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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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581 | 2024-11-06 |
The study of Alzheimer's disease risk diagnosis based on natural killer cell marker genes in the multi-omics data
2024-Nov-03, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877241295316
PMID:39497294
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研究论文 | 研究基于自然杀伤细胞标记基因的多组学数据进行阿尔茨海默病风险诊断 | 提出了一种新的特征选择算法ADGCN,并基于17个特征基因构建了诊断模型 | NA | 识别与阿尔茨海默病相关的特征基因,构建诊断模型并探索其潜在的生物学机制 | 自然杀伤细胞标记基因 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | ADGCN-XGBoost | 多组学数据 | NA |
582 | 2024-11-06 |
Single-cell transcriptomics reveals IRF7 regulation of the tumor microenvironment in isocitrate dehydrogenase wild-type glioma
2024-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.754
PMID:39492838
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组测序分析了IDH突变型和野生型胶质瘤患者的细胞亚群基因表达调控网络,揭示了IRF7在IDH野生型胶质瘤微环境中的调控作用 | 首次系统地建立了IDH转录活性在胶质瘤中的单细胞水平调控机制,并绘制了相应的细胞图谱 | NA | 探讨IDH突变型和野生型胶质瘤的基因表达调控网络及其在肿瘤微环境中的作用 | IDH突变型和野生型胶质瘤患者的细胞亚群 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | 机器学习模型 | RNA | IDH突变型和野生型胶质瘤患者 |
583 | 2024-11-04 |
Deciphering craniopharyngioma subtypes: Single-cell analysis of tumor microenvironment and immune networks
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111068
PMID:39483146
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了颅咽管瘤(包括成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型)的肿瘤微环境和免疫网络 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型颅咽管瘤的细胞组成、肿瘤组织多样性和细胞间相互作用 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示颅咽管瘤的细胞组成和免疫网络 | 成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型颅咽管瘤 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
584 | 2024-11-04 |
From metabolomics to therapeutics: identifying causal metabolites and potential drugs for the treatment of osteoarthritis
2024-Nov-03, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-024-01594-w
PMID:39488818
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研究论文 | 本文通过代谢组学广泛孟德尔随机化研究,识别与骨关节炎相关的因果代谢物和潜在药物靶点 | 首次通过代谢组学广泛孟德尔随机化研究,识别与骨关节炎相关的因果代谢物,并确定潜在的治疗靶点 | 研究依赖于现有的大规模基因组关联研究数据,可能存在数据偏差 | 识别与骨关节炎相关的因果代谢物和潜在药物靶点 | 骨关节炎及其相关代谢物和基因 | 代谢组学 | 骨关节炎 | 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据 | 涉及多个大规模基因组关联研究,包括McDonald's研究(140,025例病例,344,349例对照),Zengini's研究(12,658例病例,50,898例对照),Dönertaş's研究(39,515例病例,445,083例对照),Tachmazidou's研究(39,427例病例,378,169例对照) |
585 | 2024-11-04 |
FBXO2 as a switch guides a special fate of tumor clones evolving into a highly malignant transcriptional subtype in oral squamous cell carcinoma
2024-Nov-02, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02033-5
PMID:39487312
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研究论文 | 研究探讨了FBXO2基因在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中作为关键开关基因,引导肿瘤克隆向高度恶性转录亚型演变的机制 | 首次确定FBXO2为导致肿瘤细胞向特殊恶性状态转变的关键基因,并揭示其在OSCC中的高表达及其对肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭和抗凋亡能力的影响 | NA | 揭示口腔鳞状细胞癌中肿瘤克隆的动态特征及其向高度恶性转录亚型演变的机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的肿瘤克隆及其恶性进展 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
586 | 2024-11-04 |
Dysregulation of R-loop homeostasis shapes the immunosuppressive microenvironment and induces malignant progression in melanoma
2024-Nov-02, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02039-z
PMID:39487313
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研究论文 | 研究探讨了R-loop稳态失调在黑色素瘤发展中的作用及其对免疫微环境的影响 | 建立了基于单细胞RNA测序数据的R-loop评分模型,揭示了R-loop在黑色素瘤进展中的分子机制 | NA | 探讨R-loop稳态失调在黑色素瘤发展中的作用及其对免疫微环境的影响 | R-loop在黑色素瘤中的作用及其对免疫微环境的影响 | 癌症研究 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、DNA/RNA免疫沉淀和测序 | R-loop评分模型 | RNA测序数据 | NA |
587 | 2024-11-04 |
Tracking Rare Single Donor and Recipient Immune and Leukemia Cells after Allogeneic Hematopoietic Cell Transplantation Using Mitochondrial DNA Mutations
2024-Nov-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0138
PMID:39236287
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研究论文 | 本文研究了通过线粒体DNA突变追踪异基因造血干细胞移植后罕见供者和受者免疫及白血病细胞的方法 | 首次展示了线粒体DNA突变与体细胞核DNA突变在移植后复发时的共同进化,并利用单细胞测序技术同时确定供者和受者细胞及其表型 | 目前的技术通量有限,未来需要进一步提高单细胞测序的通量 | 研究异基因造血干细胞移植后白血病复发时细胞的克隆进化和表型变化 | 异基因造血干细胞移植后的供者和受者免疫及白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 0.1%到1%的供者和受者细胞 |
588 | 2024-11-04 |
A modified model of PANoptosisto identify prognosis and immunotherapy response in bladder cancer
2024-Nov, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2024.106672
PMID:39368544
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研究论文 | 研究了广泛性凋亡相关修饰模式在膀胱癌中的作用机制,并构建了一个风险模型用于预测膀胱癌患者的预后和免疫治疗反应 | 提出了一个改进的PANoptosis模型,用于识别膀胱癌的预后和免疫治疗反应 | NA | 研究广泛性凋亡相关修饰模式在膀胱癌中的作用机制 | 膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | 风险模型 | 转录组数据 | NA |
589 | 2024-11-04 |
Investigation of human aging at the single-cell level
2024-Nov, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102530
PMID:39395577
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用 | 本文讨论了多种单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用,并探讨了多组学层在单细胞中的结合以及与空间转录组学和质谱等先进方法的整合 | NA | 探讨单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用 | 人类衰老的机制和相关疾病 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA |
590 | 2024-11-04 |
Revealing molecular mechanisms of early-onset tongue cancer by spatial transcriptomics
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76044-2
PMID:39482351
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了早发性舌癌的分子机制 | 首次成功整合了来自FF和FFPE样本的空间转录组学数据,并揭示了早发性舌癌的独特特征 | 样本量较小,仅包括9名患者 | 探讨早发性舌癌的分子机制及其与老年患者的差异 | 早发性舌癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 舌癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 9名舌鳞状细胞癌患者,分为年轻组(5名)和老年组(4名) |
591 | 2024-11-04 |
ITGA5+ synovial fibroblasts orchestrate proinflammatory niche formation by remodelling the local immune microenvironment in rheumatoid arthritis
2024-Nov-01, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225778
PMID:39486872
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研究论文 | 研究了类风湿性关节炎(RA)中组织驻留的滑膜成纤维细胞的表型异质性及其在炎症反应中的作用 | 发现了新的组织重塑CD45-CD31-PDPN+ITGA5+滑膜成纤维细胞亚群,并揭示了其在RA进展中的调控作用 | NA | 探讨类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞的表型异质性及其在炎症反应中的作用 | 滑膜成纤维细胞及其在类风湿性关节炎中的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞和空间转录组学、免疫组织化学、多重免疫荧光、流式细胞术、细胞共培养、胶原诱导关节炎(CIA)小鼠模型、批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个队列(PEAC和R4RA)的患者样本,以及胶原诱导关节炎(CIA)小鼠模型 |
592 | 2024-11-04 |
Pharmacological activation of STAT1-GSDME pyroptotic circuitry reinforces epigenetic immunotherapy for hepatocellular carcinoma
2024-Nov-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332281
PMID:39486886
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研究论文 | 研究通过激活STAT1-GSDME焦亡通路,增强肝细胞癌的表观遗传免疫治疗 | 揭示了通过选择性HDAC抑制剂CXD101激活STAT1-GSDME焦亡通路,增强免疫检查点抑制剂治疗肝细胞癌的疗效 | NA | 识别免疫检查点抑制剂耐药相关的可药物化组蛋白去乙酰化酶,并开发针对肝细胞癌的可转化联合治疗策略 | 肝细胞癌患者及免疫检查点抑制剂耐药模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因表达数据 | 4个免疫检查点抑制剂耐药的肝细胞癌模型 |
593 | 2024-11-04 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces immunosuppression in human cancer by impairing bioenergetics and ribosome biogenesis in immune cells
2024-Nov-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53706-3
PMID:39487111
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研究论文 | 研究了前列腺素E2(PGE2)通过EP2/EP4信号通路在人类癌症中诱导免疫抑制的机制 | 首次揭示了PGE2通过EP2/EP4信号通路影响肿瘤微环境中免疫细胞的生物能量代谢和核糖体生物发生,从而抑制免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型和人类癌症样本的单细胞RNA测序数据,缺乏体内实验验证 | 探讨前列腺素E2在肿瘤微环境中对免疫细胞的影响及其机制 | 人类癌症中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类癌症样本和小鼠同基因肿瘤模型中的免疫细胞 |
594 | 2024-11-04 |
Characterization of metastasis-specific macrophages in colorectal cancer for prognosis prediction and immunometabolic remodeling
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77248-2
PMID:39487182
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研究论文 | 本研究开发了一种预测结直肠癌肝转移和预后的预测模型,通过识别特定的巨噬细胞亚群 | 首次基于EEF1G+巨噬细胞基因特征构建了8基因风险模型EMGS,用于预测结直肠癌肝转移患者的预后 | 研究主要基于公开数据库的数据,缺乏临床验证 | 预测结直肠癌肝转移患者的预后并识别潜在的治疗靶点 | 结直肠癌肝转移患者的巨噬细胞亚群及其基因特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 使用了GSE231559、TCGA和GEO数据库的数据 |
595 | 2024-11-04 |
Mechanism differences in the start time of sublingual immunotherapy in a mouse allergic airway inflammation model
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78062-6
PMID:39487347
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研究论文 | 研究了在过敏性气道炎症小鼠模型中,舌下免疫疗法(SLIT)的启动时间机制差异 | 首次详细研究了SLIT在预防性和治疗性模型中的时机差异及其对免疫耐受的影响 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 评估SLIT在预防性和治疗性模型中的疗效及其机制 | 过敏性气道炎症小鼠模型中的SLIT效果 | NA | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和T细胞受体测序 | NA | RNA序列和T细胞受体序列 | 小鼠样本 |
596 | 2024-11-04 |
Genetic association between epilepsy and gliomas: Insights from Mendelian randomization and single-cell transcriptomic analyses
2024-Nov-01, Epilepsy & behavior : E&B
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.yebeh.2024.110114
PMID:39488096
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研究论文 | 研究探讨了癫痫与胶质瘤之间的遗传关联及其生物学机制 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞转录组分析揭示了癫痫与胶质瘤之间的潜在因果关系 | NA | 探讨癫痫与胶质瘤之间的遗传关联及其生物学机制 | 癫痫与胶质瘤的遗传变异及其在胶质瘤进展中的作用 | NA | 脑肿瘤 | 全基因组关联研究、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的GSE221534数据集进行分析 |
597 | 2024-11-02 |
Genomic Profiling and Immune Phenotyping of Neuroendocrine Bladder Cancer
2024-Nov-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1277
PMID:39226396
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研究论文 | 研究神经内分泌膀胱癌的基因组特征和免疫表型 | 揭示了神经内分泌膀胱癌的免疫微环境特征,并发现混合型神经内分泌膀胱癌具有免疫浸润表型 | 样本量较小,特别是单细胞RNA测序样本仅有一个 | 探索神经内分泌膀胱癌的免疫治疗潜力 | 神经内分泌膀胱癌的基因组和免疫表型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 基因组分析、转录组分析、单细胞RNA测序、免疫组化分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA数据、图像数据 | 基因组数据19例,转录组数据3例,单细胞RNA测序1例,免疫组化分析34例 |
598 | 2024-11-02 |
Single-Cell View of Tumor Microenvironment Gradients in Pleural Mesothelioma
2024-Nov-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-0017
PMID:38959428
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术构建了胸膜间皮瘤肿瘤微环境的综合细胞图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术构建了胸膜间皮瘤肿瘤微环境的图谱,并发现了与不良疾病结局相关的四个癌症内在程序和一个新的胎儿样内皮细胞群体 | NA | 提高对胸膜间皮瘤肿瘤微环境的理解,以改进免疫治疗策略 | 胸膜间皮瘤肿瘤微环境中的细胞群体及其基因表达程序 | 数字病理学 | 胸膜间皮瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54个表达程序和多个细胞群体 |
599 | 2024-11-02 |
Dynamic evolution of fibroblasts revealed by single cell RNA sequencing of human pancreatic cancer
2024-Nov-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0489
PMID:39485038
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了人类胰腺癌中成纤维细胞的动态演化 | 开发了一种新的方法来注释癌细胞中的基因组改变,并探索了组织电路中的复杂细胞间网络 | NA | 研究胰腺癌进展和治疗反应中支持性组织微环境的共进化 | 胰腺癌中的成纤维细胞及其在疾病和治疗状态下的动态变化 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 正常、炎症和恶性胰腺组织样本 |
600 | 2024-10-30 |
New evidence of vascular defects in neurodegenerative diseases revealed by single cell RNA sequencing
2024-Nov-06, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20241658
PMID:39469930
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了神经退行性疾病中的血管缺陷,并总结了中枢神经系统血管结构和组织的最新进展 | 首次系统性地总结了神经退行性疾病中血管细胞类型或亚型的疾病特异性改变,并提出了血管缺陷可能是神经退行性疾病的早期共同特征 | 血管缺陷在疾病进展中的发生和作用仍未充分探索 | 揭示神经退行性疾病中的血管缺陷及其对神经退化的影响 | 神经退行性疾病中的血管细胞类型和结构 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠、健康个体和神经退行性疾病患者的样本 |