单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 659 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-11-23 |
Spatiotemporal Analysis of Mesenchymal Stem Cells Fate Determination by Inflammatory Niche Following Soft Tissue Injury at a Single-Cell Level
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310282
PMID:39308190
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研究论文 | 研究探讨了软组织损伤后炎症微环境中间充质干细胞命运的决定机制 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组和谱系追踪分析，揭示了炎症微环境中间充质干细胞向软骨和骨细胞分化的动态过程及其调控机制 | NA | 探讨创伤诱导的炎症暴露对间充质干细胞命运决定的影响 | 间充质干细胞及其在炎症微环境中的分化 | 数字病理学 | 软组织损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 322 | 2024-11-23 |
Spatial Isoforms Reveal the Mechanisms of Metastasis
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402242
PMID:39312471
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研究论文 | 研究食管鳞状细胞癌中淋巴结转移的机制，特别是CD8 T细胞在化疗耐药和转移中的作用 | 利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，分析了空间异构体在人类实体瘤和淋巴结中的表达和分布模式，并提出了异构体生成动力学对异构体时间异质性的影响 | 尚未完全阐明CD8 T细胞在化疗耐药和转移患者中的调控机制 | 揭示食管鳞状细胞癌中淋巴结转移的机制，特别是CD8 T细胞在化疗耐药和转移中的作用 | 食管鳞状细胞癌中的CD8 T细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人类实体瘤和淋巴结样本 |
| 323 | 2024-11-22 |
Exploring the Unknown: How Can We Improve Single-cell RNAseq Cell Type Annotations in Non-model Organisms?
2024-Nov-21, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icae112
PMID:39013613
|
研究论文 | 本文探讨了如何改进非模式生物中单细胞RNA测序（scRNAseq）细胞类型注释的方法 | 提出了利用细胞谱系进化背景进行注释、使用机器学习进行无参考注释以及利用未注释基因作为潜在细胞标记的新方法 | 未具体讨论这些方法在实际应用中的效果和局限性 | 改进非模式生物中单细胞RNA测序的细胞类型注释，以发现新的细胞类型并提高注释的准确性 | 非模式生物中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 机器学习 | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 324 | 2024-11-22 |
A cell atlas foundation model for scalable search of similar human cells
2024-Nov-20, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08411-y
PMID:39566551
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研究论文 | 开发了一种名为SCimilarity的度量学习框架，用于学习统一的、可解释的细胞表示，以便快速查询数千万个细胞档案 | 提出了SCimilarity框架，能够跨研究快速查询转录相似的细胞状态 | NA | 开发一种能够跨人体快速查询相似细胞状态的工具 | 人类细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 度量学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 2340万细胞，来自412项研究 |
| 325 | 2024-11-22 |
CD38 ligation in sepsis promotes nicotinamide phosphoribosyltransferase-mediated IL-6 production in kidney stromal cells
2024-Nov-20, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfae269
PMID:39568061
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研究论文 | 研究探讨了CD38在脓毒症中的作用及其对肾脏基质细胞IL-6产生的影响 | 首次揭示了CD38结合通过烟酰胺磷酸核糖基转移酶信号通路促进肾脏基质细胞中IL-6的产生 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证 | 阐明CD38结合在脓毒症中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 小鼠和人类的脓毒症模型 | NA | 脓毒症 | 单细胞和单核RNA测序（scRNA-seq和snRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠和人类脓毒症组织的样本 |
| 326 | 2024-11-22 |
Serinc5 Regulates Sequential Chondrocyte Differentiation by Inhibiting Sox9 Function in Pre-Hypertrophic Chondrocytes
2024-Nov-20, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31490
PMID:39568258
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研究论文 | 研究探讨了Serinc5在调节软骨细胞分化中的作用 | 首次揭示了Serinc5通过抑制Sox9功能在过渡期软骨细胞中调节软骨细胞分化的机制 | NA | 探究过渡期软骨细胞的分子基础及其在骨生长中的作用 | 软骨细胞的分化过程 | NA | NA | scRNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 荧光标记的生长板软骨细胞 |
| 327 | 2024-11-22 |
Single-cell transcriptional analysis of murine norovirus infection in a human intestinal cell line
2024-Nov-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01617-24
PMID:39475272
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析探讨了在小鼠诺如病毒感染的人类肠细胞系中的复制机制和宿主反应 | 建立了表达小鼠诺如病毒受体的人类肠细胞系，并首次在单细胞水平上分析了病毒感染过程中的转录组变化 | 研究仅限于特定的人类肠细胞系和小鼠诺如病毒，可能不适用于其他病毒或细胞类型 | 探讨小鼠诺如病毒在人类肠细胞系中的复制机制和宿主反应 | 小鼠诺如病毒感染的人类肠细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个时间点的单细胞样本 |
| 328 | 2024-11-22 |
Fibroblastic reticular cells generate protective intratumoral T cell environments in lung cancer
2024-Nov-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.10.042
PMID:39566495
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研究论文 | 研究揭示了成纤维网状细胞在肺癌肿瘤微环境中生成保护性肿瘤内T细胞环境的作用 | 首次展示了CCL19表达的成纤维网状细胞在人类非小细胞肺癌中生成互联的T细胞环境，并揭示了这些细胞在调节肿瘤内T细胞活性和分化中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞转录组学分析，可能无法完全反映人类肺癌的复杂性 | 探讨成纤维网状细胞在肺癌肿瘤微环境中生成保护性T细胞环境的作用及其机制 | 成纤维网状细胞、T细胞、肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和人类非小细胞肺癌样本 |
| 329 | 2024-11-22 |
A single-cell transcriptomic census of mammalian olfactory epithelium aging
2024-Nov-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.020
PMID:39173624
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析年轻和老年小鼠嗅上皮细胞，识别出与衰老相关的差异表达基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示了嗅上皮衰老的细胞和分子机制 | NA | 研究嗅上皮衰老的细胞和分子机制 | 年轻和老年小鼠的嗅上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的嗅上皮细胞，涉及21种细胞类型 |
| 330 | 2024-11-22 |
Integrated single-cell analysis reveals heterogeneity and therapeutic insights in osteosarcoma
2024-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01523-x
PMID:39556142
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤的细胞异质性和转录动力学，并提供了个性化治疗策略的基础 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤中11种不同的肿瘤细胞亚群及其与疾病进展和转移相关的独特转录特征 | NA | 深入了解骨肉瘤的分子机制，以改进治疗策略 | 骨肉瘤肿瘤细胞的异质性和转录动力学 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 331 | 2024-11-22 |
Multi-omics analysis reveals the role of the autophagy-related gene AGT in chemotherapy resistance in colorectal cancer and the therapeutic potential of its inhibitors
2024-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01545-5
PMID:39557714
|
研究论文 | 通过多组学分析探讨自噬相关基因AGT在结直肠癌化疗耐药中的作用及其抑制剂的治疗潜力 | 首次通过多组学分析揭示了自噬相关基因AGT在结直肠癌化疗耐药中的作用，并评估了其抑制剂的治疗潜力 | 研究主要基于数据库分析和模拟实验，缺乏体内实验验证 | 探讨自噬相关基因AGT在结直肠癌化疗耐药中的作用及其抑制剂的治疗潜力 | 自噬相关基因AGT在结直肠癌中的表达模式、功能及其与化疗耐药的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学分析、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、免疫浸润数据 | CRC组织和正常组织的基因表达数据来自GTEx和TCGA数据库，单细胞RNA测序数据来自TISCH数据库 |
| 332 | 2024-11-22 |
Molecular profiles, sources and lineage restrictions of stem cells in an annelid regeneration model
2024-Nov-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54041-3
PMID:39557833
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研究论文 | 研究了海洋环节动物Platynereis dumerilii在再生过程中干细胞的分子特征、来源和谱系限制 | 结合单细胞RNA测序和嵌合转基因技术，揭示了再生过程中细胞类型特异性损伤反应、位置身份因子的重新表达以及多个细胞群体中干细胞特征的重新出现 | NA | 探究不同动物门类中再生能力的共性和差异性原理 | 海洋环节动物Platynereis dumerilii的再生过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个细胞群体 |
| 333 | 2024-11-22 |
Single-cell RNA-seq analysis of cancer-endothelial cell interactions in primary tumor and peritoneal metastasis from a single patient with colorectal cancer
2024-Nov-18, BJC reports
DOI:10.1038/s44276-024-00112-3
PMID:39558013
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研究论文 | 研究分析了单个结直肠癌患者原发肿瘤和腹膜转移灶中单细胞RNA测序数据，揭示了肿瘤内异质性和癌细胞与肿瘤微环境细胞之间的相互作用 | 首次在单个结直肠癌患者中分析了原发肿瘤和腹膜转移灶中的单细胞转录组，揭示了肿瘤内异质性和癌细胞与内皮细胞的相互作用变化 | 研究受限于N-of-1设计，需要进一步验证 | 探索结直肠癌腹膜转移灶中的肿瘤内异质性和癌细胞与肿瘤微环境细胞的相互作用 | 单个结直肠癌患者的原发肿瘤和腹膜转移灶 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个结直肠癌患者的原发肿瘤和腹膜转移灶样本 |
| 334 | 2024-11-22 |
Exploring human pancreatic organoid modelling through single-cell RNA sequencing analysis
2024-Nov-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07193-3
PMID:39558019
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析探索了人类胰腺类器官的建模 | 首次详细描述了人类胰腺类器官的细胞组成和发育轨迹，并揭示了其复杂的异质性 | NA | 深入描述人类胰腺类器官的结构和功能，为未来的体外诊断和转化研究提供基础 | 人类胰腺类器官的细胞组成和发育机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 335 | 2024-11-22 |
Tumor microenvironment remodeling after neoadjuvant chemoradiotherapy in local advanced rectal cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Nov-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05747-x
PMID:39558398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了新辅助放化疗后局部晚期直肠癌肿瘤微环境的细胞和分子变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了新辅助放化疗后肿瘤微环境的复杂变化，揭示了不同细胞亚群的相互作用及其对治疗的反应 | 样本量相对较小，仅包括六个样本，可能影响结果的普适性 | 深入理解新辅助放化疗对局部晚期直肠癌肿瘤微环境的影响，为提高治疗效果提供理论基础 | 局部晚期直肠癌患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 32,417个细胞，来自六个样本 |
| 336 | 2024-11-22 |
Microglia and monocyte-derived macrophages drive progression of pediatric high-grade gliomas and are transcriptionally shaped by histone mutations
2024-Nov-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.09.007
PMID:39395421
|
研究论文 | 研究探讨了微胶质细胞和单核细胞衍生的巨噬细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的作用及其转录受组蛋白突变的影响 | 首次展示了组蛋白突变和肿瘤位置对髓系细胞异质性的影响，并揭示了靶向髓系细胞的潜在治疗机会 | NA | 研究髓系细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的作用及其潜在治疗策略 | 儿童高级别胶质瘤中的髓系细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA数据 | NA |
| 337 | 2024-11-22 |
Lamination-based organoid spatially resolved transcriptomics technique for primary lung and liver organoid characterization
2024-Nov-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2408939121
PMID:39514315
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于层压技术的器官芯片空间转录组学方法，用于小鼠肺和肝脏器官芯片的表征 | 提出了基于层压技术的器官芯片空间转录组学方法（LOSRT），解决了标准化组织切片方法不适用于器官芯片的问题 | NA | 开发一种新的空间转录组学技术，用于表征从初级组织衍生的器官芯片 | 小鼠肺和肝脏衍生的器官芯片 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠肺和肝脏衍生的器官芯片 |
| 338 | 2024-11-22 |
DeSide: A unified deep learning approach for cellular deconvolution of tumor microenvironment
2024-Nov-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2407096121
PMID:39514318
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研究论文 | 提出了一种名为DeSide的统一深度学习方法，用于肿瘤微环境的细胞去卷积分析 | DeSide通过整合生物学通路和优先评估非癌细胞类型，有效规避了癌细胞基因表达谱高度变异的问题，并引入了独特的采样和过滤技术生成高质量训练集 | NA | 开发一种高效且成本效益高的方法，用于分析肿瘤微环境的复杂细胞组成 | 肿瘤微环境中的细胞组成 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | 深度学习 | 基因表达谱 | 利用了来自六种癌症类型和185个癌症细胞系的单细胞RNA测序数据，以及来自TCGA的22种癌症类型的批量RNA测序数据 |
| 339 | 2024-11-22 |
Single-cell eQTL mapping in yeast reveals a tradeoff between growth and reproduction
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.07.570640
PMID:38106186
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研究论文 | 本文开发了一种单细胞RNA测序方法，用于在酵母中进行eQTL定位，揭示了生长与繁殖之间的权衡 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术在酵母中进行eQTL定位，揭示了基因表达变异与细胞周期阶段之间的相互作用 | 研究仅限于酵母，且样本量相对较小 | 通过单细胞RNA测序技术揭示基因变异对基因表达和下游性状的影响 | 酵母中的单细胞eQTL | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过100,000个单细胞 |
| 340 | 2024-11-22 |
Preclinical lentiviral hematopoietic stem cell gene therapy corrects Pompe disease-related muscle and neurological manifestations
2024-Nov-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.09.024
PMID:39295144
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研究论文 | 本文研究了通过慢病毒载体介导的造血干细胞基因疗法治疗庞贝病，并展示了其在小鼠模型中的潜力 | 提出了通过慢病毒载体介导的造血干细胞基因疗法作为下一代治疗庞贝病的方法 | 本文仅在预临床小鼠模型中进行了研究，尚未在人体中验证 | 旨在克服酶替代疗法的局限性，探索新的庞贝病治疗方法 | 庞贝病及其相关的肌肉和神经系统表现 | 基因治疗 | 庞贝病 | 慢病毒载体介导的基因疗法 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型 |