单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 583 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-11-15 |
Proximogram-A multi-omics network-based framework to capture tissue heterogeneity integrating single-cell omics and spatial profiling
2024-Nov, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109082
PMID:39255657
|
研究论文 | 本文提出了一种基于多组学网络的框架Proximogram，用于整合单细胞组学和空间分析数据，以捕捉组织异质性 | Proximogram通过图表示法整合了独立获得的组学和空间数据，提高了分类效果 | NA | 开发一种可定制和可扩展的方法，以整合多模态生物数据，提高疾病分类的准确性 | 胰腺疾病的正常组织、慢性胰腺炎和胰腺导管腺癌 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光成像 | 图深度学习模型 | 图像、基因表达数据 | 来自两个胰腺疾病患者的样本 |
| 482 | 2024-11-15 |
Spatial transcriptome analysis reveals de novo regeneration of poplar roots
2024-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae237
PMID:39512783
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探索杨树根部的再生过程 | 通过空间转录组学技术揭示了杨树根部再生的详细发育轨迹，并发现了细胞分化和基因表达的复杂模式 | NA | 探索杨树根部再生的分子机制，并提供改进植物繁殖技术的见解 | 杨树根部的再生过程 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 483 | 2024-11-15 |
Single-cell and spatial transcriptomics: Discovery of human placental development and disease
2024-Nov, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00133
PMID:39512838
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在揭示人类胎盘发育和疾病中的应用 | 利用单细胞和空间转录组学技术展示了胎盘细胞的异质性和空间分子定位 | 讨论了当前技术的弱点和未来发展方向 | 探讨单细胞和空间转录组学技术在人类胎盘发育和疾病研究中的应用 | 人类胎盘及其相关疾病，如子痫前期、妊娠糖尿病、高龄产妇、复发性流产和胎盘植入综合征 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 484 | 2024-11-14 |
Single cell RNA-seq reveals cellular and transcriptional heterogeneity in the splenic CD11b+Ly6Chigh monocyte population expanded in sepsis-surviving mice
2024-Nov-06, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00970-0
PMID:39506629
|
研究论文 | 研究分析了在脓毒症幸存小鼠中扩增的脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症幸存小鼠脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 研究仅限于C57BL/6J和BALB/c小鼠模型，结果可能不适用于其他物种或人类 | 探讨脓毒症幸存者免疫失调的分子基础 | 脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57BL/6J和BALB/c小鼠的脾脏CD11b+Ly6Chigh细胞 |
| 485 | 2024-11-14 |
Correct stimulation of CD28H arms NK cells against tumor cells
2024-Nov, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350901
PMID:39101623
|
研究论文 | 研究通过靶向CD28H激活NK细胞，增强其对肿瘤细胞的杀伤作用 | 首次研究了靶向CD28H的单克隆抗体对NK细胞的激活作用及其对肿瘤细胞的杀伤效果 | NA | 探讨CD28H在NK细胞激活和肿瘤免疫逃逸中的作用 | CD28H、NK细胞、肿瘤细胞 | 免疫学 | 肾癌 | 单克隆抗体、scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及多种血液细胞系和透明细胞肾癌细胞 |
| 486 | 2024-11-14 |
Computational methods for allele-specific expression in single cells
2024-Nov, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.07.003
PMID:39127549
|
综述 | 本文综述了单细胞等位基因特异性表达（ASE）数据的计算方法 | 本文讨论了处理和分析单细胞ASE数据的计算方法，并强调了未来需要整合和优化的生物信息学流程以及统计方法的发展 | NA | 探讨单细胞等位基因特异性表达数据的计算方法 | 单细胞等位基因特异性表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 487 | 2024-11-13 |
Shared and unique transcriptomic signatures of antidepressant and probiotics action in the mammalian brain
2024-Nov, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02619-0
PMID:38844534
|
研究论文 | 研究探讨了不同抗抑郁药物和益生菌对哺乳动物大脑不同区域的转录组影响 | 首次系统分析了抗抑郁药物和益生菌在哺乳动物大脑中的共同和独特转录组特征 | 研究仅限于特定药物和益生菌组合，未涵盖所有可能的治疗方案 | 揭示抗抑郁药物和益生菌在治疗情绪障碍中的共同和差异机制 | 抗抑郁药物（如安非他酮、地昔帕明、氟西汀）和益生菌（Lacidofil®）对大脑10个区域的影响 | 数字病理学 | 情绪障碍 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及10个大脑区域，每个区域-治疗组合平均有2211个差异表达基因 |
| 488 | 2024-11-13 |
Interpretable spatially aware dimension reduction of spatial transcriptomics with STAMP
2024-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02463-8
PMID:39407016
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为STAMP的空间感知维度缩减方法，用于空间转录组学数据的高维基因表达测量 | STAMP基于深度生成模型，能够返回生物学上有意义的低维空间主题和相关基因模块，适用于多种数据类型和样本 | NA | 开发一种可解释的空间感知维度缩减方法，以获得空间转录组学数据的有意义的低维表示 | 空间转录组学数据，包括单个切片、多个切片、不同技术以及时间序列数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度生成模型 | NA | 基因表达数据 | 超过500,000个细胞 |
| 489 | 2024-11-12 |
Dissecting L-glutamine metabolism in acute myeloid leukemia: single-cell insights and therapeutic implications
2024-Nov-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05779-3
PMID:39506790
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了急性髓系白血病中L-谷氨酰胺代谢相关基因对疾病进展的影响 | 揭示了CD34+前B细胞中谷氨酰胺相关活动的增加，并发现了与AML进展相关的10个基因，包括CCL5和CD52，这些基因可能是潜在的治疗靶点 | NA | 深入理解急性髓系白血病的生物学机制，并探索新的治疗策略 | 急性髓系白血病患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 血液癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自AML患者的单细胞RNA测序数据 |
| 490 | 2024-11-12 |
γδ T17 Cells Regulate the Acute Antiviral Response of NK Cells in HSV-1-Infected Corneas
2024-Nov-04, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.13.16
PMID:39504049
|
研究论文 | 研究γδ T17细胞在HSV-1感染的角膜中对NK细胞急性抗病毒反应的调节作用 | 首次揭示了γδ T17细胞在HSV-1感染的角膜中促进NK细胞积累，并通过IL-17A信号通路调节NK细胞的功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究γδ T细胞在HSV-1感染的角膜中对NK细胞的调节作用 | γδ T细胞和NK细胞在HSV-1感染角膜中的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、流式细胞术、多重分析 | NA | RNA | CD57Bl/6 (野生型[WT])、TCRδ-/-、IFN-γ-/-小鼠，每组若干只 |
| 491 | 2024-11-12 |
PINK1/Parkin-Mediated Mitophagy Ameliorates Mitochondrial Dysfunction in Lacrimal Gland Acinar Cells During Aging
2024-Nov-04, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.13.12
PMID:39504053
|
研究论文 | 研究了PINK1/Parkin介导的线粒体自噬在衰老过程中对泪腺腺泡细胞线粒体功能障碍的改善作用 | 首次揭示了PINK1/Parkin介导的线粒体自噬在衰老过程中对泪腺腺泡细胞的保护作用 | 仅使用了年轻和中年的C57BL/6J小鼠进行研究，缺乏更广泛年龄段的数据 | 探讨衰老过程中泪腺腺泡细胞线粒体功能障碍的机制及线粒体自噬的作用 | 泪腺腺泡细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 蛋白质表达数据 | 年轻 (6周) 和中年 (12个月) 的雄性C57BL/6J小鼠 |
| 492 | 2024-11-10 |
Multi-omics reveal immune microenvironment alterations in multiple myeloma and its precursor stages
2024-11-06, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-024-01172-x
PMID:39505839
|
研究论文 | 本研究系统地描述了多发性骨髓瘤及其前体阶段的肿瘤免疫微环境变化 | 首次全面分析了从单克隆丙种球蛋白病未定性（MGUS）和冒烟型多发性骨髓瘤（SMM）到新诊断多发性骨髓瘤的肿瘤免疫微环境变化 | NA | 系统地表征多发性骨髓瘤及其前体阶段的肿瘤免疫微环境和肿瘤-免疫相互作用 | 多发性骨髓瘤及其前体阶段的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | CIBERSORT、质谱流式细胞术（CyTOF）和单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 包括健康供体在内的多个样本 |
| 493 | 2024-11-09 |
Single-Cell Multi-Dimensional data analysis reveals the role of ARL4C in driving rheumatoid arthritis progression and Macrophage polarization dynamics
2024-Nov-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112987
PMID:39182267
|
研究论文 | 研究揭示了ARL4C在驱动类风湿性关节炎进展和巨噬细胞极化动态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和Bulk RNA测序数据的综合分析，发现激活的成纤维样滑膜细胞（FLSs）中ARL4C的高表达，并证明了ARL4C在RA FLSs中的关键作用 | NA | 探讨ARL4C在类风湿性关节炎进展中的作用及其对巨噬细胞极化的影响 | 成纤维样滑膜细胞（FLSs）和巨噬细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和Bulk RNA测序（Bulk-seq） | NA | RNA | 来自类风湿性关节炎（RA）、骨关节炎（OA）和创伤患者的成纤维样滑膜细胞（FLSs） |
| 494 | 2024-11-09 |
CD19+CD73+ B cells infiltration indicates poor prognosis and unfavorable responses to immunotherapy in gastric cancer
2024-Nov-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113002
PMID:39213870
|
研究论文 | 研究探讨了CD73在胃癌患者B细胞中的表达及其功能机制 | 发现了CD19+CD73+ B细胞在胃癌中的高浸润与不良预后和免疫治疗反应减弱之间的关联 | 研究样本量有限，仅包括390名胃癌患者 | 探索CD73在胃癌患者B细胞中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 胃癌患者的CD19+CD73+ B细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 双免疫组化染色、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 390名胃癌患者和8名胃癌患者的肿瘤及非肿瘤组织样本 |
| 495 | 2024-11-09 |
Molecular mechanisms promoting long-term cytopenia after BCMA CAR-T therapy in multiple myeloma
2024-11-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023012522
PMID:39058976
|
研究论文 | 研究了BCMA CAR-T疗法在多发性骨髓瘤患者中引起的长期细胞减少的分子机制 | 首次评估了BCMA CAR-T细胞对造血干细胞和祖细胞分化的旁分泌效应，并发现其通过上调早期造血分化相关的转录因子导致细胞成熟停滞 | 研究样本量较小，且未探讨所有可能的分子机制 | 探讨BCMA CAR-T疗法在多发性骨髓瘤患者中引起长期细胞减少的机制，并寻找减轻这种毒性的潜在治疗方法 | 接受BCMA CAR-T细胞治疗的48名多发性骨髓瘤患者 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 48名患者 |
| 496 | 2024-11-09 |
Low-intensity focused ultrasound stimulation promotes stroke recovery via astrocytic HMGB1 and CAMK2N1 in mice
2024-Nov-05, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2023-002614
PMID:38191183
|
研究论文 | 研究低强度聚焦超声刺激通过星形胶质细胞中的HMGB1和CAMK2N1促进小鼠中风恢复的机制 | 首次揭示了低强度聚焦超声刺激通过上调HMGB1和下调CAMK2N1在星形胶质细胞亚群中促进中风后血管生成和突触生成的机制 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨低强度聚焦超声刺激在中风恢复中的细胞和分子机制 | 小鼠中风模型中的星形胶质细胞 | 神经科学 | 中风 | 低强度聚焦超声刺激、激光散斑成像、电生理记录、iTRAQ蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、荧光原位杂交、Western blot | NA | 图像、电生理数据、蛋白质表达数据、基因表达数据 | 成年雄性小鼠 |
| 497 | 2024-11-09 |
Single-cell RNA sequencing elucidated the landscape of breast cancer brain metastases and identified ILF2 as a potential therapeutic target
2024-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13697
PMID:38943472
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌脑转移的生态系统，并鉴定了ILF2作为潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序全面描绘了乳腺癌脑转移的肿瘤生态系统，并发现ILF2在乳腺癌脑转移进展中的关键作用 | 研究样本量较小，仅涉及六个患者的乳腺癌脑转移数据 | 开发更有效的治疗策略，探索乳腺癌脑转移的潜在治疗靶点 | 乳腺癌脑转移患者的肿瘤生态系统及ILF2的功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 六个乳腺癌脑转移患者的样本 |
| 498 | 2024-11-09 |
Regulating Astrocytes via Short Fibers for Spinal Cord Repair
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406742
PMID:39120009
|
研究论文 | 研究通过全转录组测序识别出VIM基因在脊髓损伤小鼠模型中的关键调节作用，并构建3D可注射电纺短纤维抑制反应性星形胶质细胞增生，促进脊髓神经功能恢复 | 首次通过全转录组测序揭示VIM基因在反应性星形胶质细胞中的关键作用，并设计3D电纺短纤维抑制其异常扩张 | NA | 研究抑制反应性星形胶质细胞增生以促进脊髓损伤修复的机制 | 脊髓损伤小鼠模型中的反应性星形胶质细胞 | 生物材料 | 脊髓损伤 | 全转录组测序 | NA | RNA | 脊髓损伤小鼠模型 |
| 499 | 2024-11-09 |
CCL5/CCR5/CYP1A1 pathway prompts liver cancer cells to survive in the combination of targeted and immunological therapies
2024-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16320
PMID:39183447
|
研究论文 | 研究揭示了CCL5/CCR5/CYP1A1通路在肝癌细胞对抗靶向和免疫联合治疗中的作用 | 发现CCL5/CCR5/CYP1A1通路在肝癌细胞对抗靶向和免疫联合治疗中的作用，并验证了bergamottin作为CYP1A1竞争性抑制剂可以增强治疗效果 | NA | 探讨肝癌细胞在靶向和免疫联合治疗中的生存机制 | 肝癌细胞、CD8 T细胞、CCL5/CCR5/CYP1A1通路 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | 治疗前后的肿瘤样本、CCL5刺激的Huh7细胞、携带肿瘤的小鼠 |
| 500 | 2024-11-09 |
Spatial Transcriptomic Study Reveals Heterogeneous Metabolic Adaptation and a Role of Pericentral PPARα/CAR/Ces2a Axis During Fasting in Mouse Liver
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405240
PMID:39234807
|
研究论文 | 研究通过空间转录组学分析小鼠肝脏在不同营养状态下的基因表达变化，揭示了肝脏代谢适应的异质性和PPARα/CAR/Ces2a轴在禁食期间的作用 | 首次通过空间转录组学技术揭示了小鼠肝脏在不同营养状态下的动态基因表达变化，并确定了PPARα/CAR/Ces2a轴在禁食期间的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨肝脏在不同营养状态下代谢适应的异质性和机制 | 小鼠肝脏在喂食、禁食和再喂食状态下的基因表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肝脏样本在喂食、禁食和再喂食状态下的数据 |