769-2
PMID:39349662
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研究论文 | 研究揭示了在胎儿期人脑中，促炎性免疫细胞如何破坏血管生成并促进脑室周围出血 | 首次展示了微胶质细胞在胎儿期鼠和人脑中与新生血管的相互作用，并发现这些细胞的缺失减少了血管生成，同时揭示了GMH婴儿中CD45细胞的促炎性因子如何破坏血管完整性 | 研究主要基于小鼠模型和少量早产儿样本，可能无法完全反映人类情况 | 探讨脑室周围出血的原因及其与免疫细胞的关系 | 胎儿期鼠和人脑中的微胶质细胞及早产儿的CD45细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学和流式细胞术 | NA | 细胞 | 少量早产儿样本 |
| 91 | 2024-12-06 |
A Roadmap for Selecting and Utilizing Optimal Features in scRNA Sequencing Data Analysis for Stem Cell Research: A Comprehensive Review
2024-Nov-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23170
PMID:38531607
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在干细胞研究中的应用，并讨论了选择和利用最佳特征的路线图 | 本文提供了对scRNA-seq分析工具的详细概述和分类，基于对2,733篇科学出版物的回顾 | NA | 为使用scRNA-seq研究干细胞的生物信息学家和生物学家提供实用建议 | 干细胞及其产生的细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 2,733篇科学出版物和1,400种分析工具 |
| 92 | 2024-12-06 |
PIEZO-dependent mechanosensing is essential for intestinal stem cell fate decision and maintenance
2024-Nov-29, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adj7615
PMID:39607940
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研究论文 | 研究探讨了PIEZO机械敏感通道在小肠干细胞（ISC）微环境中的作用及其对ISC命运决定和维持的影响 | 首次揭示了PIEZO通道在ISC微环境中感知机械信号并调节ISC功能的机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探讨机械信号在小肠干细胞命运决定和维持中的作用 | 小肠干细胞及其微环境中的机械信号感知 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 |
| 93 | 2024-12-06 |
An analysis of single-cell data reveals therapeutic effects of AMG487 in experimental autoimmune uveitis
2024-Nov-28, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2024.116671
PMID:39615601
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了AMG487在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的治疗效果 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了AMG487在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 研究仅限于实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型，需进一步验证在人类患者中的效果 | 探讨AMG487在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗效果及其机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及Vogt-Koyanagi-Harada患者的外周血和淋巴结 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞转座酶可及染色质测序和RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及Vogt-Koyanagi-Harada患者的外周血和淋巴结样本 |
| 94 | 2024-12-06 |
A platform for multimodal in vivo pooled genetic screens reveals regulators of liver function
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.18.624217
PMID:39605605
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研究论文 | 开发了一种结合成像和测序的方法，用于构建大规模的多模态基因型-表型图谱，以研究肝脏功能相关的基因调控 | 首次将成像和单细胞测序结合，用于大规模多模态基因型-表型图谱的构建，并应用于小鼠肝脏的研究 | NA | 揭示肝脏功能调控的基因基础 | 小鼠肝脏中的数百个基因扰动 | 数字病理学 | NA | 成像和单细胞测序 | NA | 图像和基因表达数据 | 数百个基因扰动 |
| 95 | 2024-12-06 |
Mixed Effects Deep Learning for the interpretable analysis of single cell RNA sequencing data by quantifying and visualizing batch effects
2024-Nov-13, ArXiv
PMID:39606715
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研究论文 | 提出了一种混合效应深度学习（MEDL）自编码器框架，用于解释单细胞RNA测序数据中的批次效应，并通过量化和可视化批次效应来增强解释性 | 通过分离批次不变（固定效应）和批次特定（随机效应）组件，保留了批次特定的信息，从而提高了分类准确性并增强了可视化效果 | NA | 开发一种新的深度学习框架，用于解释单细胞RNA测序数据中的批次效应，并提高预测准确性 | 单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 机器学习 | 心血管疾病, 自闭症谱系障碍, 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 三个数据集，包括健康心脏数据集（147个批次）、自闭症谱系障碍数据集和急性髓系白血病数据集 |
| 96 | 2024-12-06 |
A prenatal skin atlas reveals immune regulation of human skin morphogenesis
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08002-x
PMID:39415002
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研究论文 | 本文构建了一个全面的产前人类皮肤多组学参考图谱，结合单细胞和空间转录组学数据，揭示了免疫细胞在皮肤形态发生中的作用 | 首次系统性地展示了免疫细胞在皮肤形态发生中的关键作用，并通过皮肤器官模型验证了这一发现 | 皮肤器官模型缺乏免疫细胞，导致内皮细胞异质性和数量显著减少 | 研究免疫细胞在人类皮肤形态发生中的作用 | 产前人类皮肤（7-17周）及其相关细胞类型 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 产前人类皮肤样本（7-17周）、皮肤器官模型（源自人类胚胎干细胞和诱导多能干细胞） |
| 97 | 2024-12-06 |
Longitudinal analysis of genetic and epigenetic changes in human pluripotent stem cells in the landscape of culture-induced abnormality
2024-Nov, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01334-8
PMID:39482531
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研究论文 | 研究了人类多能干细胞在体外培养过程中基因和表观遗传变化的长程分析 | 首次综合分析了基因组、单细胞转录组和单细胞ATAC-seq数据，揭示了20q11.21拷贝数增加和表观遗传变化对表达'培养适应表型'的必要性 | 研究仅限于一个同基因的人类胚胎干细胞模型，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨人类多能干细胞在体外培养过程中基因和表观遗传变化及其对细胞表型的影响 | 人类胚胎干细胞及其在体外培养过程中的基因和表观遗传变化 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 一个同基因的人类胚胎干细胞模型 |
| 98 | 2024-12-06 |
Neoadjuvant nivolumab or nivolumab plus ipilimumab in early-stage triple-negative breast cancer: a phase 2 adaptive trial
2024-Nov, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03249-3
PMID:39284953
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研究论文 | 研究了早期三阴性乳腺癌患者在术前使用尼伏鲁单抗或尼伏鲁单抗联合伊匹单抗的免疫治疗效果 | 探索了在没有化疗的情况下，使用免疫检查点抑制剂（ICI）联合治疗早期三阴性乳腺癌患者的潜在疗效 | 研究样本量较小，且观察到的副作用较多，特别是免疫介导的内分泌疾病 | 评估早期三阴性乳腺癌患者在术前使用免疫治疗的效果，并探讨其潜在的临床应用 | 早期三阴性乳腺癌患者 | NA | 乳腺癌 | 免疫检查点抑制剂（ICI） | NA | 单细胞RNA测序 | 45名患者（每个队列15名） |
| 99 | 2024-12-06 |
Single-cell integration reveals metaplasia in inflammatory gut diseases
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07571-1
PMID:39567783
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研究论文 | 本文通过整合25个单细胞RNA测序数据集，揭示了炎症性肠道疾病中的化生现象 | 开发了新的自动化质量控制方法scAutoQC，并构建了包含约110万个细胞的健康参考图谱，揭示了肠道炎症疾病中干细胞来源的化生细胞与免疫细胞的相互作用 | NA | 研究肠道炎症疾病中的化生现象及其对组织结构和炎症的影响 | 健康和疾病状态下的胃肠道组织细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 385个样本，包括189名健康对照和12个疾病数据集 |
| 100 | 2024-12-06 |
A spatial human thymus cell atlas mapped to a continuous tissue axis
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07944-6
PMID:39567784
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞图谱、空间转录组学和高分辨率多重成像数据，建立了人类胸腺细胞的空间图谱，并分析了胸腺皮质-髓质轴的微解剖基础 | 本文首次在胎儿发育的第二孕期开始时，展示了小叶细胞因子网络的建立、胸腺细胞的典型轨迹以及胸腺上皮细胞的分布，并识别了胸腺上皮细胞祖细胞的组织生态位及与哈塞尔小体相关的不同亚型 | NA | 研究人类胸腺细胞在胎儿和早期新生儿阶段的发育过程及其微解剖基础 | 胸腺细胞、胸腺上皮细胞及其在胸腺皮质-髓质轴中的分布和发育轨迹 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、高分辨率多重成像 | NA | 单细胞数据、图像数据 | NA |