单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 583 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-11-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Metabolic Stress-Dependent Activation of Cardiac Macrophages in a Model of Dyslipidemia-Induced Diastolic Dysfunction
2024-Nov-05, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了高脂饮食诱导的ApoE敲除小鼠模型中心脏细胞的表达谱，揭示了代谢应激对心脏巨噬细胞的激活作用及其在舒张功能障碍中的作用 | 首次揭示了代谢应激通过内质网应激途径直接激活心脏巨噬细胞，并提出了钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂作为治疗HFpEF特定表型的潜在疗法 | NA | 探讨代谢应激对心脏炎症细胞的影响，特别是巨噬细胞，并评估钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂的潜在治疗效果 | ApoE敲除小鼠模型中的心脏细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ApoE敲除小鼠 |
| 522 | 2024-11-06 |
Multiple Machine Learning Identifies Key Gene PHLDA1 Suppressing NAFLD Progression
2024-Nov-04, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02164-6
PMID:39496918
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研究论文 | 本研究通过多重机器学习策略识别出关键基因PHLDA1，该基因在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展中起抑制作用 | 本研究首次通过多重机器学习策略识别出PHLDA1基因，并验证其在NAFLD进展中的抑制作用 | 本研究主要基于细胞和小鼠模型进行验证，尚未在人体临床试验中验证PHLDA1的疗效 | 识别和验证新的NAFLD生物标志物，以促进其预测、预防和个性化治疗 | NAFLD相关基因和免疫细胞 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CIBERSORT分析 | 多种机器学习模型 | 基因表达数据 | 三个NAFLD数据集中的23个重叠差异表达基因（DEGs），以及细胞和小鼠NAFLD模型 |
| 523 | 2024-11-06 |
The study of Alzheimer's disease risk diagnosis based on natural killer cell marker genes in the multi-omics data
2024-Nov-03, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877241295316
PMID:39497294
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研究论文 | 研究基于自然杀伤细胞标记基因的多组学数据进行阿尔茨海默病风险诊断 | 提出了一种新的特征选择算法ADGCN，并基于17个特征基因构建了诊断模型 | NA | 识别与阿尔茨海默病相关的特征基因，构建诊断模型并探索其潜在的生物学机制 | 自然杀伤细胞标记基因 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | ADGCN-XGBoost | 多组学数据 | NA |
| 524 | 2024-11-06 |
Single-cell transcriptomics reveals IRF7 regulation of the tumor microenvironment in isocitrate dehydrogenase wild-type glioma
2024-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.754
PMID:39492838
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组测序分析了IDH突变型和野生型胶质瘤患者的细胞亚群基因表达调控网络，揭示了IRF7在IDH野生型胶质瘤微环境中的调控作用 | 首次系统地建立了IDH转录活性在胶质瘤中的单细胞水平调控机制，并绘制了相应的细胞图谱 | NA | 探讨IDH突变型和野生型胶质瘤的基因表达调控网络及其在肿瘤微环境中的作用 | IDH突变型和野生型胶质瘤患者的细胞亚群 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | 机器学习模型 | RNA | IDH突变型和野生型胶质瘤患者 |
| 525 | 2024-11-04 |
Deciphering craniopharyngioma subtypes: Single-cell analysis of tumor microenvironment and immune networks
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111068
PMID:39483146
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了颅咽管瘤（包括成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型）的肿瘤微环境和免疫网络 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型颅咽管瘤的细胞组成、肿瘤组织多样性和细胞间相互作用 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示颅咽管瘤的细胞组成和免疫网络 | 成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型颅咽管瘤 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 526 | 2024-11-04 |
Investigation of human aging at the single-cell level
2024-Nov, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102530
PMID:39395577
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用 | 本文讨论了多种单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用，并探讨了多组学层在单细胞中的结合以及与空间转录组学和质谱等先进方法的整合 | NA | 探讨单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用 | 人类衰老的机制和相关疾病 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA |
| 527 | 2024-11-04 |
Revealing molecular mechanisms of early-onset tongue cancer by spatial transcriptomics
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76044-2
PMID:39482351
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了早发性舌癌的分子机制 | 首次成功整合了来自FF和FFPE样本的空间转录组学数据，并揭示了早发性舌癌的独特特征 | 样本量较小，仅包括9名患者 | 探讨早发性舌癌的分子机制及其与老年患者的差异 | 早发性舌癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 舌癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 9名舌鳞状细胞癌患者，分为年轻组（5名）和老年组（4名） |
| 528 | 2024-11-04 |
Characterization of metastasis-specific macrophages in colorectal cancer for prognosis prediction and immunometabolic remodeling
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77248-2
PMID:39487182
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研究论文 | 本研究开发了一种预测结直肠癌肝转移和预后的预测模型，通过识别特定的巨噬细胞亚群 | 首次基于EEF1G+巨噬细胞基因特征构建了8基因风险模型EMGS，用于预测结直肠癌肝转移患者的预后 | 研究主要基于公开数据库的数据，缺乏临床验证 | 预测结直肠癌肝转移患者的预后并识别潜在的治疗靶点 | 结直肠癌肝转移患者的巨噬细胞亚群及其基因特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 使用了GSE231559、TCGA和GEO数据库的数据 |
| 529 | 2024-11-04 |
Mechanism differences in the start time of sublingual immunotherapy in a mouse allergic airway inflammation model
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78062-6
PMID:39487347
|
研究论文 | 研究了在过敏性气道炎症小鼠模型中，舌下免疫疗法（SLIT）的启动时间机制差异 | 首次详细研究了SLIT在预防性和治疗性模型中的时机差异及其对免疫耐受的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 评估SLIT在预防性和治疗性模型中的疗效及其机制 | 过敏性气道炎症小鼠模型中的SLIT效果 | NA | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和T细胞受体测序 | NA | RNA序列和T细胞受体序列 | 小鼠样本 |
| 530 | 2024-11-04 |
Genetic association between epilepsy and gliomas: Insights from Mendelian randomization and single-cell transcriptomic analyses
2024-Nov-01, Epilepsy & behavior : E&B
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.yebeh.2024.110114
PMID:39488096
|
研究论文 | 研究探讨了癫痫与胶质瘤之间的遗传关联及其生物学机制 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞转录组分析揭示了癫痫与胶质瘤之间的潜在因果关系 | NA | 探讨癫痫与胶质瘤之间的遗传关联及其生物学机制 | 癫痫与胶质瘤的遗传变异及其在胶质瘤进展中的作用 | NA | 脑肿瘤 | 全基因组关联研究、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的GSE221534数据集进行分析 |
| 531 | 2024-11-02 |
Genomic Profiling and Immune Phenotyping of Neuroendocrine Bladder Cancer
2024-Nov-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1277
PMID:39226396
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研究论文 | 研究神经内分泌膀胱癌的基因组特征和免疫表型 | 揭示了神经内分泌膀胱癌的免疫微环境特征，并发现混合型神经内分泌膀胱癌具有免疫浸润表型 | 样本量较小，特别是单细胞RNA测序样本仅有一个 | 探索神经内分泌膀胱癌的免疫治疗潜力 | 神经内分泌膀胱癌的基因组和免疫表型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 基因组分析、转录组分析、单细胞RNA测序、免疫组化分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA数据、图像数据 | 基因组数据19例，转录组数据3例，单细胞RNA测序1例，免疫组化分析34例 |
| 532 | 2024-11-02 |
Single-Cell View of Tumor Microenvironment Gradients in Pleural Mesothelioma
2024-Nov-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-0017
PMID:38959428
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术构建了胸膜间皮瘤肿瘤微环境的综合细胞图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术构建了胸膜间皮瘤肿瘤微环境的图谱，并发现了与不良疾病结局相关的四个癌症内在程序和一个新的胎儿样内皮细胞群体 | NA | 提高对胸膜间皮瘤肿瘤微环境的理解，以改进免疫治疗策略 | 胸膜间皮瘤肿瘤微环境中的细胞群体及其基因表达程序 | 数字病理学 | 胸膜间皮瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54个表达程序和多个细胞群体 |
| 533 | 2024-10-30 |
New evidence of vascular defects in neurodegenerative diseases revealed by single cell RNA sequencing
2024-Nov-06, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20241658
PMID:39469930
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了神经退行性疾病中的血管缺陷，并总结了中枢神经系统血管结构和组织的最新进展 | 首次系统性地总结了神经退行性疾病中血管细胞类型或亚型的疾病特异性改变，并提出了血管缺陷可能是神经退行性疾病的早期共同特征 | 血管缺陷在疾病进展中的发生和作用仍未充分探索 | 揭示神经退行性疾病中的血管缺陷及其对神经退化的影响 | 神经退行性疾病中的血管细胞类型和结构 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠、健康个体和神经退行性疾病患者的样本 |
| 534 | 2024-10-30 |
A multidimensional analysis reveals distinct immune phenotypes and the composition of immune aggregates in pediatric acute myeloid leukemia
2024-Nov, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02381-w
PMID:39187578
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研究论文 | 本文通过多维分析揭示了儿童急性髓系白血病（AML）中不同的免疫表型和免疫聚集物的组成 | 本文首次在儿童AML中进行了多维度的免疫微环境分析，揭示了免疫浸润骨髓的特征和T细胞网络的组成 | 研究仅限于儿童AML病例，未涉及成人AML或其他类型的白血病 | 了解儿童AML骨髓中T细胞和其他微环境群体的组成、表型和空间组织，为未来的免疫治疗试验提供信息 | 儿童急性髓系白血病（AML）患者的骨髓免疫微环境 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 近三分之一的儿童AML病例 |
| 535 | 2024-10-30 |
Substantive Similarities Between Synovial Fluid and Synovial Tissue T cells in Inflammatory Arthritis Via Single-Cell RNA and T Cell Receptor Sequencing
2024-Nov, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42949
PMID:38973560
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，研究了炎症性关节炎中滑液和滑膜组织T细胞的实质相似性 | 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序直接比较了滑液和滑膜组织中的记忆T细胞，揭示了它们在TCR库和T细胞亚群组成上的相似性 | 研究样本仅限于六名炎症性关节炎患者，可能限制了结果的普适性 | 探讨滑液中的T细胞是否能真实反映滑膜组织中的T细胞群体 | 滑液和滑膜组织中的记忆T细胞 | NA | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | RNA | 六名炎症性关节炎患者 |
| 536 | 2024-10-29 |
Bulk and single-cell RNA-seq analyses reveal canonical RNA editing associated with microglia homeostasis and its role in sepsis-associated encephalopathy
2024-Nov-12, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 研究分析了大量和小鼠脑组织及小胶质细胞样本的单细胞RNA测序数据，探讨了与小胶质细胞稳态相关的经典RNA编辑及其在脓毒症相关脑病中的作用 | 首次揭示了小胶质细胞稳态与RNA编辑在脓毒症相关脑病中的关系，并提供了新的见解 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨小胶质细胞稳态与RNA编辑在脓毒症相关脑病中的关系 | 小鼠脑组织及小胶质细胞样本 | 数字病理学 | 脓毒症相关脑病 | RNA测序 | NA | RNA | 107个脑组织和小胶质细胞样本 |
| 537 | 2024-10-29 |
Neuron-glia crosstalk and inflammatory mediators in migraine pathophysiology
2024-Nov-12, Neuroscience
IF:2.9Q2
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综述 | 本文综述了偏头痛病理生理学中神经炎症机制的细胞和分子层面 | 介绍了PBR28-靶向成像和单细胞测序等新技术在理解偏头痛神经炎症机制中的应用 | NA | 探讨偏头痛的神经炎症机制及其在个性化治疗中的应用 | 偏头痛的神经炎症机制，包括细胞和分子层面的研究 | NA | 偏头痛 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 538 | 2024-10-26 |
In situ reprogramming of cardiac fibroblasts into cardiomyocytes in mouse heart with chemicals
2024-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-024-01308-6
PMID:38890526
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研究论文 | 研究使用化学混合物在心脏原位将成纤维细胞重编程为心肌细胞 | 首次在全心脏水平上验证了使用小分子混合物诱导成纤维细胞原位重编程为心肌细胞的可行性 | NA | 探索化学混合物在心脏原位重编程成纤维细胞为心肌细胞的效果 | 小鼠心脏中的成纤维细胞和心肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 图像 | 两种遗传标记的小鼠 |
| 539 | 2024-10-26 |
Tongmai Zhuke decoction restrains the inflammatory reaction of macrophages for carotid artery atherosclerosis by up-regulating lincRNA-Cox2
2024-Nov, Biotechnology & genetic engineering reviews
DOI:10.1080/02648725.2023.2196489
PMID:37013943
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研究论文 | 探讨通脉逐瘀汤通过上调lincRNA-Cox2抑制巨噬细胞炎症反应，从而治疗颈动脉粥样硬化的机制 | 发现通脉逐瘀汤通过上调lincRNA-Cox2抑制巨噬细胞炎症反应，为颈动脉粥样硬化的治疗提供了新的机制 | 研究仅基于体外实验数据，缺乏体内实验验证 | 探索通脉逐瘀汤治疗颈动脉粥样硬化的分子机制 | 颈动脉粥样硬化中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两组深度转录组数据和两组单细胞RNA测序数据 |
| 540 | 2024-10-26 |
Spatial Transcriptomic Approach to Understanding Coronary Atherosclerotic Plaque Stability
2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320330
PMID:39234691
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研究论文 | 研究使用空间转录组学方法探讨冠状动脉粥样硬化斑块的稳定性 | 采用空间转录组学技术，结合GeoMx空间分析平台和全转录组图谱，对冠状动脉斑块进行细胞形态和空间转录组分析，揭示了斑块稳定性和不稳定性中的细胞特异性和区域性转录变化 | 研究样本量较小，仅包括5名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨冠状动脉粥样硬化斑块稳定性的分子机制 | 冠状动脉斑块的稳定性和不稳定性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 5名患者 |