单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 659 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
301 2024-11-23
A Study on the Inflammatory Response of the Brain in Neurosyphilis
2024-Nov-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究了神经梅毒中大脑的炎症反应机制 通过蛋白质组学和单细胞转录组学的整合分析,确定了Toll样/NF-κB信号通路在Tp引起的中枢神经系统损伤中的关键作用 NA 揭示Tp感染引起的神经梅毒中炎症介导的脑损伤机制 神经梅毒患者的中枢神经系统和外周血中的炎症细胞 NA 神经梅毒 蛋白质组学、单细胞转录组学 NA 蛋白质组数据、转录组数据 NA
302 2024-11-23
Evidence for a lipofibroblast-to- Cthrc1 + myofibroblast reversible switch during the development and resolution of lung fibrosis in young mice
2024-Nov-21, The European respiratory journal
研究论文 研究了年轻小鼠肺纤维化发展及消退过程中脂质成纤维细胞向Cthrc1+肌成纤维细胞的可逆转换 揭示了肌成纤维细胞在肺纤维化消退过程中的异质性及其分化轨迹 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 探讨肺纤维化发展及消退过程中肌成纤维细胞的来源和命运 年轻小鼠的肺纤维化过程 NA 肺纤维化 遗传谱系追踪和单细胞转录组学 NA 转录组数据 小鼠和人类IPF数据集
303 2024-11-23
Mapping of the T Cell Landscape of Biliary Tract Cancer Unravels Anatomical Subtype-Specific Heterogeneity
2024-Nov-21, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 研究揭示了胆道癌不同亚型中T细胞的分布和异质性 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序,结合病理切片分析,揭示了胆道癌不同亚型中T细胞的多样性和空间分布特征 研究样本量较小,且仅限于胆道癌患者,可能影响结果的普适性 探讨胆道癌不同亚型中T细胞的分布特征,为个性化免疫治疗提供依据 胆道癌(包括肝内胆管癌、肝外胆管癌和胆囊癌)患者的T细胞 数字病理学 胆道癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq) NA 单细胞数据和病理切片图像 36个样本来自16名胆道癌患者
304 2024-11-23
Chronic Inflammation Deters Natural Killer Cell Fitness and Cytotoxicity in Myeloid Leukemia
2024-Nov-21, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 研究慢性炎症对骨髓性白血病中自然杀伤细胞功能的影响 首次揭示了慢性炎症通过肿瘤坏死因子-α(TNFa)及其受体TNFR2和SOCS家族基因Cish抑制自然杀伤细胞功能 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体内验证 探讨慢性炎症对骨髓性白血病中自然杀伤细胞功能的影响及其机制 自然杀伤细胞在慢性骨髓性白血病中的功能和表型变化 免疫学 白血病 单细胞RNA测序 NA RNA 使用了BCR::ABL1+ CML小鼠模型和健康供体的自然杀伤细胞
305 2024-11-23
Deciphering single-cell gene expression variability and its role in drug response
2024-Nov-20, Human molecular genetics IF:3.1Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,探讨了药物反应中基因表达变异性的作用 本研究将药物反应与药物基因表达变异性的联系扩展到细胞层面,并提出了一种增强药物疗效预测的新方法 NA 探讨基因表达变异性在药物反应中的作用 药物基因在不同细胞类型和组织中的表达变异性 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 基因表达数据 涉及八种不同人体组织的多种细胞类型
306 2024-11-23
Salmonella dry surface biofilm: morphology, single-cell landscape, and sanitization
2024-Nov-20, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
研究论文 研究了Typhimurium干表面生物膜(DSB)的形成及其与湿表面生物膜(WSB)的比较,探讨了DSB的形态、单细胞景观和消毒方法 首次全面研究了DSB的特征及其生存机制,并提出了morin溶解在70%异丙醇中作为有效的干消毒剂 NA 探讨干表面生物膜的形成及其在低水分食品加工环境中的生存机制和消毒方法 Typhimurium干表面生物膜(DSB)和湿表面生物膜(WSB) NA NA 共聚焦激光扫描显微镜分析、电子显微镜、微生物组单细胞转录组学 NA 图像 39种黄酮类化合物和70%异丙醇(IPA)的组合效果测试
307 2024-11-23
Integrated analysis and systematic characterization of the regulatory network for human germline development
2024-Nov-19, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本文整合和系统表征了人类生殖细胞发育的调控网络 构建了人类生殖细胞数据库(hPGCdb),并通过多组学数据整合分析,揭示了调控人类生殖细胞命运的关键转录因子和调控网络 主要依赖于现有数据,未涉及实验验证所有关键因子的功能 揭示人类生殖细胞发育的调控机制 人类生殖细胞及其发育过程 生物信息学 NA RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据, 染色质可及性数据, 蛋白质-DNA相互作用数据 581个RNA-seq样本, 54个ATAC-seq样本, 45个ChIP-seq样本, 69个单细胞RNA-seq样本
308 2024-11-23
TRAIL induces podocyte PANoptosis via death receptor 5 in diabetic kidney disease
2024-Nov-19, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 研究探讨了TRAIL通过死亡受体5诱导足细胞PANoptosis在糖尿病肾病中的作用 首次揭示了TRAIL/DR5在糖尿病肾病中通过激活PANoptosis导致足细胞损伤的自身分泌作用 NA 探讨TRAIL/DR5在糖尿病肾病中诱导足细胞PANoptosis的作用机制 糖尿病肾病患者的足细胞 NA 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA RNA 三例正常人肾样本和三例糖尿病肾病肾样本
309 2024-11-23
Construction of molecular subtype and prognostic model for gastric cancer based on nucleus-encoded mitochondrial genes
2024-11-18, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究基于核编码线粒体基因构建胃癌的分子亚型和预后模型 首次揭示了核编码线粒体基因突变与胃癌患者生存结果之间的关联,并开发了一个评分系统来预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据,可能存在样本偏倚和数据质量问题 探讨核编码线粒体基因在胃癌中的作用,并开发一个预后模型来预测患者的治疗反应 胃癌患者的核编码线粒体基因表达和临床信息 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自TCGA和GEO数据库的胃癌样本
310 2024-11-23
Integrated analysis of single-cell RNA sequencing and bulk transcriptome data identifies a pyroptosis-associated diagnostic model for Parkinson's disease
2024-11-18, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,识别出与帕金森病相关的细胞焦亡相关诊断模型 首次通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,构建了基于细胞焦亡相关基因的帕金森病诊断模型 研究主要基于数据分析,缺乏临床验证 开发一种新的帕金森病诊断模型,特别是在疾病的早期阶段 帕金森病患者和健康个体的单细胞RNA测序数据 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序 LASSO逻辑回归、支持向量机递归特征消除和随机森林 基因表达数据 帕金森病患者和健康个体的单细胞RNA测序数据
311 2024-11-23
Airway ciliary microenvironment responses in mice with primary ciliary dyskinesia and central pair apparatus defects
2024-11-18, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 研究了小鼠上呼吸道纤毛微环境中上皮细胞对纤毛运动缺陷和黏液纤毛清除功能障碍的响应 首次使用单细胞RNA测序技术研究了上呼吸道上皮细胞对中央对装置基因突变引起的纤毛运动缺陷的响应 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类患者 探讨纤毛运动缺陷对上呼吸道上皮细胞微环境的影响 小鼠上呼吸道上皮细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及Cfap221/Pcdp1、Cfap54和Spef2基因突变的小鼠上呼吸道上皮细胞
312 2024-11-23
Lung Single-Cell Transcriptomics Offers Insights into the Pulmonary Interstitial Toxicity Caused by Silica Nanoparticles
2024-Nov-15, Environment & health (Washington, D.C.)
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了二氧化硅纳米颗粒引起的肺间质毒性的细胞特异性反应和细胞间相互作用 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了二氧化硅纳米颗粒引起的肺间质损伤的细胞特异性反应和分子机制 研究仅限于Wistar大鼠模型,结果的普适性有待进一步验证 阐明二氧化硅纳米颗粒暴露引起的肺损伤中不同细胞群体的相互作用和关键因素 Wistar大鼠的肺部细胞 数字病理学 肺部疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 10457个肺部细胞
313 2024-11-23
Molecular diversity and migration of GABAergic neurons in the developing ventral midbrain
2024-Nov-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 研究了发育中的腹侧中脑中GABA能神经元的分子多样性和迁移机制 通过单细胞RNA测序和荧光激活细胞分选技术,首次全面揭示了腹侧中脑中GABA能神经元的亚型及其空间分布和发育机制 研究仅限于小鼠模型,可能不适用于其他物种 探讨腹侧中脑中GABA能神经元的多样性和发育机制 发育中的小鼠腹侧中脑中的GABA能神经元 神经科学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq),荧光激活细胞分选 (FACS) NA 转录组数据 多个GABA能神经元亚型
314 2024-11-23
Single-Cell and Spatial Multi-omics Reveal Interferon Signaling in the Pathogenesis of Perianal Fistulizing Crohn's Disease
2024-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究使用单细胞和空间多组学技术揭示了肛周瘘管性克罗恩病发病机制中的干扰素信号 首次通过单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和空间转录组学等多组学方法,全面分析了肛周瘘管性克罗恩病中的免疫和非免疫细胞群,并揭示了干扰素信号在疾病发病机制中的关键作用 研究样本量较小,且未涉及长期随访数据 探讨肛周瘘管性克罗恩病的发病机制,并寻找潜在的治疗靶点 肛周瘘管性克罗恩病患者、无肛周疾病的克罗恩病患者和特发性肛周瘘管患者的黏膜细胞 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、空间转录组学 NA 基因表达数据 共63名患者,包括24名肛周瘘管性克罗恩病患者、10名无肛周疾病的克罗恩病患者和29名特发性肛周瘘管患者
315 2024-11-23
Leveraging Single-Cell RNA-Seq to Generate Robust Microglia Aging Clocks
2024-Nov-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用单细胞RNA测序数据开发稳健的微胶质细胞衰老时钟 首次利用单细胞RNA测序数据开发微胶质细胞衰老时钟,并比较了不同的计算方法 仅限于微胶质细胞,未涵盖其他类型的细胞 开发和比较计算方法以建立稳健的微胶质细胞衰老时钟 微胶质细胞的衰老过程 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 转录组数据 未明确提及具体样本数量
316 2024-11-23
De novo detection of somatic variants in high-quality long-read single-cell RNA sequencing data
2024-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为LongSom的计算工作流程,利用高质量的长读单细胞RNA测序数据检测体细胞单核苷酸变异、拷贝数变异和基因融合,以重建肿瘤克隆异质性 LongSom能够在不需要正常样本的情况下检测变异,有助于研究癌症进化、克隆异质性和治疗抗性 NA 开发一种新的计算方法,利用长读单细胞RNA测序数据检测体细胞变异,以研究肿瘤的克隆异质性和治疗抗性 人类卵巢癌样本中的体细胞单核苷酸变异、拷贝数变异和基因融合 生物信息学 卵巢癌 长读单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 人类卵巢癌样本
317 2024-11-23
Spatial Transcriptomics Reveals the Temporal Architecture of the Seminiferous Epithelial Cycle and Precise Sertoli-Germ Synchronization
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文利用空间转录组学技术研究了小鼠睾丸中精原上皮周期的时间结构和Sertoli细胞与生殖细胞的精确同步 首次通过空间转录组学技术揭示了精原上皮周期中的转录变化模式,并发现Sertoli细胞与生殖细胞发育的周期性转录特征紧密同步 研究仅限于小鼠模型,未涉及其他物种 揭示精原上皮周期中的转录变化及其与生殖细胞和体细胞的关联 小鼠睾丸中的生殖细胞和体细胞 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 基因表达数据 216,090个细胞,2,638个基因
318 2024-11-23
Tryptophan 2,3-dioxygenase-positive matrix fibroblasts fuel breast cancer lung metastasis via kynurenine-mediated ferroptosis resistance of metastatic cells and T cell dysfunction
2024-Nov, Cancer communications (London, England)
研究论文 研究揭示了色氨酸2,3-双加氧酶阳性基质成纤维细胞通过犬尿氨酸介导的铁死亡抵抗和T细胞功能障碍促进乳腺癌肺转移的作用 首次揭示了色氨酸2,3-双加氧酶阳性基质成纤维细胞在乳腺癌肺转移中的关键作用,并提出了针对肺特异性基质细胞代谢的治疗策略 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人体中验证其结果 解析成纤维细胞异质性及其在乳腺癌肺转移形成中的不同作用 乳腺癌肺转移中的成纤维细胞和T细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 使用小鼠模型进行实验,具体样本数量未在摘要中提及
319 2024-11-23
Genetic variation and molecular profiling of congenital malformations of the female genital tract based on whole-genome sequencing
2024-Nov, World journal of pediatrics : WJP IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过全基因组测序分析了中国590名个体的遗传变异,识别了与女性生殖道先天畸形相关的新变异,特别是ASH1L基因 首次在大规模样本中识别出与女性生殖道先天畸形相关的新变异,特别是ASH1L基因,并揭示了关键风险基因在子宫发育早期的时空特异性表达模式 样本主要集中在中国,可能影响结果的普适性 识别与女性生殖道先天畸形相关的遗传变异,揭示其分子遗传机制 女性生殖道先天畸形患者及其相关基因变异 基因组学 生殖系统疾病 全基因组测序 NA 基因组数据 590名个体,包括95名患者、442名病例对照和53名家族对照
320 2024-11-23
Blockade of CCR5+ T Cell Accumulation in the Tumor Microenvironment Optimizes Anti-TGF-β/PD-L1 Bispecific Antibody
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究通过scRNA-seq分析肿瘤微环境变化,发现YM101治疗后存在免疫抑制性CCR5 T细胞,并提出使用Maraviroc抑制CCR5 T细胞积累以优化YM101疗效 首次揭示了YM101治疗后肿瘤微环境中CCR5 T细胞的免疫抑制作用,并提出联合使用Maraviroc以增强YM101的抗肿瘤效果 研究主要在肿瘤小鼠模型中进行,尚未在临床试验中验证 探索肿瘤微环境中的免疫抑制因素,优化YM101抗肿瘤效果 肿瘤微环境中的免疫细胞和免疫抑制机制 NA NA scRNA-seq NA RNA 多只肿瘤小鼠
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