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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-14 |
Unraveling the Heterogeneity of Tumor Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma by SingleCell RNA Sequencing and its Implications for Prognosis and Therapeutic Response
2024-11-28, The Turkish journal of gastroenterology : the official journal of Turkish Society of Gastroenterology
DOI:10.5152/tjg.2024.24118
PMID:39641225
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综述 | 通过单细胞RNA测序技术解析肝细胞癌肿瘤免疫微环境的异质性及其对预后和治疗反应的影响 | 首次从细胞、转录和标志物三个维度系统阐述肝细胞癌肿瘤免疫微环境异质性,并探讨其在免疫治疗时代的意义 | 对肿瘤免疫微环境异质性在肝细胞癌发展中的作用理解仍有限 | 探索肝细胞癌肿瘤免疫微环境异质性及其临床意义 | 肝细胞癌肿瘤免疫微环境 | 单细胞测序分析 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-11-14 |
Microglia and monocyte-derived macrophages drive progression of pediatric high-grade gliomas and are transcriptionally shaped by histone mutations
2024-11-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.09.007
PMID:39395421
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研究论文 | 本研究揭示了髓系细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的关键作用及其受组蛋白突变调控的机制 | 首次在免疫健全的原位小鼠模型中证实髓系细胞是pHGGs中主要的非肿瘤浸润细胞,并发现组蛋白突变和肿瘤位置共同塑造髓系细胞异质性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩展 | 探究髓系细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的作用及潜在治疗靶点 | 儿童高级别胶质瘤(pHGGs)包括半球pHGGs和弥漫中线胶质瘤(DMGs) | 单细胞生物学 | 儿童高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织切片图像 | 小鼠模型和人类pHGG样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-11-09 |
Single-cell stimulus-response gene expression trajectories reveal the stimulus specificities of dynamic responses by single macrophages
2024-Nov-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.09.023
PMID:39413794
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建单细胞基因表达轨迹,揭示了巨噬细胞对刺激的动态响应特异性 | 首次生成高分辨率时间序列单细胞RNA测序数据,并构建实时单细胞基因表达轨迹集合,揭示动态信息对巨噬细胞刺激响应特异性的重要贡献 | 技术限制可能影响单细胞可诱导基因表达动态的捕获能力 | 研究巨噬细胞对免疫威胁的基因表达动态响应机制 | 小鼠巨噬细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因表达轨迹分析 | 单细胞基因表达数据 | 针对六种刺激的巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-11-08 |
Preclinical lentiviral hematopoietic stem cell gene therapy corrects Pompe disease-related muscle and neurological manifestations
2024-Nov-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.09.024
PMID:39295144
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研究论文 | 本研究通过慢病毒载体介导的造血干细胞基因疗法在临床前小鼠模型中逆转庞贝病的病理效应 | 首次系统性评估慢病毒造血干细胞基因疗法对庞贝病相关肌肉和神经系统表现的矫正效果,并包含整合位点分析和单细胞RNA测序的全面安全性评估 | 研究仅限于临床前小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发治疗庞贝病的下一代基因疗法 | 庞贝病小鼠模型 | 基因治疗 | 庞贝病 | 慢病毒载体基因治疗,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,整合位点分析数据 | 临床前小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-11-03 |
Expression of novel androgen receptors in three GnRH neuron subtypes in the cichlid brain
2024-11, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.13429
PMID:38986626
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研究论文 | 本研究通过多种技术方法揭示了慈鲷鱼脑中三种GnRH神经元亚型表达新型雄激素受体的特异性模式 | 首次在慈鲷鱼中明确区分了ar1和ar2基因在三种GnRH神经元亚型中的差异表达,揭示了GnRH1神经元存在遗传学上不同的亚型 | 研究仅针对A. burtoni物种,结果在其他硬骨鱼中的普适性需要进一步验证 | 探究雄激素受体基因在GnRH神经元中的特异性表达模式 | 慈鲷鱼(A. burtoni)脑中的三种GnRH神经元亚型(GnRH1、GnRH2、GnRH3) | 神经科学 | NA | 免疫组织化学, 原位杂交链式反应(HCR), 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2025-11-03 |
In situ reprogramming of cardiac fibroblasts into cardiomyocytes in mouse heart with chemicals
2024-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-024-01308-6
PMID:38890526
|
研究论文 | 本研究通过化学混合物在小鼠心脏中原位将心脏成纤维细胞重编程为心肌细胞 | 首次在全心脏水平使用化学混合物CRFVPTM实现原位成纤维细胞向心肌细胞转分化,并采用组织透明化技术进行三维观察 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探索化学诱导原位心脏成纤维细胞向心肌细胞转分化的可行性 | 小鼠心脏成纤维细胞 | 再生医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 组织透明化技术, 3D成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 两种品系的基因示踪小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | CUBIC组织透明化技术 |
| 27 | 2025-11-03 |
Establishment of a conditionally reprogrammed primary eccrine sweat gland culture for evaluation of tissue-specific CFTR function
2024-Nov, Journal of cystic fibrosis : official journal of the European Cystic Fibrosis Society
IF:5.4Q1
DOI:10.1016/j.jcf.2024.06.013
PMID:38969603
|
研究论文 | 建立条件性重编程的原代外泌汗腺培养体系,用于评估组织特异性CFTR功能 | 首次报道应用条件性重编程和单细胞RNA测序技术研究显微解剖的外泌汗腺 | 样本量有限,仅包含非CF供体和少数CF患者 | 表征外泌汗腺离子转运特性并评估CFTR调节剂疗效 | 外泌汗腺细胞和鼻上皮细胞 | 单细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序, 短路电流测量, 条件性重编程培养 | 原代细胞培养模型 | 基因表达数据, 电生理数据 | 非CF皮肤供体和两名CF患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-11-03 |
Macrophages in the infarcted heart acquire a fibrogenic phenotype, expressing matricellular proteins, but do not undergo fibroblast conversion
2024-Nov, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.07.010
PMID:39089570
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学方法,揭示心肌梗死中巨噬细胞不会转化为成纤维细胞,但会表达促纤维化的基质细胞蛋白 | 首次结合谱系追踪和单细胞RNA测序技术,明确证明心肌梗死中的巨噬细胞不会转分化为成纤维细胞,同时发现其表达多种促纤维化基质蛋白的新功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究心肌梗死中巨噬细胞是否会发生成纤维细胞转化及其在细胞外基质表达中的作用 | 心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对照组和心肌梗死组小鼠的CSF1R+髓系细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-11-03 |
Spatial transcriptomics reveals organized and distinct immune activation in cutaneous granulomatous disorders
2024-Nov, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.07.021
PMID:39098508
|
研究论文 | 通过空间转录组学揭示皮肤肉芽肿性疾病中免疫激活的空间组织模式 | 首次在皮肤肉芽肿性疾病中应用空间转录组学技术,揭示了不同类型疾病特有的空间组织化免疫激活模式 | 样本量有限,仅包含四种皮肤肉芽肿性疾病 | 理解皮肤肉芽肿性疾病的空间基因表达特征 | 皮肤结节病、环状肉芽肿、脂质坏死病和坏死性黄色肉芽肿患者组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤肉芽肿性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | CS、GA、NL、NXG病例组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2025-11-03 |
Spatial Transcriptomic Approach to Understanding Coronary Atherosclerotic Plaque Stability
2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320330
PMID:39234691
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法分析冠状动脉粥样硬化斑块的稳定性 | 首次将GeoMx空间分析平台与全转录组图谱结合,在保留细胞间信号的同时实现斑块细胞形态和空间分辨的转录组分析 | 样本量较小(每组5例患者),仅使用尸检来源的冠状动脉 | 研究稳定和不稳定斑块中血管微环境的分子特征 | 尸检获取的冠状动脉粥样硬化斑块 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,空间反卷积分析 | NA | 空间转录组数据,组织形态学数据 | 10例患者(稳定斑块组5例,不稳定斑块组5例) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间分析平台与全转录组图谱 |
| 31 | 2025-11-03 |
Hepatocellular carcinoma-specific epigenetic checkpoints bidirectionally regulate the antitumor immunity of CD4 + T cells
2024-Nov, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01215-0
PMID:39300319
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研究论文 | 本研究揭示了MATR3作为肝细胞癌特异性表观遗传检查点,双向调节CD4+T细胞的抗肿瘤免疫 | 首次发现MATR3在肝细胞癌中作为表观遗传检查点,通过招募SWI/SNF复合物调节TOX启动子区域染色质状态,双向调控Tconv细胞的抗肿瘤免疫功能 | NA | 探索肝细胞癌中CD4+T细胞的表观遗传调控机制及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肝细胞癌浸润的常规CD4+T细胞(Tconvs) | 表观遗传学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,体内外实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-11-03 |
Localized ablative immunotherapy enhances antitumor immunity by modulating the transcriptome of tumor-infiltrating Gamma delta T cells
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217267
PMID:39307410
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析激光消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞转录组的调控作用 | 首次揭示LAIT疗法通过调节γδT细胞转录组增强抗肿瘤免疫的机制,发现LAIT独特地增加IL17-producing γδT细胞比例 | 研究仅在小鼠乳腺癌模型中进行,尚未在人体直接验证 | 探究激光消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞功能动态的影响 | 小鼠乳腺癌模型中的肿瘤浸润γδT细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组、PTT组、GC组和LAIT组的小鼠肿瘤样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-10-11 |
Vispro improves imaging analysis for Visium spatial transcriptomics
2024-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617088
PMID:39416029
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研究论文 | 开发了针对10x Visium数据的全自动图像处理工具Vispro,用于改善空间转录组学图像分析 | 首个针对Visium数据的端到端全自动图像处理工具,集成了四个关键模块:基准标记检测、基准标记去除与图像修复、组织区域检测和分离组织区域分割 | 仅针对10x Visium平台数据开发,未验证在其他空间转录组技术上的适用性 | 解决空间转录组学图像分析中基准标记和背景区域带来的挑战 | 空间转录组学组织图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 34 | 2025-10-07 |
FOXP Genes Regulate Purkinje Cell Diversity in Cerebellar Development and Evolution
2024-Nov-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.07.622485
PMID:39574602
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了FOXP基因在调控小脑浦肯野细胞多样性中的关键作用 | 首次在小鼠胚胎小脑中鉴定出11种浦肯野细胞亚型,并开发了新的无监督方法进行三维空间定位 | 研究主要基于小鼠模型,人类和小鸡样本的比较分析相对有限 | 探究小脑发育过程中浦肯野细胞多样性的分子调控机制 | 小鼠、人类和小鸡的小脑浦肯野细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督学习方法 | 单细胞转录组数据 | 胚胎小鼠小脑浦肯野细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-10-05 |
Widespread transposable element dysregulation in human aging brains with Alzheimer's disease
2024-Nov, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14164
PMID:39356058
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座元件的广泛失调,并利用CRISPR干扰实验验证了特定转座元件对炎症基因的调控作用 | 首次在人类阿尔茨海默病衰老大脑中系统鉴定转座元件表达数量性状位点(teQTL),并通过CRISPRi实验验证了神经元特异性转座元件调控机制 | 研究主要基于三个脑组织生物样本库,样本来源和数量可能存在限制 | 探究人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座元件失调的遗传调控机制 | 人类阿尔茨海默病患者的脑组织样本和iPSC来源的神经元 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序,全基因组测序,CRISPR干扰,xQTL分析 | 数量性状位点分析,共定位分析 | 基因组数据,转录组数据 | 三个大型人类AD脑组织生物样本库的样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-05 |
Biallelic Loss-of-Function Variants in UBAP1L and Nonsyndromic Retinal Dystrophies
2024-Nov-01, JAMA ophthalmology
IF:7.8Q1
DOI:10.1001/jamaophthalmol.2024.3836
PMID:39325468
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研究论文 | 本研究通过临床和分子特征分析,发现UBAP1L基因的双等位基因功能丧失变异与非综合征性视网膜营养不良相关 | 首次将UBAP1L基因鉴定为新的视网膜营养不良致病基因,并通过小鼠模型和单细胞RNA测序验证其功能 | 样本量较小(仅6名患者),小鼠模型未表现出视网膜退化表型 | 阐明遗传性视网膜营养不良的遗传基础,改善临床诊断和预后 | 6名来自4家三级医院的遗传性视网膜营养不良患者 | 遗传学 | 视网膜营养不良 | 外显子组测序,基因组测序,单细胞RNA测序,小基因检测,基因敲除小鼠模型 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据,转录组数据,临床评估数据 | 6名患者,来自6个家庭 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis defines LGALS1+ fibroblasts that promote proliferation and migration of intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-11-25, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjae023
PMID:38862197
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌肿瘤微环境,鉴定出促进肿瘤恶性表型的LGALS1+成纤维细胞亚群 | 首次在肝内胆管癌中鉴定出特异性表达LGALS1的成纤维细胞亚群,并阐明其通过调控CCR2、ADAM15和β-整合素促进肿瘤进展的机制 | 样本量较小(14例患者),需更大规模研究验证 | 探究肝内胆管癌肿瘤异质性及成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用 | 14例初治肝内胆管癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织 | 单细胞测序分析 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-10-05 |
Decoding Functional and Developmental Trajectories of Tissue-Resident Uterine Dendritic Cells Through Integrative Omics
2024-Nov-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5424920/v1
PMID:39606471
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研究论文 | 通过整合多组学方法解析子宫驻留树突状细胞的功能和发育轨迹 | 首次系统鉴定人类子宫内膜中子宫树突状细胞的亚型及其发育轨迹,并揭示不同亚型在胚胎植入前后的特异性功能 | 研究样本数量有限,且主要关注早期妊娠阶段 | 阐明子宫树突状细胞的起源、分子特征及其在子宫内膜功能和胚胎植入过程中的作用 | 人类子宫内膜组织中的子宫树突状细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据,表面蛋白表达数据 | 不同月经周期和早期妊娠阶段的子宫组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-05 |
Fate (or state) of CA2 neurons in a mineralocorticoid receptor knockout
2024-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.29.626110
PMID:39651204
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法探究盐皮质激素受体敲除后海马CA2区神经元的命运变化 | 首次发现MR敲除导致CA2神经元获得CA1样分子表型,揭示了MR在控制CA2神经元发育状态中的关键作用 | 研究主要关注分子表型变化,对行为功能影响的直接证据不足 | 探究盐皮质激素受体敲除对海马CA2区神经元命运的影响 | 小鼠海马CA2区神经元 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 条件性基因敲除模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-05 |
Substrate Stiffness Dictates Unique Doxorubicin-induced Senescence-associated Secretory Phenotypes and Transcriptomic Signatures in Human Pulmonary Fibroblasts
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.18.623471
PMID:39605579
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研究论文 | 研究机械张力通过基质刚度调控人肺成纤维细胞衰老相关分泌表型和转录组特征 | 首次揭示基质刚度特异性影响多柔比星诱导的细胞衰老和SASP表型,并发现高刚度驱动的胶原蛋白富集特征 | 研究主要基于体外细胞模型,体内验证相对有限 | 探究机械力刺激对细胞衰老和衰老相关分泌表型的影响机制 | 人原代肺成纤维细胞(IMR-90)和小鼠肺纤维化模型 | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 质谱分析、转录组测序、单细胞RNA测序、计算元分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 人原代肺成纤维细胞在不同刚度基质上的培养模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |