单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 583 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-11-26 |
Actin Dysregulation Induces Neuroendocrine Plasticity and Immune Evasion: A Vulnerability of Small Cell Lung Cancer
2024-Nov-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528365
PMID:36824957
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研究论文 | 研究了CRACD在小细胞肺癌中的作用及其对肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸的影响 | 首次揭示了CRACD通过调节肌动蛋白聚合和EZH2介导的H3K27甲基化，影响小细胞肺癌的肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸 | 研究主要集中在CRACD和EZH2的作用，未全面探讨其他潜在的调控机制 | 探讨小细胞肺癌中肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸的机制 | 小细胞肺癌细胞及其相关基因和蛋白质 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小细胞肺癌患者肿瘤样本 |
| 342 | 2024-11-26 |
Cross-tissue organization of myeloid cells in scleroderma and related fibrotic diseases
2024-Nov-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001047
PMID:39171604
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综述 | 本文综述了硬皮病及相关纤维化疾病中髓系细胞在不同组织中的分布情况 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析，提出了一种统一的髓系细胞命名法，并发现了一种新的树突状细胞亚群DC3 | scRNA-Seq研究在髓系细胞类型的命名上存在不一致性 | 探讨硬皮病及相关纤维化疾病中髓系细胞的组织分布和命名统一 | 硬皮病、特发性肺纤维化、COVID-19肺纤维化、骨髓纤维化及肝、肾、心脏纤维化中的髓系细胞 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多种纤维化疾病的多个组织样本 |
| 343 | 2024-11-25 |
MCGAE: unraveling tumor invasion through integrated multimodal spatial transcriptomics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae608
PMID:39576225
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MCGAE的多视角对比图自编码器，用于整合多模态空间转录组数据，以揭示肿瘤侵袭区域 | MCGAE通过创建多视角表示和整合基因表达、空间邻接矩阵及形态学图像特征，显著提升了多模态数据处理能力 | NA | 开发一种先进的深度计算框架，用于复杂的空间转录组数据分析 | 空间转录组数据，特别是结直肠癌肝转移中的肿瘤侵袭区域 | 生物医学研究 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | 多视角对比图自编码器 | 基因表达数据、空间坐标数据、形态学信息 | 模拟数据集和真实空间转录组数据集 |
| 344 | 2024-11-25 |
Roles of cathepsin S expression levels on the prognosis and tumour microenvironment in clear cell renal cell carcinoma
2024-Nov-21, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01547-3
PMID:39570472
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研究论文 | 研究了组织蛋白酶S在透明细胞肾细胞癌中的表达水平及其对预后和肿瘤微环境的影响 | 首次探讨了组织蛋白酶S在透明细胞肾细胞癌中的潜在作用及其分子功能，并发现其作为预后生物标志物和免疫相关治疗靶点的潜力 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据分析，体外实验验证较少 | 探讨组织蛋白酶S在透明细胞肾细胞癌中的表达及其对预后和肿瘤微环境的影响 | 透明细胞肾细胞癌患者的组织样本和相关数据 | 数字病理学 | 肾癌 | qRT-PCR, IHC | NA | 基因表达数据, 免疫细胞浸润数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个透明细胞肾细胞癌样本 |
| 345 | 2024-11-25 |
Peripheral nerve-derived CSF1 induces BMP2 expression in macrophages to promote nerve regeneration and wound healing
2024-Nov-21, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-024-00379-7
PMID:39572537
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研究论文 | 研究揭示了周围神经来源的CSF1通过诱导巨噬细胞中BMP2表达促进神经再生和伤口愈合的机制 | 首次验证了神经与巨噬细胞之间的相互作用在去神经伤口愈合中的关键作用，并揭示了CSF1诱导BMP2表达的神经免疫调节途径 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人体中验证其有效性和安全性 | 探讨炎症和修复性巨噬细胞的调控机制及其在伤口愈合中的作用 | 巨噬细胞、神经元、伤口愈合过程 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 小鼠早期和晚期皮肤伤口样本 |
| 346 | 2024-11-25 |
Single-cell sequencing of full-length transcripts and T-cell receptors with automated high-throughput Smart-seq3
2024-Nov-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-11036-0
PMID:39574011
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研究论文 | 开发了一种自动化高通量Smart-seq3工作流程，用于单细胞全长转录本和T细胞受体的测序 | 提出了自动化高通量Smart-seq3工作流程，显著提高了细胞捕获效率、基因检测灵敏度和T细胞受体重建的准确性 | NA | 开发和优化单细胞测序技术，以提高数据质量和细胞异质性解析能力 | 人类初级CD4+ T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录本 | 人类初级CD4+ T细胞 |
| 347 | 2024-11-25 |
High content of nuclei-free low-quality cells in reference single-cell atlases: a call for more stringent quality control using nuclear fraction
2024-Nov-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-11015-5
PMID:39574015
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研究论文 | 本文探讨了现有单细胞RNA测序数据集中存在的低质量细胞污染问题，并呼吁采用更严格的质控标准 | 提出了将细胞内含子分数或MALAT1表达纳入质控标准，以提高细胞图谱数据的可靠性 | 未详细描述具体实施这些质控标准的步骤和方法 | 揭示现有单细胞RNA测序数据集中的低质量细胞污染问题，并提出改进建议 | 人类细胞图谱、Tabula Sapiens和Tabula Muris等大型单细胞RNA测序数据集 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多个组织和器官的数据集 |
| 348 | 2024-11-25 |
Wnt 3a-Modified Scaffolds Improve Nerve Regeneration by Boosting Schwann Cell Function
2024-Nov-20, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c15013
PMID:39520323
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研究论文 | 研究通过单细胞测序分析探讨了Wnt信号通路和施万细胞在周围神经再生中的作用，并开发了一种含有Wnt3a蛋白的聚己内酯电纺纤维支架，用于改善大鼠坐骨神经缺损模型的神经修复效果 | 首次将Wnt3a蛋白整合到聚己内酯电纺纤维支架中，显著提高了神经修复效果和施万细胞的功能 | 研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类中验证其有效性 | 探讨Wnt信号通路和施万细胞在周围神经再生中的作用，并开发新型神经修复支架 | 施万细胞、Wnt信号通路、周围神经再生 | 生物医学工程 | NA | 单细胞测序分析、电纺技术 | NA | 单细胞数据 | 大鼠坐骨神经缺损模型 |
| 349 | 2024-11-25 |
A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06806-x
PMID:38057666
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研究论文 | 本文详细描述了人类胚胎肢体在空间和时间上的发育过程 | 首次使用单细胞和空间转录组学技术全面解析人类胚胎肢体发育过程，并发现了新的细胞群体和肌肉发育的两个波次 | 研究主要集中在胚胎肢体发育，未涉及其他器官或组织的发育 | 深入了解人类胚胎肢体发育的基因表达调控机制 | 人类胚胎肢体细胞及其发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个解剖连续的空间转录组样本和鼠胚胎肢体样本 |
| 350 | 2024-11-24 |
Macrophage depletion in inflamed rat knees prevents the activation of synovial mesenchymal stem cells by weakening Nampt and Spp1 signaling
2024-Nov-20, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00361-2
PMID:39563425
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研究论文 | 研究探讨了在炎症状态下，通过清除巨噬细胞来抑制滑膜间充质干细胞的激活 | 首次揭示了巨噬细胞通过Nampt和Spp1信号通路调控滑膜间充质干细胞的激活 | 研究仅在急性炎症模型中进行，未探讨慢性炎症情况下的效果 | 探究巨噬细胞在炎症和组织再生中的作用及其与滑膜间充质干细胞的相互作用 | 滑膜间充质干细胞和巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及大鼠膝关节样本，具体数量未明确提及 |
| 351 | 2024-11-24 |
Pulrodemstat, a selective inhibitor of KDM1A, suppresses head and neck squamous cell carcinoma growth by triggering apoptosis
2024-Nov-20, BMC pharmacology & toxicology
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40360-024-00807-w
PMID:39567962
|
研究论文 | 研究了一种名为Pulrodemstat的选择性KDM1A抑制剂，通过触发凋亡来抑制头颈鳞状细胞癌的生长 | Pulrodemstat在临床试验中显示出比传统化疗药物5-Fu更强的抗肿瘤活性，并且对正常细胞无毒性 | NA | 寻找更精确和有效的头颈鳞状细胞癌治疗方案 | 头颈鳞状细胞癌 | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 高通量筛选、单细胞测序、CCK-8检测、流式细胞术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 352 | 2024-11-24 |
TNFR2 blockade promotes antitumoral immune response in PDAC by targeting activated Treg and reducing T cell exhaustion
2024-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008898
PMID:39562007
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研究论文 | 研究通过阻断TNFR2受体来增强胰腺导管腺癌（PDAC）的抗肿瘤免疫反应 | 提出了一种新的治疗策略，即结合CD40激动剂和TNFR2拮抗剂来治疗PDAC | 单独使用TNFR2阻断剂对CD8+ T细胞的激活效果有限，肿瘤生长抑制效果不显著 | 探讨TNFR2阻断剂在PDAC中的抗肿瘤免疫反应机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者和免疫活性小鼠模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞分析数据 | 24名PDAC患者和免疫活性小鼠模型 |
| 353 | 2024-11-24 |
Prediction of single-cell RNA expression profiles in live cells by Raman microscopy with Raman2RNA
2024-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-02082-2
PMID:38200118
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Raman2RNA的方法，通过拉曼显微镜图像预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 | Raman2RNA方法通过无标记的超光谱拉曼显微镜图像和领域翻译技术，实现了对活细胞中单细胞RNA表达谱的非破坏性预测 | NA | 开发一种非破坏性的方法来预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 | 活细胞中的单细胞RNA表达谱 | 数字病理学 | NA | 拉曼显微镜 | 对抗自编码器 | 图像 | 涉及小鼠成纤维细胞和胚胎干细胞的活细胞追踪 |
| 354 | 2024-11-24 |
A computational approach to assessing the prognostic implications of BRAF and RAS mutations in patients with papillary thyroid carcinoma
2024-Nov, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-024-03911-3
PMID:38886331
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后价值 | 揭示了BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌进展中的重要作用，特别是BRAF V600E突变与侵袭性特征的关联 | NA | 探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后意义 | 甲状腺乳头状癌患者中的BRAF和RAS突变 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 甲状腺乳头状癌和正常样本 |
| 355 | 2024-11-24 |
Transcriptomics of Human Brain Tissue in Parkinson's Disease: a Comparison of Bulk and Single-cell RNA Sequencing
2024-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04124-5
PMID:38578357
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综述 | 本文综述了利用RNA测序技术研究帕金森病（PD）的文献，特别是比较了批量RNA测序和单细胞RNA测序的结果 | 本文通过整合批量和单细胞RNA测序的结果，展示了这两种技术在揭示神经退行性疾病转录变化方面的互补性 | 本文主要基于文献综述，未提供新的实验数据 | 评估批量和单细胞RNA测序技术在研究帕金森病中的兼容性和互补性 | 帕金森病患者的人脑组织 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 356 | 2024-11-24 |
Advancements in Single-Cell RNA Sequencing Research for Neurological Diseases
2024-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04126-3
PMID:38564138
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综述 | 本文详细介绍了单细胞RNA测序技术，并总结了其在神经系统疾病研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术不仅识别了多种细胞类型和反应状态，还揭示了细胞特异性基因表达变化、基因调控网络、细胞间通讯和细胞运动轨迹等 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在神经系统疾病研究中的应用，揭示疾病的具体机制，并为新的治疗策略提供依据 | 神经系统疾病及其相关细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 357 | 2024-11-24 |
Targeting METTL3 as a checkpoint to enhance T cells for tumour immunotherapy
2024-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70089
PMID:39568154
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研究论文 | 本文研究了通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 | 首次探讨了m6A在调节T细胞功能和增强抗肿瘤免疫中的作用，并发现靶向METTL3可以增强肿瘤细胞的免疫原性和T细胞功能 | NA | 探索通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 | METTL3抑制剂STM2457对肿瘤细胞和T细胞功能的影响 | 肿瘤学 | NA | RNA测序 (RNA-seq)，单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，CRISPR Cas9 | NA | RNA | 多种癌细胞系，小鼠黑色素瘤 (B16) 和小鼠结直肠腺癌 (MC38) 模型，人黑色素瘤模型 (A375) 和人T细胞 |
| 358 | 2024-11-23 |
Deciphering single-cell gene expression variability and its role in drug response
2024-Nov-20, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae138
PMID:39277847
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了药物反应中基因表达变异性的作用 | 本研究将药物反应与药物基因表达变异性的联系扩展到细胞层面，并提出了一种增强药物疗效预测的新方法 | NA | 探讨基因表达变异性在药物反应中的作用 | 药物基因在不同细胞类型和组织中的表达变异性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及八种不同人体组织的多种细胞类型 |
| 359 | 2024-11-23 |
Salmonella dry surface biofilm: morphology, single-cell landscape, and sanitization
2024-Nov-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01623-24
PMID:39494899
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研究论文 | 研究了Typhimurium干表面生物膜（DSB）的形成及其与湿表面生物膜（WSB）的比较，探讨了DSB的形态、单细胞景观和消毒方法 | 首次全面研究了DSB的特征及其生存机制，并提出了morin溶解在70%异丙醇中作为有效的干消毒剂 | NA | 探讨干表面生物膜的形成及其在低水分食品加工环境中的生存机制和消毒方法 | Typhimurium干表面生物膜（DSB）和湿表面生物膜（WSB） | NA | NA | 共聚焦激光扫描显微镜分析、电子显微镜、微生物组单细胞转录组学 | NA | 图像 | 39种黄酮类化合物和70%异丙醇（IPA）的组合效果测试 |
| 360 | 2024-11-23 |
Construction of molecular subtype and prognostic model for gastric cancer based on nucleus-encoded mitochondrial genes
2024-11-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78729-0
PMID:39557952
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研究论文 | 本研究基于核编码线粒体基因构建胃癌的分子亚型和预后模型 | 首次揭示了核编码线粒体基因突变与胃癌患者生存结果之间的关联，并开发了一个评分系统来预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在样本偏倚和数据质量问题 | 探讨核编码线粒体基因在胃癌中的作用，并开发一个预后模型来预测患者的治疗反应 | 胃癌患者的核编码线粒体基因表达和临床信息 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌样本 |