单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 578 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-11-25 |
Single-cell sequencing of full-length transcripts and T-cell receptors with automated high-throughput Smart-seq3
2024-Nov-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-11036-0
PMID:39574011
|
研究论文 | 开发了一种自动化高通量Smart-seq3工作流程，用于单细胞全长转录本和T细胞受体的测序 | 提出了自动化高通量Smart-seq3工作流程，显著提高了细胞捕获效率、基因检测灵敏度和T细胞受体重建的准确性 | NA | 开发和优化单细胞测序技术，以提高数据质量和细胞异质性解析能力 | 人类初级CD4+ T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录本 | 人类初级CD4+ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-11-25 |
High content of nuclei-free low-quality cells in reference single-cell atlases: a call for more stringent quality control using nuclear fraction
2024-Nov-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-11015-5
PMID:39574015
|
研究论文 | 本文探讨了现有单细胞RNA测序数据集中存在的低质量细胞污染问题，并呼吁采用更严格的质控标准 | 提出了将细胞内含子分数或MALAT1表达纳入质控标准，以提高细胞图谱数据的可靠性 | 未详细描述具体实施这些质控标准的步骤和方法 | 揭示现有单细胞RNA测序数据集中的低质量细胞污染问题，并提出改进建议 | 人类细胞图谱、Tabula Sapiens和Tabula Muris等大型单细胞RNA测序数据集 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多个组织和器官的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-11-24 |
Macrophage depletion in inflamed rat knees prevents the activation of synovial mesenchymal stem cells by weakening Nampt and Spp1 signaling
2024-Nov-20, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00361-2
PMID:39563425
|
研究论文 | 研究探讨了在炎症状态下，通过清除巨噬细胞来抑制滑膜间充质干细胞的激活 | 首次揭示了巨噬细胞通过Nampt和Spp1信号通路调控滑膜间充质干细胞的激活 | 研究仅在急性炎症模型中进行，未探讨慢性炎症情况下的效果 | 探究巨噬细胞在炎症和组织再生中的作用及其与滑膜间充质干细胞的相互作用 | 滑膜间充质干细胞和巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及大鼠膝关节样本，具体数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-11-24 |
Pulrodemstat, a selective inhibitor of KDM1A, suppresses head and neck squamous cell carcinoma growth by triggering apoptosis
2024-Nov-20, BMC pharmacology & toxicology
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40360-024-00807-w
PMID:39567962
|
研究论文 | 研究了一种名为Pulrodemstat的选择性KDM1A抑制剂，通过触发凋亡来抑制头颈鳞状细胞癌的生长 | Pulrodemstat在临床试验中显示出比传统化疗药物5-Fu更强的抗肿瘤活性，并且对正常细胞无毒性 | NA | 寻找更精确和有效的头颈鳞状细胞癌治疗方案 | 头颈鳞状细胞癌 | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 高通量筛选、单细胞测序、CCK-8检测、流式细胞术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-11-24 |
TNFR2 blockade promotes antitumoral immune response in PDAC by targeting activated Treg and reducing T cell exhaustion
2024-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008898
PMID:39562007
|
研究论文 | 研究通过阻断TNFR2受体来增强胰腺导管腺癌（PDAC）的抗肿瘤免疫反应 | 提出了一种新的治疗策略，即结合CD40激动剂和TNFR2拮抗剂来治疗PDAC | 单独使用TNFR2阻断剂对CD8+ T细胞的激活效果有限，肿瘤生长抑制效果不显著 | 探讨TNFR2阻断剂在PDAC中的抗肿瘤免疫反应机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者和免疫活性小鼠模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞分析数据 | 24名PDAC患者和免疫活性小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-11-24 |
Prediction of single-cell RNA expression profiles in live cells by Raman microscopy with Raman2RNA
2024-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-02082-2
PMID:38200118
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Raman2RNA的方法，通过拉曼显微镜图像预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 | Raman2RNA方法通过无标记的超光谱拉曼显微镜图像和领域翻译技术，实现了对活细胞中单细胞RNA表达谱的非破坏性预测 | NA | 开发一种非破坏性的方法来预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 | 活细胞中的单细胞RNA表达谱 | 数字病理学 | NA | 拉曼显微镜 | 对抗自编码器 | 图像 | 涉及小鼠成纤维细胞和胚胎干细胞的活细胞追踪 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-11-24 |
A computational approach to assessing the prognostic implications of BRAF and RAS mutations in patients with papillary thyroid carcinoma
2024-Nov, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-024-03911-3
PMID:38886331
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后价值 | 揭示了BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌进展中的重要作用，特别是BRAF V600E突变与侵袭性特征的关联 | NA | 探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后意义 | 甲状腺乳头状癌患者中的BRAF和RAS突变 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 甲状腺乳头状癌和正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-11-24 |
Transcriptomics of Human Brain Tissue in Parkinson's Disease: a Comparison of Bulk and Single-cell RNA Sequencing
2024-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04124-5
PMID:38578357
|
综述 | 本文综述了利用RNA测序技术研究帕金森病（PD）的文献，特别是比较了批量RNA测序和单细胞RNA测序的结果 | 本文通过整合批量和单细胞RNA测序的结果，展示了这两种技术在揭示神经退行性疾病转录变化方面的互补性 | 本文主要基于文献综述，未提供新的实验数据 | 评估批量和单细胞RNA测序技术在研究帕金森病中的兼容性和互补性 | 帕金森病患者的人脑组织 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-11-24 |
Advancements in Single-Cell RNA Sequencing Research for Neurological Diseases
2024-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04126-3
PMID:38564138
|
综述 | 本文详细介绍了单细胞RNA测序技术，并总结了其在神经系统疾病研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术不仅识别了多种细胞类型和反应状态，还揭示了细胞特异性基因表达变化、基因调控网络、细胞间通讯和细胞运动轨迹等 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在神经系统疾病研究中的应用，揭示疾病的具体机制，并为新的治疗策略提供依据 | 神经系统疾病及其相关细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-11-24 |
Targeting METTL3 as a checkpoint to enhance T cells for tumour immunotherapy
2024-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70089
PMID:39568154
|
研究论文 | 本文研究了通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 | 首次探讨了m6A在调节T细胞功能和增强抗肿瘤免疫中的作用，并发现靶向METTL3可以增强肿瘤细胞的免疫原性和T细胞功能 | NA | 探索通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 | METTL3抑制剂STM2457对肿瘤细胞和T细胞功能的影响 | 肿瘤学 | NA | RNA测序 (RNA-seq)，单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，CRISPR Cas9 | NA | RNA | 多种癌细胞系，小鼠黑色素瘤 (B16) 和小鼠结直肠腺癌 (MC38) 模型，人黑色素瘤模型 (A375) 和人T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-11-23 |
Deciphering single-cell gene expression variability and its role in drug response
2024-Nov-20, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae138
PMID:39277847
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了药物反应中基因表达变异性的作用 | 本研究将药物反应与药物基因表达变异性的联系扩展到细胞层面，并提出了一种增强药物疗效预测的新方法 | NA | 探讨基因表达变异性在药物反应中的作用 | 药物基因在不同细胞类型和组织中的表达变异性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及八种不同人体组织的多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-11-23 |
Construction of molecular subtype and prognostic model for gastric cancer based on nucleus-encoded mitochondrial genes
2024-11-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78729-0
PMID:39557952
|
研究论文 | 本研究基于核编码线粒体基因构建胃癌的分子亚型和预后模型 | 首次揭示了核编码线粒体基因突变与胃癌患者生存结果之间的关联，并开发了一个评分系统来预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在样本偏倚和数据质量问题 | 探讨核编码线粒体基因在胃癌中的作用，并开发一个预后模型来预测患者的治疗反应 | 胃癌患者的核编码线粒体基因表达和临床信息 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-11-23 |
Integrated analysis of single-cell RNA sequencing and bulk transcriptome data identifies a pyroptosis-associated diagnostic model for Parkinson's disease
2024-11-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80185-9
PMID:39558055
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，识别出与帕金森病相关的细胞焦亡相关诊断模型 | 首次通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，构建了基于细胞焦亡相关基因的帕金森病诊断模型 | 研究主要基于数据分析，缺乏临床验证 | 开发一种新的帕金森病诊断模型，特别是在疾病的早期阶段 | 帕金森病患者和健康个体的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | LASSO逻辑回归、支持向量机递归特征消除和随机森林 | 基因表达数据 | 帕金森病患者和健康个体的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-11-23 |
Airway ciliary microenvironment responses in mice with primary ciliary dyskinesia and central pair apparatus defects
2024-11-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-79877-z
PMID:39558053
|
研究论文 | 研究了小鼠上呼吸道纤毛微环境中上皮细胞对纤毛运动缺陷和黏液纤毛清除功能障碍的响应 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究了上呼吸道上皮细胞对中央对装置基因突变引起的纤毛运动缺陷的响应 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类患者 | 探讨纤毛运动缺陷对上呼吸道上皮细胞微环境的影响 | 小鼠上呼吸道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及Cfap221/Pcdp1、Cfap54和Spef2基因突变的小鼠上呼吸道上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-11-23 |
Lung Single-Cell Transcriptomics Offers Insights into the Pulmonary Interstitial Toxicity Caused by Silica Nanoparticles
2024-Nov-15, Environment & health (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/envhealth.4c00052
PMID:39568699
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了二氧化硅纳米颗粒引起的肺间质毒性的细胞特异性反应和细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了二氧化硅纳米颗粒引起的肺间质损伤的细胞特异性反应和分子机制 | 研究仅限于Wistar大鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 阐明二氧化硅纳米颗粒暴露引起的肺损伤中不同细胞群体的相互作用和关键因素 | Wistar大鼠的肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10457个肺部细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-11-23 |
Molecular diversity and migration of GABAergic neurons in the developing ventral midbrain
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111239
PMID:39569362
|
研究论文 | 研究了发育中的腹侧中脑中GABA能神经元的分子多样性和迁移机制 | 通过单细胞RNA测序和荧光激活细胞分选技术，首次全面揭示了腹侧中脑中GABA能神经元的亚型及其空间分布和发育机制 | 研究仅限于小鼠模型，可能不适用于其他物种 | 探讨腹侧中脑中GABA能神经元的多样性和发育机制 | 发育中的小鼠腹侧中脑中的GABA能神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，荧光激活细胞分选 (FACS) | NA | 转录组数据 | 多个GABA能神经元亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-11-23 |
Single-Cell and Spatial Multi-omics Reveal Interferon Signaling in the Pathogenesis of Perianal Fistulizing Crohn's Disease
2024-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.08.620717
PMID:39574705
|
研究论文 | 研究使用单细胞和空间多组学技术揭示了肛周瘘管性克罗恩病发病机制中的干扰素信号 | 首次通过单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和空间转录组学等多组学方法，全面分析了肛周瘘管性克罗恩病中的免疫和非免疫细胞群，并揭示了干扰素信号在疾病发病机制中的关键作用 | 研究样本量较小，且未涉及长期随访数据 | 探讨肛周瘘管性克罗恩病的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 肛周瘘管性克罗恩病患者、无肛周疾病的克罗恩病患者和特发性肛周瘘管患者的黏膜细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共63名患者，包括24名肛周瘘管性克罗恩病患者、10名无肛周疾病的克罗恩病患者和29名特发性肛周瘘管患者 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-11-23 |
Spatial Transcriptomics Reveals the Temporal Architecture of the Seminiferous Epithelial Cycle and Precise Sertoli-Germ Synchronization
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620681
PMID:39554074
|
研究论文 | 本文利用空间转录组学技术研究了小鼠睾丸中精原上皮周期的时间结构和Sertoli细胞与生殖细胞的精确同步 | 首次通过空间转录组学技术揭示了精原上皮周期中的转录变化模式，并发现Sertoli细胞与生殖细胞发育的周期性转录特征紧密同步 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种 | 揭示精原上皮周期中的转录变化及其与生殖细胞和体细胞的关联 | 小鼠睾丸中的生殖细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 216,090个细胞，2,638个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-11-23 |
Tryptophan 2,3-dioxygenase-positive matrix fibroblasts fuel breast cancer lung metastasis via kynurenine-mediated ferroptosis resistance of metastatic cells and T cell dysfunction
2024-Nov, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12608
PMID:39221971
|
研究论文 | 研究揭示了色氨酸2,3-双加氧酶阳性基质成纤维细胞通过犬尿氨酸介导的铁死亡抵抗和T细胞功能障碍促进乳腺癌肺转移的作用 | 首次揭示了色氨酸2,3-双加氧酶阳性基质成纤维细胞在乳腺癌肺转移中的关键作用，并提出了针对肺特异性基质细胞代谢的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人体中验证其结果 | 解析成纤维细胞异质性及其在乳腺癌肺转移形成中的不同作用 | 乳腺癌肺转移中的成纤维细胞和T细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠模型进行实验，具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-11-23 |
Blockade of CCR5+ T Cell Accumulation in the Tumor Microenvironment Optimizes Anti-TGF-β/PD-L1 Bispecific Antibody
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408598
PMID:39303165
|
研究论文 | 研究通过scRNA-seq分析肿瘤微环境变化，发现YM101治疗后存在免疫抑制性CCR5 T细胞，并提出使用Maraviroc抑制CCR5 T细胞积累以优化YM101疗效 | 首次揭示了YM101治疗后肿瘤微环境中CCR5 T细胞的免疫抑制作用，并提出联合使用Maraviroc以增强YM101的抗肿瘤效果 | 研究主要在肿瘤小鼠模型中进行，尚未在临床试验中验证 | 探索肿瘤微环境中的免疫抑制因素，优化YM101抗肿瘤效果 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和免疫抑制机制 | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 多只肿瘤小鼠 | NA | NA | NA | NA |