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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-11-15 |
Targeting the autoreactive CD8+ T-cell receptor in type 1 diabetes: Insights from scRNA-seq for immunotherapy
2024-Nov, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107433
PMID:39343113
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了自身反应性CD8+ T细胞受体在1型糖尿病中的机制作用及潜在治疗应用 | 首次揭示了CD8 T细胞在1型糖尿病小鼠胰腺组织中的主要作用,并发现基因TRAJ23在1型糖尿病中的偏好性及其敲除对NOD小鼠症状的缓解作用 | 研究仅基于NOD小鼠模型,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨自身反应性CD8+ T细胞受体在1型糖尿病中的作用机制及治疗潜力 | 1型糖尿病小鼠的CD8+ T细胞及其受体 | 免疫学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠的T细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 482 | 2024-11-15 |
Pathogenic mechanisms, diagnostic, and therapeutic potential of microvesicles in diabetes and its complications
2024-Nov, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2024.110168
PMID:39349130
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综述 | 本文综述了微泡在糖尿病及其并发症中的发病机制、诊断和治疗潜力 | 探讨了微泡作为糖尿病及其并发症的生物标志物和治疗工具的潜力 | 微泡的分离和表征、分子机制的理解以及临床验证仍存在挑战 | 分析微泡在糖尿病及其并发症中的作用,并探讨其作为诊断和治疗工具的潜力 | 微泡在糖尿病及其并发症中的作用 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序和蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 483 | 2024-11-15 |
Quiescent cancer cells induced by high-density cultivation reveals cholesterol-mediated survival and lung metastatic traits
2024-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02861-x
PMID:39390252
|
研究论文 | 本文通过高密度培养诱导静止癌细胞模型,研究胆固醇介导的生存和肺转移特性 | 开发了一种通过高密度培养诱导的静止癌细胞模型,揭示了CDC25A在静止状态下的重要作用及其通过内体途径增强胆固醇代谢的机制 | 缺乏普遍接受的静止癌细胞模型限制了对静止癌细胞生存机制的理解 | 研究静止癌细胞在高密度培养条件下的生存机制及其在肺转移中的作用 | 静止癌细胞及其在高密度培养条件下的分子机制 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫沉淀-质谱(IP-MS)、代谢组学、胆固醇测定、PLA等分子实验 | NA | 单细胞RNA数据、代谢数据、机械力数据 | 涉及多种分子实验和动物模型 | NA | NA | NA | NA |
| 484 | 2024-11-15 |
Single-cell transcriptome profiles and E-64 inhibitor data reveal the essential role of cysteine proteases in the ontogeny of Ichthyophthirius multifiliis
2024-Nov, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.109979
PMID:39442737
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和E-64抑制剂数据揭示了胱氨酸蛋白酶在Ich病原体发育中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和E-64抑制剂实验验证了胱氨酸蛋白酶在Ich病原体发育中的重要作用 | 研究主要集中在体外实验,缺乏体内实验验证 | 探究Ich病原体发育机制并寻找有效的预防方法 | Ich病原体Ichthyophthirius multifiliis的不同发育阶段 | 数字病理学 | 鱼类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个发育阶段的Ichthyophthirius multifiliis样本 | NA | NA | NA | NA |
| 485 | 2024-11-15 |
Differential expression and co-expression reveal cell types relevant to genetic disorder phenotypes
2024-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae646
PMID:39468724
|
研究论文 | 本研究整合了非疾病样本的单细胞RNA测序数据与已知的遗传疾病基因和表型信息,预测了482种疾病表型相关的特定细胞类型 | 通过差异表达和共表达机制,揭示了文献中未记录的新关联,强调了细胞环境在疾病表现中的关键作用 | NA | 确定罕见遗传疾病中受遗传变异影响的特定细胞类型,以推进诊断和治疗 | 482种疾病表型相关的细胞类型 | 基因组学 | 遗传疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 非疾病样本 | NA | NA | NA | NA |
| 486 | 2024-11-15 |
SOX10 mediates glioblastoma cell-state plasticity
2024-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00258-8
PMID:39285246
|
研究论文 | 研究探讨了SOX10在胶质母细胞瘤细胞状态可塑性中的作用,并利用这一机制设计了新的治疗策略 | 首次揭示了SOX10抑制通过神经干细胞/发育样细胞状态转变促进胶质母细胞瘤进展的机制,并提出了基于单细胞表型可塑性分析的肿瘤治疗设计 | 研究主要基于动物模型和细胞系,需要进一步的临床验证 | 探讨SOX10在胶质母细胞瘤治疗失败中的作用,并设计新的治疗策略 | 胶质母细胞瘤细胞和神经干细胞样细胞状态 | NA | 脑癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 动物模型和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 487 | 2024-11-15 |
GEEES: inferring cell-specific gene-enhancer interactions from multi-modal single-cell data
2024-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae638
PMID:39468737
|
研究论文 | 提出了一种名为GEEES的新方法,用于从多模态单细胞数据中推断细胞特异性的基因增强子相互作用 | GEEES能够在单细胞水平上推断基因增强子相互作用,并显著提高了性能,特别是在考虑基因增强子距离的情况下 | 尽管GEEES在性能上有所提升,但整体改进幅度不大,且现有实验驱动的基准数据集的一致性有限,需要新的高通量实验来验证 | 开发一种新的计算方法,用于从多模态单细胞数据中推断细胞特异性的基因增强子相互作用 | 基因增强子相互作用 | 生物信息学 | NA | 多变量回归 | NA | 多模态单细胞数据 | 大量基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 488 | 2024-11-15 |
Cellular responses to neoadjuvant FOLFOX6-bevacizumab treatment in colorectal cancers analyzed by single-cell transcriptome analysis
2024-Nov, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2024.155681
PMID:39471526
|
研究论文 | 研究了新辅助FOLFOX6联合贝伐珠单抗治疗对结直肠癌肿瘤微环境中细胞亚群的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析了新辅助FOLFOX6联合贝伐珠单抗治疗对结直肠癌肿瘤微环境中细胞亚群的具体变化 | 研究样本量较小,仅包括四名患者 | 探讨新辅助FOLFOX6联合贝伐珠单抗治疗对结直肠癌肿瘤微环境中细胞亚群的影响 | 结直肠癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四名结直肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 489 | 2024-11-15 |
Proximogram-A multi-omics network-based framework to capture tissue heterogeneity integrating single-cell omics and spatial profiling
2024-Nov, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109082
PMID:39255657
|
研究论文 | 本文提出了一种基于多组学网络的框架Proximogram,用于整合单细胞组学和空间分析数据,以捕捉组织异质性 | Proximogram通过图表示法整合了独立获得的组学和空间数据,提高了分类效果 | NA | 开发一种可定制和可扩展的方法,以整合多模态生物数据,提高疾病分类的准确性 | 胰腺疾病的正常组织、慢性胰腺炎和胰腺导管腺癌 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光成像 | 图深度学习模型 | 图像、基因表达数据 | 来自两个胰腺疾病患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 490 | 2024-11-15 |
Spatial transcriptome analysis reveals de novo regeneration of poplar roots
2024-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae237
PMID:39512783
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探索杨树根部的再生过程 | 通过空间转录组学技术揭示了杨树根部再生的详细发育轨迹,并发现了细胞分化和基因表达的复杂模式 | NA | 探索杨树根部再生的分子机制,并提供改进植物繁殖技术的见解 | 杨树根部的再生过程 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 491 | 2024-11-15 |
Single-cell and spatial transcriptomics: Discovery of human placental development and disease
2024-Nov, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00133
PMID:39512838
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在揭示人类胎盘发育和疾病中的应用 | 利用单细胞和空间转录组学技术展示了胎盘细胞的异质性和空间分子定位 | 讨论了当前技术的弱点和未来发展方向 | 探讨单细胞和空间转录组学技术在人类胎盘发育和疾病研究中的应用 | 人类胎盘及其相关疾病,如子痫前期、妊娠糖尿病、高龄产妇、复发性流产和胎盘植入综合征 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 492 | 2024-11-14 |
Single cell RNA-seq reveals cellular and transcriptional heterogeneity in the splenic CD11b+Ly6Chigh monocyte population expanded in sepsis-surviving mice
2024-Nov-06, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00970-0
PMID:39506629
|
研究论文 | 研究分析了在脓毒症幸存小鼠中扩增的脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症幸存小鼠脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 研究仅限于C57BL/6J和BALB/c小鼠模型,结果可能不适用于其他物种或人类 | 探讨脓毒症幸存者免疫失调的分子基础 | 脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57BL/6J和BALB/c小鼠的脾脏CD11b+Ly6Chigh细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 493 | 2024-11-13 |
Shared and unique transcriptomic signatures of antidepressant and probiotics action in the mammalian brain
2024-Nov, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02619-0
PMID:38844534
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研究论文 | 研究探讨了不同抗抑郁药物和益生菌对哺乳动物大脑不同区域的转录组影响 | 首次系统分析了抗抑郁药物和益生菌在哺乳动物大脑中的共同和独特转录组特征 | 研究仅限于特定药物和益生菌组合,未涵盖所有可能的治疗方案 | 揭示抗抑郁药物和益生菌在治疗情绪障碍中的共同和差异机制 | 抗抑郁药物(如安非他酮、地昔帕明、氟西汀)和益生菌(Lacidofil®)对大脑10个区域的影响 | 数字病理学 | 情绪障碍 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及10个大脑区域,每个区域-治疗组合平均有2211个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 494 | 2024-11-13 |
Interpretable spatially aware dimension reduction of spatial transcriptomics with STAMP
2024-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02463-8
PMID:39407016
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STAMP的空间感知维度缩减方法,用于空间转录组学数据的高维基因表达测量 | STAMP基于深度生成模型,能够返回生物学上有意义的低维空间主题和相关基因模块,适用于多种数据类型和样本 | NA | 开发一种可解释的空间感知维度缩减方法,以获得空间转录组学数据的有意义的低维表示 | 空间转录组学数据,包括单个切片、多个切片、不同技术以及时间序列数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度生成模型 | NA | 基因表达数据 | 超过500,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 495 | 2024-11-12 |
Dissecting L-glutamine metabolism in acute myeloid leukemia: single-cell insights and therapeutic implications
2024-Nov-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05779-3
PMID:39506790
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了急性髓系白血病中L-谷氨酰胺代谢相关基因对疾病进展的影响 | 揭示了CD34+前B细胞中谷氨酰胺相关活动的增加,并发现了与AML进展相关的10个基因,包括CCL5和CD52,这些基因可能是潜在的治疗靶点 | NA | 深入理解急性髓系白血病的生物学机制,并探索新的治疗策略 | 急性髓系白血病患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 血液癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自AML患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 496 | 2024-11-12 |
γδ T17 Cells Regulate the Acute Antiviral Response of NK Cells in HSV-1-Infected Corneas
2024-Nov-04, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.13.16
PMID:39504049
|
研究论文 | 研究γδ T17细胞在HSV-1感染的角膜中对NK细胞急性抗病毒反应的调节作用 | 首次揭示了γδ T17细胞在HSV-1感染的角膜中促进NK细胞积累,并通过IL-17A信号通路调节NK细胞的功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究γδ T细胞在HSV-1感染的角膜中对NK细胞的调节作用 | γδ T细胞和NK细胞在HSV-1感染角膜中的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、流式细胞术、多重分析 | NA | RNA | CD57Bl/6 (野生型[WT])、TCRδ-/-、IFN-γ-/-小鼠,每组若干只 | NA | NA | NA | NA |
| 497 | 2024-11-12 |
PINK1/Parkin-Mediated Mitophagy Ameliorates Mitochondrial Dysfunction in Lacrimal Gland Acinar Cells During Aging
2024-Nov-04, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.13.12
PMID:39504053
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研究论文 | 研究了PINK1/Parkin介导的线粒体自噬在衰老过程中对泪腺腺泡细胞线粒体功能障碍的改善作用 | 首次揭示了PINK1/Parkin介导的线粒体自噬在衰老过程中对泪腺腺泡细胞的保护作用 | 仅使用了年轻和中年的C57BL/6J小鼠进行研究,缺乏更广泛年龄段的数据 | 探讨衰老过程中泪腺腺泡细胞线粒体功能障碍的机制及线粒体自噬的作用 | 泪腺腺泡细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 蛋白质表达数据 | 年轻 (6周) 和中年 (12个月) 的雄性C57BL/6J小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 498 | 2024-11-10 |
Multi-omics reveal immune microenvironment alterations in multiple myeloma and its precursor stages
2024-11-06, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-024-01172-x
PMID:39505839
|
研究论文 | 本研究系统地描述了多发性骨髓瘤及其前体阶段的肿瘤免疫微环境变化 | 首次全面分析了从单克隆丙种球蛋白病未定性(MGUS)和冒烟型多发性骨髓瘤(SMM)到新诊断多发性骨髓瘤的肿瘤免疫微环境变化 | NA | 系统地表征多发性骨髓瘤及其前体阶段的肿瘤免疫微环境和肿瘤-免疫相互作用 | 多发性骨髓瘤及其前体阶段的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | CIBERSORT、质谱流式细胞术(CyTOF)和单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 包括健康供体在内的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 499 | 2024-11-09 |
Single-Cell Multi-Dimensional data analysis reveals the role of ARL4C in driving rheumatoid arthritis progression and Macrophage polarization dynamics
2024-Nov-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112987
PMID:39182267
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研究论文 | 研究揭示了ARL4C在驱动类风湿性关节炎进展和巨噬细胞极化动态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和Bulk RNA测序数据的综合分析,发现激活的成纤维样滑膜细胞(FLSs)中ARL4C的高表达,并证明了ARL4C在RA FLSs中的关键作用 | NA | 探讨ARL4C在类风湿性关节炎进展中的作用及其对巨噬细胞极化的影响 | 成纤维样滑膜细胞(FLSs)和巨噬细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和Bulk RNA测序(Bulk-seq) | NA | RNA | 来自类风湿性关节炎(RA)、骨关节炎(OA)和创伤患者的成纤维样滑膜细胞(FLSs) | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2024-11-09 |
CD19+CD73+ B cells infiltration indicates poor prognosis and unfavorable responses to immunotherapy in gastric cancer
2024-Nov-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113002
PMID:39213870
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研究论文 | 研究探讨了CD73在胃癌患者B细胞中的表达及其功能机制 | 发现了CD19+CD73+ B细胞在胃癌中的高浸润与不良预后和免疫治疗反应减弱之间的关联 | 研究样本量有限,仅包括390名胃癌患者 | 探索CD73在胃癌患者B细胞中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 胃癌患者的CD19+CD73+ B细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 双免疫组化染色、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 390名胃癌患者和8名胃癌患者的肿瘤及非肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |