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当前共找到 578 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-11-27 |
Predicting survival in bladder cancer with a novel apoptotic gene-related prognostic model
2024-Nov-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01575-z
PMID:39580765
|
研究论文 | 本文建立了一种基于凋亡基因的新型膀胱癌预后模型，并通过多种分析方法验证了其预测生存率和免疫治疗反应的能力 | 首次基于凋亡基因建立了膀胱癌的预后模型，并验证了其在预测生存率和免疫治疗反应中的有效性 | NA | 建立并验证一种基于凋亡基因的膀胱癌预后模型，评估其在预测患者生存率和免疫治疗反应中的作用 | 膀胱癌患者的生存率和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | Cox回归分析 | mRNA表达数据 | TCGA和GEO数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-11-27 |
Exploring new mechanisms in cancer molecular pathways and pathogenic cell transformation: PIP4K2A as a prognostic marker and therapeutic target in cutaneous malignant melanoma
2024-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01555-3
PMID:39579298
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研究论文 | 研究探讨了PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 利用单细胞测序和机器学习技术，研究了PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其对T细胞介导的免疫反应的影响 | NA | 探讨PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其对T细胞介导的免疫反应的影响 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自皮肤黑色素瘤患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-11-27 |
Integration of the bulk transcriptome and single-cell transcriptome reveals efferocytosis features in lung adenocarcinoma prognosis and immunotherapy by combining deep learning
2024-Nov-23, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03571-3
PMID:39580462
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研究论文 | 本研究整合了大量转录组和单细胞转录组数据，通过深度学习揭示了肺腺癌预后和免疫治疗中的吞噬作用特征 | 开发了一种新的与吞噬作用相关的基因预后特征，能够准确预测肺腺癌患者的生存预后和治疗效果 | NA | 研究吞噬作用在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 肺腺癌患者及其相关基因和免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度学习 | NA | 转录组数据 | 涉及TCGA、GEO和CTRP数据库中的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-11-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment niche transitions during the invasive and metastatic processes of ground-glass nodules and part-solid nodules in lung adenocarcinoma
2024-Nov-23, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02177-7
PMID:39580469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肺腺癌中磨玻璃结节和部分实性结节在侵袭和转移过程中的免疫微环境转变 | 首次揭示了CXCL9+和TREM2+肿瘤相关巨噬细胞在不同阶段的显著富集变化，并发现GGN-LUAD在侵袭阶段表现出更强的免疫反应 | 样本量较小，仅包括8例GGN-LUAD和7例PSN-LUAD，可能影响结果的普适性 | 探索肺腺癌不同放射学表型的异质性及其影响肿瘤演变的关联因素 | 肺腺癌中的磨玻璃结节和部分实性结节 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8例GGN-LUAD和7例PSN-LUAD，以及4例邻近正常组织 | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-11-27 |
Regulation of disease-associated microglia in the optic nerve by lipoxin B4 and ocular hypertension
2024-Nov-20, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-024-00775-z
PMID:39568070
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研究论文 | 研究了脂氧素B4和眼压对视神经中疾病相关小胶质细胞的调控作用 | 首次揭示了脂氧素B4在视网膜和视神经中对小胶质细胞的调控作用，并发现其在眼压诱导的神经退行性病变中的神经保护机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步验证在人类中的适用性 | 探讨脂氧素B4在眼压诱导的神经退行性病变中对小胶质细胞的调控作用 | 视网膜和视神经中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、qPCR、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠眼模型 | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-11-27 |
TARGET-seq: Linking single-cell transcriptomics of human dopaminergic neurons with their target specificity
2024-Nov-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2410331121
PMID:39541349
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TARGET-seq的新方法，用于将人类多巴胺能神经元的单细胞转录组与其目标特异性联系起来 | 开发了TARGET-seq技术，通过AAV介导的逆行富集转录组来标记投射，从而将多巴胺能神经元的转录组与其在大脑前部的特定目标结构联系起来 | NA | 探讨不同多巴胺能神经元的分子表达谱与其特定功能或经典分类（如mesolimbic和nigrostriatal）之间的关系 | 人类多巴胺能神经元的单细胞转录组及其目标特异性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-11-27 |
Clustering-independent estimation of cell abundances in bulk tissues using single-cell RNA-seq data
2024-Nov-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100905
PMID:39561717
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ConDecon的聚类无关方法，用于从单细胞RNA测序数据中估计批量组织中的细胞丰度 | ConDecon方法在表型分辨率和功能上相对于基于回归的方法有所改进，能够推断单细胞数据集中每个细胞在批量组织中的存在可能性，并应用于神经退行性微胶质炎症途径在儿童室管膜瘤间充质转化中的作用研究 | NA | 开发一种新的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据中推断批量组织中的细胞组成 | 单细胞RNA测序数据和批量组织数据 | 生物信息学 | 儿童室管膜瘤 | 单细胞RNA测序 | ConDecon方法 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-11-27 |
Non-coding RNAs in oral cancer: Emerging biomarkers and therapeutic frontier
2024-Nov-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40096
PMID:39583806
|
研究论文 | 本文探讨了非编码RNA在口腔癌中的潜在诊断和治疗作用 | 结合空间转录组学和空间代谢组学与单细胞RNA测序，深入研究肿瘤微环境，提高诊断和治疗的精准度 | NA | 探讨非编码RNA作为口腔癌诊断和治疗工具的潜力 | 口腔癌及其相关非编码RNA | 数字病理学 | 口腔癌 | 空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-11-27 |
A signal-diffusion-based unsupervised contrastive representation learning for spatial transcriptomics analysis
2024-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae663
PMID:39546378
|
研究论文 | 提出了一种基于信号扩散的无监督对比表示学习方法（SDUCL），用于空间转录组学分析 | 设计了一种信号扩散微环境发现算法，通过模拟生物信号扩散过程，有效捕捉和整合细胞微环境中的交互信息 | 未提及具体局限性 | 学习细胞/位点的低维潜在嵌入，以解析组织异质性和分析生物功能 | 空间转录组学数据，包括正常和肿瘤组织 | 生物信息学 | 肿瘤 | 信号扩散 | 无监督对比学习 | 基因表达数据、空间信息、图像数据 | 涉及多个物种的空间转录组学数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-11-27 |
Identification and analysis of a cell communication prognostic signature for oral squamous cell carcinoma at bulk and single-cell levels
2024-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70166
PMID:39580787
|
研究论文 | 本文通过单细胞和批量测序数据分析，构建了一个新的免疫相关基因预后模型，用于预测口腔鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次整合单细胞和批量测序数据，构建了一个免疫相关基因预后模型，并验证了FCRL4对口腔鳞状细胞癌细胞的影响 | 需要进一步的临床试验来验证模型的实际应用效果 | 开发一个能够有效预测口腔鳞状细胞癌患者预后和免疫治疗反应的预后模型 | 口腔鳞状细胞癌的免疫微环境分析和预后模型构建 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞测序、批量测序、WGCNA分析、XGBoost | XGBoost | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-11-26 |
Upregulation of CD244 promotes CD8+ T cell exhaustion in patients with alveolar echinococcosis and a murine model
2024-Nov-23, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-024-06573-2
PMID:39578914
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研究论文 | 研究CD244在肺吸虫病患者和鼠模型中促进CD8+ T细胞耗竭的作用 | 首次揭示了CD244在介导CD8+ T细胞耗竭中的作用，并探讨了其在肺吸虫病恶性进展中的机制 | 研究主要基于体外和体内模型，缺乏对人类患者的长期随访数据 | 探讨CD244在肺吸虫病患者中促进CD8+ T细胞耗竭的作用及其机制 | 肺吸虫病患者的CD8+ T细胞和鼠模型 | 免疫学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、流式细胞术 | NA | RNA序列、图像 | 肺吸虫病患者的肝组织样本和CD244缺陷小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-11-26 |
Single-cell sequencing reveals PTX3 involvement in ovarian cancer metastasis
2024-Nov-23, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01558-2
PMID:39580424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化技术，揭示了PTX3在卵巢癌腹膜转移中的作用及其机制 | 首次证实PTX3在卵巢癌转移病灶中的表达高于原发病灶，并发现PTX3通过激活EMT和NF-κB信号通路促进卵巢癌细胞的转移能力 | NA | 探讨PTX3在卵巢癌腹膜转移中的作用及其分子机制 | 卵巢癌细胞、PTX3表达及其功能 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、共免疫沉淀 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-11-26 |
Single-cell analysis uncovers liver susceptibility to pancreatic cancer metastasis via myeloid cell characterization
2024-Nov-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01566-0
PMID:39578286
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胰腺癌肝转移的肿瘤免疫微环境特征 | 发现了与胰腺癌肝转移相关的特定巨噬细胞亚群Mph_SPP1，并揭示了其在调节血管生成和肿瘤侵袭中的作用 | 研究仅限于单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的实验验证 | 探究胰腺癌肝转移的肿瘤免疫微环境特征 | 胰腺癌和结直肠癌的肝转移样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括胰腺癌肝转移、结直肠癌肝转移、原发性胰腺癌、原发性结直肠癌以及外周血单核细胞和邻近正常胰腺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-11-26 |
VGAE-CCI: variational graph autoencoder-based construction of 3D spatial cell-cell communication network
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae619
PMID:39581873
|
研究论文 | 提出了一种基于变分图自编码器的深度学习框架VGAE-CCI，用于构建三维空间细胞间通信网络 | 该方法能够识别跨多层组织的细胞间通信，并适用于具有缺失或部分不完整数据的空间转录组数据 | 未提及 | 解决空间转录组数据中的不完整性和系统偏差问题，以及跨多层组织的细胞间通信分析 | 细胞间通信网络 | 生物信息学 | NA | 空间转录组测序 (ST-seq) | 变分图自编码器 (VGAE) | 空间转录组数据 | 六个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-11-26 |
BioDSNN: a dual-stream neural network with hybrid biological knowledge integration for multi-gene perturbation response prediction
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae617
PMID:39584702
|
研究论文 | 本文提出了一种双流神经网络架构BioDSNN，用于预测多基因扰动响应 | 结合生成模型和生物知识网络，实现了对单细胞RNA-seq数据的双模态深度理解 | NA | 研究基因扰动对细胞的影响，并提出一种新的计算模型来预测未见过的基因扰动组合 | 单细胞RNA-seq数据和基因扰动响应 | 机器学习 | NA | 生成模型、图网络、掩码变换器 | 双流神经网络 | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-11-26 |
Tissue factor pathway inhibitor 2 (TFPI2) is a potential serum biomarker for clear cell renal carcinoma
2024-11-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80248-x
PMID:39562727
|
研究论文 | 研究评估了组织因子途径抑制剂2（TFPI2）作为透明细胞肾细胞癌（RCC）的潜在血清生物标志物的有效性 | TFPI2作为透明细胞肾细胞癌的潜在血清生物标志物，提供了改进检测和预后评估的途径 | NA | 评估TFPI2作为透明细胞肾细胞癌的生物标志物的有效性 | 透明细胞肾细胞癌患者的血清样本和健康志愿者的血清样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血清 | 肾细胞癌患者和健康志愿者的血清样本 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-11-26 |
Cross-tissue organization of myeloid cells in scleroderma and related fibrotic diseases
2024-Nov-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001047
PMID:39171604
|
综述 | 本文综述了硬皮病及相关纤维化疾病中髓系细胞在不同组织中的分布情况 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析，提出了一种统一的髓系细胞命名法，并发现了一种新的树突状细胞亚群DC3 | scRNA-Seq研究在髓系细胞类型的命名上存在不一致性 | 探讨硬皮病及相关纤维化疾病中髓系细胞的组织分布和命名统一 | 硬皮病、特发性肺纤维化、COVID-19肺纤维化、骨髓纤维化及肝、肾、心脏纤维化中的髓系细胞 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多种纤维化疾病的多个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-11-25 |
MCGAE: unraveling tumor invasion through integrated multimodal spatial transcriptomics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae608
PMID:39576225
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MCGAE的多视角对比图自编码器，用于整合多模态空间转录组数据，以揭示肿瘤侵袭区域 | MCGAE通过创建多视角表示和整合基因表达、空间邻接矩阵及形态学图像特征，显著提升了多模态数据处理能力 | NA | 开发一种先进的深度计算框架，用于复杂的空间转录组数据分析 | 空间转录组数据，特别是结直肠癌肝转移中的肿瘤侵袭区域 | 生物医学研究 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | 多视角对比图自编码器 | 基因表达数据、空间坐标数据、形态学信息 | 模拟数据集和真实空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-11-25 |
Roles of cathepsin S expression levels on the prognosis and tumour microenvironment in clear cell renal cell carcinoma
2024-Nov-21, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01547-3
PMID:39570472
|
研究论文 | 研究了组织蛋白酶S在透明细胞肾细胞癌中的表达水平及其对预后和肿瘤微环境的影响 | 首次探讨了组织蛋白酶S在透明细胞肾细胞癌中的潜在作用及其分子功能，并发现其作为预后生物标志物和免疫相关治疗靶点的潜力 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据分析，体外实验验证较少 | 探讨组织蛋白酶S在透明细胞肾细胞癌中的表达及其对预后和肿瘤微环境的影响 | 透明细胞肾细胞癌患者的组织样本和相关数据 | 数字病理学 | 肾癌 | qRT-PCR, IHC | NA | 基因表达数据, 免疫细胞浸润数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个透明细胞肾细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-11-25 |
Peripheral nerve-derived CSF1 induces BMP2 expression in macrophages to promote nerve regeneration and wound healing
2024-Nov-21, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-024-00379-7
PMID:39572537
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研究论文 | 研究揭示了周围神经来源的CSF1通过诱导巨噬细胞中BMP2表达促进神经再生和伤口愈合的机制 | 首次验证了神经与巨噬细胞之间的相互作用在去神经伤口愈合中的关键作用，并揭示了CSF1诱导BMP2表达的神经免疫调节途径 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人体中验证其有效性和安全性 | 探讨炎症和修复性巨噬细胞的调控机制及其在伤口愈合中的作用 | 巨噬细胞、神经元、伤口愈合过程 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 小鼠早期和晚期皮肤伤口样本 | NA | NA | NA | NA |