单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
641	2024-09-22	Bulk and single-cell RNA sequencing analyses coupled with multiple machine learning to develop a glycosyltransferase associated signature in colorectal cancer 2024-Nov, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102093 PMID:39217850	研究论文	本研究旨在通过批量和单细胞RNA测序分析结合多种机器学习方法，开发结直肠癌中与糖基转移酶相关的风险特征	本研究创新性地开发了一种基于糖基转移酶的预测模型，用于预测结直肠癌患者对免疫治疗的反应	NA	识别结直肠癌中的关键糖基转移酶，并建立一个基于糖基转移酶的稳健预后特征	结直肠癌患者及其糖基转移酶相关基因	机器学习	结直肠癌	RNA测序	机器学习模型	RNA数据	NA
642	2024-09-19	Single-cell RNA sequencing reveals a distinct profile of bone immune microenvironment and decreased osteoclast differentiation in type 2 diabetic mice 2024-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2023.101145 PMID:39281831	研究论文	研究揭示了2型糖尿病小鼠骨髓细胞的单细胞转录组特征，并发现其骨免疫微环境的变化和破骨细胞分化的减少	首次详细描绘了2型糖尿病小鼠骨髓细胞的全局转录组图谱，揭示了骨免疫微环境在基因水平上的独特变化	NA	探讨2型糖尿病对骨组织的影响及其细胞和分子机制	2型糖尿病小鼠的骨髓细胞	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	野生型和2型糖尿病小鼠的骨髓细胞
643	2024-09-19	Gene interactions analysis of brain spatial transcriptome for Alzheimer's disease 2024-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101337 PMID:39281834	研究论文	本研究分析了阿尔茨海默病（AD）大脑空间转录组中的基因相互作用，揭示了不同空间区域和病理状态下基因关联的动态变化	首次基于空间转录组学识别了淀粉样β积累过程中多种基因关联，为从新视角揭示AD病因奠定了基础	NA	揭示阿尔茨海默病大脑中基因相互作用的动态变化	小鼠和人类大脑的空间转录组数据	数字病理学	阿尔茨海默病	空间转录组学	NA	转录组数据	使用了敲入AD和野生型小鼠模型以及不同AD小鼠模型和人类单核RNA-seq数据/AlzData数据库的数据
644	2024-09-17	Targeting CNS myeloid infiltrates provides neuroprotection in a progressive multiple sclerosis model 2024-Nov, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2024.08.032 PMID:39179123	研究论文	研究通过靶向中枢神经系统（CNS）中的髓系浸润细胞，提供了一种在渐进性多发性硬化症模型中的神经保护策略	首次展示了通过调节CNS髓系细胞的毒性来减少不可逆组织损伤，并提出了一种新的疾病修饰方法	研究仅在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型中进行，尚未在临床试验中验证	探讨靶向CNS髓系细胞是否能预防慢性免疫介导的脱髓鞘疾病的不可逆组织损伤	实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型中的髓系细胞和神经保护效果	神经科学	多发性硬化症	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	Biozzi小鼠模型中的脊髓CD11b+细胞
645	2024-09-15	Spatial transcriptomics in pancreatic cancer: Advances, prospects and challenges 2024-Nov, Critical reviews in oncology/hematology DOI:10.1016/j.critrevonc.2024.104430 PMID:38942220	综述	本文综述了空间转录组学在胰腺癌研究中的进展、前景和挑战	空间转录组学技术整合了细胞位置和全转录表达信息，提供了对胰腺癌微环境中细胞亚型时空变化的详细观察	空间转录组学技术在胰腺癌中的临床应用场景和技术局限性仍需进一步探索	探讨空间转录组学在胰腺癌研究中的应用及其对肿瘤异质性和免疫微环境的理解	胰腺癌中的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞	数字病理学	胰腺癌	空间转录组学	NA	转录组数据	NA
646	2024-09-15	A prognostic biomarker of disulfidptosis constructed by machine learning framework model as potential reporters of pancreatic adenocarcinoma 2024-Nov, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111371 PMID:39209222	研究论文	本文通过机器学习框架模型构建了与胰腺腺癌相关的硫化物死亡的预后生物标志物	首次将硫化物死亡与胰腺腺癌的机制和免疫浸润模式联系起来，并构建了相关的预后模型	研究样本量较小，仅基于GSE154778 scRNA-seq数据集的16个样本进行分析	探索胰腺腺癌的机制和免疫浸润模式，并构建相关的预后生物标志物	胰腺腺癌患者的硫化物死亡相关基因和免疫浸润模式	数字病理学	胰腺癌	LASSO回归	LASSO回归模型	单细胞RNA测序数据	16个胰腺腺癌样本
647	2024-09-11	SLC2A1 boosts the resistance of non-small cell lung cancer to taxanes by stimulating the formation of EPCAM+ cancer stem-like cells via glycolysis 2024-Nov, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102082 PMID:39126936	研究论文	研究SLC2A1通过激活糖酵解促进EPCAM+癌症干细胞样细胞的形成，从而增强非小细胞肺癌对紫杉烷类药物的耐药性	揭示了SLC2A1在非小细胞肺癌中通过激活糖酵解促进癌症干细胞样细胞形成的新机制	研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证	探讨SLC2A1在非小细胞肺癌对紫杉烷类药物耐药性中的作用机制	非小细胞肺癌细胞、SLC2A1表达、癌症干细胞样细胞	数字病理学	肺癌	流式细胞术、代谢组学、单细胞测序、细胞通讯分析	NA	细胞	涉及多个数据集和内部收集的样本
648	2024-09-11	GTF2H5 Identified as a crucial synthetic lethal target to counteract chemoresistance in colorectal cancer 2024-Nov, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102097 PMID:39173480	研究论文	本文研究了合成致死基因GTF2H5在结直肠癌化疗耐药中的作用，并探讨了其在克服化疗耐药中的潜在治疗靶点	首次识别GTF2H5为结直肠癌化疗耐药的关键合成致死靶点	实验验证仅初步，需进一步深入研究GTF2H5在化疗耐药中的具体机制	探讨合成致死基因在结直肠癌化疗耐药中的作用，寻找新的治疗靶点	结直肠癌患者及其化疗耐药相关基因	癌症研究	结直肠癌	RNA测序	NA	RNA测序数据	来自UCSC和GEO数据库的结直肠癌患者数据，以及来自Tumor Immunology Single Cell Center数据库的单细胞RNA测序数据
649	2024-09-08	Identification of feature genes and molecular mechanisms involved in cell communication in uveal melanoma through analysis of single‑cell sequencing data 2024-Nov, Oncology letters IF:2.5Q3 DOI:10.3892/ol.2024.14636 PMID:39233824	研究论文	本研究通过分析单细胞测序数据，识别了葡萄膜黑色素瘤中的特征基因及其在细胞通讯中的分子机制	本研究发现了葡萄膜黑色素瘤中新的关键基因，并揭示了这些基因在血管发育、粘附连接和细胞粘附分子结合等通路中的显著富集	本研究主要依赖于公共数据库的数据，未进行体内实验验证	识别葡萄膜黑色素瘤中的特征基因及其在细胞通讯中的分子机制	葡萄膜黑色素瘤中的特征基因及其在细胞通讯中的作用	数字病理学	葡萄膜黑色素瘤	单细胞测序	随机生存森林算法	RNA测序数据	13个单细胞样本亚型
650	2024-09-05	Single-cell spatial transcriptomics in cardiovascular development, disease, and medicine 2024-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2023.101163 PMID:39224111	研究论文	本文介绍了单细胞空间转录组学在心血管发育、疾病和医学中的应用，并强调了其在心血管研究中的最新进展。	结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，提供了对心血管疾病发病机制的多维度、多层次、多视角和动态的理解。	NA	探讨单细胞空间转录组学技术在心血管疾病风险分层和个体化治疗中的应用。	心血管疾病的发病机制、细胞间相互作用以及疾病进展的时空特征。	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	转录组数据	NA
651	2024-09-04	Liquid Biopsy for Proliferative Diabetic Retinopathy: Single-Cell Transcriptomics of Human Vitreous Reveals Inflammatory T-Cell Signature 2024 Nov-Dec, Ophthalmology science IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.xops.2024.100539 PMID:39220810	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了增生性糖尿病视网膜病变（PDR）患者玻璃体中的炎症T细胞特征。	首次在疾病状态下对人类玻璃体进行单细胞转录组学表征，展示了PDR玻璃体主要由T细胞组成，其活性和比例与外周血中的T细胞不同，且玻璃体中几乎没有中性粒细胞。	NA	旨在通过阐明PDR患者玻璃体的单细胞景观，识别可靶向的细胞类型和相应的信号通路。	增生性糖尿病视网膜病变（PDR）患者的玻璃体和外周血。	数字病理学	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组	5名成年患者的6只眼睛的玻璃体细胞和外周血单个核细胞（PBMCs）。
652	2024-08-31	Personalized composite scaffolds for accelerated cell- and growth factor-free craniofacial bone regeneration 2024-Nov, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.029 PMID:39188380	研究论文	本文介绍了一种用于加速颅面骨再生的个性化复合支架系统，该系统采用3D打印技术制造，包含多孔聚二醇柠檬酸-羟基磷灰石复合弹性体和聚二醇柠檬酸-石墨烯氧化物水凝胶复合物。	该支架系统通过材料中心的设计，无需细胞和生长因子即可促进骨再生，具有简化的制造过程和临床转化优势。	NA	开发一种新型的复合支架系统，用于加速颅面骨的再生。	颅面骨的再生	生物材料	骨骼疾病	3D打印	NA	NA	NA
653	2024-08-29	RNA-binding protein AZGP1 inhibits epithelial cell proliferation by regulating the genes of alternative splicing in COPD 2024-Nov-15, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148736 PMID:38950687	研究论文	研究探讨了RNA结合蛋白AZGP1通过调控选择性剪接基因在慢性阻塞性肺疾病（COPD）中抑制上皮细胞增殖的作用	首次揭示了AZGP1在COPD中通过调控选择性剪接事件影响上皮细胞增殖和粘附的新机制	研究主要基于单细胞转录组测序和批量RNA测序数据，未进行体内外实验验证	探究RNA结合蛋白在COPD中的作用及其对上皮细胞增殖的调控机制	RNA结合蛋白AZGP1及其在COPD中的表达和功能	数字病理学	慢性阻塞性肺疾病	单细胞转录组测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	使用了两组数据集：GSE173896（单细胞RNA测序）和GSE124180（批量RNA测序）
654	2024-08-17	Non-invasive determination of gene expression in placental tissue using maternal plasma cell-free DNA fragmentation characters 2024-Nov-30, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148789 PMID:39047956	研究论文	本文介绍了一种通过母体血浆中游离DNA片段特征非侵入性地确定胎盘组织基因表达的方法	开发了一种基于母体血浆游离DNA片段特征的非侵入性方法来预测胎盘基因表达	目前无法实时获取胎盘基因表达	克服无法实时获取胎盘基因表达的限制，并改进对胎盘源性妊娠综合征的非侵入性预测研究	孕妇的外周血和胎盘样本	数字病理学	妊娠综合征	深度测序	深度神经网络	DNA序列	从五名孕妇中获得了超过2000万条深度测序的游离DNA读取数据，以及32,401个单细胞表达谱和156,546个胎盘组织的单细胞表达谱
655	2024-08-14	Tailored endothelialization enabled by engineered endothelial cell vesicles accelerates remodeling of small-diameter vascular grafts 2024-Nov, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.006 PMID:39131628	研究论文	本文通过应用工程化内皮细胞囊泡来伪装血管移植物，以增强血管重塑，从而创建具有定制化内皮化的微小直径血管移植物（SDVG）。	本文创新性地通过代谢糖工程将叠氮基团修饰的工程化内皮细胞囊泡（ECVs-N）精确连接到PCL-DBCO制成的血管移植物上，形成ECVG，有助于抑制血小板粘附和激活，促进内皮细胞粘附并增强抗炎作用。	NA	研究目的是通过工程化内皮细胞囊泡实现微小直径血管移植物的定制化内皮化，以克服传统血管移植物的局限性。	研究对象是微小直径血管移植物（SDVG）及其内皮化过程。	生物工程	心血管疾病	代谢糖工程，点击化学	NA	单细胞转录组数据	具体样本数量未在摘要中提及
656	2024-08-05	Integrated analysis of ferroptosis and stemness based on single-cell and bulk RNA-sequencing data provide insights into the prognosis and treatment of esophageal carcinoma 2024-Nov-15, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148701 PMID:38885819	研究论文	本研究基于单细胞和大规模RNA测序数据，探讨了铁死亡与干性在食管癌预后和治疗中的作用	构建了一个新颖的与铁死亡相关的干性标记，并识别了两个在食管癌中的标记基因	缺乏对铁死亡相关基因与干性标志物在ESCA预后中的联合作用的深入研究	探讨铁死亡及干细胞特征对食管癌患者预后和治疗的影响	未治疗的食管癌样本中的干细胞与血流动力学相关基因	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	机器学习算法	RNA测序数据	18个未治疗的食管癌样本
657	2024-08-05	Dissection of molecular mechanisms of liver injury induced by microcystin-leucine arginine via single-cell RNA-sequencing 2024-Nov, Journal of environmental sciences (China) DOI:10.1016/j.jes.2023.08.032 PMID:38844317	研究论文	这篇文章探讨了微囊藻毒素-亮氨酸精氨酸（MC-LR）引起的肝损伤的分子机制	首次建立了小鼠肝脏对MC-LR反应的单细胞图谱，提供了对MC-LR诱导肝毒性的深入见解	文章未提及具体的样本量和可重复性等限制	研究微囊藻毒素MC-LR引起的肝毒性分子机制	以小鼠为研究对象，分析MC-LR诱导的肝脏损伤	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	小鼠的肝脏样本
658	2024-08-05	Single-cell RNA sequencing analysis of the retina under acute high intraocular pressure 2024-Nov-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/1673-5374.389363 PMID:38526288	研究论文	本文分析了在急性高眼压下视网膜的单细胞RNA测序特征	首次揭示了高眼压下视网膜的分子变化和细胞间相互作用	未提及具体限制	探讨高眼压引起的视网膜损伤的分子机制	视网膜细胞，特别是视网膜神经节细胞	数字病理学	青光眼	单细胞RNA测序	NA	细胞基因表达数据	建立了急性高眼压的大鼠模型