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当前共找到 579 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-08-23 |
Hunger signalling in the olfactory bulb primes exploration, food-seeking and peripheral metabolism
2024-Nov, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.102025
PMID:39236785
|
研究论文 | 本研究探讨了嗅球中饥饿素受体（GHSR）如何影响嗅觉功能、觅食行为及外周代谢。 | 首次通过条件性基因敲除小鼠模型，证明嗅球GHSR在饥饿状态下对嗅觉功能、探索行为和代谢调节的关键作用，并结合单细胞和空间转录组数据鉴定GHSR+神经元类型。 | 研究主要基于小鼠模型，未涉及人类；未深入探究GHSR下游信号通路的具体分子机制。 | 阐明嗅球中GHSR在调节嗅觉功能、觅食行为及代谢过程中的作用机制。 | 小鼠（嗅球GHSR缺失小鼠及对照） | 神经科学 | NA | 行为学分析、scRNA-seq、空间转录组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、行为数据、代谢数据 | 未明确，涉及小鼠模型和多组学数据集 | 未明确（可能包含10x Genomics） | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 未明确 | 未明确 |
| 22 | 2026-08-21 |
A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06806-x
PMID:38057666
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学技术在空间和时间上详细描绘了人类胚胎肢体发育过程，揭示了细胞多样化和新的细胞群体，并绘制了胎儿后肢的空间转录图谱 | 首次对人类胚胎肢体发育进行跨空间和时间的单细胞与空间转录组综合分析，发现了多个新的细胞群体和两波肌肉发育过程，并利用新开发的VisiumStitcher工具拼接多个空间转录组样本 | 未提及具体局限性 | 深入表征人类胚胎肢体发育的细胞和分子机制，以填补模式生物之外的人类研究空白 | 人类胚胎肢体（包括上肢和下肢）及小鼠胚胎肢体 | 转录组学 | 先天性肢体畸形 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 未明确提及具体样本数量，但包括多个人类胚胎肢体样本和小鼠胚胎肢体样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞转录组和10x Visium空间转录组，使用VisiumStitcher拼接多个空间样本 |
| 23 | 2026-08-21 |
Proinflammatory immune cells disrupt angiogenesis and promote germinal matrix hemorrhage in prenatal human brain
2024-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01769-2
PMID:39349662
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研究论文 | 该研究揭示了产前人类大脑中促炎免疫细胞破坏血管生成并促进生发基质出血的机制 | 首次发现小胶质细胞与新生血管的年龄依赖性相互作用，并证明在早产儿生发基质出血中，激活的中性粒细胞和单核细胞通过产生促炎因子破坏血管完整性 | 研究主要基于小鼠模型和早产儿样本，可能无法完全代表人类胎儿发育的复杂情况，且具体分子机制尚需进一步验证 | 探究生发基质出血的病因，特别是免疫细胞在血管生成和血管脆弱性中的作用 | 产前小鼠和人类大脑的生发基质，以及CD45免疫细胞 | 神经科学 | 生发基质出血 | 单细胞转录组学，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 包含正常早产儿和生发基质出血早产儿的CD45细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 24 | 2026-08-20 |
WEST is an ensemble method for spatial transcriptomics analysis
2024-11-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100886
PMID:39515332
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研究论文 | 提出了一种用于空间转录组学分析的加权集成方法WEST，以提高数据分析的性能和鲁棒性 | 利用集成技术结合多个方法，提升空间域检测的准确性和灵活性，具有广泛的适用性 | 未明确提及局限性；可能依赖于合成和真实数据集的验证 | 开发一种通用的空间转录组数据分析方法，以有效整合表达和空间信息 | 空间转录组学数据，包括合成和真实数据集 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 集成方法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 25 | 2026-08-20 |
Clustering-independent estimation of cell abundances in bulk tissues using single-cell RNA-seq data
2024-11-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100905
PMID:39561717
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研究论文 | 提出了一种名为ConDecon的无聚类方法，用于从单细胞RNA测序数据推断bulk组织中每个细胞存在的可能性，从而无需依赖离散细胞类型即可进行基因表达去卷积。 | 创新点在于开发了ConDecon，一种聚类独立的去卷积方法，能够推断连续细胞过程（如细胞分化或免疫细胞激活）中的细胞状态，相比基于回归的方法提高了表型分辨率和功能性。 | 局限性在于ConDecon可能依赖于单细胞数据的质量和代表性，且对于噪声或批次效应敏感，但摘要未明确提及具体限制。 | 旨在通过单细胞RNA-seq数据，以聚类独立的方式估计bulk组织中的细胞丰度，提高去卷积的分辨率，以支持对连续细胞过程的推断。 | 研究对象包括儿科室管膜瘤中的神经退行性小胶质细胞炎症通路及其间质转化，以及bulk ATAC-seq等其他数据模态。 | 机器学习, 生物信息学 | 儿科室管膜瘤, 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），bulk RNA测序，bulk ATAC测序 | NA | 基因表达数据，ATAC-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，bulk ATAC测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-08-20 |
Decoding Functional and Developmental Trajectories of Tissue-Resident Uterine Dendritic Cells Through Integrative Omics
2024-Nov-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5424920/v1
PMID:39606471
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和CITE-seq技术，解码人类子宫内膜中组织驻留树突状细胞（uDCs）的功能和发育轨迹 | 首次通过整合单细胞RNA测序和CITE-seq技术，全面解析人子宫内膜中uDCs的亚型、发育轨迹及其在胚胎着床前后的特定功能 | 未提供具体的样本量和验证实验，uDCs在女性生殖疾病中的直接作用仍需进一步研究 | 阐明人类子宫内膜中uDCs的起源、分子特征及在胚胎着床前后的特定作用 | 人类子宫内膜组织中的树突状细胞（uDCs） | 单细胞组学 | 女性生殖障碍 | 单细胞RNA测序、CITE-seq | NA | 基因表达数据、表面蛋白表达数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA测序、CITE-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-08-20 |
Jag1 insufficiency alters liver fibrosis via T cell and hepatocyte differentiation defects
2024-11, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-024-00145-8
PMID:39358604
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研究论文 | 本研究使用Alagille综合征小鼠模型，结合单细胞RNA测序和多色流式细胞术，揭示Jag1单倍剂量不足通过影响T细胞和肝细胞分化导致肝纤维化的机制。 | 首次证明Jag1基因单倍剂量不足通过肝细胞和免疫细胞（尤其是调节性T细胞）的相互作用决定Alagille综合征的纤维化进程。 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且未深入探讨除T细胞和肝细胞外的其他细胞类型在纤维化中的作用。 | 阐明Jag1单倍剂量不足如何通过肝细胞和T细胞分化缺陷促进Alagille综合征中的肝纤维化。 | Alagille综合征小鼠模型（Jag1缺陷小鼠）、Rag1小鼠及患者肝脏样本。 | 免疫学、肝病学、分子生物学 | Alagille综合征、肝纤维化 | 单细胞RNA测序、多色流式细胞术、过继转移、DSS诱导结肠炎、胆管结扎 | 小鼠模型（Jag1缺陷、Rag1缺陷） | 单细胞基因表达数据、流式细胞术数据、组织学数据 | 小鼠模型若干组及患者肝脏样本（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞RNA测序系统 |
| 28 | 2026-08-18 |
Single-cell landscape identified SERPINB9 as a key player contributing to stemness and metastasis in non-seminomas
2024-11-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07220-5
PMID:39528470
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析非精原细胞瘤样本，鉴定出SERPINB9在转移性胚胎癌细胞中高表达，并通过体外和体内实验证明其通过增强肿瘤干性和抑制三级淋巴结构来驱动肿瘤进展 | 首次在单细胞水平阐明非精原细胞瘤的分子特征，并鉴定SERPINB9作为关键调控因子，连接肿瘤干性与转移，为治疗干预提供新靶点 | 未提及明显局限性，但可能包括样本量小或机制探索仅限于体外实验 | 探究非精原细胞瘤中胚胎癌的恶性机制，特别是SERPINB9在肿瘤干性和转移中的作用 | 非精原细胞瘤样本（共4例）及NCCIT和NTERA-2细胞系 | 癌症基因组学 | 睾丸生殖细胞瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、ELISA、Transwell迁移实验、药物敏感性实验、有限稀释实验 | 不适用 | 基因表达数据（单细胞和批量）、实验数据 | 4例非精原细胞瘤样本 | 不明确 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 不明确 | 不明确 |
| 29 | 2026-08-17 |
CH6824025, Potent and Selective Discoidin Domain Receptor 1 Inhibitor, Reduces Kidney Fibrosis in Unilateral Ureteral Obstruction Mice
2024-11-19, The Journal of pharmacology and experimental therapeutics
IF:3.1Q2
DOI:10.1124/jpet.124.002330
PMID:39379147
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研究论文 | 本研究探讨了新型DDR1抑制剂CH6824025对单侧输尿管梗阻小鼠肾纤维化的改善作用，并通过空间转录组分析揭示其潜在机制 | 首次报道强效选择性DDR1抑制剂CH6824025在肾纤维化模型中的治疗效果，并结合10x Visium空间转录组分析揭示其作用机制 | 研究仅在单侧输尿管梗阻小鼠模型中进行，缺乏对其他肾纤维化模型和人类样本的验证，且未深入探讨DDR1抑制剂的长期安全性 | 评估CH6824025对肾纤维化的改善作用及其潜在机制，并探索DDR1作为治疗靶点的可行性 | 单侧输尿管梗阻小鼠的肾脏组织 | 数字病理学 | 肾纤维化 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明，涉及UUO小鼠模型和多组比较 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组分析 |
| 30 | 2026-08-13 |
Human vascularized macrophage-islet organoids to model immune-mediated pancreatic β cell pyroptosis upon viral infection
2024-11-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.08.007
PMID:39232561
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研究论文 | 利用GeoMx空间多组学平台和单细胞RNA测序分析COVID-19胰腺尸检样本及人类胰岛病毒感染模型，开发了hPSC衍生的血管化巨噬细胞-胰岛类器官，揭示了促炎巨噬细胞通过TNFSF12-TNFRSF12A通路介导β细胞焦亡的机制 | 首次开发人类多能干细胞衍生的血管化巨噬细胞-胰岛类器官模型，用于模拟病毒感染时免疫介导的宿主细胞损伤，并揭示了促炎巨噬细胞诱导β细胞焦亡的新机制 | 类器官模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境，且研究主要基于体外实验，缺乏体内验证 | 建立研究免疫介导宿主损伤的人类模型，并探究病毒感染时β细胞损伤的机制 | COVID-19胰腺尸检样本、人类胰岛细胞、hPSC衍生的血管化巨噬细胞-胰岛类器官 | 数字病理学 | 糖尿病、COVID-19、病毒感染相关疾病 | 空间多组学、单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、图像 | COVID-19胰腺尸检样本（具体数量未提及）及人类胰岛细胞样本（具体数量未提及） | NanoString | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | GeoMx Digital Spatial Profiler, Chromium | GeoMx空间多组学平台, 10x Genomics Chromium单细胞RNA测序 |
| 31 | 2026-08-13 |
Alveolar regeneration by airway secretory-cell-derived p63+ progenitors
2024-11-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.08.005
PMID:39232560
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研究论文 | 本研究揭示肺损伤后由气道分泌细胞衍生的p63阳性祖细胞在肺泡再生中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序和克隆分析揭示p63祖细胞在肺损伤后的起源与分化轨迹，并利用双重组酶介导的谱系追踪证实其来源于气道分泌细胞 | 尚未明确p63激活调控肺泡再生的具体分子通路，且动物模型结果向人类肺损伤修复的转化需进一步验证 | 阐明肺损伤后p63阳性祖细胞的起源、命运及其在肺泡再生中的功能 | 小鼠博来霉素诱导的肺损伤模型中的p63阳性祖细胞及其衍生细胞 | 细胞生物学、再生医学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序、克隆分析、双重组酶介导的谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据、遗传谱系追踪数据 | 小鼠肺组织样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-08-13 |
Tryptophan 2,3-dioxygenase-positive matrix fibroblasts fuel breast cancer lung metastasis via kynurenine-mediated ferroptosis resistance of metastatic cells and T cell dysfunction
2024-11, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12608
PMID:39221971
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌肺转移中TDO2阳性基质成纤维细胞通过犬尿氨酸介导的转移细胞铁死亡抵抗和T细胞功能障碍促进肺转移的机制 | 首次解析了肺转移微环境中转移相关成纤维细胞的异质性，并发现TDO2+基质成纤维细胞作为主要亚型通过产生犬尿氨酸上调FTH1增强转移细胞铁死亡抵抗，同时分泌趋化因子招募并诱导T细胞功能障碍，提出靶向肺特异性基质细胞代谢的治疗策略 | 未提及 | 阐明乳腺癌肺转移中转移相关成纤维细胞的异质性及其在肺转移形成中的不同作用 | 乳腺癌肺转移小鼠模型、转移相关成纤维细胞、TDO2+基质成纤维细胞、T细胞、播散肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序 |
| 33 | 2026-08-13 |
Hepatocellular carcinoma-specific epigenetic checkpoints bidirectionally regulate the antitumor immunity of CD4 + T cells
2024-11, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01215-0
PMID:39300319
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研究论文 | 本研究揭示了MATR3作为肝细胞癌特异性表观遗传检查点，双向调控CD4+ T细胞的抗肿瘤免疫，为HCC免疫治疗提供新策略 | 首次发现MATR3在肝细胞癌中作为表观遗传检查点，通过招募SWI/SNF复合物调节TOX启动子区域的染色质状态，双向调控CD4+ T细胞的抗肿瘤活性 | 未提及 | 阐明MATR3在肝细胞癌微环境中对CD4+ T细胞功能的调控机制及其在免疫逃逸中的作用 | 肝细胞癌中的CD4+ T细胞，特别是常规CD4+ T细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Tonsils Reveals Nicotine Enhances HIV-1-Induced NLRP3 Inflammasome and Mitochondrial Activation
2024-11-20, Viruses
DOI:10.3390/v16111797
PMID:39599911
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析人类扁桃体，揭示尼古丁增强HIV-1诱导的NLRP3炎症小体和线粒体激活 | 首次利用单细胞RNA测序技术，在人类扁桃体组织中揭示HIV-1感染与尼古丁暴露对免疫细胞功能的协同效应，特别是对NLRP3炎症小体、氧化应激和线粒体通路的激活 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究HIV-1感染与尼古丁对免疫细胞功能的协同作用，重点关注NLRP3炎症小体激活、氧化应激和线粒体通路 | 人类扁桃体外植体中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-08-06 |
Single-cell profiling reveals a conserved role for hypoxia-inducible factor signaling during human craniotomy infection
2024-11-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101790
PMID:39426374
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了人类开颅术后感染中缺氧诱导因子信号传导的保守作用 | 首次对人类开颅术后感染组织进行单细胞转录组分析，发现粒细胞系髓源性抑制细胞可能来源于迁移的中性粒细胞，并鉴定出保守的缺氧诱导因子信号特征 | 研究仅基于回顾性数据和小鼠模型验证，需要更多前瞻性研究确认其临床转化价值 | 探讨人类开颅术后感染的细胞和分子特征，特别是缺氧诱导因子信号的作用 | 人类开颅术后感染组织及小鼠金黄色葡萄球菌开颅感染模型 | 单细胞转录组学 | 开颅术后感染 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 超过2500例开颅手术的回顾性队列及患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-08-06 |
Cellular heterogeneity and dynamics of the human uterus in healthy premenopausal women
2024-11-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404775121
PMID:39471215
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康绝经前女性子宫细胞，构建了包含超过167,000个细胞的正常子宫细胞图谱，并提出了39种细胞亚型的一致注释系统 | 首次整合多个数据集构建正常子宫细胞图谱，解决命名冲突并提出共识注释系统，识别多种潜在祖细胞 | 未提及 | 描绘健康绝经前女性子宫的细胞异质性和动态变化，为子宫功能及疾病研究提供基础 | 健康绝经前女性的子宫内膜和肌层细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名健康绝经前个体，超过50,000个细胞，并与15名个体的公共数据联合分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-08-06 |
Storm: Incorporating transient stochastic dynamics to infer the RNA velocity with metabolic labeling information
2024-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012606
PMID:39556617
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研究论文 | 提出一种名为Storm的动力学方法，通过求解随机微分方程，利用代谢标记信息推断RNA速度，适用于瞬态过程的时间分辨单细胞RNA测序数据 | 该方法解决了先前方法在瞬态过程中的不足，直接处理计数数据，并放宽参数恒定假设，实现基因-细胞特异性的转录/剪接速率估计 | 未在文中明确说明局限性 | 开发一种能够从代谢标记scRNA-seq数据中推断RNA速度和动力学参数的随机方法，以分析瞬态转录调控 | 时间分辨的单细胞RNA测序数据（tscRNA-seq） | 单细胞转录组学 | 不涉及具体疾病 | 代谢标记scRNA-seq | 随机微分方程模型 | 单细胞基因表达计数数据 | 未在摘要中说明 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-08-06 |
scGRN-Entropy: Inferring cell differentiation trajectories using single-cell data and gene regulation network-based transfer entropy
2024-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012638
PMID:39585902
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研究论文 | 提出scGRN-Entropy方法，利用单细胞数据和基因调控网络中的传递熵推断细胞分化轨迹 | 该方法通过整合基因表达空间的静态关系和基因调控网络（GRN）空间的动态变化，改进了分化轨迹推断的准确性 | 文中未提及明显局限性 | 提高从单细胞RNA测序数据推断细胞分化轨迹和伪时间的准确性 | 细胞分化过程 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 最小生成树算法 | 基因表达数据 | 八个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-08-01 |
Longitudinal analysis of genetic and epigenetic changes in human pluripotent stem cells in the landscape of culture-induced abnormality
2024-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01334-8
PMID:39482531
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研究论文 | 对人胚胎干细胞在培养过程中出现的遗传和表观遗传变化进行了纵向分析，揭示了“培养适应表型”获得的分子机制 | 首次通过同基因人胚胎干细胞模型，结合基因组、单细胞转录组和单细胞ATAC-seq分析，阐明了20q11.21拷贝数增加及表观遗传改变在触发“培养适应表型”中的协同作用 | 未明确提及 | 探究人胚胎干细胞在体外培养中获得“培养适应表型”的分子机制，特别是遗传和表观遗传变化的作用 | 人胚胎干细胞（hESCs）及其同基因模型 | 基因组学、单细胞转录组学、表观遗传学 | 不适用 | 基因组测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据 | 未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-07-30 |
TARGET-seq: Linking single-cell transcriptomics of human dopaminergic neurons with their target specificity
2024-11-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2410331121
PMID:39541349
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研究论文 | 开发TARGET-seq技术，将人多巴胺能神经元的单细胞转录组与其靶标特异性联系起来 | 首次建立单细胞转录组与轴突靶标特异性的直接关联，实现了基于神经解剖学分类的分子身份推断 | 未明确说明局限性 | 探究多巴胺能神经元分子表达谱与其靶标特异性和功能的关系 | 人多巴胺能神经元 | 单细胞转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | TARGET-seq技术（通过AAV介导的逆行转运富集转录组） |