单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 582 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-11-19 |
Widespread transposable element dysregulation in human aging brains with Alzheimer's disease
2024-Nov, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14164
PMID:39356058
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研究论文 | 研究了阿尔茨海默病（AD）患者大脑中转座元件（TE）的失调现象，并利用大规模RNA测序和全基因组测序数据识别了TE表达的定量性状位点（teQTLs） | 首次在人类衰老大脑中系统地描述了TE表达的定量性状位点（teQTLs），并验证了AD相关TE的功能 | 研究主要集中在AD患者的大脑样本上，可能无法完全代表所有衰老大脑的情况 | 探讨阿尔茨海默病患者大脑中转座元件的失调现象及其与神经炎症的关系 | 阿尔茨海默病患者的大脑样本和人类诱导多能干细胞衍生的神经元 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序、全基因组测序、CRISPR干扰（CRISPRi） | NA | 基因组数据 | 三个阿尔茨海默病大脑生物库的样本，共26,188个基因组范围内的显著TE表达QTLs |
| 402 | 2024-11-19 |
From MGUS to multiple myeloma: Unraveling the unknown of precursor states
2024-Nov, Blood reviews
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.blre.2024.101242
PMID:39389906
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综述 | 本文回顾了从单克隆免疫球蛋白病到多发性骨髓瘤的前驱状态的历史、当前定义、风险分层模型的挑战以及新兴技术在预测和改善患者预后中的作用 | 本文介绍了新兴技术如全基因组测序、肿瘤微环境分析和单细胞RNA测序在分子水平上理解前驱状态的应用 | 当前的统计模型仅提供平均风险评分，无法在个体层面上预测进展风险 | 旨在更好地表征单克隆免疫球蛋白病和其他骨髓瘤前驱状态，以提供更精确的个体化风险评估 | 单克隆免疫球蛋白病和多发性骨髓瘤的前驱状态 | NA | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序、肿瘤微环境分析、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-11-19 |
[Current applications and translational prospects of omics technologies in urothelial carcinoma]
2024-Nov-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
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研究论文 | 本文探讨了组学技术在尿路上皮癌诊断和治疗中的应用及转化前景 | 利用基因组学、转录组学和蛋白质组学揭示了尿路上皮癌的分子机制和生物学特性，单细胞组学和空间转录组学进一步加深了对细胞异质性和肿瘤微环境的理解 | NA | 探讨组学技术在尿路上皮癌诊断和治疗中的应用及转化前景 | 尿路上皮癌 | NA | 泌尿系统肿瘤 | 组学技术 | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-11-19 |
Comprehensive mapping of somatotroph pituitary neuroendocrine tumour heterogeneity using spatial and single-cell transcriptomics
2024-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70090
PMID:39548559
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，全面分析了生长激素细胞垂体神经内分泌肿瘤的异质性 | 首次通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，可视化了正常和肿瘤垂体组织的细胞分布，并揭示了生长激素细胞垂体神经内分泌肿瘤的转录组异质性 | NA | 研究生长激素细胞垂体神经内分泌肿瘤的驱动基因和机制，以开发新的治疗策略 | 生长激素细胞垂体神经内分泌肿瘤和正常垂体样本 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 空间转录组学 (ST) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 生长激素细胞肿瘤和正常垂体样本 |
| 405 | 2024-11-18 |
YAP1 Inhibition Induces Phenotype Switching of Cancer-Associated Fibroblasts to Tumor Suppressive in Prostate Cancer
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0932
PMID:39137404
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研究论文 | 研究揭示了YAP1抑制剂在前列腺癌中诱导癌症相关成纤维细胞表型转换的机制 | 首次揭示了YAP1在调节癌症相关成纤维细胞表型中的作用，并提出了一种通过靶向YAP1来改变成纤维细胞亚型以增强免疫检查点阻断疗法效果的治疗策略 | NA | 揭示调节癌症相关成纤维细胞可塑性的机制，以增强前列腺癌对免疫检查点阻断疗法的响应 | 前列腺癌中的癌症相关成纤维细胞及其表型转换 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个前列腺癌单细胞RNA测序数据集 |
| 406 | 2024-11-18 |
A Dual-Payload Antibody-Drug Conjugate Targeting CD276/B7-H3 Elicits Cytotoxicity and Immune Activation in Triple-Negative Breast Cancer
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-4099
PMID:39186778
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研究论文 | 研究开发了一种双载荷抗体药物偶联物（DualADC），用于治疗三阴性乳腺癌（TNBC），通过靶向CD276/B7-H3诱导细胞毒性和免疫激活 | 首次开发了一种双载荷抗体药物偶联物，结合了传统的细胞毒性载荷和免疫调节的Toll样受体7/8激动剂，有效杀伤多种TNBC亚型并增强肿瘤微环境中的免疫功能 | NA | 开发一种新的抗体药物偶联物，用于治疗难治性转移性三阴性乳腺癌 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | NA | 乳腺癌 | 抗体药物偶联物（ADC） | NA | RNA测序、多重细胞因子分析、组织学 | NA |
| 407 | 2024-11-18 |
Identification of feature genes in intestinal epithelial cell types
2024-Nov-15, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-024-00208-8
PMID:39542983
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了人和小鼠肠道不同细胞类型的特征基因，并通过免疫荧光染色和CRISPR/Cas9敲除技术探讨了这些基因在调节肠道上皮细胞增殖和分化中的作用 | 本研究不仅报道了多种肠道上皮细胞类型的新标记物，还阐明了相关基因在决定上皮细胞命运和维持干细胞稳态中的作用 | NA | 深入探索肠道上皮细胞的代表性标记物和转录因子，以进行全面的细胞命运轨迹分析 | 人和小鼠的肠道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、CRISPR/Cas9敲除 | NA | 基因表达数据 | 人和小鼠的肠道上皮细胞 |
| 408 | 2024-11-18 |
Insulin-like growth factor 2 drives fibroblast-mediated tumor immunoevasion and confers resistance to immunotherapy
2024-Nov-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183366
PMID:39545420
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研究论文 | 本文揭示了胰岛素样生长因子2（IGF2）在肿瘤免疫逃逸和免疫治疗耐药中的关键作用 | 发现IGF2通过促进癌症相关成纤维细胞（CAFs）与T细胞的相互作用，驱动肿瘤免疫逃逸，并增加免疫治疗耐药性 | NA | 探讨IGF2在肿瘤免疫逃逸和免疫治疗耐药中的作用机制 | 胰岛素样生长因子2（IGF2）及其在肿瘤免疫逃逸中的作用 | NA | NA | 空间转录组学和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用IGF2缺陷小鼠模型进行研究 |
| 409 | 2024-11-18 |
A multimodal zebrafish developmental atlas reveals the state-transition dynamics of late-vertebrate pluripotent axial progenitors
2024-Nov-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.047
PMID:39454574
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研究论文 | 本文介绍了Zebrahub，一个整合了单细胞测序时间序列数据和光片显微镜重建的斑马鱼胚胎发育动态图谱 | Zebrahub提供了高分辨率和深入的分子洞察力，通过在十个发育阶段对单个胚胎进行测序，并重建细胞轨迹，同时包含一个交互式工具来导航复杂的细胞流动和谱系 | NA | 阐明生物体发育过程，全面理解细胞谱系在空间、时间和分子域中的变化 | 斑马鱼胚胎发育中的神经-中胚层前体细胞（NMPs）和联合肾-造血干细胞前体细胞的起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，光片显微镜 | NA | 单细胞数据 | 十个发育阶段的单个斑马鱼胚胎 |
| 410 | 2024-11-18 |
Machine learning-driven discovery of novel therapeutic targets in diabetic foot ulcers
2024-Nov-14, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00955-z
PMID:39543487
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研究论文 | 利用机器学习方法识别糖尿病足溃疡（DFU）中的治疗反应基因 | 首次通过机器学习方法识别出与DFU相关的关键基因SCUBE1和RNF103-CHMP3，并探讨了其在免疫调节和细胞通讯中的作用 | 研究结果需要在更大规模的队列中进行验证，并探索其在临床治疗中的应用潜力 | 通过机器学习方法识别糖尿病足溃疡中的潜在治疗靶点 | 糖尿病足溃疡患者的转录组数据和单细胞转录组数据 | 机器学习 | 糖尿病 | 转录组分析 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 糖尿病足溃疡患者和健康对照的转录组数据，以及单细胞转录组数据 |
| 411 | 2024-11-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of the cellular ecosystem of primary hepatocellular carcinoma
2024-Nov-14, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03574-0
PMID:39543644
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在原发性肝细胞癌（HCC）细胞生态系统中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了HCC细胞生态系统的复杂性和异质性 | NA | 理解HCC的发展并识别新的治疗靶点 | HCC细胞及其非恶性基质细胞的异质性和相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 412 | 2024-11-18 |
Comparison of functional characterization of cancer stem cells in different tumor tissues of pseudomyxoma peritonei
2024-Nov-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05730-6
PMID:39543711
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研究论文 | 本研究比较了伪黏液瘤腹膜（PMP）患者不同肿瘤组织中癌症干细胞（CSCs）的功能特征 | 首次比较了PMP患者不同肿瘤组织中CSCs的增殖、迁移和抗炎能力 | 样本量较小，未涉及长期疗效和临床应用 | 研究PMP患者不同肿瘤组织中CSCs的生物学特性 | PMP患者的癌症干细胞（CSCs） | 数字病理学 | 腹膜肿瘤 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据 | 涉及PMP患者的不同肿瘤组织中的CSCs |
| 413 | 2024-11-18 |
Transcriptome-based network analysis related to regulatory T cells infiltration identified RCN1 as a potential biomarker for prognosis in clear cell renal cell carcinoma
2024-Nov-14, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-024-00404-x
PMID:39543725
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研究论文 | 研究通过转录组网络分析识别与调节性T细胞浸润相关的RCN1作为透明细胞肾细胞癌的潜在预后生物标志物 | 开发了一个与调节性T细胞浸润相关的预后模型，并发现RCN1在透明细胞肾细胞癌中的预后价值 | NA | 识别透明细胞肾细胞癌的预后标志物和治疗靶点 | 调节性T细胞在透明细胞肾细胞癌中的作用 | 生物信息学 | 肾癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 转录组数据 | TCGA-KIRC样本 |
| 414 | 2024-11-18 |
Preexisting senescent fibroblasts in the aged bladder create a tumor-permissive niche through CXCL12 secretion
2024-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00704-1
PMID:39251867
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研究论文 | 研究揭示了衰老膀胱中预先存在的衰老成纤维细胞通过分泌CXCL12促进肿瘤生长的机制 | 首次揭示了衰老膀胱中p16-sn成纤维细胞通过分泌CXCL12促进肿瘤生长的机制 | 研究主要基于基因修饰小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探讨衰老如何通过特定机制促进膀胱癌的发生 | 衰老膀胱中的成纤维细胞及其在膀胱癌中的作用 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因修饰小鼠模型中的成纤维细胞 |
| 415 | 2024-11-18 |
Jag1 insufficiency alters liver fibrosis via T cell and hepatocyte differentiation defects
2024-Nov, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-024-00145-8
PMID:39358604
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研究论文 | 研究Jag1不足如何通过T细胞和肝细胞分化缺陷影响肝纤维化 | 首次揭示了Jag1不足导致的肝细胞和T细胞分化缺陷与肝纤维化之间的关系 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探讨Jag1不足对肝纤维化的影响及其机制 | Jag1小鼠模型、T细胞、肝细胞 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序、多色流式细胞术 | NA | RNA | 涉及Jag1小鼠和患者肝样本 |
| 416 | 2024-11-18 |
Integrated single-cell transcriptomic analyses identify a novel lineage plasticity-related cancer cell type involved in prostate cancer progression
2024-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105398
PMID:39418984
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组分析，识别出一种与前列腺癌进展相关的新型细胞类型，该细胞类型具有谱系可塑性 | 首次识别出一种新型谱系可塑性相关的前列腺癌细胞类型，并揭示其在肿瘤进展中的关键作用 | NA | 识别并验证与前列腺癌进展相关的谱系可塑性相关细胞类型 | 前列腺癌细胞及其谱系可塑性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3314个样本和222,529个细胞 |
| 417 | 2024-11-17 |
Galectin-9 Mediates the Functions of Microglia in the Hypoxic Brain Tumor Microenvironment
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3878
PMID:39207402
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研究论文 | 研究探讨了Galectin-9在缺氧脑肿瘤微环境中对小胶质细胞功能的影响 | 揭示了Galectin-9在脑肿瘤微环境中对小胶质细胞的独特功能，并发现Gal-9高表达的小胶质细胞具有炎症激活和较高的细胞死亡率，而Gal-9低表达的小胶质细胞则具有更强的吞噬能力 | 研究主要基于小鼠模型和人类胶质母细胞瘤的bulk RNA测序数据，可能需要进一步的人类临床数据验证 | 阐明Galectin-9在脑肿瘤微环境中对小胶质细胞功能的调控作用，并探讨其作为治疗靶点的潜力 | Galectin-9在脑肿瘤微环境中对小胶质细胞和巨噬细胞的功能影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠脑肿瘤模型和人类胶质母细胞瘤样本 |
| 418 | 2024-11-17 |
SPathDB: a comprehensive database of spatial pathway activity atlas
2024-Nov-15, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1041
PMID:39546631
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研究论文 | 介绍了一个名为SPathDB的综合数据库，用于解析空间通路活动图谱 | 首次构建了一个包含大量空间转录组数据和生物通路的数据库，提供了对空间异质性功能活动的交互分析和可视化 | NA | 揭示驱动空间异质性的功能特征和理解复杂的生物过程 | 人类和小鼠的空间转录组数据及生物通路 | 生物信息学 | 癌症 | 空间转录组测序技术 | NA | 转录组数据 | 1689868个空间点，来自84个空间转录组数据集的695个切片，涉及36种组织和疾病 |
| 419 | 2024-11-17 |
Contributions of T Cell Signaling for Wound Healing
2024-Nov-14, Journal of burn care & research : official publication of the American Burn Association
IF:1.5Q3
DOI:10.1093/jbcr/irae151
PMID:39110034
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研究论文 | 研究探讨了T细胞在伤口愈合过程中的信号传导机制 | 通过scRNA-seq和免疫荧光成像技术，首次识别了伤口愈合炎症阶段中不同T细胞群体的信号传导特征 | 研究主要集中在炎症阶段的T细胞信号传导，未来需要进一步研究T细胞在伤口愈合其他阶段的作用 | 揭示T细胞在伤口愈合过程中的信号传导机制及其对伤口愈合质量的影响 | T细胞在伤口愈合过程中的信号传导 | NA | NA | scRNA-seq, 免疫荧光成像 | NA | RNA, 图像 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 420 | 2024-11-17 |
Profound cellular defects attribute to muscular pathogenesis in the rhesus monkey model of Duchenne muscular dystrophy
2024-Nov-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.08.041
PMID:39305903
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研究论文 | 研究揭示了在杜氏肌营养不良（DMD）的恒河猴模型中，肌肉病理发生与细胞缺陷之间的关系 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了DMD恒河猴模型中肌肉组织的细胞和分子变化，发现了免疫细胞景观的改变、纤维化纤维脂肪前体细胞（FAPs）的谱系进展方向逆转以及FAPs和肌肉干细胞（MuSCs）对TGF-β的抵抗性 | NA | 阐明在病理条件下肌肉组织中多种细胞类型的细胞和分子变化 | 杜氏肌营养不良（DMD）的恒河猴模型中的肌肉组织 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |