单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 659 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-11-17 |
Basic Fibroblast Growth Factor Supports the Function of Limbal Niche Cells via the Wnt/β-Catenin Pathway
2024-Nov, Journal of ocular pharmacology and therapeutics : the official journal of the Association for Ocular Pharmacology and Therapeutics
IF:1.9Q3
DOI:10.1089/jop.2024.0042
PMID:39083404
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研究论文 | 研究bFGF对角膜缘微环境细胞功能的影响及其机制 | 首次探讨了bFGF通过Wnt/β-catenin途径支持角膜缘微环境细胞功能的机制 | 研究仅限于体外实验，缺乏体内验证 | 探讨bFGF对角膜缘微环境细胞功能的影响及其分子机制 | 角膜缘微环境细胞（LNC）及其增殖、干细胞标志物表达和β-catenin转录水平 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 不同浓度的bFGF处理组和FGFR抑制剂处理组 |
| 462 | 2024-11-17 |
Macrophage iron dyshomeostasis promotes aging-related renal fibrosis
2024-Nov, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14275
PMID:39016438
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞在肾脏衰老中的作用，特别是铁稳态失调和铁死亡信号在促进肾脏纤维化中的作用 | 揭示了巨噬细胞铁稳态失调和铁死亡信号在肾脏衰老中的关键作用，并提出了Pcbp1作为干预靶点和Rutin作为潜在治疗药物 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床转化和人类适用性需要进一步验证 | 探讨巨噬细胞在肾脏衰老中的作用及其机制 | C57BL/6J小鼠的肾脏单细胞RNA测序数据 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从8周到24个月大的C57BL/6J小鼠 |
| 463 | 2024-11-17 |
Spatial transcriptomics reveals organized and distinct immune activation in cutaneous granulomatous disorders
2024-Nov, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.07.021
PMID:39098508
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研究论文 | 本文研究了非感染性皮肤肉芽肿性疾病的免疫激活特征 | 首次通过空间转录组学技术揭示了不同皮肤肉芽肿性疾病的免疫激活模式和分子特征 | NA | 理解这些疾病的基因表达特征 | 皮肤肉芽肿性疾病（如皮肤结节病、环状肉芽肿、脂质渐进性坏死和渐进性坏死性黄色肉芽肿） | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及皮肤结节病、环状肉芽肿、脂质渐进性坏死和渐进性坏死性黄色肉芽肿的病例 |
| 464 | 2024-11-17 |
Tissue-specific functions of MSCs are linked to homeostatic muscle maintenance and alter with aging
2024-Nov, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14299
PMID:39323233
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研究论文 | 研究探讨了间充质干细胞（MSCs）在不同组织中的特异性功能及其与肌肉维持和衰老的关系 | 首次通过单细胞RNA测序研究揭示了MSCs在不同组织中的异质性，并探讨了这种异质性在衰老过程中的功能意义 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种 | 探讨MSCs在不同组织中的特异性功能及其在衰老过程中的变化 | 小鼠的七种组织中的MSCs及其在衰老过程中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七种小鼠组织中的MSCs |
| 465 | 2024-11-17 |
Pan-Cancer Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Divergent Expression of Embryonic Proangiogenesis Gene Modules in Tumorigenesis
2024-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70373
PMID:39526457
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研究论文 | 本研究通过泛癌单细胞转录组分析，揭示了胚胎血管生成基因模块在肿瘤发生中的表达差异 | 首次通过泛癌单细胞RNA测序分析，发现肿瘤微环境中髓系细胞高表达胚胎血管生成基因模块，表明肿瘤可能利用这些模块促进血管生成和持续生长 | 研究仅限于七种癌症类型，样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨胚胎血管生成基因模块在肿瘤发生中的表达及其潜在机制 | 髓系细胞及其亚群在不同癌症类型中的胚胎血管生成基因模块表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 332名患者，涵盖七种癌症类型 |
| 466 | 2024-11-17 |
Integrated machine learning developed a prognosis-related gene signature to predict prognosis in oesophageal squamous cell carcinoma
2024-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70171
PMID:39535375
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研究论文 | 本研究开发了一种基于随机生存森林算法的17基因预后相关基因签名模型，用于预测食管鳞状细胞癌的预后 | 该模型在训练和验证队列中均表现出优于其他临床病理特征和已发表签名的预后准确性 | NA | 开发一种新的预测模型，以提高食管鳞状细胞癌的预后预测准确性 | 食管鳞状细胞癌患者的预后 | 机器学习 | 食管癌 | 随机生存森林算法 | 随机生存森林 | 基因表达数据 | 260名患者 |
| 467 | 2024-11-17 |
Molecular characterization of human HSPCs with different cell fates in vivo using single-cell transcriptome analysis and lentiviral barcoding technology
2024-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70085
PMID:39538416
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研究论文 | 本研究开发了一种名为SCALeBa的新技术，通过单细胞转录组分析和慢病毒条形码技术，研究人体HSPCs在体内的分子机制 | 首次引入SCALeBa技术，结合转录条形码库和算法，同时分析单个细胞的命运及其基因表达谱 | NA | 研究人体造血干细胞和祖细胞（HSPCs）在体内的异质性及其分子机制 | 人体造血干细胞和祖细胞（HSPCs）及其分化相关基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组分析，慢病毒条形码技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 468 | 2024-11-17 |
Brain-wide alterations revealed by spatial transcriptomics and proteomics in COVID-19 infection
2024-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00730-z
PMID:39543407
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研究论文 | 研究使用空间转录组学和蛋白质组学技术，分析了COVID-19感染后患者大脑多个皮质和皮质下区域的分子变化 | 首次在多个大脑区域中观察到抗病毒反应，并发现与年龄相关神经退行性疾病相似的分子变化 | 样本量较小，且仅限于具有匹配肺病理的COVID-19患者和对照组 | 理解COVID-19感染后神经系统症状的病理生理机制，以优化治疗和预后 | COVID-19患者和对照组的大脑组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 空间转录组学、基因表达和蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 42例COVID-19患者和对照组 |
| 469 | 2024-11-15 |
Targeted inhibition of CHKα and mTOR in models of pancreatic ductal adenocarcinoma: A novel regimen for metastasis
2024-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217280
PMID:39343354
|
研究论文 | 本文研究了胰腺导管腺癌（PDAC）中CHKα和mTOR的靶向抑制，提出了一种新的抗转移治疗方案 | 设计了一种新的CHKα抑制剂CHKI-03，并验证了其在多个临床前模型中抑制转移的有效性 | NA | 探索胰腺导管腺癌转移的机制，并开发新的治疗方案 | 胰腺导管腺癌的转移机制及CHKα和mTOR的靶向抑制 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序和代谢组学分析 | NA | RNA | 多个临床前模型 |
| 470 | 2024-11-15 |
Spatial transcriptomics reveals profound subclonal heterogeneity and T-cell dysfunction in extramedullary myeloma
2024-Nov-14, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024590
PMID:39172759
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研究论文 | 本文应用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，分析了多发性骨髓瘤的髓外病变中的三维肿瘤细胞和微环境结构 | 揭示了髓外病变中的显著亚克隆异质性和T细胞功能障碍，并发现了GPRC5D和TNFRSF17的空间表达差异 | 样本量较小，仅分析了14个髓外病变活检样本 | 探讨多发性骨髓瘤髓外病变中的肿瘤细胞和微环境的三维结构及其异质性 | 多发性骨髓瘤的髓外病变及其微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14个髓外病变活检样本，其中2个样本使用tomo-seq技术，12个样本使用10x Visium技术，3个样本使用单细胞RNA测序技术 |
| 471 | 2024-11-15 |
Progressive polyadenylation and m6A modification of Ighg1 mRNA maintain IgG1 antibody homeostasis in antibody-secreting cells
2024-Nov-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.10.004
PMID:39476842
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研究论文 | 研究了RNA转录后修饰如何影响抗体稳态，特别是通过mRNA多聚腺苷酸化和m6A修饰维持IgG1抗体在抗体分泌细胞中的生产 | 首次揭示了mRNA多聚腺苷酸化和m6A修饰在维持IgG1抗体稳态中的作用机制 | NA | 探讨RNA转录后修饰对抗体稳态的影响 | 抗体分泌细胞中的IgG1抗体生产 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 系统性红斑狼疮患者和狼疮小鼠模型 |
| 472 | 2024-11-15 |
TLR8 agonist selgantolimod regulates Kupffer cell differentiation status and impairs HBV entry into hepatocytes via an IL-6-dependent mechanism
2024-Nov-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331396
PMID:38697771
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研究论文 | 研究TLR8激动剂selgantolimod对库普弗细胞分化状态的调节及其通过IL-6依赖机制抑制HBV进入肝细胞的作用 | 首次详细描述了selgantolimod在肝微环境中引起的转录组变化和细胞间通讯事件，并展示了其对HBV进入的抑制作用 | 研究主要基于体外实验和转录组数据，缺乏体内实验验证 | 研究selgantolimod在肝微环境中的作用机制，特别是其对库普弗细胞和HBV感染的影响 | 库普弗细胞、肝细胞、HBV感染 | NA | 肝炎 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用公开的单细胞RNA测序数据和体外实验样本 |
| 473 | 2024-11-15 |
Targeting squalene epoxidase restores anti-PD-1 efficacy in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis-induced hepatocellular carcinoma
2024-Nov-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331117
PMID:38744443
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研究论文 | 研究探讨了角鲨烯环氧化酶（SQLE）在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎诱导的肝细胞癌（MASH-HCC）中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次揭示了SQLE通过影响胆固醇积累在肿瘤微环境中调节CD8+ T细胞和髓源抑制性细胞（MDSCs）的功能，从而促进MASH-HCC的免疫抑制 | NA | 探讨SQLE在MASH-HCC中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响，并评估其作为增强抗PD-1免疫治疗靶点的潜力 | 角鲨烯环氧化酶（SQLE）、CD8+ T细胞、髓源抑制性细胞（MDSCs） | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 转基因和敲除小鼠模型 |
| 474 | 2024-11-15 |
Dual decoding of cell types and gene expression in spatial transcriptomics with PANDA
2024-Nov-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae876
PMID:39404057
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PANDA的新方法，用于在空间转录组学中同时解码细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达 | PANDA方法通过整合原型分析和动态学习细胞类型特征，能够捕捉细胞类型内的异质性，并在解卷积过程中动态学习每个斑点的细胞类型特征 | NA | 旨在改进空间转录组学数据的解卷积方法，以更好地理解复杂生物系统的组织动态 | 空间转录组学数据中的细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 原型分析 | 基因表达数据 | 包括肿瘤、大脑和发育中的心脏等多种组织的真实空间转录组学数据 |
| 475 | 2024-11-15 |
Overcoming tyrosine kinase inhibitor resistance in lung cancer brain metastasis with CTLA4 blockade
2024-Nov-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.09.012
PMID:39423817
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研究论文 | 本文研究了肺癌脑转移对酪氨酸激酶抑制剂（TKI）治疗的耐药机制，并探讨了CTLA4阻断剂在克服这种耐药性中的潜力 | 首次揭示了TKI治疗通过上调T细胞中的CTLA4表达，促进免疫抑制微环境的形成，并提出CTLA4阻断剂与TKI联合治疗在肺癌脑转移中的潜在疗效 | 研究主要基于小鼠模型，需要在临床试验中进一步验证 | 探讨肺癌脑转移对TKI治疗的耐药机制，并寻找有效的治疗策略 | 肺癌脑转移样本及其对TKI治疗的反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个具有不同遗传背景和TKI治疗历史的肺癌脑转移样本 |
| 476 | 2024-11-15 |
UBR7 E3 Ligase Suppresses Interferon-β Mediated Immune Signaling by Targeting Sp110 in Hepatitis B Virus-Induced Hepatocellular Carcinoma
2024-Nov-08, ACS infectious diseases
IF:4.0Q1
DOI:10.1021/acsinfecdis.4c00213
PMID:38938101
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研究论文 | 研究报告了UBR7 E3连接酶通过靶向Sp110抑制干扰素-β介导的免疫信号传导，从而促进乙型肝炎病毒（HBV）诱导的肝细胞癌（HCC）的发展 | 首次揭示了UBR7在非组蛋白蛋白质泛素化中的新功能，并阐明了其在HBV诱导的HCC中的作用机制 | NA | 探讨UBR7在HBV诱导的肝细胞癌中的作用及其机制 | UBR7 E3连接酶及其底物Sp110在HBV感染和HCC中的功能 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | 来自HCC患者的样本 |
| 477 | 2024-11-15 |
Single-cell RNA sequencing reveals common interactions between follicle immune cells and granulosa cells in premature ovarian insufficiency patients
2024-Nov-08, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae157
PMID:39513542
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研究论文 | 研究早发性卵巢功能不全（POI）患者卵泡微环境中免疫细胞与颗粒细胞的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了POI患者卵泡微环境中免疫细胞与颗粒细胞的常见相互作用，并发现VEGFA-FLT1相互作用的丧失可能是一个潜在的治疗靶点 | 样本量较小，仅包括9名女性，可能影响结果的普适性 | 探讨POI、正常卵巢储备和高龄产妇的卵泡微环境，并识别潜在的治疗靶点 | POI、正常卵巢储备和高龄产妇的卵泡微环境 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9名女性，包括3名POI患者、3名正常卵巢储备女性和3名高龄产妇 |
| 478 | 2024-11-15 |
New insights on extramedullary granulopoiesis and neutrophil heterogeneity in the spleen and its importance in disease
2024-Nov-08, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae220
PMID:39514106
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综述 | 本文综述了脾脏中粒细胞生成和嗜中性粒细胞异质性的新见解及其在疾病中的重要性 | 本文利用现代转录组学和新型成像技术，揭示了嗜中性粒细胞在器官内的显著异质性及其复杂的生理功能 | NA | 探讨脾脏中粒细胞生成和嗜中性粒细胞异质性的机制及其在疾病中的作用 | 脾脏中的粒细胞生成和嗜中性粒细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 479 | 2024-11-15 |
Correction: Study on the mechanism of heterogeneous tumor-associated macrophages in three subtypes of breast cancer through the integration of single-cell RNA sequencing and in vitro experiments
2024-Nov-08, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-10053-2
PMID:39514125
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-11-15 |
Spatial and Single Cell Analyses Reveal Heterogeneity of DNAM-1 Receptor-Ligand Interactions that Instructs Intratumoral γδT-Cell Activity
2024-Nov-08, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1509
PMID:39514370
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤细胞与γδT细胞在肿瘤微环境中的相互作用，特别是DNAM-1受体与CD112和CD155配体的相互作用对γδT细胞活性的影响 | 揭示了CD112和CD155在肿瘤中的表达水平和定位差异如何影响γδT细胞的激活和肿瘤的抗性 | NA | 研究肿瘤细胞与γδT细胞在肿瘤微环境中的相互作用及其对疾病进展和免疫治疗结果的影响 | 肿瘤细胞、γδT细胞、DNAM-1受体、CD112和CD155配体 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 空间和单细胞RNA测序、空间代谢组分析 | NA | RNA、代谢物 | NA |