本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-12-11 |
Key Regulatory Elements of the TGFβ-LRRC15 Axis Predict Disease Progression and Immunotherapy Resistance Across Cancer Types
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.22.624939
PMID:39651139
|
研究论文 | 本文研究了TGFβ-LRRC15轴的关键调控元件,揭示其在不同癌症类型中预测疾病进展和免疫治疗抵抗的潜力 | 本文通过结合功能性化合物筛选和单细胞RNA测序,揭示了调控TGFβ增加LRRC15表达的关键基因特征,并验证了这些基因在预测免疫治疗反应中的潜力 | 本文主要基于细胞模型进行验证,尚未在临床试验中验证其效果 | 揭示TGFβ-LRRC15轴的关键调控元件,并探索其在个性化免疫治疗中的应用 | TGFβ-LRRC15轴的关键调控基因及其在癌症进展和免疫治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络 | 基因表达数据 | 细胞模型 | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-12-11 |
An estrogen receptor signaling transcriptional program linked to immune evasion in human hormone receptor-positive breast cancer
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.23.619172
PMID:39651157
|
研究论文 | 本文研究了雌激素受体信号传导程序与激素受体阳性乳腺癌中免疫逃避的关系 | 首次定义并研究了与雌激素受体信号传导(ERS)和免疫信号相关的基因模块,揭示了ERS与T细胞浸润减少的潜在机制 | 研究主要基于批量和单细胞转录组数据,缺乏功能验证实验 | 探讨雌激素受体信号传导在激素受体阳性乳腺癌中免疫逃避的机制 | 激素受体阳性乳腺癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序,多重免疫荧光 | NA | 转录组数据,免疫荧光图像 | 来自多个临床来源的乳腺癌组织和人类细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-12-11 |
Prenatal p25-activated Cdk5 induces pituitary tumorigenesis through MCM2 phosphorylation-mediated cell proliferation
2024-11, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101054
PMID:39366214
|
研究论文 | 研究揭示了产前p25激活的Cdk5通过MCM2磷酸化介导的细胞增殖诱导垂体肿瘤发生 | 首次揭示了Cdk5和Mcm2在垂体腺瘤肿瘤发生中的新作用,并提供了一种新的中间叶来源的垂体腺瘤小鼠模型 | NA | 探讨Cdk5在垂体肿瘤发生中的作用及其机制 | Cdk5、Mcm2以及中间叶来源的垂体肿瘤 | NA | 垂体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型和293T细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-12-10 |
The Risk Genes S1PR5, CMC1, and ASAH1 as Potential Targets for the Diagnosis, Immunotherapy, and Treatment of Colon Adenocarcinoma by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Analysis
2024-11-07, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据构建了一个新的免疫细胞功能风险模型,用于预测结肠腺癌的预后和免疫治疗效果 | 本研究首次提出了S1PR5、CMC1和ASAH1作为结肠腺癌的新型治疗靶点,并通过单细胞和批量RNA测序数据验证了其潜在的临床应用价值 | 本研究仅在特定的数据集和临床队列中验证了模型的有效性,未来需要在更多独立队列中进行验证 | 开发新的风险模型以预测结肠腺癌的预后和免疫治疗效果,并发现新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者的预后和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Lasso回归分析 | RNA测序数据 | 使用了来自Tumour Immune Single Cell Hub数据库的COAD单细胞数据集GSE146771,并在多个独立队列中进行了验证 | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-12-09 |
IFN-γ-induced Th1-Treg polarization in inflamed brains limits exacerbation of experimental autoimmune encephalomyelitis
2024-Nov-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2401692121
PMID:39560646
|
研究论文 | 研究探讨了IFN-γ在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)中诱导Th1-Treg极化的作用 | 首次揭示了IFN-γ在EAE中诱导Tregs向Th1-Tregs极化的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类疾病 | 探讨IFN-γ在EAE中的作用及其对Tregs极化的影响 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)中的Tregs和IFN-γ | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-12-08 |
Identification of PANoptosis-based signature for predicting the prognosis and immunotherapy response in AML
2024-Nov-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40267
PMID:39634422
|
研究论文 | 本研究通过筛选PANoptosis相关基因,建立了PANoptosis风险特征,用于预测急性髓系白血病(AML)的预后和免疫治疗反应 | 首次探索了基于PANoptosis特征在AML中的作用,并验证了其作为独立预后因子的有效性 | NA | 建立和验证基于PANoptosis的风险特征,以预测AML患者的生存和免疫治疗反应 | 急性髓系白血病(AML)患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 白血病 | LASSO回归分析、Cox回归分析、分子对接、分子动力学模拟 | NA | RNA测序数据 | 使用了TCGA、bulk RNA测序和单细胞测序的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-12-07 |
Alpha-2-macroglobulin mitigates glucocorticoid-induced osteonecrosis via Keap1/Nrf2 pathway activation
2024-Nov-20, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 研究探讨了α-2-巨球蛋白通过激活Keap1/Nrf2信号通路减轻糖皮质激素诱导的股骨头坏死的作用 | 首次揭示了α-2-巨球蛋白在糖皮质激素诱导的股骨头坏死中的作用及其通过Keap1/Nrf2通路减轻症状的机制 | 研究主要基于动物模型和患者样本的转录组和蛋白质组分析,缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨α-2-巨球蛋白在糖皮质激素诱导的股骨头坏死中的作用及其机制 | 糖皮质激素诱导的股骨头坏死及其相关生物标志物 | NA | 股骨头坏死 | 转录组分析、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 患者样本和糖皮质激素诱导的股骨头坏死大鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-12-07 |
Taurine ameliorates radiation-induced oxidative stress in bone marrow mesenchymal stromal cells and promotes osteogenesis
2024-Nov-20, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 研究探讨了牛磺酸对辐射诱导的骨髓间充质干细胞氧化应激的影响及其促进成骨的作用 | 首次揭示了牛磺酸代谢在辐射后下颌骨间充质细胞中的激活,并通过补充牛磺酸显著改善了辐射小鼠的生存率和下颌骨成骨 | 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类患者中进行验证 | 探讨牛磺酸在辐射诱导的下颌骨坏死中的作用及其潜在的治疗价值 | 骨髓间充质干细胞和辐射小鼠 | NA | NA | scRNA-Seq 和代谢组学 | NA | NA | 辐射和未辐射的骨髓间充质干细胞,以及辐射和未辐射的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-12-06 |
A Roadmap for Selecting and Utilizing Optimal Features in scRNA Sequencing Data Analysis for Stem Cell Research: A Comprehensive Review
2024-Nov-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23170
PMID:38531607
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在干细胞研究中的应用,并讨论了选择和利用最佳特征的路线图 | 本文提供了对scRNA-seq分析工具的详细概述和分类,基于对2,733篇科学出版物的回顾 | NA | 为使用scRNA-seq研究干细胞的生物信息学家和生物学家提供实用建议 | 干细胞及其产生的细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 2,733篇科学出版物和1,400种分析工具 | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-12-05 |
Microarray integrated spatial transcriptomics (MIST) for affordable and robust digital pathology
2024-Nov-30, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00462-1
PMID:39616155
|
研究论文 | 提出了一种名为MIST的新型空间转录组学方法,结合了传统的组织微阵列与Visium技术,通过激光切割和3D打印提高载玻片通量,旨在降低成本并提高数字病理学的鲁棒性 | MIST方法通过结合组织微阵列与Visium技术,利用激光切割和3D打印技术,显著提高了载玻片通量,降低了成本,并提供了独立复制和定制化的能力 | NA | 开发一种成本效益高且鲁棒性强的空间转录组学方法,以解决现有方法高成本和样本使用限制的问题 | 空间转录组学技术及其在数字病理学中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、激光切割、3D打印 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-12-05 |
SenMayo transcriptomic senescence panel highlights glial cells in the ageing mouse and human retina
2024-Nov-30, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-024-00187-9
PMID:39616175
|
研究论文 | 研究使用SenMayo转录组衰老面板分析了不同年龄小鼠和人类视网膜中的衰老细胞,特别是胶质细胞 | 首次将SenMayo基因面板应用于视网膜衰老细胞的鉴定,并比较了不同年龄小鼠和人类视网膜胶质细胞的转录组特征 | 研究主要集中在视网膜胶质细胞,未涵盖其他类型的细胞 | 鉴定中枢神经系统和视网膜中的衰老细胞,并分析其转录组特征 | 不同年龄小鼠和人类的视网膜胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同年龄的小鼠和人类视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-12-05 |
Single-cell transcriptomics reveals over-activated reactive oxygen species pathway in hepatocytes in the development of hepatocellular carcinoma
2024-11-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81481-0
PMID:39616235
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肝细胞中活性氧通路在肝细胞癌发展中的过度激活 | 首次揭示了肝细胞癌中活性氧通路的异常激活及其与能量代谢相关通路的正相关性,并发现了与预后不良相关的GPX4+肝细胞亚群 | 研究基于GSE189175数据集,样本量有限,未来需要更大规模的研究验证 | 探讨活性氧通路在肝细胞癌发展中的作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织及其邻近组织中的肝细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于GSE189175数据集,具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-12-05 |
CD22 blockade exacerbates neuroinflammation in Neuromyelitis optica spectrum disorder
2024-Nov-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03305-2
PMID:39616380
|
研究论文 | 研究CD22在视神经脊髓炎谱系障碍(NMOSD)中对神经炎症和中枢神经系统损伤的影响 | 揭示了CD22作为调控微胶质细胞和Gr-1+髓系细胞在NMOSD中负面效应的关键分子开关的新角色 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨CD22在NMOSD中的作用及其对微胶质细胞活性和神经炎症的影响 | CD22在NMOSD中的表达、功能及其对微胶质细胞和髓系细胞的影响 | 神经科学 | 神经疾病 | 单细胞测序、流式细胞术 | NA | 细胞 | 人类样本每组5个,小鼠样本每组8个 | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-12-05 |
[Hepatic T cell subtypes and functional analysis among alveolar echinococcosis patients using single-cell RNA sequencing]
2024-Nov-08, Zhongguo xue xi chong bing fang zhi za zhi = Chinese journal of schistosomiasis control
DOI:10.16250/j.32.1915.2024172
PMID:39623989
|
研究论文 | 研究了泡型包虫病患者肝脏免疫微环境中T细胞亚型及其功能 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析泡型包虫病患者肝脏中T细胞亚型及其功能 | 样本量较小,仅包括四名患者 | 探讨泡型包虫病患者肝脏免疫微环境中T细胞亚型及其功能 | 泡型包虫病患者的肝脏T细胞亚型及其功能 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 四名泡型包虫病患者,共采集八份肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-12-02 |
CMTM7 shapes the chronic inflammatory and immunosuppressive tumor microenvironment in hepatocellular carcinoma as an M2 macrophage biomarker
2024-Nov-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-75538-3
PMID:39609464
|
研究论文 | 研究探讨了CMTM7蛋白在肝细胞癌中的作用及其对慢性炎症和免疫抑制肿瘤微环境的影响 | 首次揭示了CMTM7作为M2巨噬细胞的分子标记物,并提出了其作为肝细胞癌患者免疫检查点的潜在应用 | 研究主要基于组织微阵列、测序数据和分析工具,缺乏体内实验验证 | 探讨CMTM7在肝细胞癌中的作用及其对患者预后的影响 | CMTM7蛋白、肝细胞癌、M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、多重荧光染色 | NA | 组织微阵列、测序数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-12-02 |
New direction: identification of immunoinflammatory subtypes and potential therapeutic targets for cholangiocarcinoma
2024-Nov-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01628-3
PMID:39612077
|
研究论文 | 本研究旨在识别胆管癌的免疫炎症亚型并探索潜在的治疗靶点 | 首次识别出胆管癌的两种免疫亚型(CS1和CS2),并揭示了它们在肿瘤微环境中的不同特征和代谢调控机制 | 研究主要基于数据库中的转录组和单细胞测序数据,缺乏体内实验验证 | 识别胆管癌的免疫亚型并探讨其在巨噬细胞功能代谢调控中的作用 | 胆管癌的免疫亚型及其在肿瘤微环境中的特征 | 数字病理学 | 胆管癌 | 转录组分析、单细胞测序 | NA | 转录组数据、单细胞数据 | 多个数据库中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-12-02 |
CardioAtlas: deciphering the single-cell transcriptome landscape in cardiovascular tissues and diseases
2024-Nov-28, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00696-5
PMID:39609860
|
研究论文 | 构建了一个名为CardioAtlas的资源,提供了心血管组织和疾病中单细胞转录组数据的全面分析结果 | 首次构建了一个全面且精心制作的心血管系统和疾病参考图谱,详细描述了大量人类和小鼠中先前未被识别的细胞群体 | NA | 揭示心血管组织和疾病中的单细胞转录组景观 | 心血管系统和疾病中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 27个人类数据集中的1,929,000个细胞和39个小鼠数据集中的1,088,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-12-02 |
Genetic and therapeutic heterogeneity shape the baseline and longitudinal immune ecosystem of ovarian clear cell carcinoma
2024-Nov-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010069
PMID:39608974
|
研究论文 | 研究卵巢透明细胞癌的免疫生态系统及其在基因和治疗压力下的动态变化 | 揭示了ARID1A突变与卵巢透明细胞癌基线免疫激活的关联,并探讨了VEGF抑制剂在重塑肿瘤基质和增强免疫治疗效果中的作用 | 研究样本量有限,且主要集中在特定基因突变和治疗策略上,可能无法全面反映所有卵巢透明细胞癌的免疫生态系统 | 探讨卵巢透明细胞癌的免疫反应异质性及其潜在的联合治疗策略 | 卵巢透明细胞癌患者的肿瘤样本和血清肿瘤标志物 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞mRNA测序、TCR测序、免疫组化、空间转录组学、RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 13名卵巢透明细胞癌患者的肿瘤样本和31份石蜡包埋样本 | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-12-02 |
Germ cell progression through zebrafish spermatogenesis declines with age
2024-Nov-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204319
PMID:39470160
|
研究论文 | 研究了斑马鱼随着年龄增长精子发生过程中的细胞和分子变化 | 首次使用单细胞RNA测序生成斑马鱼衰老睾丸的发育图谱,揭示了精子发生随年龄下降的分子机制 | 研究仅限于斑马鱼,可能不适用于其他物种 | 探讨斑马鱼精子发生随年龄下降的分子和细胞机制 | 斑马鱼睾丸中的生殖细胞和免疫细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个年龄段的斑马鱼睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-12-01 |
Single-cell multiomics reveals simvastatin inhibits pan-cancer epithelial-mesenchymal transition via the MEK/ERK pathway in XBP1+ mast cells
2024-Nov-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80858-5
PMID:39604504
|
研究论文 | 研究通过单细胞多组学分析,揭示辛伐他汀通过MEK/ERK通路抑制泛癌种上皮-间质转化(EMT)在XBP1+肥大细胞中的作用 | 首次揭示辛伐他汀通过抑制XBP1+肥大细胞中的MEK/ERK信号通路,逆转泛癌种中的EMT过程 | 研究主要基于体外实验验证,缺乏体内实验数据支持 | 探讨肥大细胞在肿瘤微环境中的作用及其在系统治疗中的潜在靶点 | 肥大细胞及其在泛癌种转移中的作用 | 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞测序 | WGCNA和12种机器学习算法 | 单细胞数据 | 泛癌种转移的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |