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当前共找到 579 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-11-21 |
Overcoming Low mRNA Expression in White Matter: A Protocol for RNA Extraction From the Optic Nerve in Large Animals for Transcriptomic Analysis
2024-Nov-04, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.13.25
PMID:39540862
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研究论文 | 本文开发了一种从大型动物视神经中提取高质量RNA的协议，用于转录组分析 | 首次发现白质中的mRNA表达水平显著低于灰质，并开发了一种专门用于大型动物视神经的RNA提取协议 | NA | 研究白质异常与中枢神经系统疾病的关系，并开发适用于大型动物视神经的RNA提取方法 | 大型动物视神经中的RNA提取 | 数字病理学 | NA | 原位杂交和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 442 | 2024-11-21 |
Cell type-specific weighting-factors to solve solid organs-specific limitations of single cell RNA-sequencing
2024-Nov, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011436
PMID:39556600
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研究论文 | 本文提出了一种计算方法，通过引入细胞类型特异性权重因子（cWF）来解决单细胞RNA测序（scRNA-seq）在分析复杂实体器官时的问题 | 本文的创新点在于提出了细胞类型特异性权重因子（cWF），并通过计算方法解决了scRNA-seq在分析实体器官时的局限性 | 本文的局限性在于仅针对10种实体器官的76种细胞类型进行了验证，可能不适用于所有器官和细胞类型 | 本文的研究目的是解决单细胞RNA测序在分析复杂实体器官时的局限性 | 本文的研究对象是10种实体器官中的76种细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 10种实体器官中的76种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 443 | 2024-11-20 |
scCancerExplorer: a comprehensive database for interactively exploring single-cell multi-omics data of human pan-cancer
2024-Nov-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1100
PMID:39558175
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研究论文 | 开发了一个名为scCancerExplorer的综合数据库，用于交互式探索人类泛癌的单细胞多组学数据 | 填补了缺乏专门用于交互式探索人类泛癌单细胞多组学数据的数据库的空白 | NA | 开发一个用户友好的数据库，促进对单细胞基因组、表观基因组和转录组数据的探索 | 人类泛癌的单细胞基因组、表观基因组和转录组数据 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞多组学 | NA | 基因组、表观基因组和转录组数据 | 50种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 444 | 2024-11-20 |
Single-cell expression and immune infiltration analysis of polyamine metabolism in breast cancer
2024-Nov-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01524-w
PMID:39549127
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和系统免疫学方法分析了乳腺癌中多胺代谢与免疫浸润的关系 | 首次结合单细胞RNA测序和系统免疫学方法，探讨了乳腺癌中多胺代谢与免疫微环境的相互作用 | 研究样本主要来自TCGA和GEO数据库，可能存在数据偏差 | 探讨乳腺癌中多胺代谢与免疫浸润的关系，为个性化治疗提供新思路 | 乳腺癌样本中的多胺代谢与免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 46个乳腺癌增殖相关共表达模块 | NA | NA | NA | NA |
| 445 | 2024-11-20 |
Single-cell data revealed the regulatory mechanism of TNK cell heterogeneity in liver metastasis from gastric cancer
2024-Nov-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01528-6
PMID:39549183
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析了胃癌肝转移中TNK细胞异质性的调控机制 | 首次揭示了TNK细胞亚群在胃癌肝转移中的关键作用及其调控机制 | NA | 分类与胃癌肝转移相关的细胞亚群，并探讨其与其他免疫细胞亚群的相互作用机制 | 胃癌肝转移中的TNK细胞亚群及其调控机制 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | GSE163558数据集中的胃癌患者及其转移组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 446 | 2024-11-19 |
Chrysalis: decoding tissue compartments in spatial transcriptomics with archetypal analysis
2024-Nov-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07165-7
PMID:39550461
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Chrysalis的计算方法，用于在空间转录组学中通过空间变异基因检测和原型分析快速揭示组织区室，无需外部参考数据 | Chrysalis方法无需外部参考数据，通过空间变异基因检测和原型分析快速揭示组织区室，并提供独特的可视化方法 | NA | 开发一种无需外部参考数据的空间转录组学组织区室解析方法 | 空间转录组学中的组织区室 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 原型分析 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 447 | 2024-11-20 |
Unveiling the role of Pleckstrin-2 in tumor progression and immune modulation: insights from a comprehensive pan-cancer analysis with focus on lung cancer
2024-11-15, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-024-00225-8
PMID:39546161
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研究论文 | 研究探讨了Pleckstrin-2（PLEK2）在肿瘤进展和免疫调节中的作用，特别是在肺癌中的表现 | 系统分析了PLEK2在多种癌症中的表达模式、预后相关性和功能影响，并发现PLEK2抑制剂Navitoclax的潜在应用 | 研究主要基于TCGA、GTEx和Human Protein Atlas的数据，可能存在数据来源的局限性 | 揭示PLEK2在肿瘤进展和免疫调节中的作用，寻找新的生物标志物和治疗靶点 | PLEK2在多种癌症中的表达、预后影响及其在肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 使用了来自TCGA、GTEx和Human Protein Atlas的数据，具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 448 | 2024-11-20 |
Analysis of single-cell RNA sequencing in human oocytes with diminished ovarian reserve uncovers mitochondrial dysregulation and translation deficiency
2024-Nov-15, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01321-8
PMID:39548561
|
研究论文 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术分析了卵巢储备减少（DOR）患者卵母细胞的转录组变化，揭示了线粒体功能失调和翻译缺陷 | 首次采用单细胞RNA测序技术揭示DOR卵母细胞的转录组变化，并发现PLAG1-IGF2轴的失调可能与DOR卵母细胞质量下降有关 | 研究仅限于GV阶段的DOR卵母细胞，未涵盖其他发育阶段的卵母细胞 | 揭示卵巢储备减少患者卵母细胞的特定致病机制 | 卵巢储备减少患者的卵母细胞 | 基因组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | DOR卵母细胞和对照卵母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2024-11-20 |
Lateralized nodose ganglia gene expression implicates cholecystokinin receptors in interoceptive reward signaling
2024-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.01.621506
PMID:39554115
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析左右迷走神经节基因表达差异，探讨胆囊收缩素受体在内脏奖励信号中的作用 | 首次揭示了迷走神经节中胆囊收缩素A受体在右迷走神经中的特异性表达，可能与内脏奖励信号的不对称编码有关 | 研究仅限于大鼠和小鼠，尚未在人类中验证 | 探讨迷走神经节基因表达差异在内脏奖励信号中的作用 | 大鼠和小鼠的左右迷走神经节 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠和小鼠的左右迷走神经节样本 | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2024-11-19 |
Atypical chemokine receptor 1-positive endothelial cells mediate leucocyte infiltration and synergize with secreted frizzled-related protein 2/asporin-positive fibroblasts to promote skin fibrosis in systemic sclerosis
2024-Nov-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae286
PMID:39009432
|
研究论文 | 研究探讨了系统性硬化症（SSc）和局限性硬皮病（LS）中皮肤纤维化的病理机制，特别是血管内皮细胞损伤与免疫细胞浸润的关系以及不同细胞类型在纤维化皮肤生态系统中的相互作用 | 首次揭示了非典型趋化因子受体1（ACKR1）在纤维化皮肤组织中高表达促进免疫细胞浸润，并发现SFRP2/ASPN+成纤维细胞协同加剧皮肤纤维化的机制 | 研究样本量较小，且仅限于SSc和LS患者，可能影响结果的普适性 | 探索血管内皮细胞损伤与免疫细胞浸润的关系，以及不同细胞类型在纤维化皮肤生态系统中的相互作用 | 系统性硬化症（SSc）和局限性硬皮病（LS）患者的皮肤纤维化 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共62,295个细胞，来自3名健康供体和7名SSc患者以及3名LS患者的皮肤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2024-11-19 |
Identification of PDLIM1 as a glioblastoma stem cell marker driving tumorigenesis and chemoresistance
2024-Nov-15, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-024-02241-7
PMID:39548074
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，鉴定PDLIM1为胶质母细胞瘤干细胞标记物，驱动肿瘤发生和化学抗性 | 首次鉴定PDLIM1为胶质母细胞瘤干细胞的新标记物，并揭示其在肿瘤发生和化学抗性中的作用 | NA | 识别新的胶质母细胞瘤干细胞标记物，以改善诊断和靶向治疗 | 胶质母细胞瘤干细胞及其在肿瘤进展、复发和化学抗性中的作用 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量RNA测序 (RNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2024-11-19 |
Single cell-spatial transcriptomics and bulk multi-omics analysis of heterogeneity and ecosystems in hepatocellular carcinoma
2024-Nov-15, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00752-1
PMID:39548284
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研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组学和批量多组学分析，揭示了肝细胞癌（HCC）生态系统的异质性和多样性 | 首次全面分析了HCC细胞在塑造肿瘤生态系统中的核心作用，并揭示了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的代谢紊乱和免疫功能障碍 | 研究样本量较小，仅包括六个HCC病例和一个非癌性肝脏对照 | 探讨肝细胞癌的异质性和生态系统构成 | 肝细胞癌（HCC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞空间转录组学和批量多组学分析 | NA | 转录组数据 | 六个HCC病例和一个非癌性肝脏对照 | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2024-11-19 |
Multi-omics-driven discovery of invasive patterns and treatment strategies in CA19-9 positive intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Nov-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05854-9
PMID:39548460
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了CA19-9阳性肝内胆管癌的分子特征和治疗靶点 | 首次系统地阐明了CA19-9阳性肝内胆管癌的临床、基因组、转录组和免疫特征，并揭示了与糖酵解相关的细胞群及其促进癌症的机制 | NA | 支持CA19-9阳性肝内胆管癌的个性化治疗 | CA19-9阳性肝内胆管癌 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 多组学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 7个临床队列、2个全外显子测序队列、6个RNA测序/微阵列队列、1个蛋白质组队列、20个单细胞RNA测序样本、1个空间转录组样本、52个组织微阵列样本 | NA | NA | NA | NA |
| 454 | 2024-11-19 |
Modulation of SRC by SNTB1 activates the Hippo-YAP pathway during colon adenocarcinoma metastasis
2024-Nov-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05548-2
PMID:39548564
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研究论文 | 研究探讨了SNTB1通过调节SRC激活Hippo-YAP通路在结肠腺癌转移中的作用 | 首次揭示了SNTB1与SRC相互作用激活Hippo-YAP通路，促进结肠腺癌转移的机制 | NA | 探究结肠腺癌转移的分子机制，寻找新的治疗靶点 | 结肠腺癌及其转移组织 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 408名结肠腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 455 | 2024-11-19 |
Stomatal maturomics: hunting genes regulating guard cell maturation and function formation from single-cell transcriptomes
2024-Nov, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.05.004
PMID:38768655
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研究论文 | 研究通过整合分析三个公开的气孔相关单细胞RNA测序数据集，识别出586个在气孔成熟和功能形成过程中特异性上调的基因 | 首次定义并应用了“maturomics”概念，即组织或器官成熟过程的组学分析，并识别出与气孔成熟和功能形成相关的基因列表 | 研究主要基于已有的公开数据集，未进行新的实验验证 | 研究气孔成熟和功能形成过程中基因的调控机制 | 气孔及其保卫细胞的成熟过程 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个公开的气孔相关单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 456 | 2024-11-19 |
Insights into left-right asymmetric development of chicken ovary at the single-cell level
2024-Nov, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.08.002
PMID:39147128
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析了鸡胚胎发育过程中左右卵巢的基因表达模式，揭示了卵巢不对称发育的分子机制 | 首次在单细胞水平上揭示了鸡卵巢左右不对称发育的基因表达模式，并识别了特定细胞类型和信号通路在不对称发育中的作用 | 研究仅限于鸡胚胎发育阶段，未涵盖成年鸡的卵巢发育情况 | 探讨鸡卵巢左右不对称发育的分子机制 | 鸡胚胎发育过程中左右卵巢的细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 135,000个细胞，来自鸡胚胎发育的六个不同阶段 | NA | NA | NA | NA |
| 457 | 2024-11-19 |
From MGUS to multiple myeloma: Unraveling the unknown of precursor states
2024-Nov, Blood reviews
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.blre.2024.101242
PMID:39389906
|
综述 | 本文回顾了从单克隆免疫球蛋白病到多发性骨髓瘤的前驱状态的历史、当前定义、风险分层模型的挑战以及新兴技术在预测和改善患者预后中的作用 | 本文介绍了新兴技术如全基因组测序、肿瘤微环境分析和单细胞RNA测序在分子水平上理解前驱状态的应用 | 当前的统计模型仅提供平均风险评分，无法在个体层面上预测进展风险 | 旨在更好地表征单克隆免疫球蛋白病和其他骨髓瘤前驱状态，以提供更精确的个体化风险评估 | 单克隆免疫球蛋白病和多发性骨髓瘤的前驱状态 | NA | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序、肿瘤微环境分析、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 458 | 2024-11-19 |
Comprehensive mapping of somatotroph pituitary neuroendocrine tumour heterogeneity using spatial and single-cell transcriptomics
2024-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70090
PMID:39548559
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，全面分析了生长激素细胞垂体神经内分泌肿瘤的异质性 | 首次通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，可视化了正常和肿瘤垂体组织的细胞分布，并揭示了生长激素细胞垂体神经内分泌肿瘤的转录组异质性 | NA | 研究生长激素细胞垂体神经内分泌肿瘤的驱动基因和机制，以开发新的治疗策略 | 生长激素细胞垂体神经内分泌肿瘤和正常垂体样本 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 空间转录组学 (ST) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 生长激素细胞肿瘤和正常垂体样本 | NA | NA | NA | NA |
| 459 | 2024-11-18 |
Identification of feature genes in intestinal epithelial cell types
2024-Nov-15, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-024-00208-8
PMID:39542983
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了人和小鼠肠道不同细胞类型的特征基因，并通过免疫荧光染色和CRISPR/Cas9敲除技术探讨了这些基因在调节肠道上皮细胞增殖和分化中的作用 | 本研究不仅报道了多种肠道上皮细胞类型的新标记物，还阐明了相关基因在决定上皮细胞命运和维持干细胞稳态中的作用 | NA | 深入探索肠道上皮细胞的代表性标记物和转录因子，以进行全面的细胞命运轨迹分析 | 人和小鼠的肠道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、CRISPR/Cas9敲除 | NA | 基因表达数据 | 人和小鼠的肠道上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 460 | 2024-11-18 |
A multimodal zebrafish developmental atlas reveals the state-transition dynamics of late-vertebrate pluripotent axial progenitors
2024-Nov-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.047
PMID:39454574
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研究论文 | 本文介绍了Zebrahub，一个整合了单细胞测序时间序列数据和光片显微镜重建的斑马鱼胚胎发育动态图谱 | Zebrahub提供了高分辨率和深入的分子洞察力，通过在十个发育阶段对单个胚胎进行测序，并重建细胞轨迹，同时包含一个交互式工具来导航复杂的细胞流动和谱系 | NA | 阐明生物体发育过程，全面理解细胞谱系在空间、时间和分子域中的变化 | 斑马鱼胚胎发育中的神经-中胚层前体细胞（NMPs）和联合肾-造血干细胞前体细胞的起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，光片显微镜 | NA | 单细胞数据 | 十个发育阶段的单个斑马鱼胚胎 | NA | NA | NA | NA |