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当前共找到 577 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Addressing the mean-variance relationship in spatially resolved transcriptomics data with spoon
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621867
PMID:39574747
|
研究论文 | 提出一种名为spoon的统计框架，用于解决空间转录组数据中的均值-方差关系偏差，从而更准确地识别空间可变基因 | 首次在空间转录组数据中证明均值-方差关系的存在，并提出使用经验贝叶斯技术消除这种技术偏差的新方法 | 方法性能仅在模拟和真实空间转录组数据中进行了验证，未在其他类型空间组学数据中测试 | 开发更准确识别空间可变基因的统计方法 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 经验贝叶斯模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-05 |
Shear stress is uncoupled from atheroprotective KLK10 in atherosclerotic plaques
2024-11, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究通过比较健康和动脉粥样硬化条件下内皮细胞对生理剪切应力的转录组反应，揭示了动脉粥样硬化斑块中生理剪切应力与保护性因子KLK10的解耦现象 | 首次发现动脉粥样硬化斑块中生理剪切应力与保护性因子KLK10的解耦机制，揭示了疾病状态下内皮细胞对机械力刺激反应能力的改变 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人类样本中进一步验证；单细胞RNA测序样本量有限 | 探究动脉粥样硬化条件下内皮细胞对生理剪切应力保护性反应的改变机制 | 小鼠主动脉内皮细胞，包括健康C57BL/6小鼠、轻度病变Apoe-/-正常饮食小鼠和重度病变Apoe-/-高脂饮食小鼠 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，3D光片成像，计算流体动力学 | NA | 单细胞转录组数据，成像数据 | 三组小鼠模型的内皮细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-05 |
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111250
PMID:39569377
|
研究论文 | 本研究建立了视网膜单细胞RNA测序的样本多重标记方法，用于分析小鼠视网膜神经节细胞 | 使用胆固醇修饰寡核苷酸进行样本多重标记，能够同时解析样本来源和表型数据 | 研究聚焦于小鼠视网膜神经节细胞，方法在其他细胞类型中的适用性需要进一步验证 | 开发单细胞RNA测序样本多重标记方法以提高稀有细胞群体分析的效率 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微流控单细胞RNA测序平台 |
| 44 | 2025-10-05 |
Cross-species single-cell RNA sequencing reveals divergent phenotypes and activation states of adaptive immunity in human carotid and experimental murine atherosclerosis
2024-11-25, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae154
PMID:39041203
|
研究论文 | 通过跨物种单细胞RNA测序比较人类颈动脉和实验性小鼠动脉粥样硬化的免疫细胞组成和激活状态 | 首次通过整合人类和小鼠单细胞RNA测序数据揭示物种间免疫细胞组成的显著差异，挑战标准小鼠模型的转化价值 | 研究主要关注颈动脉粥样硬化，结果可能不适用于其他血管部位；样本数量相对有限 | 比较人类和小鼠动脉粥样硬化中适应性免疫细胞的表型和激活状态差异 | 人类颈动脉粥样硬化斑块和小鼠动脉粥样硬化血管组织中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，多色流式细胞术 | 生物信息学整合分析 | 单细胞转录组数据 | 人类颈动脉斑块样本（验证队列43例患者）+7个小鼠单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-05 |
Regulation of Ptbp1-controlled alternative splicing of pyruvate kinase muscle by liver kinase B1 governs vascular smooth muscle cell plasticity in vivo
2024-11-25, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae187
PMID:39189621
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研究论文 | 本研究揭示了肝激酶B1通过调控Ptbp1依赖的丙酮酸激酶肌肉亚型选择性剪接来控制血管平滑肌细胞可塑性的机制 | 首次发现Lkb1通过调控Ptbp1-PKM选择性剪接轴控制血管平滑肌细胞命运决定，并证明PKM2激活剂可逆转血管病变 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究控制血管平滑肌细胞可塑性的关键分子机制 | 血管平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据，影像数据 | Lkb1flox/flox;Myh11-Cre/ERT2基因工程小鼠和人类主动脉瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-05 |
Olfr2-positive macrophages originate from monocytes proliferate in situ and present a pro-inflammatory foamy-like phenotype
2024-11-05, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae153
PMID:39229899
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研究论文 | 本研究探讨了表达Olfr2的血管巨噬细胞在动脉粥样硬化中的功能表型和起源 | 首次揭示Olfr2+巨噬细胞来源于单核细胞，具有原位增殖能力并呈现促炎性泡沫样表型 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 研究Olfr2+血管巨噬细胞在动脉粥样硬化中的功能表型和细胞起源 | Apoe-/-小鼠主动脉中的Olfr2+巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱流式细胞术, 流式细胞术, 过继转移实验 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | Apoe-/-小鼠模型，WD喂养12周 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-10-05 |
NAD + activates renal metabolism and protects from chronic kidney disease in a model of Alport syndrome
2024-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.580911
PMID:38464264
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研究论文 | 本研究通过Alport综合征小鼠模型揭示了NAD+补充通过激活肾代谢途径特别是近端小管细胞的脂肪酸氧化来保护慢性肾脏病的机制 | 首次在Alport小鼠模型中应用单核RNA测序和空间转录组学技术，首次报道该模型中转录水平的性别差异，明确了NAD+补充通过近端小管细胞发挥肾脏保护作用的具体机制 | 研究仅限于Alport综合征小鼠模型，尚未在人类或其他慢性肾脏病模型中验证 | 探究NAD+补充保护慢性肾脏病的分子机制和涉及的细胞类型 | Alport综合征小鼠模型 | 代谢研究 | 慢性肾脏病 | bulk RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 正交成像技术, 生化检测 | NA | RNA测序数据, 影像数据, 生化数据 | Alport综合征小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses reveal that monocyte gene expression profiles influence HIV-1 reservoir size in acutely treated cohorts
2024-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.12.623270
PMID:39605411
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现单核细胞基因表达谱影响急性治疗队列中HIV-1病毒库大小 | 首次通过无偏倚高通量单细胞RNA测序揭示单核细胞基因表达与HIV-1病毒库大小的负相关关系 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 研究宿主基因表达差异是否调节抑制性ART期间HIV-1病毒库大小 | 急性感染期开始ART治疗的HIV-1感染者外周血单核细胞 | 单细胞基因组学 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序，完整前病毒DNA检测 | NA | 单细胞基因表达数据 | 14名主要队列参与者 + 38名独立验证队列参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Liquid Biopsy for Proliferative Diabetic Retinopathy: Single-Cell Transcriptomics of Human Vitreous Reveals Inflammatory T-Cell Signature
2024 Nov-Dec, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2024.100539
PMID:39220810
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析增生性糖尿病视网膜病变患者玻璃体液，揭示炎症性T细胞特征 | 首次在疾病状态下对人类玻璃体进行单细胞转录组表征，发现PDR玻璃体主要由T细胞组成 | 样本量较小（5例患者6只眼睛），为病例系列研究 | 通过阐明PDR患者玻璃体的单细胞图谱，识别可靶向的细胞类型和相应信号通路 | 接受玻璃体切除术的PDR患者的玻璃体和外周血样本 | 数字病理 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例成人患者（6只眼睛）的玻璃体细胞和外周血单核细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | Chromium 10x | 基于液滴的单细胞RNA测序平台 |
| 50 | 2025-10-06 |
PIEZO1 overexpression in hereditary hemorrhagic telangiectasia arteriovenous malformations
2024-Nov-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625696
PMID:39651206
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现PIEZO1过表达在遗传性出血性毛细血管扩张症动静脉畸形中的关键作用 | 首次揭示PIEZO1在HHT2疾病中的过表达现象，并证明其抑制可有效减轻动静脉畸形形成 | ALK1突变体中信号改变的全谱仍不完全清楚，患者AVM形成的防治方法尚待开发 | 探究ALK1突变导致动静脉畸形的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 内皮特异性Alk1敲除小鼠视网膜和人HHT病变组织 | 单细胞测序 | 遗传性出血性毛细血管扩张症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | Alk1 KO小鼠和对照组小鼠视网膜内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
Contributions of T Cell Signaling for Wound Healing
2024-11-14, Journal of burn care & research : official publication of the American Burn Association
IF:1.5Q3
DOI:10.1093/jbcr/irae151
PMID:39110034
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光成像技术揭示了T细胞在伤口愈合过程中的信号传导特征 | 首次在伤口愈合过程中发现并验证了耗竭T细胞的存在，并揭示了不同T细胞亚群具有独特的信号传导特征 | 耗竭T细胞在伤口愈合中的分子机制和具体作用需要未来更深入的研究 | 探索T细胞在伤口愈合过程中的信号传导作用 | 伤口愈合过程中的T细胞亚群 | 免疫学 | 伤口愈合 | scRNA-seq, 免疫荧光成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
The unveiled mosaic of intra-tumor heterogeneity in ovarian cancer through spatial transcriptomic technologies: A systematic review
2024-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.08.001
PMID:39111726
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系统综述 | 通过空间转录组技术揭示卵巢癌肿瘤内异质性的系统综述 | 系统整合空间转录组技术在卵巢癌研究中的应用，强调空间背景对理解肿瘤异质性和微环境的重要性 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于现有文献分析 | 探讨空间转录组技术在卵巢癌肿瘤内异质性和肿瘤微环境研究中的应用价值 | 卵巢癌肿瘤组织及其微环境 | 数字病理 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals Novel Immune Perturbations in Fibrotic Hypersensitivity Pneumonitis
2024-Nov-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202401-0078OC
PMID:38924775
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示纤维化过敏性肺炎中新型免疫紊乱机制 | 首次在单细胞水平发现FHP中GZM细胞毒性CD4和CD8 T细胞的增加，以及S100A和CCL3/CCL4经典单核细胞的异常 | 样本量有限，仅包含特定地区（美国和墨西哥）的患者 | 阐明纤维化过敏性肺炎的免疫异常机制 | 纤维化过敏性肺炎患者、特发性肺纤维化患者、非纤维化过敏性肺炎患者和健康对照者 | 单细胞转录组学 | 间质性肺病 | 单细胞5' RNA测序 | Seurat, DoRothEA-VIPER, Monocle3, Velocyto-scVelo-CellRank | 单细胞RNA测序数据 | 148名参与者（45名FHP患者，63名IPF患者，4名非纤维化HP患者，36名健康对照），共分析589,870个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞5' RNA测序 |
| 54 | 2025-10-06 |
Intrahepatic IgA complex induces polarization of cancer-associated fibroblasts to matrix phenotypes in the tumor microenvironment of HCC
2024-Nov-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000772
PMID:38466639
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研究论文 | 本研究探讨了肝内IgA复合物在肝细胞癌肿瘤微环境中诱导癌症相关成纤维细胞向基质表型极化的机制 | 首次揭示IgA复合物通过CD71受体促进CAFs向恶性基质表型极化并削弱CD8+T细胞功能的新机制 | 样本量相对有限(50例HCC样本)，且为体外实验验证 | 阐明IgA复合物在HCC肿瘤微环境中对癌症相关成纤维细胞的影响 | 肝细胞癌患者样本中的癌症相关成纤维细胞和CD8+T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,共培养实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 | 50例肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses identify an immunotherapy nonresponse-related fibroblast signature in gastric cancer
2024-11-01, Anti-cancer drugs
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/CAD.0000000000001651
PMID:39110142
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序分析，识别了胃癌中与免疫治疗无响应相关的成纤维细胞特征 | 首次构建了与免疫检查点抑制剂无响应相关的成纤维细胞基因特征，并发现该特征能预测胃癌患者对免疫治疗的反应 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索胃癌中免疫治疗无响应的决定因素，构建预测生物标志物 | 胃癌患者样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | Cox回归模型, LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
Identification of the key targets for sepsis-associated acute kidney injury by RNA sequencing combined with bioinformatics methods
2024-11-30, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00673-5
PMID:39616313
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研究论文 | 通过RNA测序结合生物信息学方法识别脓毒症相关急性肾损伤的关键靶点基因 | 首次将脓毒症差异表达基因与肾脏特异性基因进行交集分析，鉴定出CD74和IL32作为脓毒症相关肾损伤的新型生物标志物 | 样本量较小（10例健康对照和22例脓毒症患者），需要更大规模研究验证 | 探索脓毒症患者并发肾损伤的相关基因，为早期识别和预后研究提供可靠靶点 | 脓毒症患者和健康个体的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | RNA测序, 生物信息学分析, 单细胞RNA测序 | 差异表达分析, GO分析, KEGG分析, 生存分析, ROC分析 | RNA测序数据 | 32例样本（10例健康对照，22例脓毒症患者） | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
Preparation of Frozen Non-Human Primate Fetal Islets for Combined Single Nuclei RNA-Sequencing and ATAC-Sequencing, and Bulk Metabolomics
2024-Nov-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66849
PMID:39584693
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研究论文 | 开发了一种从非人灵长类胎儿胰岛组织中同时进行单核RNA测序、ATAC测序和批量代谢组学分析的方法 | 建立了能够从同一冷冻样本中同时获取单核转录组、表观基因组和代谢组数据的技术流程 | 方法依赖于冷冻组织样本，且样本获取时间跨度长达两年可能引入批次效应 | 开发多组学整合分析方法以研究代谢物在细胞身份建立中的作用 | 非人灵长类胎儿胰岛组织 | 多组学分析 | NA | 单核RNA测序, ATAC测序, 毛细管电泳-质谱, 代谢组学 | NA | 基因组, 表观基因组, 代谢组数据 | 两年期间收集的多个批次的非人灵长类胎儿胰岛样本 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, bulk metabolomics | NA | NA |
| 58 | 2025-10-06 |
CosGeneGate selects multi-functional and credible biomarkers for single-cell analysis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae626
PMID:39592241
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研究论文 | 提出了一种名为CosGeneGate的新模型，用于在单细胞测序分析中选择更具代表性的标记基因 | 结合细胞类型分类准确性和标记基因特异性表达模式的优势来选择标记基因 | NA | 开发更有效的单细胞测序标记基因选择方法 | 单细胞测序数据中的标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序分析 | CosGeneGate | 单细胞测序数据 | 公共数据集和新测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
FIND-seq: high-throughput nucleic acid cytometry for rare single-cell transcriptomics
2024-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01021-y
PMID:39039320
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研究论文 | 介绍FIND-seq高通量核酸流式技术及其在稀有单细胞转录组分析中的应用 | 开发了基于核酸序列检测的细胞分选平台，可基于RNA或DNA标记分离稀有细胞并进行转录组分析 | 需要微流体学、光学和分子生物学专业知识 | 建立稀有细胞分离和测序的技术平台 | 稀有细胞亚群，包括HIV感染细胞、具有特定DNA突变或转录特征的细胞 | 单细胞测序技术 | HIV感染 | 核酸流式技术，单细胞转录组测序 | NA | RNA，DNA，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，核酸检测 | FIND-seq | 基于微流体的核酸检测和测序平台，支持稀有细胞分离和全转录组测序 |
| 60 | 2025-10-06 |
The single-cell transcriptomic landscape of the topological differences in mammalian auditory receptors
2024-11, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2672-1
PMID:39083201
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示哺乳动物听觉受体拓扑差异的转录组景观 | 首次在单细胞水平系统揭示毛细胞拓扑分子梯度，发现Ptn、Rxra和Nfe2l2等新型音位分布相关基因，并预测调控这些梯度的转录因子 | NA | 探索哺乳动物耳蜗毛细胞音位分布图的分子组织机制 | 哺乳动物内毛细胞和外毛细胞 | 单细胞转录组学 | 听觉系统疾病 | 单细胞RNA测序 | SCENIC算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |