单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 579 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-11-18 |
Machine learning-driven discovery of novel therapeutic targets in diabetic foot ulcers
2024-Nov-14, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00955-z
PMID:39543487
|
研究论文 | 利用机器学习方法识别糖尿病足溃疡（DFU）中的治疗反应基因 | 首次通过机器学习方法识别出与DFU相关的关键基因SCUBE1和RNF103-CHMP3，并探讨了其在免疫调节和细胞通讯中的作用 | 研究结果需要在更大规模的队列中进行验证，并探索其在临床治疗中的应用潜力 | 通过机器学习方法识别糖尿病足溃疡中的潜在治疗靶点 | 糖尿病足溃疡患者的转录组数据和单细胞转录组数据 | 机器学习 | 糖尿病 | 转录组分析 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 糖尿病足溃疡患者和健康对照的转录组数据，以及单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2024-11-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of the cellular ecosystem of primary hepatocellular carcinoma
2024-Nov-14, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03574-0
PMID:39543644
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在原发性肝细胞癌（HCC）细胞生态系统中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了HCC细胞生态系统的复杂性和异质性 | NA | 理解HCC的发展并识别新的治疗靶点 | HCC细胞及其非恶性基质细胞的异质性和相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 463 | 2024-11-18 |
Comparison of functional characterization of cancer stem cells in different tumor tissues of pseudomyxoma peritonei
2024-Nov-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05730-6
PMID:39543711
|
研究论文 | 本研究比较了伪黏液瘤腹膜（PMP）患者不同肿瘤组织中癌症干细胞（CSCs）的功能特征 | 首次比较了PMP患者不同肿瘤组织中CSCs的增殖、迁移和抗炎能力 | 样本量较小，未涉及长期疗效和临床应用 | 研究PMP患者不同肿瘤组织中CSCs的生物学特性 | PMP患者的癌症干细胞（CSCs） | 数字病理学 | 腹膜肿瘤 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据 | 涉及PMP患者的不同肿瘤组织中的CSCs | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2024-11-18 |
Transcriptome-based network analysis related to regulatory T cells infiltration identified RCN1 as a potential biomarker for prognosis in clear cell renal cell carcinoma
2024-Nov-14, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-024-00404-x
PMID:39543725
|
研究论文 | 研究通过转录组网络分析识别与调节性T细胞浸润相关的RCN1作为透明细胞肾细胞癌的潜在预后生物标志物 | 开发了一个与调节性T细胞浸润相关的预后模型，并发现RCN1在透明细胞肾细胞癌中的预后价值 | NA | 识别透明细胞肾细胞癌的预后标志物和治疗靶点 | 调节性T细胞在透明细胞肾细胞癌中的作用 | 生物信息学 | 肾癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 转录组数据 | TCGA-KIRC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-11-18 |
Integrated single-cell transcriptomic analyses identify a novel lineage plasticity-related cancer cell type involved in prostate cancer progression
2024-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105398
PMID:39418984
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组分析，识别出一种与前列腺癌进展相关的新型细胞类型，该细胞类型具有谱系可塑性 | 首次识别出一种新型谱系可塑性相关的前列腺癌细胞类型，并揭示其在肿瘤进展中的关键作用 | NA | 识别并验证与前列腺癌进展相关的谱系可塑性相关细胞类型 | 前列腺癌细胞及其谱系可塑性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3314个样本和222,529个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-11-17 |
Galectin-9 Mediates the Functions of Microglia in the Hypoxic Brain Tumor Microenvironment
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3878
PMID:39207402
|
研究论文 | 研究探讨了Galectin-9在缺氧脑肿瘤微环境中对小胶质细胞功能的影响 | 揭示了Galectin-9在脑肿瘤微环境中对小胶质细胞的独特功能，并发现Gal-9高表达的小胶质细胞具有炎症激活和较高的细胞死亡率，而Gal-9低表达的小胶质细胞则具有更强的吞噬能力 | 研究主要基于小鼠模型和人类胶质母细胞瘤的bulk RNA测序数据，可能需要进一步的人类临床数据验证 | 阐明Galectin-9在脑肿瘤微环境中对小胶质细胞功能的调控作用，并探讨其作为治疗靶点的潜力 | Galectin-9在脑肿瘤微环境中对小胶质细胞和巨噬细胞的功能影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠脑肿瘤模型和人类胶质母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2024-11-17 |
SPathDB: a comprehensive database of spatial pathway activity atlas
2024-Nov-15, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1041
PMID:39546631
|
研究论文 | 介绍了一个名为SPathDB的综合数据库，用于解析空间通路活动图谱 | 首次构建了一个包含大量空间转录组数据和生物通路的数据库，提供了对空间异质性功能活动的交互分析和可视化 | NA | 揭示驱动空间异质性的功能特征和理解复杂的生物过程 | 人类和小鼠的空间转录组数据及生物通路 | 生物信息学 | 癌症 | 空间转录组测序技术 | NA | 转录组数据 | 1689868个空间点，来自84个空间转录组数据集的695个切片，涉及36种组织和疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-11-17 |
Profound cellular defects attribute to muscular pathogenesis in the rhesus monkey model of Duchenne muscular dystrophy
2024-Nov-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.08.041
PMID:39305903
|
研究论文 | 研究揭示了在杜氏肌营养不良（DMD）的恒河猴模型中，肌肉病理发生与细胞缺陷之间的关系 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了DMD恒河猴模型中肌肉组织的细胞和分子变化，发现了免疫细胞景观的改变、纤维化纤维脂肪前体细胞（FAPs）的谱系进展方向逆转以及FAPs和肌肉干细胞（MuSCs）对TGF-β的抵抗性 | NA | 阐明在病理条件下肌肉组织中多种细胞类型的细胞和分子变化 | 杜氏肌营养不良（DMD）的恒河猴模型中的肌肉组织 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-11-17 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the developmental trajectory and transcriptional regulatory networks of quinoa salt bladders
2024-Nov-13, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-024-00189-3
PMID:39532803
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析揭示了藜麦盐囊泡的发育轨迹和转录调控网络 | 首次通过单细胞RNA测序构建了藜麦盐囊泡的细胞图谱，并识别了13个不同的细胞集群，揭示了盐囊泡发育过程中的关键调控因子 | 研究主要集中在藜麦盐囊泡的发育机制，未涉及其在实际农业生产中的应用 | 揭示藜麦盐囊泡的发育机制及其在盐胁迫下的耐受性 | 藜麦盐囊泡的发育过程及其转录调控网络 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 藜麦幼叶来源的原生质体 | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2024-11-17 |
Single-cell transcriptomics reveals the molecular basis of human iPS cell differentiation into ectodermal ocular lineages
2024-Nov-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07130-4
PMID:39532995
|
研究论文 | 本文利用单细胞转录组学研究了人类诱导多能干细胞（hiPSCs）分化为眼外胚层谱系的分子基础 | 本文揭示了眼外胚层细胞在SEAM形成过程中的发育轨迹，并展示了从多能性到组织特化和分化的进展 | NA | 研究人类诱导多能干细胞分化为眼外胚层谱系的分子机制 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）分化为眼外胚层谱系的分子基础 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 12周内的多个时间点样本 | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-11-17 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis reveals tumor cell heterogeneity and underlying molecular program in uveal melanoma
2024-Nov-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05831-2
PMID:39533334
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组分析揭示了葡萄膜黑色素瘤的肿瘤细胞异质性及其潜在的分子机制 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了葡萄膜黑色素瘤的肿瘤细胞异质性，并开发了一种基于机器学习的9基因签名用于患者分层 | 研究仅限于17个肿瘤样本，样本量较小，可能影响结果的普适性 | 揭示葡萄膜黑色素瘤的肿瘤细胞异质性及其对患者分层的潜在影响 | 葡萄膜黑色素瘤的肿瘤细胞及其分子特征 | 数字病理学 | 眼癌 | 单细胞转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 37,660个恶性细胞来自17个葡萄膜黑色素瘤肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2024-11-17 |
m5C related-regulator-mediated methylation modification patterns and prognostic significance in breast cancer
2024-11-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77389-4
PMID:39523404
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和转录组数据，筛选与乳腺癌进展相关的m5C调控因子，并分析其临床价值 | 首次在单细胞水平揭示m5C调控因子在乳腺癌中的失调机制及其在癌变和进展中的关键作用 | 需要更多独立数据集进行外部验证，以增强研究结果的可靠性 | 评估m5C调控因子在乳腺癌中的表达及其与肿瘤微环境、临床病理特征和预后的相关性 | m5C调控因子在乳腺癌中的作用及其临床意义 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及乳腺癌患者的单细胞和转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2024-11-17 |
Integrated multiomics analysis identified comprehensive crosstalk between diverse programmed cell death patterns and novel molecular subtypes in Hepatocellular Carcinoma
2024-11-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78911-4
PMID:39528670
|
研究论文 | 本文通过整合多组学分析，揭示了肝细胞癌中多种程序性细胞死亡模式之间的相互作用，并识别出新的分子亚型 | 开发并验证了一种新的分类器，用于肝细胞癌患者的个性化管理，并提出了程序性细胞死亡指数（PCDI），该指数与患者的病理分级和预后相关 | NA | 开发和验证一种新的分类器，用于肝细胞癌患者的个性化管理，并研究程序性细胞死亡模式与肝细胞癌进展和预后的关系 | 肝细胞癌患者的转录组、蛋白质组和单细胞数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | qPCR, 蛋白质印迹, 免疫组化 | Elastic net, Random Forest, XgBoost, Boruta, Nonnegative Matrix Factorization (NMF) | 转录组, 蛋白质组, 单细胞数据 | 四个独立的肝细胞癌队列，以及一个真实世界的肝细胞癌样本集 | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2024-11-17 |
Comparative transcriptomic analyses of thymocytes using 10x Genomics and Parse scRNA-seq technologies
2024-Nov-11, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10976-x
PMID:39528918
|
研究论文 | 本文比较了10x Genomics和Parse scRNA-seq技术在胸腺细胞转录组分析中的表现 | 首次对10x Genomics和Parse scRNA-seq技术在复杂免疫组织中的性能进行了全面比较 | 研究仅限于小鼠胸腺细胞，未涉及其他细胞类型或组织 | 评估10x Genomics和Parse scRNA-seq技术在免疫学研究中的适用性 | 小鼠胸腺细胞 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 生物和技术重复的小鼠胸腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2024-11-17 |
Single cell analysis identified a basal cell transition state associated with the development and progression of bladder cancer
2024-Nov-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05841-0
PMID:39523319
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析，揭示了膀胱癌发展过程中基底细胞的过渡状态 | 发现了基底细胞在膀胱癌发展中的过渡状态，并识别了与癌症进展相关的关键转录因子 | 研究主要基于已有的单细胞数据，未进行新的实验验证 | 揭示膀胱癌的分子机制并寻找新的治疗方法 | 膀胱癌中的基底细胞及其过渡状态 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 24,930个细胞，包括上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-11-17 |
Protective role of aconitate decarboxylase 1 in neuroinflammation-induced dysfunctions of the paraventricular thalamus and sleepiness
2024-Nov-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07215-0
PMID:39523388
|
研究论文 | 研究探讨了神经炎症引起的睡眠障碍与腹侧室旁核（PVT）功能异常的关系，并发现阿康酸脱羧酶1（Acod1）在其中的保护作用 | 首次揭示了Acod1在神经炎症引起的睡眠障碍中的保护作用，并验证了其代谢产物伊塔康酸的抗炎和神经保护作用 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨神经炎症引起的睡眠障碍的神经调节机制 | 腹侧室旁核（PVT）神经元和小胶质细胞 | 神经科学 | 神经炎症 | 电生理记录、RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 电生理数据、基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2024-11-17 |
Single-cell transcriptomic and cross-species comparison analyses reveal distinct molecular changes of porcine testes during puberty
2024-Nov-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07163-9
PMID:39521938
|
研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术分析了巴马猪睾丸在不同发育阶段的转录组特征，并与人类和小鼠进行了比较 | 揭示了猪在出生后不久即开始减数分裂的早期现象，并发现了一种类似于人类0型精原干细胞的猪精原细胞亚型 | NA | 研究猪睾丸在青春期的分子变化，并探讨其在生殖生物学、农业育种和转化医学中的应用潜力 | 巴马猪睾丸在胎儿期、婴儿期、青春期和成年期的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 多个发育阶段的巴马猪睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2024-11-17 |
Spatial transcriptomics reveals strong association between SFRP4 and extracellular matrix remodeling in prostate cancer
2024-Nov-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07161-x
PMID:39511287
|
研究论文 | 研究通过空间转录组学和多组学分析揭示了SFRP4与前列腺癌中细胞外基质重塑的强关联 | 首次通过空间转录组学和多组学分析揭示了SFRP4 mRNA在前列腺癌微环境中的分布及其与细胞外基质成分的共表达，为诊断和治疗提供了新见解 | 研究中发现SFRP4 mRNA水平与蛋白质水平不一致，这可能影响基于mRNA的诊断准确性 | 探讨SFRP4在前列腺癌中的生物学机制及其与癌症侵袭性的关系 | SFRP4基因表达及其在前列腺癌组织中的空间分布 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学、转录组学、蛋白质组学、DNA甲基组学和组织染色 | NA | mRNA、蛋白质、DNA甲基化 | 相同的前列腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2024-11-17 |
scGraphformer: unveiling cellular heterogeneity and interactions in scRNA-seq data using a scalable graph transformer network
2024-Nov-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07154-w
PMID:39511415
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于transformer的图神经网络模型scGraphformer，用于从单细胞RNA测序数据中揭示细胞异质性和相互作用 | scGraphformer通过直接从scRNA-seq数据中学习全面的细胞-细胞关系网络，超越了传统图神经网络依赖预定义图的局限性 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的细胞类型分类，并揭示细胞间的相互作用 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和细胞间关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-11-17 |
Single-cell sequencing reveals cellular heterogeneity of nucleus pulposus in intervertebral disc degeneration
2024-11-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78675-x
PMID:39516278
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了椎间盘退变过程中髓核组织的细胞异质性 | 首次在单细胞水平上揭示了椎间盘退变过程中髓核组织的细胞和分子变化，并识别了不同细胞群之间的潜在相互作用 | 研究样本仅来自接受椎间盘切除术的患者，可能存在选择偏倚 | 深入了解椎间盘退变过程中髓核组织的细胞异质性和分子特征 | 椎间盘退变患者的髓核组织 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 47,610个单细胞 | NA | NA | NA | NA |