单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
541	2024-10-26	Hic-5 antisense oligonucleotide inhibits advanced hepatic fibrosis and steatosis in vivo 2024-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101195 PMID:39444410	研究论文	本研究探讨了Hic-5反义寡核苷酸在抑制体内晚期肝纤维化和脂肪变性中的临床应用	开发了针对Hic-5的反义寡核苷酸，并在MASH小鼠模型中验证了其治疗晚期肝纤维化和脂肪变性的潜力	NA	研究Hic-5在肝纤维化和脂肪性肝炎中的作用，并评估反义寡核苷酸作为治疗手段的潜力	人肝纤维化组织和MASH小鼠模型	NA	肝病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
542	2024-10-24	Timing, initiation and function: An in-depth exploration of the interaction network among neutrophil extracellular traps related genes in acute pancreatitis 2024-Nov-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112923 PMID:39137629	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序，深入探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）相关基因在急性胰腺炎（AP）中的相互作用网络及其关键生物行为	首次探索了NETs在AP中的时间点和发病机制，为后续研究提供了基因靶点	NA	全面探索NETs在急性胰腺炎中的关键生物行为，包括时间点和发病机制	中性粒细胞外陷阱（NETs）相关基因及其在急性胰腺炎中的作用	NA	急性胰腺炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）	NA	RNA	AP小鼠模型
543	2024-10-24	Single-cell analysis in rheumatic and allergic diseases: insights for clinical practice 2024-Nov, Nature reviews. Immunology DOI:10.1038/s41577-024-01043-3 PMID:38914790	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在风湿性和过敏性疾病临床样本中的应用，探讨了其在疾病发病机制中的作用及在临床实践中的潜在应用	结合scRNA-seq数据和细胞表面分子特征、染色质可及性及空间信息等多种细胞属性，深入理解病理机制	单细胞分析结果转化为临床实践和开发个性化治疗策略仍面临挑战	探讨单细胞分析在风湿性和过敏性疾病中的应用，并讨论其在临床实践中的应用前景	风湿性和过敏性疾病的临床样本，包括类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、系统性硬化症、过敏性呼吸道疾病和特应性皮炎	数字病理学	风湿性疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞数据	涉及多种风湿性和过敏性疾病的临床样本，包括外周血细胞和局部病变组织
544	2024-10-24	Circulating Immune Cells from Early- and Late-onset Pre-eclampsia Displays Distinct Profiles with Differential Impact on Endothelial Activation 2024-Nov-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2400196 PMID:39302114	研究论文	研究了早发型和晚发型先兆子痫患者循环免疫细胞的差异及其对内皮细胞激活的影响	首次比较了早发型和晚发型先兆子痫患者循环免疫细胞的差异，并探讨了其对内皮细胞激活的影响	研究仅限于体外实验，未涉及临床干预或长期效果的评估	探讨早发型和晚发型先兆子痫患者系统性免疫变化及其对内皮细胞激活的影响	早发型和晚发型先兆子痫患者及正常妊娠对照组的循环免疫细胞	NA	妊娠相关疾病	流式细胞术、多重检测、细胞内细胞因子染色、单细胞RNA测序	NA	血液样本	早发型先兆子痫、晚发型先兆子痫及正常妊娠对照组
545	2024-10-24	Albumin reprograms the B cell transcriptional landscape and improves neutrophil antimicrobial function in patients with decompensated cirrhosis 2024-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101184 PMID:39434891	研究论文	研究探讨了白蛋白在失代偿性肝硬化患者中对B细胞转录组景观的重新编程作用，以及其对中性粒细胞抗菌功能的影响	发现白蛋白能够促进B细胞转录组的重新编程和扩增，并改善中性粒细胞的抗菌功能，从而降低失代偿性肝硬化患者感染的发生率	研究样本量较小，且未进行随机对照临床试验，需要进一步的大规模临床研究验证	探讨白蛋白在失代偿性肝硬化患者中的免疫调节作用及其对感染发生率的影响	失代偿性肝硬化患者和健康志愿者的外周血单核细胞及中性粒细胞	NA	肝硬化	RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	RNA	共涉及20名失代偿性肝硬化患者和34名健康志愿者的外周血单核细胞，以及6名失代偿性肝硬化患者和9名健康志愿者的中性粒细胞
546	2024-10-21	Single-cell RNA sequencing and immune repertoire analysis revealed dynamic immune characteristics associated with peripheral blood during sepsis 2024-Nov-19, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150751 PMID:39357334	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和免疫组库分析，揭示了脓毒症期间外周血细胞的动态免疫特征	结合单细胞基因表达谱和B细胞受体组库分析，揭示了感染对B细胞抗原呈递能力和B细胞受体多样性的短期影响	研究仅在脓毒症小鼠模型中进行，结果的临床适用性需进一步验证	探索脓毒症期间免疫反应失调的机制并识别潜在的治疗靶点	脓毒症小鼠的外周血细胞	数字病理学	脓毒症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	脓毒症小鼠
547	2024-10-21	Genomic insights into the contribution of de novo lipogenesis to intramuscular fat deposition in chicken 2024-Nov, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2023.12.003 PMID:38065407	研究论文	研究揭示了从头脂肪生成在鸡肌肉内脂肪沉积中的作用及其基因调控机制	首次通过全基因组重测序和单细胞RNA测序揭示了脂肪酸合酶在肌肉内脂肪沉积中的关键作用，并发现从头脂肪生成是肌肉内脂肪沉积的重要贡献者	研究样本量有限，且仅针对特定品种的鸡进行研究，结果的普适性有待进一步验证	探究肌肉内脂肪沉积的调控机制，以提高鸡肉品质	黄羽鸡的肌肉内脂肪沉积	NA	NA	全基因组重测序、单细胞RNA测序、转录组测序、13C同位素示踪技术	NA	基因组数据、转录组数据	516只黄羽鸡和3只63日龄的雌性JXY鸡
548	2024-10-20	Multi-omic analysis revealed the immunological patterns and diagnostic value of exhausted T cell-derived PTTG1 in patients with psoriasis 2024-Nov-19, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150740 PMID:39342798	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了银屑病患者中耗竭T细胞来源的PTTG1的免疫学模式及其诊断价值	本研究首次揭示了耗竭T细胞来源的PTTG1在银屑病中的诊断价值，并验证了leptomycin B作为靶向PTTG1治疗银屑病的潜在药物	本研究主要基于单细胞RNA测序和机器学习方法，未涉及临床试验验证PTTG1作为诊断标志物的实际应用效果	探索银屑病的发病机制及其诊断标志物	银屑病患者的临床样本和耗竭T细胞来源的PTTG1	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、机器学习、分子对接	机器学习	基因数据	银屑病患者的临床样本
549	2024-10-19	Gamma-aminobutyric acid-mediated neuro-immune interactions in glioblastoma: Implications for prognosis and immunotherapy response 2024-Nov-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2024.123067 PMID:39322177	研究论文	研究探讨了伽马氨基丁酸（GABA）在胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响	引入了GABA相关评分模型（GABAAS），提供了新的预后指标，并揭示了GABA相关基因（如NDRG2和TIMP1）在免疫调节中的关键作用	NA	研究GABA在胶质母细胞瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响	胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的GABA及其相关基因	数字病理学	脑癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、非负矩阵分解（NMF）、免疫组化（IHC）、免疫荧光（IF）、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析	NA	基因表达数据	NA
550	2024-10-19	High-Dimensional Overdispersed Generalized Factor Model With Application to Single-Cell Sequencing Data Analysis 2024-Nov-10, Statistics in medicine IF:1.8Q1 DOI:10.1002/sim.10213 PMID:39237124	研究论文	本文提出了一种高维过度分散广义因子模型（OverGFM），用于处理高维非线性因子分析中的过度分散混合型数据	引入了一个额外的误差项来捕捉因子无法解释的过度分散，并提出了一种新的变分EM算法来解决计算挑战	NA	解决高维非线性因子模型在处理过度分散混合型数据时的不足	高维过度分散混合型数据	生物信息学	NA	单细胞测序	广义因子模型	混合型数据	NA
551	2024-10-19	Integrated analysis of single-cell transcriptome and structural biology approach reveals the dynamics changes of NP subtypes and roles of Menaquinone in attenuating intervertebral disc degeneration 2024-Nov, Journal of biomolecular structure & dynamics IF:2.7Q2 DOI:10.1080/07391102.2023.2275172 PMID:37902557	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和结构生物学方法，揭示了椎间盘退变过程中NP亚型的动态变化及甲萘醌在缓解椎间盘退变中的作用	首次报道了甲萘醌在缓解退变性NP细胞中的重要作用，并结合scRNA-seq、bulk-RNA seq和HTVS技术系统解析了IDD过程中NP亚型的纵向变化	NA	研究椎间盘退变（IDD）过程中NP细胞的异质性及其动态变化，并探索潜在的治疗药物	椎间盘退变过程中的NP细胞亚型及甲萘醌的作用	数字病理学	脊柱疾病	单细胞测序分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、差异表达分析、高通量筛选（HTVS）、分子动力学模拟	NA	转录组数据	5种NP亚群
552	2024-10-19	The opposite aging effect to single cell transcriptome profile among cell subsets 2024-Nov, Biogerontology IF:4.4Q1 DOI:10.1007/s10522-024-10138-2 PMID:39261411	研究论文	本研究探讨了不同细胞亚群中单细胞转录组谱的相反衰老效应	首次报告了衰老在不同细胞亚群中对基因表达的相反效应，并强调了在干预衰老相关基因时考虑细胞亚群的重要性	NA	研究衰老对不同细胞亚群基因表达的影响	小鼠的单细胞RNA测序数据	基因表达	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用Tabula Muris Senis数据集，包含大量小鼠的单细胞RNA测序数据
553	2024-09-27	Spatial transcriptomics of acute kidney injury 2024-Nov, Nature reviews. Nephrology DOI:10.1038/s41581-024-00899-x PMID:39322738	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
554	2024-10-17	Single-cell RNA sequencing and transcriptomic analysis reveal key genes and regulatory mechanisms in sepsis 2024-Nov, Biotechnology & genetic engineering reviews DOI:10.1080/02648725.2023.2196475 PMID:37017187	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序和转录组分析揭示了脓毒症中的关键基因及其调控机制	通过单细胞RNA测序和转录组分析，识别出与脓毒症发展相关的九个关键基因，并构建了miRNA网络和调控网络	研究主要基于生物信息学分析，未进行实验验证	深入研究脓毒症的分子发病机制，识别关键的脓毒症相关基因	脓毒症的关键基因及其调控机制	数字病理学	脓毒症	单细胞RNA测序，转录组测序	NA	基因表达数据	使用了来自GEO数据库的scRNA数据集（GSE167363）和RNA-seq数据集（GSE65682，GSE134347）
555	2024-10-16	Hunger signalling in the olfactory bulb primes exploration, food-seeking and peripheral metabolism 2024-Nov, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2024.102025 PMID:39236785	研究论文	研究探讨了嗅球中的胃饥饿素受体（GHSRs）对嗅觉功能、觅食行为和代谢的影响	首次评估了嗅球中胃饥饿素受体对嗅觉功能、觅食行为和代谢的具体机制及其影响	研究仅限于小鼠模型，结果的普遍性和在人类中的适用性尚不清楚	探讨胃饥饿素受体在嗅球中的作用及其对行为和代谢的影响	小鼠的嗅觉功能、觅食行为和代谢	NA	NA	scRNA-seq和空间转录组学	NA	NA	小鼠模型，具体数量未明确
556	2024-10-16	Localized ablative immunotherapy enhances antitumor immunity by modulating the transcriptome of tumor-infiltrating Gamma delta T cells 2024-Nov-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217267 PMID:39307410	研究论文	研究局部消融免疫疗法通过调节肿瘤浸润γδT细胞的转录组增强抗肿瘤免疫	首次使用单细胞RNA测序研究局部消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞的影响，并发现其与免疫检查点抑制剂治疗的转录组特征相似	研究仅在乳腺癌小鼠模型中进行，结果的普适性需进一步验证	探讨局部消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞转录组的影响及其在抗肿瘤免疫中的作用	肿瘤浸润γδT细胞及其在不同治疗条件下的功能动态	免疫学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	小鼠模型中的乳腺癌肿瘤样本
557	2024-10-16	Spatial Transcriptomic Signatures of Early Acute T Cell-mediated Rejection in Kidney Transplants 2024-Nov, Transplantation direct IF:1.9Q3 DOI:10.1097/TXD.0000000000001705 PMID:39399058	研究论文	研究肾脏移植中急性T细胞介导排斥反应的早期空间转录组特征	发现非T细胞因素在急性T细胞介导排斥反应中的潜在作用，并揭示了先天免疫系统在排斥反应中的作用	研究样本量较小，需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性	探讨急性T细胞介导排斥反应的早期空间转录组特征及其相关免疫机制	肾脏移植中的急性T细胞介导排斥反应	数字病理学	肾脏疾病	空间转录组学	NA	转录组数据	9天手术后的活检样本，包括疑似急性T细胞介导排斥反应和非T细胞介导排斥反应患者
558	2024-10-15	Hepatic stellate cells promote hepatocellular carcinoma development by regulating histone lactylation: Novel insights from single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analyses 2024-Nov-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217243 PMID:39260669	研究论文	本研究评估了肝细胞癌（HCC）的细胞异质性和分子机制，通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了肝星状细胞（HSC）在HCC发展中的关键作用	首次揭示了肝星状细胞通过调节组蛋白乳酸化在肝细胞癌发展中的重要作用	NA	评估肝细胞癌的细胞异质性和分子机制	肝星状细胞和肝细胞癌细胞	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学分析	NA	RNA测序数据	从公共数据库收集的数据
559	2024-10-15	Identification of SPP1+ macrophages in promoting cancer stemness via vitronectin and CCL15 signals crosstalk in liver cancer 2024-Nov-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217199 PMID:39216547	研究论文	研究分析了肝癌患者的单细胞RNA测序数据，发现SPP1+巨噬细胞通过vitronectin和CCL15信号的交叉对话促进肝癌干细胞特性	首次揭示了SPP1+巨噬细胞通过vitronectin依赖的旁分泌机制上调肿瘤干细胞特性，并建立了巨噬细胞与肿瘤干细胞之间的正反馈回路	研究样本仅限于12名肝癌患者，可能影响结果的普适性	探讨巨噬细胞在肝癌进展中的作用机制，为肝癌治疗提供新思路	肝癌患者的单细胞RNA测序数据，SPP1+巨噬细胞及其与肝癌干细胞的关系	NA	肝癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	12名肝癌患者
560	2024-10-12	Pivotal role of JNK protein in the therapeutic efficacy of parthenolide against breast cancer: Novel and comprehensive evidences from network pharmacology, single-cell RNA sequencing and metabolomics 2024-Nov, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.135209 PMID:39244135	研究论文	本研究通过整合网络药理学、单细胞RNA测序和代谢组学，评估了小白菊内酯（PTL）在乳腺癌（BC）中的疗效和治疗机制	本研究首次综合运用网络药理学、单细胞RNA测序和代谢组学，揭示了JNK蛋白在PTL治疗乳腺癌中的关键作用，并提出了新的治疗策略	本研究主要基于体外和体内模型进行验证，未来需要更多临床数据支持	评估小白菊内酯在乳腺癌中的疗效和治疗机制	小白菊内酯、JNK蛋白、乳腺癌	生物信息学	乳腺癌	单细胞RNA测序、代谢组学	NA	RNA、代谢物	70个治疗靶点，16个核心靶点