单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
561	2024-10-12	Knock-out of CD73 delays the onset of HR-negative breast cancer by reprogramming lipid metabolism and is associated with increased tumor mutational burden 2024-Nov, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2024.102035 PMID:39304062	研究论文	研究探讨了CD73在HR阴性乳腺癌中的作用，通过代谢重编程影响脂质代谢，并增加肿瘤突变负担	首次揭示了CD73在乳腺癌发生过程中的重要作用，特别是通过调节脂质代谢和增加肿瘤突变负担来影响HR阴性乳腺癌的发展	研究主要基于小鼠模型和公共数据集，需要进一步在人类样本中验证	探讨CD73在乳腺癌发生中的作用及其对脂质代谢和肿瘤突变负担的影响	CD73在HR阴性乳腺癌中的作用及其对脂质代谢和肿瘤突变负担的影响	数字病理学	乳腺癌	RNA测序、免疫组化、蛋白质印迹、气相色谱-电子电离-质谱	NA	RNA、蛋白质、脂质	小鼠模型、公共数据集中的乳腺癌组织和细胞系
562	2024-10-10	Sequencing-based study of neural induction of human dental pulp stem cells 2024-Nov, Human cell IF:3.4Q3 DOI:10.1007/s13577-024-01121-7 PMID:39210197	研究论文	本研究评估了通过神经诱导的人类牙髓干细胞（DPSCs）获得的神经谱系细胞的细胞成分和分化途径	首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）详细研究了DPSCs的神经诱导特性及其分化状态	研究主要集中在体外培养的DPSCs，未涉及体内实验	评估人类牙髓干细胞在神经诱导后的细胞成分和分化途径	人类牙髓干细胞（DPSCs）及其神经诱导后的细胞	干细胞生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	人类牙髓干细胞（DPSCs）的单细胞样本
563	2024-10-08	The heterogeneity of breast cancer metastasis: a bioinformatics analysis utilizing single-cell RNA sequencing data 2024-Nov, Breast cancer research and treatment IF:3.0Q2 DOI:10.1007/s10549-024-07428-1 PMID:38992286	研究论文	本文利用单细胞RNA测序数据分析了乳腺癌转移的异质性	利用单细胞RNA测序技术区分转移的分子特征并识别患者预后的预测基因	没有单一基因或通路能完全解释肿瘤转移的机制	探索乳腺癌原发肿瘤组织与淋巴结和肝脏转移细胞之间的基因表达差异	乳腺癌原发肿瘤组织与淋巴结和肝脏转移细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
564	2024-10-06	Immune escape between endoplasmic reticulum stress-related cancer cells and exhausted CD8+T cells leads to neoadjuvant chemotherapy resistance in ovarian cancer 2024-Nov-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150686 PMID:39278093	研究论文	研究探讨了新辅助化疗对高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤细胞和免疫细胞的影响	揭示了新辅助化疗抵抗的机制，并提出了针对ERS标记HSP90B1和免疫逃逸标记MDK的治疗策略	研究样本量较小，仅涉及11名患者	探索新辅助化疗对高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤微环境中肿瘤细胞和免疫细胞的影响	高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤细胞和CD8+T细胞	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	11名高级别浆液性卵巢癌患者
565	2024-10-04	The concept of onychodermis containing onychofibroblasts has histological (microanatomical), immunohistochemical as well as molecular basis 2024-Nov, Journal of cutaneous pathology IF:1.6Q3 DOI:10.1111/cup.14696 PMID:39044464	研究论文	本文探讨了包含onychofibroblasts的onychodermis的概念，并提供了其组织学、免疫组织化学和分子基础的证据	首次通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，揭示了onychofibroblasts在onychodermis中表达的关键基因，这些基因与指甲形成和相关疾病有关	NA	研究onychodermis和onychofibroblasts在指甲发育和病理中的作用	onychodermis和onychofibroblasts的组织学、免疫组织化学和分子特征	NA	NA	单细胞RNA测序、原位杂交	NA	基因表达数据	NA
566	2024-10-04	Gastroduodenal injury and repair mechanisms 2024-Nov-01, Current opinion in gastroenterology IF:2.6Q2 DOI:10.1097/MOG.0000000000001049 PMID:38935320	综述	本文综述了胃十二指肠黏膜损伤后的修复机制	重点介绍了黏膜保护的新机制，包括腺病毒疗法、植物提取物和RNA技术在黏膜再生中的应用	缺乏对急性浅表性损伤修复机制的深入研究	探讨胃十二指肠黏膜损伤后的修复机制	胃十二指肠黏膜损伤及其修复机制	NA	NA	RNA测序	NA	NA	NA
567	2024-09-26	Integrated single-cell and bulk RNA sequencing identifies POSTN as a potential biomarker and therapeutic target for rheumatoid arthritis 2024-Nov-30, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148798 PMID:39067546	研究论文	本研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出POSTN作为类风湿性关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点	首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，通过生物信息学分析和分子对接验证，识别出POSTN作为类风湿性关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点	NA	识别类风湿性关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点	类风湿性关节炎的生物标志物和治疗靶点	生物信息学	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序、批量RNA测序、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接	NA	RNA测序数据	NA
568	2024-09-26	Immunoinhibitory effects of hypoxia-driven reprogramming of EGR1hi and EGR3 positive B cells in the nasopharyngeal carcinoma microenvironment 2024-Nov, Oral oncology IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.oraloncology.2024.106999 PMID:39197193	研究论文	研究探讨了在鼻咽癌微环境中，缺氧条件下EGR1和EGR3阳性B细胞的免疫抑制作用及其机制	首次揭示了EGR1和EGR3在缺氧条件下对Breg细胞分化的调控作用，并阐明了其通过MAPK途径和免疫抑制因子表达影响肿瘤微环境的机制	研究主要基于单细胞转录组测序和移植实验，缺乏体内实验验证	探讨鼻咽癌微环境中Breg细胞的分化及其免疫抑制机制	鼻咽癌微环境中的Breg细胞及其在缺氧条件下的分化和调控机制	NA	鼻咽癌	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	涉及人类鼻咽癌样本
569	2024-09-22	Bulk and single-cell RNA sequencing analyses coupled with multiple machine learning to develop a glycosyltransferase associated signature in colorectal cancer 2024-Nov, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102093 PMID:39217850	研究论文	本研究旨在通过批量和单细胞RNA测序分析结合多种机器学习方法，开发结直肠癌中与糖基转移酶相关的风险特征	本研究创新性地开发了一种基于糖基转移酶的预测模型，用于预测结直肠癌患者对免疫治疗的反应	NA	识别结直肠癌中的关键糖基转移酶，并建立一个基于糖基转移酶的稳健预后特征	结直肠癌患者及其糖基转移酶相关基因	机器学习	结直肠癌	RNA测序	机器学习模型	RNA数据	NA
570	2024-09-19	Single-cell RNA sequencing reveals a distinct profile of bone immune microenvironment and decreased osteoclast differentiation in type 2 diabetic mice 2024-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2023.101145 PMID:39281831	研究论文	研究揭示了2型糖尿病小鼠骨髓细胞的单细胞转录组特征，并发现其骨免疫微环境的变化和破骨细胞分化的减少	首次详细描绘了2型糖尿病小鼠骨髓细胞的全局转录组图谱，揭示了骨免疫微环境在基因水平上的独特变化	NA	探讨2型糖尿病对骨组织的影响及其细胞和分子机制	2型糖尿病小鼠的骨髓细胞	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	野生型和2型糖尿病小鼠的骨髓细胞
571	2024-09-17	Targeting CNS myeloid infiltrates provides neuroprotection in a progressive multiple sclerosis model 2024-Nov, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2024.08.032 PMID:39179123	研究论文	研究通过靶向中枢神经系统（CNS）中的髓系浸润细胞，提供了一种在渐进性多发性硬化症模型中的神经保护策略	首次展示了通过调节CNS髓系细胞的毒性来减少不可逆组织损伤，并提出了一种新的疾病修饰方法	研究仅在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型中进行，尚未在临床试验中验证	探讨靶向CNS髓系细胞是否能预防慢性免疫介导的脱髓鞘疾病的不可逆组织损伤	实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型中的髓系细胞和神经保护效果	神经科学	多发性硬化症	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	Biozzi小鼠模型中的脊髓CD11b+细胞
572	2024-09-15	Spatial transcriptomics in pancreatic cancer: Advances, prospects and challenges 2024-Nov, Critical reviews in oncology/hematology DOI:10.1016/j.critrevonc.2024.104430 PMID:38942220	综述	本文综述了空间转录组学在胰腺癌研究中的进展、前景和挑战	空间转录组学技术整合了细胞位置和全转录表达信息，提供了对胰腺癌微环境中细胞亚型时空变化的详细观察	空间转录组学技术在胰腺癌中的临床应用场景和技术局限性仍需进一步探索	探讨空间转录组学在胰腺癌研究中的应用及其对肿瘤异质性和免疫微环境的理解	胰腺癌中的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞	数字病理学	胰腺癌	空间转录组学	NA	转录组数据	NA
573	2024-09-11	SLC2A1 boosts the resistance of non-small cell lung cancer to taxanes by stimulating the formation of EPCAM+ cancer stem-like cells via glycolysis 2024-Nov, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102082 PMID:39126936	研究论文	研究SLC2A1通过激活糖酵解促进EPCAM+癌症干细胞样细胞的形成，从而增强非小细胞肺癌对紫杉烷类药物的耐药性	揭示了SLC2A1在非小细胞肺癌中通过激活糖酵解促进癌症干细胞样细胞形成的新机制	研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证	探讨SLC2A1在非小细胞肺癌对紫杉烷类药物耐药性中的作用机制	非小细胞肺癌细胞、SLC2A1表达、癌症干细胞样细胞	数字病理学	肺癌	流式细胞术、代谢组学、单细胞测序、细胞通讯分析	NA	细胞	涉及多个数据集和内部收集的样本
574	2024-09-11	GTF2H5 Identified as a crucial synthetic lethal target to counteract chemoresistance in colorectal cancer 2024-Nov, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102097 PMID:39173480	研究论文	本文研究了合成致死基因GTF2H5在结直肠癌化疗耐药中的作用，并探讨了其在克服化疗耐药中的潜在治疗靶点	首次识别GTF2H5为结直肠癌化疗耐药的关键合成致死靶点	实验验证仅初步，需进一步深入研究GTF2H5在化疗耐药中的具体机制	探讨合成致死基因在结直肠癌化疗耐药中的作用，寻找新的治疗靶点	结直肠癌患者及其化疗耐药相关基因	癌症研究	结直肠癌	RNA测序	NA	RNA测序数据	来自UCSC和GEO数据库的结直肠癌患者数据，以及来自Tumor Immunology Single Cell Center数据库的单细胞RNA测序数据
575	2024-09-08	Identification of feature genes and molecular mechanisms involved in cell communication in uveal melanoma through analysis of single‑cell sequencing data 2024-Nov, Oncology letters IF:2.5Q3 DOI:10.3892/ol.2024.14636 PMID:39233824	研究论文	本研究通过分析单细胞测序数据，识别了葡萄膜黑色素瘤中的特征基因及其在细胞通讯中的分子机制	本研究发现了葡萄膜黑色素瘤中新的关键基因，并揭示了这些基因在血管发育、粘附连接和细胞粘附分子结合等通路中的显著富集	本研究主要依赖于公共数据库的数据，未进行体内实验验证	识别葡萄膜黑色素瘤中的特征基因及其在细胞通讯中的分子机制	葡萄膜黑色素瘤中的特征基因及其在细胞通讯中的作用	数字病理学	葡萄膜黑色素瘤	单细胞测序	随机生存森林算法	RNA测序数据	13个单细胞样本亚型
576	2024-09-05	Single-cell spatial transcriptomics in cardiovascular development, disease, and medicine 2024-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2023.101163 PMID:39224111	研究论文	本文介绍了单细胞空间转录组学在心血管发育、疾病和医学中的应用，并强调了其在心血管研究中的最新进展。	结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，提供了对心血管疾病发病机制的多维度、多层次、多视角和动态的理解。	NA	探讨单细胞空间转录组学技术在心血管疾病风险分层和个体化治疗中的应用。	心血管疾病的发病机制、细胞间相互作用以及疾病进展的时空特征。	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	转录组数据	NA
577	2024-08-31	Personalized composite scaffolds for accelerated cell- and growth factor-free craniofacial bone regeneration 2024-Nov, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.029 PMID:39188380	研究论文	本文介绍了一种用于加速颅面骨再生的个性化复合支架系统，该系统采用3D打印技术制造，包含多孔聚二醇柠檬酸-羟基磷灰石复合弹性体和聚二醇柠檬酸-石墨烯氧化物水凝胶复合物。	该支架系统通过材料中心的设计，无需细胞和生长因子即可促进骨再生，具有简化的制造过程和临床转化优势。	NA	开发一种新型的复合支架系统，用于加速颅面骨的再生。	颅面骨的再生	生物材料	骨骼疾病	3D打印	NA	NA	NA
578	2024-08-29	RNA-binding protein AZGP1 inhibits epithelial cell proliferation by regulating the genes of alternative splicing in COPD 2024-Nov-15, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148736 PMID:38950687	研究论文	研究探讨了RNA结合蛋白AZGP1通过调控选择性剪接基因在慢性阻塞性肺疾病（COPD）中抑制上皮细胞增殖的作用	首次揭示了AZGP1在COPD中通过调控选择性剪接事件影响上皮细胞增殖和粘附的新机制	研究主要基于单细胞转录组测序和批量RNA测序数据，未进行体内外实验验证	探究RNA结合蛋白在COPD中的作用及其对上皮细胞增殖的调控机制	RNA结合蛋白AZGP1及其在COPD中的表达和功能	数字病理学	慢性阻塞性肺疾病	单细胞转录组测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	使用了两组数据集：GSE173896（单细胞RNA测序）和GSE124180（批量RNA测序）
579	2024-08-17	Non-invasive determination of gene expression in placental tissue using maternal plasma cell-free DNA fragmentation characters 2024-Nov-30, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148789 PMID:39047956	研究论文	本文介绍了一种通过母体血浆中游离DNA片段特征非侵入性地确定胎盘组织基因表达的方法	开发了一种基于母体血浆游离DNA片段特征的非侵入性方法来预测胎盘基因表达	目前无法实时获取胎盘基因表达	克服无法实时获取胎盘基因表达的限制，并改进对胎盘源性妊娠综合征的非侵入性预测研究	孕妇的外周血和胎盘样本	数字病理学	妊娠综合征	深度测序	深度神经网络	DNA序列	从五名孕妇中获得了超过2000万条深度测序的游离DNA读取数据，以及32,401个单细胞表达谱和156,546个胎盘组织的单细胞表达谱
580	2024-08-14	Tailored endothelialization enabled by engineered endothelial cell vesicles accelerates remodeling of small-diameter vascular grafts 2024-Nov, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.006 PMID:39131628	研究论文	本文通过应用工程化内皮细胞囊泡来伪装血管移植物，以增强血管重塑，从而创建具有定制化内皮化的微小直径血管移植物（SDVG）。	本文创新性地通过代谢糖工程将叠氮基团修饰的工程化内皮细胞囊泡（ECVs-N）精确连接到PCL-DBCO制成的血管移植物上，形成ECVG，有助于抑制血小板粘附和激活，促进内皮细胞粘附并增强抗炎作用。	NA	研究目的是通过工程化内皮细胞囊泡实现微小直径血管移植物的定制化内皮化，以克服传统血管移植物的局限性。	研究对象是微小直径血管移植物（SDVG）及其内皮化过程。	生物工程	心血管疾病	代谢糖工程，点击化学	NA	单细胞转录组数据	具体样本数量未在摘要中提及