单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 659 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2024-11-07 |
Application of computational algorithms for single-cell RNA-seq and ATAC-seq in neurodegenerative diseases
2024-Nov-05, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae044
PMID:39500613
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）技术在神经退行性疾病中的应用 | 本文介绍了将scRNA-seq和scATAC-seq数据整合的计算工具和机器学习方法，以揭示神经退行性疾病中的染色质可及性和基因表达变化 | 面临数据稀疏性和计算需求等挑战 | 探讨单细胞技术在神经退行性疾病中的应用，揭示病理机制和潜在治疗靶点 | 阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因组数据 | NA |
| 562 | 2024-11-07 |
Emerging Techniques in Spatial Multiomics: Fundamental Principles and Applications to Dermatology
2024-Nov-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.006
PMID:39503694
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综述 | 本文综述了空间多组学技术在皮肤病学中的基本原理、应用、优势、局限性和潜在发展 | 空间多组学技术能够在单个组织切片中同时可视化基因组、蛋白质组和表观基因组目标，无需标记多个相邻切片 | 早期工作主要集中在RNA（空间转录组学），但目前技术可以同时捕获DNA、基因组可及性、组蛋白修饰和蛋白质，具有空间分辨的单细胞分辨率 | 探讨空间多组学技术在皮肤病学研究中的应用潜力 | 皮肤组织中的基因组、蛋白质组和表观基因组目标 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间多组学技术 | NA | 基因组、蛋白质组和表观基因组数据 | NA |
| 563 | 2024-11-07 |
Inhibition of SUMOylation Induces Adaptive Antitumor Immunity against Pancreatic Cancer through Multiple Effects on the Tumor Microenvironment
2024-Nov-04, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-23-0572
PMID:39150446
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研究论文 | 研究通过抑制SUMOylation诱导胰腺癌的适应性抗肿瘤免疫，并探讨其在肿瘤微环境中的多重效应 | 首次探讨了SUMOylation抑制在胰腺癌肿瘤微环境中对适应性抗肿瘤免疫的影响 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在临床试验中验证 | 探索改善胰腺导管腺癌患者预后的新治疗靶点 | 胰腺导管腺癌及其肿瘤微环境 | NA | 胰腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 使用临床相关的小鼠胰腺癌模型进行研究 |
| 564 | 2024-11-07 |
CRISPR Screening of Transcribed Super-Enhancers Identifies Drivers of Triple-Negative Breast Cancer Progression
2024-Nov-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3995
PMID:39186674
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研究论文 | 研究通过CRISPR筛选转录超级增强子，识别三阴性乳腺癌进展的驱动因素 | 系统分析了三阴性乳腺癌特异性转录增强子的调控机制及其非编码增强子RNA（eRNA）转录本，并使用高吞吐量CRISPR干扰实验结合RNA测序，无偏倚地检测了全基因组的目标基因 | NA | 探讨eRNA产生的超级增强子如何驱动基因表达网络，从而影响三阴性乳腺癌的生物学特性 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的转录超级增强子及其eRNA转录本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | CRISPR干扰、RNA测序、Hi-C染色质相互作用图谱、单细胞RNA测序、高吞吐量测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 565 | 2024-11-07 |
SGSM2 in Uveal Melanoma: Implications for Survival, Immune Infiltration, and Drug Sensitivity
2024-Nov-04, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
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研究论文 | 研究SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的表达及其对生存、免疫浸润和药物敏感性的影响 | 首次探讨了SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的作用，并发现其与患者的生存率、免疫浸润和药物敏感性相关 | 研究主要基于生物信息学分析和实验验证，缺乏大规模临床试验验证 | 阐明SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的作用及其对患者生存和治疗反应的影响 | 葡萄膜黑色素瘤细胞系和患者样本 | NA | 葡萄膜黑色素瘤 | qRT-PCR, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 葡萄膜黑色素瘤细胞系和患者样本 |
| 566 | 2024-11-07 |
HiDDEN: a machine learning method for detection of disease-relevant populations in case-control single-cell transcriptomics data
2024-Nov-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53666-8
PMID:39487129
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HiDDEN的机器学习方法，用于在病例对照单细胞转录组数据中检测与疾病相关的细胞群体 | HiDDEN方法能够改进病例对照标签，准确反映每个细胞的扰动状态，从而在模拟数据和实际数据中表现出优于标准分析流程的能力 | 标准单细胞分析方法在受影响子集较小或扰动强度较弱时无法有效隔离受影响的病例细胞及其标记 | 开发一种能够准确检测病例对照单细胞转录组数据中与疾病相关细胞群体的方法 | 病例对照单细胞转录组数据中的细胞群体及其与疾病相关的扰动状态 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括人类多发性骨髓瘤前体条件数据和鼠类脱髓鞘模型数据 |
| 567 | 2024-11-07 |
Single-cell sequencing: Current applications in various tuberculosis specimen types
2024-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13698
PMID:38956399
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在结核病研究中的应用，特别是其在分析不同来源结核病样本中的应用 | 单细胞测序技术具有高分辨率，能够超越传统技术，揭示与结核病发病机制相关的免疫细胞亚群的组成和比例 | NA | 探讨单细胞测序技术在结核病研究中的临床应用潜力 | 结核病样本，主要包括外周血和肺部样本 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 568 | 2024-11-07 |
Combined lineage tracing and scRNA-seq reveal the activation of Sox9+ cells in renal regeneration with PGE2 treatment
2024-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13679
PMID:38801100
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研究论文 | 研究揭示了PGE2处理下Sox9+细胞在肾再生中的激活机制 | 首次结合谱系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了PGE2在急性肾损伤后激活Sox9+细胞并促进其分化为近端小管上皮细胞的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 揭示内源性再生和修复机制，开发针对驻留干细胞谱系的特定疗法 | Sox9+干细胞在急性肾损伤后的命运决定机制 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | Sox9谱系追踪小鼠模型中的样本 |
| 569 | 2024-11-07 |
Macrophages in the infarcted heart acquire a fibrogenic phenotype, expressing matricellular proteins, but do not undergo fibroblast conversion
2024-Nov, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.07.010
PMID:39089570
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研究论文 | 研究探讨了心肌梗死后巨噬细胞是否转化为成纤维细胞及其对细胞外基质表达的影响 | 首次通过谱系追踪和单细胞转录组学方法，证明了心肌梗死后的巨噬细胞并未转化为成纤维细胞，但表达多种促纤维化基质蛋白 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类心肌梗死的数据 | 验证心肌梗死后巨噬细胞是否转化为成纤维细胞，并分析其细胞外基质表达特征 | 心肌梗死后的巨噬细胞及其细胞外基质表达 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠心肌梗死模型 |
| 570 | 2024-11-07 |
Beyond the Heartbeat: Single-Cell Omics Redefining Cardiovascular Research
2024-Nov, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-024-02117-3
PMID:39158785
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术在人类心脏各个区域的应用，揭示了细胞多样性、调控网络和疾病机制 | 单细胞组学技术在心脏研究中的应用，揭示了心脏细胞组成、细胞类型异质性和分子动力学 | NA | 探索单细胞组学技术在心脏研究中的最新进展 | 人类心脏的细胞多样性、调控网络和疾病机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、基因组学、蛋白质组学、表观基因组学和空间转录组学 | NA | 细胞 | NA |
| 571 | 2024-11-07 |
Immunologic Profiling of CSF in Subarachnoid Neurocysticercosis Reveals Specific Interleukin-10-Producing Cell Populations During Treatment
2024-Nov, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200320
PMID:39475624
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研究论文 | 研究了在治疗期间，蛛网膜下腔神经囊虫病（SANCC）患者脑脊液（CSF）中免疫细胞群体的特征，特别是IL-10产生细胞的分布和作用 | 首次全面分析了SANCC患者CSF和外周血中IL-10产生细胞的多样性和动态变化 | 样本量较小，仅包括5名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入理解SANCC的免疫学机制，特别是IL-10在治疗过程中的作用 | SANCC患者的脑脊液和外周血中的免疫细胞群体 | NA | 神经囊虫病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | 5名SANCC患者，共8份脑脊液样本和4份匹配的外周血样本 |
| 572 | 2024-11-07 |
Molecular Profiling Defines Three Subtypes of Synovial Sarcoma
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404510
PMID:39257029
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研究论文 | 本研究通过RNA和靶向DNA测序分析了91个滑膜肉瘤样本，确定了三种分子亚型，并探讨了其与临床特征的关系 | 首次通过分子谱分析定义了滑膜肉瘤的三种亚型，并揭示了其与临床预后的关联 | 样本量相对较小，可能需要更大规模的验证 | 阐明驱动滑膜肉瘤表型多样性的基因组事件 | 滑膜肉瘤的分子亚型及其与临床特征的关系 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | RNA测序和靶向DNA测序 | NA | 基因表达数据 | 91个肿瘤样本来自55名患者 |
| 573 | 2024-11-07 |
Construction of a Prognostic Model for Mitochondria and Macrophage Polarization Correlation in Glioma Based on Single-Cell and Transcriptome Sequencing
2024-Nov, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70083
PMID:39491527
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析构建了一个基于线粒体和巨噬细胞极化相关基因的胶质瘤预后模型 | 揭示了与胶质瘤预后相关的五个基因（ECI2, MCCC2, OXCT1, SUCLG2, 和 CPT2），为个性化治疗和预后提供了新的见解 | NA | 探讨线粒体相关基因和巨噬细胞极化相关基因与胶质瘤预后的关系 | 胶质瘤患者的预后预测 | 生物信息学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序和转录组测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 包括TCGA-GBMLGG, mRNA-seq-325, mRNA-seq-693, GSE16011, GSE4290, 和 GSE138794等多个数据集 |
| 574 | 2024-11-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Metabolic Stress-Dependent Activation of Cardiac Macrophages in a Model of Dyslipidemia-Induced Diastolic Dysfunction
2024-Nov-05, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了高脂饮食诱导的ApoE敲除小鼠模型中心脏细胞的表达谱，揭示了代谢应激对心脏巨噬细胞的激活作用及其在舒张功能障碍中的作用 | 首次揭示了代谢应激通过内质网应激途径直接激活心脏巨噬细胞，并提出了钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂作为治疗HFpEF特定表型的潜在疗法 | NA | 探讨代谢应激对心脏炎症细胞的影响，特别是巨噬细胞，并评估钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂的潜在治疗效果 | ApoE敲除小鼠模型中的心脏细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ApoE敲除小鼠 |
| 575 | 2024-11-06 |
Isolation and Comprehensive Analysis of Cochlear Tissue-Derived Small Extracellular Vesicles
2024-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408964
PMID:39497619
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研究论文 | 研究评估了三种耳蜗组织消化和耳蜗组织来源的小细胞外囊泡（CDsEV）分离方法，并首次提出使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心法是分离CDsEVs的最佳方法 | 首次提出了一种优化的耳蜗组织来源小细胞外囊泡（CDsEV）分离方法，并全面研究了CDsEV的内容物和细胞来源 | NA | 评估耳蜗组织来源小细胞外囊泡（CDsEV）的分离方法，并研究其内容物和细胞来源 | 耳蜗组织来源的小细胞外囊泡（CDsEV）及其内容物和细胞来源 | NA | NA | 小RNA测序和蛋白质组学 | NA | RNA和蛋白质 | 不同类型的耳蜗细胞分泌的CDsEVs |
| 576 | 2024-11-06 |
Angiotensin-Converting Enzyme-Dependent Intrarenal Angiotensin II Contributes to CTP: Phosphoethanolamine Cytidylyltransferase Downregulation, Mitochondrial Membranous Disruption, and Reactive Oxygen Species Overgeneration in Diabetic Tubulopathy
2024-Nov-04, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2024.0637
PMID:39495586
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研究论文 | 研究探讨了血管紧张素转换酶（ACE）依赖的肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中的作用 | 揭示了ACE依赖的肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中的关键作用，为治疗提供了新的见解 | NA | 测试ACE依赖的肾内血管紧张素II是否破坏肾小管线粒体膜稳态并导致过量ROS生成 | 糖尿病肾小管病变中的线粒体膜稳态和ROS生成 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 577 | 2024-11-06 |
Navigating the immune landscape with plasma cells: A pan-cancer signature for precision immunotherapy
2024-Nov-04, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.2142
PMID:39495620
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研究论文 | 本研究通过泛癌单细胞RNA测序分析，识别出一种新的浆细胞特征，用于预测患者对免疫治疗的反应 | 本研究首次提出了名为Plasma cell.Sig的浆细胞特征，通过机器学习算法在多个队列中验证，显示出卓越的预测能力 | NA | 旨在通过识别新的浆细胞特征，提高对患者免疫治疗反应的预测准确性 | 浆细胞特征在泛癌免疫治疗中的预测作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 多个队列 |
| 578 | 2024-11-06 |
Deciphering normal and cancer stem cell niches by spatial transcriptomics: opportunities and challenges
2024-Nov-04, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351956.124
PMID:39496456
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研究论文 | 本文探讨了通过空间转录组学技术解析正常干细胞和癌症干细胞微环境的机会与挑战 | 利用下一代测序、单细胞转录组学和空间转录组学等先进技术，提供高分辨率和全面的疾病组织分子图谱 | 技术限制和计算工具的局限性阻碍了对这些微环境的全面表征 | 研究正常干细胞和癌症干细胞在不同器官中的特性及其在正常发育和肿瘤发生中的作用 | 正常干细胞和癌症干细胞及其微环境 | 数字病理学 | NA | 下一代测序、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 579 | 2024-11-06 |
Single-cell sequencing applications in acute myeloid leukemia
2024-Nov-04, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2024.2422833
PMID:39496597
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病中的应用及其进展 | 单细胞测序技术有助于理解急性髓系白血病中的遗传和功能异质性，特别是与白血病干细胞、克隆进化和可测量残留病监测相关的方面 | NA | 探讨单细胞测序技术在急性髓系白血病研究中的应用及其对临床实践的影响 | 急性髓系白血病及其相关细胞和遗传特征 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 580 | 2024-11-06 |
Multiple Machine Learning Identifies Key Gene PHLDA1 Suppressing NAFLD Progression
2024-Nov-04, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02164-6
PMID:39496918
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研究论文 | 本研究通过多重机器学习策略识别出关键基因PHLDA1，该基因在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展中起抑制作用 | 本研究首次通过多重机器学习策略识别出PHLDA1基因，并验证其在NAFLD进展中的抑制作用 | 本研究主要基于细胞和小鼠模型进行验证，尚未在人体临床试验中验证PHLDA1的疗效 | 识别和验证新的NAFLD生物标志物，以促进其预测、预防和个性化治疗 | NAFLD相关基因和免疫细胞 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CIBERSORT分析 | 多种机器学习模型 | 基因表达数据 | 三个NAFLD数据集中的23个重叠差异表达基因（DEGs），以及细胞和小鼠NAFLD模型 |