单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 578 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-11-29 |
Single-cell RNA sequencing reveals key regulators and differentiation trajectory of iPSC-derived cardiomyocytes
2024-11-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-79488-8
PMID:39587160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人诱导多能干细胞（iPSC）向心肌细胞分化的动态基因调控网络和关键调控因子 | 首次在单细胞分辨率下揭示了iPSC向心肌细胞分化的关键调控基因和分化轨迹 | 研究仅基于两个iPSC细胞系，可能存在样本多样性不足的问题 | 揭示心肌细胞分化过程中的动态基因调控网络和关键调控因子 | 人诱导多能干细胞（iPSC）及其分化为心肌细胞的过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 32,365个细胞，来自4个分化阶段的两个iPSC细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-11-29 |
A comprehensive analysis of gene expression and the immune landscape in gastric cancer through single-cell and multi-omics approaches
2024-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01591-z
PMID:39585511
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研究论文 | 本研究通过单细胞和多组学方法全面分析了胃癌中的基因表达和免疫景观 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了胃癌微环境的细胞景观和基因表达谱，并发现了与肿瘤微环境相关的性别偏倚基因功能 | NA | 探讨胃癌微环境中不同细胞类型和基因表达谱的分布，揭示潜在的分子机制 | 胃癌样本中的基因表达和免疫微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-11-29 |
Inhalation of itraconazole mitigates bleomycin-induced lung fibrosis via regulating SPP1 and C3 signaling pathway pivotal in the interaction between phagocytic macrophages and diseased fibroblasts
2024-Nov-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05895-0
PMID:39587675
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研究论文 | 研究通过吸入伊曲康唑减轻博来霉素诱导的肺纤维化，并探讨其通过调节SPP1和C3信号通路在吞噬性巨噬细胞与病变成纤维细胞相互作用中的作用 | 开发了一种吸入型伊曲康唑制剂，显著提高了药物在肺组织中的积累，从而增强了治疗效果 | 研究仅在动物模型中进行，尚未进行临床试验 | 探索吸入伊曲康唑对肺纤维化的治疗效果及其分子机制 | 博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-11-29 |
Integration of single-cell sequencing and drug sensitivity profiling reveals an 11-gene prognostic model for liver cancer
2024-Nov-25, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00698-2
PMID:39587687
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和药物敏感性分析，构建了一个11基因的肝癌预后模型 | 首次基于单细胞测序数据构建了肝癌的11基因预后模型，并结合药物敏感性分析识别了高风险患者的潜在治疗药物 | 研究仅使用了TCGA-LIHC数据集和GDSC数据库中的15个肝癌细胞系，样本量有限 | 旨在通过单细胞测序和药物敏感性分析，构建肝癌的预后模型并识别潜在治疗药物 | 肝癌患者的预后和治疗 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO模型 | 基因表达数据 | 370名肝癌患者和15个肝癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-11-29 |
Stiffness-dependent LOX regulation via HIF-1 drives extracellular matrix modifications in psoriasis
2024-Nov-25, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.10.611
PMID:39603411
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研究论文 | 研究探讨了银屑病中机械力调节对疾病进展的影响，特别是通过HIF-1介导的LOX调控对细胞外基质（ECM）的重组作用 | 发现了HIF-1在机械敏感性皮肤成纤维细胞中对LOX蛋白调控的新机制，并揭示了机械力在银屑病发病机制中的潜在作用 | 研究主要集中在体外实验和scRNA-seq分析，缺乏体内实验验证 | 探讨机械力调节在银屑病发病机制中的作用 | 银屑病患者的皮肤成纤维细胞和细胞外基质 | 数字病理学 | 银屑病 | 多光子二次谐波生成显微镜、scRNA-seq | NA | 图像、基因表达数据 | 银屑病患者皮肤样本及体外培养的皮肤成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-11-29 |
Integrated single-cell transcriptome and TCR profiles of hepatocellular carcinoma highlight the convergence on interferon signaling during immunotherapy
2024-Nov-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010534
PMID:39581706
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研究论文 | 研究分析了肝细胞癌患者在接受免疫检查点抑制剂联合治疗前后的单细胞转录组和T细胞受体谱，揭示了干扰素信号在免疫治疗响应中的关键作用 | 首次全面分析了肝细胞癌患者在接受免疫检查点抑制剂联合治疗前后的单细胞转录组和T细胞受体谱，揭示了干扰素信号在免疫治疗响应中的普遍收敛现象 | 研究样本量较小，仅包括7名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨免疫检查点抑制剂联合治疗对肝细胞癌患者免疫微环境的影响，寻找预测治疗响应的生物标志物 | 肝细胞癌患者的单细胞转录组和T细胞受体谱 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14个腹水样本，来自7名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-11-29 |
Understanding isoform expression by pairing long-read sequencing with single-cell and spatial transcriptomics
2024-Nov-20, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279640.124
PMID:39567235
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综述 | 本文综述了单细胞和空间长读长测序技术的发展及其在理解RNA异构体表达中的应用 | 结合长读长测序与单细胞和空间转录组学技术，以更好地表征异构体表达 | 这些技术在实施和数据解释方面存在挑战，且我们对RNA异构体生物学角色的理解仍然有限 | 探讨长读长测序技术在单细胞和空间转录组学中的应用，以及其在理解RNA异构体在发育和病理中的作用 | RNA异构体的表达及其在生物学中的作用 | NA | NA | 长读长测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-11-29 |
Identification of Spatial Specific Lipid Metabolic Signatures in Long-Standing Diabetic Kidney Disease
2024-Nov-20, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14110641
PMID:39590877
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研究论文 | 研究通过整合单细胞RNA测序和空间多组学数据，分析了长期糖尿病肾病中的脂质代谢特征 | 首次在长期糖尿病肾病样本中识别出两种受损细胞类型（iTAL和iPT），并发现其脂质代谢和生物合成活动的变化 | 研究主要基于Kidney Precision Medicine Project的数据，样本量和多样性可能有限 | 探讨长期糖尿病肾病中的脂质代谢特征及其与细胞损伤的关系 | 长期糖尿病肾病样本中的脂质代谢和细胞损伤 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、空间多组学 | NA | RNA测序数据、空间代谢组学数据 | 长期糖尿病肾病样本，具体数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-11-29 |
Lactylation Modification as a Promoter of Bladder Cancer: Insights from Multi-Omics Analysis
2024-Nov-13, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46110766
PMID:39590360
|
研究论文 | 本文通过多组学分析探讨了乳酸化修饰在膀胱癌中的作用，并构建了一个基于乳酸化修饰的预后模型 | 首次构建了基于乳酸化修饰的膀胱癌预后模型，并验证了其在临床预后预测和治疗指导中的潜力 | 需要进一步的临床验证和更大样本量的研究来确认模型的普适性和稳定性 | 探讨乳酸化修饰在膀胱癌中的作用，并构建一个有效的预后模型 | 膀胱癌患者的乳酸化修饰相关基因和预后 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 多组学分析 | Lasso算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库和TCGA数据库的多个膀胱癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-11-29 |
From Genomic Exploration to Personalized Treatment: Next-Generation Sequencing in Oncology
2024-Nov-06, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46110744
PMID:39590338
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综述 | 本文综述了下一代测序（NGS）在肿瘤学中的应用，从基因组探索到个性化治疗 | NGS提供了全面的癌症基因组分析，使临床医生和研究人员能够更好地理解癌症的分子基础，并根据基因组改变定制治疗策略 | NGS在个性化肿瘤学中的全部潜力需要通过生物信息学分析来实现 | 探讨NGS技术在个性化肿瘤学中的应用，包括理解肿瘤异质性和识别驱动突变 | NGS技术及其在癌症基因组和转录组分析中的应用 | 数字病理学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-11-29 |
Deep Learning and Single-Cell Sequencing Analyses Unveiling Key Molecular Features in the Progression of Carotid Atherosclerotic Plaque
2024-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70220
PMID:39586797
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析，揭示了颈动脉粥样硬化斑块进展中的关键分子特征 | 本研究首次识别出在高级斑块中显著增加浸润的单核细胞亚群，并基于此开发了区分早期和高级斑块的机器学习模型 | 本研究主要基于单细胞RNA测序数据，未来需进一步验证这些发现在临床样本中的适用性 | 揭示颈动脉粥样硬化斑块进展中的免疫细胞特征和诊断标志物 | 颈动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞和分子特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-11-27 |
Predicting survival in bladder cancer with a novel apoptotic gene-related prognostic model
2024-Nov-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01575-z
PMID:39580765
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研究论文 | 本文建立了一种基于凋亡基因的新型膀胱癌预后模型，并通过多种分析方法验证了其预测生存率和免疫治疗反应的能力 | 首次基于凋亡基因建立了膀胱癌的预后模型，并验证了其在预测生存率和免疫治疗反应中的有效性 | NA | 建立并验证一种基于凋亡基因的膀胱癌预后模型，评估其在预测患者生存率和免疫治疗反应中的作用 | 膀胱癌患者的生存率和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | Cox回归分析 | mRNA表达数据 | TCGA和GEO数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-11-27 |
Exploring new mechanisms in cancer molecular pathways and pathogenic cell transformation: PIP4K2A as a prognostic marker and therapeutic target in cutaneous malignant melanoma
2024-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01555-3
PMID:39579298
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研究论文 | 研究探讨了PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 利用单细胞测序和机器学习技术，研究了PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其对T细胞介导的免疫反应的影响 | NA | 探讨PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其对T细胞介导的免疫反应的影响 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自皮肤黑色素瘤患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-11-27 |
Integration of the bulk transcriptome and single-cell transcriptome reveals efferocytosis features in lung adenocarcinoma prognosis and immunotherapy by combining deep learning
2024-Nov-23, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03571-3
PMID:39580462
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研究论文 | 本研究整合了大量转录组和单细胞转录组数据，通过深度学习揭示了肺腺癌预后和免疫治疗中的吞噬作用特征 | 开发了一种新的与吞噬作用相关的基因预后特征，能够准确预测肺腺癌患者的生存预后和治疗效果 | NA | 研究吞噬作用在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 肺腺癌患者及其相关基因和免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度学习 | NA | 转录组数据 | 涉及TCGA、GEO和CTRP数据库中的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-11-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment niche transitions during the invasive and metastatic processes of ground-glass nodules and part-solid nodules in lung adenocarcinoma
2024-Nov-23, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02177-7
PMID:39580469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肺腺癌中磨玻璃结节和部分实性结节在侵袭和转移过程中的免疫微环境转变 | 首次揭示了CXCL9+和TREM2+肿瘤相关巨噬细胞在不同阶段的显著富集变化，并发现GGN-LUAD在侵袭阶段表现出更强的免疫反应 | 样本量较小，仅包括8例GGN-LUAD和7例PSN-LUAD，可能影响结果的普适性 | 探索肺腺癌不同放射学表型的异质性及其影响肿瘤演变的关联因素 | 肺腺癌中的磨玻璃结节和部分实性结节 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8例GGN-LUAD和7例PSN-LUAD，以及4例邻近正常组织 | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-11-27 |
Regulation of disease-associated microglia in the optic nerve by lipoxin B4 and ocular hypertension
2024-Nov-20, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-024-00775-z
PMID:39568070
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研究论文 | 研究了脂氧素B4和眼压对视神经中疾病相关小胶质细胞的调控作用 | 首次揭示了脂氧素B4在视网膜和视神经中对小胶质细胞的调控作用，并发现其在眼压诱导的神经退行性病变中的神经保护机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步验证在人类中的适用性 | 探讨脂氧素B4在眼压诱导的神经退行性病变中对小胶质细胞的调控作用 | 视网膜和视神经中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、qPCR、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠眼模型 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-11-27 |
TARGET-seq: Linking single-cell transcriptomics of human dopaminergic neurons with their target specificity
2024-Nov-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2410331121
PMID:39541349
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TARGET-seq的新方法，用于将人类多巴胺能神经元的单细胞转录组与其目标特异性联系起来 | 开发了TARGET-seq技术，通过AAV介导的逆行富集转录组来标记投射，从而将多巴胺能神经元的转录组与其在大脑前部的特定目标结构联系起来 | NA | 探讨不同多巴胺能神经元的分子表达谱与其特定功能或经典分类（如mesolimbic和nigrostriatal）之间的关系 | 人类多巴胺能神经元的单细胞转录组及其目标特异性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-11-27 |
Clustering-independent estimation of cell abundances in bulk tissues using single-cell RNA-seq data
2024-Nov-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100905
PMID:39561717
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ConDecon的聚类无关方法，用于从单细胞RNA测序数据中估计批量组织中的细胞丰度 | ConDecon方法在表型分辨率和功能上相对于基于回归的方法有所改进，能够推断单细胞数据集中每个细胞在批量组织中的存在可能性，并应用于神经退行性微胶质炎症途径在儿童室管膜瘤间充质转化中的作用研究 | NA | 开发一种新的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据中推断批量组织中的细胞组成 | 单细胞RNA测序数据和批量组织数据 | 生物信息学 | 儿童室管膜瘤 | 单细胞RNA测序 | ConDecon方法 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-11-27 |
Non-coding RNAs in oral cancer: Emerging biomarkers and therapeutic frontier
2024-Nov-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40096
PMID:39583806
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研究论文 | 本文探讨了非编码RNA在口腔癌中的潜在诊断和治疗作用 | 结合空间转录组学和空间代谢组学与单细胞RNA测序，深入研究肿瘤微环境，提高诊断和治疗的精准度 | NA | 探讨非编码RNA作为口腔癌诊断和治疗工具的潜力 | 口腔癌及其相关非编码RNA | 数字病理学 | 口腔癌 | 空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-11-27 |
A signal-diffusion-based unsupervised contrastive representation learning for spatial transcriptomics analysis
2024-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae663
PMID:39546378
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研究论文 | 提出了一种基于信号扩散的无监督对比表示学习方法（SDUCL），用于空间转录组学分析 | 设计了一种信号扩散微环境发现算法，通过模拟生物信号扩散过程，有效捕捉和整合细胞微环境中的交互信息 | 未提及具体局限性 | 学习细胞/位点的低维潜在嵌入，以解析组织异质性和分析生物功能 | 空间转录组学数据，包括正常和肿瘤组织 | 生物信息学 | 肿瘤 | 信号扩散 | 无监督对比学习 | 基因表达数据、空间信息、图像数据 | 涉及多个物种的空间转录组学数据集 | NA | NA | NA | NA |