单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 582 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2024-10-21 |
Genomic insights into the contribution of de novo lipogenesis to intramuscular fat deposition in chicken
2024-Nov, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.12.003
PMID:38065407
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研究论文 | 研究揭示了从头脂肪生成在鸡肌肉内脂肪沉积中的作用及其基因调控机制 | 首次通过全基因组重测序和单细胞RNA测序揭示了脂肪酸合酶在肌肉内脂肪沉积中的关键作用，并发现从头脂肪生成是肌肉内脂肪沉积的重要贡献者 | 研究样本量有限，且仅针对特定品种的鸡进行研究，结果的普适性有待进一步验证 | 探究肌肉内脂肪沉积的调控机制，以提高鸡肉品质 | 黄羽鸡的肌肉内脂肪沉积 | NA | NA | 全基因组重测序、单细胞RNA测序、转录组测序、13C同位素示踪技术 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 516只黄羽鸡和3只63日龄的雌性JXY鸡 |
| 542 | 2024-10-20 |
Multi-omic analysis revealed the immunological patterns and diagnostic value of exhausted T cell-derived PTTG1 in patients with psoriasis
2024-Nov-19, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150740
PMID:39342798
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了银屑病患者中耗竭T细胞来源的PTTG1的免疫学模式及其诊断价值 | 本研究首次揭示了耗竭T细胞来源的PTTG1在银屑病中的诊断价值，并验证了leptomycin B作为靶向PTTG1治疗银屑病的潜在药物 | 本研究主要基于单细胞RNA测序和机器学习方法，未涉及临床试验验证PTTG1作为诊断标志物的实际应用效果 | 探索银屑病的发病机制及其诊断标志物 | 银屑病患者的临床样本和耗竭T细胞来源的PTTG1 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、机器学习、分子对接 | 机器学习 | 基因数据 | 银屑病患者的临床样本 |
| 543 | 2024-10-19 |
Gamma-aminobutyric acid-mediated neuro-immune interactions in glioblastoma: Implications for prognosis and immunotherapy response
2024-Nov-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123067
PMID:39322177
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研究论文 | 研究探讨了伽马氨基丁酸（GABA）在胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 引入了GABA相关评分模型（GABAAS），提供了新的预后指标，并揭示了GABA相关基因（如NDRG2和TIMP1）在免疫调节中的关键作用 | NA | 研究GABA在胶质母细胞瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的GABA及其相关基因 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、非负矩阵分解（NMF）、免疫组化（IHC）、免疫荧光（IF）、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 544 | 2024-10-19 |
High-Dimensional Overdispersed Generalized Factor Model With Application to Single-Cell Sequencing Data Analysis
2024-Nov-10, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.10213
PMID:39237124
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研究论文 | 本文提出了一种高维过度分散广义因子模型（OverGFM），用于处理高维非线性因子分析中的过度分散混合型数据 | 引入了一个额外的误差项来捕捉因子无法解释的过度分散，并提出了一种新的变分EM算法来解决计算挑战 | NA | 解决高维非线性因子模型在处理过度分散混合型数据时的不足 | 高维过度分散混合型数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 广义因子模型 | 混合型数据 | NA |
| 545 | 2024-10-19 |
Integrated analysis of single-cell transcriptome and structural biology approach reveals the dynamics changes of NP subtypes and roles of Menaquinone in attenuating intervertebral disc degeneration
2024-Nov, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2023.2275172
PMID:37902557
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和结构生物学方法，揭示了椎间盘退变过程中NP亚型的动态变化及甲萘醌在缓解椎间盘退变中的作用 | 首次报道了甲萘醌在缓解退变性NP细胞中的重要作用，并结合scRNA-seq、bulk-RNA seq和HTVS技术系统解析了IDD过程中NP亚型的纵向变化 | NA | 研究椎间盘退变（IDD）过程中NP细胞的异质性及其动态变化，并探索潜在的治疗药物 | 椎间盘退变过程中的NP细胞亚型及甲萘醌的作用 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞测序分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、差异表达分析、高通量筛选（HTVS）、分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | 5种NP亚群 |
| 546 | 2024-10-19 |
The opposite aging effect to single cell transcriptome profile among cell subsets
2024-Nov, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-024-10138-2
PMID:39261411
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研究论文 | 本研究探讨了不同细胞亚群中单细胞转录组谱的相反衰老效应 | 首次报告了衰老在不同细胞亚群中对基因表达的相反效应，并强调了在干预衰老相关基因时考虑细胞亚群的重要性 | NA | 研究衰老对不同细胞亚群基因表达的影响 | 小鼠的单细胞RNA测序数据 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Tabula Muris Senis数据集，包含大量小鼠的单细胞RNA测序数据 |
| 547 | 2024-09-27 |
Spatial transcriptomics of acute kidney injury
2024-Nov, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-024-00899-x
PMID:39322738
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 548 | 2024-10-17 |
Single-cell RNA sequencing and transcriptomic analysis reveal key genes and regulatory mechanisms in sepsis
2024-Nov, Biotechnology & genetic engineering reviews
DOI:10.1080/02648725.2023.2196475
PMID:37017187
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和转录组分析揭示了脓毒症中的关键基因及其调控机制 | 通过单细胞RNA测序和转录组分析，识别出与脓毒症发展相关的九个关键基因，并构建了miRNA网络和调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析，未进行实验验证 | 深入研究脓毒症的分子发病机制，识别关键的脓毒症相关基因 | 脓毒症的关键基因及其调控机制 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的scRNA数据集（GSE167363）和RNA-seq数据集（GSE65682，GSE134347） |
| 549 | 2024-10-16 |
Hunger signalling in the olfactory bulb primes exploration, food-seeking and peripheral metabolism
2024-Nov, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.102025
PMID:39236785
|
研究论文 | 研究探讨了嗅球中的胃饥饿素受体（GHSRs）对嗅觉功能、觅食行为和代谢的影响 | 首次评估了嗅球中胃饥饿素受体对嗅觉功能、觅食行为和代谢的具体机制及其影响 | 研究仅限于小鼠模型，结果的普遍性和在人类中的适用性尚不清楚 | 探讨胃饥饿素受体在嗅球中的作用及其对行为和代谢的影响 | 小鼠的嗅觉功能、觅食行为和代谢 | NA | NA | scRNA-seq和空间转录组学 | NA | NA | 小鼠模型，具体数量未明确 |
| 550 | 2024-10-16 |
Localized ablative immunotherapy enhances antitumor immunity by modulating the transcriptome of tumor-infiltrating Gamma delta T cells
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217267
PMID:39307410
|
研究论文 | 研究局部消融免疫疗法通过调节肿瘤浸润γδT细胞的转录组增强抗肿瘤免疫 | 首次使用单细胞RNA测序研究局部消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞的影响，并发现其与免疫检查点抑制剂治疗的转录组特征相似 | 研究仅在乳腺癌小鼠模型中进行，结果的普适性需进一步验证 | 探讨局部消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞转录组的影响及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肿瘤浸润γδT细胞及其在不同治疗条件下的功能动态 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的乳腺癌肿瘤样本 |
| 551 | 2024-10-16 |
Spatial Transcriptomic Signatures of Early Acute T Cell-mediated Rejection in Kidney Transplants
2024-Nov, Transplantation direct
IF:1.9Q3
DOI:10.1097/TXD.0000000000001705
PMID:39399058
|
研究论文 | 研究肾脏移植中急性T细胞介导排斥反应的早期空间转录组特征 | 发现非T细胞因素在急性T细胞介导排斥反应中的潜在作用，并揭示了先天免疫系统在排斥反应中的作用 | 研究样本量较小，需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 | 探讨急性T细胞介导排斥反应的早期空间转录组特征及其相关免疫机制 | 肾脏移植中的急性T细胞介导排斥反应 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 9天手术后的活检样本，包括疑似急性T细胞介导排斥反应和非T细胞介导排斥反应患者 |
| 552 | 2024-10-15 |
Hepatic stellate cells promote hepatocellular carcinoma development by regulating histone lactylation: Novel insights from single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analyses
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217243
PMID:39260669
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研究论文 | 本研究评估了肝细胞癌（HCC）的细胞异质性和分子机制，通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了肝星状细胞（HSC）在HCC发展中的关键作用 | 首次揭示了肝星状细胞通过调节组蛋白乳酸化在肝细胞癌发展中的重要作用 | NA | 评估肝细胞癌的细胞异质性和分子机制 | 肝星状细胞和肝细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学分析 | NA | RNA测序数据 | 从公共数据库收集的数据 |
| 553 | 2024-10-15 |
Identification of SPP1+ macrophages in promoting cancer stemness via vitronectin and CCL15 signals crosstalk in liver cancer
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217199
PMID:39216547
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研究论文 | 研究分析了肝癌患者的单细胞RNA测序数据，发现SPP1+巨噬细胞通过vitronectin和CCL15信号的交叉对话促进肝癌干细胞特性 | 首次揭示了SPP1+巨噬细胞通过vitronectin依赖的旁分泌机制上调肿瘤干细胞特性，并建立了巨噬细胞与肿瘤干细胞之间的正反馈回路 | 研究样本仅限于12名肝癌患者，可能影响结果的普适性 | 探讨巨噬细胞在肝癌进展中的作用机制，为肝癌治疗提供新思路 | 肝癌患者的单细胞RNA测序数据，SPP1+巨噬细胞及其与肝癌干细胞的关系 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 12名肝癌患者 |
| 554 | 2024-10-12 |
Pivotal role of JNK protein in the therapeutic efficacy of parthenolide against breast cancer: Novel and comprehensive evidences from network pharmacology, single-cell RNA sequencing and metabolomics
2024-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.135209
PMID:39244135
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、单细胞RNA测序和代谢组学，评估了小白菊内酯（PTL）在乳腺癌（BC）中的疗效和治疗机制 | 本研究首次综合运用网络药理学、单细胞RNA测序和代谢组学，揭示了JNK蛋白在PTL治疗乳腺癌中的关键作用，并提出了新的治疗策略 | 本研究主要基于体外和体内模型进行验证，未来需要更多临床数据支持 | 评估小白菊内酯在乳腺癌中的疗效和治疗机制 | 小白菊内酯、JNK蛋白、乳腺癌 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | RNA、代谢物 | 70个治疗靶点，16个核心靶点 |
| 555 | 2024-10-12 |
Knock-out of CD73 delays the onset of HR-negative breast cancer by reprogramming lipid metabolism and is associated with increased tumor mutational burden
2024-Nov, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.102035
PMID:39304062
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研究论文 | 研究探讨了CD73在HR阴性乳腺癌中的作用，通过代谢重编程影响脂质代谢，并增加肿瘤突变负担 | 首次揭示了CD73在乳腺癌发生过程中的重要作用，特别是通过调节脂质代谢和增加肿瘤突变负担来影响HR阴性乳腺癌的发展 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据集，需要进一步在人类样本中验证 | 探讨CD73在乳腺癌发生中的作用及其对脂质代谢和肿瘤突变负担的影响 | CD73在HR阴性乳腺癌中的作用及其对脂质代谢和肿瘤突变负担的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序、免疫组化、蛋白质印迹、气相色谱-电子电离-质谱 | NA | RNA、蛋白质、脂质 | 小鼠模型、公共数据集中的乳腺癌组织和细胞系 |
| 556 | 2024-10-10 |
Sequencing-based study of neural induction of human dental pulp stem cells
2024-Nov, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01121-7
PMID:39210197
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研究论文 | 本研究评估了通过神经诱导的人类牙髓干细胞（DPSCs）获得的神经谱系细胞的细胞成分和分化途径 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）详细研究了DPSCs的神经诱导特性及其分化状态 | 研究主要集中在体外培养的DPSCs，未涉及体内实验 | 评估人类牙髓干细胞在神经诱导后的细胞成分和分化途径 | 人类牙髓干细胞（DPSCs）及其神经诱导后的细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 人类牙髓干细胞（DPSCs）的单细胞样本 |
| 557 | 2024-10-08 |
The heterogeneity of breast cancer metastasis: a bioinformatics analysis utilizing single-cell RNA sequencing data
2024-Nov, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-024-07428-1
PMID:38992286
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据分析了乳腺癌转移的异质性 | 利用单细胞RNA测序技术区分转移的分子特征并识别患者预后的预测基因 | 没有单一基因或通路能完全解释肿瘤转移的机制 | 探索乳腺癌原发肿瘤组织与淋巴结和肝脏转移细胞之间的基因表达差异 | 乳腺癌原发肿瘤组织与淋巴结和肝脏转移细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 558 | 2024-10-06 |
Immune escape between endoplasmic reticulum stress-related cancer cells and exhausted CD8+T cells leads to neoadjuvant chemotherapy resistance in ovarian cancer
2024-Nov-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150686
PMID:39278093
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研究论文 | 研究探讨了新辅助化疗对高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤细胞和免疫细胞的影响 | 揭示了新辅助化疗抵抗的机制，并提出了针对ERS标记HSP90B1和免疫逃逸标记MDK的治疗策略 | 研究样本量较小，仅涉及11名患者 | 探索新辅助化疗对高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤微环境中肿瘤细胞和免疫细胞的影响 | 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤细胞和CD8+T细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11名高级别浆液性卵巢癌患者 |
| 559 | 2024-10-04 |
The concept of onychodermis containing onychofibroblasts has histological (microanatomical), immunohistochemical as well as molecular basis
2024-Nov, Journal of cutaneous pathology
IF:1.6Q3
DOI:10.1111/cup.14696
PMID:39044464
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研究论文 | 本文探讨了包含onychofibroblasts的onychodermis的概念，并提供了其组织学、免疫组织化学和分子基础的证据 | 首次通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，揭示了onychofibroblasts在onychodermis中表达的关键基因，这些基因与指甲形成和相关疾病有关 | NA | 研究onychodermis和onychofibroblasts在指甲发育和病理中的作用 | onychodermis和onychofibroblasts的组织学、免疫组织化学和分子特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序、原位杂交 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 560 | 2024-10-04 |
Gastroduodenal injury and repair mechanisms
2024-Nov-01, Current opinion in gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/MOG.0000000000001049
PMID:38935320
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综述 | 本文综述了胃十二指肠黏膜损伤后的修复机制 | 重点介绍了黏膜保护的新机制，包括腺病毒疗法、植物提取物和RNA技术在黏膜再生中的应用 | 缺乏对急性浅表性损伤修复机制的深入研究 | 探讨胃十二指肠黏膜损伤后的修复机制 | 胃十二指肠黏膜损伤及其修复机制 | NA | NA | RNA测序 | NA | NA | NA |