单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 659 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-11-13 |
Interpretable spatially aware dimension reduction of spatial transcriptomics with STAMP
2024-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02463-8
PMID:39407016
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STAMP的空间感知维度缩减方法，用于空间转录组学数据的高维基因表达测量 | STAMP基于深度生成模型，能够返回生物学上有意义的低维空间主题和相关基因模块，适用于多种数据类型和样本 | NA | 开发一种可解释的空间感知维度缩减方法，以获得空间转录组学数据的有意义的低维表示 | 空间转录组学数据，包括单个切片、多个切片、不同技术以及时间序列数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度生成模型 | NA | 基因表达数据 | 超过500,000个细胞 |
| 522 | 2024-11-12 |
Dissecting L-glutamine metabolism in acute myeloid leukemia: single-cell insights and therapeutic implications
2024-Nov-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05779-3
PMID:39506790
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了急性髓系白血病中L-谷氨酰胺代谢相关基因对疾病进展的影响 | 揭示了CD34+前B细胞中谷氨酰胺相关活动的增加，并发现了与AML进展相关的10个基因，包括CCL5和CD52，这些基因可能是潜在的治疗靶点 | NA | 深入理解急性髓系白血病的生物学机制，并探索新的治疗策略 | 急性髓系白血病患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 血液癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自AML患者的单细胞RNA测序数据 |
| 523 | 2024-11-12 |
γδ T17 Cells Regulate the Acute Antiviral Response of NK Cells in HSV-1-Infected Corneas
2024-Nov-04, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.13.16
PMID:39504049
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研究论文 | 研究γδ T17细胞在HSV-1感染的角膜中对NK细胞急性抗病毒反应的调节作用 | 首次揭示了γδ T17细胞在HSV-1感染的角膜中促进NK细胞积累，并通过IL-17A信号通路调节NK细胞的功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究γδ T细胞在HSV-1感染的角膜中对NK细胞的调节作用 | γδ T细胞和NK细胞在HSV-1感染角膜中的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、流式细胞术、多重分析 | NA | RNA | CD57Bl/6 (野生型[WT])、TCRδ-/-、IFN-γ-/-小鼠，每组若干只 |
| 524 | 2024-11-12 |
PINK1/Parkin-Mediated Mitophagy Ameliorates Mitochondrial Dysfunction in Lacrimal Gland Acinar Cells During Aging
2024-Nov-04, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.13.12
PMID:39504053
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研究论文 | 研究了PINK1/Parkin介导的线粒体自噬在衰老过程中对泪腺腺泡细胞线粒体功能障碍的改善作用 | 首次揭示了PINK1/Parkin介导的线粒体自噬在衰老过程中对泪腺腺泡细胞的保护作用 | 仅使用了年轻和中年的C57BL/6J小鼠进行研究，缺乏更广泛年龄段的数据 | 探讨衰老过程中泪腺腺泡细胞线粒体功能障碍的机制及线粒体自噬的作用 | 泪腺腺泡细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 蛋白质表达数据 | 年轻 (6周) 和中年 (12个月) 的雄性C57BL/6J小鼠 |
| 525 | 2024-11-10 |
Multi-omics reveal immune microenvironment alterations in multiple myeloma and its precursor stages
2024-11-06, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-024-01172-x
PMID:39505839
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研究论文 | 本研究系统地描述了多发性骨髓瘤及其前体阶段的肿瘤免疫微环境变化 | 首次全面分析了从单克隆丙种球蛋白病未定性（MGUS）和冒烟型多发性骨髓瘤（SMM）到新诊断多发性骨髓瘤的肿瘤免疫微环境变化 | NA | 系统地表征多发性骨髓瘤及其前体阶段的肿瘤免疫微环境和肿瘤-免疫相互作用 | 多发性骨髓瘤及其前体阶段的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | CIBERSORT、质谱流式细胞术（CyTOF）和单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 包括健康供体在内的多个样本 |
| 526 | 2024-11-09 |
Single-Cell Multi-Dimensional data analysis reveals the role of ARL4C in driving rheumatoid arthritis progression and Macrophage polarization dynamics
2024-Nov-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112987
PMID:39182267
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研究论文 | 研究揭示了ARL4C在驱动类风湿性关节炎进展和巨噬细胞极化动态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和Bulk RNA测序数据的综合分析，发现激活的成纤维样滑膜细胞（FLSs）中ARL4C的高表达，并证明了ARL4C在RA FLSs中的关键作用 | NA | 探讨ARL4C在类风湿性关节炎进展中的作用及其对巨噬细胞极化的影响 | 成纤维样滑膜细胞（FLSs）和巨噬细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和Bulk RNA测序（Bulk-seq） | NA | RNA | 来自类风湿性关节炎（RA）、骨关节炎（OA）和创伤患者的成纤维样滑膜细胞（FLSs） |
| 527 | 2024-11-09 |
CD19+CD73+ B cells infiltration indicates poor prognosis and unfavorable responses to immunotherapy in gastric cancer
2024-Nov-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113002
PMID:39213870
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研究论文 | 研究探讨了CD73在胃癌患者B细胞中的表达及其功能机制 | 发现了CD19+CD73+ B细胞在胃癌中的高浸润与不良预后和免疫治疗反应减弱之间的关联 | 研究样本量有限，仅包括390名胃癌患者 | 探索CD73在胃癌患者B细胞中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 胃癌患者的CD19+CD73+ B细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 双免疫组化染色、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 390名胃癌患者和8名胃癌患者的肿瘤及非肿瘤组织样本 |
| 528 | 2024-11-09 |
Molecular mechanisms promoting long-term cytopenia after BCMA CAR-T therapy in multiple myeloma
2024-11-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023012522
PMID:39058976
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研究论文 | 研究了BCMA CAR-T疗法在多发性骨髓瘤患者中引起的长期细胞减少的分子机制 | 首次评估了BCMA CAR-T细胞对造血干细胞和祖细胞分化的旁分泌效应，并发现其通过上调早期造血分化相关的转录因子导致细胞成熟停滞 | 研究样本量较小，且未探讨所有可能的分子机制 | 探讨BCMA CAR-T疗法在多发性骨髓瘤患者中引起长期细胞减少的机制，并寻找减轻这种毒性的潜在治疗方法 | 接受BCMA CAR-T细胞治疗的48名多发性骨髓瘤患者 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 48名患者 |
| 529 | 2024-11-09 |
Low-intensity focused ultrasound stimulation promotes stroke recovery via astrocytic HMGB1 and CAMK2N1 in mice
2024-Nov-05, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2023-002614
PMID:38191183
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研究论文 | 研究低强度聚焦超声刺激通过星形胶质细胞中的HMGB1和CAMK2N1促进小鼠中风恢复的机制 | 首次揭示了低强度聚焦超声刺激通过上调HMGB1和下调CAMK2N1在星形胶质细胞亚群中促进中风后血管生成和突触生成的机制 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨低强度聚焦超声刺激在中风恢复中的细胞和分子机制 | 小鼠中风模型中的星形胶质细胞 | 神经科学 | 中风 | 低强度聚焦超声刺激、激光散斑成像、电生理记录、iTRAQ蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、荧光原位杂交、Western blot | NA | 图像、电生理数据、蛋白质表达数据、基因表达数据 | 成年雄性小鼠 |
| 530 | 2024-11-09 |
Olfr2-positive macrophages originate from monocytes proliferate in situ and present a pro-inflammatory foamy-like phenotype
2024-Nov-05, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae153
PMID:39229899
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研究论文 | 研究了Olfr2阳性血管巨噬细胞的功能表型和起源，发现这些细胞起源于单核细胞，并在动脉粥样硬化早期积累，表现出增殖和促炎潜力 | 首次揭示了Olfr2阳性血管巨噬细胞起源于单核细胞，并在动脉粥样硬化早期积累，具有增殖和促炎潜力 | 研究主要基于Apoe-/-小鼠模型，结果的普适性需要进一步验证 | 探讨Olfr2阳性血管巨噬细胞在动脉粥样硬化中的功能表型和起源 | Olfr2阳性血管巨噬细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、Mass cytometry | NA | RNA-seq数据 | 使用Apoe-/-小鼠模型进行实验 |
| 531 | 2024-11-09 |
Ly6E on tumor cells impairs anti-tumor T-cell responses: a novel mechanism of tumor-induced immune exclusion
2024-Nov-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03851-x
PMID:39487896
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤细胞表面抗原Ly6E在肿瘤微环境中对T细胞反应的抑制作用及其机制 | 首次揭示了Ly6E通过促进M2型巨噬细胞在肿瘤微环境中的积累，从而导致CD8+ T细胞排斥的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证 | 探讨Ly6E在肿瘤微环境中对免疫反应的调控机制，为癌症免疫治疗提供新思路 | Ly6E在肿瘤细胞中的表达及其对T细胞和巨噬细胞的影响 | 肿瘤学 | 多种癌症 | 流式细胞术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | NA | RNA | 包括人乳腺癌组织、肿瘤细胞系以及Ly6E敲除和过表达的小鼠细胞系 |
| 532 | 2024-11-09 |
FIND-seq: high-throughput nucleic acid cytometry for rare single-cell transcriptomics
2024-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01021-y
PMID:39039320
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FIND-seq的高通量核酸细胞计数平台，用于分离和研究稀有单细胞转录组 | 开发了一种新的核酸细胞计数平台FIND-seq，能够基于RNA或DNA标记物分离稀有细胞，并进行批量或单细胞转录组分析 | 需要微流体学、光学和分子生物学知识 | 开发和优化一种新的技术平台，用于分离和研究稀有细胞的转录组 | 稀有细胞，特别是HIV感染的细胞和其他难以分离和测序的细胞亚群 | 单细胞转录组学 | HIV感染 | FIND-seq | NA | RNA或DNA | 稀有HIV感染细胞和其他难以分离的细胞亚群 |
| 533 | 2024-11-09 |
Single-cell RNA sequencing elucidated the landscape of breast cancer brain metastases and identified ILF2 as a potential therapeutic target
2024-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13697
PMID:38943472
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌脑转移的生态系统，并鉴定了ILF2作为潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序全面描绘了乳腺癌脑转移的肿瘤生态系统，并发现ILF2在乳腺癌脑转移进展中的关键作用 | 研究样本量较小，仅涉及六个患者的乳腺癌脑转移数据 | 开发更有效的治疗策略，探索乳腺癌脑转移的潜在治疗靶点 | 乳腺癌脑转移患者的肿瘤生态系统及ILF2的功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 六个乳腺癌脑转移患者的样本 |
| 534 | 2024-11-09 |
Regulating Astrocytes via Short Fibers for Spinal Cord Repair
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406742
PMID:39120009
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研究论文 | 研究通过全转录组测序识别出VIM基因在脊髓损伤小鼠模型中的关键调节作用，并构建3D可注射电纺短纤维抑制反应性星形胶质细胞增生，促进脊髓神经功能恢复 | 首次通过全转录组测序揭示VIM基因在反应性星形胶质细胞中的关键作用，并设计3D电纺短纤维抑制其异常扩张 | NA | 研究抑制反应性星形胶质细胞增生以促进脊髓损伤修复的机制 | 脊髓损伤小鼠模型中的反应性星形胶质细胞 | 生物材料 | 脊髓损伤 | 全转录组测序 | NA | RNA | 脊髓损伤小鼠模型 |
| 535 | 2024-11-09 |
CCL5/CCR5/CYP1A1 pathway prompts liver cancer cells to survive in the combination of targeted and immunological therapies
2024-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16320
PMID:39183447
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研究论文 | 研究揭示了CCL5/CCR5/CYP1A1通路在肝癌细胞对抗靶向和免疫联合治疗中的作用 | 发现CCL5/CCR5/CYP1A1通路在肝癌细胞对抗靶向和免疫联合治疗中的作用，并验证了bergamottin作为CYP1A1竞争性抑制剂可以增强治疗效果 | NA | 探讨肝癌细胞在靶向和免疫联合治疗中的生存机制 | 肝癌细胞、CD8 T细胞、CCL5/CCR5/CYP1A1通路 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | 治疗前后的肿瘤样本、CCL5刺激的Huh7细胞、携带肿瘤的小鼠 |
| 536 | 2024-11-09 |
Spatial Transcriptomic Study Reveals Heterogeneous Metabolic Adaptation and a Role of Pericentral PPARα/CAR/Ces2a Axis During Fasting in Mouse Liver
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405240
PMID:39234807
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研究论文 | 研究通过空间转录组学分析小鼠肝脏在不同营养状态下的基因表达变化，揭示了肝脏代谢适应的异质性和PPARα/CAR/Ces2a轴在禁食期间的作用 | 首次通过空间转录组学技术揭示了小鼠肝脏在不同营养状态下的动态基因表达变化，并确定了PPARα/CAR/Ces2a轴在禁食期间的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨肝脏在不同营养状态下代谢适应的异质性和机制 | 小鼠肝脏在喂食、禁食和再喂食状态下的基因表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肝脏样本在喂食、禁食和再喂食状态下的数据 |
| 537 | 2024-11-09 |
SHP2-Triggered Endothelial Cell Activation Fuels Estradiol-Independent Endometrial Sterile Inflammation
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403038
PMID:39234819
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研究论文 | 研究了SHP2在雌激素非依赖性子宫内膜无菌炎症中的作用 | 首次揭示了SHP2在子宫内膜内皮细胞中的上调促进炎症激活和巨噬细胞迁移，从而维持无菌炎症 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步在人体中验证 | 探讨雌激素诱导的无菌炎症如何调节子宫内膜增生 | 子宫内膜内皮细胞和巨噬细胞 | NA | 子宫内膜增生 | 单细胞RNA测序、RNA测序、磷酸化蛋白质组分析 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 538 | 2024-11-09 |
Epigenetic Dynamics in Reprogramming to Dopaminergic Neurons for Parkinson's Disease
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403105
PMID:39279468
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析多巴胺能神经元重编程的轨迹，揭示了重编程过程中的关键调控因子Arid4b | 首次揭示了Arid4b在多巴胺能神经元重编程中的关键作用，并通过过表达Arid4b提高了重编程效率 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 揭示多巴胺能神经元重编程的分子机制，为帕金森病的治疗提供新策略 | 多巴胺能神经元的重编程过程及其关键调控因子 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠脑组织样本 |
| 539 | 2024-11-09 |
Differentiating visceral sensory ganglion organoids from induced pluripotent stem cells
2024-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02455-8
PMID:39438735
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研究论文 | 本文介绍了从诱导多能干细胞（iPS细胞）生成内脏感觉神经元（VSN）的方法，并探讨了其在神经系统疾病中的应用 | 本文首次建立了从人类iPS细胞分化出内脏感觉神经节类器官（VSGOs）的协议，并将其应用于阿尔茨海默病的研究 | NA | 研究内脏感觉神经元在神经系统疾病中的作用 | 内脏感觉神经元（VSN）和内脏感觉神经节类器官（VSGOs） | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 540 | 2024-11-09 |
Egfl6 promotes ovarian cancer progression by enhancing the immunosuppressive functions of tumor-associated myeloid cells
2024-Nov-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175147
PMID:39312740
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研究论文 | 研究揭示了Egfl6通过增强肿瘤相关髓系细胞的免疫抑制功能促进卵巢癌进展的机制 | 首次发现Egfl6通过结合β3整合素并激活p38和SYK信号通路，促进髓系细胞迁移并分化为免疫抑制状态 | 研究主要基于小鼠模型和人类卵巢癌组织样本，需进一步验证在其他癌症类型中的适用性 | 探讨Egfl6在卵巢癌中的免疫抑制机制及其作为治疗靶点的潜力 | 卵巢癌、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和髓源性抑制细胞（MDSCs） | 免疫学 | 卵巢癌 | scRNA-Seq | NA | 组织样本 | 小鼠模型和人类卵巢癌组织样本 |